PROSITE entry PS50056
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50056
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | TYR_PHOSPHATASE_2 |
Accession [info] | PS50056 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-NOV-1997 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC00323 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | Tyrosine specific protein phosphatases domain profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=68; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=63; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.7969000; R2=0.0165700; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2939.9223633; R2=3.8252428; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=465; H_SCORE=4719; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=345; H_SCORE=4260; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MM=1; M0=-1; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='E'; M= -9, -3,-21, 0, 5,-18,-20, -6,-15, 1, -6, -7, -6,-13, 1, 2, -8, -7,-13,-25,-10, 2; /M: SY='D'; M= -9, 10,-25, 13, 10,-22,-12, 0,-24, 5,-20,-15, 8,-12, 3, 2, 2, -4,-20,-28,-11, 6; /M: SY='F'; M=-14,-27,-24,-34,-26, 39,-27,-18, 6,-25, 9, 2,-21,-25,-28,-20,-19,-10, 2, 10, 19,-25; /M: SY='L'; M= -6,-22,-21,-24,-16, 2,-26,-18, 13,-19, 14, 8,-19,-20,-15,-16,-14, -6, 11,-20, -3,-16; /M: SY='E'; M= -7, 5,-26, 7, 10,-24,-10, -2,-24, 7,-22,-13, 5, -8, 8, 6, 1, -5,-21,-27,-14, 8; /M: SY='M'; M= -4,-13,-21,-15, -5, -2,-19,-12, -4, -7, 1, 3,-12,-17, -6, -6, -9, -6, -3,-19, -4, -5; /M: SY='V'; M= 1,-24,-12,-27,-23, -2,-27,-24, 19,-19, 11, 8,-22,-24,-21,-19,-10, -1, 24,-25, -7,-22; /M: SY='R'; M=-10, 5,-25, 4, 7,-23,-17, 2,-22, 13,-20, -9, 6,-14, 9, 14, -2, -6,-19,-26,-10, 7; /M: SY='E'; M= -4, 1,-22, -2, 3,-12,-17, -3,-14, -2,-13, -7, 2,-13, 2, -4, 2, 3,-12,-23, -6, 2; /I: MD=-15; /M: SY='I'; M= -6,-19,-13,-23,-17, 4,-24,-14, 7,-15, 5, 4,-16,-21,-15,-13,-10, -4, 7,-16, 1,-16; D=-2; /I: MD=-15; /M: SY='Y'; M=-10, -7,-22, -9, -6, -4,-19, -5, -5, -5, -3, -2, -5,-17, -5, -2, -8, -4, -5,-18, 1, -7; D=-2; /I: MD=-15; /M: SY='E'; M= -6, 3,-19, 4, 9,-22,-12, -5,-20, 6,-19,-12, 2, -1, 5, 4, 0, -4,-18,-24,-15, 6; D=-2; /I: MD=-15; /M: SY='E'; M= -3, -3,-19, -3, 5,-16,-14, -3,-13, 4,-12, -6, -4, -7, 4, 0, -2, -5,-10,-19, -9, 4; D=-2; /I: I=-4; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11; /M: SY='K'; M= -3, -2,-14, -2, 2,-11, -6, -4,-12, 3, -9, -5, -2, -5, 1, 2, -1, -2, -9,-13, -7, 1; D=-2; /I: DM=-15; /M: SY='S'; M= -4, 2,-19, 1, 3,-21, -9, -1,-21, -1,-19,-11, 3,-12, 4, -2, 5, -1,-17,-28,-11, 3; /M: SY='E'; M= -4, -1,-25, 0, 5,-24,-14, -3,-20, 5,-21,-12, 1, 4, 4, 2, 0, -4,-19,-27,-15, 3; /M: SY='G'; M= -3, 0,-27, 0,-10,-27, 40,-11,-34,-13,-28,-19, 7,-18,-11,-13, 4,-12,-27,-24,-23,-11; /M: SY='P'; M= -5,-10,-14,-10, -5,-24, 0,-13,-24, -4,-22,-14, -6, 