ID   AD; MATRIX.
AC   PS52001;
DT   12-OCT-2022 CREATED; 12-OCT-2022 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   AD domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=95;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=90;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1351166; R2=0.0069454; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1133; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=629; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-22; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380;
MA   /I: B1=0; BI=-380; BD=-380;
MA   /M: SY='P'; M=6,-50,9,25,-63,-19,18,-54,-1,-49,-34,2,53,22,2,19,7,-51,-80,-34;
MA   /M: SY='P'; M=4,-58,-17,3,-27,-51,-2,-23,-2,-31,-34,9,45,-2,4,32,-6,11,-30,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-34,-71,-66,-75,-16,-73,-74,46,-56,51,21,-61,-32,-24,-75,-52,-26,46,-75,-36;
MA   /M: SY='D'; M=-42,-75,68,3,-60,-28,22,-39,-14,-72,-71,66,-24,9,-25,13,-3,-62,-91,-55;
MA   /I: I=-16; MD=-40;
MA   /M: SY='I'; M=-17,-23,-16,0,-5,-39,-14,35,-5,18,7,0,-15,-30,-24,-10,1,15,-19,-38; D=-16;
MA   /I: I=-16; MD=-40;
MA   /M: SY='E'; M=17,-2,19,28,-42,-6,0,-11,5,-43,-20,13,-7,15,-21,-1,1,-21,-82,-53; D=-16;
MA   /I: I=-16; MD=-40;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-21,8,20,-19,-40,-16,-34,32,-24,-17,-9,-16,28,38,-3,-15,-31,-79,-41; D=-16;
MA   /I: I=-16; MD=-40;
MA   /M: SY='L'; M=-15,-3,-10,-1,-30,-52,-39,30,-28,35,0,-34,-15,-22,-45,-29,-10,29,-36,-31; D=-16;
MA   /I: I=-16; MD=-40;
MA   /M: SY='E'; M=-15,-79,11,40,-46,-56,-12,-26,30,-33,-34,11,-32,37,26,-10,-9,-27,-81,-51; D=-16;
MA   /I: I=-16; MD=-40;
MA   /M: SY='A'; M=21,-55,1,19,-46,-31,-9,-37,16,-25,-28,11,-41,20,-2,21,20,-40,-83,-68; D=-16;
MA   /I: I=-16; MD=-40;
MA   /M: SY='R'; M=-23,-28,-30,-17,-18,-78,-25,-18,8,0,-17,-20,-35,-8,77,-33,-21,-31,-19,-44; D=-16;
MA   /I: I=-16; MD=-40;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-61,-21,48,-2,-54,-44,-3,-22,24,10,-60,-41,2,-28,-40,-11,-14,-78,-16; D=-16;
MA   /I: I=-16; MD=-40;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-84,2,26,-84,-65,-3,-71,34,-68,-21,8,-48,29,54,-17,-58,-62,-85,-55; D=-16;
MA   /I: I=-16; MD=-40;
MA   /M: SY='H'; M=-5,-82,-8,7,-73,-69,21,-20,19,6,0,3,-47,17,13,-19,-28,-27,-85,-27; D=-16;
MA   /I: I=-16; MD=-40;
