ID COV_NSP8; MATRIX. AC PS51950; DT 07-APR-2021 CREATED; 07-APR-2021 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE Coronavirus RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) Nsp8 cofactor domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=198; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=193; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8597527; R2=0.0114071; TEXT='-LogE'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=-3006.3264160; R2=36.8080101; TEXT='Heuristic 5.0%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=889; H_SCORE=29716; N_SCORE=12.0; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=407; H_SCORE=11975; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='A'; M=27,-4,-10,-9,-4,-20,0,-14,-16,-10,-21,-16,1,-10,-4,-14,27,11,-6,-31,-20,-4; MA /M: SY='V'; M=-4,-30,-16,-32,-27,3,-32,-27,30,-24,22,14,-28,-28,-26,-22,-17,-4,36,-26,-6,-27; MA /M: SY='A'; M=24,-5,-15,-13,-2,-24,-9,-12,-13,-5,-13,-7,-5,-10,9,-10,9,7,-8,-22,-15,4; MA /M: SY='S'; M=6,0,-14,0,4,-24,-4,-6,-20,-6,-28,-16,8,-10,11,-6,32,14,-14,-36,-18,8; MA /M: SY='E'; M=2,5,-22,8,34,-25,-15,-7,-23,2,-18,-17,0,-4,10,-5,9,2,-20,-30,-19,22; MA /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-35,-27,67,-30,-9,0,-25,7,0,-20,-30,-32,-17,-20,-10,-3,15,43,-27; MA /M: SY='V'; M=11,-17,-10,-18,-17,-10,-15,-22,7,-15,-7,-3,-13,-20,-17,-17,10,7,22,-32,-15,-17; MA /M: SY='N'; M=2,7,-21,0,-6,-22,13,12,-25,-10,-25,-15,18,-17,-4,-9,9,-5,-23,-30,-15,-6; MA /M: SY='M'; M=-10,-26,-22,-32,-22,4,-28,-14,26,-22,33,36,-24,-24,-12,-18,-24,-10,14,-20,0,-18; MA /M: SY='P'; M=6,-17,-32,-13,-3,-27,-15,-20,-17,-10,-25,-17,-17,63,-10,-20,-5,-7,-22,-27,-27,-10; MA /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0; MA /M: SY='Y'; M=-20,-27,-29,-31,-25,47,-29,-3,-3,-19,1,-3,-23,-30,-23,-15,-23,-13,-9,39,53,-24; MA /M: SY='V'; M=16,-23,-13,-28,-23,-7,-21,-27,19,-18,5,5,-22,-22,-22,-21,-5,-1,30,-25,-12,-23; MA /M: SY='E'; M=15,-3,-22,-4,20,-22,-14,-12,-12,-3,-11,-11,-7,-7,3,-12,2,-6,-10,-25,-17,10; MA /M: SY='Y'; M=-19,-21,-29,-21,-20,27,-30,14,3,-13,7,3,-21,-30,-11,-11,-21,-10,-7,23,69,-20; MA /M: SY='E'; M=-1,7,-27,14,49,-28,-17,-3,-27,7,-18,-18,-2,-2,15,-3,2,-8,-25,-28,-20,32; MA /M: SY='R'; M=-8,-5,-19,-10,-8,-12,-20,-13,-8,3,-7,-5,-1,-19,-6,9,-2,9,-2,-27,-10,-8; MA /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10; MA /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,8,-28,-20,-3,-28,36,-25,-8,0,-14,18,42,-8,-10,-22,-20,-10,11; MA /M: SY='Q'; M=-1,8,-25,4,16,-29,-13,-1,-23,16,-23,-11,10,-10,19,8,1,-7,-23,-25,-15,17; MA /M: SY='B'; M=-2,12,-22,9,7,-21,-12,-3,-15,-5,-9,-10,12,-15,5,-7,-1,-6,-18,-29,-15,6; MA /M: SY='Y'; M=-16,-24,-26,-24,-20,22,-30,3,8,-18,21,8,-24,-30,-14,-14,-24,-10,-2,9,47,-20; MA /M: SY='E'; M=-13,21,-30,34,49,-33,-17,0,-33,7,-23,-23,5,-3,15,-3,0,-10,-30,-33,-20,32; MA /M: SY='E'; M=-11,15,-29,19,32,-32,-16,1,-29,15,-24,-16,10,-7,20,6,-1,-9,-28,-29,-17,26; MA /M: SY='A'; M=41,-14,-10,-22,-14,-16,-6,-22,-2,-12,-6,-6,-14,-14,-14,-20,6,0,9,-22,-18,-14; MA /M: SY='V'; M=-7,-19,-20,-19,-13,-9,-26,-18,3,4,2,4,-18,-23,-12,6,-14,-6,14,-24,-8,-13; MA /M: SY='A'; M=19,-5,-14,-11,-8,-18,-8,-15,-8,-2,-14,-9,-1,-15,-8,-9,8,1,1,-27,-17,-8; MA /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; MA /M: SY='N'; M=-5,29,-17,15,0,-20,0,5,-20,-3,-30,-20,46,-17,0,-3,18,5,-25,-40,-20,0; MA /M: SY='G'; M=-3,-1,-30,1,-14,-31,59,-17,-40,-17,-30,-21,3,-19,-17,-19,0,-19,-30,-23,-29,-16; MA /M: SY='S'; M=2,2,-17,5,-5,-22,7,-13,-20,-12,-24,-17,4,-15,-8,-13,19,5,-8,-35,-20,-6; MA /M: SY='A'; M=16,-11,-14,-12,-8,-17,-8,-18,-8,-12,-17,-12,-7,-1,-10,-16,16,7,1,-31,-19,-10; MA /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; MA /M: SY='P'; M=-10,-6,-34,-1,19,-35,-20,-3,-22,2,-24,-11,-8,30,27,-3,-4,-10,-30,-25,-19,21; MA /M: SY='Q'; M=-8,-5,-27,-5,12,-34,-22,4,-12,5,-15,2,-5,-13,46,5,-2,-8,-17,-22,-10,29; MA /M: SY='I'; M=-8,-14,-26,-15,2,-15,-28,-12,9,-10,4,5,-14,-16,8,-11,-10,-8,3,-23,-8,3; MA /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-32,-24,6,-32,-24,29,-29,38,19,-28,-28,-21,-22,-25,-9,20,-21,-1,-24; MA /M: SY='K'; M=1,-2,-26,-4,6,-28,-16,-12,-26,39,-26,-10,-2,-10,6,21,-6,-8,-16,-20,-12,6; MA /M: SY='Q'; M=1,-2,-26,-4,13,-35,-16,1,-20,13,-20,-3,-2,-10,39,7,0,-8,-23,-20,-12,26; MA /M: SY='L'; M=-12,-28,-22,-28,-20,14,-30,-12,16,-26,41,16,-28,-30,-18,-18,-28,-10,6,-11,15,-20; MA /M: SY='R'; M=-12,0,-27,1,18,-24,-20,-6,-27,24,-21,-13,0,-10,10,29,-3,-1,-20,-24,-13,12; MA /M: SY='K'; M=-11,0,-30,0,9,-29,-20,4,-30,42,-29,-9,1,-11,10,26,-10,-11,-21,-21,-6,9; MA /M: SY='A'; M=44,-8,-10,-17,-8,-20,0,-18,-12,-10,-13,-12,-7,-10,-8,-18,15,3,-2,-23,-20,-8; MA /M: SY='C'; M=0,-21,20,-30,-22,4,-22,-18,-2,-21,7,10,-20,-27,-19,-20,-13,-8,1,-24,-8,-20; MA /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0; MA /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,42,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,38,-24,-4,-30; MA /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10; MA /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10; MA /M: SY='S'; M=15,-1,-10,-2,-1,-20,0,-11,-19,-10,-28,-19,8,-10,-1,-11,36,18,-9,-38,-20,-1; MA /M: SY='E'; M=7,3,-21,7,18,-23,-15,-11,-15,-2,-13,-13,-6,-10,0,-11,1,-5,-7,-29,-18,9; MA /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-35,-27,66,-30,-9,0,-25,7,0,-20,-30,-32,-17,-20,-10,-3,15,44,-27; MA /M: SY='D'; M=-16,33,-30,49,37,-36,-14,0,-36,4,-26,-26,12,-6,8,-6,0,-10,-30,-36,-20,22; MA /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0; MA /M: SY='D'; M=-16,35,-30,51,35,-36,-14,0,-36,4,-26,-26,12,-6,8,-6,0,-10,-30,-36,-20,22; MA /M: SY='A'; M=15,-13,-17,-17,-8,-14,-11,-13,-11,-3,-4,-6,-9,-16,-5,6,1,-2,-5,-22,-14,-8; MA /M: SY='A'; M=35,-6,-10,-12,-6,-20,0,-16,-14,-10,-18,-14,-2,-10,-6,-16,22,8,-4,-28,-20,-6; MA /M: SY='V'; M=-2,-25,-12,-27,-26,-1,-27,-24,23,-17,9,15,-25,-26,-23,-17,-8,5,37,-28,-8,-24; MA /M: SY='Q'; M=6,-3,-25,-5,12,-35,-15,2,-17,5,-17,-3,-3,-10,41,2,3,-7,-22,-20,-13,26; MA /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,39,-24,-10,0,-16,10,52,-10,-10,-20,-20,-10,4; MA /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,24,-30,46,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,12,-20,0,-21; MA /M: SY='D'; M=-15,32,-29,43,35,-33,-13,1,-33,4,-26,-25,16,-7,9,-5,1,-9,-30,-36,-20,22; MA /M: SY='R'; M=-11,-5,-26,-5,3,-23,-16,-5,-28,28,-25,-12,2,-15,8,43,-1,-4,-18,-24,-12,3; MA /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10; MA /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10; MA /M: SY='E'; M=-14,27,-30,41,43,-34,-16,0,-34,6,-24,-24,9,-4,11,-4,0,-10,-30,-34,-20,27; MA /M: SY='Q'; M=-12,-10,-27,-10,5,-23,-23,0,-11,3,-1,4,-8,-17,29,13,-10,-10,-17,-20,-7,16; MA /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10; MA /M: SY='M'; M=13,-19,-16,-26,-16,-5,-15,-13,8,-15,17,22,-19,-19,-9,-17,-11,-6,6,-20,-8,-13; MA /M: SY='T'; M=19,-4,-10,-14,-10,-14,-12,-20,-10,-10,-10,-10,-4,-10,-10,-14,16,31,0,-26,-14,-10; MA /M: SY='N'; M=2,10,-18,1,3,-24,-9,-2,-17,-2,-21,-11,17,-13,14,-3,13,9,-18,-30,-15,8; MA /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10; MA /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20; MA /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10; MA /M: SY='E'; M=-10,8,-30,17,54,-32,-20,2,-28,10,-20,-17,0,-2,26,2,0,-10,-30,-28,-18,40; MA /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10; MA /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0; MA /M: SY='A'; M=18,-18,-15,-24,-18,-11,-16,-23,12,-17,-1,0,-13,-16,-15,-21,3,0,16,-25,-13,-18; MA /M: SY='T'; M=-4,1,-16,-5,-4,-12,-18,-13,0,-8,-9,-7,5,-19,-10,-10,3,8,6,-33,-14,-7; MA /M: SY='D'; M=-18,48,-28,58,15,-35,-8,2,-35,0,-30,-28,30,-12,0,-8,2,-8,-30,-40,-20,8; MA /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,39,-24,-10,0,-16,10,53,-10,-10,-20,-20,-10,4; MA /M: SY='R'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,43,-27,-10,0,-13,10,44,-10,-10,-20,-20,-10,7; MA /M: SY='S'; M=24,-3,-10,-7,-3,-20,0,-13,-17,-10,-23,-17,3,-10,-3,-13,30,13,-7,-33,-20,-3; MA /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10; MA /M: SY='V'; M=-3,-30,-15,-31,-28,2,-31,-28,31,-23,19,13,-29,-29,-27,-21,-15,-3,40,-27,-7,-28; MA /M: SY='V'; M=0,-25,-10,-27,-27,-2,-28,-28,24,-18,7,7,-25,-27,-27,-18,-5,8,42,-30,-10,-27; MA /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0; MA /M: SY='A'; M=42,-8,-10,-16,-8,-20,0,-18,-12,-10,-14,-12,-6,-10,-8,-18,16,4,-2,-24,-20,-8; MA /M: SY='M'; M=-10,-25,-20,-30,-20,5,-25,-9,20,-19,34,42,-25,-25,-9,-15,-25,-10,10,-20,0,-15; MA /M: SY='H'; M=-16,0,-30,0,9,-29,-20,61,-26,-1,-20,0,6,-16,31,4,-6,-16,-30,-26,7,17; MA /M: SY='T'; M=13,-2,-10,-8,-6,-16,-9,-16,-14,-10,-18,-14,2,-10,-6,-12,26,29,-4,-32,-16,-6; MA /M: SY='L'; M=-10,-26,-20,-30,-20,6,-26,-11,20,-21,37,37,-26,-26,-11,-16,-26,-10,10,-20,0,-16; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20; MA /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30; MA /M: SY='G'; M=5,-4,-18,-5,-9,-22,24,-15,-26,-14,-27,-18,5,-14,-9,-14,22,9,-16,-31,-22,-9; MA /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10; MA /M: SY='L'; M=-7,-30,-17,-30,-23,7,-30,-23,23,-27,39,17,-30,-30,-23,-20,-25,-7,21,-23,-3,-23; MA /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,37,-23,-10,0,-17,10,57,-10,-10,-20,-20,-10,3; MA /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,45,-28,-10,0,-12,10,40,-10,-10,-20,-20,-10,8; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,26,-30,44,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,14,-20,0,-22; MA /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10; MA /M: SY='N'; M=-6,9,-18,-3,-8,-12,-8,2,-5,-6,-11,11,20,-18,0,-6,4,0,-11,-32,-12,-4; MA /M: SY='E'; M=-4,10,-22,15,20,-30,-11,-1,-25,1,-25,-16,7,-8,20,-3,15,2,-22,-33,-17,20; MA /M: SY='A'; M=23,-4,-14,-9,-2,-22,-4,-14,-18,1,-21,-14,0,-10,-2,-7,18,6,-8,-28,-18,-2; MA /M: SY='L'; M=-6,-30,-16,-30,-24,6,-30,-24,24,-26,35,16,-30,-30,-24,-20,-22,-6,25,-24,-4,-24; MA /M: SY='N'; M=-12,42,-22,32,5,-25,-2,8,-25,0,-30,-22,50,-18,0,-2,8,-2,-30,-40,-20,2; MA /M: SY='T'; M=1,1,-12,-6,-9,-12,-13,-14,-7,-10,-15,-11,6,-15,-9,-10,18,25,2,-34,-14,-9; MA /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28,2,-38,-28,44,-30,26,20,-22,-22,-20,-28,-22,-10,26,-20,0,-28; MA /M: SY='L'; M=-12,-30,-23,-35,-25,20,-33,-23,25,-30,34,16,-25,-27,-24,-23,-25,-10,14,-14,6,-25; MA /M: SY='D'; M=-16,46,-26,50,12,-32,-6,4,-32,0,-30,-26,36,-14,0,-6,4,-6,-30,-40,-20,6; MA /M: SY='N'; M=-10,11,-23,1,2,-20,-13,5,-10,-2,-11,1,20,-18,17,0,-2,-6,-20,-29,-12,10; MA /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10; MA /M: SY='R'; M=-8,-12,-21,-12,-7,-16,-19,-11,-12,11,-15,-6,-6,-20,-3,26,-1,-2,1,-26,-12,-7; MA /M: SY='D'; M=-9,24,-24,25,8,-28,-8,-2,-28,12,-30,-20,23,-13,3,3,7,-2,-24,-35,-17,6; MA /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20; MA /M: SY='C'; M=-4,-26,46,-30,-30,-9,-30,-30,4,-24,-3,-3,-26,-34,-30,-24,-10,-4,24,-39,-19,-30; MA /M: SY='V'; M=-1,-30,-11,-30,-29,1,-30,-29,29,-21,16,11,-30,-30,-29,-20,-13,-1,44,-29,-9,-29; MA /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20; MA /M: SY='N'; M=9,15,-14,5,-2,-20,0,-3,-18,-6,-26,-18,28,-14,-2,-8,22,8,-17,-36,-20,-2; MA /M: SY='V'; M=11,-19,-16,-27,-21,-7,-23,-25,18,-18,4,4,-16,-18,-18,-21,-2,6,21,-24,-10,-21; MA /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-30,0,-38,-30,46,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,34,-22,-2,-30; MA /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; MA /M: SY='A'; M=16,-17,-19,-21,-13,-13,-15,-20,3,-17,0,-2,-13,-2,-12,-20,0,-2,2,-24,-14,-14; MA /M: SY='V'; M=4,-19,-13,-23,-19,-3,-23,-23,11,-19,13,4,-19,-22,-19,-17,-4,11,18,-26,-9,-19; MA /M: SY='S'; M=9,-5,14,-11,-10,-17,-11,-18,-18,-14,-20,-16,-1,-16,-10,-15,21,20,-6,-36,-19,-10; MA /M: SY='A'; M=37,-7,-10,-14,-7,-20,0,-17,-13,-10,-16,-13,-4,-10,-7,-17,19,6,-3,-26,-20,-7; MA /M: SY='N'; M=9,16,-15,1,-5,-17,-5,-6,-15,-5,-19,-15,25,-15,-5,-8,13,13,-14,-32,-17,-5; MA /M: SY='K'; M=-10,-3,-25,-5,2,-22,-20,-10,-25,29,-22,-10,0,-13,5,29,-2,6,-15,-23,-10,2; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20; MA /M: SY='T'; M=-3,-6,-13,-15,-15,-7,-20,-16,4,-11,-3,5,-3,-18,-12,-11,5,21,11,-30,-10,-14; MA /M: SY='I'; M=-6,-30,-20,-34,-28,2,-34,-28,36,-26,21,16,-26,-26,-24,-24,-18,-6,35,-24,-4,-28; MA /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,38,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,42,-26,-6,-30; MA /M: SY='V'; M=-2,-22,-14,-27,-25,-3,-29,-27,23,-19,7,7,-20,-23,-23,-19,-4,11,33,-28,-8,-25; MA /M: SY='P'; M=-7,-17,-36,-9,0,-29,-17,-19,-20,-10,-30,-20,-16,77,-9,-19,-4,-6,-27,-31,-29,-9; MA /M: SY='D'; M=-16,43,-27,60,17,-37,-9,-1,-37,-1,-30,-29,19,-10,0,-10,6,-6,-27,-40,-20,9; MA /M: SY='Y'; M=-13,-15,-30,-14,-7,-10,-25,2,-6,1,-7,-1,-12,0,-5,-4,-16,-11,-11,-15,7,-9; MA /M: SY='E'; M=-8,14,-27,22,24,-32,-1,-3,-31,0,-25,-20,6,-8,11,-6,6,-7,-27,-31,-20,18; MA /M: SY='T'; M=2,-12,-10,-16,-16,-8,-19,-22,4,-14,-7,-4,-10,-18,-16,-14,12,22,18,-32,-12,-16; MA /M: SY='Y'; M=-20,-28,-30,-31,-26,45,-28,-5,-4,-20,0,-4,-24,-30,-23,-16,-24,-14,-10,45,51,-24; MA /M: SY='D'; M=-7,9,-20,12,-2,-21,-15,-11,-12,0,-18,-12,5,-17,-8,-6,2,-1,-1,-34,-15,-5; MA /M: SY='K'; M=-11,5,-28,2,10,-30,-17,0,-26,29,-26,-9,9,-13,22,25,-4,-8,-24,-23,-12,15; MA /M: SY='V'; M=-6,-22,8,-30,-26,-5,-30,-25,17,-22,5,10,-20,-25,-21,-22,-9,2,21,-30,-10,-25; MA /M: SY='V'; M=-7,-21,4,-23,-18,-11,-26,-17,5,-10,-2,7,-19,-26,-10,-4,-10,-5,16,-29,-12,-15; MA /M: SY='D'; M=-14,19,-28,29,19,-31,-17,-2,-26,5,-21,-17,5,-12,10,4,-2,-9,-19,-32,-16,14; MA /M: SY='N'; M=-8,16,-27,16,11,-28,18,-4,-32,-4,-27,-21,19,-13,-2,-8,3,-11,-30,-30,-23,5; MA /M: SY='V'; M=-3,-4,-18,-10,-19,-13,3,-16,-2,-14,-12,-6,4,-25,-19,-14,-2,-5,7,-31,-18,-19; MA /M: SY='Y'; M=-14,-6,-5,-13,-14,7,-22,16,-14,-13,-11,-7,0,-25,-11,-10,-6,-1,-14,-13,21,-14; MA /M: SY='V'; M=-3,-30,-12,-32,-30,13,-30,-28,25,-22,10,8,-28,-30,-32,-20,-12,-2,42,-24,-4,-30; MA /M: SY='H'; M=-8,0,-18,-6,-6,-14,-20,26,-18,-10,-14,-6,4,-14,-2,-6,8,23,-12,-30,2,-6; MA /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20; MA /M: SY='A'; M=42,-8,-10,-16,-8,-20,0,-18,-12,-10,-14,-12,-6,-10,-8,-18,16,4,-2,-24,-20,-8; MA /M: SY='G'; M=0,-8,-24,-8,-12,-25,31,-18,-29,-15,-26,-18,-1,-3,-14,-17,9,1,-21,-26,-25,-14; MA /M: SY='A'; M=12,-1,-13,-11,-13,-13,-12,-15,-1,-10,-9,-7,4,-19,-13,-13,5,6,7,-30,-16,-13; MA /M: SY='V'; M=-4,-30,-17,-33,-28,2,-33,-28,34,-24,19,14,-27,-27,-26,-23,-16,-4,38,-26,-6,-28; MA /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20; MA /M: SY='N'; M=-9,14,-22,7,10,-22,-14,12,-20,-1,-21,-12,20,-13,11,-1,7,7,-22,-32,-11,9; MA /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-37,-29,1,-37,-29,44,-29,22,19,-23,-23,-21,-27,-20,-9,31,-21,-1,-29; MA /M: SY='Q'; M=-10,1,-27,4,7,-29,-22,-3,-8,-1,-13,-2,-3,-14,26,-3,-4,-9,-11,-25,-11,16; MA /M: SY='E'; M=-5,9,-21,11,18,-25,-16,-6,-22,0,-19,-15,4,-7,11,-4,12,14,-17,-31,-15,15; MA /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,38,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,42,-26,-6,-30; MA /M: SY='K'; M=-8,-10,-27,-12,-1,-22,-25,-11,-3,13,-12,1,-8,-15,12,5,-9,-8,-2,-22,-8,4; MA /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10; MA /M: SY='A'; M=30,4,-12,-7,-6,-20,0,-11,-14,-8,-18,-14,10,-12,-6,-14,14,3,-9,-28,-20,-6; MA /M: SY='D'; M=-19,49,-29,63,17,-37,-9,1,-37,0,-30,-29,26,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9; MA /M: SY='G'; M=2,-8,-27,-8,-17,-28,59,-18,-37,-18,-30,-20,2,-18,-17,-18,6,-14,-27,-23,-28,-17; MA /M: SY='T'; M=4,-1,-18,-6,-1,-21,-15,-15,-19,14,-21,-11,0,-10,-1,5,10,16,-9,-26,-13,-1; MA /M: SY='N'; M=-9,0,-22,-5,-1,-14,-20,5,0,-9,-9,-3,6,-19,-6,-10,-4,-6,0,-31,-9,-5; MA /M: SY='V'; M=-5,-22,-17,-22,-17,-6,-27,-23,12,-3,7,6,-22,-25,-17,-6,-14,-5,23,-25,-8,-17; MA /M: SY='H'; M=-16,0,-30,0,9,-29,-20,61,-26,-1,-20,0,6,-16,31,4,-6,-16,-30,-26,7,17; MA /M: SY='L'; M=-9,-28,-23,-26,-17,1,-28,-21,14,-25,30,11,-28,-7,-19,-20,-24,-9,8,-23,-7,-19; MA /M: SY='N'; M=-5,11,-20,4,2,-22,-11,-6,-22,16,-26,-14,18,-13,2,8,9,9,-17,-30,-14,2; MA /M: SY='E'; M=-7,13,-26,22,44,-29,-15,-2,-29,5,-23,-21,4,-3,14,-3,8,-4,-26,-33,-20,29; MA /M: SY='V'; M=-4,-24,-19,-31,-26,-2,-32,-28,31,-22,11,11,-20,-22,-22,-22,-9,5,32,-26,-6,-26; MA /M: SY='T'; M=-3,11,-18,6,-5,-21,4,-11,-22,-9,-22,-17,13,-13,-8,-10,15,17,-16,-32,-18,-6; MA /M: SY='A'; M=10,-2,-17,-4,-6,-18,-11,-12,-9,-3,-12,-1,-5,-14,-5,-9,5,0,-1,-28,-14,-5; MA /M: SY='D'; M=-3,18,-26,21,10,-32,5,-4,-30,-3,-25,-19,12,-12,5,-8,3,-9,-26,-30,-21,8; MA /M: SY='N'; M=-7,13,2,1,-8,-14,-10,-4,-14,-11,-14,-12,25,-24,-8,-9,3,-1,-17,-38,-18,-8; MA /M: SY='T'; M=4,6,-17,0,6,-21,-11,-8,-17,-3,-19,-13,9,-10,5,-6,15,16,-14,-31,-16,6; MA /I: I=-9; MD=-18; MA /M: SY='E'; M=-9,-9,-22,-5,8,-5,-18,-2,-8,-5,-2,-5,-11,4,-1,-8,-10,-7,-12,-9,5,2; D=-9; MA /I: I=-9; MD=-18; MA /M: SY='N'; M=-5,5,12,-4,-9,-12,-10,-7,-8,-10,-14,-10,13,-17,-8,-10,4,-1,-9,-29,-14,-9; D=-9; MA /I: I=-9; MD=-18; MA /M: SY='L'; M=-7,-22,-16,-24,-16,5,-24,-16,20,-22,31,15,-20,-20,-15,-16,-20,-7,11,-15,0,-16; D=-9; MA /I: I=-9; MD=-18; MA /M: SY='S'; M=11,-5,-7,-8,-6,-11,-6,-13,-6,-8,-11,-8,-2,-10,-6,-10,16,13,3,-23,-12,-6; D=-9; MA /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; MA /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20; MA /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20; MA /M: SY='V'; M=-3,-20,-19,-23,-18,-8,-27,-23,17,-8,0,5,-16,-21,-15,-12,-6,-2,23,-27,-9,-18; MA /M: SY='I'; M=-7,-30,-21,-34,-28,2,-34,-28,36,-27,24,17,-26,-26,-23,-24,-19,-7,32,-23,-3,-28; MA /M: SY='T'; M=-2,2,-17,-7,-11,-14,-5,-15,-8,-12,-14,-10,10,-15,-10,-12,12,19,-6,-30,-14,-11; MA /M: SY='C'; M=16,-18,38,-26,-20,-14,-17,-24,-12,-21,-3,-8,-18,-25,-20,-24,-5,-6,-2,-32,-20,-20; MA /M: SY='E'; M=-8,10,-22,7,18,-17,-16,-4,-16,-3,-10,-12,12,-12,3,-5,2,4,-18,-31,-15,10; MA /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0; MA /M: SY='H'; M=-1,-1,-20,-9,-10,-14,-17,16,-5,-12,-10,-3,6,-18,-6,-11,0,0,-4,-29,-4,-10; MA /M: SY='N'; M=-4,8,-18,-2,-12,-16,3,-10,-10,-10,-17,-11,18,-21,-12,-10,5,3,-6,-32,-18,-12; MA /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; MA /M: SY='S'; M=4,-6,-6,-6,-6,-9,-6,-10,-3,-8,-11,-7,-1,-10,-6,-8,15,9,5,-23,-10,-6; D=-10; MA /I: I=-10; DM=-22; MA /M: SY='A'; M=11,6,-10,6,-1,-15,-4,-9,-12,-4,-10,-10,1,-6,-4,-9,6,4,-6,-17,-11,-2; D=-10; MA /I: I=-10; DM=-22; MA /M: SY='V'; M=0,-14,-6,-16,-16,-1,-17,-17,13,-11,3,3,-14,-16,-16,-11,-2,7,24,-18,-6,-16; D=-10; MA /I: I=-10; DM=-22; MA /M: SY='K'; M=-5,-14,-21,-14,-8,-16,-25,-19,-2,18,-12,-1,-14,-19,-8,7,-10,-5,12,-25,-10,-8; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20; MA /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=59(59); /POSITIVE=59(59); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=????V; /MAX-REPEAT=1; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=RdRp Nsp8 cofactor; CC /VERSION=1; DR P0C6W1 , R1AB_BC133 , T; P0C6V9 , R1AB_BC279 , T; DR P0C6W0 , R1AB_BC512 , T; P0C6W2 , R1AB_BCHK3 , T; DR P0C6W3 , R1AB_BCHK4 , T; P0C6W4 , R1AB_BCHK5 , T; DR P0C6W5 , R1AB_BCHK9 , T; P0C6W6 , R1AB_BCRP3 , T; DR P0C6W7 , R1AB_CVBEN , T; P0C6W8 , R1AB_CVBLU , T; DR P0C6W9 , R1AB_CVBM , T; P0C6X0 , R1AB_CVBQ , T; DR P0C6X1 , R1AB_CVH22 , T; P0C6X2 , R1AB_CVHN1 , T; DR P0C6X3 , R1AB_CVHN2 , T; P0C6X4 , R1AB_CVHN5 , T; DR P0C6X5 , R1AB_CVHNL , T; P0C6X6 , R1AB_CVHOC , T; DR P0C6X8 , R1AB_CVM2 , T; P0C6X9 , R1AB_CVMA5 , T; DR P0C6Y0 , R1AB_CVMJH , T; P0C6Y5 , R1AB_CVPPU , T; DR Q98VG9 , R1AB_FIPV , T; P0C6Y1 , R1AB_IBVB , T; DR P0C6Y2 , R1AB_IBVBC , T; P0C6Y3 , R1AB_IBVM , T; DR K9N7C7 , R1AB_MERS1 , T; P0C6Y4 , R1AB_PEDV7 , T; DR P0C6X7 , R1AB_SARS , T; P0DTD1 , R1AB_SARS2 , T; DR P0C6F7 , R1A_BC133 , T; P0C6F5 , R1A_BC279 , T; DR P0C6F6 , R1A_BC512 , T; P0C6F8 , R1A_BCHK3 , T; DR P0C6T4 , R1A_BCHK4 , T; P0C6T5 , R1A_BCHK5 , T; DR P0C6T6 , R1A_BCHK9 , T; P0C6T7 , R1A_BCRP3 , T; DR P0C6T8 , R1A_CVBEN , T; P0C6T9 , R1A_CVBLU , T; DR P0C6U0 , R1A_CVBM , T; P0C6U1 , R1A_CVBQ , T; DR P0C6U2 , R1A_CVH22 , T; P0C6U3 , R1A_CVHN1 , T; DR P0C6U4 , R1A_CVHN2 , T; P0C6U5 , R1A_CVHN5 , T; DR P0C6U6 , R1A_CVHNL , T; P0C6U7 , R1A_CVHOC , T; DR P0C6U9 , R1A_CVM2 , T; P0C6V0 , R1A_CVMA5 , T; DR P0C6V1 , R1A_CVMJH , T; P0C6V2 , R1A_CVPPU , T; DR P0C6V3 , R1A_IBVB , T; P0C6V4 , R1A_IBVBC , T; DR P0C6V5 , R1A_IBVM , T; K9N638 , R1A_MERS1 , T; DR P0C6V6 , R1A_PEDV7 , T; P0C6U8 , R1A_SARS , T; DR P0DTC1 , R1A_SARS2 , T; 3D 2AHM; 3UB0; 5F22; 6M71; 6NUR; 6NUS; 6WIQ; 6WQD; 6WTC; 6XIP; 6YHU; 6YYT; 3D 7BTF; 7BV1; 7BV2; 7BZF; 7C2K; 7CYQ; 7DCD; 7EIZ; 7L1F; 7YWR; 8EIR; 8GW1; 3D 8GWB; 8GWE; 8GWF; 8GWG; 8GWI; 8GWN; 8GWO; 8GY6; PR PRU01295; DO PDOC51948; //