ID   ZF_RG_N; MATRIX.
AC   PS52036;
DT   24-JAN-2024 CREATED; 24-JAN-2024 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   Zinc finger reverse gyrase N-terminal-type profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=40;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3040311; R2=0.0087802; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1219; N_SCORE=13.0; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=478; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-31; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380;
MA   /I: B1=0; BI=-380; BD=-380;
MA   /M: SY='M'; M=-62,-70,-82,-74,-52,-77,-57,-3,-67,-18,138,-18,-72,-60,-66,-71,-60,-3,-76,-52;
MA   /I: I=-25; MD=-63;
MA   /M: SY='N'; M=-2,-90,19,2,-86,-20,-36,-78,-77,0,-77,25,-89,-75,-48,-13,-23,-20,-2,-84; D=-25;
MA   /I: I=-25; DM=-63;
MA   /M: SY='I'; M=-65,-78,-80,-76,-59,-84,-79,52,-74,17,-12,-35,45,-74,-41,-25,9,39,-82,-32; D=-25;
MA   /I: I=-25; MI=-63; IM=-63; DM=-63;
MA   /M: SY='N'; M=-27,-77,-28,15,-47,-18,25,0,0,-6,-8,48,40,-54,38,-58,-17,-17,-80,-32;
MA   /M: SY='P'; M=49,-70,-71,-66,-33,5,-70,11,-67,-7,21,-66,57,-64,-72,6,-55,21,-75,-26;
MA   /M: SY='I'; M=-41,-73,-78,-74,-24,-81,-72,72,-23,14,-41,-72,-76,-68,-3,0,-56,44,-70,25;
MA   /M: SY='Y'; M=-71,-80,-73,-75,31,-79,-42,-10,-68,-4,-47,-73,-83,-64,-65,-68,-65,-56,-31,125;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-75,-10,13,-68,-32,22,-44,45,1,12,-1,-69,-23,57,-5,-12,-65,-76,-23;
MA   /M: SY='H'; M=-29,-74,-7,-12,-42,33,78,-79,-3,-76,-65,62,-69,-24,18,21,-56,-77,-80,8;
MA   /M: SY='L'; M=9,-16,-72,-70,-6,25,-67,2,-69,49,24,-64,-74,-64,-71,43,-55,-28,-72,-29;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='P'; M=-66,-87,-70,-60,8,-72,-72,12,-66,-68,-62,-74,117,-69,-76,-65,-59,-4,-75,-71;
MA   /M: SY='N'; M=-33,-69,-48,-61,-64,-59,-3,4,-53,-11,-57,99,-73,-19,-5,3,-20,9,-84,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /M: SY='G'; M=-52,-75,-24,-67,-33,89,-9,-86,-18,-83,-73,35,-69,-23,-38,-2,-62,-81,-76,-72;
MA   /M: SY='G'; M=-52,-14,-61,-11,-79,86,-65,-54,-38,-81,-72,5,-69,-59,30,-6,-46,-79,19,-72;
MA   /M: SY='D'; M=-32,-76,68,42,-75,-42,-12,-27,-24,-47,-19,16,29,-51,1,5,16,-44,-85,-27;
MA   /I: I=-45; MI=0; MD=-115; IM=0; DM=-115;
MA   /M: SY='I'; M=10,4,-46,-75,-53,-76,-75,78,-72,19,-41,21,-75,-70,-75,-33,-56,26,-78,-60;
MA   /M: SY='S'; M=-10,-69,44,27,-76,-59,-59,-73,-25,-74,-69,-15,-19,-50,-12,66,52,-65,-85,-68;
MA   /M: SY='D'; M=18,-70,68,9,-37,-57,-58,-45,-55,-74,-70,10,-65,-52,-38,65,-1,-37,-86,-67;
MA   /M: SY='E'; M=-58,-74,21,62,-62,-39,-25,-62,-35,-4,-60,11,-66,-16,7,21,1,6,-73,35;
MA   /M: SY='R'; M=-32,-80,23,50,-78,-71,-53,-82,-17,-76,-68,-15,-68,-41,92,0,-60,-75,-79,-66;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-70,-77,-75,-46,-79,-70,47,-74,72,-34,14,-79,-69,-74,-69,-59,-12,-74,-56;
MA   /M: SY='E'; M=3,-72,-4,50,-36,-45,-62,32,-13,12,9,3,-68,-53,-22,4,-7,0,-77,-23;
MA   /M: SY='K'; M=2,-73,-54,21,-67,-15,-21,-17,40,2,-21,34,-68,25,13,23,-23,-63,-75,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-56,-5,-61,-40,-28,75,35,-79,15,-55,-67,9,-70,-57,29,-34,-64,-43,-71,18;
MA   /I: I=-42; MI=0; MD=-106; IM=0; DM=-106;
MA   /M: SY='G'; M=-35,-77,-72,-77,2,45,-10,-59,-74,44,-16,37,-81,-71,-77,-15,-46,-44,-80,-65; D=-42;
MA   /I: I=-42; DM=-106;
MA   /M: SY='P'; M=20,-11,-69,-61,-16,-68,-24,15,-14,-46,-6,-66,83,-63,-14,5,2,18,-78,-67;
MA   /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82;
MA   /I: I=-28; MI=0; MD=-70; IM=0; DM=-70;
MA   /M: SY='E'; M=-27,-75,33,63,-79,-65,8,-76,8,-76,-69,-2,20,-45,12,40,10,-45,-83,-68;
MA   /M: SY='K'; M=-28,-74,-54,24,-71,-68,-57,-5,57,-24,-59,36,-68,-5,45,14,-55,2,-78,-65;
MA   /M: SY='C'; M=-61,149,15,-73,-73,-75,-77,-79,-74,-70,-70,-63,-89,-80,-81,-32,-60,-67,-101,-81;
MA   /M: SY='M'; M=-14,-71,-75,-40,-17,-77,-15,16,-65,52,56,-34,-77,-32,6,-6,-34,9,-68,29;
MA   /I: I=-22; MD=-55;
MA   /M: SY='H'; M=-41,-101,-7,-38,-19,-92,14,-95,-46,-66,-90,2,-4,-39,12,9,-16,-46,-107,-87; D=-22;
MA   /I: I=-22; MI=0; MD=-55; IM=0; DM=-55;
MA   /M: SY='P'; M=-37,-78,26,40,-19,-25,-59,-74,-11,-77,-69,6,75,-1,-11,39,-53,-40,-80,-70;
MA   /M: SY='E'; M=-59,-76,16,76,-75,-13,-55,-74,12,-28,-66,17,-62,0,8,7,4,-43,-79,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-42,-78,64,55,-30,-15,-4,-19,0,-22,-66,1,11,-24,8,-15,-58,-36,-83,-66;
MA   /M: SY='I'; M=-42,-72,-23,-19,-22,-12,-8,32,28,-5,-53,13,-36,-16,3,24,9,24,-78,-61;
MA   /M: SY='E'; M=-18,-2,14,45,-23,-16,-30,-1,1,9,-57,13,-31,-27,1,5,14,-11,-79,-64;
MA   /M: SY='L'; M=2,-22,-29,20,6,-14,-62,11,-11,21,-19,4,14,-57,4,11,-26,-8,-71,8;
MA   /I: E1=0; IE=-380; DE=-380;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /FT_KEY=ZN_FING; /FT_DESC=RG N-terminal-type;
CC   /VERSION=1;
PR   PRU01380;
DO   PDOC52036;
//