ID   LNS2_IG_N; MATRIX.
AC   PS52093;
DT   10-JUN-2026 CREATED; 10-JUN-2026 DATA UPDATE; 10-JUN-2026 INFO UPDATE.
DE   Lipin/Ned1/Smp2 (LNS2)-associated immunoglobulin (Ig)-like domain N-terminal part profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=66;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=61;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.2190480; R2=0.0118635; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=699; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=446; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=4,-4,-19,-6,-10,-23,27,-16,-27,-14,-27,-18,4,-14,-10,-14,20,8,-17,-30,-23,-10;
MA   /M: SY='G'; M=-2,0,-28,-4,-16,-28,57,-14,-36,-16,-30,-20,11,-20,-16,-16,2,-16,-30,-24,-28,-16;
MA   /M: SY='A'; M=34,-15,7,-23,-16,-17,-9,-23,-6,-14,-8,-8,-15,-17,-16,-21,4,-1,7,-26,-20,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-23,-36,-30,0,-36,-30,43,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,37,-24,-4,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-30,-18,-34,-30,0,-34,-30,38,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,42,-26,-6,-30;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-12,-30,-28,2,-30,-28,28,-22,18,12,-30,-30,-28,-20,-14,-2,42,-28,-8,-28;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-30,-13,-31,-30,0,-31,-30,33,-21,11,11,-29,-29,-29,-21,-11,-1,47,-29,-9,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-2,-30,0,20,-29,-20,3,-27,19,-20,-9,0,-12,28,35,-5,-10,-25,-22,-12,22;
MA   /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,0,-30,0,14,-34,-20,38,-23,4,-20,0,3,-13,45,7,-3,-13,-30,-23,-1,28;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-15,-37,-9,-1,-31,-3,-16,-24,-9,-29,-17,-14,56,-3,-16,-7,-12,-30,-27,-27,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-17,41,-29,54,25,-35,-11,1,-35,2,-28,-27,21,-9,4,-7,1,-9,-30,-38,-20,14;
MA   /M: SY='G'; M=6,0,-26,1,-12,-30,44,-17,-34,-15,-26,-20,1,-16,-15,-18,2,-15,-24,-23,-26,-13;
MA   /I: I=-13; MD=-27;
MA   /M: SY='T'; M=-1,4,-12,-1,-3,-13,-8,-7,-15,-2,-18,-12,11,-11,-2,3,17,18,-9,-27,-12,-3; D=-13;
MA   /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-20,-34,-24,40,-30,-20,11,-30,33,11,-26,-30,-29,-20,-26,-10,6,-7,13,-24;
MA   /M: SY='K'; M=3,-9,-21,-10,-2,-21,-16,-12,-13,12,-16,-6,-6,-15,4,10,0,-3,-3,-24,-13,0;
MA   /M: SY='C'; M=2,-8,44,-12,-12,-20,-12,-18,-24,-18,-26,-20,-2,-22,-12,-18,19,8,-10,-44,-24,-12;
MA   /M: SY='S'; M=5,-3,-12,-6,-5,-15,-6,-10,-12,-10,-19,-6,4,-12,-1,-10,28,19,-5,-35,-15,-3;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-14,-38,-4,11,-30,-20,-16,-22,-6,-28,-20,-16,73,-4,-16,-8,-10,-30,-30,-28,0;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-34,-33,-40,-30,50,-26,-24,-9,-26,-3,-9,-29,-30,-31,-20,-29,-19,-13,70,30,-26;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-5,-30,-5,-5,-8,-22,81,-23,-10,-15,0,3,-22,5,-2,-12,-18,-25,-16,34,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-13,-32,-30,0,-32,-30,33,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,47,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-12,-28,-14,-4,-16,-20,0,-20,22,-12,3,-4,-20,8,55,-12,-10,-14,-20,-8,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-38,-28,68,-30,-20,3,-30,17,3,-22,-30,-37,-20,-22,-10,2,5,25,-28;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-27,-10,-18,-27,55,-20,-35,-18,-27,-18,0,-18,-18,-18,3,-8,-25,-22,-27,-18;
MA   /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-5,-25,-7,2,-20,-22,-13,-18,27,-14,-5,-5,-13,2,15,-8,0,-12,-22,-8,2;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-20,-20,-24,-16,23,-21,-12,-3,-14,5,6,-13,-23,-16,-2,-8,-4,-2,-13,5,-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,6,-28,3,9,-33,-4,3,-24,11,-25,-8,11,-13,30,7,0,-9,-28,-24,-15,20;
MA   /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-25,-11,-26,-25,0,-26,-25,27,-18,10,10,-24,-24,-24,-18,-10,-1,39,-24,-7,-25; D=-9;
MA   /I: I=-9; DM=-18;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-21,-19,-21,-13,3,-23,-13,7,-14,28,11,-19,-23,-11,1,-21,-8,3,-17,-2,-13; D=-9;
MA   /I: I=-9; DM=-18;
