ID   HERC2_LIKE; MATRIX.
AC   PS52085;
DT   10-JUN-2026 CREATED; 10-JUN-2026 DATA UPDATE; 10-JUN-2026 INFO UPDATE.
DE   HERC2-like domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=67;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=67;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.8764880; R2=0.0078268; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1038; N_SCORE=11.0; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=463; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='R?';
MA   /DEFAULT: M0=-58; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380;
MA   /I: B1=0; BI=-380; BD=-380;
MA   /M: SY='V'; M=-28,-109,-118,-113,-95,-119,13,56,-109,-29,-83,-111,-115,-109,-7,4,-92,84,-122,-99;
MA   /I: I=-12; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-16,-117,-105,-114,-124,103,-112,-130,-18,-126,-115,-92,-109,-107,-114,-90,-108,-123,-115,-118; D=-12;
MA   /I: I=-12; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-28,-124,110,-19,-131,-108,-96,-127,-95,-124,-120,-82,-110,58,-102,-97,-102,-124,-138,-112; D=-12;
MA   /I: I=-12; MD=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-108,-122,-115,-18,9,-119,-8,-20,31,-1,-99,-110,-117,-101,38,-18,-14,17,118,-90; D=-12;
MA   /I: I=-12; MD=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-96,-110,-125,-120,-98,-127,-128,-12,-118,-83,-86,-120,-121,-120,-120,-108,-15,103,-131,-105; D=-12;
MA   /I: I=-12; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-108,39,-104,-95,-114,-117,39,-118,40,-115,-106,0,-117,13,91,-103,-106,-27,-119,2; D=-12;
MA   /I: I=-12; MD=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-104,38,-127,-121,14,-126,-118,49,-119,37,43,-119,-122,-117,-119,-25,-101,52,-118,-97; D=-12;
MA   /I: I=-12; MD=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-106,30,-6,-94,-113,-116,16,6,73,-18,-101,-96,-111,-10,33,-99,42,-103,-122,-106; D=-12;
MA   /I: I=-12; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=25,18,59,6,-107,-38,-102,-103,-30,14,-100,-97,20,-14,6,-96,14,-29,-118,15; D=-12;
MA   /I: I=-12; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-29,-114,82,-43,-122,22,-96,-122,-95,-123,-116,57,-109,-94,-18,54,-92,-117,-131,-112; D=-12;
MA   /I: I=-12; MD=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-29,-114,-121,-116,-93,-122,-115,51,-112,30,11,-115,-8,-111,-15,-19,-11,54,-117,5; D=-12;
MA   /I: I=-12; MD=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-20,-145,46,46,-145,-34,-123,-142,-115,-38,-134,-117,-131,2,-16,-122,-126,-138,-150,-136; D=-12;
MA   /I: I=-12; MD=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-29,-139,-130,-124,-136,-18,-131,-2,24,-129,-124,-121,-134,-119,35,-119,29,-25,-144,-131; D=-12;
MA   /I: I=-12; MD=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-33,17,-148,-142,-112,-147,-138,-9,-141,34,-104,-144,-147,-138,-141,-135,-124,31,-138,4; D=-12;
MA   /I: I=-12; MD=-29;
MA   /M: SY='K'; M=-132,-149,-122,-7,-150,-140,-125,-149,67,-146,-134,-119,-133,31,5,-125,-129,-145,-143,-135; D=-12;
MA   /I: I=-12; MD=-29;
MA   /M: SY='S'; M=-123,-142,15,7,-141,-28,-123,-139,9,-29,-130,-116,-133,-1,13,24,-121,-137,-146,-132; D=-12;
MA   /I: I=-12; MD=-29;