MA   /M: SY='A'; M=39,-53,-33,15,-83,-57,-57,-38,-21,-53,-35,16,-47,25,-19,19,-2,-38,-53,-61; D=-16;
MA   /I: I=-16; MD=-40;
MA   /M: SY='I'; M=-26,-39,-85,-25,-52,-61,-39,30,-37,-4,-30,-31,-47,-41,-42,3,-19,24,-94,-52; D=-16;
MA   /I: I=-16; MI=0; MD=-40; IM=0; DM=-40;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-64,-10,31,-87,-54,-58,-37,-9,-14,-19,-52,-18,-7,5,-10,-25,-38,-95,-58; D=-16;
MA   /I: I=-16; DM=-40;
MA   /M: SY='Q'; M=-19,-87,-25,21,34,-66,-27,-38,-1,-11,-22,-14,-50,38,-10,-20,-41,-62,-43,-19; D=-16;
MA   /I: I=-16; DM=-40;
MA   /M: SY='R'; M=9,-44,-50,-9,-8,-64,-15,-25,26,-2,-17,-22,-7,0,33,-29,-31,-36,-82,-33; D=-16;
MA   /I: I=-16; DM=-40;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-57,-42,14,-35,-11,-25,-66,34,-36,-25,-5,4,34,31,-14,-12,-56,-60,-48; D=-16;
MA   /I: I=-16; DM=-40;
MA   /M: SY='N'; M=-8,-42,4,26,-37,-27,-18,-27,27,-36,-31,27,7,6,20,-9,-13,-35,-84,-70; D=-16;
MA   /I: I=-16; DM=-40;
MA   /M: SY='E'; M=20,-74,4,37,-26,-27,3,-42,11,-16,-24,-5,-15,23,15,10,5,-35,-29,-16;
MA   /I: I=-38; MI=0; MD=-97; IM=0; DM=-97;
MA   /M: SY='C'; M=26,35,-18,17,-34,-54,-45,5,-2,7,-5,-26,-15,11,-4,-3,13,0,-78,-28;
MA   /I: I=-36; MI=0; MD=-90; IM=0; DM=-90;
MA   /M: SY='R'; M=8,-17,4,17,-72,-33,3,-56,34,-24,-34,2,-31,26,35,15,7,-28,-78,-22;
MA   /M: SY='R'; M=21,-31,-35,-8,-3,-44,9,-12,0,9,19,12,-31,1,24,8,5,-13,-75,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-34,-18,-3,-34,-1,-43,-5,34,-1,11,20,-26,-11,-1,24,-3,-9,-1,5,17;
MA   /M: SY='G'; M=-17,-35,2,-19,-63,46,3,-30,8,-76,-68,39,-8,4,-5,38,2,-52,-81,-69;
MA   /M: SY='P'; M=1,-17,-6,34,-46,-31,-21,-17,25,-52,-29,-25,43,24,-10,16,-8,4,-79,-55;
MA   /I: I=-36; MI=0; MD=-90; IM=0; DM=-90;
MA   /M: SY='G'; M=-30,-58,27,38,-78,55,6,-50,7,-56,-70,39,-44,-1,-30,-15,-26,-76,1,-47;
MA   /M: SY='V'; M=6,-27,-78,-42,-37,-62,-45,27,-71,22,5,-63,-61,-70,-49,-33,-8,71,-19,-40;
MA   /M: SY='S'; M=-18,-69,1,12,-60,-29,-35,-52,-2,-36,-49,-15,6,1,-21,64,52,-48,-43,-67;
MA   /M: SY='P'; M=10,-38,-17,23,-54,-46,-12,-27,26,-30,-22,-9,55,18,21,4,-17,-26,-78,-35;
MA   /M: SY='E'; M=-35,-79,5,66,-52,-69,5,-45,-1,-17,-36,-21,-46,1,63,-38,-24,-31,-47,-24;
MA   /M: SY='G'; M=39,-34,-28,-41,-68,55,-49,-67,36,-62,-66,-46,-68,-12,39,-31,-24,-48,-76,-70;
MA   /M: SY='Q'; M=-18,-37,-12,13,-79,-47,-26,-19,10,-34,-39,-2,-50,100,17,-19,-42,-42,-40,-54;
MA   /I: I=-28; MI=0; MD=-70; IM=0; DM=-70;
