ID   HV_L_CBD; MATRIX.
AC   PS52106;
DT   02-SEP-2026 CREATED; 02-SEP-2026 DATA UPDATE; 02-SEP-2026 INFO UPDATE.
DE   Hantaviridae family large (L) protein cap-binding domain (CBD) profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=119;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=114;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1611967; R2=0.0170388; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=578; N_SCORE=12.0; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=255; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-18,-26,-18,-11,5,-27,-4,-1,0,11,5,-18,-24,-8,-2,-21,-10,-5,-4,23,-11;
MA   /M: SY='V'; M=0,-20,-16,-23,-20,-6,-23,-24,20,-20,0,3,-14,-21,-17,-20,3,4,25,-30,-10,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-15,-20,-15,-14,-12,11,-17,-11,-21,1,-5,-9,-21,-14,-17,0,-5,-9,-26,-16,-14;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-16,-4,-1,-19,-14,-14,-19,9,-22,-13,3,-10,-1,3,16,22,-9,-30,-13,-1;
MA   /M: SY='S'; M=1,-3,-22,-3,1,-29,14,-6,-26,-6,-27,-14,4,-13,14,-6,15,-1,-22,-28,-20,7;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-12,-30,-12,-8,7,-26,8,-12,13,-12,-4,-12,-22,-2,5,-16,-10,-14,11,45,-8;
MA   /M: SY='M'; M=-16,0,-23,0,-10,10,-20,-6,-5,-13,1,13,-7,-20,-12,-13,-14,-10,-6,-18,2,-9;
MA   /M: SY='Y'; M=3,-17,-24,-20,-17,14,-20,7,-3,-10,-3,-3,-17,-24,-10,-13,-10,-7,-7,14,48,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-21,-26,-21,-14,8,-27,-1,-1,-6,14,5,-18,-27,-8,9,-21,-10,-5,-4,23,-14;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-27,24,-34,-30,-6,-34,-30,18,-27,4,4,-23,-29,-26,-27,-14,-7,23,-33,-13,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-11,-22,-24,-25,-18,-8,-29,-18,13,-4,1,5,-16,-23,-12,12,-13,-7,17,-23,-7,-18;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='K'; M=-7,0,-24,-3,4,-24,-20,-13,-24,31,-24,-10,0,-10,4,17,0,9,-14,-23,-10,4;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-28,-38,-28,-24,22,-26,1,-8,-14,-8,-8,-28,-30,-14,-14,-28,-18,-18,76,61,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-14,44,-24,39,8,-28,-4,6,-28,0,-30,-24,45,-16,0,-4,6,-4,-30,-40,-20,4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-4,-34,3,25,-33,-20,-5,-23,2,-24,-14,-8,32,20,-5,-4,-10,-30,-27,-21,21;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-17,-24,-17,-12,0,-27,1,4,-7,-3,3,-17,-24,4,-7,-11,-7,4,-4,25,-6;
MA   /M: SY='T'; M=-4,4,-18,2,17,-18,-20,-12,-18,-2,-14,-14,0,-6,2,-6,12,27,-12,-30,-14,9;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,4,-24,-20,-4,-30,38,-24,-10,0,-16,10,55,-10,-10,-20,-20,-10,4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-24,-34,-24,6,-34,-24,32,-30,38,20,-26,-26,-20,-24,-26,-10,18,-20,0,-24;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-28,-38,-28,-24,22,-26,1,-8,-14,-8,-8,-28,-30,-14,-14,-28,-18,-18,76,61,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-2,6,-22,12,37,-26,-12,-4,-26,2,-24,-20,4,-4,12,-4,15,2,-22,-34,-20,25;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-16,46,-26,51,12,-32,-6,4,-32,0,-30,-26,35,-14,0,-6,4,-6,-30,-40,-20,6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-20,31,-30,44,14,-34,-13,0,-37,10,-27,-24,14,-13,3,16,-3,-10,-27,-34,-17,7;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-9,-16,-9,3,-12,-24,-18,0,-8,-5,-5,-12,-15,-9,-11,3,13,11,-30,-13,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-26,-20,-36,-26,49,-26,-12,8,-22,14,23,-20,-26,-25,-16,-20,-10,4,-2,18,-22;