MA   /M: SY='M'; M=-131,-136,-148,-139,-15,-148,-130,-101,-23,45,73,-142,-144,-131,-132,-139,-127,-25,-137,-117; D=-12;
MA   /I: I=-12; MD=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-115,-100,-89,-117,-108,-99,-104,-2,-34,-99,-8,-108,101,-92,-23,60,-5,-120,-106; D=-12;
MA   /I: I=-12; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-23,20,-91,65,-117,-111,21,2,-90,-111,-105,7,-11,46,18,-3,37,-105,-124,-108; D=-12;
MA   /I: I=-12; MD=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-124,-108,-104,-126,68,-111,-122,-17,-125,-114,-102,95,-106,-15,-98,-105,-121,-119,-121; D=-12;
MA   /I: I=-12; MD=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-109,-121,-102,-97,-9,-115,119,-116,18,-9,-97,-92,-114,-90,63,-23,-26,-115,-126,-89; D=-12;
MA   /I: I=-12; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-99,-117,-107,-111,26,68,37,-112,-105,-36,-103,-2,-114,-104,-12,4,-14,-112,62,62; D=-12;
MA   /I: I=-12; MD=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-1,10,-15,30,-120,79,-106,-121,4,-36,-110,-94,-5,-11,-105,-18,-103,-116,-117,-115; D=-12;
MA   /I: I=-12; MD=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-114,17,-134,-120,15,-26,-134,-113,-112,-110,-113,-7,-120,-113,-116,-118,-123,-125,174,-71; D=-12;
MA   /I: I=-12; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='N'; M=-16,-110,-94,-23,-114,27,19,-110,32,-113,-105,47,-106,2,21,38,44,-24,-121,-106;
MA   /M: SY='D'; M=-38,-114,68,42,-120,28,-97,-117,-15,-117,8,21,14,-90,-100,41,-13,-113,-124,-110;
MA   /M: SY='Q'; M=15,-115,36,45,-113,-22,14,-26,16,-104,-99,-95,-107,54,13,-95,-97,40,-121,-105;
MA   /M: SY='M'; M=-27,-109,-108,-106,-101,24,-100,-19,2,-86,118,-17,-107,-97,-18,-3,45,-35,-117,-99;
MA   /M: SY='H'; M=21,-114,-11,-97,-4,-107,77,4,-97,-4,-95,-97,61,1,19,8,21,-99,-119,-97;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-116,0,53,-117,8,37,-118,25,-116,-108,-11,44,2,-14,19,-2,-113,35,-106;
MA   /M: SY='S'; M=15,17,-9,-101,10,-100,-102,-97,-101,-103,-100,-94,-10,-99,-106,73,46,19,-111,38;
MA   /M: SY='I'; M=-17,-111,-120,-114,-90,-121,-115,61,-26,45,2,-114,-115,-109,-27,-106,4,47,43,-96;
MA   /M: SY='G'; M=-29,-115,-9,-111,-122,104,-110,-127,-108,-124,-114,-89,-107,-106,-115,-88,-9,-120,-115,-116;
MA   /M: SY='Q'; M=-99,31,-103,-16,-9,-115,38,-6,46,-52,-93,-98,-110,54,14,-97,25,51,-118,-98;
MA   /M: SY='V'; M=-26,-109,-118,-113,-94,-120,-115,46,-106,-7,53,-111,-115,-108,12,-103,16,78,-121,-99;
MA   /M: SY='H'; M=-26,-113,-101,-103,-111,72,76,-112,-19,-55,15,-90,-107,1,-103,30,9,-32,-117,-12;
MA   /M: SY='T'; M=-3,27,-100,-31,-111,-7,-102,-20,25,-105,-100,-2,-108,-5,46,32,47,18,-120,-106;
MA   /M: SY='V'; M=-96,-109,-124,-119,-8,-125,-123,64,-116,-33,5,-117,-117,-116,-117,-109,-93,90,-119,-97;
MA   /I: I=-24; MD=-60;
MA   /M: SY='H'; M=-125,23,-132,-126,-133,-38,35,2,-20,-36,-121,-123,-139,11,12,11,-123,-22,-147,-127; D=-24;
MA   /I: I=-24; MI=0; MD=-60; IM=0; DM=-60;
MA   /M: SY='D'; M=-108,-122,70,19,-4,-115,38,-116,-23,-14,-109,-94,-114,-3,8,13,5,-115,-123,15; D=-24;
MA   /I: I=-24; DM=-60;
MA   /M: SY='E'; M=30,-118,8,49,-120,22,-106,-116,-99,-116,14,15,11,-96,-18,15,-100,-31,34,-113; D=-24;
MA   /I: I=-24; DM=-60;
