ID GL_GHV; MATRIX. AC PS52026; DT 13-SEP-2023 CREATED; 13-SEP-2023 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. DE Gammaherpesvirus glycoprotein L (gL) domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=116; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=111; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4041522; R2=0.0109830; TEXT='-LogE'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=783; N_SCORE=11.0; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=373; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-250; E1=-250; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='L'; M=-11,-10,-21,-16,-15,4,-22,-9,5,-13,11,5,-4,-25,-13,-8,-14,-4,0,-19,2,-14; MA /M: SY='P'; M=-8,-17,-36,-9,0,-29,-18,-14,-20,-10,-30,-19,-16,75,-8,-18,-5,-7,-28,-31,-27,-9; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /M: SY='H'; M=6,11,-22,9,1,-25,-9,16,-24,-1,-21,-13,11,-14,0,-4,1,-7,-19,-29,-10,-1; MA /M: SY='I'; M=-8,-30,-26,-38,-29,1,-38,-29,45,-28,20,18,-22,-22,-22,-28,-19,-8,32,-22,-2,-29; MA /M: SY='Q'; M=-9,-7,-22,-12,-6,-6,-22,4,-5,-9,-7,-1,-2,-19,6,-6,-2,0,-7,-20,3,-1; MA /M: SY='A'; M=15,-10,-21,-14,-7,-19,-9,-9,-10,-9,-12,-8,-8,2,-2,-14,0,-5,-9,-22,-13,-6; MA /M: SY='L'; M=-4,-13,-19,-14,-9,-9,-13,-14,-5,-8,4,1,-9,-19,-8,-5,-2,2,-4,-26,-10,-9; MA /I: I=-5; MD=-25; MA /M: SY='B'; M=7,8,-20,7,0,-23,-7,-9,-20,-4,-21,-17,7,4,-4,-8,7,1,-16,-29,-19,-3; D=-5; MA /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; MA /M: SY='A'; M=12,-7,-18,-8,0,-18,-9,-16,-7,-4,-10,-8,-9,-13,-7,-11,0,-5,1,-24,-16,-4; D=-5; MA /I: I=-5; DM=-25; MA /M: SY='S'; M=-1,-1,-17,-2,1,-15,-12,-7,-17,-2,-21,-13,3,-12,-1,-3,17,12,-9,-31,-12,0; MA /M: SY='T'; M=-4,0,-19,-5,-2,-18,-12,-1,-15,-5,-16,-9,5,-13,3,-3,10,13,-12,-29,-10,0; MA /M: SY='L'; M=-11,-29,-25,-31,-22,7,-31,-19,21,-27,28,16,-25,-20,-19,-21,-25,-11,11,-12,1,-22; MA /M: SY='P'; M=-7,-13,-33,-7,-3,-23,-14,-16,-17,-11,-21,-16,-13,51,-10,-18,-7,-8,-23,-27,-21,-10; MA /M: SY='L'; M=1,-11,-18,-12,-3,-5,-15,-12,-5,-15,3,-4,-8,-15,-8,-14,1,0,-5,-25,-7,-6; MA /M: SY='F'; M=-13,-28,-25,-33,-24,26,-31,-23,14,-26,11,5,-22,-8,-27,-22,-19,-9,8,-11,5,-25; MA /M: SY='F'; M=-17,-21,-22,-27,-14,51,-27,-12,-7,-18,2,-4,-15,-25,-25,-11,-14,-9,-7,3,24,-17; MA /M: SY='E'; M=8,11,-20,11,20,-25,-9,-6,-22,-1,-20,-18,8,-8,4,-8,10,0,-18,-31,-20,12; MA /M: SY='V'; M=0,-28,-18,-33,-28,-2,-31,-29,34,-23,12,12,-24,-24,-24,-24,-12,-4,38,-25,-7,-28; MA /M: SY='H'; M=-3,1,-18,-3,-5,-17,-13,19,-16,-5,-19,-9,9,-16,-2,-2,9,6,-11,-32,-6,-5; MA /M: SY='S'; M=-1,1,-20,4,5,-21,-8,-11,-24,0,-27,-19,3,-11,1,-4,17,7,-16,-18,-13,3; MA /M: SY='I'; M=-11,-30,-28,-40,-30,10,-38,-28,43,-29,19,19,-20,-21,-22,-28,-20,-10,26,-16,4,-29; MA /M: SY='H'; M=-17,-10,-27,-11,-10,-1,-25,52,-12,-12,-7,1,-5,-24,-2,-6,-13,-11,-14,-11,34,-10; MA /M: SY='F'; M=-14,-30,-21,-36,-26,42,-31,-21,14,-30,26,10,-24,-29,-30,-21,-23,-10,9,-6,14,-26; MA /M: SY='T'; M=11,-2,-13,-11,-11,-11,-12,-13,-5,-10,-11,-9,2,-16,-11,-13,10,14,2,-26,-10,-11; MA /M: SY='D'; M=-6,20,-23,27,6,-26,-11,-7,-21,-6,-20,-19,11,-8,-4,-12,5,-3,-16,-35,-18,1; MA /M: SY='P'; M=-10,-16,-34,-11,-4,-23,-20,-18,-13,-12,-19,-14,-14,60,-11,-18,-11,-9,-22,-30,-25,-11; MA /M: SY='N'; M=-1,12,-23,7,8,-25,-7,1,-20,3,-23,-13,18,-13,9,-1,5,-4,-21,-30,-16,8; MA /M: SY='H'; M=-9,-5,-21,-9,-8,-12,-20,21,-17,-10,-12,-6,0,-16,-3,-4,3,14,-13,-17,3,-7; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /M: SY='N'; M=-9,14,-27,10,2,-30,8,-2,-28,3,-28,-16,20,-10,7,-1,1,-9,-29,-29,-20,4; MA /M: SY='G'; M=-3,-4,-29,-7,-17,-25,52,-13,-35,-15,-28,-18,6,-21,-16,-13,0,-16,-28,-20,-22,-17; MA /M: SY='V'; M=-9,-21,-19,-24,-19,6,-26,-19,6,-9,2,2,-16,-24,-17,4,-9,0,14,-20,-3,-19; MA /M: SY='C'; M=-4,6,28,-3,-10,-20,-11,-6,-24,-13,-26,-19,16,-23,-9,-13,12,2,-17,-43,-22,-10; MA /M: SY='V'; M=-3,-28,-16,-31,-28,0,-32,-28,31,-23,15,12,-26,-27,-26,-22,-13,0,38,-27,-7,-28; MA /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10; MA /M: SY='K'; M=-7,-3,-23,-6,2,-20,-19,-6,-18,12,-16,-7,-2,-13,12,9,3,7,-14,-21,-5,6; MA /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-32,-25,14,-31,-24,24,-28,33,16,-28,-29,-24,-21,-23,-8,20,-19,1,-25; MA /M: SY='R'; M=-15,-7,-26,-10,-4,-9,-21,4,-16,8,-11,-5,0,-21,5,24,-8,-6,-14,-17,3,-2; MA /I: I=-6; MD=-32; MA /M: SY='Y'; M=-4,-6,-19,-7,-4,-8,-15,3,-12,-4,-16,-8,-2,-16,3,-5,9,6,-9,-16,10,-2; D=-6; MA /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='K'; M=-9,-5,-27,-7,0,-22,-20,-10,-20,25,-21,-9,-1,-8,3,25,-7,-5,-13,-23,-12,0; MA /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; MA /M: SY='R'; M=-6,-1,-16,-3,0,-14,-6,-3,-14,10,-13,-3,2,-9,5,13,-1,-2,-11,-15,-8,1; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-22; MA /M: SY='N'; M=-2,10,-16,2,-3,-16,-12,-6,-11,-6,-14,-10,14,-15,0,-6,8,12,-9,-30,-13,-2; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-22; MA /M: