ID   AG_I_II_AR; MATRIX.
AC   PS51965;
DT   02-JUN-2021 CREATED; 02-JUN-2021 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   Streptococcus antigen I/II alanine-rich (Ag I/II A) repeat profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=82;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=82;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.3393261; R2=0.0028050; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=2910; N_SCORE=11.5; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=1127; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='R?';
MA   /DEFAULT: M0=-32; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380;
MA   /I: B1=0; BI=-380; BD=-380;
MA   /M: SY='Q'; M=41,-74,36,41,-42,-64,-32,-72,26,-36,-65,-3,-66,49,-32,-26,-13,-48,-80,-67;
MA   /M: SY='A'; M=62,-71,24,22,-78,-61,-63,-62,25,-53,-65,-29,14,16,-56,-28,-1,-28,-80,-71;
MA   /M: SY='K'; M=27,-70,12,-1,-74,-62,-21,-71,45,-33,-64,36,-66,1,-28,24,31,-60,-80,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-40,-74,-24,35,-74,-68,-57,-69,66,-27,-63,46,-66,31,-43,-32,24,-17,-79,-30;
MA   /M: SY='A'; M=71,-69,-1,43,-79,-59,-63,-71,-13,-63,-65,-43,-65,31,-15,-47,10,-61,-79,-71;
MA   /M: SY='Q'; M=47,-75,46,6,-83,-39,-57,-76,15,-74,-66,-35,-66,80,-51,-12,-35,-69,-80,-68;
MA   /M: SY='Y'; M=20,-78,-72,-70,-23,-49,-15,7,-66,-33,-51,-70,-79,4,-65,-62,-63,-30,-39,115;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,-80,67,14,-86,-66,-54,-78,29,-76,-67,-17,-66,89,-47,-52,-43,-51,-82,-67;
MA   /M: SY='A'; M=63,-68,-49,-5,-76,-59,-64,-24,42,-68,-63,-10,-66,9,-21,8,20,-34,-78,-69;
MA   /M: SY='D'; M=51,-73,75,21,-82,-61,-60,-50,25,-76,-70,-20,-66,1,-56,-38,-31,-68,-85,-71;
MA   /M: SY='N'; M=-42,-72,-63,-62,-54,-72,-59,-32,39,49,-6,56,-76,1,-55,-62,-58,11,-73,23;
MA   /M: SY='A'; M=66,-68,-35,16,-77,-59,-53,-38,15,-64,-62,-31,-66,39,-31,-10,24,-28,-79,-69;
MA   /M: SY='A'; M=78,-66,-32,3,-76,-56,-66,-43,-7,-57,-62,-31,-67,15,-56,15,-12,-19,-78,-70;
MA   /M: SY='Y'; M=29,-78,-66,-64,-35,-69,32,-63,-40,-60,-55,-4,-77,28,-60,-37,-62,-64,-42,112;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-78,32,40,-81,-68,-55,-50,11,-44,-63,11,-66,88,-24,-53,-17,-11,-80,-67;
MA   /M: SY='A'; M=55,-70,4,23,-78,-55,-61,-70,25,-51,-64,-16,-65,49,-54,-3,24,-42,-79,-69;
MA   /M: SY='E'; M=22,-77,25,83,-80,-45,-57,-77,20,-32,-68,-10,-62,-4,-52,-36,-55,-56,-81,-72;
MA   /M: SY='Y'; M=-62,-73,-74,-67,-45,-39,-63,-16,28,38,-45,-69,-77,-12,-41,-42,-7,47,-33,62;
