ID UPF1_CH_RICH; MATRIX. AC PS51997; DT 03-AUG-2022 CREATED; 03-AUG-2022 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE Upf1 cysteine-histidine-rich (CH-rich) domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=158; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=158; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4779823; R2=0.0091338; TEXT='-LogE'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1098; N_SCORE=12.5; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=441; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='E'; M=-7,6,-24,3,10,-22,-4,-3,-19,5,-19,-6,10,-13,5,-1,0,-5,-19,-28,-16,7; MA /M: SY='K'; M=-9,0,-27,1,11,-26,-18,-10,-20,14,-21,-11,-2,0,6,4,-3,-2,-16,-26,-14,8; MA /M: SY='E'; M=-10,8,-25,12,15,-25,-18,-7,-23,9,-19,-14,3,-10,6,8,2,4,-17,-29,-14,10; MA /M: SY='L'; M=-9,-17,-26,-15,-10,-3,-24,-15,-2,-12,12,2,-19,-3,-13,-12,-19,-10,-6,-19,-4,-12; MA /M: SY='P'; M=-6,-2,-30,4,6,-30,-16,-11,-22,4,-26,-16,-5,26,5,-5,-1,-5,-22,-29,-20,3; MA /M: SY='E'; M=-8,-3,-29,1,18,-20,-20,-5,-17,8,-15,-5,-7,4,5,-2,-7,-9,-18,-22,-8,11; MA /M: SY='H'; M=-13,-7,-25,-8,0,-10,-22,30,-11,-9,-9,3,-4,-13,-1,-7,-10,-12,-10,-25,4,-2; MA /M: SY='A'; M=12,-9,-22,-11,-3,-23,-6,-9,-21,5,-20,-12,-5,0,-2,6,3,-4,-14,-24,-17,-5; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /M: SY='A'; M=14,-11,-22,-15,-5,-19,-9,-12,-18,1,-18,-11,-8,-14,3,4,2,-5,-13,-2,-11,-1; MA /M: SY='Y'; M=-19,-21,-29,-21,-20,28,-30,15,2,-12,6,2,-21,-30,-11,-11,-21,-10,-8,24,70,-20; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /M: SY='G'; M=0,-5,-28,-3,-1,-28,40,-10,-35,-12,-27,-19,1,-15,-9,-15,2,-15,-27,-24,-25,-5; MA /I: I=-15; MD=-32; MA /M: SY='I'; M=-1,-18,-20,-23,-12,-5,-25,-19,19,-17,11,10,-15,-15,-11,-18,-11,-4,13,-20,-5,-13; D=-15; MA /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='H'; M=7,4,-20,4,4,-24,-9,20,-24,-5,-21,-12,5,-12,2,-8,8,-4,-17,-30,-8,1; MA /M: SY='D'; M=-7,17,-22,21,14,-23,-11,-5,-22,-5,-17,-17,11,-12,1,-8,8,1,-19,-35,-17,7; MA /M: SY='P'; M=1,-18,-27,-16,-7,-18,-20,-20,-7,-7,-9,-7,-17,27,-11,-14,-9,-5,-10,-25,-18,-11; MA /I: I=-14; MD=-29; MA /M: SY='E'; M=1,6,-19,5,8,-20,-10,-2,-18,4,-16,-12,6,-10,2,-2,5,0,-14,-26,-12,4; D=-14; MA /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; MA /M: SY='C'; M=-3,-8,21,-11,-8,-19,-15,-17,-21,-7,-22,-16,-5,-5,-9,-11,7,5,-12,-34,-20,-9; D=-14; MA /I: I=-14; DM=-29; MA /M: SY='V'; M=-5,-30,-16,-30,-25,5,-30,-25,26,-25,29,15,-30,-30,-25,-20,-20,-5,30,-25,-5,-25; MA /M: SY='V'; M=4,-27,-16,-31,-27,-2,-29,-28,30,-22,12,10,-24,-24,-24,-23,-11,-3,36,-25,-8,-27; MA /M: SY='R'; M=-14,-6,-28,-6,8,-17,-21,-3,-22,24,-17,-3,-4,-14,11,28,-10,-10,-18,-18,-5,8; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /M: SY='N'; M=-7,2,-23,-8,-14,-14,4,-10,-5,-15,-7,-4,13,-21,-11,-14,-4,-5,-11,-28,-15,-14; MA /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; MA /M: SY='T'; M=7,-3,-13,-9,-9,-13,-6,-10,-8,-10,-13,-9,2,-12,-8,-11,13,15,-2,-26,-12,-9; D=-13; MA /I: I=-13; DM=-27; MA /M: SY='C'; M=-9,-19,116,-29,-29,-20,-29,-29,-30,-29,-20,-20,-19,-39,-29,-29,-8,-9,-10,-50,-30,-29; MA /M: SY='R'; M=-6,-3,-26,-4,-5,-25,14,-9,-31,8,-28,-16,6,-17,-2,15,3,-8,-22,-25,-19,-5; MA /M: SY='K'; M=-11,0,-30,2,15,-29,-20,-8,-30,43,-28,-11,0,-10,11,30,-9,-10,-21,-21,-11,13; MA /M: SY='W'; M=-16,-34,-23,-35,-29,8,-24,-24,-13,-20,-14,-14,-34,-31,-21,-20,-30,-22,-15,90,24,-22; MA /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29,74,-30,-15,0,-28,9,0,-20,-30,-36,-19,-20,-10,-1,12,36,-29; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /M: SY='N'; M=-9,38,-19,19,0,-20,0,9,-20,-1,-30,-20,57,-19,0,-1,12,1,-29,-40,-20,0; MA /M: SY='G'; M=5,-1,-20,-5,-11,-23,28,-14,-26,-14,-26,-18,9,-16,-11,-14,14,-1,-18,-29,-24,-11; MA /M: SY='R'; M=-10,-5,-23,-9,-4,-9,-13,-8,-22,11,-19,-11,3,-17,-2,22,1,2,-15,-22,-8,-4; MA /M: SY='G'; M=-6,7,-26,9,-6,-24,24,-2,-31,-11,-27,-19,10,-17,-9,-13,5,-9,-25,-25,-14,-8; MA /M: SY='N'; M=0,8,-23,1,-6,-24,16,5,-27,-5,-26,-15,19,-17,-5,-6,5,-8,-24,-29,-17,-6; MA /M: SY='T'; M=2,-2,-15,-7,-7,-17,-5,-17,-18,-4,-19,-13,2,-11,-7,-7,18,26,-8,-29,-15,-7; MA /M: SY='S'; M=1,-1,-4,-5,-4,-18,-6,-13,-21,-2,-25,-16,5,-14,-4,-5,20,13,-12,-34,-17,-4; MA /I: I=-15; MD=-32; MA /M: SY='G'; M=4,-12,-19,-14,-16,-17,21,-18,-11,-16,-14,-9,-5,-16,-15,-17,3,-6,-5,-22,-18,-16; D=-15; MA /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='S'; M=9,-1,-11,-1,-1,-21,4,-11,-21,-11,-30,-20,9,-11,-1,-11,38,18,-11,-39,-21,-1; MA /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0; MA /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30; MA /M: SY='V'; M=-3,-30,-16,-33,-30,0,-33,-30,36,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,44,-27,-7,-30; MA /M: SY='H'; M=-12,2,-21,-6,-7,-3,-16,12,-15,-7,-10,-7,12,-20,-6,2,-1,3,-15,-26,-2,-7; MA /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0; MA /M: SY='L'; M=-3,-27,-19,-29,-19,6,-26,-19,16,-26,41,19,-27,-27,-18,-19,-25,-9,9,-20,-2,-18; MA /M: SY='V'; M=0,-23,-12,-23,-20,-7,-25,-23,18,-15,2,5,-22,-25,-15,-15,-3,1,33,-30,-11,-18; MA /M: SY='R'; M=-12,-10,-26,-10,-2,-16,-20,-8,-18,18,-9,-5,-5,-18,2,30,-8,-6,-12,-22,-9,-2; MA /M: SY='A'; M=21,-7,-11,-12,-7,-15,-6,-16,-10,-12,-11,-10,-3,-12,-7,-15,18,13,-3,-29,-16,-7; MA /M: SY='K'; M=-10,-3,-30,-3,3,-29,-3,-4,-31,29,-27,-11,0,-14,7,24,-8,-12,-23,-20,-12,4; MA /M: SY='H'; M=-20,-1,-25,-1,-1,-20,-20,96,-30,-11,-20,-1,9,-21,9,-1,-10,-20,-29,-31,18,-1; MA /M: SY='K'; M=-12,11,-29,11,9,-29,-16,-5,-30,35,-29,-14,11,-12,7,24,-6,-9,-23,-25,-13,8; MA /M: SY='E'; M=-5,7,-24,13,24,-25,-15,8,-23,-1,-20,-15,2,-9,9,-5,5,-5,-18,-32,-14,16; MA /M: SY='V'; M=-2,-29,-18,-33,-27,1,-31,-28,32,-24,19,14,-26,-26,-24,-23,-16,-5,33,-24,-6,-27; MA /I: I=-15; MD=-32; MA /M: SY='R'; M=-3,-4,-15,-5,6,-18,-16,-5,-17,7,-15,-9,-3,-12,8,9,1,-1,-13,-20,-7,5; D=-15; MA /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='L'; M=-9,-23,-24,-24,-15,-2,-28,-20,11,-17,23,10,-22,-10,-15,-15,-21,-6,3,-22,-6,-16; MA /M: SY='H'; M=-16,-1,-26,-4,-6,-12,-20,64,-18,-10,-15,-1,7,-22,1,-4,-9,-14,-18,-24,19,-6; MA /M: SY='S'; M=6,-6,-23,-5,0,-25,2,-14,-24,2,-26,-16,-2,4,-3,-5,9,-1,-17,-28,-21,-2; MA /M: SY='D'; M=-13,29,-29,41,32,-34,-14,4,-34,5,-25,-23,12,-7,8,-4,0,-10,-29,-34,-18,20; MA /I: I=-10; MD=-21; MA /M: SY='S'; M=0,1,-15,-1,2,-7,-1,-8,-18,-9,-20,-15,8,-12,-4,-9,17,5,-14,-26,-12,-1; D=-10; MA /I: I=-10; MD=-21; MA /M: SY='P'; M=-8,-8,-24,-4,-5,-7,-16,-4,-11,-10,-12,-10,-9,10,-7,-12,-2,-2,-14,-14,6,-8; D=-10; MA /I: I=-10; MD=-21; MA /M: SY='L'; M=-8,-22,-8,-25,-18,8,-24,-17,15,-23,28,12,-21,-22,-17,-17,-20,-8,8,-16,0,-18; D=-10; MA /I: I=-10; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21; MA /M: SY='G'; M=-1,-8,-23,-7,-12,-23,39,-15,-27,-14,-23,-15,-2,-1,-13,-15,0,-12,-22,-17,-23,-13; D=-10; MA /I: I=-10; DM=-21; MA /M: SY='D'; M=-9,23,-20,33,22,-26,-9,-1,-26,1,-21,-19,9,-5,5,-5,5,-4,-20,-28,-15,13; D=-10; MA /I: I=-10; DM=-21; MA /M: SY='T'; M=-1,6,-10,3,-3,-12,-12,-12,-12,-6,-12,-11,4,-8,-5,-8,15,28,-5,-25,-10,-4; D=-10; MA /I: I=-10; DM=-21; MA /M: SY='V'; M=0,-16,-13,-20,-16,-5,-21,-19,16,-14,4,5,-13,-16,-11,-14,-4,5,19,-20,-6,-15; D=-10; MA /I: I=-10; DM=-21; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-32,-22,6,-32,-22,26,-29,41,19,-27,-24,-20,-22,-27,-10,14,-20,-1,-22; MA /M: SY='E'; M=-11,4,-30,10,39,-24,-21,3,-25,12,-19,-14,-2,-6,20,3,-4,-10,-26,-20,-5,29; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /M: SY='Y'; M=-18,-5,-27,-10,-13,14,-22,13,-8,-4,-9,-6,2,-26,-7,1,-12,-8,-16,6,43,-13; MA /M: SY='N'; M=-11,16,-24,9,-2,-18,-13,-3,-12,0,-15,-10,23,-18,-3,0,-1,-4,-16,-32,-14,-3; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /M: SY='G'; M=-1,-6,-29,-6,-4,-28,34,-14,-35,-2,-26,-17,-1,-16,-8,-2,-2,-15,-26,-21,-24,-6; MA /M: SY='T'; M=-3,-3,13,-8,-4,-17,-18,-16,-18,-10,-18,-15,-1,-17,-8,-10,12,18,-7,-36,-18,-6; MA /M: SY='R'; M=-13,3,-28,5,6,-26,-18,-6,-30,31,-26,-13,3,-13,7,34,-4,-5,-20,-24,-12,5; MA /M: SY='N'; M=-9,34,-21,16,-2,-21,9,6,-22,-2,-30,-20,53,-20,-2,-2,9,-2,-30,-38,-21,-2; MA /M: SY='V'; M=-5,-29,-20,-30,-25,-2,-32,-28,29,-23,13,10,-26,-13,-24,-23,-15,-5,30,-26,-8,-26; MA /M: SY='F'; M=-18,-26,-19,-36,-28,69,-29,-20,-1,-28,8,-1,-18,-28,-36,-19,-15,-3,0,5,25,-28; MA /M: SY='V'; M=-4,-15,-18,-17,-13,-6,-21,-17,6,-12,7,4,-11,-21,-12,-11,-5,-1,8,-27,-9,-13; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20; MA /M: SY='G'; M=-1,-12,-29,-12,-20,-25,58,-20,-33,-21,-21,-15,-4,-21,-20,-20,-4,-19,-25,-20,-26,-20; MA /M: SY='F'; M=-19,-25,-21,-33,-19,67,-29,-18,-4,-25,6,-2,-18,-26,-33,-18,-18,-10,-4,5,24,-22; MA /M: SY='I'; M=-9,-21,-24,-29,-23,0,-30,-20,31,-23,20,19,-14,-23,-16,-21,-18,-8,18,-23,-3,-22; MA /M: SY='P'; M=-6,-13,-32,-8,0,-29,-7,-15,-22,-9,-28,-17,-10,47,-2,-15,0,-4,-26,-29,-25,-4; MA /M: SY='A'; M=20,-9,-14,-15,-13,-17,5,-20,-12,-13,-13,-10,-6,-14,-13,-17,11,9,0,-25,-18,-13; MA /M: SY='K'; M=-10,-1,-30,-1,9,-29,-19,-10,-29,44,-30,-11,0,-6,9,28,-8,-9,-20,-21,-11,8; MA /I: I=-10; MD=-21; MA /M: SY='E'; M=10,-1,-17,-2,12,-23,-10,-7,-17,2,-17,-11,-1,-7,11,-4,9,2,-13,-23,-15,12; D=-10; MA /I: I=-10; MD=-21; MA /M: SY='D'; M=-13,27,-25,35,29,-29,-12,1,-29,6,-23,-21,15,-7,7,-2,1,-8,-26,-31,-17,18; D=-10; MA /I: I=-10; MD=-21; MA /M: SY='S'; M=14,-2,-12,-6,-4,-18,2,-12,-16,-8,-19,-13,3,-10,-2,-11,19,12,-9,-27,-17,-3; D=-10; MA /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; MA /M: SY='V'; M=-2,-24,6,-26,-25,-2,-25,-23,18,-18,6,11,-24,-27,-23,-18,-10,-2,32,-28,-10,-24; D=-10; MA /I: I=-10; DM=-21; MA /M: SY='V'; M=1,-19,-9,-20,-20,-4,-22,-23,16,-15,1,3,-18,-22,-20,-15,1,8,31,-28,-10,-20; D=-10; MA /I: I=-10; DM=-21; MA /M: SY='V'; M=0,-20,-11,-22,-23,-5,-13,-24,13,-16,1,3,-19,-23,-23,-16,-4,3,28,-25,-11,-23; D=-10; MA /I: I=-10; DM=-21; MA /M: SY='L'; M=-10,-29,-8,-34,-26,2,-34,-26,27,-30,29,15,-24,-27,-21,-26,-23,-10,16,-24,-4,-26; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-34,-25,14,-33,-24,27,-29,33,17,-26,-27,-23,-23,-24,-9,18,-18,2,-25; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /M: SY='R'; M=-18,-5,-10,-9,-4,-20,-19,-3,-29,19,-21,-12,5,-22,4,49,-8,-9,-20,-26,-14,-4; MA /M: SY='Q'; M=-7,1,-23,4,5,-23,-10,-10,-14,-6,-12,-8,-3,-14,6,-8,0,1,-10,-27,-14,5; MA /I: I=-15; MD=-32; MA /M: SY='P'; M=-8,-8,-28,-4,0,-22,-13,-12,-15,-6,-23,-15,-5,55,-6,-13,-5,-6,-23,-24,-22,-6; D=-15; MA /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /M: SY='A'; M=13,-13,-18,-17,-9,-13,-10,-14,-10,-5,-1,-5,-10,-17,-7,3,-1,-3,-5,-22,-13,-9; MA /I: I=-1; MD=-2; MA /M: SY='H'; M=2,-6,-17,-9,-5,-11,-11,9,-10,-5,-11,1,-2,-14,4,-4,4,0,-9,-18,3,-2; D=-1; MA /I: I=-1; MD=-2; MA /M: SY='S'; M=-2,-4,-17,-8,-7,-10,-9,-4,-7,-7,-13,-6,3,-16,-1,-5,6,2,-6,-19,-2,-5; D=-1; MA /I: I=-1; MD=-2; MA /M: SY='H'; M=-2,0,-11,-4,-3,-14,-12,5,-16,-2,-17,-9,4,-4,-2,-4,4,4,-13,-22,-5,-4; D=-1; MA /I: I=-1; MD=-2; MA /M: SY='T'; M=1,0,-13,-2,-6,-8,-12,-12,-5,-10,-9,-8,0,-10,-8,-12,8,10,-2,-22,-8,-7; D=-1; MA /I: I=-1; MD=-2; MA /M: SY='L'; M=-2,-11,-16,-13,-5,-9,-16,-9,4,-10,5,4,-8,-13,3,-9,-3,-1,0,-17,-5,-2; D=-1; MA /I: I=-1; MI=0; MD=-2; IM=0; DM=-2; MA /M: SY='K'; M=-10,3,-26,3,13,-25,-16,-5,-26,34,-24,-11,4,-9,9,25,-6,-8,-19,-20,-11,11; D=-1; MA /I: I=-1; DM=-2; MA /M: SY='D'; M=-6,27,-22,31,9,-26,-8,-2,-21,-2,-19,-16,16,-11,-1,-9,1,-6,-18,-31,-16,4; D=-1; MA /I: I=-1; DM=-2; MA /M: SY='M'; M=-6,-13,-20,-15,-9,-9,-21,-10,7,-8,10,15,-13,-17,0,-8,-14,-8,3,-19,-5,-5; D=-1; MA /I: I=-1; DM=-2; MA /M: SY='N'; M=-7,20,-22,13,-1,-22,5,-1,-22,-4,-26,-19,29,-2,-4,-6,6,-3,-25,-32,-20,-3; D=-1; MA /I: I=-1; DM=-2; MA /M: SY='W'; M=-18,-30,-42,-30,-23,5,-18,-10,-19,-16,-18,-15,-29,-25,-14,-15,-32,-25,-26,110,25,-15; D=-1; MA /I: I=-1; DM=-2; MA /M: SY='D'; M=-14,36,-25,50,21,-32,-9,0,-32,1,-25,-24,16,-8,2,-7,3,-7,-25,-34,-18,12; D=-1; MA /I: I=-1; DM=-2; MA /M: SY='T'; M=-1,-14,-17,-16,-10,-9,-18,-13,0,-8,1,2,-11,-11,-6,-3,-3,3,3,-22,-9,-9; D=-1; MA /I: I=-1; DM=-2; MA /M: SY='S'; M=-3,11,-18,13,12,-24,-9,-4,-21,0,-22,-15,9,-8,9,-3,14,6,-17,-30,-15,10; D=-1; MA /I: I=-1; DM=-2; MA /M: SY='S'; M=-4,1,-19,0,3,-23,-14,-2,-20,2,-20,-11,4,-12,11,3,13,12,-15,-30,-12,7; MA /M: SY='W'; M=-18,-35,-44,-36,-29,14,-11,-28,-20,-21,-17,-18,-33,-29,-22,-20,-33,-26,-26,113,23,-21; MA /M: SY='Q'; M=-7,-8,-19,-10,2,-21,-22,-7,-12,5,-5,0,-8,-16,16,3,-7,-3,-13,-22,-9,9; MA /M: SY='P'; M=-6,-12,-30,-6,5,-24,-16,-13,-17,-8,-23,-11,-11,44,-3,-14,1,-3,-21,-31,-23,-2; MA /M: SY='L'; M=-8,-29,-20,-32,-24,5,-30,-21,27,-26,34,23,-27,-27,-19,-20,-23,-8,21,-22,-2,-22; MA /M: SY='I'; M=-8,-30,-25,-38,-30,0,-38,-30,45,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,35,-22,-2,-30; MA /M: SY='E'; M=-4,8,-9,12,32,-28,-17,-5,-27,1,-21,-19,1,-8,9,-6,2,-7,-24,-33,-21,21; MA /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; MA /M: SY='D'; M=-15,32,-30,47,38,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,11,-5,9,-5,0,-10,-30,-35,-20,24; MA /M: SY='R'; M=-17,-9,-30,-9,-1,-22,-9,-3,-31,26,-22,-11,0,-19,6,55,-9,-11,-21,-20,-12,-1; MA /M: SY='C'; M=3,-9,18,-15,-6,-22,-18,-13,-22,-2,-18,-11,-8,-20,4,-4,-1,-6,-14,-28,-17,-1; MA /M: SY='F'; M=-7,-28,-18,-34,-24,41,-26,-20,7,-27,20,6,-22,-28,-29,-20,-19,-8,6,-5,12,-24; MA /M: SY='L'; M=-5,-22,-10,-24,-18,1,-25,-20,10,-24,25,8,-21,-26,-18,-18,-12,2,10,-26,-6,-18; MA /I: I=-14; MD=-29; MA /M: SY='P'; M=-3,1,-22,1,6,-20,-10,-8,-19,1,-24,-16,6,14,-1,-4,7,0,-19,-28,-18,1; D=-14; MA /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; MA /M: SY='W'; M=-14,-28,-37,-27,-16,3,-19,-23,-13,-14,-14,-14,-29,-23,-14,-15,-27,-20,-17,89,16,-12; D=-14; MA /I: I=-14; DM=-29; MA /M: SY='I'; M=-10,-21,-24,-28,-22,1,-31,-21,29,-26,25,15,-14,-24,-18,-22,-20,-8,16,-23,-3,-22; MA /M: SY='V'; M=-1,-16,16,-17,-22,-11,-25,-25,5,-19,-3,-3,-19,-28,-24,-21,-7,-4,21,-34,-16,-23; MA /M: SY='K'; M=-5,3,-26,0,4,-24,-14,5,-24,13,-25,-12,7,-1,3,8,0,-3,-21,-28,-12,2; MA /M: SY='I'; M=-4,-15,-22,-17,-10,-14,-23,-15,7,-14,-1,2,-11,-7,-2,-14,-4,-1,3,-26,-11,-7; MA /M: SY='P'; M=-10,-18,-39,-9,1,-30,-20,-19,-21,-3,-30,-19,-18,78,-8,-14,-10,-10,-29,-29,-28,-8; MA /M: SY='S'; M=4,-3,-14,-3,3,-16,-9,-11,-15,-10,-16,-14,2,-11,-2,-10,24,17,-8,-35,-16,1; MA /M: SY='E'; M=-2,5,-21,5,14,-20,-17,-8,-11,-2,-13,-11,3,-13,1,-7,1,-2,-6,-31,-16,7; MA /M: SY='E'; M=-9,7,-28,14,26,-30,-19,-2,-21,2,-16,-12,-1,-4,19,-3,-2,-7,-22,-28,-16,22; MA /M: SY='E'; M=-10,7,-23,14,36,-30,-7,-4,-32,4,-22,-19,0,-7,12,0,-1,-11,-28,-29,-21,24; MA /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; MA /M: SY='Q'; M=-7,2,-19,4,8,-19,-14,-1,-10,1,-8,2,-3,-10,14,-1,-3,-6,-11,-20,-9,11; D=-8; MA /I: I=-8; DM=-17; MA /M: SY='L'; M=-1,-10,-15,-12,-5,-7,-15,-12,-2,-7,4,-1,-8,-14,-6,-3,-2,4,-1,-20,-7,-6; D=-8; MA /I: I=-8; DM=-17; MA /M: SY='R'; M=-3,-7,-20,-11,-4,-13,-15,-8,-9,10,-8,-3,-2,-13,0,19,-6,-6,-6,-16,-8,-4; D=-8; MA /I: I=-8; DM=-17; MA /M: SY='A'; M=16,-11,-11,-15,-11,-10,-2,-16,-3,-12,-1,-3,-10,-13,-11,-14,2,1,4,-19,-12,-11; D=-8; MA /I: I=-8; DM=-17; MA /M: SY='R'; M=-15,-4,-30,-4,10,-24,-20,-1,-25,24,-20,-9,2,-15,15,41,-7,-10,-21,-22,-11,10; MA /M: SY='R'; M=-11,-9,-27,-8,2,-22,-19,1,-20,10,-14,-6,-4,-6,12,20,-5,-7,-18,-24,-10,5; MA /M: SY='I'; M=-9,-27,-24,-33,-24,3,-33,-25,32,-28,29,17,-22,-23,-19,-24,-20,-6,19,-21,-1,-24; MA /M: SY='T'; M=3,0,-10,-7,-7,-13,-15,-17,-13,-10,-15,-13,3,-10,-7,-10,25,42,-3,-33,-13,-7; MA /M: SY='A'; M=1,-12,-24,-13,-6,-10,-17,-7,-10,1,-10,-6,-9,-6,-5,-5,-4,-5,-9,-17,0,-7; MA /M: SY='Q'; M=-8,-3,-27,-4,10,-28,-19,15,-18,3,-18,-3,-1,-9,36,3,0,-6,-24,-19,-1,22; MA /M: SY='Q'; M=-9,7,-26,7,12,-32,-15,3,-21,9,-21,-6,7,-12,31,5,3,-5,-24,-26,-13,21; MA /M: SY='I'; M=-7,-16,-24,-21,-20,-6,-27,-17,25,-19,11,22,-15,-19,-12,-21,-15,-9,17,-23,-5,-18; MA /M: SY='A'; M=10,1,-16,-8,-7,-17,-9,-10,-11,-1,-14,-10,7,-17,-6,0,6,2,-6,-28,-16,-7; MA /M: SY='K'; M=-7,-1,-25,-2,9,-24,-19,-9,-25,28,-22,-11,-1,-11,7,24,-2,1,-17,-23,-12,7; MA /M: SY='L'; M=-11,-25,-21,-28,-18,3,-26,-12,15,-16,31,28,-23,-26,-11,-6,-24,-10,7,-20,-1,-15; MA /M: SY='E'; M=-3,11,-26,15,44,-28,-15,-1,-26,6,-20,-19,6,-4,14,-2,2,-8,-26,-30,-20,29; MA /M: SY='E'; M=-7,-3,-30,2,26,-20,-18,-6,-22,4,-14,-12,-8,-10,8,3,-8,-11,-22,-6,-11,17; MA /M: SY='R'; M=-12,-15,-24,-16,-2,-2,-23,-9,-6,-3,8,4,-13,-20,-3,9,-14,-8,-7,-19,-4,-3; MA /M: SY='W'; M=-18,-26,-40,-28,-22,3,-19,-20,-17,-13,-13,-14,-22,-28,-14,-6,-29,-22,-24,86,16,-15; MA /M: SY='R'; M=-11,-7,-27,-9,2,-21,-23,-9,-11,18,-15,-4,-3,-16,8,20,-9,-8,-8,-23,-10,3; MA /M: SY='N'; M=-6,7,-22,3,7,-19,-14,-5,-10,-4,-15,-8,11,-13,4,-6,6,1,-13,-32,-14,5; MA /M: SY='N'; M=-10,18,-27,13,7,-26,-11,4,-25,12,-28,-17,23,-2,3,4,0,-6,-26,-32,-16,4; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=11(11); /POSITIVE=11(11); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=Upf1 CH-rich; CC /VERSION=1; DR Q9FJR0 , RENT1_ARATH, T; O76512 , RENT1_CAEEL, T; DR F1RCY6 , RENT1_DANRE, T; Q54I89 , RENT1_DICDI, T; DR Q9VYS3 , RENT1_DROME, T; Q92900 , RENT1_HUMAN, T; DR Q9EPU0 , RENT1_MOUSE, T; Q9HEH1 , RENT1_NEUCR, T; DR Q09820 , RENT1_SCHPO, T; Q98TR3 , RENT1_TAKRU, T; DR P30771 , RENT1_YEAST, T; 3D 2IYK; 2WJV; 2WJY; 2XZL; PR PRU01341; DO PDOC51997; //