PROSITE entry PS01031

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	SHSP
Accession [info]	PS01031
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-JUN-1994 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 08-NOV-2023 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC00791
Associated ProRule [info]	PRU00285

Name and characterization of the entry

Description [info]

Small heat shock protein (sHSP) domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=111;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=111;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.9372208; R2=0.0204281; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=346; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=175; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M:         M= -1, -6,-21, -8, -4,-16,-11, -9,-10, -5,-10, -4, -4,-10, -3, -5,  0, -1, -7,-26,-13, -5;
/M: SY='A';  M=  1,-10,-19,-14, -8, -8,-12,-14, -9, -8, -8, -6, -7,-14, -7, -7, -1,  0, -6,-20, -9, -8;
/M:         M= -3, -8,-23,-10, -4,-11,-11,-10,-12, -4,-11, -6, -4,-11, -6, -1, -2, -3,-10,-21, -9, -6;
/M: SY='S';  M=  0, -4,-20, -7, -4,-16, -8,-12,-12, -7,-14,-10,  0,-10, -6, -6,  3, -2, -9,-26,-15, -6;
/M:         M= -6, -4,-24, -3, -2,-14, -9, -9,-15, -8,-15, -9, -4, -5, -5,-10, -1, -5,-14,-21,-11, -4;
/M: SY='A';  M=  2,-13,-21,-17,-13, -6, -7,-16, -4,-15, -3, -3, -9,-17,-13,-14, -4, -4, -2,-18, -9,-13;
/M:         M= -4, -6,-20, -8, -7, -7,-10, -9,-12, -7,-10, -7, -2,-18, -8, -4,  0, -2, -8,-22, -6, -8;
/M: SY='P';  M= -1, -6,-23, -6, -3,-20,-14,-13,-13, -6,-18, -9, -4, 16, -5,-10,  2,  2,-13,-28,-18, -6;
/M: SY='P';  M= -5, -9,-30, -7,  0,-25, -4,-12,-24, -2,-25,-16, -6, 24, -4, -2, -2, -6,-24,-26,-21, -5;
/M: SY='V';  M= -3,-21,-19,-26,-21,  5,-22,-15,  9,-16,  5,  8,-18,-23,-16,-14,-11, -5, 10, -9,  5,-19;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='D';  M=-13, 16,-27, 23, 13,-25,-15, -5,-22,  1,-19,-16,  7, -9,  1, -3, -2, -6,-18,-31,-14,  6;
/M: SY='I';  M= -5,-21,-24,-23,-16, -3,-22,-20,  9,-17,  2,  1,-18,-19,-16,-18,-13, -9,  9, -5, -3,-17;
/M: SY='R';  M= -8, -7,-24, -9, -2,-18,-17, -7,-15,  9,-14, -6, -5,-14,  2, 11, -5, -3,-11,-20, -8, -1;
/M: SY='E';  M= -9,  3,-24,  6, 18,-21,-19, -5,-17,  0,-13,-10, -1, -6,  4, -3, -1, -3,-15,-29,-14, 10;
/M: SY='D';  M= -6,  9,-20, 10,  3,-23, -4, -9,-23, -4,-20,-16,  5,-11, -3, -8,  7,  7,-16,-30,-16,  0;
/M: SY='D';  M= -9, 11,-28, 16, 14,-30, -8, -6,-29,  7,-26,-19,  6,  1,  3,  1, -1, -8,-25,-30,-19,  8;
/M: SY='D';  M=-11, 20,-26, 26, 14,-29, -8,  0,-29,  3,-25,-19, 14,-11,  4, -1,  3, -6,-24,-32,-16,  9;
/M: SY='K';  M=  0, -2,-22, -3,  2,-22, -8,  2,-21,  3,-19,-10,  1,-13,  3,  2,  0, -6,-16,-25,-11,  1;
/M: SY='Y';  M=-17,-23,-25,-27,-22, 30,-29,  1,  2,-20,  7,  2,-19,-28,-19,-15,-20,-11, -4, 14, 37,-21;
/M: SY='E';  M= -6,-10,-23,-11,  1,-13,-23, -5, -5,  0, -8, -3, -9,-16,  1,  1, -5, -5, -2,-22, -5,  0;
/M: SY='I';  M= -9,-28,-21,-33,-26, 12,-32,-23, 26,-25, 19, 14,-24,-22,-23,-22,-19, -7, 22,-18,  2,-26;
/M: SY='R';  M= -7, -7,-19, -9, -2, -9,-20, -8,-11,  0,-10, -6, -3,-17, -4,  4, -3, -1, -7,-23, -7, -4;
/M: SY='L';  M=  0,-23,-17,-27,-19,  5,-24,-21, 14,-22, 18, 10,-22,-24,-19,-19,-14, -4, 14,-20, -3,-19;
/M: SY='D';  M= -8, 26,-26, 35, 18,-29,-12, -3,-28, -2,-20,-21, 11,-11,  1, -9,  1, -7,-22,-32,-17,  9;
/M: SY='V';  M= -4,-27,-16,-30,-24,  3,-28,-21, 24,-21, 23, 20,-26,-26,-20,-18,-17, -5, 26,-24, -5,-22;