MA   /M: SY='K'; M=31,-38,19,16,-33,-49,-15,-43,39,-29,-4,7,-67,26,20,3,-17,-45,-77,-32;
MA   /M: SY='L'; M=-25,-41,-83,-78,-27,-84,-75,50,-76,59,3,-78,-79,-73,-76,-61,-26,44,-75,-45;
MA   /M: SY='F'; M=-50,1,-79,-65,92,-81,-50,10,10,-8,-7,-71,-80,-39,-4,-69,-40,-12,-18,44;
MA   /M: SY='D'; M=-15,-55,71,16,-73,-52,-15,-34,8,-9,-12,23,-68,15,8,7,-32,-26,-85,-38;
MA   /M: SY='W'; M=41,-33,-50,-39,-3,-42,12,-38,-15,-6,1,-61,-72,-13,-22,-2,-3,-29,117,7;
MA   /M: SY='L'; M=-60,-71,-85,-79,31,-86,-71,39,-78,73,26,-65,-82,-73,-76,-76,-62,-9,-68,-49;
MA   /M: SY='S'; M=11,-4,-25,27,-19,-26,7,-42,26,-34,-33,1,-67,9,25,37,-12,-29,-25,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-28,-77,-30,-1,-65,-70,-30,-58,86,-39,-34,-17,-43,16,38,-22,-24,-48,-75,-51;
MA   /M: SY='T'; M=-37,-31,-53,-51,-67,-56,26,-25,-9,-20,-24,68,-59,-10,-39,-15,78,-29,-86,-27;
MA   /M: SY='M'; M=-52,-33,-72,-57,21,-47,32,20,-38,37,51,-20,-77,-1,46,-58,-42,-27,-67,24;
MA   /I: I=-29; MI=0; MD=-75; IM=0; DM=-75;
MA   /M: SY='I'; M=-38,-87,5,-8,-16,-33,-19,37,-34,-14,-26,-7,-3,-32,-48,-8,-44,4,-90,-58; D=-29;
MA   /I: I=-29; DM=-75;
MA   /M: SY='P'; M=-41,-83,45,17,-84,-47,-38,-75,-17,-69,-55,11,95,22,-36,-24,-28,-56,-83,-75;
MA   /M: SY='C'; M=-13,79,-79,-75,-5,-79,-51,26,-73,-23,-48,-71,-51,-75,-76,-45,18,71,-39,-31;
MA   /M: SY='R'; M=-26,-75,-30,31,-73,-64,-1,-21,30,-57,-42,-23,-66,28,57,12,33,-16,-78,-32;
MA   /M: SY='W'; M=-70,-90,-26,42,-25,-68,-58,-34,-45,-30,-37,-42,-52,-50,-68,-72,-47,-25,157,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-16,-18,56,30,-76,-36,39,-51,10,-35,-64,16,-67,38,-14,17,-22,-8,-85,-58;
MA   /M: SY='G'; M=-26,-76,36,17,-81,69,-51,-81,7,-60,-41,37,-25,-25,-45,-21,-28,-65,-80,-73;
MA   /M: SY='D'; M=-19,-49,52,34,-79,-29,-55,-76,42,-63,-69,38,-4,29,-7,-12,7,-50,-83,-53;
MA   /M: SY='D'; M=-28,-41,57,21,-74,9,-13,-27,-6,-37,-22,45,-58,-11,-33,22,9,-25,-44,-35;
MA   /I: I=-19; MI=0; MD=-49; IM=0; DM=-49;
MA   /M: SY='I'; M=-68,-51,-89,-85,-33,-92,-82,87,-81,31,25,-81,-80,-77,-83,-77,-62,6,-76,-47; D=-19;
MA   /I: I=-19; DM=-49;
MA   /M: SY='V'; M=-53,17,-72,-33,-57,-78,3,45,-4,8,-10,-11,-75,-21,8,-1,-25,54,-81,-41; D=-19;
MA   /I: I=-19; DM=-49;
MA   /M: SY='V'; M=-23,-52,-72,-64,-20,-84,-82,51,-74,1,-11,-77,-78,-75,-50,-62,-54,82,-80,-47;
MA   /M: SY='M'; M=11,-9,-15,-19,28,-43,-16,-25,-45,45,65,11,-63,-45,-58,-10,-37,-16,-30,-11;
