PROSITE entry PS50072
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50072
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | CSA_PPIASE_2 |
Accession [info] | PS50072 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-NOV-1997 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC00154 |
Associated ProRule [info] | PRU00156 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | Cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=158; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=153; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.3487000; R2=0.0100965; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=-1814.7358398; R2=23.3429527; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=877; H_SCORE=18657; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=679; H_SCORE=14035; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MM=1; M0=-1; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='F'; M=-20,-25,-26,-30,-24, 51,-29, 1, -3,-21, 3, -1,-19,-29,-25,-15,-21,-12, -7, 23, 48,-24; /M: SY='F'; M=-15,-25,-19,-34,-25, 47,-27,-17, 6,-25, 15, 13,-19,-26,-27,-17,-17, -4, 3, -3, 17,-23; /M: SY='D'; M=-18, 45,-29, 63, 21,-38,-11, -1,-38, 0,-28,-28, 18, -9, 1, -9, 1, -7,-29,-39,-20, 11; /M: SY='I'; M= -8,-25,-23,-29,-21, -4,-28,-19, 23,-18, 9, 20,-22, -7,-14,-19,-15, -7, 18,-24, -7,-19; /M: SY='S'; M= 0, -5,-14, -6, 2,-18,-16,-14,-10, -3,-14, -9, -4,-14, -2, -5, 8, 7, -1,-31,-15, 0; /M: SY='I'; M= 1,-15,-19,-22,-17, -9,-23,-12, 12,-18, -1, 2, -9,-17,-12,-18, 1, 7, 12,-27, -6,-17; /M: SY='G'; M= -8, 5,-25, 5, -7,-13, 13,-11,-25,-11,-18,-15, 6,-18,-12,-12, -1,-10,-21,-24,-15, -9; /M: SY='G'; M= -7, 3,-28, 6, 7,-28, 14, 8,-33, -2,-26,-16, 5,-13, 0, -5, 1,-12,-27,-27,-16, 3; /M: SY='E'; M= -5, 1,-23, 0, 15,-23,-19, -8,-19, 12,-17, -8, -2, -9, 8, 5, 1, 4,-14,-26,-13, 11; /M: SY='P'; M= 0, 1,-27, 0, 2,-26,-12,-11,-20, -1,-24,-16, 2, 24, -3, -9, -1, -5,-21,-29,-22, -2; /M: SY='V'; M= 1,-16,-18,-20,-14, -9,-13, -8, 1,-16, 0, 1,-13,-20,-13,-16, -8, -7, 4,-24, -8,-14; /M: SY='G'; M= 0, -8,-29, -9,-16,-29, 58,-18,-38,-15,-28,-19, 1,-19,-16,-13, 0,-18,-28,-21,-28,-17; /M: SY='R'; M=-16, 10,-27, 13, 4,-23,-16, -3,-27, 11,-20,-15, 9,-12, 2, 24, -4, -4,-21,-29,-14, 1; /M: SY='I'; M= -9,-30,-27,-37,-28, 1,-37,-28, 43,-29, 23, 19,-22,-22,-21,-28,-20, -9, 28,-21, -1,-28; /M: SY='V'; M= -4,-10,-18,-12, -9,-11,-17,-18, -1, -7, -7, -4, -8,-19,-12, -9, -2, 6, 8,-23,-12,-11; /M: SY='I'; M=-12,-29,-21,-36,-27, 22,-32,-22, 25,-27, 23, 19,-22,-25,-23,-23,-22,-10, 15,-13, 7,-25; /M: SY='E'; M= -7, 2,-28, 7, 23,-26, -6, -7,-26, 7,-19,-13, -2, -9, 7, 1, -3,-10,-22,-24,-17, 15; /M: SY='L'; M= -9,-27,-18,-28,-20, 9,-29,-21, 17,-27, 40, 16,-27,-28,-20,-19,-24, -3, 11,-21, -1,-20; /M: SY='F'; M=-17,-14,-25,-17,-18, 39,-25, -3, -6,-17, 0, -4,-12,-26,-22,-14,-16,-10, -8, 7, 34,-19; /M: SY='G'; M= 3, 5,-24, 4, -7,-23, 15,-12,-26, -8,-23,-18, 7,-11,-10,-12, 3, -7,-19,-25,-21, -8; /M: SY='D'; M=-11, 23,-26, 28, 13,-27,-13, -1,-27, 3,-24,-20, 15, -7, 3, -4, 2, -2,-24,-32,-14, 7; /I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32; /M: SY='K'; M= -6, -7,-21, -8, -5,-14,-22,-10, -3, 2, -7, 0, -8,-17, -6, -3, -7, -4, 2,-25, -8, -6; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='A'; M= 23,-17, -2,-23,-18,-12,-14,-24, 4,-15, -4, -4,-17,-20,-18,-20, 3, 3, 18,-27,-16,-18; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 89,-10,-20, -9,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='K'; M=-10, -5,-19, -6, 4,-22,-21,-10,-17, 22,-18, -7, -4,-15, 2, 12,-10,-10,-12,-23,-10, 2; /M: SY='T'; M= 5, -1,-10,-10, -9,-11,-17,-19,-11,-10,-11,-11, 0,-10, -9,-11, 20, 44, -1,-30,-11, -9; /M: SY='V'; M= 16,-21, 6,-26,-23, -9,-19,-26, 8,-18, -1, -1,-21,-24,-23,-21, -3, 0, 25,-29,-16,-23; /M: SY='E'; M= -4, 6,-26, 6, 21,-25,-10, -4,-24, 11,-20,-12, 5, -9, 8, 4, -1, -7,-22,-26,-15, 14; /M: SY='N'; M= -8, 35,-19, 17, -1,-19, -1, 7,-19, -1,-29,-19, 54,-19, -1, -1, 12, 4,-27,-39,-19, -1; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='V'; M= -6,-20, -9,-21,-14, -8,-25,-16, 0, -6, 2, 0,-17,-24,-12, 5,-12, -7, 8,-24, -7,-15; /M: SY='A'; M= 8, 6,-18, 6, 6,-26, -9, -4,-21, 0,-19,-12, 3,-11, 4, -7, 6, -1,-15,-28,-16, 5; /M: SY='L'; M=-13,-27,-23,-27,-20, 14,-30, -7, 14,-25, 34, 14,-26,-29,-17,-17,-26,-10, 5, -9, 18,-20; /M: SY='C'; M= 5,-18, 60,-26,-24,-16,-22,-27,-14,-23,-13,-12,-18,-30,-24,-24, -3, -2, 3,-39,-23,-24; /M: SY='T'; M= -5, 1,-21, -2, 2,-20,-15, -5,-18, 2,-15, -9, 