MA   /M: SY='A'; M=61,-69,19,23,-78,-58,-61,-71,28,-73,-66,35,-66,-9,-55,2,-22,-29,-81,-71;
MA   /I: I=-36; MD=-90;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-81,-22,34,-82,-73,-58,-72,51,-77,-67,-55,-69,44,67,-57,-5,-74,-79,-68; D=-36;
MA   /I: I=-36; MI=0; MD=-90; IM=0; DM=-90;
MA   /M: SY='Y'; M=40,-71,-28,-7,-53,-72,-68,49,-34,-42,-50,-67,-72,-43,-69,-44,6,38,-68,50;
MA   /M: SY='Q'; M=-62,-78,37,28,-81,-69,-55,-46,49,-58,-65,25,-66,76,-24,-53,15,-27,-81,-67;
MA   /M: SY='A'; M=67,-69,-15,20,-77,-60,-64,-24,22,-68,-62,-57,-66,36,-31,-9,3,-22,-78,-69;
MA   /M: SY='E'; M=59,-72,16,62,-46,-62,-61,-75,29,-73,-67,-25,-63,-16,-41,-50,-14,-65,-79,-70;
MA   /M: SY='N'; M=-65,-74,-24,-13,-32,-62,-46,-51,25,-72,-64,94,-21,12,-53,-53,-55,-47,-66,69;
MA   /M: SY='A'; M=61,-71,37,-1,-80,-60,-62,-70,38,-71,-65,-43,-66,43,-52,-6,-26,-26,-80,-69;
MA   /M: SY='A'; M=73,-68,6,2,-78,-57,-63,-69,-5,-52,-63,-1,-67,35,-34,-15,8,-46,-79,-70;
MA   /M: SY='A'; M=74,-68,-69,-55,-60,-60,-64,2,-8,-14,-55,-64,-70,2,-39,-49,9,-37,-67,45;
MA   /M: SY='K'; M=-43,-80,49,-24,-53,-70,-56,-78,78,-45,-66,-48,-66,69,2,-56,-60,-76,-77,-65;
MA   /M: SY='A'; M=69,-68,-6,34,-76,-59,-64,-43,10,-51,-63,-31,-66,-1,-28,10,-25,-21,-79,-70;
MA   /M: SY='Q'; M=27,-76,33,35,-56,-65,-56,-77,39,-75,-67,10,-65,64,-5,-25,-7,-71,-80,-68;
MA   /M: SY='Y'; M=-70,-79,-69,-73,-26,-77,-14,-42,-66,-4,-49,16,-83,-62,-65,-66,-63,0,-37,121;
MA   /M: SY='E'; M=22,-78,57,84,-84,-43,-56,-82,-48,-78,-73,-13,-62,15,-57,-32,-59,-74,-84,-73;
MA   /M: SY='Q'; M=1,-76,-52,37,-78,-68,-57,-55,63,-44,-62,-26,-64,74,-21,-21,5,-26,-76,-66;
MA   /M: SY='D'; M=50,-72,62,9,-75,-60,-57,-74,47,-75,-68,25,-66,-43,-51,-40,-41,-59,-79,5;
MA   /M: SY='L'; M=2,-71,-66,-7,-57,-74,-38,-17,30,48,31,-1,-73,40,-28,-62,-58,22,-75,-59;
MA   /M: SY='A'; M=85,-65,-61,13,-76,-54,-66,-66,6,-68,-62,-59,-65,-6,-18,-39,-5,-35,-76,-70;
MA   /M: SY='A'; M=57,-70,1,39,-77,-61,-61,-46,38,-70,-64,-54,-63,31,-29,-8,13,-36,-78,-68;
MA   /M: SY='Y'; M=-44,-29,7,-29,-42,-67,38,-18,-11,-46,-56,66,-75,-27,-31,-56,-18,-29,-53,96;
MA   /M: SY='N'; M=-32,-73,34,8,-76,-52,-53,-63,52,-41,-65,63,-66,51,-45,-17,23,-67,-81,-37;
MA   /I: I=-12; MD=-29;
MA   /M: SY='A'; M=68,-76,-54,2,-86,-42,-77,-50,1,-77,-72,-70,-76,-14,-70,-37,-2,-21,-88,-80; D=-12;
MA   /I: I=-12; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='K'; M=5,-93,12,33,-98,-83,11,-95,36,-92,-84,-20,-81,25,-33,-69,-28,-89,-98,-84; D=-12;