/M: SY='P';  M= -1, -9,-30, -6,  1,-27,-15,-12,-20, -1,-25,-15, -8, 39, -3, -8, -3, -6,-22,-28,-22, -4;
/M: SY='G';  M= -4, -4,-28, -4,-11,-27, 38, -2,-33,-15,-26,-16,  2,-17, -9,-14,  0,-14,-27,-24,-20,-11;
/M: SY='F';  M=-13,-28,-19,-34,-27, 37,-29,-20, 13,-26, 16,  7,-22,-28,-29,-20,-19, -8, 12, -7, 14,-27;
/M: SY='S';  M=  0, -1,-21, -2,  1,-18,-10, -9,-19,  3,-17,-12,  1,-11,  0,  1,  6,  1,-13,-27,-13,  0;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='P';  M= -7, -6,-31, -2,  9,-28,-17,-11,-24, 14,-26,-13, -6, 23,  5,  5, -4, -7,-23,-26,-19,  5;
/M: SY='E';  M= -9, 13,-27, 20, 32,-30,-13, -1,-30,  7,-24,-19,  6, -3, 11,  0,  2, -7,-27,-31,-19, 21;
/M: SY='D';  M=-10, 24,-28, 34, 31,-32,-13,  2,-31,  4,-24,-21, 11, -7, 11, -4,  2, -8,-27,-33,-18, 21;
/M: SY='I';  M= -8,-30,-20,-33,-26,  6,-33,-25, 31,-27, 29, 18,-26,-27,-23,-23,-21, -7, 26,-22, -2,-26;
/M: SY='K';  M= -8,  2,-24,  2,  7,-19,-18, -8,-18, 10,-17, -9,  1,-12,  3,  5,  0,  0,-13,-26,-10,  5;
/M: SY='V';  M= -4,-30,-15,-33,-29,  2,-33,-29, 33,-24, 15, 13,-27,-27,-26,-23,-15, -4, 39,-25, -5,-29;
/M: SY='E';  M= -7,  6,-25,  7, 14,-25,-16, -4,-23, 11,-21,-12,  4,-10, 11,  4,  3,  0,-20,-23,-12, 12;
/M: SY='V';  M= -1,-22,-16,-26,-22,  0,-26,-18, 17,-20,  9,  7,-20,-24,-19,-18, -8,  2, 23,-23, -2,-22;
/M: SY='E';  M=-10,  6,-26, 11, 18,-22,-19,  2,-20,  4,-15,-11,  1,-11,  7, -1, -3, -7,-17,-28,-11, 12;
/M: SY='D';  M=-11, 15,-28, 20,  8,-27,  3, -2,-31, -2,-25,-19, 10, -9,  0, -5,  0,-10,-26,-29,-17,  4;
/M: SY='N';  M= -7, 15,-25, 14,  3,-26,  3, -3,-27, -2,-26,-19, 18, -8, -1, -3,  6, -4,-24,-32,-20,  0;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='V';  M= -7,-15,-19,-17,-11, -4,-24,-10, -1, -4, -4,  0,-12,-21, -8, -2, -7, -3,  4,-17,  1,-10;
/M: SY='L';  M= -8,-30,-18,-31,-23,  7,-31,-23, 25,-27, 38, 18,-29,-29,-22,-21,-24, -8, 21,-22, -2,-23;
/M: SY='T';  M= -5,-10,-19,-12, -4,-10,-23,-13,  1, -9, -3, -2, -8,-17, -7, -8, -1,  6,  4,-27, -9, -6;
/M: SY='I';  M= -6,-29,-22,-34,-29,  0,-35,-28, 38,-23, 14, 14,-23,-24,-23,-22,-15, -6, 35,-24, -4,-28;
/M: SY='K';  M= -6,  0,-23,  0,  8,-22,-15,  4,-23, 10,-22,-11,  4,-12,  9, 10,  6,  3,-17,-28,-10,  7;
/M: SY='G';  M=  7,-11,-25,-13,-18,-26, 50,-20,-30,-19,-24,-16, -3,-18,-18,-20,  1,-15,-21,-21,-26,-18;
/I:         I=-2; MD=-3;
/M: SY='E';  M= -8,  3,-26,  5, 21,-25,-18, -3,-22, 16,-19,-11,  1, -9, 14, 10, -3, -6,-20,-24,-13, 17; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-3;
/M: SY='H';  M=-11, -5,-27, -6,  1,-21,-17, 18,-22, 10,-19, -7,  0,-11,  6, 17, -6, -9,-19,-21, -4,  1; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-3;
/M: SY='E';  M= -3, -1,-18,  0,  8,-17,-10, -6,-15,  8,-16, -9,  0,  1,  4,  4,  1, -1,-13,-18,-11,  5; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-3; IM=0; DM=-3;
/M: SY='E';  M= -5,  0,-17,  1,  9,-11, -9, -4,-13,  1,-11, -9,  0, -3,  1, -1, -1, -3,-12,-17, -8,  5; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-3;
/M: SY='E';  M= -5,  3,-16,  5, 10,-16,-11, -4,-14,  6,-13, -9,  1, -5,  4,  1, -1, -4,-11,-19,-10,  7; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-3;
/M: SY='E';  M= -5,  4,-17,  6,  9,-18, -8, -5,-16,  6,-15,-10,  3, -3,  3,  0,  0, -2,-14,-20,-11,  5; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-3;
/M: SY='E';  M= -5,  7,-19,  8, 11,-20, -1, -4,-21,  1,-19,-14,  8,-10,  3, -3,  2, -5,-19,-23,-15,  7; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-3;