MA   /M: SY='G'; M=-3,9,-21,0,-11,-21,21,-10,-25,-11,-24,-17,19,-17,-11,-11,9,7,-21,-29,-21,-11;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-13,9,-27,18,22,-20,-20,-6,-17,-6,0,-10,-4,-13,1,-9,-10,-10,-17,-30,-14,12;
MA   /M: SY='V'; M=8,2,-16,5,-8,-19,-15,-17,-4,-11,-9,-9,-8,-18,-14,-17,-1,-3,10,-30,-16,-11;
MA   /M: SY='C'; M=19,-10,32,-17,-14,-20,-10,-20,-19,-16,-19,-16,-7,-20,-14,-20,12,3,-6,-36,-23,-14;
MA   /M: SY='V'; M=13,-24,-13,-27,-21,-4,-20,-24,14,-20,15,6,-24,-24,-21,-20,-9,-3,22,-24,-10,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-17,4,-27,-1,0,-20,-14,3,-27,21,-23,-13,17,-20,7,50,-4,-7,-23,-26,-13,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-17,-24,-18,-1,-10,-31,-20,18,-14,4,4,-16,-16,-10,-17,-11,-7,16,-26,-9,-7;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /I: I=-14; MD=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-10,-15,-13,-4,14,-16,-4,-6,-7,-3,0,-6,-13,4,-4,-6,-6,-9,-3,7,2; D=-14;
MA   /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='W'; M=-6,-16,-25,-16,-16,-5,14,-16,-18,-12,-15,-12,-13,-16,-12,-12,-13,-16,-18,43,1,-12; D=-14;
MA   /I: I=-14; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-13,19,-30,28,28,-33,-17,-4,-33,22,-27,-19,6,-7,10,8,-4,-10,-26,-29,-16,19;
MA   /M: SY='K'; M=-14,19,-30,27,14,-34,-16,-6,-34,31,-30,-18,8,-10,6,15,-6,-10,-24,-28,-14,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-5,-30,-4,18,-21,-26,-12,-7,11,-12,-5,-6,-9,5,1,-9,-10,-9,-24,-11,10;
MA   /M: SY='K'; M=7,-6,-24,-9,1,-24,-14,-10,-24,25,-21,-10,-3,-13,4,25,-4,-7,-14,-20,-13,1;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-27,-22,-30,-27,10,-33,-14,26,-20,10,10,-24,-27,-21,-20,-16,-6,25,-8,22,-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-16,-22,-19,-16,1,-22,-8,8,-16,-5,-1,-8,-19,-9,-16,3,2,3,-13,15,-16;
MA   /M: SY='M'; M=-4,-17,-17,-21,-14,-3,-17,-9,8,-16,15,24,-15,-20,-6,-13,-6,-1,4,-26,-6,-10;
MA   /M: SY='T'; M=-3,3,-16,0,13,-16,-20,-14,-16,-4,-13,-13,0,-7,0,-7,14,31,-10,-30,-13,6;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-9,-16,-19,-16,-7,-26,-23,7,-16,-1,-1,-6,-13,-13,-16,8,33,9,-27,-7,-16;
MA   /M: SY='S'; M=1,14,-16,20,6,-26,-3,-7,-26,-7,-30,-23,13,-10,0,-10,28,11,-16,-40,-20,3;
MA   /M: SY='A'; M=16,-14,-16,-24,-16,-11,-19,-23,9,-16,0,0,-10,-13,-13,-20,3,11,10,-23,-11,-16;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-10,-6,-6,-14,-12,-16,-14,-10,-18,-14,4,-10,-6,-10,28,38,-4,-34,-14,-6;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,14,-30,20,20,-40,-17,7,-26,7,-23,-9,6,-10,43,4,0,-10,-30,-26,-13,31;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-8,-28,-7,0,-24,-20,-17,-20,9,-24,-14,-8,29,-4,-1,-1,7,-18,-27,-18,-4;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-16,-27,-16,-20,-17,38,-20,-21,-23,-4,-7,-10,-23,-20,-20,-10,-17,-17,-20,-20,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-6,-18,-5,11,-14,-23,-16,-5,-6,-7,-7,-10,-13,-5,-9,3,11,5,-30,-14,3;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-24,-27,-27,-17,-4,-31,-17,15,-11,16,10,-16,-23,-10,5,-20,-10,8,-20,-3,-17;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-16,-4,-1,-19,-14,-14,-19,9,-22,-13,3,-10,-1,3,16,22,-9,-30,-13,-1;