4, -7, -5, -3, -8,-19,-28,-21, -8; /I: MD=-21; /M: SY='P'; M= -6, -7,-17, -6, 0,-17,-10, -9,-14, 2,-14, -8, -6, 8, -2, 1, -5, -6,-13,-20,-13, -3; D=-4; /I: I=-5; MI=0; IM=0; DM=-21; /M: SY='I'; M= -4,-27,-18,-32,-26, -1,-32,-27, 30,-24, 15, 13,-22,-21,-22,-23,-14, -3, 28,-24, -5,-26; /M: SY='V'; M= -2,-25,-13,-28,-23, 0,-24,-22, 18,-23, 17, 9,-23,-26,-22,-21,-14, -3, 21,-24, -6,-23; /M: SY='V'; M= -1,-29,-14,-31,-29, 1,-31,-29, 32,-22, 12, 11,-28,-28,-28,-22,-11, -1, 44,-28, -8,-29; /M: SY='H'; M=-19, -1,-29, -1, -1,-19,-20, 94,-28,-10,-20, 0, 9,-20, 9, -1, -9,-18,-28,-29, 19, -1; /M: SY='C'; M=-10,-20,117,-30,-30,-20,-28,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-49,-30,-30; /M: SY='S'; M= 3, -6,-15, -8, -4,-15, -9,-11,-12, -7,-15, -9, 0,-15, -1, -4, 16, 8, -6,-31,-13, -3; /M: SY='A'; M= 30, -4,-11,-11, -8,-20, -1,-13,-13,-10,-12, -9, -4,-13, -9,-17, 6, -2, -5,-24,-18, -9; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='V'; M= -3,-24,-14,-28,-22, -4,-27,-21, 19,-20, 10, 8,-20,-24,-18,-18,-12, -4, 21,-25, -6,-22; /M: SY='G'; M= 1, -4,-25, -5,-13,-27, 46,-15,-34,-15,-29,-19, 6,-17,-12,-15, 9,-10,-25,-25,-26,-13; /M: SY='R'; M=-18,-10,-29,-10, 1,-20,-20, -1,-28, 28,-19,-10, 0,-19, 10, 64, -9, -9,-19,-20,-10, 1; /M: SY='T'; M= 6, -1, -8, -7, -6,-15,-11,-16,-14,-10,-18,-14, 3,-10, -6,-11, 27, 35, -4,-34,-15, -6; /M: SY='G'; M= 8,-11,-23,-12,-16,-26, 42,-20,-30,-16,-25,-17, -4,-12,-17,-19, 3,-12,-20,-22,-26,-17; /M: SY='T'; M= 0,-11, -3,-18,-16, -7,-22,-20, 0,-15, -3, -3,-10,-18,-14,-15, 6, 22, 8,-28, -8,-16; /M: SY='F'; M=-12,-29,-20,-34,-26, 35,-30,-19, 15,-26, 20, 11,-24,-28,-28,-20,-20, -8, 13, -7, 15,-26; /M: SY='I'; M= -2,-24, 0,-31,-26, -5,-30,-27, 22,-24, 8, 7,-20,-24,-21,-24,-11, -3, 22,-27, -9,-26; /M: SY='A'; M= 16,-18, -8,-24,-19,-10,-12,-22, 4,-18, 3, 1,-16,-20,-17,-20, -3, -1, 11,-24,-14,-18; /M: SY='I'; M= 8,-21,-12,-27,-19, -5,-22,-21, 13,-19, 11, 8,-18,-21,-16,-19, -9, -4, 12,-23, -9,-19; /M: SY='Y'; M=-12, 1,-25, 5, 0, -4,-18, 3,-17, -8,-11,-10, -5,-19, -6,-10, -8, -9,-16, -4, 14, -4; /M: SY='L'; M= -6,-20,-17,-25,-19, 1,-27,-17, 15,-21, 17, 11,-17,-23,-16,-17,-14, -4, 10,-20, 0,-19; /M: SY='M'; M= -6,-23,-15,-29,-22, -1,-22,-16, 19,-20, 18, 27,-20,-23,-14,-18,-17, -7, 14,-23, -5,-19; /I: I=-5; MI=0; IM=0; DM=-15; MD=-15; /M: SY='E'; M= -6, 4,-25, 4, 14,-21,-12, -4,-20, 2,-18,-13, 3, -8, 4, -2, 1, -2,-19,-25,-11, 8; /M: SY='E'; M= -8, -3,-20, -3, 1,-15,-10, -4,-18, -2,-11, -7, -3,-15, -1, -2, -6, -8,-16,-23, -8, -1; /M: M= -6, -3,-18, -5, -5,-19, -3,-10,-15, -6,-16, -9, 0,-14, -5, -6, -1, -4,-10,-27,-15, -6; /M: SY='I'; M= -8,-26,-16,-29,-22, 6,-29,-21, 19,-20, 16, 14,-23,-25,-20,-17,-17, -7, 19,-17, -1,-21; /M: SY='D'; M= -9, 20,-24, 25, 8,-27, -8, -4,-27, 2,-26,-20, 13,-10, 1, -2, 8, 1,-21,-33,-15, 4; /M: SY='I'; M= -3,-24,-22,-26,-19, -1,-27,-21, 16,-20, 9, 