ID COV_NSP15_NTD; MATRIX. AC PS51960; DT 02-JUN-2021 CREATED; 02-JUN-2021 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE Coronavirus (CoV) Nsp15 N-terminal oligomerization domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=61; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=56; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.6880867; R2=0.0127346; TEXT='-LogE'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=732; N_SCORE=11.0; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=378; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='S'; M=7,-3,-16,-3,-6,-23,21,-13,-26,-13,-30,-20,7,-13,-6,-13,28,8,-16,-34,-23,-6; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,24,-30,46,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,13,-20,0,-21; MA /M: SY='E'; M=-11,16,-30,27,54,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,3,-1,17,-1,0,-10,-30,-31,-20,36; MA /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0; MA /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-30,0,-35,-30,40,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,40,-25,-5,-30; MA /M: SY='A'; M=36,-15,-12,-23,-15,-15,-9,-23,2,-13,-4,-4,-14,-14,-14,-21,4,-1,11,-22,-17,-15; MA /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-24,50,-30,4,0,-18,4,0,-20,-30,-22,-14,-20,-10,-6,22,60,-24; MA /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0; MA /M: SY='V'; M=-5,-29,-14,-30,-26,5,-29,-23,25,-21,22,20,-28,-29,-23,-19,-17,-4,32,-25,-5,-25; MA /M: SY='V'; M=-5,-29,-15,-29,-28,5,-31,-22,26,-20,13,10,-28,-29,-25,-19,-14,-3,36,-20,5,-28; MA /M: SY='K'; M=-10,18,-26,9,6,-26,-11,-1,-26,28,-30,-14,27,-14,6,17,-1,-6,-24,-29,-14,6; MA /M: SY='K'; M=2,-4,-24,-6,0,-26,-4,-12,-22,16,-22,-10,-2,-12,6,6,0,-4,-15,-22,-15,3; MA /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20; MA /M: SY='H'; M=-10,-1,-21,-2,-1,-20,-16,71,-27,-11,-21,-5,8,-18,6,-4,0,-12,-24,-32,9,-1; MA /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-34,-27,65,-30,-8,0,-24,7,0,-20,-30,-31,-17,-20,-10,-3,16,45,-27; MA /M: SY='D'; M=-10,17,-21,24,0,-22,-18,-13,-14,-8,-15,-15,3,-14,-9,-13,3,9,-4,-34,-14,-5; MA /M: SY='G'; M=10,-10,-25,-12,-17,-28,53,-20,-33,-18,-26,-18,-2,-18,-17,-20,4,-14,-23,-21,-28,-17; MA /M: SY='V'; M=-4,-15,-22,-16,-9,-15,-23,-9,3,-5,-2,3,-12,-20,1,2,-8,-7,5,-23,-8,-6; MA /M: SY='A'; M=14,5,-20,4,9,-26,-11,-11,-17,-1,-16,-13,-2,-9,2,-10,4,-2,-12,-26,-17,5; MA /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20; MA /M: SY='E'; M=-11,12,-30,23,58,-31,-19,0,-31,9,-21,-21,1,-1,19,-1,0,-10,-30,-31,-20,38; MA /M: SY='L'; M=-5,-26,-18,-29,-20,5,-26,-16,18,-23,36,26,-26,-26,-16,-18,-23,-8,12,-21,-2,-18; MA /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; MA /M: SY='V'; M=-3,-21,23,-26,-26,-7,-28,-28,6,-21,-2,-2,-21,-28,-26,-21,-4,8,24,-35,-15,-26; MA /M: SY='A'; M=36,-11,-11,-19,-11,-17,-5,-20,-4,-12,-10,-8,-9,-12,-11,-19,11,2,4,-24,-18,-11; MA /M: SY='I'; M=-2,-29,-20,-34,-29,-1,-33,-29,38,-24,14,14,-24,-24,-24,-25,-14,-5,37,-24,-6,-29; MA /M: SY='I'; M=-4,-22,-19,-28,-22,-3,-28,-23,25,-21,10,13,-17,-20,-17,-20,-6,4,23,-26,-6,-22; MA /M: SY='N'; M=-3,20,-23,7,-8,-23,24,-2,-26,-8,-29,-19,35,-19,-8,-8,7,-7,-28,-32,-23,-8; MA /M: SY='D'; M=-18,45,-28,58,21,-36,-9,2,-36,1,-29,-28,24,-11,2,-8,2,-8,-30,-39,-20,11; MA /M: SY='K'; M=-5,-1,-27,-3,6,-27,-18,-11,-27,40,-26,-10,-1,-11,7,25,-6,-5,-17,-21,-11,6; MA /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-29,1,-32,-29,33,-22,14,12,-28,-28,-28,-22,-13,-2,44,-28,-8,-29; MA /M: SY='F'; M=-15,-27,-22,-32,-26,38,-30,-11,12,-22,11,10,-22,-28,-25,-18,-19,-8,10,2,29,-25; MA /M: SY='V'; M=7,-18,-11,-23,-21,-6,-23,-25,13,-16,1,1,-17,-20,-20,-17,2,15,26,-28,-11,-21; MA /M: SY='K'; M=-13,-7,-30,-8,2,-23,-23,-10,-18,33,-20,-6,-3,-14,6,32,-11,-10,-13,-20,-9,2; MA /M: SY='D'; M=-11,8,-25,13,-2,-18,-21,-12,-2,-12,-10,-8,1,-16,-9,-16,-3,-5,0,-31,-11,-7; MA /M: SY='D'; M=-10,16,-29,20,4,-35,17,-4,-33,-5,-28,-18,12,-14,7,-8,1,-13,-30,-28,-21,6; MA /M: SY='G'; M=-5,5,-24,-1,-10,-22,16,-11,-21,-7,-24,-15,13,-13,-11,-9,2,-5,-17,-29,-21,-11; MA /M: SY='V'; M=-2,-6,-16,-8,-4,-11,-21,-17,2,-10,-6,-5,-5,-18,-12,-13,1,6,10,-30,-13,-8; MA /M: SY='D'; M=-19,44,-30,63,26,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,17,-9,3,-9,0,-10,-30,-39,-20,14; MA /M: SY='V'; M=-5,-7,-18,-12,-12,-12,-22,-17,3,2,-9,-2,-3,-20,-12,-3,-4,3,12,-29,-11,-12; MA /M: SY='C'; M=2,-19,10,-21,-11,-9,-24,-22,1,-18,5,-1,-20,-24,-17,-19,-10,-6,10,-30,-15,-14; MA /M: SY='I'; M=-6,-29,-20,-34,-28,1,-33,-27,36,-25,19,18,-26,-26,-23,-23,-17,-6,35,-24,-4,-28; MA /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30; MA /M: SY='E'; M=-7,-8,-22,-9,5,-10,-24,-16,-6,4,-9,-5,-9,-14,-5,-3,-4,2,1,-24,-9,0; MA /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0; MA /M: SY='K'; M=-10,14,-27,8,10,-28,-13,0,-25,26,-28,-12,20,-13,14,16,-1,-7,-25,-27,-14,12; MA /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10; MA /M: SY='T'; M=3,-5,-8,-10,-8,-15,-15,-18,-11,-12,-17,-13,-1,-3,-8,-14,19,25,-4,-33,-16,-9; MA /M: SY='L'; M=-12,-29,-21,-31,-21,22,-30,-17,16,-29,41,16,-28,-30,-22,-19,-28,-10,7,-12,10,-21; MA /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; MA /M: SY='T'; M=0,-5,-10,-13,-13,-8,-22,-22,-4,-12,-7,-7,-5,-13,-13,-12,15,42,8,-30,-10,-13; MA /M: SY='N'; M=-4,32,-18,15,-1,-20,0,6,-19,-2,-29,-19,49,-18,-1,-3,14,3,-26,-39,-20,-1; MA /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30; MA /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10; MA /M: SY='F'; M=-15,-30,-17,-37,-30,59,-30,-23,8,-27,10,3,-23,-30,-37,-20,-17,-7,13,0,20,-30; MA /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20; MA /M: SY='Y'; M=-20,-28,-30,-32,-26,45,-28,-6,-4,-20,0,-4,-24,-30,-24,-16,-24,-14,-10,47,50,-24; MA /M: SY='A'; M=45,-9,-10,-19,-10,-19,-2,-20,-10,-10,-10,-10,-9,-10,-10,-19,11,5,0,-21,-19,-10; MA /M: SY='K'; M=-10,1,-30,1,13,-30,-20,-9,-30,48,-29,-11,0,-9,11,28,-9,-10,-21,-21,-11,12; MA /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=30(30); /POSITIVE=30(30); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=????V; /MAX-REPEAT=1; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=Nsp15 N-terminal oligomerization; CC /VERSION=1; DR P0C6W1 , R1AB_BC133 , T; P0C6V9 , R1AB_BC279 , T; DR P0C6W0 , R1AB_BC512 , T; P0C6W2 , R1AB_BCHK3 , T; DR P0C6W3 , R1AB_BCHK4 , T; P0C6W4 , R1AB_BCHK5 , T; DR P0C6W5 , R1AB_BCHK9 , T; P0C6W6 , R1AB_BCRP3 , T; DR P0C6W7 , R1AB_CVBEN , T; P0C6W8 , R1AB_CVBLU , T; DR P0C6W9 , R1AB_CVBM , T; P0C6X0 , R1AB_CVBQ , T; DR P0C6X1 , R1AB_CVH22 , T; P0C6X2 , R1AB_CVHN1 , T; DR P0C6X3 , R1AB_CVHN2 , T; P0C6X4 , R1AB_CVHN5 , T; DR P0C6X5 , R1AB_CVHNL , T; P0C6X6 , R1AB_CVHOC , T; DR P0C6X8 , R1AB_CVM2 , T; P0C6X9 , R1AB_CVMA5 , T; DR P0C6Y0 , R1AB_CVMJH , T; P0C6Y5 , R1AB_CVPPU , T; DR Q98VG9 , R1AB_FIPV , T; P0C6Y1 , R1AB_IBVB , T; DR P0C6Y2 , R1AB_IBVBC , T; P0C6Y3 , R1AB_IBVM , T; DR K9N7C7 , R1AB_MERS1 , T; P0C6Y4 , R1AB_PEDV7 , T; DR P0C6X7 , R1AB_SARS , T; P0DTD1 , R1AB_SARS2 , T; 3D 2GTH; 2GTI; 2H85; 2OZK; 2RHB; 4RS4; 4S1T; 5S6X; 5S6Y; 5S6Z; 5S70; 5S71; 3D 5S72; 5SA4; 5SA5; 5SA6; 5SA7; 5SA8; 5SA9; 5SAA; 5SAB; 5SAC; 5SAD; 5SAE; 3D 5SAF; 5SAG; 5SAH; 5SAI; 5SBF; 6VWW; 6W01; 6WLC; 6WXC; 6X1B; 6X4I; 6XDH; 3D 7DW0; 7K0R; 7K1L; 7K1O; 7K9P; 7KEG; 7KEH; 7KF4; 7ME0; 7N06; 7N33; 7N7R; 3D 7N7U; 7N7W; 7N7Y; 7N83; 7RB0; 7RB2; 7TJ2; 7TQV; 8D34; 8U2X; PR PRU01305; DO PDOC51960; //