3,-13, 5, 4, 5, 11,-13,-27,-11, 2; /I: MD=-15; /M: SY='G'; M= 0, -5,-16, -5, -9,-16, 32,-10,-21, -9,-17,-11, 1,-11, -9, -7, 2, -8,-15,-13,-16, -9; D=-2; /I: I=-4; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-15; /M: SY='E'; M= -4, 4,-16, 6, 18,-16,-11, -3,-12, 4,-10, -8, 1, -3, 6, -1, -1, -5,-12,-16,-10, 12; D=-2; /I: DM=-15; /M: SY='E'; M=-10, 11,-27, 12, 16,-29,-15, -2,-25, 16,-24,-13, 9,-10, 14, 11, 0, -7,-22,-28,-15, 15; /M: SY='G'; M= -2, -7,-29, -7,-15,-29, 51,-11,-37,-13,-28,-18, 2,-19,-13,-12, 0,-17,-28,-22,-25,-14; /M: SY='F'; M=-15,-24,-22,-30,-22, 37,-29,-14, 6,-19, 8, 6,-18,-26,-23,-15,-17, -7, 3, 0, 22,-22; /I: MD=-17; /M: SY='G'; M= 2, -2,-15, -2, -7,-15, 21,-10,-17, -9,-13, -9, 0, -9, -8,-10, 2, -5,-12,-15,-14, -8; D=-3; /I: I=-6; MI=0; IM=0; DM=-17; /M: SY='Y'; M=-18,-20,-28,-22,-20, 35,-28, 13, -1,-13, 0, -1,-18,-29,-14,-11,-17, -8, -9, 23, 68,-20; /M: SY='K'; M= -9, 12,-25, 7, 3,-24,-13, -5,-21, 17,-25,-13, 16, -9, 2, 10, -2, -6,-19,-29,-15, 2; /M: SY='G'; M= -4, 7,-27, 3, -6,-28, 36, -8,-32, -9,-29,-19, 17,-18, -8,-10, 3,-12,-29,-27,-25, -7; /M: SY='T'; M= 1, -3, -6, -8, -8,-13,-13,-14,-13,-11,-12,-11, 2,-15, -7, -8, 18, 23, -5,-33,-14, -8; /M: SY='T'; M= -7, -8,-24,-11, -6,-15,-21,-17, -3, -1,-10, -5, -7, -7, -7, -6, -3, 4, -2,-25,-10, -8; /M: SY='F'; M=-19,-29,-12,-39,-30, 71,-30,-21, 0,-30, 9, 0,-20,-30,-39,-21,-19,-10, 0, 5, 25,-30; /M: SY='H'; M=-19, 3,-29, 3, 0,-18,-19, 84,-29,-10,-20, -3, 11,-19, 7, -1, -8,-16,-28,-30, 16, -1; /M: SY='R'; M=-19, -9,-30, -9, 1,-21,-20, 0,-30, 31,-21,-10, 0,-19, 10, 66,-10,-10,-20,-20,-10, 1; /M: SY='V'; M= -2,-25,-15,-29,-26, -1,-29,-26, 27,-21, 13, 11,-23,-26,-24,-20,-11, -1, 35,-27, -8,-26; /M: SY='I'; M= -9,-26,-26,-33,-25, 0,-36,-26, 37,-26, 17, 15,-20,-21,-19,-25,-17, -5, 25,-20, 0,-25; /M: SY='P'; M= -8, 2,-30, 5, 5,-28,-16,-11,-24, 8,-28,-17, 0, 28, -1, -3, -3, -4,-24,-29,-20, 0; /M: SY='N'; M= -8, 16,-25, 13, -1,-24, 14, -5,-30, -2,-28,-19, 20,-17, -4, -3, 3, -8,-26,-30,-20, -3; /M: SY='F'; M=-16,-27,-21,-35,-26, 60,-23,-18, -3,-25, 6, -2,-18,-25,-34,-18,-18,-10, -3, 5, 23,-26; /M: SY='M'; M= -7,-22,-20,-29,-21, 1,-21, -5, 17,-12, 17, 45,-22,-22, -5,-12,-18, -9, 12,-14, 2,-13; /M: SY='I'; M= -6,-27, -8,-34,-26, -2,-33,-27, 29,-27, 17, 12,-21,-24,-21,-26,-16, -7, 21,-25, -6,-26; /M: SY='Q'; M= -8, -1,-29, -1, 19,-37,-17, 7,-20, 8,-19, 0, -1,-10, 52, 7, 0,-10,-28,-21,-11, 35; /M: SY='G'; M= 2,-12,-27,-13,-20,-25, 54,-21,-30,-20,-24,-16, -3,-20,-20,-20, -1,-16,-21,-20,-26,-20; /M: SY='G'; M= 0,-11,-28,-11,-19,-27, 61,-19,-35,-20,-25,-18, -1,-20,-19,-19, 0,-17,-27,-21,-28,-19; /I: MD=-27; /M: SY='D'; M=-11, 23,-22, 33, 7,-28, 4, -4,-27, -3,-21,-18, 9,-10, -1, -8, 0, -9,-20,-26,-16, 3; D=-5; /I: I=-7; MI=0; IM=0; DM=-27; /M: SY='F'; M=-14,-12,-15,-14,-18, 24,-26,-18, 0,-21, 0, -3,-11,-24,-24,-19,-11, -7, 3,-15, 5,-20; /M: SY='T'; M= -2, -8,-19, -8, -1,-18,-17,-18,-12, -9,-15,-12, -9, 12, -9,-13, 5, 15, -6,-30,-18, -6; /M: SY='N'; M= -6, 0,-25, -1, 3,-20,-12, -2,-22, 3,-21,-14, 5, 2, 0, 4, 3, 0,-20,-29,-14, 0; /M: SY='G'; M= -2, -4,-27, -4,-10,-26, 36, -5,-32,-13,-26,-16, 3,-18, -8,-13, 1,-14,-25,-24,-21, -9; /M: SY='B'; M= -9, 19,-20, 15, -1,-19,-11, 0,-15, -5,-17, -6, 17,-15, -3, -7, 6, 6,-14,-34,-13, -2; /M: SY='G'; M= -1, -8,-28, -8,-13,-29, 48,-16,-36, -9,-29,-18, 1,-18,-11,-10, 2,-15,-27,-22,-26,-12; /M: SY='T'; M= -6, -5,-20,-10, -4,-13,-19, -9,-12, -4,-12, -7, -3, -9, 0, -2, 5, 18, -8,-24, -7, -3; /I: I=-4; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='G'; M= -1, -7,-25, -7,-11,-26, 50,-16,-33,-12,-25,-17, 0,-16,-14,-13, -1,-16,-25,-18,-24,-13; D=-1; /M: SY='G'; M= 2, -5,-23, -4,-10,-24, 43,-15,-30,-14,-23,-16, 0,-15,-13,-15, 3,-13,-22,-20,-23,-11; D=-1; /I: I=-4; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='E'; M=-10, -3,-26, -3, 12,-12,-19, -7,-16, 8,-14, -8, -4,-10, 3, 3, -6, -4,-15,-18, -3, 7; D=-1; /I: DM=-15; /M: SY='S'; M= 6, -3,-17, -2, 3,-20, -5,-11,-20, -6,-25,-17, 2, 2, -1, -9, 22, 11,-13,-32,-17, 0; D=-1; /I: DM=-15; /M: SY='I'; M= -9,-25,-21,-33,-25, 1,-34,-23, 31,-24, 12, 14,-19,-18,-17,-23,-15, -5, 21,-19, 2,-24; D=-1; /I: DM=-15; /M: SY='Y'; M=-15,-19,-28,-20,-17, 15,-25, 3, -7, -7, -6, -5,-18,-22,-11, -9,-19,-12,-13, 29, 44,-16; /M: SY='G'; M= 3, -3,-23, -2,-11,-27, 35,-16,-31,-15,-25,-18, 0,-14,-14,-18, 2,-12,-22,-24,-24,-13; /M: SY='E'; M= -9, 3,-29, 8, 13,-27,-11, -7,-27, 7,-25,-18, 1, 11, 2, 3, -1, -7,-25,-28,-19, 6; /M: SY='K'; M= -9,-10,-20,-12, -4,-15,-23,-12,-13, 9,-16, -6, -8, -3, -2, 2, -8, -4,-12,-19, -4, -5; /M: SY='F'; M=-17,-24,-22,-30,-19, 51,-28,-13, -2,-19, 8, 1,-18,-26,-26,-13,-19,-10, -4, 2, 23,-20; /M: SY='P'; M= -5, 3,-28, 7, 11,-27, -9, -9,-23, -1,-25,-18, 3, 18, 0, -8, 2, -6,-24,-31,-22, 4; /M: SY='D'; M=-16, 37,-29, 51, 25,-35,-12, 0,-35, 1,-27,-26, 17, -6, 4, -7, 1, -8,-29,-37,-20, 14; /M: SY='E'; M= -4, 8,-27, 15, 42,-27,-17, -3,-25, 5,-16,-17, 0, -2, 14, -4, 0, -9,-25,-29,-19, 28; /M: SY='N'; M= -8, 20,-21, 9, -3, -8, -4, 1,-20, -4,-22,-16, 30,-19, -5, -5, 4, -2,-22,-29,-11, -4; /M: SY='F'; M=-15,-17,-22,-24,-19, 29,-23, -7, -3,-18, -1, -2, -8,-19,-22,-12,-14, -8, -5, -8, 13,-20; /M: SY='S'; M= -1, -3,-22, -5, -3,-16, -6, -3,-18, 0,-19,-11, 0,-13, -3, -4, 5, 0,-13,-23, -6, -4; /M: SY='L'; M= -4,-19,-22,-19,-10, -6,-15,-16, 1,-16, 16, 4,-19,-18,-13,-14,-15, -8, 0,-22, -8,-12; /I: I=-5; MI=0; MD=-16; IM=0; /M: SY='K'; M= -5, -6,-22, -5, 3,-22,-17,-11,-17, 19,-21, -9, -4, -2, 3, 9, -3, -5,-11,-23,-12, 2; D=-3; /I: DM=-16; /M: SY='H'; M=-17, 0,-26, -3, -3,-10,-18, 68,-21,-11,-14, -1, 10,-20, 3, -3, -9,-15,-23,-26, 14, -3; D=-3; /I: DM=-16; /M: SY='D'; M=-11, 15,-21, 19, 2,-16,-15, -3,-19, -3,-17,-15, 6,-13, -4, -7, 3, 5,-13,-24, -3, -2; D=-3; /I: DM=-16; /M: SY='R'; M= 0, -7,-24, -8, -4,-22, 3,-10,-26, 8,-21,-13, -2, -9, -2, 17, -2, -7,-18,-21,-17, -5; D=-3; /I: DM=-16; /M: SY='P'; M= -4,-15,-31,-12, -4,-21, -7,-16,-22, -3,-23,-15,-11, 30, -8, -1, -7,-10,-22,-23,-21, -9; /M: SY='G'; M= -1,-10,-27,-11,-16,-18, 43,-16,-31,-17,-23,-16, -3,-19,-17,-17, 0,-11,-23,-16,-16,-17; /M: SY='I'; M= -8,-23,-18,-26,-20, 0,-27,-20, 11,-16, 11, 6,-20,-24,-16,-10,-14, 0, 11,-10, 0,-19; /M: SY='L'; M= -1,-27,-18,-29,-20, 5,-26,-21, 18,-26, 37, 15,-27,-27,-20,-20,-22, -8, 14,-21, -4,-20; /M: SY='S'; M= 12, -6,-14, -8, -7,-19, 7,-12,-16,-11,-20, -8, 1,-13, -4,-13, 22, 7, -9,-31,-19, -6; /M: SY='M'; M= -3,-19,-20,-29,-19, -2,-17, -4, 15,-10, 15, 48,-19,-19, -2,-12,-17, -9, 7,-14, -2,-10; /M: SY='A'; M= 35,-11,-10,-20,-10,-19, -6,-18,-10, -6,-10, -9, -9,-13, -8, -9, 5, -2, -1,-21,-18,-10; /I: MD=-25; /M: SY='N'; M= -9, 27,-19, 12, -2,-16, -5, 10,-18, -1,-24,-16, 42,-18, -1, 1, 9, 4,-24,-33,-12, -2; D=-5; /I: MD=-25; /M: SY='A'; M= 13, -6,-15, -9, -3,-18,-10,-11,-17, 4,-16,-10, -4, -9, 0, 2, 3, -3,-10,-21,-14, -2; D=-5; /I: MD=-25; /M: SY='G'; M= 0, -5,-27, -5,-15,-27, 54,-16,-34,-17,-27,-17, 2,-18,-16,-17, 1,-16,-26,-21,-26,-16; D=-5; /I: I=-7; MI=-7; IM=-7; DM=-25; /M: SY='P'; M= -7,-10,-33, -4, 3,-29,-17,-15,-23, 3,-29,-18,-10, 47, -3, -6, -3, -6,-25,-29,-23, -3; /M: SY='N'; M=-14, 37,-25, 34, 6,-27, -2, 13,-29, -2,-29,-22, 38,-17, 0, -5, 4, -6,-30,-38,-17, 2; /M: SY='T'; M= 1, 2,-11, -4, -7,-13,-15,-17,-13,-10,-13,-12, 2,-11, -8,-10, 22, 38, -3,-32,-12, -7; /M: SY='N'; M= -1, 28,-19, 12, -2,-21, 2, 3,-20, 0,-27,-18, 43,-18, -2, -2, 9, -1,-25,-35,-20, -2; /M: SY='G'; M= 0, -6,-24, -8,-15,-25, 45,-17,-32,-16,-27,-18, 3,-17,-15,-15, 8, -4,-23,-25,-25,-15; /I: I=-6; MI=0; IM=0; DM=-15; MD=-15; /M: SY='S'; M= 11, -3, -4, -4, -3,-18, -3,-12,-18,-12,-24,-17, 5,-13, -3,-12, 32, 16, -8,-38,-19, -3; /M: SY='Q'; M= -8, 0,-29, 0, 20,-38,-19, 8,-21, 11,-20, -2, 0,-10, 54, 10, 0,-10,-28,-20,-11, 37; /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-30, 78,-30,-19, 0,-29, 10, 0,-20,-30,-39,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='F'; M=-19,-29,-22,-37,-29, 65,-31,-15, 5,-27, 10, 2,-20,-29,-34,-20,-20,-10, 2, 10, 34,-29; /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-38,-29, 6,-38,-28, 43,-29, 21, 19,-21,-22,-21,-28,-20, -9, 27,-19, 1,-29; /M: SY='T'; M= -4, -2, 5,-11,-10, -9,-20,-18,-11,-12,-11,-11, 0,-17,-13,-12, 9, 26, -2,-32,-13,-11; /M: SY='T'; M= -6,-13,-12,-18,-16, 4,-24,-12, 0,-16, 2, -2,-11,-20,-16,-13, 1, 20, 6,-21, 4,-16; /M: SY='A'; M= 5,-13,-18,-15, -8,-11,-14,-13, -6, -3,-10, -5,-10,-18, -9, -2, 0, -1, 5,-24,-10, -9; /M: SY='P'; M= -4, 4,-30, 11, 11,-30,-13,-11,-26, 7,-25,-18, -3, 18, -1, -4, -4, -9,-23,-28,-21, 4; /M: SY='T'; M= 3, 1, -2, -6, -4,-19,-15,-13,-15, -9,-16,-11, 2, -9, -4,-11, 10, 16,-10,-32,-17, -4; /M: SY='P'; M= -2, -1,-28, 2, 7,-28,-11,-11,-23, 2,-25,-17, -2, 21, 1, -7, 2, -3,-22,-29,-21, 2; /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; /M: SY='W'; M=-17,-19,-32,-21,-14, 9,-19, 10,-15,-14,-11, -8,-16,-23,-10,-11,-22,-18,-20, 48, 23,-11; D=-4; /I: I=-4; MI=-19; IM=-19; DM=-19; /M: SY='L'; M=-10,-29,-15,-31,-21, 10,-30,-20, 19,-29, 44, 