ID COV_NSP12_IF; MATRIX. AC PS52000; DT 12-OCT-2022 CREATED; 12-OCT-2022 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE Coronavirus Nsp12 Interface domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=99; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=94; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0515165; R2=0.0122455; TEXT='-LogE'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=976; N_SCORE=14.0; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=364; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='R'; M=-13,-11,-29,-13,-4,-19,-25,-12,-10,23,-14,-2,-6,-16,2,28,-12,-10,-6,-20,-8,-4; MA /M: SY='E'; M=-3,-2,-20,-2,11,-20,-18,-9,-15,2,-14,-9,-3,-11,8,-2,8,8,-10,-29,-13,10; MA /M: SY='W'; M=-20,-31,-33,-34,-27,42,-27,-12,-7,-21,-3,-7,-27,-30,-25,-17,-27,-17,-13,63,44,-24; MA /M: SY='D'; M=-19,39,-31,57,16,-37,-12,-3,-35,-2,-26,-27,14,-1,-2,-11,-2,-10,-28,-38,-20,7; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,22,-30,48,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,12,-20,0,-21; MA /M: SY='L'; M=-8,-27,-6,-29,-22,4,-29,-23,16,-27,33,13,-27,-29,-22,-20,-21,-4,15,-25,-5,-22; MA /M: SY='K'; M=0,0,-27,1,19,-30,-17,-6,-25,25,-23,-10,-2,-8,18,12,-3,-8,-21,-22,-14,19; MA /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20; MA /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10; MA /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-34,-27,66,-30,-8,0,-24,7,0,-20,-30,-31,-17,-20,-10,-3,16,44,-27; MA /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10; MA /M: SY='E'; M=-12,24,-29,36,39,-34,-15,0,-32,5,-23,-22,7,-5,15,-4,0,-10,-29,-33,-19,27; MA /M: SY='H'; M=-18,-7,-28,-7,5,6,-24,37,-18,-8,-10,-5,-5,-19,0,-6,-12,-13,-20,-8,28,0; MA /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,48,-29,-10,0,-11,10,34,-10,-10,-20,-20,-10,9; MA /M: SY='L'; M=-9,-15,-23,-14,1,-7,-27,-11,4,-12,10,4,-16,-19,-1,-11,-12,-5,1,-20,-1,-1; MA /M: SY='E'; M=-4,4,-11,4,10,-23,-9,-6,-22,-1,-21,-15,4,-15,2,-6,2,-6,-17,-29,-15,6; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20; MA /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30; MA /M: SY='N'; M=-10,26,-23,19,9,-26,-7,10,-23,1,-27,-16,33,-15,12,0,8,-2,-28,-35,-16,10; MA /M: SY='K'; M=-11,-1,-30,-1,9,-29,-20,-9,-30,48,-29,-10,0,-11,10,34,-10,-10,-20,-20,-10,9; MA /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20; MA /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30; MA /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10; MA /M: SY='Y'; M=-20,-13,-30,-13,-13,13,-27,47,-10,-10,-7,0,-10,-27,-3,-7,-17,-13,-17,10,60,-13; MA /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20; MA /M: SY='D'; M=-9,26,-26,37,6,-34,11,-7,-36,-7,-30,-26,13,-12,-5,-12,8,-7,-26,-35,-22,1; MA /M: SY='Q'; M=-12,-10,-26,-13,2,-18,-21,3,-7,2,-4,16,-8,-16,29,7,-9,-10,-14,-18,-4,16; MA /M: SY='T'; M=-6,7,-21,6,9,-23,-19,-10,-19,-1,-18,-13,1,-2,6,-5,9,19,-15,-29,-14,7; MA /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20; MA /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0; MA /M: SY='P'; M=-6,-19,-38,-11,-1,-29,-19,-20,-19,-10,-29,-19,-19,83,-10,-20,-9,-9,-28,-29,-29,-10; MA /M: SY='N'; M=-11,41,-21,24,1,-21,-1,9,-21,0,-30,-21,57,-19,0,-1,9,-1,-30,-40,-20,1; MA /M: SY='C'; M=-8,-16,96,-26,-26,-18,-28,-28,-26,-26,-18,-18,-16,-35,-26,-26,-5,1,-8,-46,-26,-26; MA /M: SY='V'; M=-3,-19,-9,-20,-15,-9,-24,-21,9,-11,-3,0,-16,-23,-16,-7,-2,0,21,-31,-13,-16; MA /M: SY='D'; M=-11,40,-26,46,15,-32,-7,1,-32,0,-28,-25,27,-12,1,-7,3,-7,-28,-38,-20,8; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /M: SY='S'; M=-1,-3,-20,-4,0,-16,-11,6,-16,-10,-12,-8,-1,-15,1,-9,7,5,-13,-26,-5,-1; MA /M: SY='D'; M=-17,45,-28,61,17,-37,-9,0,-37,-1,-30,-29,21,-10,0,-10,4,-7,-28,-40,-20,9; MA /M: SY='D'; M=-18,42,-30,60,28,-38,-12,0,-38,2,-28,-28,16,-8,4,-8,0,-10,-30,-38,-20,16; MA /M: SY='R'; M=-15,-8,-27,-9,4,-19,-19,0,-22,19,-15,-2,-2,-17,12,44,-6,-8,-17,-22,-10,5; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /M: SY='I'; M=-9,-30,-26,-37,-29,1,-37,-29,44,-29,23,19,-23,-23,-21,-27,-20,-9,30,-21,-1,-29; MA /M: SY='I'; M=-9,-30,-23,-35,-26,4,-35,-26,35,-29,31,19,-25,-25,-21,-25,-23,-9,24,-21,-1,-26; MA /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,96,-30,-8,-20,0,10,-20,10,3,-10,-20,-30,-30,19,0; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /M: SY='A'; M=47,-9,-10,-19,-9,-20,0,-19,-11,-10,-11,-11,-9,-10,-9,-19,12,1,-1,-21,-20,-9; MA /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0; MA /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30; MA /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0; MA /M: SY='V'; M=-4,-20,-18,-27,-23,-3,-30,-27,24,-20,7,7,-16,-19,-19,-20,-3,14,25,-26,-6,-23; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20; MA /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30; MA /M: SY='S'; M=21,-3,-10,-5,-3,-20,0,-13,-17,-10,-25,-17,5,-10,-3,-13,32,15,-7,-35,-20,-3; MA /M: SY='M'; M=-5,-10,-15,-20,-15,-5,-20,-10,5,-10,5,25,-10,-15,-5,-10,0,20,5,-25,-5,-10; MA /M: SY='V'; M=-1,-17,-11,-22,-20,-3,-26,-25,12,-17,7,3,-17,-22,-20,-16,0,20,24,-29,-9,-20; MA /M: SY='I'; M=-11,-29,-24,-35,-26,12,-33,-23,31,-28,29,20,-24,-25,-21,-23,-23,-9,20,-17,3,-25; MA /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; MA /M: SY='N'; M=-8,6,-26,-1,-2,-22,-9,-4,-12,1,-20,-8,16,-5,4,-3,0,-6,-18,-29,-16,0; MA /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10; MA /M: SY='C'; M=19,-8,22,-14,-11,-20,-7,-18,-19,-15,-21,-17,-4,-17,-11,-18,17,6,-7,-36,-22,-11; MA /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30; MA /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20; MA /M: SY='P'; M=-10,-12,-37,-6,0,-29,-17,-16,-20,-9,-30,-20,-10,76,-9,-17,-7,-9,-30,-31,-29,-9; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,9,-31,-21,24,-30,46,20,-29,-29,-20,-21,-29,-10,13,-20,0,-21; MA /M: SY='C'; M=-4,-26,40,-30,-30,-8,-30,-30,7,-24,-2,-2,-26,-34,-30,-24,-10,-4,27,-38,-18,-30; MA /M: SY='R'; M=-19,-9,-30,-9,2,-22,-20,1,-29,28,-20,-9,0,-19,14,65,-9,-10,-21,-20,-10,3; MA /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,12,-32,-20,-6,-28,43,-28,-8,0,-10,19,26,-8,-10,-22,-20,-10,15; MA /M: SY='I'; M=-6,-29,-4,-35,-30,-3,-35,-30,33,-26,11,11,-24,-26,-25,-26,-15,-6,32,-27,-7,-30; MA /M: SY='F'; M=-20,-28,-25,-35,-26,58,-28,-7,-5,-25,3,-3,-20,-29,-30,-17,-22,-13,-7,25,33,-25; MA /M: SY='V'; M=-3,-30,-17,-33,-30,0,-33,-30,37,-23,13,13,-27,-27,-27,-23,-13,-3,43,-27,-7,-30; MA /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10; MA /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20; MA /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30; MA /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; MA /M: SY='F'; M=-15,-30,-18,-37,-28,54,-30,-22,9,-28,17,5,-23,-30,-35,-20,-20,-8,10,-2,18,-28; MA /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30; MA /M: SY='V'; M=10,-20,-10,-24,-22,-6,-22,-26,15,-16,2,2,-20,-22,-22,-18,0,9,31,-28,-12,-22; MA /M: SY='T'; M=5,0,-10,-5,-5,-15,-10,-15,-15,-10,-20,-15,5,-10,-5,-10,30,34,-5,-35,-15,-5; MA /M: SY='C'; M=13,-14,22,-24,-19,-14,-19,-25,-5,-19,-7,-7,-13,-20,-17,-23,1,5,3,-30,-17,-19; MA /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20; MA /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20; MA /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0; MA /M: SY='F'; M=-16,-22,-23,-27,-22,47,-26,-2,-3,-19,1,-3,-16,-27,-23,-15,-12,-6,-5,12,44,-22; MA /M: SY='K'; M=-12,-2,-30,-2,8,-28,-20,-8,-30,46,-28,-10,0,-12,10,38,-10,-10,-20,-20,-10,8; MA /M: SY='E'; M=-10,7,-30,13,46,-33,-20,3,-27,10,-20,-13,0,-3,34,3,0,-10,-30,-27,-17,40; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20; MA /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20; MA /M: SY='I'; M=-6,-30,-18,-33,-27,3,-33,-27,33,-26,24,16,-27,-27,-24,-23,-18,-6,33,-24,-4,-27; MA /M: SY='V'; M=-1,-30,-13,-31,-30,0,-31,-30,33,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,47,-29,-9,-30; MA /M: SY='W'; M=-15,-25,-32,-30,-21,1,-20,1,0,-13,2,25,-24,-23,-6,-12,-26,-18,-8,38,13,-12; MA /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0; MA /M: SY='Q'; M=-10,-7,-25,-12,0,-19,-20,-1,-5,6,-1,17,-6,-16,18,4,-11,-9,-11,-21,-6,9; MA /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10; MA /M: SY='V'; M=-4,-21,-14,-25,-25,1,-27,-23,23,-20,11,8,-17,-28,-24,-18,-11,-2,31,-28,-8,-25; MA /M: SY='N'; M=-10,26,-22,20,3,-23,-8,0,-24,5,-27,-19,31,-15,0,5,8,4,-23,-35,-17,1; MA /M: SY='L'; M=-7,-17,-18,-22,-14,-2,-26,-16,10,-18,19,14,-16,-20,-8,-14,-10,9,5,-23,-4,-12; MA /M: SY='H'; M=-16,5,-27,6,2,-22,-17,77,-30,-9,-22,-5,11,-18,8,-2,-3,-14,-27,-32,11,1; MA /M: SY='R'; M=-1,-8,-18,-11,-6,-6,-12,-10,-19,1,-18,-12,0,-16,-4,14,12,7,-10,-24,-9,-6; MA /M: SY='H'; M=-5,-7,-19,-9,-6,-9,-15,13,-11,-9,-14,-2,-2,-17,2,-7,8,4,-9,-21,8,-4; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=30(30); /POSITIVE=30(30); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=????V; /MAX-REPEAT=1; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=Nsp12 Interface; CC /VERSION=1; DR P0C6W1 , R1AB_BC133 , T; P0C6V9 , R1AB_BC279 , T; DR P0C6W0 , R1AB_BC512 , T; P0C6W2 , R1AB_BCHK3 , T; DR P0C6W3 , R1AB_BCHK4 , T; P0C6W4 , R1AB_BCHK5 , T; DR P0C6W5 , R1AB_BCHK9 , T; P0C6W6 , R1AB_BCRP3 , T; DR P0C6W7 , R1AB_CVBEN , T; P0C6W8 , R1AB_CVBLU , T; DR P0C6W9 , R1AB_CVBM , T; P0C6X0 , R1AB_CVBQ , T; DR P0C6X1 , R1AB_CVH22 , T; P0C6X2 , R1AB_CVHN1 , T; DR P0C6X3 , R1AB_CVHN2 , T; P0C6X4 , R1AB_CVHN5 , T; DR P0C6X5 , R1AB_CVHNL , T; P0C6X6 , R1AB_CVHOC , T; DR P0C6X8 , R1AB_CVM2 , T; P0C6X9 , R1AB_CVMA5 , T; DR P0C6Y0 , R1AB_CVMJH , T; P0C6Y5 , R1AB_CVPPU , T; DR Q98VG9 , R1AB_FIPV , T; P0C6Y1 , R1AB_IBVB , T; DR P0C6Y2 , R1AB_IBVBC , T; P0C6Y3 , R1AB_IBVM , T; DR K9N7C7 , R1AB_MERS1 , T; P0C6Y4 , R1AB_PEDV7 , T; DR P0C6X7 , R1AB_SARS , T; P0DTD1 , R1AB_SARS2 , T; 3D 6M71; 6NUR; 6NUS; 6YYT; 7BTF; 7BV1; 7BV2; 7BZF; 7C2K; 7CYQ; 7L1F; 7O7Y; 3D 7O7Z; 7O80; 7O81; 8GY6; PR PRU01344; DO PDOC51948; //