PROSITE entry PS50020
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50020
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | WW_DOMAIN_2 |
Accession [info] | PS50020 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-NOV-1995 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC50020 |
Associated ProRule [info] | PRU00224 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | WW/rsp5/WWP domain profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=34; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=31; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.2776000; R2=0.0197000; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=1518.2681885; R2=1.0788643; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=418; H_SCORE=1969; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=316; H_SCORE=1859; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='S'; M= -5, -9,-25,-10, -3,-21, -5,-13,-15, -7,-16, -9, -6, -1, 0, -5, 2, 1,-13,-26,-17, -3; /M: SY='P'; M= -7, -5,-30, -1, -1,-24, -5,-13,-22, -9,-24,-17, -4, 27, -6,-13, 0, -5,-24,-29,-22, -5; /M: SY='L'; M= -8,-23,-19,-24,-18, 2,-27,-18, 15,-22, 29, 12,-22,-24,-16,-14,-21, -7, 12,-24, -5,-18; /M: SY='P'; M= -9,-10,-34, -5, 7,-27,-18,-12,-18, -6,-23,-13,-10, 49, 1,-13, -5, -8,-26,-29,-23, 1; /M: SY='P'; M= -1, -1,-24, 1, -2,-22, -6,-11,-21, -5,-24,-17, 2, 12, -5,-10, 8, 1,-19,-29,-17, -5; /M: SY='G'; M= -4, -9,-31, -7,-11,-29, 34,-14,-30,-16,-27,-18, -3, 4,-12,-18, -1,-14,-27,-24,-25,-13; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='E'; M= -8, 0,-25, 3, 24,-20,-20, -7,-21, 15,-18,-10, -3, -8, 9, 5, -2, -3,-16,-25,-12, 16; /M: SY='E'; M= -1, -8,-15, -8, 7,-19,-15,-11,-13, 1,-11, -5, -9,-15, 1, 1, -3, -5, -6,-26,-15, 3; /M: SY='R'; M= -2,-16,-23,-18,-12, -7,-20, -4, -7, -1, -7, -3,-12,-21, -7, 6, -9, -8, -2,-10, 2,-11; /M: SY='Y'; M=-11,-14,-24,-18, -8, 4,-25,-10, -5, -4, -4, 1,-12,-19, -4, -5,-10, -2, -5, -7, 5, -6; /M: SY='D'; M= -5, 17,-20, 19, 3,-23,-11, 1,-22, -6,-20,-14, 10,-12, -2, -9, 10, 10,-15,-34,-13, 0; /M: SY='B'; M= -2, 6,-25, 6, 3,-26, -6, -8,-23, -1,-23,-16, 4, 3, -3, -8, 3, 0,-19,-29,-18, -1; /M: SY='N'; M= -7, 10,-22, 10, 8,-21,-13, -6,-22, 6,-22,-15, 11,-13, 1, 2, 7, 2,-16,-31,-15, 5; /I: MD=-27; /M: SY='G'; M= -3, -5,-26, -7,-11,-23, 30,-13,-28, -3,-23,-12, 2,-17,-10, -7, -2,-11,-22,-18,-17,-11; D=-5; /I: I=-10; MI=-5; MD=-27; IM=-5; DM=-27; /M: SY='R'; M=-13,-10,-25,-12, -3,-14,-17, -7,-18, 14,-14, -7, -4,-18, 3, 34, -7, -4,-11,-20, -8, -3; D=-5; /I: DM=-27; /M: SY='P'; M= -7,-15,-25,-16, -9, -8,-23,-17, -5, -7,-11, -7,-13, 5,-11, -9, -5, 3, -4,-14, -5,-12; /M: SY='Y'; M=-19,-24,-26,-27,-24, 40,-30, 5, 4,-17, 4, 1,-20,-30,-19,-14,-20,-10, -3, 20, 59,-24; /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-24, 50,-30, 4, 0,-18, 4, 0,-20,-30,-22,-14,-20,-10, -6, 22, 60,-24; /M: SY='Y'; M=-12,-26,-25,-29,-24, 10,-29, -9, 13,-21, 7, 5,-22,-26,-19,-18,-18, -8, 10, 6, 14,-23; /M: SY='N'; M=-12, 40,-22, 29, 4,-24, -3, 12,-24, 0,-30,-21, 51,-18, 0, -2, 7, -3,-30,-40,-18, 2; /M: SY='H'; M=-12, -5,-28, -5, -3,-18,-20, 39,-19, -8,-12, -3, -1, -5, 0, -4, -9,-10,-19,-28, 2, -5; /M: SY='E'; M= -5, 2,-23, 0, 9,-19,-17, -8,-12, 2,-13, -9, 5,-10, 2, -3, -1, -3,-11,-29,-15, 5; /M: SY='T'; M= -1, 3,-13, -5, -8,-12,-17,-16,-10,-10,-11,-11, 5,-12, -8,-11, 17, 34, -3,-32,-12, -8; /M: SY='K'; M=-11, 1,-29, -1, 4,-28, -7, 1,-29, 25,-27,-10, 6,-14, 11, 22, -6,-11,-24,-22,-12, 7; /M: SY='E'; M= -7, 5,-23, 5, 17,-23,-19, -4,-23, 10,-20,-13, 2, -8, 7, 5, 5, 10,-17,-28,-12, 12; /M: SY='T'; M= 3, 0,-10, -7, -7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13, 3,-10, -7,-10, 26, 40, -3,-33,-13, -7; /M: SY='Q'; M= -6, -5,-11, -8, 0,-19,-19, -5,-16, -3,-14, -7, -3,-15, 14, 1, 7, 11,-14,-25, -7, 6; /M: SY='W'; M=-19,-36,-45,-37,-28, 14,-21,-24,-17,-19,-16,-17,-35,-29,-20,-19,-34,-24,-25,124, 33,-20; /M: SY='E'; M= -9, 4,-25, 9, 19,-22,-20, -6,-15, 0,-14,-11, -2,-10, 8, -5, 0, -2,-14,-27,-10, 13; /M: SY='D'; M=-15, 5,-32, 12, 8,-29,-18, 4,-27, 10,-25,-15, 1, 11, 2, 8, -8,-11,-24,-29,-14, 2; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='R'; M= -9, 1,-23, 0, 1,-20,-14, -8,-21, 10,-16,-11, 2,-16, 0, 19, -1, 0,-13,-27,-13, -1; /M: SY='M'; M=-10,-15,-24,-17, -8, -2,-13,-10, -6,-11, -1, 2,-12,-11,-11, -8,-11, -6, -6,-20, -6,-10; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 392 in 227 different sequences |
Number of true positive hits | 392 in 227 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 0 |
Number of false negative sequences | 17 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 95.84 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
Maximum number of repetitions [info] | 4 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | K_Hofmann |
Feature key [info] | DOMAIN |
Feature description [info] | WW |
Version [info] | 5 |
Cross-references [info]