ID   LNS2_IG; MATRIX.
AC   PS52092;
DT   10-JUN-2026 CREATED; 10-JUN-2026 DATA UPDATE; 10-JUN-2026 INFO UPDATE.
DE   Lipin/Ned1/Smp2 (LNS2)-associated immunoglobulin (Ig)-like domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=98;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=93;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9140383; R2=0.0117403; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=774; N_SCORE=11.0; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=391; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='A'; M=35,-15,-15,-25,-15,-15,-10,-22,5,-15,-3,-3,-12,-12,-12,-22,3,-2,7,-20,-15,-15;
MA   /M: SY='N'; M=-4,29,-17,14,0,-20,0,4,-20,-3,-30,-20,46,-17,0,-3,19,6,-24,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=12,-17,-10,-22,-19,-8,-20,-25,9,-15,-1,-1,-17,-19,-19,-17,3,14,24,-28,-12,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-21,-35,-29,1,-35,-29,38,-26,20,16,-25,-25,-24,-25,-17,-6,35,-24,-4,-29;
MA   /M: SY='V'; M=24,-20,-10,-25,-20,-10,-16,-25,11,-15,0,0,-20,-20,-20,-20,0,0,26,-25,-15,-20;
MA   /M: SY='C'; M=4,2,20,-8,-6,-25,-13,-8,-21,-8,-20,-13,7,-21,4,-11,2,-5,-17,-33,-20,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='G'; M=-10,19,-30,28,-1,-35,32,-10,-40,-10,-30,-25,10,-15,-10,-15,0,-15,-30,-30,-25,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-10,-30,-10,-10,-25,23,-10,-35,6,-25,-15,0,-20,-4,27,-5,-15,-25,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-13,-38,-3,14,-30,-20,-15,-22,-5,-28,-20,-15,68,-3,-15,-8,-10,-30,-30,-28,2;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-25,-15,-25,-23,-5,-28,-23,16,-8,3,5,-23,-28,-20,2,-10,-2,33,-28,-10,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-19,-30,-21,9,-30,-21,21,-29,45,19,-30,-30,-21,-20,-28,-9,15,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-3,9,-14,-1,-9,-13,-12,-9,-6,-8,-16,-11,18,-19,-9,-8,12,15,-2,-35,-15,-9;
MA   /M: SY='G'; M=12,-10,-25,-12,-18,-28,53,-20,-33,-18,-25,-18,-2,-18,-18,-20,2,-15,-23,-20,-28,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-23,-17,-30,-23,0,-23,-9,23,-13,17,46,-23,-23,-9,-13,-17,-7,21,-23,-3,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-15,-32,-30,0,-32,-30,35,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,45,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='T'; M=12,-2,-10,-12,-10,-12,-15,-20,-10,-10,-10,-10,-2,-10,-10,-12,18,38,0,-28,-12,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-5,0,-15,-8,-8,-12,-20,9,-15,-10,-12,-8,2,-12,-5,-8,13,33,-7,-30,-3,-8;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-15,-32,-30,0,-32,-30,35,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,45,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-13,-28,-13,-10,1,-25,49,-10,-15,2,5,-8,-25,-3,-7,-17,-15,-15,-11,32,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,42,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='T'; M=3,-1,-15,-9,-5,-16,-18,-18,-15,4,-15,-10,-1,-10,-5,-2,12,30,-5,-26,-11,-5;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,14,-30,21,29,-38,-18,5,-27,8,-22,-12,5,-8,36,3,0,-10,-30,-27,-15,33;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-18,-27,-13,-6,-16,-18,-18,-9,-16,-7,-9,-16,33,-11,-18,-4,-3,-14,-29,-19,-11;
