ID COV_VIROPORIN_3A_CD; MATRIX. AC PS51967; DT 02-JUN-2021 CREATED; 02-JUN-2021 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE Coronavirus (CoV) 3a-like viroporin cytosolic (CD) domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=81; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=76; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0669315; R2=0.0292846; TEXT='-LogE'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=306; N_SCORE=11.0; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=152; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='T'; M=-8,4,-20,-3,-6,-7,-16,7,-14,-3,-17,-10,10,-17,-3,-3,6,12,-14,-19,10,-6; MA /M: SY='F'; M=-16,-29,-21,-34,-25,48,-30,-16,8,-28,24,8,-24,-30,-29,-19,-24,-10,3,1,24,-25; MA /M: SY='I'; M=0,-22,-7,-29,-23,-5,-25,-20,19,-20,9,17,-19,-22,-16,-21,-10,-5,17,-26,-8,-20; MA /M: SY='F'; M=-17,-22,8,-29,-22,20,-28,-18,-9,-13,-4,-5,-14,-28,-21,2,-15,-10,-4,-16,2,-22; MA /M: SY='V'; M=-8,-31,-23,-33,-27,4,-28,-25,19,-22,12,11,-30,-28,-22,-20,-21,-10,21,10,2,-24; MA /M: SY='H'; M=-12,11,-25,10,5,-25,-13,39,-27,1,-25,-10,16,-15,11,2,3,-8,-26,-32,-2,6; MA /M: SY='G'; M=-1,-1,-20,-7,-13,-20,21,-17,-24,-13,-21,-15,6,-15,-13,-13,10,15,-16,-27,-20,-13; MA /M: SY='R'; M=-9,-1,-23,-5,-5,-19,-10,4,-18,8,-19,-8,6,-18,-3,9,-3,-3,-11,-27,-9,-5; MA /M: SY='C'; M=12,-4,41,-15,-16,-20,-12,-18,-21,-16,-19,-17,0,-24,-16,-20,4,-3,-10,-37,-24,-16; MA /M: SY='W'; M=1,-7,-24,-13,-13,-2,-4,-8,-16,-12,-18,-14,0,-20,-11,-13,-1,-6,-17,13,6,-12; MA /M: SY='Y'; M=-13,4,-27,6,-5,-4,-10,7,-20,-10,-18,-14,3,-9,-8,-11,-4,-8,-20,-15,10,-8; MA /M: SY='Y'; M=-13,-24,-24,-25,-23,22,-23,-3,6,-18,10,4,-22,-29,-19,-15,-19,-9,4,5,36,-23; MA /M: SY='C'; M=-8,-6,8,-8,-4,-15,-22,-14,-6,-9,-8,-2,-9,-22,-11,-12,-7,-6,2,-34,-16,-7; MA /M: SY='I'; M=-9,-15,-25,-21,-18,-3,-13,-17,6,-14,-3,1,-7,-22,-12,-9,-10,-9,5,-20,-7,-17; MA /M: SY='P'; M=-7,-12,-32,-6,2,-27,-16,-15,-23,4,-29,-17,-9,45,-3,-2,-1,-4,-24,-29,-23,-4; MA /I: I=-11; MD=-23; MA /M: SY='Y'; M=-6,-16,-13,-18,-16,11,-18,-6,8,-12,2,6,-14,-19,-13,-11,-6,-2,11,-7,14,-15; D=-11; MA /I: I=-11; MD=-23; MA /M: SY='N'; M=-6,14,-13,7,4,-11,-5,2,-7,-1,-12,-8,21,-9,1,-2,2,-2,-12,-20,-10,2; D=-11; MA /I: I=-11; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23; MA /M: SY='H'; M=-4,-5,-19,-6,-4,-9,-12,27,-16,-4,-15,-6,1,-16,1,2,2,-4,-14,-16,11,-4; D=-11; MA /I: I=-11; DM=-23; MA /M: SY='T'; M=1,-8,-12,-10,-5,-9,-15,-14,-1,-11,-4,-5,-6,-13,-8,-11,9,12,5,-27,-11,-7; D=-11; MA /I: I=-11; DM=-23; MA /M: SY='K'; M=-2,3,-16,0,1,-18,-11,-9,-18,13,-21,-11,7,-9,1,6,10,11,-12,-25,-11,1; D=-11; MA /I: I=-11; DM=-23; MA /M: SY='P'; M=-12,2,-31,9,2,-26,-17,-2,-19,-6,-23,-16,-2,21,-4,-8,-2,-7,-20,-32,-17,-4; MA /M: SY='Y'; M=-13,-16,-26,-22,-19,18,-22,-11,-3,-17,-3,-5,-11,-24,-17,-15,-12,-2,-8,20,21,-18; MA /M: SY='V'; M=-4,-28,-17,-33,-27,20,-29,-26,22,-24,14,9,-24,-27,-28,-22,-15,-5,26,-16,2,-27; MA /M: SY='V'; M=0,-23,-3,-30,-25,-5,-28,-26,21,-21,7,10,-21,-24,-21,-22,-9,1,27,-28,-10,-25; MA /M: SY='L'; M=-11,-24,-23,-27,-19,5,-29,-19,12,-12,16,9,-20,-25,-16,-2,-19,-8,11,-19,-1,-19; MA /M: SY='Y'; M=-11,3,-22,-3,-1,-2,-19,2,-10,-7,-7,-8,6,-19,-4,-7,-2,5,-14,-14,13,-4; MA /M: SY='G'; M=-4,-11,-22,-14,-14,1,20,-17,-23,-18,-17,-14,-4,-19,-19,-16,3,-3,-16,-17,-11,-15; MA /M: SY='G'; M=-3,2,-27,1,-7,-28,40,-14,-34,-13,-27,-20,6,-16,-12,-15,3,-9,-27,-25,-25,-9; MA /M: SY='D'; M=-11,20,-26,28,11,-32,-14,-2,-22,-2,-22,-15,9,-11,13,-7,6,-4,-20,-33,-15,11; MA /I: I=-4; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9; MA /M: SY='H'; M=-12,4,-21,4,10,-18,-13,32,-20,3,-16,-6,9,-11,13,8,-3,-9,-21,-21,-1,10; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-9; MA /M: SY='Y'; M=-13,-1,-21,2,-8,7,-8,3,-12,-9,-8,-8,-5,-17,-10,-10,-9,-9,-13,1,23,-10; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-9; MA /M: SY='I'; M=-8,-19,-17,-22,-18,7,-23,-8,18,-15,12,13,-18,-20,-13,-14,-14,-6,14,-6,15,-17; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-9; MA /M: SY='Y'; M=-8,-10,-17,-12,-7,5,-19,-1,-3,-6,-4,-1,-9,-15,2,-5,-4,3,-4,-4,15,-3; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-9; MA /M: SY='I'; M=-5,-19,-16,-23,-18,5,-22,-18,19,-19,13,8,-14,-17,-15,-17,-9,-3,15,-16,-1,-18; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-9; MA /M: SY='G'; M=-2,3,-20,-1,-11,-20,38,-9,-26,-11,-22,-15,13,-15,-11,-11,2,-11,-22,-19,-20,-11; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-9; MA /M: SY='G'; M=-5,9,-20,11,-5,-22,24,-9,-26,-9,-21,-16,8,-12,-9,-11,2,-6,-20,-21,-18,-7; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-9; MA /M: SY='Y'; M=-9,-6,-18,-4,-3,-2,-17,-2,-5,-4,-2,-3,-8,-16,-5,-1,-6,-4,-3,-10,10,-5; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-9; MA /M: SY='T'; M=-4,-11,-13,-17,-13,9,-18,-15,4,-15,-1,-2,-6,-13,-13,-13,3,12,4,-15,0,-13; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-9; MA /M: SY='V'; M=-5,-13,-15,-13,-2,-5,-20,-12,10,-10,7,9,-14,-14,-7,-11,-9,-5,11,-20,-7,-5; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-9; MA /M: SY='D'; M=-3,5,-18,7,3,-20,-10,3,-19,4,-18,-11,2,0,0,-1,3,0,-14,-22,-9,1; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-9; MA /M: SY='F'; M=-13,-20,-22,-23,-19,27,-10,-11,-9,-15,-4,-6,-15,-21,-19,-9,-15,-12,-10,26,19,-17; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-9; MA /M: SY='V'; M=0,-14,-13,-15,-10,1,-17,0,3,-12,-1,1,-12,-17,-13,-11,-6,-4,11,-17,-1,-12; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-9; MA /M: SY='S'; M=2,2,-12,3,-1,-15,-5,-9,-10,-9,-17,-12,5,-9,-2,-10,19,9,-5,-28,-13,-2; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-9; MA /M: SY='G'; M=-5,-5,-18,-8,-9,-8,4,-11,-16,-7,-14,-10,1,-2,-10,-4,1,4,-13,-17,-11,-10; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-9; MA /M: SY='V'; M=-4,-5,-13,-8,-12,-7,-15,-11,8,-10,-1,5,-4,-16,-11,-11,-2,-1,12,-23,-8,-12; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-9; MA /M: SY='D'; M=-8,13,-18,16,5,-19,-10,-4,-18,6,-14,-11,8,-10,0,0,0,-3,-14,-24,-11,2; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-9; MA /M: SY='D'; M=-10,2,-17,9,-4,-9,-16,-10,-3,-12,8,-2,-7,-16,-10,-12,-11,-6,-1,-22,-7,-7; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-9; MA /M: SY='Y'; M=-10,-7,-10,-9,-11,9,-16,8,-6,-8,-8,-5,-3,-20,-7,-8,-5,-3,-10,3,32,-11; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-9; MA /M: SY='V'; M=3,-20,-11,-22,-19,-1,-20,-20,19,-16,13,8,-19,-19,-18,-16,-9,-3,24,-19,-6,-19; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-9; MA /M: SY='A'; M=21,-14,-9,-18,-13,-8,-9,-17,4,-12,3,0,-14,-14,-13,-15,-1,-1,11,-17,-11,-13; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-9; MA /M: SY='I'; M=-6,-22,-18,-27,-21,2,-27,-21,29,-21,18,13,-18,-18,-17,-19,-15,-6,22,-17,-2,-21; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-9; MA /M: SY='R'; M=-13,-8,-20,-8,-4,-11,-16,15,-15,9,-11,-3,-2,-16,3,28,-8,-8,-9,-16,1,-4; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-9; MA /M: SY='G'; M=0,-7,-25,-7,-12,-26,37,-14,-33,-10,-28,-18,3,-17,-10,-3,9,-8,-23,-25,-24,-12; MA /M: SY='C'; M=-10,-17,13,-20,-16,-3,-23,-9,-12,-12,-3,-6,-14,-28,-12,-4,-8,-5,-7,-21,4,-16; MA /M: SY='F'; M=-2,-17,-10,-23,-15,12,-21,-6,-8,-15,-6,-4,-10,-21,-13,-10,-6,-7,-5,-16,2,-14; MA /M: SY='C'; M=-10,2,12,2,8,-23,-22,-2,-27,-3,-20,-16,-2,-16,-3,-7,-1,1,-18,-35,-15,2; MA /M: SY='S'; M=8,1,-18,0,13,-23,-10,-10,-22,6,-23,-16,2,-8,4,-2,15,6,-14,-30,-17,9; MA /M: SY='D'; M=-15,26,-25,29,4,-26,-12,9,-23,-2,-22,-17,21,-17,-2,-2,-1,-7,-19,-36,-13,0; MA /M: SY='C'; M=-10,-22,13,-26,-21,2,-28,-14,2,-24,11,2,-20,-30,-18,-20,-15,-7,0,-19,7,-21; MA /M: SY='Y'; M=-12,-15,-22,-18,-11,16,-24,3,-6,-14,-1,-1,-11,-22,-5,-10,-7,-2,-9,-6,21,-8; MA /M: SY='L'; M=-11,-22,-23,-23,-14,8,-28,-8,8,-17,20,10,-21,-26,-5,-12,-19,-9,2,-10,13,-10; MA /M: SY='L'; M=-2,-25,-18,-27,-19,2,-25,-19,17,-24,28,16,-23,-25,-17,-19,-16,-5,13,-23,-5,-18; MA /M: SY='R'; M=-19,1,-30,5,9,-20,-20,26,-29,11,-20,-10,3,-17,9,29,-8,-13,-24,-23,1,5; MA /M: SY='S'; M=6,-2,-16,-5,-1,-20,-9,-12,-20,5,-24,-15,4,-11,0,5,19,14,-10,-31,-16,-1; MA /M: SY='V'; M=6,-17,-10,-20,-19,-7,-20,-24,10,-15,-2,-1,-15,-21,-19,-16,6,14,26,-31,-13,-19; MA /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; MA /M: SY='E'; M=-9,19,-25,28,32,-29,-15,-4,-29,2,-22,-21,7,-5,8,-5,7,2,-23,-34,-18,20; MA /M: SY='Y'; M=-12,-18,-22,-20,-16,8,-27,3,4,-19,18,7,-17,-25,-12,-13,-15,1,-1,-11,20,-16; MA /M: SY='L'; M=-8,-22,-25,-23,-22,-1,0,-14,1,-22,10,3,-18,-26,-19,-19,-16,-12,-1,-12,4,-22; MA /M: SY='B'; M=-7,15,-24,14,12,-18,-14,0,-16,-2,-17,-15,14,-14,0,-7,0,-6,-17,-27,-8,5; MA /M: SY='G'; M=-7,-2,8,0,-2,-29,18,-16,-35,-14,-25,-21,-3,-20,-12,-17,-3,-14,-25,-32,-27,-7; MA /M: SY='N'; M=-5,12,-21,7,3,-16,-14,3,-19,-1,-19,-14,13,-14,-1,-4,5,8,-17,-25,-4,0; MA /M: SY='F'; M=-3,-19,-4,-26,-21,19,-24,-15,-3,-15,-2,-4,-16,-25,-22,-15,-8,-1,3,-9,12,-21; MA /M: SY='I'; M=-6,-24,-20,-30,-24,0,-32,-26,29,-24,16,12,-20,-22,-20,-22,-11,4,25,-24,-4,-24; MA /M: SY='Y'; M=-12,-18,-22,-21,-18,33,-22,0,-5,-16,-4,-5,-12,-25,-17,-13,-5,-2,-7,6,39,-18; MA /M: SY='I'; M=-13,-25,-23,-30,-21,12,-30,-19,13,-13,9,7,-18,-25,-18,0,-17,-8,13,-16,2,-21; MA /M: SY='F'; M=-17,-29,-23,-37,-28,52,-32,-18,12,-28,15,6,-21,-28,-31,-21,-21,-10,6,3,26,-28; MA /M: SY='S'; M=1,-11,-5,-14,-11,-6,-15,-11,-10,-9,-15,-10,-5,-18,-9,-12,9,3,-5,-22,0,-11; MA /M: SY='E'; M=-7,11,-24,8,17,-28,-12,0,-24,14,-26,-14,15,-10,17,8,7,-3,-24,-30,-16,17; MA /M: SY='E'; M=-7,-2,-12,-3,8,-22,-18,7,-20,3,-20,-11,1,-13,3,-1,4,-1,-15,-31,-10,4; MA /M: SY='P'; M=-7,-18,-26,-17,-9,-16,-24,-17,3,-14,-3,-1,-16,12,-4,-15,-7,-2,-2,-26,-13,-8; MA /M: SY='V'; M=1,-28,-16,-31,-25,1,-29,-26,27,-23,20,12,-26,-26,-24,-22,-15,-4,31,-25,-7,-25; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=18(18); /POSITIVE=18(18); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=????V; /MAX-REPEAT=1; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=CoV 3a-like viroporin CD; CC /VERSION=1; DR Q0Q474 , AP3A_BC279 , T; Q3LZX0 , AP3A_BCHK3 , T; DR Q3I5J4 , AP3A_BCRP3 , T; P59632 , AP3A_SARS , T; DR P0DTC3 , AP3A_SARS2 , T; Q7T6T1 , NS3B_CVCBG , T; DR P22656 , NS3B_CVPFS , T; P09047 , NS3B_CVPPU , T; DR P24414 , NS3B_CVPRM , T; Q0Q4E9 , NS3D_BC133 , T; DR A3EX98 , NS3D_BCHK4 , T; A3EXD4 , NS3D_BCHK5 , T; DR Q0Q465 , NS3_BC512 , T; A3EXG7 , NS3_BCHK9 , T; DR Q6Q1S1 , NS3_CVHNL , T; Q91AV0 , NS3_PEDV7 , T; DR P19740 , NS4B_CVH22 , T; K9N7D2 , ORF5_MERS1 , T; 3D 6XDC; 7KJR; 8EQJ; 8EQS; 8EQT; 8EQU; PR PRU01312; DO PDOC51966; //