ID CFEM; MATRIX. AC PS52012; DT 22-FEB-2023 CREATED; 22-FEB-2023 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE CFEM domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=112; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=107; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.1021421; R2=0.0086916; TEXT='-LogE'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=737; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='R'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=391; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='R?'; MA /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='M'; M=-7,4,-20,-8,-11,-12,-3,1,-3,-7,-7,17,12,-19,-2,-7,-2,-5,-10,-29,-12,-7; MA /M: SY='P'; M=-6,-5,-27,-7,-1,-22,-16,4,-17,7,-20,-2,-1,9,1,0,-5,-7,-18,-27,-12,-2; MA /M: SY='Y'; M=-7,-18,-22,-24,-17,18,-21,-4,0,-8,2,14,-15,-22,-11,-9,-12,-7,-2,-4,19,-14; MA /M: SY='S'; M=7,-8,-16,-13,-8,-10,-8,-13,-14,-4,-13,-5,-3,-14,-6,-3,9,9,-6,-24,-11,-7; MA /M: SY='S'; M=4,-12,-17,-16,-11,-8,-16,-17,-3,-6,-10,-6,-6,-16,-9,-6,7,7,3,-25,-10,-11; MA /M: SY='Y'; M=-8,-19,-18,-24,-20,14,-27,-14,8,-18,5,2,-16,-23,-19,-16,-6,7,10,-11,15,-20; MA /I: I=-15; MD=-32; MA /M: SY='P'; M=-2,-10,-18,-9,-4,-15,-14,-13,-7,-10,-11,-8,-8,12,-4,-11,6,6,-6,-26,-15,-5; D=-15; MA /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='S'; M=4,-11,-16,-11,-7,-14,-14,-16,-8,-6,-8,-7,-7,-11,-7,-8,8,6,-1,-30,-14,-7; MA /M: SY='V'; M=-5,-30,-16,-31,-26,7,-31,-26,27,-25,25,14,-29,-29,-26,-21,-18,-5,32,-24,-4,-26; MA /M: SY='A'; M=18,-15,-18,-20,-12,-14,-13,-20,2,-16,-4,-4,-11,-4,-11,-20,4,0,2,-25,-15,-13; MA /M: SY='L'; M=-3,-15,-20,-16,-8,-8,-21,-16,-3,-3,10,3,-13,-19,-8,-2,-10,-1,-2,-23,-7,-8; MA /M: SY='T'; M=6,-13,-14,-18,-15,-3,-9,-20,-4,-17,0,-4,-10,-18,-16,-16,4,12,3,-23,-10,-15; MA /M: SY='A'; M=40,-14,-12,-23,-14,-16,-7,-22,-1,-13,-5,-5,-13,-13,-13,-21,5,-1,8,-21,-17,-14; MA /M: SY='A'; M=20,-8,-1,-12,-8,-17,-5,-16,-13,-13,-15,-13,-3,-14,-8,-16,19,8,-5,-32,-19,-8; MA /M: SY='I'; M=-2,-23,-22,-28,-22,-4,-20,-22,21,-23,13,13,-17,-21,-16,-22,-11,-6,16,-23,-7,-21; MA /M: SY='N'; M=1,2,-2,-8,-11,-13,-11,-9,-7,-12,-11,-4,9,-20,-9,-12,6,4,-5,-34,-16,-10; MA /M: SY='G'; M=7,-17,-18,-20,-18,-12,8,-19,-5,-18,0,1,-13,-21,-17,-18,-3,-7,2,-24,-16,-17; MA /M: SY='F'; M=9,-16,-14,-23,-16,14,-16,-19,-3,-18,-1,-5,-12,-19,-19,-17,2,4,3,-17,-2,-16; MA /M: SY='A'; M=33,-9,-11,-17,-9,-16,-5,-18,-9,-12,-8,-9,-8,-12,-9,-17,12,7,-1,-24,-17,-9; MA /I: I=-15; MD=-32; MA /M: SY='D'; M=5,12,-18,14,5,-24,-9,-7,-20,2,-17,-13,3,-8,3,-5,3,0,-13,-23,-14,4; D=-15; MA /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='Q'; M=-5,-5,-26,-6,9,-25,-19,-4,-18,8,-13,-5,-5,-7,20,10,-3,-3,-18,-22,-12,13; MA /M: SY='I'; M=-1,-21,-21,-26,-21,-6,-10,-21,12,-22,11,10,-17,-21,-17,-20,-11,-4,10,-22,-9,-20; MA /M: SY='Y'; M=-10,-19,-25,-16,-8,2,-25,-6,0,-14,5,-1,-19,-7,-11,-14,-12,-6,-4,-11,14,-12; MA /I: I=-14; MD=-29; MA /M: SY='D'; M=1,23,-18,29,7,-25,-4,-4,-23,-3,-20,-19,13,-9,-2,-9,7,-2,-17,-28,-16,3; D=-14; MA /I: I=-14; MD=-29; MA /M: SY='Q'; M=1,-2,-15,-3,6,-17,-5,-4,-12,-2,-8,-4,-2,-7,12,-3,1,-1,-12,-15,-9,9; D=-14; MA /I: I=-14; MI=-29; IM=-29; DM=-29; MA /M: SY='L'; M=-7,-28,-22,-27,-19,-1,-29,-23,16,-24,23,10,-28,-7,-21,-21,-21,-7,14,-24,-8,-21; MA /M: SY='P'; M=-8,-18,-37,-9,0,-29,-18,-19,-20,-10,-30,-20,-17,80,-9,-19,-5,-7,-28,-31,-29,-9; MA /M: SY='E'; M=7,5,-24,6,14,-30,-6,-7,-25,7,-21,-14,0,-9,11,-2,1,-8,-20,-24,-18,13; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /M: SY='A'; M=29,-11,-12,-17,-9,-14,-6,-18,-7,-14,-4,-7,-9,-14,-9,-18,10,3,-1,-25,-16,-9; MA /M: SY='Q'; M=-10,-10,-27,-10,3,-20,-23,-7,-10,9,1,4,-10,-17,17,6,-13,-10,-13,-20,-7,10; MA /M: SY='E'; M=7,2,-24,5,9,-25,-11,-10,-18,-5,-18,-11,-4,9,-1,-13,2,-5,-16,-29,-20,3; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /M: SY='V'; M=3,-25,-15,-30,-23,11,-24,-21,15,-21,15,12,-24,-25,-23,-19,-13,-5,21,-19,-3,-22; MA /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; MA /M: SY='K'; M=-2,-12,-20,-14,-6,-6,-20,-14,-8,2,-5,-2,-10,-17,-3,-1,-4,-1,-4,-20,-6,-4; MA /M: SY='Q'; M=1,0,-23,-3,0,-22,-7,-8,-18,5,-18,-8,0,-15,7,-1,-1,-7,-13,-22,-13,4; MA /M: SY='S'; M=7,-2,-19,-6,-6,-22,7,-13,-20,0,-23,-14,5,-15,-6,-5,10,-1,-11,-28,-19,-6; MA /M: SY='T'; M=4,-11,-18,-16,-7,-3,-20,-18,-4,-9,1,-3,-10,-15,-11,-11,-1,9,-1,-21,-7,-8; MA /M: SY='S'; M=6,-7,-21,-6,-5,-24,8,-16,-23,-7,-27,-17,-1,5,-7,-11,14,4,-17,-30,-22,-7; MA /M: SY='S'; M=7,0,-18,-3,4,-20,-3,-12,-15,-8,-19,-14,4,-12,-3,-11,14,5,-10,-31,-19,0; MA /M: SY='T'; M=-1,2,-15,2,-4,-14,-13,-13,-12,-12,-9,-11,1,-14,-7,-12,14,18,-6,-33,-13,-5; MA /I: I=-15; MD=-32; MA /M: SY='P'; M=-4,-9,-26,-7,-7,-23,15,-16,-23,-6,-23,-15,-6,17,-10,-11,-2,-6,-21,-20,-21,-10; D=-15; MA /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; MA /M: SY='P'; M=-5,-5,-30,2,1,-29,9,-15,-28,-10,-29,-21,-4,27,-8,-16,3,-7,-26,-30,-27,-5; MA /M: SY='Y'; M=1,-19,-22,-20,-14,3,-20,-7,1,-16,8,1,-18,-13,-12,-16,-11,-5,-3,-8,14,-15; MA /I: I=-15; MD=-32; MA /M: SY='W'; M=-10,-12,-26,-15,-14,-4,-7,-5,-14,-13,-10,-9,-8,-19,-10,-11,-11,-6,-16,28,4,-11; D=-15; MA /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='D'; M=-19,49,-29,65,18,-38,-9,1,-38,0,-30,-29,24,-11,0,-9,1,-9,-30,-40,-20,9; MA /M: SY='T'; M=-5,-10,-19,-11,-11,-1,-22,-17,-4,-14,-3,-4,-11,-9,-11,-14,-3,7,1,-23,-6,-11; MA /I: I=-15; MD=-32; MA /M: SY='G'; M=1,-5,-24,-5,-5,-25,20,-14,-28,8,-26,-14,0,-13,-5,0,1,-9,-19,-20,-18,-5; D=-15; MA /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='C'; M=-9,-21,108,-30,-30,-18,-30,-30,-24,-29,-17,-17,-21,-39,-30,-29,-10,-9,-4,-48,-28,-30; MA /M: SY='L'; M=-10,-23,-21,-26,-19,5,-29,-4,15,-24,23,12,-19,-25,-16,-18,-18,-5,10,-22,3,-19; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /M: SY='T'; M=-1,-11,-15,-14,-12,-8,-19,-14,0,-12,-9,-5,-7,-17,-7,-12,11,16,7,-26,-3,-10; MA /M: SY='M'; M=-9,-4,-9,-8,-5,-18,-19,2,-11,-1,-11,7,-4,-17,4,-4,-3,-2,-9,-28,-8,-1; MA /M: SY='P'; M=-2,-7,-31,-4,6,-27,-15,-13,-21,-2,-27,-18,-5,44,-4,-11,-1,-6,-25,-30,-24,-2; MA /M: SY='N'; M=-8,16,-23,14,14,-26,-11,11,-24,0,-25,-15,19,-12,14,-2,10,0,-25,-33,-14,14; MA /I: I=-14; MD=-29; MA /M: SY='F'; M=-16,-23,-22,-27,-16,43,-26,-13,-1,-21,10,0,-19,-24,-23,-15,-19,-10,-4,10,23,-17; D=-14; MA /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; MA /M: SY='A'; M=6,-9,-18,-14,-13,-13,-3,-17,-4,-14,-6,-5,-5,-8,-13,-16,0,2,-2,-23,-15,-14; D=-14; MA /I: I=-14; DM=-29; MA /M: SY='G'; M=2,3,-21,2,-7,-20,16,-8,-25,-11,-26,-18,8,-16,-8,-13,13,-1,-19,-26,-13,-8; MA /M: SY='A'; M=18,-1,-20,-5,-8,-24,15,-15,-22,-8,-17,-14,1,-15,-10,-14,3,-8,-14,-23,-21,-9; MA /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-36,-29,1,-36,-29,41,-27,20,17,-24,-24,-23,-26,-18,-7,35,-23,-3,-29; MA /M: SY='G'; M=-5,-4,-23,-5,-2,-22,8,-13,-27,3,-22,-15,1,-14,-4,8,5,4,-18,-25,-17,-4; MA /M: SY='D'; M=-10,9,-2,12,2,-29,-15,-10,-28,2,-28,-19,4,-1,-2,-6,0,-6,-22,-35,-21,0; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /M: SY='V'; M=-2,-24,-13,-27,-24,0,-29,-26,22,-21,14,9,-24,-25,-24,-19,-9,7,31,-28,-8,-24; MA /M: SY='A'; M=13,-1,-19,-4,0,-23,-12,-13,-17,7,-13,-9,-4,-12,1,-3,1,0,-10,-23,-14,0; MA /M: SY='E'; M=-4,6,-22,9,24,-27,-14,-4,-24,5,-23,-16,4,-7,15,-1,13,5,-20,-31,-17,19; MA /M: SY='A'; M=10,-5,-19,-12,-7,-18,-14,-16,-5,1,-13,-6,-1,-13,-5,-6,4,3,-3,-25,-13,-7; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; MA /M: SY='P'; M=-10,-6,-32,-4,3,-28,-18,-12,-22,9,-27,-15,-4,34,2,1,-5,-3,-24,-27,-20,0; MA /M: SY='G'; M=-1,3,-25,0,-10,-24,19,-12,-20,-12,-20,-13,9,-18,-8,-14,1,-10,-16,-27,-21,-9; MA /M: SY='E'; M=2,9,-25,10,20,-29,-5,-5,-26,4,-22,-16,6,-9,10,-4,2,-8,-23,-27,-19,15; MA /M: SY='D'; M=-17,39,-29,53,28,-36,-12,1,-36,2,-28,-27,19,-8,5,-7,1,-9,-30,-38,-20,16; MA /M: SY='A'; M=14,-15,-18,-20,-10,-17,-18,-16,6,-10,-3,2,-14,-16,1,-14,-2,-4,9,-22,-12,-5; MA /M: SY='D'; M=-6,3,-23,7,1,-21,-16,-5,-11,-4,-14,-9,-2,-15,-6,-9,-1,-3,-4,-30,-12,-3; MA /M: SY='S'; M=11,-2,-17,-5,-1,-22,-7,-13,-19,2,-24,-15,3,-3,-2,-5,17,10,-12,-31,-18,-2; MA /M: SY='V'; M=13,-21,-11,-26,-22,3,-20,-25,10,-17,2,1,-20,-22,-23,-19,-2,4,24,-22,-8,-22; MA /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; MA /M: SY='V'; M=-6,-16,-20,-18,-11,-5,-24,-15,7,-12,1,1,-12,-20,-10,-8,-3,3,8,-22,-1,-13; MA /M: SY='S'; M=0,1,-18,0,9,-17,-10,-7,-17,-3,-22,-14,6,-12,5,-5,17,6,-12,-32,-15,7; MA /M: SY='A'; M=11,-16,-17,-21,-9,5,-16,-17,-2,-17,8,-2,-15,-18,-14,-17,-5,-4,-1,-18,-5,-11; MA /M: SY='A'; M=19,-17,-16,-23,-19,0,4,-22,-8,-17,-7,-7,-13,-19,-21,-20,-1,-6,1,-16,-11,-19; MA /M: SY='K'; M=-5,-6,-19,-10,-5,-16,-21,-14,-7,6,-9,-3,-4,-17,-2,1,-2,6,0,-26,-10,-4; MA /M: SY='S'; M=3,-2,-18,-2,-1,-23,5,-11,-25,2,-29,-18,6,-12,0,1,22,7,-15,-32,-19,-1; MA /M: SY='I'; M=5,-14,-20,-18,-10,-14,-19,-16,8,-15,-4,1,-8,-15,-1,-16,5,1,5,-26,-11,-7; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /M: SY='S'; M=6,-3,-18,-3,-1,-24,1,-12,-23,-1,-29,-18,3,-1,-2,-6,21,7,-15,-33,-20,-2; MA /M: SY='S'; M=5,-2,-19,0,1,-21,3,-15,-17,-9,-18,-14,-2,-13,-7,-13,8,1,-7,-30,-19,-3; MA /M: SY='A'; M=18,-8,-17,-11,-9,-14,-12,-11,-4,-9,-6,0,-11,-16,-4,-14,-1,-4,2,-19,-6,-7; MA /M: SY='G'; M=1,-3,-25,-5,-14,-27,50,-15,-34,-16,-30,-20,8,-18,-14,-16,9,-10,-26,-26,-27,-14; MA /M: SY='A'; M=15,-17,-13,-20,-17,-13,-7,-14,1,-15,-6,-3,-14,-20,-17,-17,2,-2,14,-27,-14,-17; MA /I: I=-12; MD=-25; MA /M: SY='W'; M=5,-2,-17,-7,-5,-12,-2,-8,-13,-6,-15,-11,2,-12,0,-8,1,-4,-14,6,-6,-2; D=-12; MA /I: I=-12; MD=-25; MA /M: SY='V'; M=-1,-3,-11,0,-2,-9,-11,-10,-1,-7,-1,-3,-6,-11,-7,-9,-1,-1,4,-19,-9,-4; D=-12; MA /I: I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25; MA /M: SY='P'; M=-5,-10,-29,-7,-3,-24,-7,-16,-19,-10,-26,-17,-8,47,-9,-15,0,-1,-23,-28,-24,-9; D=-12; MA /I: I=-12; DM=-25; MA /M: SY='Y'; M=-3,-2,-21,0,-9,-8,-9,-6,-9,-11,-11,-9,-5,-17,-10,-13,-1,-3,-6,-14,7,-11; D=-12; MA /I: I=-12; DM=-25; MA /M: SY='W'; M=0,-12,-22,-13,-10,-10,-9,-18,-18,-13,-24,-18,-6,-16,-8,-13,13,11,-14,17,-4,-8; MA /M: SY='M'; M=1,-9,-19,-14,-8,-13,-7,-11,0,-12,-6,7,-4,-16,-6,-14,1,-3,0,-27,-13,-8; MA /M: SY='I'; M=2,-17,-19,-20,-14,-11,-19,-18,6,-15,-2,4,-14,-1,-11,-17,0,4,6,-28,-13,-14; MA /M: SY='P'; M=-6,-13,-19,-8,-1,-28,-1,-18,-26,-12,-28,-20,-11,38,-10,-18,-2,-9,-26,-31,-28,-8; MA /M: SY='A'; M=20,-12,-16,-15,-9,-20,-1,-18,-10,-11,-15,-10,-9,-4,-7,-16,8,0,-2,-26,-20,-8; MA /M: SY='S'; M=2,1,-18,2,7,-22,-2,-10,-22,-7,-26,-19,7,0,0,-9,22,11,-17,-35,-21,3; MA /M: SY='S'; M=5,-11,-17,-12,-8,-16,-7,-19,-5,-13,-14,-9,-8,-8,-11,-15,10,7,3,-31,-17,-10; MA /M: SY='S'; M=13,-3,-14,-5,-3,-22,3,-12,-20,-7,-24,-16,4,-11,0,-9,24,12,-11,-31,-19,-2; MA /M: SY='S'; M=8,-1,-5,-1,-6,-23,11,-14,-25,-13,-27,-20,5,-14,-7,-14,22,6,-14,-35,-23,-6; MA /M: SY='S'; M=15,-3,-11,-7,-5,-17,-5,-13,-14,-10,-20,-12,3,-11,-4,-12,27,20,-5,-33,-17,-4; MA /M: SY='S'; M=-3,-7,-21,-8,-4,-14,0,-13,-13,-11,-4,-7,-2,-18,-8,-10,1,-1,-11,-27,-15,-6; MA /M: SY='S'; M=10,2,-15,1,4,-22,-5,-11,-20,-7,-24,-18,5,-2,-1,-11,24,12,-13,-34,-20,1; MA /M: SY='S'; M=8,-6,-17,-8,-9,-21,15,-16,-22,-9,-23,-15,1,-14,-9,-11,16,7,-11,-29,-20,-9; MA /M: SY='S'; M=14,-1,-17,-4,8,-23,-8,-11,-19,0,-20,-14,0,-8,5,-6,15,7,-12,-28,-17,6; MA /M: SY='A'; M=32,-3,-14,-8,-5,-22,-4,-17,-15,-9,-15,-14,-5,-3,-8,-17,11,4,-6,-25,-20,-7; MA /M: SY='S'; M=11,1,-12,-3,-4,-19,-2,-13,-18,-10,-22,-16,6,-11,-5,-12,25,21,-8,-33,-18,-5; MA /M: SY='A'; M=17,-3,-15,-7,-8,-21,9,-17,-19,-11,-19,-15,0,-12,-10,-15,16,11,-9,-27,-20,-9; MA /M: SY='T'; M=10,-5,-12,-10,-9,-15,-4,-17,-12,-12,-17,-12,-1,-13,-9,-13,21,22,0,-32,-16,-9; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=22(19); /POSITIVE=22(19); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=3; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=4; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=CFEM; CC /VERSION=1; DR Q5AFN8 , CCW14_CANAL, T; O13547 , CCW14_YEAST, T; DR I1REI8 , CFM1_GIBZE , T; K1XVG1 , CFM1_MARBU , T; DR I1RET0 , CFM5_GIBZE , T; K1WG73 , CFM6_MARBU , T; DR K1XW16 , CFM8_MARBU , T; D4AZC5 , CFMA_ARTBC , T; DR Q4WLB9 , CFMA_ASPFU , T; D4B2Q8 , CFMB_ARTBC , T; DR Q4WMA6 , CFMB_ASPFU , T; D4AXU8 , CFMC_ARTBC , T; DR Q4WNE1 , CFMC_ASPFU , T; I1RAQ3 , CFMN1_GIBZE, T; DR G1UB63 , CSA1_CANAL , T; Q5A0X8 , CSA2_CANAL , T; DR Q59UP6 , PGA10_CANAL, T; Q59UT5 , PGA7_CANAL , T; DR Q59UT4 , RBT5_CANAL , T; DR K1XT82 , CFM9_MARBU , N; G1XAA9 , MAD1_ARTOA , N; DR Q2LC49 , MAD1_METAN , N; 3D 4Y7S; PR PRU01356; DO PDOC52012; //