MA   /M: SY='S'; M=20,-2,-10,-5,-2,-20,0,-12,-18,-10,-25,-18,5,-10,-2,-12,33,15,-8,-35,-20,-2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-12,3,-30,7,32,-28,-20,-3,-30,26,-23,-15,0,-7,15,25,-5,-10,-25,-25,-15,22;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-23,-18,-28,-23,0,-30,-25,24,-23,18,10,-20,-22,-20,-20,-11,7,23,-25,-5,-23;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-10,-28,-12,-10,10,-24,61,-19,-15,-10,0,-1,-24,-5,-6,-14,-16,-20,-13,30,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23,30,-30,-20,14,-30,39,14,-27,-30,-26,-20,-27,-10,7,-11,9,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-7,21,-25,30,4,-32,15,-8,-35,-8,-30,-25,12,-13,-6,-13,10,-6,-25,-34,-23,-1;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,0,-28,8,41,-20,-22,-5,-18,0,-3,-10,-7,-7,10,-5,-7,-10,-20,-28,-15,25;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-15,-32,-30,0,-32,-30,35,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,45,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-12,42,-22,32,5,-25,-2,8,-25,0,-30,-22,50,-18,0,-2,8,-2,-30,-40,-20,2;
MA   /M: SY='S'; M=0,10,-17,5,2,-22,-5,-5,-22,7,-30,-18,20,-12,2,2,21,8,-17,-35,-18,2;
MA   /M: SY='S'; M=5,10,-12,5,0,-20,0,-5,-20,-8,-30,-20,22,-12,0,-8,33,15,-15,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-22,-35,-27,3,-35,-27,37,-28,26,18,-25,-25,-22,-25,-20,-8,29,-22,-2,-27;
MA   /M: SY='T'; M=5,0,-10,-5,-5,-15,-10,-15,-15,-10,-20,-15,5,-10,-5,-10,30,35,-5,-35,-15,-5;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23,44,-30,9,0,-16,3,0,-20,-30,-19,-13,-20,-10,-7,24,66,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-3,4,-21,-1,-2,-20,-11,-11,-18,-8,-25,-18,11,16,-5,-11,14,14,-18,-35,-20,-5;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-30,0,-35,-30,40,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,40,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-12,10,-28,18,19,-29,-14,-4,-30,7,-25,-20,4,3,6,10,3,-5,-25,-32,-19,11;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-2,-27,2,21,-29,-17,-6,-22,0,-22,-14,-3,16,17,-5,5,1,-24,-29,-19,17;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-12,-25,-12,-7,-15,-22,17,-16,8,-13,-3,-5,-22,0,31,-10,-10,-6,-25,-3,-7;
MA   /M: SY='R'; M=7,-8,-20,-10,-3,-20,-10,-8,-22,9,-20,-12,0,-15,2,25,8,0,-12,-25,-15,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-28,-20,-30,-28,7,-33,-18,28,-20,10,10,-25,-27,-22,-20,-15,-5,30,-13,14,-28;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-15,-32,-30,0,-32,-30,35,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,45,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-15,-32,-30,0,-32,-30,35,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,45,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-13,-3,-30,-3,7,-27,-20,-7,-30,44,-27,-10,0,-13,10,41,-10,-10,-20,-20,-10,7;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='H'; M=-18,0,-30,0,5,-25,-20,79,-28,-5,-20,0,8,-18,22,2,-8,-18,-30,-28,13,9;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-18,12,-22,-20,19,-23,-9,-12,-20,-9,-9,-13,-28,-20,-17,-3,-3,-8,-10,18,-20;
MA   /M: SY='A'; M=38,-15,-10,-22,-15,-15,-7,-22,0,-12,-5,-5,-15,-15,-15,-20,5,0,12,-22,-18,-15;
MA   /M: SY='D'; M=-15,22,-28,33,22,-28,-15,0,-23,1,-16,-6,5,-9,6,-7,-5,-10,-21,-33,-15,14;
MA   /M: SY='C'; M=0,-10,58,-16,-16,-20,-16,-20,-25,-20,-25,-20,-6,-26,-16,-20,14,4,-10,-45,-25,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-17,-20,13,-23,-23,16,-30,6,-9,-16,-6,-6,-20,-33,-16,-16,-17,-10,-10,7,49,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-32,-22,5,-30,-18,27,-25,35,30,-25,-25,-15,-20,-25,-10,15,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=12,-2,-10,-12,-10,-12,-15,-20,-10,-10,-10,-10,-2,-10,-10,-12,18,38,0,-28,-12,-10;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-15,-30,-25,5,-30,-25,25,-25,29,15,-30,-30,-25,-20,-20,-5,31,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='P'; M=1,-16,-31,-10,-1,-27,-14,-18,-19,-10,-27,-19,-14,62,-8,-18,0,-4,-23,-30,-27,-8;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
PP   /COMPETES_HIT_WITH: PS52093; PS52094;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=LNS2-associated Ig-like;
CC   /VERSION=1;
PR   PRU01438;
DO   PDOC52092;
//