/M: SY='E';  M= -8,  6,-22, 10, 16,-22,-13, -4,-20,  4,-16,-13,  1, -9,  4,  2, -1, -5,-16,-26,-14, 10; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-3;
/M: SY='R';  M= -8,  1,-22,  1,  4,-21,-11, -6,-22, 10,-18,-10,  1,-11,  2, 12, -3, -4,-16,-24,-13,  2; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-3;
/M: SY='Y';  M=-12,-11,-29,-10, -3, -6,-19, -5,-11, -5, -9, -4,-12,-15,  1, -7,-13,-11,-15,  9, 10, -1; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-3;
/M:         M=-10, -3,-23, -1, -3,-13,-15, -1,-12, -9, -4, -6, -5,-17, -5, -6, -8, -6,-11,-22, -6, -5; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-3;
/M: SY='E';  M=-10, -1,-26,  1,  5,-19,-14,  4,-20,  1,-16, -9, -1,-15,  5,  4, -5, -9,-18,-17, -5,  3;
/M: SY='H';  M= -7, -3,-24, -4, -2,-19,-11, 15,-17, -3,-17, -6,  2,-15,  4, -1,  0, -6,-15,-25, -4, -1;
/M: SY='E';  M= -6,  0,-21,  2, 11,-25, 11, -7,-29, -6,-22,-17,  1,-12, -2, -8,  0,-11,-25,-27,-20,  4;
/M: SY='R';  M=-12,-14,-24,-17,-10, -2,-21, -5,-10,  0, -8, -4, -8,-21, -5, 13, -9, -5, -9, -8,  7,-10;
/M: SY='S';  M=  0,-12,-19,-15,-10,-14,-11,-15, -5, -9,-12, -5, -7,-11, -9, -8,  3,  0, -2,-23,-12,-11;
/M: SY='S';  M= -4, -5,-17, -6, -4, -8,-13, -6,-13, -7,-14, -9, -3,-14, -6, -7,  3, -1,-10,-21, -4, -5;
/M: SY='R';  M= -7, -4,-27, -6, -4,-24, 11, -6,-29,  5,-24,-13,  4,-17,  0, 16, -1, -9,-22,-23,-17, -4;
/M: SY='E';  M= -6,  3,-22,  3, 11,-23,-14, -2,-22,  7,-21,-14,  5, -7,  4,  4,  3, -2,-18,-29,-14,  7;
/M: SY='F';  M=-19,-28,-21,-36,-27, 65,-29,-16,  1,-26,  9,  1,-20,-29,-34,-18,-19, -9,  0, 10, 32,-27;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='H';  M= -5, -4,-20, -7, -2,-16,-14,  2,-13, -2,-14, -3, -1,-16,  0, -2,  1,  0, -9,-24, -8, -2;
/M: SY='R';  M=-14, -9,-26,-10, -2,-16,-19, -2,-22, 17,-15, -7, -2,-18,  5, 38, -6, -5,-15,-21, -7, -1;
/M: SY='R';  M= -5, -5,-22, -7,  0,-20,-16, -6,-17, 11,-18, -7,  0,-15,  6, 17,  2,  1,-11,-25,-10,  2;
/M: SY='F';  M=-14,-27,-21,-33,-26, 36,-31,-15, 12,-24, 15,  7,-22,-28,-26,-19,-20, -8,  8,  0, 24,-25;
/M: SY='R';  M= -7, -1,-24, -3,  2,-20,-15, -7,-17,  7,-17, -9,  1,-10,  4, 10,  0,  0,-13,-26,-12,  2;
/M: SY='L';  M=-10,-29,-20,-30,-21, 12,-30,-20, 20,-29, 43, 18,-28,-29,-21,-20,-27, -9, 12,-19,  1,-21;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='P';  M= -7,-15,-32, -8, -1,-24,-14,-16,-17, -9,-24,-16,-14, 62, -8,-17, -6, -6,-23,-25,-23, -8; D=-11;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='E';  M= -3,  7,-20, 10, 16,-23,-10, -6,-21,  2,-20,-16,  3,  0,  4, -4,  4, -3,-18,-26,-16, 10; D=-11;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='B';  M= -4, 18,-24, 16,  6,-26,  1, -4,-26, -2,-25,-19, 18,-11, -1, -5,  5, -4,-23,-32,-20,  2;
/M: SY='V';  M=  4,-19,-10,-21,-16, -5,-23,-17,  9,-16,  5,  2,-19,-23,-18,-18, -9, -4, 17,-23, -5,-18;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='D';  M=-11,  9,-28, 14,  7,-25,-16, -2,-21,  2,-17,-13,  3,  1,  1, -3, -6, -8,-20,-29,-14,  2;
/M: SY='T';  M= -2, -9,-21,-10, -5,-13,-18,-13, -3,-10, -4, -1, -9,-11, -6,-12, -3,  1, -1,-24,-10, -6;
/M: SY='D';  M= -3, 13,-24, 17, 13,-27,-11, -1,-24,  0,-21,-16,  7, -9,  5, -4,  5, -3,-20,-31,-16,  8;
/M: SY='V';  M= -6, -8,-21,-10, -6,-13,-18,-12, -2, -3, -6, -1, -6,-18, -4, -5, -5, -3,  2,-26,-10, -6;
/M: SY='V';  M= -3,-17,-20,-22,-17, -7,-26,-20, 15,-13,  1,  5,-13,-17,-13,-14, -4,  3, 16,-26, -8,-17;