MA   /M: SY='D'; M=-108,-121,101,9,-122,-108,-95,-124,10,-123,-118,35,-110,-93,5,-97,-17,-121,-132,-3; D=-24;
MA   /I: I=-24; DM=-60;
MA   /M: SY='G'; M=-99,-124,-11,-18,-129,85,21,-134,-18,-130,-119,-40,-114,2,-113,0,-110,-128,-124,-119; D=-24;
MA   /I: I=-24; DM=-60;
MA   /M: SY='D'; M=-110,11,71,-28,-122,0,-105,-44,21,-53,-117,23,-117,2,-105,-34,9,-119,-131,-2; D=-24;
MA   /I: I=-24; MI=0; MD=-60; IM=0; DM=-60;
MA   /M: SY='V'; M=-100,-109,-122,-116,-87,-34,-115,13,-115,63,17,-118,-119,-112,-115,-109,-20,67,41,-95;
MA   /M: SY='R'; M=-32,5,13,5,-108,-34,-103,18,40,-47,-97,-96,-109,-92,58,4,-11,35,-119,-104;
MA   /M: SY='V'; M=-27,19,-122,-117,-93,-123,-123,40,-115,-10,-81,-117,-118,-116,-117,-106,-92,96,-124,-101;
MA   /M: SY='Q'; M=42,-115,44,45,-116,-12,-96,-116,8,-113,-106,-91,-105,55,28,-2,-97,-109,-115,0;
MA   /M: SY='F'; M=-108,14,-123,-120,107,-122,-105,-30,-115,-41,-88,-114,-123,-121,-114,-109,-16,34,-87,52;
MA   /M: SY='C'; M=-8,91,15,-100,-22,-37,-107,4,-18,-41,-103,14,76,-103,-12,-3,-13,-102,-122,-110;
MA   /I: I=-26; MD=-67;
MA   /M: SY='G'; M=-33,-137,-130,-136,26,58,-130,-132,-131,-131,-128,-23,-135,-130,-136,-21,-125,-34,36,-14; D=-26;
MA   /I: I=-26; MI=0; MD=-67; IM=0; DM=-67;
MA   /M: SY='R'; M=-51,-135,-11,1,-128,12,18,-127,-107,5,-117,-114,-130,-1,44,-1,-119,-126,-137,-122; D=-26;
MA   /I: I=-26; DM=-67;
MA   /M: SY='Q'; M=-109,-129,44,41,-133,-23,-104,-129,-22,-129,-120,22,39,56,-104,13,-105,-127,-132,-120; D=-26;
MA   /I: I=-26; MI=0; MD=-67; IM=0; DM=-67;
MA   /M: SY='Q'; M=-27,-113,-11,-23,-114,22,19,-36,22,-108,13,19,-3,50,17,-18,50,-25,-120,-105;
MA   /M: SY='R'; M=-26,-115,-103,-15,-108,-47,16,-101,9,10,-96,-98,40,-90,76,24,-15,3,-118,-103;
MA   /M: SY='W'; M=-114,-134,-139,-120,39,-115,-132,-105,-112,-104,-108,-131,-120,-113,-115,-120,-122,-27,175,2;
MA   /M: SY='T'; M=-34,18,-104,-98,-104,-108,0,-25,-3,1,13,-95,-108,23,43,33,66,-22,45,-100;
MA   /I: I=-38; MD=-97;
MA   /M: SY='F'; M=-1,52,-117,-118,70,40,-106,8,-113,-10,-94,-108,-119,-114,-115,-102,-18,-23,-97,57; D=-38;
MA   /I: I=-38; MI=0; MD=-97; IM=0; DM=-97;
MA   /M: SY='N'; M=-100,-113,59,-29,-116,-100,69,-117,-29,-38,-108,77,-13,-92,-99,47,-16,-115,-133,-104; D=-38;
MA   /I: I=-38; DM=-97;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-123,-108,-99,-112,-108,-108,-18,-104,-37,16,-110,118,-105,-113,-24,-20,-31,-115,-2;
MA   /M: SY='A'; M=58,-106,-95,26,-115,21,-101,-110,-17,-111,15,24,-104,-92,-101,53,9,-102,-119,-109;
MA   /M: SY='E'; M=35,48,54,60,-111,-108,8,-97,-97,-10,-99,-96,-107,-3,-103,-95,-97,35,-124,-107;
MA   /M: SY='L'; M=-28,-108,-123,-115,-86,-122,-111,-18,-115,74,49,-119,-120,-110,-114,-111,-98,58,-115,-95;
MA   /M: SY='E'; M=-94,-112,-83,91,-113,-111,-99,-101,-89,-106,-103,-95,-100,-2,-97,22,52,30,-122,-108;
MA   /M: SY='K'; M=-2,-114,-108,-97,-104,-115,-105,-25,78,35,11,-102,-21,-94,8,-102,-16,-3,-116,-104;
MA   /M: SY='V'; M=12,-18,-19,-31,-94,-117,18,38,-111,2,18,-8,-117,-108,-113,-104,-97,66,-118,22;
MA   /M: SY='P'; M=26,-116,9,17,-119,-24,-19,-21,3,-114,-106,42,57,-4,11,-19,-19,-25,-123,-112;
MA   /I: E1=0; IE=-380; DE=-380;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=HERC2-like;
CC   /VERSION=1;
PR   PRU01430;
DO   PDOC52085;
//