ID   UBM; MATRIX.
AC   PS52064;
DT   28-JAN-2026 CREATED; 28-JAN-2026 DATA UPDATE; 28-JAN-2026 INFO UPDATE.
DE   Ubiquitin-binding motif (UBM) domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=36;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=33;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2780006; R2=0.0078158; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1244; N_SCORE=12.0; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=541; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='R?';
MA   /DEFAULT: M0=-65; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380;
MA   /I: B1=0; BI=-380; BD=-380;
MA   /M: SY='I'; M=-15,-152,14,41,-4,-64,-141,71,-138,-28,-128,16,-147,13,-143,12,-26,-42,-150,9;
MA   /M: SY='T'; M=-16,-148,32,42,-149,-47,-1,-6,-48,-44,-139,30,-142,-14,7,29,57,-22,-162,-143;
MA   /M: SY='L'; M=-65,-3,34,-137,-18,7,-139,-28,-8,58,-124,18,-39,34,-2,-140,-138,-17,-151,-8;
MA   /M: SY='P'; M=1,-159,-141,1,-13,-144,-5,-144,-139,-23,-141,-144,115,-139,-148,10,-22,-52,-155,-149;
MA   /I: I=-26; MD=-67;
MA   /M: SY='S'; M=40,-149,25,8,13,-47,-142,-147,-139,-29,-144,-7,-4,-16,-144,65,-16,-56,-158,-143; D=-26;
MA   /I: I=-26; MD=-67;
MA   /M: SY='M'; M=-34,-16,39,-147,17,-158,-153,-141,-12,-144,69,-146,8,-37,-153,17,1,20,-167,-147; D=-26;
MA   /I: I=-26; MI=0; MD=-67; IM=0; DM=-67;
MA   /M: SY='P'; M=-142,10,2,16,-150,-60,-148,25,-140,4,-139,-41,41,-141,14,28,35,-56,-165,-150; D=-26;
MA   /I: I=-26; DM=-67;
MA   /M: SY='Q'; M=-64,-154,58,55,-154,21,-132,-13,-52,-151,-144,45,-143,60,-50,-129,17,-148,-157,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-137,-149,-159,-153,-11,-159,-154,67,-151,20,44,-152,10,-149,-153,-6,-133,67,-154,-134;
MA   /M: SY='D'; M=-15,-154,112,24,-52,-140,-133,-158,-132,-157,-155,-117,-143,-129,-140,22,-5,-153,-171,-146;
MA   /M: SY='P'; M=11,-152,-13,20,-150,-140,-136,-146,-66,-149,7,4,75,49,-138,45,18,-63,-153,16;
MA   /M: SY='E'; M=20,-150,-1,70,-153,19,-137,-150,-129,-8,-142,-131,-141,18,-5,48,-17,-144,-156,-146;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-146,-30,8,75,-156,-149,-113,-147,-38,-126,-149,-154,-149,-149,-140,-2,79,-143,-4;
MA   /M: SY='F'; M=-145,-147,-160,-154,84,-160,-144,-116,-153,72,47,-154,-158,-151,-151,-148,18,-122,-137,-116;
MA   /M: SY='E'; M=48,-150,-13,65,-143,-141,-132,-146,29,-63,-140,36,-143,13,-130,-37,-133,-38,-147,50;
MA   /M: SY='A'; M=67,-145,-129,63,-153,-137,-139,-143,-131,-146,-141,-13,-140,29,-137,18,34,-13,-157,-147;
MA   /M: SY='L'; M=-144,-147,-162,-154,-119,-164,-146,0,-155,97,16,-160,-161,-148,-152,-154,-140,-116,-149,-131;
MA   /M: SY='P'; M=-144,-169,-145,-133,-162,-146,-147,-150,-141,-64,-147,-151,134,-144,-153,-141,-137,-155,-157,-160;
MA   /M: SY='P'; M=-18,-154,26,61,-156,-144,-138,-146,23,-92,-145,27,74,-128,-134,-5,0,1,-160,-150;
MA   /M: SY='D'; M=6,-154,82,65,23,-144,-135,-153,-131,-151,-148,-127,28,-16,-139,-15,14,-148,-159,-141;
MA   /M: SY='I'; M=-140,-149,-15,13,-17,-161,-149,65,-148,54,38,-149,-152,-144,-150,-146,2,23,-152,-133;
MA   /M: SY='Q'; M=-32,-157,-135,-123,-153,-147,-129,-149,30,-5,-135,27,-148,96,79,-132,-138,-148,-152,-140;
MA   /M: SY='Q'; M=37,-151,-3,38,-144,-141,22,-149,18,-43,-139,31,-144,50,17,-4,-22,-144,-149,41;
MA   /M: SY='E'; M=-138,-157,61,98,-158,-50,-131,-156,-124,-23,-147,-128,-138,41,-132,-23,-137,-152,-160,-148;
MA   /M: SY='I'; M=6,-149,-157,-151,-130,-158,-155,75,12,29,-117,-151,-153,-147,-147,-144,-134,59,-154,-137;
MA   /M: SY='L'; M=-143,-151,34,-10,-9,-153,-138,4,-22,63,-14,24,-152,49,5,-142,-138,-50,-152,-134;
MA   /M: SY='A'; M=58,-146,8,-133,-13,-21,17,11,-7,-140,32,4,-145,39,-137,35,-9,-134,-153,-34;
MA   /M: SY='Q'; M=3,-151,46,33,-12,-36,-134,-70,-130,-2,-137,17,-144,80,-134,17,0,-29,-156,-140;
MA   /M: SY='W'; M=-8,16,-143,17,12,-150,52,-135,-27,36,36,-141,-151,30,29,-8,-139,-137,59,34;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-153,25,26,-149,-37,-137,-1,-3,-62,-137,8,-44,-9,72,-27,-62,30,-158,-143;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-151,-42,29,-144,-17,-25,0,-10,23,-132,-136,-5,18,45,37,-16,-22,-155,-141;
MA   /M: SY='Q'; M=15,-154,-129,58,-5,-146,8,-48,22,-38,-138,-7,-143,78,34,-41,-22,-145,-152,-139;
MA   /M: SY='Q'; M=-136,-152,-134,10,-147,-36,-132,-143,57,-4,57,16,-145,57,37,22,-9,-143,-153,-44;
MA   /M: SY='R'; M=1,-18,20,-130,0,-54,-10,-146,10,-73,12,-17,-32,20,77,22,-135,-27,-150,13;
MA   /M: SY='Q'; M=2,-151,11,11,-12,-147,33,-19,16,7,21,-4,-32,34,33,-4,-59,10,-155,-136;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-153,-80,3,3,-17,-135,-36,-124,-6,-133,-8,-9,55,68,-34,-23,6,-147,20;
MA   /I: E1=0; IE=-380; DE=-380;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=UBM;
CC   /VERSION=1;
PR   PRU01409;
DO   PDOC52064;
//