/M: SY='S';  M=  1, -1, -7, -4, -1,-23, -7, -9,-24,  3,-24,-14,  3,-15,  0, -1,  8,  2,-16,-30,-16, -1;
/M: SY='A';  M= 29, -8, -7,-16,-10,-18, -5,-17,-10,-11,-12,-10, -6,-13, -9,-16, 11,  4, -1,-26,-18,-10;
/M:         M= -6,-10,-21,-11, -3, -8,-17,-12, -6,-10, -1, -3, -7,-18, -4, -8, -3, -2, -6,-19, -8, -4;
/M: SY='F';  M= -7,-18,-14,-22,-17, 10,-20,-12,  1,-18,  6,  6,-14,-22,-15,-14, -7, -1,  1,-15,  5,-16;
/M: SY='E';  M= -6,  5,-25,  8, 12,-24,-13, -5,-21,  5,-20,-13,  2, -5,  3, -1,  0, -4,-17,-29,-15,  7;
/M: SY='D';  M=-13, 33,-25, 34, 13,-29, -6,  6,-29,  2,-28,-22, 29,-14,  3, -3,  4, -6,-28,-36,-17,  8;
/M: SY='G';  M= -1, -7,-29, -7,-15,-30, 61,-17,-38,-17,-29,-20,  3,-19,-16,-18,  1,-18,-30,-21,-29,-15;
/M: SY='V';  M= -6,-25,-18,-28,-22,  2,-29,-20, 21,-20, 15, 12,-23,-26,-19,-17,-14, -4, 25,-24, -4,-21;
/M: SY='L';  M=-10,-29,-20,-30,-20,  8,-29,-20, 20,-29, 46, 20,-29,-28,-20,-20,-29,-10, 11,-20, -1,-20;
/M: SY='T';  M= -6, -5,-18,-10, -5,-10,-20, -6,-11, -4,-11, -6, -3,-15, -4, -3,  4, 15, -5,-21, -4, -5;
/M: SY='I';  M= -7,-29,-21,-34,-28,  6,-32,-27, 33,-26, 20, 14,-24,-25,-24,-24,-17, -7, 30,-22, -2,-28;
/M: SY='T';  M= -6, -1,-17, -3,  2,-13,-19,-11,-14, -2,-14,-10, -1,-13, -3, -2,  6, 12, -7,-28,-10, -1;
/M: SY='V';  M=  3,-25,-17,-29,-24,  1,-18,-24, 17,-22, 12,  8,-21,-24,-22,-21,-12, -6, 20,-21, -7,-24;
/M: SY='P';  M= -9,-11,-33, -5,  6,-26,-19,-14,-19, -4,-24,-16,-10, 48, -3,-11, -5, -7,-24,-29,-23, -1;
/M: SY='K';  M=-11, -5,-24, -5,  2,-22,-21, -9,-22, 30,-21, -8, -3,-13,  4, 26,-10, -9,-14,-22, -9,  2;
/M:         M= -6, -2,-24, -3,  0,-17,-19,-11, -8, -2, -9, -6, -2,-10, -3, -4, -5, -3, -7,-27,-12, -2;
/M: SY='E';  M= -2, -7,-23, -6,  5,-20,-14,-11,-12, -1,-14, -8, -7, -1, -1, -7, -3, -5,-10,-26,-15,  1;
/M: SY='P';  M= -3, -9,-26, -8, -3,-19,-12,-11,-13, -8,-16,-10, -7, 12, -6,-11, -1, -3,-13,-27,-16, -6;
/M: SY='E';  M= -4,  2,-25,  3, 10,-24,-10, -6,-21,  3,-21,-14,  1, -2,  3, -3,  3, -2,-18,-28,-15,  6;
/M: SY='E';  M= -2, -2,-24, -2,  8,-21,-15, -8,-18,  6,-17,-10, -2, -5,  4,  1,  1, -2,-14,-26,-14,  5;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='P';  M= -6, -4,-27, -2,  3,-23,-16, -9,-16,  1,-17,-10, -5, 11,  1, -2, -3, -4,-15,-26,-16,  0; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='K';  M= -3, -3,-22, -3,  3,-16,-13, -8,-15,  5,-15, -9, -2, -4, -1,  1, -1, -3,-11,-22,-11,  0; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-28,  0,  9,-27,-17, -3,-25, 21,-23,-10,  2, -7, 15, 21, -3, -6,-21,-24,-13, 10;
/M: SY='T';  M= -4, -9,-22, -9,  0,-16,-18,-13, -7, -4,-10, -6, -7, -6, -4, -4,  0,  1, -4,-28,-13, -4;
/M: SY='I';  M= -6,-18,-25,-22,-15, -7,-24,-18, 10,-10, -2,  2,-11,-13,-10, -6, -8, -6,  6,-22, -7,-15;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='E';  M= -3, -1,-25,  0,  9,-24,-14, -8,-17,  0,-19,-12,  0,  6,  4, -4,  1, -3,-17,-28,-17,  5;
/M: SY='I';  M= -5,-25,-21,-33,-27, -1,-31,-26, 33,-25, 13, 12,-18,-22,-21,-25,-14, -6, 26,-23, -4,-27;
/M: SY='E';  M= -1,  4,-24,  2,  9,-25,-11, -3,-22,  3,-23,-14,  6,  1,  7, -1,  5, -1,-21,-28,-16,  7;
/M: SY='V';  M= -2,-17,-21,-19,-13,-10,-16,-19,  8,-13, -2,  1,-13,-19,-13,-12, -6, -5, 11,-24, -9,-14;
/M: SY='E';  M= -1,  7,-21,  6,  9,-23,-10, -7,-21,  0,-21,-15,  8, -6,  4, -3,  8,  3,-18,-30,-17,  6;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Post-processing [info]