MA   /M: SY='D'; M=-52,-57,77,17,-70,46,13,-82,-9,-74,-37,34,-67,5,-31,-20,-58,-54,-86,-69;
MA   /I: I=-36; MI=0; MD=-90; IM=0; DM=-90;
MA   /M: SY='E'; M=1,22,32,40,-60,-21,19,-35,-29,-49,-9,0,-67,29,-14,19,-5,20,-83,-56;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-43,-81,-76,-28,-81,-79,24,-74,26,-22,-76,-78,-74,-75,-56,-23,82,-81,-48;
MA   /M: SY='R'; M=-42,-13,-66,-19,-19,-75,-34,19,6,3,-19,-60,-71,-9,51,-3,43,26,-45,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-62,-48,-85,-82,-50,-88,-84,94,-65,-5,-37,-77,-75,-75,-80,-61,-57,48,-76,-58;
MA   /I: I=-42; MI=0; MD=-106; IM=0; DM=-106;
MA   /M: SY='S'; M=9,-29,13,33,-43,-19,11,-38,13,-22,-25,4,-51,2,9,38,1,-12,-80,-54;
MA   /M: SY='P'; M=4,-58,-43,-7,-82,-61,-31,-74,5,-74,-69,-65,111,-53,-45,6,-43,-74,-78,-47;
MA   /M: SY='P'; M=-61,-91,-44,-50,-85,-68,-69,-73,-63,-72,-70,-54,126,-66,-75,-63,-52,-78,-79,-60;
MA   /M: SY='Y'; M=-71,-52,-58,-74,10,-78,-38,-57,-66,-53,-50,-72,-83,-62,-63,-66,-66,-62,11,132;
MA   /M: SY='T'; M=-17,-71,8,-9,-38,24,-15,-67,24,-26,-24,17,-52,-5,22,-12,56,-31,-80,-41;
MA   /M: SY='P'; M=23,-72,-43,-3,-50,-55,-36,0,-40,-6,-35,-38,65,-19,-56,15,-3,37,-48,-67;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-24,62,64,-81,-22,-32,-79,-8,-64,-71,23,-29,5,-27,6,-8,-59,-37,-70;
MA   /M: SY='N'; M=-30,32,61,-38,-67,-49,1,-76,-1,-79,-51,77,-69,-4,-53,43,-24,-56,-91,-69;
MA   /M: SY='C'; M=-25,123,-68,-79,-54,-58,-81,32,-76,-26,-30,-71,-59,-79,-80,-38,-39,45,-90,-70;
MA   /M: SY='S'; M=-38,0,-51,-4,-4,-39,-5,-6,32,-20,-26,-30,-69,14,28,38,11,10,-52,-3;
MA   /M: SY='C'; M=8,72,-56,-40,-60,44,-21,-35,-36,-23,-43,-18,-5,-30,-53,45,-8,-11,-81,-41;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-35,28,-5,-55,-10,-23,-9,6,3,-38,9,7,-14,-26,30,25,-10,-81,-51;
MA   /I: I=-20; MI=0; MD=-51; IM=0; DM=-51;
MA   /M: SY='N'; M=-22,-71,31,4,-78,-8,-19,-76,8,-79,-41,92,-29,-9,-31,9,-6,-59,-89,-70;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-40,8,50,-78,-10,-12,-54,8,-58,-43,4,20,36,-4,25,3,-35,-15,-68;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-37,-12,-23,-43,-14,-10,46,4,-29,8,-15,-20,12,8,23,0,9,-78,-54;
MA   /M: SY='V'; M=34,-15,-48,-41,-51,-39,-22,37,-32,-8,-9,-39,-35,13,-31,18,-16,39,-78,-38;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-30,-42,-24,-19,-52,-54,-26,-20,68,2,-10,-28,-31,-24,-36,-25,-1,-74,-36;
