ID   FV_VP35_NPBP; MATRIX.
AC   PS52111;
DT   04-NOV-2026 CREATED; 04-NOV-2026 DATA UPDATE; 04-NOV-2026 INFO UPDATE.
DE   Filoviruses viral protein 35 (VP35) nucleoprotein (NP) binding peptide (NPBP) domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=28;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=26;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.2244177; R2=0.0155984; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=563; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=339; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='M'; M=-14,0,-4,-2,-9,-16,-19,12,-9,-10,-4,18,-6,-20,-3,-11,-12,-12,-9,-31,-6,-6;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-4,-35,3,-4,-17,-15,3,-26,-11,-25,-19,-8,-3,-6,-13,-10,-14,-27,21,0,-5;
MA   /M: SY='G'; M=6,8,-25,12,-5,-31,29,-14,-33,-12,-25,-21,4,-15,-12,-17,2,-12,-23,-26,-25,-8;
MA   /M: SY='P'; M=1,-9,-24,-5,0,-25,-9,-15,-20,-10,-30,-20,-4,36,-5,-15,17,6,-19,-35,-25,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-4,5,-24,9,32,-29,-14,-1,-25,4,-23,-15,3,-5,23,-1,12,-1,-24,-31,-18,28;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-23,-20,-26,-23,28,-29,-9,7,-19,10,3,-20,-27,-22,-16,-14,0,7,-1,29,-23;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-9,-14,-16,-12,-8,-15,-9,1,-10,-2,19,-6,-14,-3,-10,7,16,2,-28,-8,-7;
MA   /M: SY='G'; M=-5,6,-26,10,2,-33,19,-7,-31,-7,-28,-17,6,-14,7,-9,8,-8,-26,-28,-21,4;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-15,-34,-15,-4,-16,-16,-12,-22,3,-24,-13,-13,-17,9,-1,-9,-12,-24,39,3,4;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-30,-18,-34,-28,12,-32,-27,29,-26,20,13,-26,-28,-27,-22,-17,-6,31,-20,0,-28;
MA   /M: SY='S'; M=16,-2,-10,-6,-4,-18,-4,-14,-16,-10,-22,-16,4,-10,-4,-12,30,22,-6,-34,-18,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-12,18,-30,30,52,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,4,-2,16,-2,0,-10,-30,-32,-20,34;
MA   /M: SY='Q'; M=4,-4,-26,-6,4,-34,6,-3,-23,-1,-20,-7,-2,-12,26,-3,2,-10,-24,-20,-17,15;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-30,-20,-32,-24,6,-32,-24,28,-28,37,18,-28,-28,-22,-22,-24,-8,22,-22,-2,-24;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-22,-20,-30,-20,2,-22,-4,20,-14,26,52,-22,-22,-4,-12,-22,-10,10,-20,0,-12;
MA   /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-13,4,-28,1,5,-25,-16,-3,-28,34,-27,-12,11,-15,8,37,-6,-8,-22,-24,-12,5;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-21,-34,-26,4,-34,-26,33,-28,29,18,-26,-26,-22,-24,-21,-8,27,-22,-2,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-12,-28,-6,0,-26,-12,-16,-20,-10,-30,-20,-8,51,-6,-16,9,2,-22,-34,-26,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-20,-34,-27,18,-32,-25,26,-28,26,14,-26,-28,-26,-22,-21,-8,22,-17,3,-27;
MA   /M: SY='D'; M=-11,32,-23,42,10,-30,-11,-6,-30,-4,-25,-24,14,-10,-2,-10,10,8,-20,-38,-18,4;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,13,-26,17,19,-33,-18,0,-24,4,-20,-12,5,-9,27,0,4,2,-24,-28,-14,23;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-30,-22,-36,-30,0,-36,-30,42,-26,16,16,-24,-24,-24,-26,-16,-6,38,-24,-4,-30;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='F'; M=-16,-30,-18,-38,-30,65,-30,-22,6,-28,10,2,-22,-30,-38,-20,-18,-8,9,2,22,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-10,-9,-11,-1,-23,-3,-14,-13,-11,-14,-8,-9,-18,1,-13,-5,-11,-10,-27,-18,0;
MA   /M: SY='D'; M=7,11,8,12,-3,-26,-12,-15,-25,-10,-19,-19,0,-16,-10,-17,3,0,-13,-34,-21,-7;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-1,-17,-8,-11,-13,-13,-12,3,-14,-13,-7,10,-17,-9,-14,12,5,2,-34,-14,-11;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=VP35 NPBP;
CC   /VERSION=1;
PR   PRU01455;
DO   PDOC52111;
//