COMPETES_HIT_WITH

PS51203

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2023_05 which contains 570'420 sequence entries.

Total number of hits	390 in 387 different sequences
Number of true positive hits	390 in 387 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	7

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Taxonomic range [info]	Archaea, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info]	2
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	sHSP
Version [info]	6

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

387 sequences

18K1_MYCAV  (P46729), 18K1_MYCIT  (P46730), 18K2_MYCAV  (P46731),

18K2_MYCIT  (P46732), 18KD_MYCLE  (P12809), AACUJ_ASPA1 (A0A1L9WLD5), 
ACR_MYCBO   (P0A5B8), ACR_MYCTO   (P9WMK0), ACR_MYCTU   (P9WMK1), 
ARID3_ARATH (Q940Y3), ARID5_ARATH (Q0WNR6), ARID6_ARATH (C0SUW7), 
ASP1_STRTR  (P80485), ASP2_STRTR  (O30851), COTP_BACSU  (P96698), 
CRYAA_ALLMI (P06904), CRYAA_ANAPL (O12984), CRYAA_ARTJA (P02482), 
CRYAA_BALAC (P02474), CRYAA_BOVIN (P02470), CRYAA_BRAVA (P02487), 
CRYAA_CAMDR (P02472), CRYAA_CANLF (P68280), CRYAA_CAVPO (P68281), 
CRYAA_CERSI (P02479), CRYAA_CHICK (P02504), CRYAA_CHOHO (P02486), 
CRYAA_COLLI (O12988), CRYAA_DIDVI (P02503), CRYAA_ELERU (P82530), 
CRYAA_ERIEU (P82533), CRYAA_EUDEL (Q90497), CRYAA_EULFU (P02494), 
CRYAA_FELCA (P68282), CRYAA_GIRCA (P68284), CRYAA_HALGR (P68289), 
CRYAA_HIPAM (P68285), CRYAA_HORSE (P02478), CRYAA_HUMAN (P02489), 
CRYAA_LITCT (Q91311), CRYAA_LOXAF (P02498), CRYAA_MACMU (P02488), 
CRYAA_MANJA (P02484), CRYAA_MELUS (P02480), CRYAA_MERUN (P68405), 
CRYAA_MESAU (P02497), CRYAA_MOUSE (P24622), CRYAA_NEOVI (P02483), 
CRYAA_OCHPR (P02492), CRYAA_ORYAF (P02501), CRYAA_ORYLA (O73919), 
CRYAA_OSPRU (P02502), CRYAA_OTOCR (P68287), CRYAA_PEDCA (P68283), 
CRYAA_PELLE (P02507), CRYAA_PERPO (P68286), CRYAA_PHOPH (P02477), 
CRYAA_PIG   (P02475), CRYAA_PROCA (P02499), CRYAA_PSAFA (O93591), 
CRYAA_PTEPO (P82531), CRYAA_RABIT (P02493), CRYAA_RANTE (P02508), 
CRYAA_RAT   (P24623), CRYAA_RHEAM (P02505), CRYAA_SHEEP (Q5ENZ0), 
CRYAA_SPAEH (P15990), CRYAA_SQUAC (P02509), CRYAA_TAMME (P02485), 
CRYAA_TAPIN (P02476), CRYAA_TRASE (Q91517), CRYAA_TRIIN (P02500), 
CRYAA_TUPGL (P68406), CRYAA_TUPTE (P02506), CRYAA_ZALCA (P68288), 
CRYAB_ANAPL (Q05557), CRYAB_BOVIN (P02510), CRYAB_CHICK (Q05713), 
CRYAB_HUMAN (P02511), CRYAB_LITCT (Q91312), CRYAB_MACFA (Q60HG8), 
CRYAB_MESAU (P05811), CRYAB_MOUSE (P23927), CRYAB_PIG   (Q7M2W6), 
