PROSITE entry PS00091
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General information about the entry
Entry name [info] | THYMIDYLATE_SYNTHASE |
Accession [info] | PS00091 |
Entry type [info] | PATTERN |
Date [info] |
01-APR-1990 CREATED;
01-DEC-2004 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC00086 |
Associated ProRule [info] | PRU10016 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | Thymidylate synthase active site. |
Pattern [info] |
R-x(2)-[LIVMT]-x(2,3)-[FWY]-[QNYDI]-x(8,13)-[LVESI]-x-P-C-[HAVMLC]-x(3)- [QMTLHD]-[FYWL]-x(0,1)-[LV]. |
Numerical results [info]
Total number of hits | 404 in 404 different sequences |
Number of true positive hits | 403 in 403 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 1 |
Number of false negative sequences | 49 |
Number of 'partial' sequences | 1 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 99.75 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 89.16 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Archaea, Bacteriophages, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria), Eukaryotic viruses |
Maximum number of repetitions [info] | 1 |
Site [info] | active_site at position 11 |
Version [info] | 1 |
Cross-references [info]
UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
403 sequences
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UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
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UniProtKB/Swiss-Prot 'Partial' sequences |
1 sequence
TYSY_STAEP (P0C0M4) |
UniProtKB/Swiss-Prot False positive sequences |
1 sequence
DCLK_CAEEL (Q95QC4) |
PDB [Detailed view] |
247 PDB
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