ID NIRAN; MATRIX. AC PS51947; DT 10-FEB-2021 CREATED; 10-FEB-2021 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE Nidovirus RdRp-associated nucleotidyl transferase (NiRAN) domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=224; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=219; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.2497869; R2=0.0103099; TEXT='-LogE'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=801; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=510; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-5; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='D'; M=-9,6,-23,19,-7,4,-17,-14,-9,-9,13,-9,-9,-21,-15,-12,-5,-4,-2,-15,19,-12; MA /M: SY='F'; M=2,-15,-16,-20,-17,22,-20,-14,15,-10,21,13,-12,-32,-17,-12,-12,-1,15,-22,10,-17; MA /M: SY='N'; M=0,26,-18,5,-6,-13,11,-15,-5,6,-20,1,52,-19,-10,-14,0,2,-22,-48,-33,-8; MA /M: SY='R'; M=-6,-14,-20,-10,-3,-15,-6,-8,-17,0,-10,-7,-18,7,18,27,-11,-14,-17,-9,-3,2; MA /M: SY='I'; M=-5,-16,19,-17,-15,8,-27,-24,22,-22,22,6,-18,-34,-24,-16,-16,1,21,-24,8,-16; MA /M: SY='R'; M=-6,-14,-12,-7,5,-12,-20,-7,-21,6,-9,0,-17,-9,27,44,-10,-20,-12,-6,0,11; MA /M: SY='G'; M=13,-1,-35,-7,-9,-27,44,-23,-8,-6,-17,-10,-1,-9,1,-11,2,-9,-18,-10,-31,-7; MA /I: I=-10; MD=-21; MA /M: SY='V'; M=13,-7,-17,-11,-13,-4,-12,-17,18,-10,8,8,-5,-18,-8,-15,-1,10,19,-33,-8,-12; D=-10; MA /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; MA /M: SY='W'; M=-12,-15,9,-16,-7,-2,-12,-24,-5,-15,3,-7,-18,-20,-13,-15,-1,1,-6,14,4,-9; MA /M: SY='V'; M=1,-11,-14,-9,-12,4,-16,-15,8,-9,4,-1,-14,-23,-12,1,3,4,11,-23,5,-14; MA /M: SY='A'; M=25,14,-29,25,3,-27,-3,-19,-12,0,-11,-5,3,-10,2,-10,11,6,-1,-44,-29,-1; MA /M: SY='T'; M=7,-7,11,-10,-2,-24,-15,-20,-10,-7,-10,-10,-4,8,-3,-17,8,15,-6,-39,-29,-4; MA /M: SY='R'; M=0,-12,-22,-6,4,-19,-16,13,-21,4,-15,1,-11,-4,16,28,1,-15,-13,-21,-12,6; MA /I: I=-15; MD=-32; MA /M: SY='H'; M=2,-7,-21,-11,-7,-12,3,16,4,-8,-3,4,-2,-5,-4,-10,-2,-5,-2,-20,-11,-7; D=-15; MA /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='F'; M=-13,-16,-9,-23,-19,45,-23,-16,14,-17,34,7,-17,-33,-23,-17,-17,-6,10,-11,30,-19; MA /M: SY='C'; M=-11,-1,48,-1,9,-28,-23,-23,-15,-9,-9,-18,1,-2,-11,-15,-10,-8,-16,-31,-32,1; MA /M: SY='P'; M=-10,-17,-26,-17,-9,-1,-2,-9,-14,-1,-8,-20,-19,30,-8,-2,-10,-10,-19,-11,-3,-12; MA /M: SY='C'; M=-14,-7,48,-8,1,-5,-27,-27,-14,-15,3,-14,-8,-23,-2,-8,-13,-12,-13,-16,-16,0; MA /M: SY='N'; M=10,8,-18,-4,-10,-14,-13,-15,3,-6,-9,0,23,-17,6,-12,3,19,1,-47,-20,-4; MA /I: I=-15; MD=-32; MA /M: SY='G'; M=7,-2,-26,-6,-11,-19,22,-19,-8,-4,-13,-8,-1,-7,-3,-4,8,1,-10,-15,-20,-10; D=-15; MA /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='G'; M=11,-3,-34,-7,-12,-24,39,-24,-10,-4,-17,-7,-3,-10,-3,-1,2,-12,-14,-11,-29,-10; MA /I: I=-9; MD=-19; MA /M: SY='Y'; M=-7,-7,-19,-6,-10,1,1,-8,-1,-7,7,-2,-9,-9,-7,-9,-4,2,0,2,15,-9; D=-9; MA /I: I=-9; MI=-19; MD=-19; IM=-19; DM=-19; MA /M: SY='E'; M=-1,2,15,7,16,-23,-14,-11,-17,-1,-9,-12,-4,-5,13,-1,0,-5,-17,-15,-17,14; D=-9; MA /I: I=-9; DM=-19; MA /M: SY='T'; M=-3,-7,-22,-5,-7,-7,-11,-6,-7,-3,-3,-10,-8,9,-3,-11,8,15,-3,-14,6,-8; D=-9; MA /I: I=-9; DM=-19; MA /M: SY='D'; M=3,12,-18,22,6,-17,-4,-11,-16,6,-12,-11,2,-4,-6,-4,13,2,-11,-23,-10,-2; D=-9; MA /I: I=-9; DM=-19; MA /M: SY='H'; M=1,-12,-21,-8,-4,-14,-13,11,-8,-1,-10,-3,-12,11,3,9,-4,-6,-5,-21,-8,-4; D=-9; MA /I: I=-9; DM=-19; MA /M: SY='S'; M=6,3,-16,9,0,-13,-7,-10,-6,-2,-9,-12,-2,-10,1,-3,11,7,-3,-21,-8,-3; D=-9; MA /I: I=-9; DM=-19; MA /M: SY='R'; M=0,-4,-14,-3,1,-4,-7,-9,-8,6,-7,0,-5,-6,-1,8,8,0,-7,-15,-4,-2; D=-9; MA /I: I=-9; DM=-19; MA /M: SY='R'; M=-6,-12,-20,-8,-4,-11,-14,21,-17,0,-13,1,-10,-4,11,29,0,-13,-11,-13,-3,-1; D=-9; MA /I: I=-9; DM=-19; MA /M: SY='G'; M=1,-9,-30,-4,-1,-15,9,-14,-14,0,-7,-6,-12,-9,3,3,-3,-12,-10,-2,-4,-1; MA /M: SY='F'; M=-9,-18,-19,-32,-27,42,-22,-21,16,-14,22,-1,-8,-29,-21,-19,-8,0,16,-14,16,-26; MA /M: SY='D'; M=-7,9,-32,25,-12,-2,-20,-20,-13,-7,5,-17,-5,-19,-15,-11,-4,-2,3,-18,15,-15; MA /M: SY='I'; M=6,-15,-18,-26,-22,2,-13,-19,41,-17,18,11,-6,-28,-17,-23,-9,3,31,-31,-5,-22; MA /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; MA /M: SY='D'; M=0,0,-3,6,-4,-12,-16,-18,-8,-9,4,-6,-6,-15,-8,-14,1,6,-1,-25,-4,-7; MA /M: SY='N'; M=2,15,-16,0,-12,-10,3,-14,0,-6,-8,-3,31,-19,-11,-20,7,14,-10,-44,-20,-11; MA /M: SY='D'; M=5,19,-19,27,18,-27,-9,-15,-21,15,-14,-3,14,-4,1,-6,1,-6,-18,-35,-20,10; MA /M: SY='D'; M=-7,11,-35,24,-5,-9,-12,-11,-16,-3,0,-13,3,-16,-8,-8,-1,-1,-6,-16,13,-9; MA /M: SY='V'; M=11,-3,-21,-9,-14,-1,-17,-23,18,-4,-3,4,4,-26,-16,-9,-4,7,21,-39,-9,-16; MA /M: SY='A'; M=23,0,-32,-2,2,-19,10,-22,-7,9,-14,8,0,-5,3,-6,6,0,-4,-33,-31,-1; MA /M: SY='G'; M=-6,-11,-2,-21,-16,4,11,-26,4,-13,1,-11,-5,-22,-20,-18,-1,-8,-5,-9,-13,-19; MA /M: SY='I'; M=1,-18,-17,-30,-27,6,-17,-21,48,-20,20,9,-9,-33,-23,-23,-12,3,38,-28,2,-27; MA /M: SY='R'; M=7,-9,-26,-10,-16,-14,5,-21,-3,-5,-10,-3,-8,-14,0,10,0,-3,2,-18,-13,-12; MA /M: SY='M'; M=-10,-9,-28,-7,4,0,-18,7,-8,9,4,16,-12,-5,-7,-2,-9,-9,-10,-16,14,0; MA /M: SY='H'; M=-10,-21,-37,-24,-15,0,-30,60,3,-19,1,8,-13,-13,-14,-10,-10,-10,3,-36,7,-15; MA /M: SY='F'; M=3,0,-16,-9,-11,13,-10,-15,2,-6,2,-3,8,-23,-13,-14,6,6,-1,-31,-6,-13; MA /M: SY='R'; M=-4,-8,-26,-4,8,-10,-14,-16,-24,28,-20,12,-8,2,12,39,-4,-18,-16,-12,-6,6; MA /M: SY='T'; M=8,-2,-22,-8,-11,-13,-16,-19,0,-1,-6,-1,3,-5,-5,-18,17,30,6,-39,-10,-9; MA /M: SY='N'; M=-2,14,-15,-6,-14,2,-9,-8,-3,3,-9,7,43,-30,-7,-2,-6,-1,-12,-44,-21,-12; MA /M: SY='C'; M=0,-9,23,-18,-11,-3,-21,-28,-6,-12,-1,-9,-1,-16,-9,-19,7,13,0,-31,-21,-11; MA /M: SY='H'; M=-4,-14,-3,-20,-10,3,-19,8,3,-14,5,2,-8,-18,-12,-15,-3,-5,0,-29,-8,-12; MA /I: I=-7; MD=-15; MA /M: SY='R'; M=1,-5,-12,-2,-2,-6,-5,-6,-11,2,-12,-7,-5,-6,4,16,11,0,-6,-10,-7,-3; D=-7; MA /I: I=-7; MD=-15; MA /M: SY='F'; M=-3,-14,-14,-22,-20,26,-14,-16,17,-9,10,-3,-6,-22,-16,-9,-6,-3,18,-8,7,-20; D=-7; MA /I: I=-7; MD=-15; MA /M: SY='P'; M=-2,-7,-8,-2,14,-19,-10,0,-16,7,-11,-9,-10,18,17,10,-4,-7,-17,-8,-8,14; D=-7; MA /I: I=-7; MD=-15; MA /M: SY='Y'; M=-7,-3,-18,-2,-6,2,-8,-4,-7,-1,-2,-5,0,-10,-1,5,2,-1,-3,-4,9,-7; D=-7; MA /I: I=-7; MD=-15; MA /M: SY='Q'; M=2,-5,-4,-4,9,-8,-13,-5,-1,-2,1,-1,-8,-7,12,0,-6,-2,-3,-9,0,11; D=-7; MA /I: I=-7; MD=-15; MA /M: SY='D'; M=2,18,-13,23,1,-16,-2,-8,-12,0,-9,-11,15,-9,-6,-7,7,3,-10,-26,-13,-3; D=-7; MA /I: I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; MA /M: SY='G'; M=14,-1,-30,-4,0,-21,18,-19,-10,5,-17,-3,-1,-5,5,-4,7,-2,-14,-20,-25,0; MA /M: SY='R'; M=0,-5,-29,0,-11,0,-15,-15,-13,-2,-3,-8,-7,-13,0,5,5,2,0,-17,3,-10; MA /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; MA /M: SY='F'; M=-13,-26,-30,-38,-33,51,-24,-23,21,-14,20,-7,-12,-35,-25,-15,-11,-9,24,-2,23,-33; MA /M: SY='N'; M=5,6,-19,-3,-12,-15,-13,-5,10,2,4,18,21,-32,-14,-12,-9,3,3,-42,-16,-13; MA /M: SY='I'; M=-3,-19,-16,-28,-26,22,-20,-21,36,-19,23,6,-12,-34,-24,-20,-13,0,30,-22,12,-26; MA /M: SY='K'; M=0,0,-30,0,20,-10,-10,-20,-20,40,-20,20,0,10,0,10,0,-10,-20,-20,-10,10; MA /M: SY='R'; M=-5,-10,-23,-3,-17,6,-23,-20,-9,-2,-4,-8,-14,-22,-1,28,-8,-15,7,-13,6,-14; MA /M: SY='V'; M=5,-14,4,-20,-20,-7,-27,-24,18,-14,7,5,-8,-28,-18,-16,-4,16,24,-34,-7,-18; MA /M: SY='G'; M=-2,3,1,2,-2,-25,11,-26,-16,-1,-13,-11,1,-8,-11,-13,5,-3,-18,-19,-25,-6; MA /M: SY='D'; M=-2,11,-24,25,2,-26,-14,-13,-22,4,-8,-11,-4,8,-2,-1,-2,0,-13,-31,-5,-2; MA /M: SY='Q'; M=11,5,-15,11,17,-32,-15,-11,-17,3,-9,-7,-1,0,21,-7,5,7,-13,-30,-18,19; MA /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; MA /M: SY='H'; M=-10,-15,-23,-17,-11,15,-16,19,-3,-4,8,6,-8,-13,-8,-3,-8,-8,-2,-4,15,-11; D=-13; MA /I: I=-13; DM=-27; MA /M: SY='E'; M=7,11,-5,18,34,-34,-13,-7,-22,11,-11,-8,5,-1,11,-11,2,-10,-20,-28,-25,28; MA /M: SY='F'; M=-8,-18,-28,-21,-16,15,-20,4,6,-11,12,5,-14,-20,-8,-3,-10,-9,7,-14,14,-15; MA /M: SY='A'; M=4,-8,-23,-6,4,-18,-6,-8,-9,3,1,4,-7,-9,1,-11,-1,1,-6,-14,-4,4; MA /M: SY='R'; M=1,-12,-23,-11,1,-10,-18,-12,-10,15,-11,13,-10,-10,12,26,-8,-10,-5,-16,-4,2; MA /M: SY='T'; M=14,-2,-18,-7,-9,-19,-18,-19,1,-6,-2,0,2,-5,0,-22,12,30,10,-43,-13,-4; MA /M: SY='C'; M=5,-10,19,-11,4,-20,-16,-24,-8,-2,-10,-5,-9,3,-5,-9,-4,-2,-5,-32,-31,-2; MA /M: SY='Y'; M=-13,-17,-35,-16,-10,14,-11,-14,-14,2,-1,-7,-16,-13,7,13,-10,-14,-9,10,20,-7; MA /M: SY='D'; M=-5,8,-8,12,5,-5,-15,-12,-2,-2,12,6,1,-17,-10,-14,-10,-4,-7,-28,4,1; MA /I: I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; MA /M: SY='P'; M=-2,-5,-17,-5,0,-10,4,-7,-7,2,-7,-7,-9,14,-7,-8,0,-1,-13,-14,-7,-4; D=-9; MA /I: I=-9; DM=-19; MA /M: SY='P'; M=2,-9,-20,-9,-2,-5,-6,-5,-11,2,-12,-17,-10,25,-4,-7,5,3,-11,-20,-11,-7; D=-9; MA /I: I=-9; DM=-19; MA /M: SY='I'; M=5,-12,-14,-15,-18,3,-14,-17,26,-12,5,-1,-8,-23,-17,-11,0,7,26,-22,-1,-19; D=-9; MA /I: I=-9; DM=-19; MA /M: SY='T'; M=9,-9,-21,-13,-6,-14,-12,-12,8,-7,1,1,-7,2,5,-14,-2,10,4,-34,-12,-4; MA /M: SY='Q'; M=0,-8,-14,-5,18,-26,-6,-3,-17,2,-10,-12,-14,17,23,-1,-8,-7,-26,-13,-10,20; MA /M: SY='H'; M=-17,-18,-39,-17,0,-24,-26,99,-15,-16,-5,12,-14,18,-3,-12,-12,-14,-25,-43,2,-2; MA /M: SY='D'; M=-1,3,-10,7,-4,-29,-2,4,-9,-12,-6,-6,-1,-11,-9,-16,-4,-10,-10,-32,-22,-7; MA /M: SY='F'; M=-12,-23,-26,-27,-22,26,-23,-9,6,-4,18,9,-14,-30,-11,4,-15,-11,9,-2,22,-20; MA /M: SY='F'; M=0,-18,-20,-24,-13,33,-24,-23,5,-6,8,-8,-11,-27,-15,-10,-5,-8,14,-13,6,-15; MA /M: SY='N'; M=7,3,-21,-2,-4,-14,-10,-15,-10,7,-14,2,12,-7,3,1,10,11,-6,-37,-18,-4; MA /M: SY='F'; M=-5,-12,-33,-18,-10,15,-20,10,-8,-7,0,-3,-1,-16,6,-3,-7,-7,-7,-17,6,-6; MA /M: SY='D'; M=-4,17,10,21,4,-21,-13,-20,-16,-2,-7,-9,14,-17,-12,-12,0,-3,-15,-36,-20,-3; MA /M: SY='G'; M=1,-1,-26,4,-4,-26,15,-19,-8,-4,-12,-18,-9,4,-13,-13,-4,-8,-11,-15,-15,-8; MA /M: SY='D'; M=2,13,-19,22,12,-37,11,-17,-22,2,-11,-16,1,-2,-2,-16,3,-6,-21,-19,-19,8; MA /I: I=-12; MD=-25; MA /M: SY='G'; M=-7,-7,-25,-5,-6,-5,10,-11,-10,3,-5,-4,-9,-5,-3,7,-4,-11,-10,7,5,-6; D=-12; MA /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; MA /M: SY='W'; M=-20,-18,-27,-11,-12,2,3,-31,-17,-11,-10,-25,-30,-11,-15,-8,-14,-23,-14,57,15,-15; MA /M: SY='F'; M=-16,-16,-29,-24,-23,38,-25,0,4,-13,15,-3,-6,-28,-19,-11,-12,-8,6,-10,25,-23; MA /M: SY='I'; M=-2,-15,-10,-21,-20,12,-20,-18,36,-20,27,12,-15,-32,-22,-20,-15,2,28,-25,14,-20; MA /M: SY='I'; M=3,-18,-20,-29,-23,15,-17,-17,29,-11,18,12,-7,-31,-18,-17,-10,-1,24,-25,0,-23; MA /M: SY='R'; M=-10,-20,-20,-10,-10,-10,-20,-10,-30,10,-20,0,-20,-10,30,80,-10,-30,-10,0,0,0; MA /M: SY='R'; M=-11,-13,-32,-8,-6,-7,-1,-14,-21,10,-12,-1,-15,-7,7,32,-7,-20,-13,5,6,-5; MA /M: SY='H'; M=-12,-3,-36,2,-5,-21,-19,31,-17,-6,-7,-7,-2,15,-4,-13,-5,1,-17,-32,3,-6; MA /M: SY='H'; M=-3,-8,-18,-9,-1,-17,-20,14,-6,-8,3,1,-8,11,-2,-19,-1,12,-8,-35,-1,0; MA /M: SY='P'; M=2,-8,-23,-8,-7,-22,-14,-9,-14,0,-15,-14,-7,25,3,-4,11,19,-10,-33,-13,-6; MA /I: I=-14; MD=-29; MA /M: SY='P'; M=0,-5,-16,-3,10,-14,-8,-3,-13,11,-13,-3,-7,20,15,6,-3,-2,-17,-11,-7,10; D=-14; MA /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; MA /M: SY='W'; M=-25,-21,-28,-11,-10,14,-10,-9,-10,-8,8,-10,-29,-14,-6,0,-14,-13,-2,57,45,-10; D=-14; MA /I: I=-14; DM=-29; MA /M: SY='S'; M=10,0,-20,-2,-5,-12,-5,-12,-8,-2,-15,-15,2,-8,-8,-15,35,27,-5,-35,-18,-10; MA /M: SY='L'; M=-5,-12,-5,-15,-10,10,-20,-3,18,-10,35,30,-15,-32,-18,-15,-20,0,8,-22,20,-10; MA /M: SY='I'; M=0,-11,-22,-18,-19,-7,15,-17,17,-12,10,7,-8,-26,-20,-18,-10,-6,4,-14,-4,-19; MA /M: SY='D'; M=0,50,-30,90,10,-50,-10,-20,-40,0,-10,-30,10,-10,-10,-10,0,-10,-20,-40,-10,0; MA /M: SY='L'; M=3,-11,-10,-11,-14,11,-19,-17,22,-17,24,13,-17,-29,-18,-16,-13,4,20,-27,14,-14; MA /M: SY='C'; M=-13,-19,25,-18,-14,6,-30,-25,13,-21,18,-1,-21,-32,-22,-13,-17,-3,17,-13,11,-16; MA /M: SY='Y'; M=-31,-27,-41,-15,-17,19,-21,-12,-8,-13,19,-8,-35,-20,-10,-7,-16,-7,4,51,63,-16; MA /M: SY='A'; M=25,8,-29,13,2,-23,-5,-20,-9,4,-10,4,3,-6,4,-10,8,9,1,-44,-28,0; MA /M: SY='I'; M=-6,-12,-29,-18,-19,-2,10,-17,15,-13,7,-4,-9,-20,-17,-18,-2,-4,6,-6,4,-20; MA /M: SY='W'; M=-10,-22,-14,-19,-2,-9,-14,-7,-11,5,2,15,-22,-23,2,15,-17,-19,-10,24,8,0; MA /M: SY='D'; M=-3,11,-16,19,4,-19,-18,3,-7,-6,1,-3,3,-16,-9,-13,-6,-5,-6,-35,-4,0; MA /I: I=-2; MD=-5; MA /M: SY='G'; M=-5,-10,2,-20,-15,7,14,-28,-7,-11,-3,-14,-4,-19,-16,-14,-4,-14,-10,-3,-17,-17; D=-2; MA /I: I=-2; MD=-5; MA /M: SY='D'; M=2,32,-24,61,2,-34,-12,-19,-22,-3,-6,-21,4,-13,-12,-9,-2,-6,-6,-33,-6,-5; D=-2; MA /I: I=-2; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5; MA /M: SY='F'; M=-7,-9,-5,-12,-11,24,-13,-9,9,-10,20,5,-10,-19,-13,-10,-10,-3,6,-7,18,-11; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='C'; M=-2,-2,8,-4,7,-8,-8,-13,-10,8,-9,0,-1,-3,-4,-1,5,-1,-10,-14,-14,1; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='E'; M=-3,3,-8,10,20,-23,-12,20,-17,3,-6,-3,-4,4,5,-6,-2,-11,-16,-16,-7,15; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='C'; M=-4,-12,23,-20,-7,-9,-13,-11,12,-7,8,8,-2,-19,-10,-11,-9,-4,6,-16,-15,-9; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='L'; M=-4,-4,-7,-6,-8,2,7,-10,6,-10,12