CRYAB_PONAB (Q5R9K0), CRYAB_RABIT (P41316), CRYAB_RAT   (P23928), 
CRYAB_SHEEP (Q5ENY9), CRYAB_SPAJD (Q9EPF3), CRYAB_SQUAC (P02512), 
HR29_HALRO  (Q04757), HS147_ARATH (Q6NLV0), HS154_ARATH (O49710), 
HS157_ARATH (Q9FHQ3), HS166_ORYSJ (Q943Q3), HS16A_ORYSJ (P27777), 
HS16A_WHEAT (P12810), HS16B_ORYSJ (Q943E6), HS16B_WHEAT (Q41560), 
HS16C_ORYSJ (Q943E7), HS174_ARATH (Q9SYG1), HS174_ORYSJ (P31673), 
HS176_ARATH (P29830), HS177_ARATH (O81822), HS177_ORYSJ (Q84J50), 
HS178_ARATH (Q9LNW0), HS178_ORYSJ (Q0DY72), HS17A_ARATH (Q9XIE3), 
HS17A_ORYSJ (Q84Q77), HS17B_ARATH (Q9ZW31), HS17B_ORYSJ (Q943E9), 
HS17C_ARATH (P13853), HS181_ARATH (P19037), HS181_ORYSJ (Q84Q72), 
HS185_ARATH (O64564), HS186_ORYSJ (Q6K7E9), HS188_ORYSJ (Q7EZ57), 
HS189_ORYSJ (Q0E4A8), HS217_ARATH (Q9FIT9), HS219_ORYSJ (Q53M11), 
HS21C_PEA   (P09886), HS21C_SOLLC (Q95661), HS21C_WHEAT (Q00445), 
HS223_ORYSJ (Q6AUW3), HS22C_CHLRE (P12811), HS22C_PETHY (P30222), 
HS22C_SOYBN (P09887), HS22M_PEA   (P46254), HS22M_SOYBN (Q39818), 
HS232_ORYSJ (Q7XUW5), HS235_ARATH (Q9FGM9), HS23C_OXYRB (P11890), 
HS23M_ARATH (Q96331), HS23M_ORYSJ (B7EZJ7), HS24M_ORYSJ (Q6Z7V2), 
HS25P_ARATH (P31170), HS26M_ARATH (Q9SSQ8), HS26M_ORYSJ (Q67X83), 
HS26P_ORYSJ (Q10P60), HS30A_XENLA (P04120), HS30C_XENLA (P30218), 
HS30D_XENLA (P30219), HSP10_CAEEL (P34328), HSP11_CAEEL (P34696), 
HSP11_DAUCA (P27396), HSP11_HELAN (P30693), HSP11_MEDSA (P27879), 
HSP11_OXYRB (Q05832), HSP11_PEA   (P19243), HSP11_SOLLC (P30221), 
HSP11_SOLPE (O82011), HSP11_SOYBN (P02519), HSP12_CAEEL (P06582), 
HSP12_DAUCA (P27397), HSP12_MEDSA (P27880), HSP12_SOLPE (O82012), 
HSP12_SOYBN (P02520), HSP13_SOYBN (P04793), HSP14_SOYBN (P04794), 
HSP15_LEPIC (Q72QA1), HSP15_LEPIN (Q93TV7), HSP15_SCHPO (O74984), 
HSP15_SOYBN (P04795), HSP16_CAEEL (P06581), HSP16_ONYPE (P81958), 
HSP16_ORYSJ (Q652V8), HSP16_SCHPO (O14368), HSP16_SOYBN (P05478), 
HSP17_ARATH (P19036), HSP17_CAEEL (P02513), HSP18_CLOAB (Q03928), 
HSP18_ORYSJ (Q5VRY1), HSP18_STRAL (Q53595), HSP19_ORYSJ (Q6Z6L5), 
HSP20_NIPBR (Q07160), HSP21_CANAL (Q5AHH4), HSP21_HELAN (P46516), 
HSP21_IPONI (Q01544), HSP21_MAIZE (P24631), HSP21_PEA   (P19242), 
HSP21_SOLPE (O82013), HSP21_SOYBN (P05477), HSP22_ARATH (Q38806), 
HSP22_DROME (P02515), HSP22_IPONI (Q01545), HSP22_MAIZE (P24632), 
HSP23_DROME (P02516), HSP23_MAIZE (Q08275), HSP26_DROME (P02517), 
HSP26_YEAST (P15992), HSP27_DROME (P02518), HSP30_EMENI (P40920), 