MA   /M: SY='T'; M=1,-10,-16,-16,-13,-11,-19,-19,6,-16,-8,-4,-3,-13,-9,-16,15,19,6,-31,-11,-13;
MA   /M: SY='V'; M=11,-21,-13,-27,-21,-6,-18,-17,15,-14,7,20,-21,-21,-14,-17,-7,-3,23,-24,-10,-18;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-17,12,-30,19,9,-29,-17,-3,-33,26,-26,-16,6,-14,7,32,-7,-10,-23,-26,-13,6;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-3,-27,-2,18,-21,-20,-4,-16,20,-12,7,-6,-10,10,9,-10,-10,-15,-23,-10,14;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-7,-24,-7,0,-20,-14,-3,-27,17,-23,-13,3,-17,7,44,6,0,-17,-26,-13,0;
MA   /M: SY='A'; M=16,-1,-16,-4,13,-20,-12,-14,-16,-4,-13,-13,-4,-7,0,-11,10,11,-10,-26,-17,6;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-6,-24,-2,13,-17,-23,19,-11,-6,-10,-4,-7,-16,1,-6,-6,-10,-4,-30,-5,6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=7,-13,-24,-19,-5,-21,-21,-12,6,-9,-4,4,-9,-13,14,-12,-4,-7,-2,-20,-10,3;
MA   /M: SY='S'; M=4,0,-16,0,3,-23,-6,-10,-23,9,-30,-17,7,-10,3,3,24,10,-13,-34,-17,3;
MA   /M: SY='C'; M=13,-16,70,-26,-22,-20,-18,-26,-22,-22,-16,-16,-16,-28,-22,-26,-2,-6,-6,-38,-26,-22;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-20,-23,-27,-17,20,-23,-6,-1,-5,5,20,-14,-23,-10,10,-17,-10,-2,-10,7,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-17,10,13,15,-1,-28,-19,-9,-34,1,-24,-21,2,-22,-5,10,-6,-10,-21,-36,-20,-5;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-30,-24,-37,-27,29,-34,-24,25,-30,25,14,-23,-26,-26,-24,-23,-10,14,-10,10,-27;
MA   /M: SY='H'; M=-14,7,-30,4,0,-23,-14,36,-24,-7,-26,-12,18,12,1,-6,-4,-11,-30,-33,-7,-3;
MA   /M: SY='V'; M=0,-20,-10,-24,-24,-3,-27,-27,17,-17,4,4,-20,-24,-24,-17,0,16,34,-30,-10,-24;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-8,-26,-9,11,12,-24,-11,-18,6,-11,-9,-8,-14,-6,1,-11,-10,-16,-12,2,4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-17,-29,-14,-1,-18,-24,-10,-5,-11,4,2,-17,11,9,-10,-14,-10,-15,-23,-12,2;
MA   /M: SY='A'; M=18,-13,-10,-16,-13,-14,-10,-19,-1,-13,-11,-7,-9,-16,-13,-16,15,8,12,-31,-17,-13;
MA   /M: SY='S'; M=1,0,-16,-3,4,-24,-12,-6,-17,-4,-21,-11,4,-10,17,-4,21,19,-14,-31,-14,10;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-30,-1,3,-30,44,-14,-37,-11,-27,-20,0,-14,-8,-14,0,-17,-30,-23,-27,-3;
MA   /M: SY='E'; M=-10,9,-24,18,19,-23,-20,-10,-13,-3,-13,-13,-4,-13,-2,-9,-3,-7,-4,-33,-17,9;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-3,-30,-3,10,-30,-20,-1,-27,32,-24,-7,0,-13,24,37,-7,-10,-23,-20,-10,15;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-3,-30,-3,4,-24,-20,29,-30,25,-24,-7,3,-16,10,32,-10,-13,-23,-23,0,4;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-13,-27,-16,-12,-16,6,-6,-17,3,-10,10,-6,-20,-2,18,-10,-13,-13,-20,-13,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-18,-21,-18,-16,-5,-26,23,4,-19,10,9,-15,-26,-12,-12,-16,-11,8,-27,4,-16;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-19,-33,-27,3,-33,-27,33,-26,26,16,-27,-27,-24,-23,-19,-6,31,-24,-4,-27;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-21,-27,-28,-18,17,-31,-21,11,-7,2,5,-14,-20,-18,-9,-17,-10,6,-10,7,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-10,12,-27,6,7,-27,-14,-4,-27,36,-30,-13,17,-13,7,21,-4,-7,-23,-26,-13,7;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-7,-24,-10,-9,-20,6,-12,-26,3,-20,-13,0,-17,-5,18,3,7,-16,-23,-16,-9;
