ID   LID; MATRIX.
AC   PS51957;
DT   10-FEB-2021 CREATED; 10-FEB-2021 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   LIM interaction domain (LID) domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.6648701; R2=0.0148688; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=527; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=326; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='D'; M=-12,20,-30,32,31,-34,1,-4,-35,1,-25,-24,7,-7,5,-7,0,-12,-30,-32,-22,18;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-29,-16,-33,-28,11,-31,-25,28,-23,15,15,-26,-28,-27,-21,-15,-4,34,-22,-2,-28;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-19,-22,-23,-10,1,-24,-4,12,-13,22,33,-20,-21,-4,-12,-20,-10,3,-17,4,-7;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-25,-11,-27,-26,-1,-28,-26,23,-19,11,11,-25,-27,-25,-18,-8,5,37,-29,-9,-25;
MA   /M: SY='V'; M=2,-27,-14,-27,-25,-5,-27,-28,21,-18,3,5,-27,-13,-26,-20,-9,-1,36,-29,-13,-26;
MA   /M: SY='G'; M=2,2,-24,5,-4,-30,27,-11,-31,-10,-27,-18,4,-14,-2,-13,9,-8,-24,-27,-23,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='S'; M=6,-4,-14,-8,-5,-17,-11,-15,-12,-4,-19,-12,2,-11,-4,-7,21,19,-4,-31,-14,-5;
MA   /M: SY='M'; M=-8,-23,-20,-29,-21,2,-27,-16,21,-20,25,29,-21,-23,-13,-17,-17,-2,14,-22,-2,-18;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,-20,-30,-20,2,-22,-3,20,-13,25,53,-22,-22,-3,-12,-22,-10,10,-20,0,-12;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-2,-30,1,-6,-31,52,-16,-39,-14,-29,-21,2,-17,-13,-17,0,-18,-30,-23,-28,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-6,-10,-6,-5,-28,27,-16,-34,-6,-27,-19,-2,-18,-10,-10,0,-13,-25,-26,-25,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-10,14,-25,17,26,-19,-10,-3,-26,0,-21,-19,9,-9,4,-6,3,-4,-24,-29,-16,15;
MA   /I: I=-14; MD=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-22,-21,-26,-21,40,-27,-4,2,-19,9,2,-18,-26,-21,-14,-17,-5,-2,10,38,-21; D=-14;
MA   /I: I=-14; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-3,-10,-7,-13,-19,30,-11,-23,-13,-18,-9,5,-17,-12,-13,-1,-11,-18,-20,-19,-13; D=-14;
MA   /I: I=-14; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-9,19,-25,25,14,-30,-4,-3,-30,3,-27,-21,13,-11,6,1,7,-4,-25,-33,-19,10;
MA   /M: SY='E'; M=-11,18,-29,24,38,-31,-10,1,-30,5,-24,-20,11,-6,14,-2,1,-9,-30,-32,-20,26;
MA   /M: SY='D'; M=-19,49,-29,64,17,-37,-9,1,-37,0,-30,-29,25,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,2,-22,-20,1,-29,28,-20,-9,0,-19,15,64,-9,-10,-21,-20,-10,4;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-4,-26,-8,-1,-20,-19,-3,-10,7,-12,-1,-1,-8,6,2,-6,-4,-12,-24,-9,2;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-22,-28,-33,-26,-2,-34,-22,39,-25,15,21,-12,-20,-15,-25,-17,-9,22,-22,-2,-25;
MA   /M: SY='T'; M=0,-4,-16,-8,-6,-13,-16,-11,-6,-10,-3,3,-5,-14,-1,-10,6,15,-4,-28,-10,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-19,-10,-30,-10,-1,-16,-21,1,-27,28,-19,-9,-2,-20,8,59,-11,-10,-19,-15,-1,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-22,-21,-23,-22,-1,-31,-24,26,-24,21,12,-22,-25,-21,-22,-18,-7,24,-25,-5,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-9,6,-29,15,49,-28,-20,-3,-28,7,-20,-19,-2,8,15,-3,1,-5,-28,-30,-20,31;
MA   /M: SY='N'; M=-10,32,-21,16,0,-20,-3,20,-21,-2,-29,-17,50,-19,1,-1,10,-1,-28,-39,-15,0;
MA   /M: SY='S'; M=3,-2,-21,-3,0,-21,0,-12,-19,-10,-20,-15,4,4,-5,-12,10,3,-17,-31,-21,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,1,-28,2,5,-25,-8,3,-22,-4,-22,-12,1,7,8,-7,-1,-5,-24,-24,-11,5;
MA   /M: SY='F'; M=-4,-15,-20,-22,-17,24,-19,-11,-4,-18,-5,-6,-8,-16,-19,-16,-4,-3,-5,-7,14,-18;
MA   /M: SY='D'; M=-8,21,-25,22,3,-28,-3,-3,-24,-4,-22,-13,15,-8,1,-8,2,-4,-22,-32,-18,2;
MA   /M: SY='N'; M=-8,-7,-28,-11,-10,-19,-4,-7,-8,-14,-12,-6,1,-1,-6,-14,-4,-5,-13,-26,-14,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-5,5,-21,-1,-3,-16,-7,-4,-11,-7,-20,-12,15,-11,-2,-9,7,0,-13,-29,-11,-3;
MA   /M: SY='E'; M=3,2,-25,5,14,-29,6,-9,-28,1,-23,-17,1,-9,6,-6,5,-7,-22,-26,-20,10;
MA   /M: SY='N'; M=-1,-2,-19,-7,-8,-8,-12,-9,-9,-11,-13,-11,6,-5,-9,-12,6,5,-10,-27,-9,-9;
MA   /M: SY='N'; M=-2,-1,-23,-5,0,-21,3,-7,-17,-5,-12,-5,4,-16,3,-7,-1,-8,-17,-26,-16,1;
MA   /M: SY='H'; M=-7,2,-23,2,0,-22,-9,8,-18,-4,-16,-8,5,-17,8,0,4,-4,-16,-30,-11,3;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,1,-25,-3,3,-21,-11,3,-17,-4,-20,-8,7,-7,10,-5,2,-5,-21,-15,-11,6;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,5,-28,5,10,-27,-12,11,-24,6,-21,-9,6,-14,22,10,-2,-10,-25,-22,-7,15;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=11(11); /POSITIVE=11(11); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=LIM interaction domain (LID);
CC   /VERSION=1;
DR   O73715    , LDB1A_DANRE, T; O42252    , LDB1_CHICK , T;
DR   Q86U70    , LDB1_HUMAN , T; P70662    , LDB1_MOUSE , T;
DR   P70060    , LDB1_XENLA , T; Q6NVL6    , LDB1_XENTR , T;
DR   Q9W676    , LDB2_CHICK , T; O43679    , LDB2_HUMAN , T;
DR   O55203    , LDB2_MOUSE , T; Q1EQW7    , LDB2_XENLA , T;
DR   G5EEL0    , LIDB1_CAEEL, T;
3D   1J2O; 1M3V; 1RUT; 2JTN; 2L6Y; 2L6Z; 2LXD; 2XJY; 2XJZ; 2YPA; 4JCJ;
PR   PRU01302;
DO   PDOC51957;
//