HSP30_NEUCR (P19752), HSP30_ONCTS (P42931), HSP41_PEA   (P19244), 
HSP41_SOYBN (P30236), HSP42_YEAST (Q12329), HSP57_ARATH (F4JMH9), 
HSP6A_DROME (P05812), HSP6C_DROME (P22979), HSPA_BRADU  (P70917), 
HSPB1_BOVIN (Q3T149), HSPB1_CANLF (P42929), HSPB1_CHICK (Q00649), 
HSPB1_CRILO (P15991), HSPB1_HUMAN (P04792), HSPB1_MOUSE (P14602), 
HSPB1_PIG   (Q5S1U1), HSPB1_POELU (O13224), HSPB1_RAT   (P42930), 
HSPB2_HUMAN (Q16082), HSPB2_MOUSE (Q99PR8), HSPB2_RAT   (O35878), 
HSPB3_BOVIN (Q2KHU9), HSPB3_HUMAN (Q12988), HSPB3_MOUSE (Q9QZ57), 
HSPB3_RAT   (Q9QZ58), HSPB6_BOVIN (Q148F8), HSPB6_HUMAN (O14558), 
HSPB6_MOUSE (Q5EBG6), HSPB6_RAT   (P97541), HSPB7_HUMAN (Q9UBY9), 
HSPB7_MOUSE (P35385), HSPB7_RAT   (Q9QUK5), HSPB8_BOVIN (Q5EAC9), 
HSPB8_CANLF (Q8MJ36), HSPB8_HUMAN (Q9UJY1), HSPB8_MACMU (Q6SJQ8), 
HSPB8_MOUSE (Q9JK92), HSPB8_PONAB (Q5RAB0), HSPB8_RAT   (Q9EPX0), 
HSPB9_BOVIN (Q2TBQ6), HSPB9_HUMAN (Q9BQS6), HSPB9_MOUSE (Q9DAM3), 
HSPBB_DANRE (A5JV83), HSPB_BRADU  (P70918), HSPC1_RICBR (Q1RI96), 
HSPC1_RICCN (Q92IQ7), HSPC1_RICFE (Q4UKR7), HSPC1_RICPR (Q9ZDQ3), 
HSPC1_RICTY (Q68X97), HSPC2_RICFE (Q4UKR8), HSPC3_RICFE (Q4UJB0), 
HSPC4_RICFE (Q4UJB1), HSPD_BRADU  (O69241), HSPE_BRADU  (O69242), 
HSPF_DICDI  (Q1ZXL6), HSPG1_DICDI (Q86I25), HSPG2_DICDI (Q552K9), 
HSPG3_DICDI (Q551F8), HSPG4_DICDI (Q551G1), HSPG5_DICDI (Q8MPA7), 
HSPG6_DICDI (Q8MMN1), HSPG7_DICDI (Q8MPA5), HSPG8_DICDI (Q550E9), 
HSPG9_DICDI (Q86KF5), HSPGA_DICDI (Q550E5), HSPGB_DICDI (Q550E3), 
HSPGC_DICDI (Q76NU5), HSPH_BRADU  (O86110), HSPI_DICDI  (Q54I91), 
HSPJ_DICDI  (Q54WT6), HSPK_DICDI  (Q86H60), HSPL_DICDI  (Q55GH8), 
HSPM_DICDI  (Q54W43), HSPS_METJA  (Q57733), IBPA_CITK8  (A8ACK0), 
IBPA_ECO24  (A7ZTP1), IBPA_ECO27  (B7UMF4), IBPA_ECO45  (B7MGA8), 
IBPA_ECO55  (B7L831), IBPA_ECO57  (P0C055), IBPA_ECO5E  (B5YX93), 
IBPA_ECO7I  (B7NQY7), IBPA_ECO81  (B7N1Z1), IBPA_ECO8A  (B7M4H6), 
IBPA_ECOBW  (C4ZYW4), IBPA_ECODH  (B1X9B7), IBPA_ECOHS  (A8A6E7), 
IBPA_ECOK1  (A1AHM2), IBPA_ECOL5  (Q0TB20), IBPA_ECOL6  (P0C056), 
IBPA_ECOLC  (B1IYQ7), IBPA_ECOLI  (P0C054), IBPA_ECOLU  (B7NF04), 
IBPA_ECOSE  (B6I3S0), IBPA_ECOSM  (B1LL12), IBPA_ESCF3  (B7LK29), 
IBPA_KLEP3  (B5XT60), IBPA_PECAS  (Q6CYV2), IBPA_PECCP  (C6DGL0), 
IBPA_SALCH  (Q57I24), IBPA_SALPA  (Q5PKS5), IBPA_SALPB  (A9MWJ7), 
IBPA_SALPK  (B5BIJ2), IBPA_SALSV  (B4TMX7), IBPA_SALTI  (Q8XGW7), 
IBPA_SALTY  (Q7CPF1), IBPA_SERP5  (A8G7R8), IBPA_SHIB3  (B2TUT5), 
IBPA_SHIBS  (Q31UU6), IBPA_SHIDS  (Q329C6), IBPA_SHIF8  (Q0SYN0), 