SY='G'; M=-4,3,-23,2,-5,-24,15,7,-29,-5,-26,-15,9,-15,-4,-6,7,-5,-22,-28,-14,-5; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-22; MA /M: SY='N'; M=-4,12,-21,10,4,-25,-11,-3,-21,2,-22,-12,13,-13,10,1,10,5,-18,-31,-15,7; MA /M: SY='V'; M=-3,-20,-19,-24,-21,-6,-21,-23,18,-21,5,5,-14,-18,-18,-20,-5,0,19,-28,-10,-21; MA /M: SY='T'; M=-3,-5,-15,-13,-11,-9,-23,-17,-4,-8,-7,-5,-5,-13,-7,-9,10,33,3,-25,-5,-10; MA /M: SY='T'; M=-7,-13,-19,-17,-13,-10,-25,-1,2,-10,-1,2,-10,-19,-8,-7,-4,8,8,-27,-3,-12; MA /M: SY='E'; M=-7,-4,-23,0,15,-14,-21,-9,-11,-6,-6,-9,-8,-8,-1,-9,-1,0,-9,-26,-8,7; MA /M: SY='I'; M=-6,-15,-20,-19,-10,-7,-26,-19,9,-13,4,2,-12,-17,-10,-8,-4,7,9,-26,-8,-12; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /M: SY='V'; M=13,-20,-12,-23,-21,-10,-11,-25,9,-17,-3,-1,-18,-22,-21,-19,1,0,25,-28,-15,-21; MA /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0; MA /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20; MA /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,73,-30,-20,2,-30,14,2,-21,-30,-38,-20,-21,-10,1,7,27,-29; MA /M: SY='N'; M=-6,28,-21,13,-2,-20,1,19,-22,-3,-27,-16,44,-19,0,-3,7,-4,-28,-36,-15,-2; MA /M: SY='L'; M=-6,-30,-17,-30,-24,6,-30,-24,25,-26,35,16,-30,-30,-24,-20,-22,-6,25,-24,-4,-24; MA /M: SY='M'; M=-8,-18,-24,-23,-14,-9,-22,-9,4,1,2,18,-12,-20,-2,15,-13,-8,4,-21,-6,-11; MA /M: SY='S'; M=17,-2,-11,-4,-3,-20,3,-12,-19,-10,-26,-18,6,-10,-3,-12,32,14,-9,-35,-20,-3; MA /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-39,-30,78,-30,-19,0,-29,10,0,-20,-30,-39,-20,-20,-10,0,11,32,-30; MA /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22,27,-30,-20,15,-30,40,15,-28,-30,-25,-20,-28,-10,8,-13,7,-22; MA /M: SY='L'; M=-6,-26,-21,-29,-20,1,-27,-23,23,-25,27,14,-24,-25,-19,-21,-20,-8,17,-22,-5,-21; MA /M: SY='A'; M=28,-4,-15,-13,-7,-20,-5,-8,-15,-4,-14,-11,0,-13,-5,-4,8,0,-7,-23,-16,-7; MA /M: SY='V'; M=-1,-29,-15,-31,-27,1,-30,-28,30,-23,18,13,-27,-27,-25,-22,-14,-4,37,-26,-7,-27; MA /M: SY='L'; M=-8,-27,-19,-29,-22,10,-29,-19,20,-25,30,16,-26,-28,-21,-19,-20,-6,17,-19,2,-22; MA /M: SY='R'; M=-8,-1,-25,-1,5,-24,-16,-1,-20,12,-20,-9,1,-15,17,18,1,-5,-17,-22,-7,9; MA /M: SY='R'; M=-15,-5,-29,-6,2,-24,-14,-3,-29,28,-24,-11,3,-17,10,48,-7,-9,-21,-22,-12,3; MA /M: SY='L'; M=-4,-26,-19,-29,-21,5,-27,-22,20,-25,25,12,-23,-25,-20,-21,-15,-5,17,-22,-3,-21; MA /M: SY='G'; M=-3,1,-24,3,-1,-26,13,-12,-28,-6,-28,-19,6,-2,-5,-7,10,-1,-22,-30,-22,-4; MA /M: SY='Y'; M=-7,-4,-20,-4,-5,1,-17,-4,-10,-13,-5,-8,-3,-19,-8,-12,2,2,-9,-17,8,-7; MA /M: SY='R'; M=-5,-2,-27,-7,-4,-17,-11,-9,-22,7,-24,-15,5,-12,-1,11,-2,-6,-21,-1,-9,-3; MA /M: SY='T'; M=10,-12,-13,-18,-13,-9,-18,-10,-2,-15,1,-2,-11,-17,-12,-15,2,13,6,-26,-8,-13; MA /M: SY='P'; M=-5,-3,-25,-1,9,-21,-16,-5,-17,-6,-21,-15,0,16,-1,-10,7,5,-18,-30,-15,2; MA /M: SY='Q'; M=-10,4,-28,7,15,-30,-10,-3,-25,7,-23,-13,3,-3,16,7,0,-8,-24,-27,-17,14; MA /I: I=-4; MD=-23; MA /M: SY='E'; M=-6,8,-23,11,22,-18,-15,1,-20,0,-13,-12,2,-9,10,-4,-2,-8,-20,-23,-11,16; D=-4; MA /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; MA /M: SY='B'; M=-9,20,-18,18,16,-18,-7,3,-19,4,-18,-14,20,-8,5,2,2,-4,-20,-24,-13,10; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-23; MA /M: SY='L'; M=-7,-7,-17,-6,-7,-4,-17,-6,0,-12,7,1,-7,-18,-5,-10,-7,-3,-1,-17,1,-6; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-23; MA /M: SY='R'; M=-8,5,-19,4,5,-19,-11,-2,-20,9,-18,-11,7,-11,7,19,4,2,-16,-23,-11,5; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-23; MA /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22,23,-30,-19,16,-29,41,18,-28,-30,-23,-20,-28,-10,8,-14,6,-21; MA /M: SY='L'; M=-8,-21,-22,-23,-15,-3,-26,-17,6,-10,19,8,-18,-24,-11,2,-17,-5,5,-21,-5,-15; MA /M: SY='N'; M=0,4,-25,-1,5,-19,-10,-3,-21,1,-23,-16,8,-14,2,-4,0,-7,-22,-2,-9,4; MA /M: SY='Y'; M=-12,-7,-26,-9,-8,0,-22,21,-10,-7,-5,-2,-6,-22,1,-4,-11,-7,-14,-5,29,-6; MA /M: SY='L'; M=-9,-29,-19,-31,-22,8,-30,-21,23,-28,42,21,-29,-29,-20,-20,-26,-9,16,-21,-1,-21; MA /M: SY='Q'; M=-9,-3,-25,-6,5,-21,-21,-6,-12,7,-12,-5,0,-13,13,9,-2,0,-13,-24,-10,8; MA /M: SY='R'; M=-3,-9,-21,-12,-4,-14,-20,-10,-10,3,-9,-5,-6,-15,0,8,0,6,-6,-21,-5,-3; MA /M: SY='Y'; M=0,-14,-17,-15,-11,0,-16,-7,-3,-16,2,-3,-10,-20,-9,-14,4,3,-3,-18,7,-11; MA /M: SY='L'; M=-12,-13,-26,-12,2,-13,-24,-4,-7,2,8,4,-12,-19,5,6,-16,-10,-10,-22,-5,3; MA /M: SY='T'; M=-5,11,-18,9,5,-20,-13,-4,-19,-2,-20,-15,10,-12,-1,-5,13,15,-13,-34,-14,1; MA /M: SY='Q'; M=2,0,-21,0,4,-21,-16,-10,-10,-7,-9,-7,-4,-13,6,-10,3,1,-8,-27,-13,5; MA /M: SY='F'; M=-20,-25,-25,-30,-25,55,-30,0,0,-20,5,0,-20,-30,-25,-15,-20,-10,-5,20,55,-25; MA /M: SY='T'; M=6,-6,-15,-8,-9,-12,-12,-16,-7,-15,-1,-6,-7,-16,-11,-15,6,10,-1,-28,-13,-10; MA /I: I=-6; MD=-32; MA /M: SY='A'; M=8,-7,-15,-8,0,-16,-11,-7,-8,-6,-11,-7,-5,-13,-1,-8,8,1,-2,-26,-12,-1; D=-6; MA /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='N'; M=0,5,-22,1,3,-23,1,-9,-22,5,-24,-15,11,-13,-2,-1,6,0,-17,-29,-18,1; MA /M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-38,-28,63,-30,-20,5,-30,20,5,-22,-30,-35,-20,-22,-10,2,3,23,-28; MA /M: SY='S'; M=1,10,-16,4,2,-20,-3,-7,-21,-2,-26,-18,19,-12,0,-4,22,14,-16,-36,-18,1; MA /M: SY='A'; M=12,-8,-18,-10,-11,-16,-17,-20,1,-11,-6,-5,-10,-12,-13,-17,-1,0,8,-26,-14,-13; MA /M: SY='T'; M=-3,-3,-18,-3,6,-13,-18,-13,-11,-4,-13,-10,-4,-13,-2,-7,8,11,-3,-29,-12,2; MA /M: SY='T'; M=-6,9,-17,4,-3,-16,-16,1,-18,-5,-17,-12,10,-13,-4,-6,12,24,-12,-31,-7,-4; MA /M: SY='A'; M=20,-7,-13,-14,-10,-14,-12,-19,-5,-13,-4,-6,-7,-13,-11,-17,8,14,1,-25,-14,-11; MA /M: SY='N'; M=-12,29,-23,25,2,-16,-4,1,-25,-2,-26,-20,32,-17,-4,-5,5,-4,-25,-33,-15,-1; MA /M: SY='S'; M=5,1,-15,-1,-3,-20,5,-13,-21,-10,-24,-17,6,-12,-6,-11,23,18,-12,-33,-19,-5; MA /I: I=-4; MD=-22; MA /M: SY='S'; M=4,1,-13,1,4,-19,-5,-7,-16,-6,-23,-15,8,-9,3,-5,26,11,-11,-33,-16,3; D=-4; MA /I: I=-4; MD=-22; MA /M: SY='I'; M=-7,-13,-22,-16,-8,-9,-17,-14,2,-5,-6,-1,-7,-15,-4,-1,-4,-5,2,-21,-7,-8; D=-4; MA /I: I=-4; MD=-22; MA /M: SY='F'; M=-13,-17,-18,-21,-15,30,-21,3,-5,-17,5,1,-10,-21,-18,-10,-12,-8,-5,-6,14,-15; D=-4; MA /I: I=-4; MD=-22; MA /M: SY='N'; M=-6,3,-20,-1,-3,-13,1,-4,-20,8,-21,-12,11,-14,-2,5,1,-5,-17,-18,-7,-3; D=-4; MA /I: I=-4; MD=-22; MA /M: SY='V'; M=-3,-17,-10,-20,-17,4,-20,-17,14,-15,11,8,-16,-18,-16,-13,-8,3,19,-17,-3,-17; D=-4; MA /I: I=-4; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22; MA /M: SY='N'; M=1,5,-15,-1,-6,-13,-6,-9,-7,-6,-10,-7,9,-13,-6,-8,3,2,-6,-23,-12,-7; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-22; MA /M: SY='A'; M=7,-11,-18,-18,-13,-8,-18,-15,1,-13,-5,-4,-8,-11,-11,-14,2,7,2,-20,-3,-14; MA /M: SY='N'; M=-9,-3,-25,-7,-6,-13,-20,-10,-4,-4,-13,-7,2,-13,-4,-5,-2,-1,-7,-17,-6,-7; MA /M: SY='H'; M=-10,-12,-24,-15,-10,-9,-22,4,-2,-6,-2,1,-4,-21,-5,3,-7,-6,-3,-24,-1,-10; MA /M: SY='G'; M=-4,-5,-26,-9,-9,-21,3,-13,-11,-13,-18,-10,3,0,-6,-15,2,-6,-15,-28,-19,-9; MA /M: SY='R'; M=0,-9,-22,-11,-5,-19,-12,-12,-14,-1,-13,-8,-5,-5,0,4,4,4,-11,-26,-14,-4; MA /M: SY='V'; M=-8,-17,-22,-18,-13,-7,-21,-7,0,-1,0,5,-16,-23,-8,-2,-13,-8,6,-18,2,-12; MA /M: SY='A'; M=10,-11,-22,-14,-8,-19,3,-17,-11,-10,-9,-7,-8,-11,-8,-14,-2,-8,-7,-23,-18,-8; MA /M: SY='K'; M=-5,-4,-29,-3,-4,-19,-11,-15,-23,5,-20,-15,-7,-11,-5,-1,-8,-7,-19,5,-7,-4; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=gL gammaherpesvirus-type; CC /VERSION=1; PR PRU01370; DO PDOC52024; //