MA   /I: I=-38; MI=0; MD=-97; IM=0; DM=-97;
MA   /M: SY='D'; M=-7,-56,43,43,-63,-12,-10,-45,10,-44,-8,23,-35,23,-27,30,-6,-52,-40,-48;
MA   /I: I=-20; MI=0; MD=-51; IM=0; DM=-51;
MA   /M: SY='R'; M=-57,-48,-31,-32,-29,-66,45,-76,-2,-31,-27,-38,-76,20,89,-44,-57,-74,-9,33; D=-20;
MA   /I: I=-20; DM=-51;
MA   /M: SY='V'; M=-43,-71,-83,-68,-21,-85,-83,61,-63,-16,-8,-52,-63,-76,-78,-59,-34,80,-81,-59;
MA   /M: SY='Q'; M=-31,-12,-51,-14,-79,-71,-2,-76,60,-54,-21,-46,-54,76,59,-29,-26,-63,-35,-63;
MA   /M: SY='K'; M=-26,-51,-5,2,-76,-18,-10,-53,74,-47,-24,22,-53,-5,37,-2,-18,-59,-45,-66;
MA   /M: SY='I'; M=-42,-72,-81,-46,-31,-72,-30,62,-75,47,27,-54,-77,-71,-68,-55,-25,43,-76,-57;
MA   /M: SY='V'; M=-49,-71,-84,-64,-39,-86,-77,53,-76,52,2,-79,-79,-73,-63,-55,-41,57,-77,-57;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-53,19,55,-78,-6,-30,-58,18,-52,2,-4,-44,37,18,17,-23,-45,-80,-68;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-38,1,-6,-52,25,-16,-55,44,-51,-2,32,-53,23,21,19,-20,-54,-78,-47;
MA   /M: SY='M'; M=-14,-12,-56,29,42,-47,34,4,-13,-3,63,-49,-34,-24,-35,-26,-19,2,-68,13;
MA   /M: SY='W'; M=-41,-52,-2,-35,-5,-58,25,-42,-6,-7,-35,-18,59,-8,30,-28,-19,-32,87,20;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-21,12,26,-52,-60,-31,-23,26,-17,-63,16,-6,26,6,13,-3,-17,-47,-49;
MA   /M: SY='K'; M=-25,-30,31,24,-56,-43,-29,-40,45,-35,-28,-7,-27,18,21,5,-31,-63,-85,-71;
MA   /M: SY='Q'; M=-32,-40,-36,-8,0,-53,-1,-4,-7,21,-10,-7,-27,27,-8,-8,-16,-9,-51,-34;
MA   /M: SY='Q'; M=-3,-40,12,27,-60,-11,-21,-51,12,-53,-36,-23,-28,30,-3,3,-21,-38,-50,-60;
MA   /I: E1=0; IE=-380; DE=-380;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=16(16); /POSITIVE=16(16); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=AD;
CC   /VERSION=1;
DR   Q2KHW8    , GEMI6_BOVIN, T; Q8WXD5    , GEMI6_HUMAN, T;
DR   Q9CX53    , GEMI6_MOUSE, T; Q9VT67    , HEZ_DROME  , T;
DR   Q6PBA2    , LS12A_DANRE, T; Q6NSN1    , LS12B_DANRE, T;
DR   Q0VCF9    , LSM12_BOVIN, T; Q5ZML5    , LSM12_CHICK, T;
DR   Q9VYR0    , LSM12_DROME, T; Q3MHD2    , LSM12_HUMAN, T;
DR   Q9D0R8    , LSM12_MOUSE, T; Q5RAT5    , LSM12_PONAB, T;
DR   Q38E83    , LSM12_TRYB2, T; Q6GP89    , LSM12_XENLA, T;
DR   Q6P833    , LSM12_XENTR, T; P38828    , LSM12_YEAST, T;
PR   PRU01345;
DO   PDOC52001;
//