,4,-8,-14,-12,-12,-8,-4,-2,-6,6,-8; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='F'; M=-3,-10,-10,-13,-13,22,-12,-12,7,-8,9,-3,-8,-18,-14,-7,-2,0,8,-9,9,-14; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='V'; M=9,-6,-13,-10,-12,-4,-9,-14,14,-7,3,3,-2,-13,-6,-11,1,10,17,-23,-7,-10; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='F'; M=-9,-13,-15,-15,-15,26,-16,-11,7,-9,15,-2,-12,-20,-14,-6,-9,-4,11,1,22,-15; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='N'; M=5,15,-15,15,-3,-16,8,-11,-8,-1,-9,-6,16,-10,-5,-9,1,-1,-9,-24,-17,-4; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='P'; M=3,-7,-17,-9,-5,-13,6,-7,3,-3,-6,-7,-6,13,-4,-10,-2,-1,-3,-15,-14,-7; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='C'; M=-4,-5,34,-9,-1,-12,-13,-17,-7,-9,-4,-9,-1,-9,-7,-11,6,7,-5,-18,-20,-3; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='D'; M=-1,4,-10,12,4,-17,-10,-8,-15,3,-6,-6,-2,-2,6,8,1,-3,-7,-14,-5,5; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='E'; M=1,8,-5,18,21,-24,-10,-4,-18,6,-7,-10,-2,1,13,-1,-1,-8,-16,-11,-9,19; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='E'; M=3,0,-2,2,15,-17,-9,-4,-10,5,-5,-5,-2,2,5,-9,8,4,-9,-15,-10,13; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='F'; M=-16,-16,11,-21,-13,30,-19,-17,-4,-9,10,-11,-9,-20,-14,-6,-9,-11,1,6,10,-15; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='F'; M=-8,-11,-7,-16,-13,31,-14,-11,7,-9,19,2,-9,-20,-14,-9,-9,-5,6,-4,18,-13; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='D'; M=1,17,-11,31,9,-25,-8,-9,-18,1,-5,-12,3,-2,-1,-8,2,0,-9,-21,-7,5; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='D'; M=-2,11,-15,16,5,-18,-5,-6,-15,6,-11,-10,7,13,-3,-5,-2,-2,-15,-23,-11,0; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='G'; M=7,0,-19,-2,2,-11,10,-13,-6,8,-10,3,0,-1,-1,-3,2,-4,-8,-12,-15,-1; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='N'; M=0,26,-11,25,-1,-16,-2,-8,-10,0,-9,-7,30,-13,-6,-9,0,1,-12,-34,-16,-3; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='W'; M=-17,-19,-18,-13,-2,2,-6,-12,-13,-6,-4,-11,-25,-10,11,6,-12,-14,-11,54,25,2; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='F'; M=-7,-11,-18,-9,-9,12,-11,-7,-8,-1,-1,-7,-10,-11,-1,12,1,-6,-1,2,11,-9; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='S'; M=0,-5,-21,-2,-1,-1,-6,-7,-6,3,-2,-2,-6,-5,-2,-2,5,2,-1,-6,5,-4; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='F'; M=-4,1,-14,-8,-4,15,-8,-12,-5,8,-4,1,11,-10,-7,-3,-2,-5,-6,-14,-3,-7; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='F'; M=-7,-9,-5,-12,-11,24,-13,-9,9,-10,20,5,-10,-19,-13,-10,-10,-3,6,-7,18,-11; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='G'; M=7,0,-20,-2,-2,-13,18,-14,-6,4,-10,0,0,-3,-3,-5,2,-5,-9,-10,-16,-3; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='P'; M=-2,3,-7,1,10,-18,-6,1,-12,6,-13,-11,6,23,1,-8,-2,-1,-18,-22,-15,6; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='I'; M=0,-8,-8,-13,-6,-1,-9,-7,15,-9,9,5,-5,-13,4,-6,-8,0,7,-13,2,-3; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='F'; M=-5,-9,-6,-12,-12,20,-14,-11,12,-11,17,5,-11,-20,-14,-9,-9,-1,11,-9,15,-12; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='Q'; M=3,1,-6,1,8,-13,-7,-5