MA   /I: I=-12; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-77,-84,-61,-45,-43,-74,-27,-20,-10,-37,-70,83,-87,-66,-40,-65,-27,-47,-77,59; D=-12;
MA   /I: I=-12; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=37,-83,46,21,-92,-72,-49,-86,1,-86,-80,14,-76,6,-56,-60,7,-78,-96,-81; D=-12;
MA   /I: I=-12; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=45,-80,-32,39,-75,-71,-69,-78,-10,-52,-72,-27,-74,36,2,-12,-11,-39,-87,-77; D=-12;
MA   /I: I=-12; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=26,-79,-9,-52,-66,-77,-75,52,34,-18,-55,-40,-77,-10,-64,-37,-53,6,-80,-6; D=-12;
MA   /I: I=-12; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=1,-79,-46,20,-75,-47,-67,-18,24,-7,-18,-1,-74,55,-58,-39,6,13,-84,-71; D=-12;
MA   /I: I=-12; DM=-29;
MA   /M: SY='A'; M=85,-65,-41,5,-75,-54,-65,-65,-11,-50,-61,-59,-65,23,-60,-10,-15,-36,-76,-44;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-78,43,86,-80,-70,-55,-66,16,-75,-70,-51,-60,33,-50,-53,4,-73,-80,-26;
MA   /M: SY='N'; M=-45,-71,-48,-37,-29,-60,-48,-55,46,-36,-60,92,-73,-51,-43,-35,-53,1,-68,59;
MA   /M: SY='A'; M=56,-69,7,55,-76,-53,-60,-69,-14,-43,-64,8,-63,21,-41,-25,31,-46,-80,-69;
MA   /M: SY='A'; M=70,-70,-58,25,-75,-59,-60,-70,9,-69,-62,-58,-66,48,29,-30,-29,-43,-74,-19;
MA   /M: SY='I'; M=37,-73,-7,-5,-55,-73,-71,75,-25,-33,-46,-67,-71,-28,-70,-39,-41,13,-71,24;
MA   /I: I=-36; MD=-90;
MA   /M: SY='Q'; M=-36,-80,39,10,-56,-71,-58,-74,56,-41,-20,3,-69,57,23,-44,-4,-35,-81,-67; D=-36;
MA   /I: I=-36; MD=-90;
MA   /M: SY='K'; M=51,-73,-58,19,-81,-54,-62,-75,57,-74,-31,-37,-66,49,-37,-14,-2,-67,-78,-70; D=-36;
MA   /I: I=-36; MD=-90;
MA   /M: SY='R'; M=40,-77,14,16,-47,-53,-61,-48,-1,-60,-67,-19,-72,28,56,-27,-15,-46,-79,-17; D=-36;
MA   /I: I=-36; MI=-90; MD=-90; IM=-90; DM=-90;
MA   /M: SY='N'; M=-67,-74,-46,-64,-52,-60,-43,-71,-55,-74,-27,106,-79,-55,-61,-52,-54,-75,-65,81; D=-36;
MA   /I: I=-36; DM=-90;
MA   /M: SY='A'; M=65,-70,30,38,-78,-47,-59,-55,-23,-52,-64,1,-65,48,-34,-47,-12,-48,-79,-69;
MA   /M: SY='Q'; M=46,-71,3,21,-77,-62,-59,-63,28,-51,-62,-38,-64,64,-20,6,29,-37,-78,-67;
MA   /M: SY='A'; M=80,-50,0,-39,-71,-55,-66,-42,26,0,-58,-38,-41,-56,-54,-13,-53,-54,-76,-68;
MA   /M: SY='K'; M=-62,-79,-54,23,-52,-71,-29,-73,86,-15,-61,-52,-65,62,10,-57,-60,-72,-14,-41;
MA   /M: SY='A'; M=82,-64,-39,7,-75,-21,-67,-63,-10,-67,-62,-59,-40,-27,-63,-2,5,-8,-77,-70;