MA   /M: SY='G'; M=0,-1,-24,3,12,-27,21,-11,-31,-7,-27,-20,3,-11,-1,-11,12,-5,-24,-29,-24,5;
MA   /M: SY='H'; M=-6,15,-20,8,0,-20,-6,30,-23,-6,-27,-14,29,-17,3,-3,14,1,-24,-37,-8,0;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-16,-27,-19,-23,2,41,-20,-28,-23,-18,-14,-6,-23,-26,-20,-6,-17,-21,-11,-13,-23;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-17,-21,-21,-17,32,-21,-2,-6,-16,-5,-6,-11,-24,-17,-13,-3,-1,-7,3,35,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-9,-27,-9,11,6,-23,-6,-21,6,-11,-10,-6,-16,-1,21,-10,-10,-17,-15,-2,4;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-31,-44,-31,-27,-2,6,-27,-26,-20,-23,-20,-28,-27,-20,-20,-28,-27,-30,101,13,-20;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-16,-27,-19,-23,2,41,-20,-28,-23,-18,-14,-6,-23,-26,-20,-6,-17,-21,-11,-13,-23;
MA   /M: SY='K'; M=7,-3,-24,-6,4,-27,-14,-13,-24,33,-24,-10,-3,-10,4,16,-4,-7,-14,-20,-13,4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-14,-37,-7,3,-30,-20,-17,-23,7,-30,-17,-14,61,-4,-6,-10,-10,-27,-27,-24,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-14,9,-27,3,3,-23,-14,0,-27,26,-26,-13,19,-17,7,36,-4,-7,-23,-26,-13,3;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-13,-30,-16,-12,-20,0,-19,-7,4,-14,-3,-6,-16,-8,-4,-10,-13,-7,-20,-13,-12;
MA   /M: SY='P'; M=-9,4,-33,13,-2,-33,18,-14,-34,-11,-30,-23,-1,19,-11,-17,-3,-14,-30,-29,-27,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-17,1,13,6,-11,-19,-19,-18,-31,-16,-24,-24,-10,-26,-16,-19,-15,-16,-24,12,-9,-12;
MA   /M: SY='W'; M=-11,-34,-32,-37,-30,4,-29,-30,17,-23,2,2,-31,-27,-23,-23,-25,-15,13,43,9,-26;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-9,-15,-22,-12,-1,1,-27,-5,3,-8,-2,-2,-18,-21,-9,-11,-10,-6,7,-11,16,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-5,14,-22,20,9,-29,-9,-7,-29,12,-30,-20,10,-10,3,3,12,2,-19,-34,-17,6;
MA   /M: SY='N'; M=-10,28,-23,14,3,-23,-6,4,-23,14,-30,-17,43,-17,3,9,4,-3,-27,-34,-17,3;
MA   /M: SY='C'; M=-3,-27,32,-30,-30,-6,-30,-30,11,-23,0,0,-27,-33,-30,-23,-10,-3,31,-36,-16,-30;
MA   /M: SY='V'; M=14,-22,-13,-29,-22,15,-18,-23,6,-19,2,-1,-19,-22,-25,-20,-5,-3,16,-15,-2,-22;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-30,-23,-37,-27,34,-33,-23,21,-30,26,12,-23,-27,-28,-23,-23,-10,12,-8,12,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-20,13,-30,21,8,-28,-16,0,-34,18,-24,-18,8,-16,6,39,-6,-10,-24,-28,-14,4;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-20,-14,-27,-24,28,-27,-23,5,-21,4,0,-16,-24,-27,-17,-4,12,14,-15,5,-24;
MA   /M: SY='A'; M=20,-4,-16,-8,-1,-23,-6,-14,-19,7,-22,-13,-1,-10,-1,-2,14,4,-9,-26,-17,-1;
MA   /M: SY='M'; M=-6,-27,-16,-30,-24,3,-27,-18,24,-20,26,28,-27,-27,-18,-17,-19,-6,25,-24,-4,-21;
MA   /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=Cap-binding Hantaviridae-type;
CC   /VERSION=1;
PR   PRU01450;
DO   PDOC52105;
//