,-10,5,-9,-1,4,-4,9,7,0,-6,-8,-16,-13,8; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='N'; M=-3,5,-11,0,-2,-11,-4,-2,-9,3,-14,-7,15,11,1,2,-3,-1,-14,-25,-15,-3; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='A'; M=17,0,-18,0,3,-10,-2,-12,-3,6,-7,7,0,-3,4,-3,4,3,1,-25,-19,2; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='I'; M=-2,-9,-6,-14,-10,3,-10,-4,18,-7,17,15,-6,-19,-10,-11,-10,0,10,-15,5,-10; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='L'; M=4,-5,-7,-5,-7,4,-10,-10,11,-9,12,8,-9,-16,-8,-9,-6,3,11,-18,4,-7; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='N'; M=3,7,-11,2,1,-6,-1,-7,-5,5,-12,-3,15,-7,-5,-5,11,6,-9,-24,-14,-3; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='F'; M=-1,-11,9,-16,-11,14,-15,-19,4,-9,4,-5,-6,-19,-12,-7,-5,-3,9,-11,-5,-12; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='I'; M=4,-6,-12,-10,-11,-3,-8,-11,13,-7,1,-2,-1,-12,-9,-11,7,11,12,-20,-5,-12; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='H'; M=0,-7,-17,-4,9,-19,-9,25,-12,0,-9,-3,-8,19,4,-6,-2,-5,-14,-21,-11,6; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='F'; M=-5,-5,-13,-18,-17,23,-9,-13,11,-6,5,-3,10,-20,-13,-11,-4,-3,7,-14,-1,-17; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='V'; M=-5,-11,3,-9,-7,1,-15,-13,2,-9,6,-3,-12,-15,-8,-5,-7,-2,9,-4,6,-8; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='D'; M=-9,9,-13,16,-1,-12,-1,-16,-15,-4,-9,-13,2,-13,-6,-6,-6,-10,-14,16,0,-3; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='Q'; M=7,-2,-16,-2,9,-11,-6,-8,-9,11,-10,5,-2,2,16,7,-1,-2,-10,-14,-10,10; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='I'; M=1,-11,-9,-16,-15,4,-11,-12,27,-12,12,5,-6,-19,-14,-13,-7,2,22,-16,3,-15; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='V'; M=1,-6,-10,-6,-5,4,-12,-13,9,-1,5,7,-8,-13,-10,-4,-6,1,10,-14,5,-7; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='A'; M=14,-4,-10,-3,13,-19,-9,-2,-5,9,-2,12,-2,-8,6,-5,-1,-2,-4,-23,-19,10; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='C'; M=3,-6,18,-9,-2,-12,-15,-21,-2,-4,-3,0,-3,-11,-6,-9,-1,5,3,-25,-19,-4; D=-2; MA /I: I=-2; DM=-5; MA /M: SY='E'; M=-12,-9,0,-8,6,-13,2,-19,-13,0,-1,-5,-12,-10,-8,-10,-8,-14,-16,0,-3,1; MA /M: SY='V'; M=-1,-15,-21,-14,-16,7,-19,-15,15,-12,15,7,-17,-25,-9,-2,-11,-2,18,-16,14,-14; MA /M: SY='P'; M=-3,-13,-16,-11,3,-16,-14,-5,0,-2,-4,-13,-17,25,-8,-14,-4,1,-7,-26,-7,-3; MA /M: SY='P'; M=-13,-15,-33,-10,-6,-15,6,-5,-13,-3,-5,-20,-23,35,-10,-12,-11,-7,-20,-4,6,-10; MA /M: SY='T'; M=9,-6,-21,-11,-10,-7,-15,-20,11,-3,4,9,-2,-12,-7,-16,2,15,13,-35,-7,-10; MA /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; MA /M: SY='I'; M=-7,-17,-22,-23,-16,0,-21,23,24,-20,17,14,-12,-21,-16,-19,-13,-4,14,-32,8,-16; MA /M: SY='T'; M=9,0,-22,-7,-14,-18,-2,-18,-4,-7,-8,-8,6,-4,-5,-23,23,33,-1,-37,-15,-11; MA /M: SY='P'; M=-10,-14,-12,-10,-2,-5,-16,-2,-1,-8,11,-5,-24,28,-12,-16,-16,0,-11,-24,9,-6; MA /M: SY='D'; M=0,29,-34,49,-2,-42,27,-24,-28,-4,-14,-26,6,-10,-14,-14,0,-14,-24,-19,-18,-8; MA /M: SY='N'; M=0,43,-16,33,-4,-22,-3,-13,-12,0,-17,-9,59,-24,-10,-17,0,4,-20,-61,-31,-7; MA /M: SY='Q'; M=8,-14,-20,-18,-10,-10,-22,-16,16,-11,-1,-2,-9,-18,17,0,-6,9,13,-25,-3,-1; MA /M: SY='D'; M=6,29,-33,50,1,-40,15,-23,-26,-3,-13,-21,6,-10,-9,-13,2,-9,-18,-29,-20,-5; MA /M: SY='I'; M=-3,-14,-8,-17,-18,14,-21,-17,31,-20,29,13,-17,-33,-23,-19,-16,3,25,-24,19,-18; MA /M: SY='N'; M=-1,28,-19,14,-8,-19,-8,5,-8,-4,-14,-2,49,-18,-7,-19,2,10,-17,-60,-26,-7; MA /M: SY='G'; M=0,0,-40,-10,-20,-30,80,-30,-10,-10,-20,-20,0,-10,-20,-20,0,-20,-30,10,-30,-20; MA /M: SY='F'; M=-9,-9,-24,-14,0,18,-21,-12,-12,4,0,-8,-2,-15,7,0,-7,-10,-11,-5,10,1; MA /M: SY='Y'; M=-14,-18,-12,-18,-15,19,-18,-18,1,-13,16,4,-21,-25,-10,-2,-14,-7,2,9,23,-12; MA /M: SY='W'; M=-44,-38,-43,-22,-16,22,-13,-21,-18,-14,9,-18,-52,-24,-10,0,-24,-27,-7,112,73,-16; MA /M: SY='D'; M=0,50,-30,90,10,-50,-10,-20,-40,0,-10,-30,10,-10,-10,-10,0,-10,-20,-40,-10,0; MA /M: SY='F'; M=-20,-30,-30,-50,-40,100,-30,-30,0,-10,20,-20,-10,-40,-30,-10,-10,-20,10,10,30,-40; MA /M: SY='G'; M=0,0,-19,-2,13,-34,39,-18,-18,2,-16,-16,-4,-2,-3,-16,0,-20,-30,2,-26,9; MA /M: SY='D'; M=12,29,-28,53,6,-36,-6,-18,-25,0,-12,-18,6,-10,-5,-10,9,0,-11,-41,-19,-2; MA /M: SY='Y'; M=-25,-26,-44,-15,-10,10,-22,0,-17,-2,4,-24,-32,31,-8,-5,-15,-7,-11,12,37,-14; MA /M: SY='P'; M=-5,-17,-32,-14,-6,-25,-4,12,-9,-4,-16,-19,-20,41,-10,-12,-8,-3,-15,-27,-12,-10; MA /M: SY='C'; M=-1,-6,11,-15,-8,-18,-3,-26,-2,-7,-6,-6,1,-11,-11,-19,6,9,-5,-26,-24,-10; MA /M: SY='P'; M=4,9,-27,8,-1,-26,6,-14,-15,5,-17,-10,10,13,-5,-13,2,3,-18,-35,-23,-5; MA /M: SY='N'; M=7,3,-17,-1,0,-16,4,-14,-8,0,-9,0,8,-13,2,-1,-2,-6,-11,-27,-21,1; MA /I: I=-10; MD=-22; MA /M: SY='P'; M=-1,-5,-16,-2,6,-13,-4,-3,-12,9,-14,-10,-7,26,-2,-3,5,2,-15,-16,-10,0; D=-10; MA /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; MA /M: SY='G'; M=3,-5,-17,-7,-6,-11,11,-12,0,-6,-7,-7,-5,-9,5,-1,-3,-3,-5,-4,-7,-2; D=-10; MA /I: I=-10; DM=-22; MA /M: SY='C'; M=-3,-6,9,-11,-7,4,-12,-15,-4,-6,-1,-9,-1,-10,-8,-10,7,7,-1,-15,-9,-8; D=-10; MA /I: I=-10; DM=-22; MA /M: SY='A'; M=19,6,-24,0,1,-23,17,-18,-6,0,-14,-1,12,-11,1,-14,5,-1,-9,-34,-35,0; MA /M: SY='L'; M=-12,-15,2,-16,-10,7,-22,-19,12,-10,18,7,-16,-23,-16,-12,-14,-4,10,-11,14,-12; MA /M: SY='W'; M=-6,-19,-25,-18,-3,4,-14,4,-16,-4,-7,-3,-17,-13,3,5,-7,-18,-10,8,0,-3; MA /M: SY='I'; M=-4,-16,12,-19,-17,8,-25,-23,27,-21,22,7,-16,-33,-23,-18,-15,1,24,-25,7,-18; MA /M: SY='T'; M=10,-8,-17,-9,-13,-1,-15,-18,12,-11,4,0,-8,-21,-14,-15,8,17,16,-34,-3,-15; MA /M: SY='A'; M=16,11,-20,12,5,-23,-6,-15,-10,1,-12,-4,12,-9,2,-14,12,11,-6,-44,-27,2; MA /M: SY='E'; M=0,2,14,8,19,-30,-17,-14,-23,-1,-13,-17,-4,-7,17,-1,4,-4,-22,-21,-22,17; MA /M: SY='I'; M=-8,-21,-27,-23,-21,9,-22,-9,25,-11,24,13,-16,-31,-18,-13,-16,-1,24,-9,24,-21; MA /M: SY='W'; M=-19,-28,-30,-25,-21,9,-16,-21,9,-13,7,-5,-29,-26,-9,3,-16,-15,13,37,30,-19; MA /M: SY='S'; M=5,-5,-25,-6,1,-18,-10,14,-12,-4,-16,-10,-2,-4,7,-6,22,14,-14,-32,-14,0; MA /M: SY='M'; M=9,-14,-34,-14,-11,-5,-13,-8,9,-2,10,14,-10,-21,-3,-9,-6,2,13,-19,2,-11; MA /M: SY='C'; M=0,-15,26,-25,-10,-4,-24,-20,-3,-6,6,8,-2,-25,-11,-14,-6,3,0,-28,-21,-10; MA /M: SY='Q'; M=10,-10,-21,-12,-4,-18,-15,-4,-7,5,-6,12,-4,-14,16,12,1,6,-5,-27,-13,1; MA /I: I=-14; MD=-29; MA /M: SY='F'; M=-5,-11,-17,-16,-15,9,3,-14,0,-4,-1,-5,-5,-13,-5,6,-5,-12,0,0,-1,-13; D=-14; MA /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; MA /M: SY='F'; M=-10,-21,3,-25,-11,16,-21,-20,-14,-5,-4,-18,-15,6,-8,-1,-9,-12,-9,-14,-10,-14; MA /M: SY='H'; M=-6,-16,-24,-12,-3,-16,-17,21,-14,1,-8,2,-15,9,3,13,-4,-8,-15,-24,-4,-4; MA /M: SY='I'; M=-1,-12,-20,-14,-16,-5,6,-15,7,-8,7,7,-12,-25,-14,-2,-11,-8,2,-12,1,-15; MA /M: SY='D'; M=15,14,-31,21,-5,-31,16,-23,-14,-4,-11,-10,4,-9,-5,-15,6,1,-9,-31,-25,-6; MA /M: SY='L'; M=5,-7,-24,-10,-13,3,-13,-11,5,0,6,6,0,-26,-13,-11,-1,-1,5,-26,-8,-16; MA /M: SY='T'; M=5,-9,-8,-9,-6,-16,-16,-17,-8,-7,-2,-5,-8,3,-1,-15,2,14,0,-29,-11,-6; MA /M: SY='Q'; M=0,-10,-25,-7,3,-20,-12,12,-19,1,-20,-13,-11,10,14,13,10,0,-20,-24,-12,2; MA /M: SY='F'; M=-12,-15,-2,-18,-14,17,-10,-21,1,-14,16,-3,-15,-25,-17,-14,-12,-9,1,-4,12,-15; MA /M: SY='D'; M=-10,4,10,15,1,-16,-18,-15,-10,-11,10,-9,-12,-2,-14,-16,-13,-6,-10,-27,-1,-4; MA /M: SY='D'; M=2,8,-24,23,6,-17,-12,-12,-15,-1,0,-10,-6,-11,-4,-10,3,-2,-6,-22,0,1; MA /M: SY='P'; M=-6,-3,-2,-6,7,-25,-10,-8,-19,7,-22,-18,1,37,-5,-10,-2,0,-27,-35,-27,-2; MA /M: SY='Y'; M=-10,-12,-14,-3,14,-5,-24,-6,-6,0,11,-4,-21,-12,-2,-9,-10,-10,-1,1,21,10; MA /M: SY='M'; M=7,0,-24,-7,-2,-13,4,-12,-3,10,-4,17,8,-15,-7,-7,-4,-3,-10,-28,-17,-5; MA /M: SY='Y'; M=-10,-15,-23,-10,-2,15,-21,-9,-3,-5,18,0,-19,-18,-6,-10,-10,-7,3,0,26,-4; MA /I: I=-15; MD=-32; MA /M: SY='H'; M=-1,-14,-25,-19,-16,-9,-20,22,16,-15,4,7,-6,-13,-11,-15,-4,5,13,-34,-1,-14; D=-15; MA /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='P'; M=3,-7,-26,-6,1,-22,-10,-7,-9,6,-18,-14,-7,39,-4,-9,-4,3,-13,-37,-19,-5; MA /M: SY='V'; M=7,4,-20,5,-16,-10,-18,-22,9,-10,-2,-7,5,-23,-16,-15,5,15,16,-40,-6,-17; MA /M: SY='R'; M=2,7,-24,24,-1,-24,-11,-14,-26,4,-16,-11,-5,-10,9,28,3,-11,-11,-23,-11,-2; MA /M: SY='G'; M=-14,-15,-42,-14,-16,-10,21,-13,-4,-8,-2,-16,-17,4,-14,-14,-9,-11,-11,11,10,-18; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=42(42); /POSITIVE=42(42); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=????V; /MAX-REPEAT=1; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=NiRAN; CC /VERSION=1; DR P0C6W1 , R1AB_BC133 , T; P0C6V9 , R1AB_BC279 , T; DR P0C6W0 , R1AB_BC512 , T; P0C6W2 , R1AB_BCHK3 , T; DR P0C6W3 , R1AB_BCHK4 , T; P0C6W4 , R1AB_BCHK5 , T; DR P0C6W5 , R1AB_BCHK9 , T; P0C6W6 , R1AB_BCRP3 , T; DR P0C6V7 , R1AB_BEV , T; P0C6V8 , R1AB_BRV1 , T; DR P0C6W7 , R1AB_CVBEN , T; P0C6W8 , R1AB_CVBLU , T; DR P0C6W9 , R1AB_CVBM , T; P0C6X0 , R1AB_CVBQ , T; DR P0C6X1 , R1AB_CVH22 , T; P0C6X2 , R1AB_CVHN1 , T; DR P0C6X3 , R1AB_CVHN2 , T; P0C6X4 , R1AB_CVHN5 , T; DR P0C6X5 , R1AB_CVHNL , T; P0C6X6 , R1AB_CVHOC , T; DR P0C6X8 , R1AB_CVM2 , T; P0C6X9 , R1AB_CVMA5 , T; DR P0C6Y0 , R1AB_CVMJH , T; P0C6Y5 , R1AB_CVPPU , T; DR Q98VG9 , R1AB_FIPV , T; P0C6Y1 , R1AB_IBVB , T; DR P0C6Y2 , R1AB_IBVBC , T; P0C6Y3 , R1AB_IBVM , T; DR K9N7C7 , R1AB_MERS1 , T; P0C6Y4 , R1AB_PEDV7 , T; DR P0C6X7 , R1AB_SARS , T; P0DTD1 , R1AB_SARS2 , T; DR Q008X6 , R1AB_WBV24 , T; P19811 , RPOA_EAVBU , T; DR Q06502 , RPOA_LDVC , T; Q83017 , RPOA_LDVP , T; DR Q9YN02 , RPOA_PRRS1 , T; Q8B912 , RPOA_PRRSB , T; DR Q04561 , RPOA_PRRSL , T; Q9WJB2 , RPOA_PRRSR , T; DR A0MD28 , RPOA_PRRSS , T; Q68772 , RPOA_SHFV , T; 3D 6M71; 6NUR; 6NUS; 6YYT; 7BTF; 7BV1; 7BV2; 7BZF; 7C2K; 7CYQ; 7L1F; 7O7Y; 3D 7O7Z; 7O80; 7O81; 8GY6; PR PRU01292; DO PDOC51947; //