IBPA_SHIFL  (P0C057), IBPA_SHISS  (Q3YWC5), IBPA_YERP3  (A7FPA8), 
IBPA_YERPA  (Q1C3L0), IBPA_YERPB  (B2K7E5), IBPA_YERPE  (Q8Z9V5), 
IBPA_YERPG  (A9R4H2), IBPA_YERPN  (Q1CD74), IBPA_YERPP  (A4TGM6), 
IBPA_YERPS  (Q663X0), IBPA_YERPY  (B1JGZ5), IBPB_AZOVI  (P96193), 
IBPB_CITK8  (A8ACJ9), IBPB_ECO24  (A7ZTP0), IBPB_ECO27  (B7UMF3), 
IBPB_ECO45  (B7MGA7), IBPB_ECO55  (B7L830), IBPB_ECO57  (Q8XC04), 
IBPB_ECO5E  (B5YX92), IBPB_ECO7I  (B7NQY6), IBPB_ECO81  (B7N2D2), 
IBPB_ECO8A  (B7M4H5), IBPB_ECOBW  (C4ZYW3), IBPB_ECODH  (B1X9B6), 
IBPB_ECOHS  (A8A6E6), IBPB_ECOL6  (P0C059), IBPB_ECOLC  (B1IYQ8), 
IBPB_ECOLI  (P0C058), IBPB_ECOLU  (B7NF03), IBPB_ECOSE  (B6I3R9), 
IBPB_ECOSM  (B1LL11), IBPB_ENT38  (A4W4S4), IBPB_KLEP3  (B5XT61), 
IBPB_KLEP7  (A6TFY9), IBPB_PECAS  (Q6CYV3), IBPB_PECCP  (C6DGL1), 
IBPB_SALA4  (B5EY83), IBPB_SALCH  (Q57I25), IBPB_SALDC  (B5FMC8), 
IBPB_SALHS  (B4TA60), IBPB_SALNS  (B4SY76), IBPB_SALPA  (Q5PKS6), 
IBPB_SALPB  (A9MWJ6), IBPB_SALPK  (B5BIJ1), IBPB_SALSV  (B4TMX6), 
IBPB_SALTI  (Q8Z2L8), IBPB_SALTY  (Q8ZL03), IBPB_SERP5  (A8G7R9), 
IBPB_SHIB3  (B2TUT6), IBPB_SHIF8  (Q0SYM9), IBPB_SHIFL  (P0C060), 
IBPB_YERP3  (A7FPA7), IBPB_YERPA  (Q1C3K9), IBPB_YERPB  (B2K7E6), 
IBPB_YERPE  (Q8Z9V6), IBPB_YERPG  (A9R4H1), IBPB_YERPN  (Q1CD75), 
IBPB_YERPP  (A4TGM7), IBPB_YERPS  (Q663W9), IBPB_YERPY  (B1JGZ6), 
IBP_BUCAI   (P57640), IBP_BUCAP   (Q9Z616), IBP_BUCTS   (O31288), 
IBP_WIGBR   (P0DKS2), IDM2L_ARATH (Q84K79), IDM2_ARATH  (Q8RWL4), 
L2EFL_DROME (P82147), OV251_ONCVO (P29778), OV252_ONCVO (P29779), 
P40_SCHMA   (P12812), PIG19_CLAP2 (M1VWN2), RTM2A_ARATH (D5K211), 
RTM2B_ARATH (D9UBX6), RTM2C_ARATH (D9UBX4), RTM2D_ARATH (D9UC01), 
RTM2_ARATH  (Q9M670), SIP1_CAEEL  (Q20363), SLTSR_BACSU (O34321), 
SP21_STIAD  (Q06823), TSP36_TAESA (Q7YZT0), Y0215_DICDI (Q54VP4), 
Y3913_DICDI (Q54QE8), Y8886_DICDI (Q54IG2), YPQA_BACSU  (P50836)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

UniProtKB/Swiss-Prot
'Partial' sequences

7 sequences

CRYAB_COLLI (O12987), CRYAB_EUDEL (O12991), CRYAB_TRASE (Q91518),

CRYAB_TURME (O12995), HS22M_SOLLC (P81161), HS30E_XENLA (P30220), 
HSP11_PINPS (P81083)

» more

PDB
[Detailed view]

44 PDB

1GME; 1SHS; 2BOL; 2BYU; 2H50; 2H53; 2KLR; 2N0K; 2N3J; 2WJ5; 2WJ7; 2Y1Y; 2Y1Z; 2Y22; 2YGD; 3J07; 3L1E; 3L1F; 3L1G; 3Q9P; 3Q9Q; 3W1Z; 4ELD; 4I88; 4JUS; 4JUT; 4M5S; 4M5T; 4MJH; 4YDZ; 4YE0; 5DS1; 5DS2; 5LTW; 5LUM; 5NMS; 6BP9; 6DV5; 6F2R; 6GJH; 6T1R; 7BZW; 7BZY; 7OA6
» more