ID NCOA4_HBD; MATRIX. AC PS52084; DT 10-JUN-2026 CREATED; 10-JUN-2026 DATA UPDATE; 10-JUN-2026 INFO UPDATE. DE NCOA4 HERC2-binding domain (HBD) profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=63; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=58; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.7996895; R2=0.0097123; TEXT='-LogE'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1051; N_SCORE=12.0; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=484; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-29; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380; MA /I: B1=0; BI=-380; BD=-380; MA /M: SY='I'; M=3,22,5,-19,-67,9,-67,33,-10,-18,-56,-2,23,1,-65,16,31,-4,-80,-67; MA /M: SY='P'; M=-1,-72,-59,-55,-67,-62,-59,-13,37,-22,-61,25,52,2,-54,43,30,-61,-74,17; MA /M: SY='Q'; M=-13,25,27,41,-73,-67,-59,-64,-12,-17,13,-53,1,54,-57,19,37,-16,-82,-66; MA /M: SY='D'; M=-7,23,85,-2,-78,-18,-59,-65,-56,-71,-68,13,0,28,-63,-54,-6,21,-91,-70; MA /M: SY='M'; M=-10,24,31,-53,-63,-68,-59,-58,53,14,53,-55,3,2,-51,12,-9,-29,-74,8; MA /M: SY='Q'; M=-12,-73,-54,26,0,30,-59,-67,0,-27,-63,32,2,49,-57,39,-54,-10,-76,-64; MA /M: SY='R'; M=23,-75,-7,16,-76,-66,31,-71,31,-71,-63,-53,-68,32,67,12,-57,-9,-78,-63; MA /M: SY='W'; M=-70,24,-80,12,3,-75,-82,-66,-12,-66,-67,-80,-76,-65,-68,-72,-11,-16,159,24; MA /M: SY='L'; M=-67,-71,-81,-73,31,-85,-69,33,-14,75,-33,-77,-81,5,-70,-74,-63,-39,-67,-49; MA /M: SY='M'; M=7,-72,-60,15,-63,-67,30,-6,32,-9,49,-56,-67,33,-7,28,-4,-18,-73,12; MA /I: I=-12; MD=-29; MA /M: SY='R'; M=-17,16,19,0,-89,-24,31,-90,-12,-86,-77,-61,-79,18,48,15,-9,-83,-93,-75; D=-12; MA /I: I=-12; MD=-29; MA /M: SY='I'; M=-77,-94,-74,14,-86,3,-4,28,-5,-76,26,19,3,-72,-78,-5,-74,-71,-97,-83; D=-12; MA /I: I=-12; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; MA /M: SY='D'; M=22,-85,57,30,-86,-72,30,-82,-65,-31,-75,-60,49,-61,-72,-3,-64,-78,-93,-77; D=-12; MA /I: I=-12; DM=-29; MA /M: SY='T'; M=3,-80,-65,-5,-83,-9,-69,-21,37,-77,-70,-60,-72,31,16,-11,50,-69,-86,-74; D=-12; MA /I: I=-12; DM=-29; MA /M: SY='M'; M=-62,-79,38,22,-72,-70,31,-68,-10,-67,64,-3,13,-56,-63,43,-57,-18,-85,2; D=-12; MA /I: I=-12; DM=-29; MA /M: SY='C'; M=-24,61,-8,-68,22,-77,-72,-6,-9,-22,-61,-68,10,17,-70,-16,23,6,58,12; D=-12; MA /I: I=-12; DM=-29; MA /M: SY='D'; M=21,-73,38,-4,-74,6,-60,-68,0,1,-62,-1,31,30,0,0,20,-65,-80,-68; MA /M: SY='D'; M=25,-73,42,12,-68,25,-65,-55,-60,8,20,-59,33,-59,-4,-57,-58,23,-80,-67; MA /M: SY='P'; M=-19,17,5,-61,20,-17,-67,-6,-11,-27,-60,10,62,-62,16,-2,-9,12,51,-59; MA /M: SY='P'; M=-18,33,24,-52,-68,-68,23,-62,15,23,20,2,44,43,4,7,-57,-64,-80,-63; MA /M: SY='V'; M=-59,-70,-82,-74,10,-85,-77,44,-73,38,-38,-77,-79,13,-74,-69,-56,70,-75,-55; MA /M: SY='E'; M=19,-74,1,63,-75,-16,-57,-70,17,-24,28,6,-63,30,-7,-9,3,-66,-79,-67; MA /M: SY='D'; M=-62,-79,69,65,-73,-67,-54,-80,15,-77,-72,14,-64,8,-53,10,-57,-77,57,12; MA /M: SY='V'; M=23,-65,-77,-71,-56,-73,-76,-29,-70,6,31,-71,-75,-69,-72,-2,-5,82,-83,-62; MA /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82; MA /M: SY='K'; M=-63,-78,-60,-47,-76,-72,-58,-71,76,-73,-63,-53,12,18,72,-57,3,-9,-75,-65; MA /M: SY='A'; M=92,-62,-67,-61,-76,14,-69,-67,-63,-68,-62,-60,-66,-60,-68,-41,5,-54,-76,-72; MA /M: SY='N'; M=-60,-67,7,-55,-77,-52,-45,-75,-49,-82,-70,117,-71,-50,-57,3,6,-76,-95,-71; MA /M: SY='E'; M=-59,-80,-34,105,-82,-74,-54,-84,-4,-77,-72,-55,-57,-35,1,-5,-59,-76,-80,-72; MA /M: SY='P'; M=-58,-73,-67,-59,-67,-72,-70,-9,41,-21,-55,-62,72,-61,-58,-1,36,46,-80,-67; MA /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82; MA /M: SY='Q'; M=29,-71,43,-5,-79,-5,-58,-75,28,-75,-67,-47,-64,51,-52,48,7,-68,-80,-68; MA /M: SY='S'; M=-14,-67,7,-56,-74,14,31,-72,-10,-74,-67,14,-64,-54,-61,68,61,-65,-85,-65; MA /M: SY='F'; M=-71,-76,-77,-72,93,-79,47,-52,-68,-10,-51,-71,37,-72,-4,-69,-65,-6,-49,54; MA /M: SY='S'; M=1,-69,52,-49,-77,-56,-59,-71,18,-76,-70,1,6,-51,-57,79,-44,-16,-85,-68; MA /M: SY='E'; M=-13,-79,58,77,-82,-68,31,-82,32,-77,-71,-48,-61,20,-48,-13,-58,-76,-83,-67; MA /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82; MA /M: SY='V'; M=-8,-68,-83,-77,9,-82,-81,34,-75,18,-40,-78,-78,-75,-76,-67,-54,83,-78,-56; MA /M: SY='C'; M=-9,134,-73,-73,-66,-70,-71,-70,-70,-65,27,-61,-80,-72,-75,22,22,-61,-88,1; MA /M: SY='D'; M=-63,-78,98,32,-85,-64,-53,-81,-51,-80,-76,14,-65,38,-58,-7,4,-78,-93,-69; MA /M: SY='P'; M=-58,-79,22,52,-78,24,-61,-9,-55,-70,17,-55,61,31,-62,-1,18,-67,-80,-71; MA /M: SY='N'; M=-60,-73,10,-52,-78,-10,73,-78,-52,-79,-66,91,27,37,-57,16,-52,-79,-90,-63; MA /M: SY='C'; M=-61,154,-81,-81,-71,-77,-81,-78,-77,-69,-69,-67,-92,-85,-83,-64,-61,-66,-101,-82; MA /M: SY='Y'; M=3,9,-67,-15,31,36,27,-59,14,28,-52,-62,-74,2,-61,-60,-63,-60,-60,54; MA /M: SY='D'; M=-64,-78,52,18,22,-9,-56,-67,25,-8,-60,-53,-70,33,47,-59,-61,-22,-70,19; MA /M: SY='T'; M=-19,-69,-53,21,-71,3,-59,-62,-52,-16,-60,32,-65,47,-6,14,66,-10,-82,-66; MA /M: SY='A'; M=59,35,-59,0,7,-59,42,-60,-61,-3,-57,44,-70,-58,-65,-8,-4,-11,-79,-61; MA /M: SY='W'; M=0,-73,-1,-7,9,-69,-61,-7,-59,37,-49,10,-3,34,-6,16,-57,-16,45,5; MA /I: I=-33; MI=0; MD=-84; IM=0; DM=-84; MA /M: SY='K'; M=-57,1,3,33,-77,-16,19,-76,46,-32,-66,5,35,19,-6,43,-53,-73,-80,-67; MA /M: SY='N'; M=-57,-74,9,30,-73,7,46,-70,24,-73,-66,58,-67,-49,-5,31,-54,3,45,-62; MA /M: SY='W'; M=-64,-77,25,-5,23,-74,-67,-57,16,9,-57,-62,32,1,0,-61,27,5,98,-51; MA /M: SY='D'; M=-59,-73,53,17,-69,-68,17,-61,-9,15,-58,-51,24,7,-60,20,49,-19,-84,-64; MA /M: SY='Q'; M=21,34,0,-3,-68,4,22,-11,-57,13,-56,-55,-69,46,-6,20,23,-58,-79,-64; MA /M: SY='Y'; M=-55,-72,-60,-4,-62,-22,-61,-55,33,-63,-58,-56,27,37,-54,29,37,35,-71,38; MA /M: SY='Q'; M=-15,-76,16,0,-7,-66,-55,-65,45,14,-58,48,28,60,-48,-55,-57,-67,-76,-62; MA /M: SY='K'; M=-60,-74,34,23,-72,-66,-59,-71,58,-27,-66,27,13,-49,-48,0,44,-69,57,-64; MA /M: SY='W'; M=24,10,-69,-65,-2,12,-69,43,-64,2,-52,-4,1,35,-68,10,-7,-49,57,-58; MA /M: SY='W'; M=-20,-76,-1,41,-68,-22,-61,-62,0,6,-59,-3,11,-50,47,17,-57,6,50,-63; MA /M: SY='D'; M=-19,-73,72,-46,-71,-63,-55,-65,11,15,13,45,-69,34,-56,10,-5,-65,-85,-65; MA /M: SY='W'; M=2,-77,-2,-3,-66,-8,-60,-65,44,-16,13,2,30,16,14,-13,-59,-18,58,12; MA /M: SY='N'; M=-58,-72,22,-57,-62,6,-57,-9,-13,-18,48,55,-71,37,-60,-6,1,25,-76,19; MA /M: SY='H'; M=-61,-79,-52,49,-73,25,53,-6,51,-71,-64,8,31,-49,-50,-58,-61,-21,46,-63; MA /M: SY='N'; M=9,26,3,-60,-68,-12,-62,8,-9,-3,-57,65,30,-60,-64,-12,22,-1,-84,-68; MA /I: E1=0; IE=-380; DE=-380; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=NCOA4 HERC2-binding (HBD); CC /VERSION=1; PR PRU01429; DO PDOC52084; //