MA   /M: SY='D'; M=39,-72,59,31,-78,-63,-58,-48,30,-50,-66,7,-65,23,-35,-33,12,-30,-83,-68;
MA   /M: SY='Y'; M=-71,-82,-70,-72,-4,-77,-38,-57,-31,-54,-50,-39,-83,-60,-61,-66,-65,-62,12,132;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-79,61,77,-84,-68,-39,-81,-3,-77,-71,5,-41,53,-51,-53,-39,-76,-83,-70;
MA   /M: SY='A'; M=67,-66,-60,-9,-73,-58,-63,-55,25,-41,-60,-6,-66,33,-30,-3,20,-1,-78,-67;
MA   /M: SY='A'; M=66,-69,28,6,-78,-58,-61,-72,51,-52,-64,-53,-65,26,-49,-8,-54,-63,-77,-69;
MA   /M: SY='L'; M=-64,-71,-72,-28,-28,-79,-63,-38,30,66,46,-69,-75,36,-35,-65,-25,-2,-72,-56;
MA   /M: SY='A'; M=81,-65,-62,2,-74,-55,-67,-28,21,-61,-60,-37,-65,-24,-58,-14,3,-15,-77,-69;
MA   /M: SY='Q'; M=14,-77,1,32,-80,-67,-55,-45,32,-69,-61,-15,-65,92,-17,-33,-25,-6,-77,-65;
MA   /M: SY='Y'; M=-71,-81,-69,-72,-5,-77,-38,-58,-15,-55,-51,-13,-82,-60,-60,-65,-65,-63,-30,130;
MA   /M: SY='Q'; M=-21,-78,30,63,-83,-66,-52,-78,16,-76,-67,43,-63,76,-48,-51,1,-75,-81,-68;
MA   /M: SY='Q'; M=43,-71,-1,26,-78,-62,-60,-70,47,-71,-64,-31,-64,51,-48,2,31,-34,-78,-68;
MA   /M: SY='D'; M=42,-75,85,21,-83,-57,-57,-78,23,-77,-72,-32,-65,11,-31,-51,-31,-71,-86,-70;
MA   /M: SY='K'; M=-64,-74,-9,-31,-57,-76,-62,-46,65,52,-46,-61,-62,10,-5,-35,-31,-6,-72,-11;
MA   /M: SY='A'; M=87,-64,-64,-23,-76,-52,-67,-38,5,-68,-62,-59,-57,-13,-61,17,-35,-55,-76,-70;
MA   /M: SY='A'; M=56,-71,-5,31,-77,-62,-24,-69,27,-70,-36,-20,-65,40,17,-25,5,-23,-78,-68;
MA   /M: SY='Y'; M=-36,-78,-73,-73,-13,-78,-49,32,-27,-30,-30,-20,-80,-31,-65,-66,-62,18,2,112;
MA   /M: SY='D'; M=-6,-78,70,33,-82,-66,-54,-77,41,-56,-69,24,-65,53,-14,-53,-31,-51,-84,-68;
MA   /M: SY='K'; M=34,-73,-40,13,-77,-64,-58,-71,62,-38,-30,-15,-65,62,-13,-28,22,-66,-76,-66;
MA   /M: SY='A'; M=65,-69,26,39,-73,-36,-62,-44,5,-59,-64,-20,-65,-52,-59,-7,-3,-20,-77,-4;
MA   /M: SY='N'; M=-63,-72,-21,-56,-23,-69,-56,-54,56,31,24,63,-73,0,-4,-59,-56,1,-76,-14;
MA   /I: E1=0; IE=-380; DE=-380;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=32(8); /POSITIVE=32(8); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=???P?; /MAX-REPEAT=6;
CC   /FT_KEY=REPEAT; /FT_DESC=Ag I/II A;
CC   /VERSION=1;
DR   Q9LBG3    , PAA_STRCG  , T; P11657    , PAC_STRMG  , T;
DR   Q9KW51    , PAS_STRIT  , T; P21979    , SPAA_STRDO , T;
DR   P23504    , SPAP_STRMU , T; A8AUS0    , SSPA_STRGC , T;
DR   A8AUS1    , SSPB_STRGC , T; P16952    , SSPB_STRGN , T;
3D   2WD6; 6E36; 6TZL; 6UBV;
PR   PRU01310;
DO   PDOC51965;
//