6,-21,-11,-18,-20,-12, -5, 15,-19, -2,-20; /M: M= -9, -4,-23, -6, -1, 0,-16, -6,-15, -5,-10, -9, -3,-13, -7, -4, -7, -8,-15,-17, -1, -4; /M: SY='D'; M= -9, 14,-27, 20, 16,-29, -8, 1,-28, 3,-23,-16, 8, -9, 10, -1, 1, -8,-25,-29,-16, 13; /M: SY='A'; M= 17,-16, -9,-23,-17, -7,-16,-20, 3,-16, 1, 0,-14,-17,-15,-19, 0, 4, 9,-23,-11,-16; /M: SY='V'; M= -7,-27,-19,-31,-26, 8,-31,-21, 24,-21, 15, 12,-24,-27,-22,-18,-16, -5, 26,-15, 6,-26; /M: SY='K'; M= -9, 2,-21, 5, 8,-23,-16, -3,-22, 9,-16,-11, -1,-14, 6, 8, -3, -7,-18,-26,-11, 6; /M: SY='Y'; M= -7,-11,-22,-14, -5, -1,-20, -6, -7, -6, -3, 0, -8,-18, -4, -4, -7, -4, -7,-15, 3, -5; /M: SY='L'; M= -8,-28,-19,-31,-23, 7,-29,-20, 24,-24, 29, 23,-26,-27,-18,-19,-21, -8, 20,-21, -1,-21; /M: SY='R'; M=-17, -7,-29, -7, 4,-22,-20, 0,-28, 29,-21, -9, 0,-17, 12, 53, -9,-10,-20,-20, -9, 4; /M: SY='Q'; M= -5, 1,-23, 1, 5,-21,-16, -1,-17, 4,-15, -7, 1,-14, 8, 3, 1, -1,-14,-26,-10, 6; /M: SY='Q'; M= -7, -5,-22, -6, 3,-21,-19, 2,-18, 8,-15, -4, -3,-16, 17, 11, -4, -8,-17,-20, -5, 9; /M: SY='R'; M=-19, -8,-30, -8, 1,-21,-20, -1,-30, 31,-21,-10, 1,-19, 10, 65,-10,-10,-20,-20,-10, 1; /M: SY='P'; M= -7,-12,-27,-11, -6,-20,-12, -9,-15, -8,-17, -8, -7, 26, -7, -8, -6, -7,-18,-28,-19, -9; /M: SY='G'; M= -3, -4,-25, -8,-13,-18, 27, -6,-23,-14,-19, -9, 5,-20,-10,-13, 0,-11,-21,-22,-15,-12; /M: SY='M'; M= 0,-19,-19,-25,-17, -4,-16,-11, 11,-14, 14, 27,-17,-20, -8,-13,-11, -6, 7,-22, -6,-13; /M: SY='V'; M= -2,-28,-16,-31,-28, 2,-28,-28, 28,-22, 10, 11,-24,-26,-26,-22,-11, -3, 36,-25, -7,-28; /M: SY='Q'; M= -9, -2,-25, -5, 9,-28,-19, 1,-11, 1,-12, -1, 0,-14, 32, 2, -2, -7,-18,-24,-11, 20; /M: SY='T'; M= 0, 0,-14, -5, -4,-17,-13,-12,-14, -7,-15, -9, 1,-11, 0, -7, 17, 29, -7,-30,-12, -2; /M: SY='E'; M=-10, 0,-26, 4, 11,-16,-19, -9,-20, 1,-16,-13, -4, 6, 0, -5, -5, -6,-20,-24,-11, 5; /M: SY='E'; M= -3, 10,-23, 13, 23,-27,-13, -1,-23, 1,-19,-14, 4, -9, 11, -5, 3, -5,-21,-30,-16, 17; /M: SY='Q'; M=-11, -2,-29, -2, 16,-34,-21, 11,-18, 8,-15, 1, -2,-12, 47, 8, -4,-11,-26,-21, -8, 31; /M: SY='Y'; M=-17,-14,-29,-13,-12, 14,-27, 11, -6, -5, -2, -2,-15,-23, -5, -5,-16, -9,-12, 11, 48,-12; /M: SY='Y'; M= -9,-15,-25,-17, -6, -2,-25, -7, 0, -6, -1, 0,-13,-20, -4, -3,-11, -6, -1,-12, 6, -7; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 443 in 402 different sequences |
Number of true positive hits | 442 in 401 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 1 |
Number of false negative sequences | 46 |
Number of 'partial' sequences | 27 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 99.77 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 90.57 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria), Eukaryotic viruses |
Maximum number of repetitions [info] | 2 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | K_Hofmann |
Version [info] | 5 |
Cross-references [info]