MA   /M: SY='K'; M=0,5,-21,6,5,-23,-11,-7,-23,20,-20,-12,1,-10,3,14,-3,-6,-14,-20,-12,3; D=-9;
MA   /I: I=-9; DM=-18;
MA   /M: SY='G'; M=-3,5,-21,1,-6,-21,20,-7,-23,-9,-25,-17,15,-2,-8,-10,7,-5,-22,-26,-21,-8; D=-9;
MA   /I: I=-9; DM=-18;
MA   /M: SY='A'; M=4,-9,-16,-11,-6,-17,-4,-10,-9,-3,-12,-5,-6,-14,2,1,3,-3,-2,-21,-13,-3; D=-9;
MA   /I: I=-9; DM=-18;
MA   /M: SY='E'; M=-7,6,-23,6,14,-24,4,-1,-24,3,-20,-13,10,-10,9,5,1,-9,-24,-23,-16,11; D=-9;
MA   /I: I=-9; DM=-18;
MA   /M: SY='K'; M=-10,9,-24,9,3,-21,-16,-8,-13,14,-17,-8,7,-11,1,5,-6,-7,-12,-23,-10,1; D=-9;
MA   /I: I=-9; DM=-18;
MA   /M: SY='A'; M=3,-6,-15,-13,-11,1,-13,-12,-3,-6,-3,-3,-2,-17,-12,-8,-5,-4,0,-17,-6,-11; D=-9;
MA   /I: I=-9; DM=-18;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-30,-19,-35,-30,0,-35,-30,39,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,41,-25,-5,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-12,14,-27,20,12,-32,-13,1,-29,8,-25,-15,8,-12,19,14,4,-5,-24,-30,-15,14;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-37,-30,0,-37,-30,44,-27,17,17,-23,-23,-23,-27,-17,-7,36,-23,-3,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-6,-21,-5,-2,5,-21,-6,-9,-12,-2,-7,-8,-18,-9,-12,-3,4,-9,-15,10,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-30,-15,-32,-30,0,-32,-30,35,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,45,-28,-8,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='G'; M=-8,13,-30,22,3,-34,31,-11,-39,-9,-29,-24,7,-14,-8,-14,0,-15,-30,-28,-25,-2;
MA   /M: SY='H'; M=-10,5,-24,2,6,-21,-18,12,-20,10,-20,-9,9,-14,3,5,-1,-1,-15,-29,-7,4;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-2,-28,3,9,-23,-18,-9,-22,9,-17,-13,-3,4,2,10,-3,-6,-19,-28,-16,4;
MA   /M: SY='I'; M=4,-21,-18,-25,-19,-5,-23,-22,18,-22,9,6,-15,-20,-16,-21,-3,-1,16,-26,-8,-19;
MA   /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='D'; M=-13,29,-29,33,6,-31,0,-2,-31,-4,-30,-24,24,2,-4,-10,1,-8,-30,-36,-23,1;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-29,-16,-34,-28,33,-29,-21,16,-24,16,13,-25,-29,-29,-19,-18,-6,20,-12,8,-26;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-5,-25,-9,-10,-5,-5,15,-21,-14,-17,-10,3,-7,-10,-11,-2,-2,-19,-23,-2,-11;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,-20,-30,-20,2,-22,-4,20,-14,26,52,-22,-22,-4,-12,-22,-10,10,-20,0,-12;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-10,-28,-10,-2,-9,-24,-5,-15,23,-10,-3,-10,-18,0,13,-16,-10,-13,-8,13,-2;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-28,-18,-30,-22,7,-28,-18,22,-25,39,25,-28,-28,-18,-18,-25,-8,17,-22,-2,-20;
MA   /M: SY='G'; M=0,-8,-22,-6,-11,-15,9,-16,-13,-19,0,-6,-8,-20,-14,-18,-5,-8,-11,-25,-16,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-15,25,-30,34,20,-32,-13,8,-31,-1,-27,-22,14,6,3,-7,-1,-10,-30,-35,-18,10;
MA   /M: SY='S'; M=4,1,-18,-2,3,-11,-11,-3,-15,-5,-17,-13,5,-14,-1,-9,11,7,-13,-21,0,0;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-2,2,-27,6,33,-28,-17,-2,-26,11,-18,-14,-2,-6,17,11,0,-8,-23,-25,-17,24;
MA   /M: SY='A'; M=40,-12,11,-22,-13,-20,-5,-22,-13,-13,-12,-12,-12,-15,-13,-22,7,-2,-2,-25,-22,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-19,-23,-24,-21,37,-28,1,-2,-16,1,-2,-16,-26,-19,-13,-12,1,-5,13,48,-21;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /I: I=-15; MD=-32;
MA   /M: SY='V'; M=7,-21,-12,-25,-20,-3,-21,-22,19,-17,10,7,-20,-20,-19,-18,-8,-2,26,-21,-8,-20; D=-15;
MA   /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-6,-27,-11,-6,4,-19,-6,-17,-2,-15,-9,3,-4,-3,9,-8,-8,-19,-17,-4,-5;
MA   /M: SY='E'; M=1,6,-26,12,47,-28,-16,-4,-26,6,-18,-18,-2,-2,14,-4,2,-8,-24,-28,-20,30;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-5,-17,-5,-12,-9,-22,-16,2,-14,4,4,-10,-19,-13,-14,-4,10,9,-29,-9,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-11,29,-26,30,19,-29,0,1,-30,0,-27,-23,26,-12,3,-5,4,-8,-30,-35,-21,11;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
PP   /COMPETES_HIT_WITH: PS52092;
PP   /PROMOTED_BY: PS52094;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=LNS2-associated Ig-like;
CC   /VERSION=1;
PR   PRU01438;
DO   PDOC52092;
//