19,-29,-30,-20,-20,-28,-10, 10,-20, 0,-21; /M: SY='D'; M=-16, 39,-28, 49, 16,-34, -9, 0,-33, -1,-29,-26, 24, -5, 0, -8, 3, -6,-29,-39,-20, 8; /M: SY='G'; M= -3, -9,-29,-10,-16,-24, 44,-12,-33,-14,-26,-16, 0,-14,-15,-11, -2,-17,-27,-20,-22,-16; /M: SY='K'; M=-10, -1,-28, 0, 11,-27,-17, -8,-26, 31,-24,-10, -1,-12, 8, 23, -7, -9,-17,-23,-12, 9; /M: SY='H'; M=-15, -4,-27, -4, -3,-12,-19, 65,-23, -8,-18, -3, 4,-20, 6, -1, -4,-12,-23,-20, 23, -2; /I: I=-5; MI=0; IM=0; DM=-15; MD=-15; /M: SY='V'; M= 7,-17, -5,-21,-20, -7,-22,-25, 9,-16, -1, -1,-16,-21,-20,-17, 3, 14, 24,-30,-13,-20; /M: SY='V'; M= 2,-28,-13,-30,-28, -2,-29,-29, 29,-21, 10, 10,-26,-27,-26,-21,-10, 0, 41,-28, -9,-28; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='G'; M= 1,-10,-29,-10,-20,-30, 68,-20,-39,-20,-29,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-19,-29,-20,-30,-20; /M: SY='Q'; M=-12, -2,-28, 0, 17,-23,-21, 0,-22, 17,-18, -8, -2,-11, 19, 17, -5, -6,-21,-19, -5, 17; /M: SY='V'; M= -2,-29,-13,-31,-28, 1,-31,-29, 30,-22, 15, 12,-28,-28,-27,-21,-13, -1, 42,-28, -8,-28; /M: SY='V'; M= -4,-20,-17,-23,-17, -5,-27,-21, 16,-15, 9, 8,-18,-21,-13,-15, -8, 4, 20,-26, -7,-16; /M: SY='D'; M= -3, 14,-26, 20, 20,-31, -5, -4,-30, 5,-25,-19, 5, -9, 6, -3, 3, -8,-24,-30,-19, 13; /I: I=-6; MI=0; IM=0; DM=-15; MD=-15; /M: SY='G'; M= 0,-11,-28,-11,-19,-26, 57,-19,-33,-20,-23,-16, -2,-20,-19,-19, 0,-17,-25,-21,-27,-19; /M: SY='M'; M=-10,-14,-23,-18, -8, -7,-21, -4, 4, -3, 9, 28,-14,-19, 4, -3,-16,-10, -1,-20, -3, -2; /M: SY='D'; M=-13, 28,-27, 37, 13,-29,-10, 1,-31, 2,-25,-21, 14,-12, 2, -4, 1, -6,-25,-33,-14, 7; /M: SY='V'; M= -2,-22,-13,-25,-22, 0,-28,-26, 18,-19, 9, 6,-21,-24,-22,-18, -5, 10, 30,-28, -8,-22; /M: SY='V'; M= 0,-28,-14,-30,-25, 1,-27,-24, 25,-21, 19, 16,-27,-27,-23,-20,-14, -4, 33,-26, -7,-24; /M: SY='D'; M=-15, 16,-28, 24, 14,-27,-17, 0,-29, 12,-22,-17, 6,-12, 6, 12, -4, -6,-23,-27,-10, 9; /M: SY='K'; M= 8, -3,-21, -7, 1,-21,-14,-11,-18, 16,-19, -9, -3,-12, 1, 4, 0, 0,-11,-20, -8, 0; /M: SY='I'; M= -9,-29,-26,-37,-28, 2,-36,-27, 42,-28, 25, 21,-22,-22,-20,-27,-21, -9, 26,-21, -1,-27; /M: SY='E'; M= -1, 5,-26, 9, 32,-28,-15, -1,-26, 9,-20,-16, 0, -6, 13, 3, 3, -7,-23,-28,-17, 22; /M: SY='N'; M= 0, 11,-22, 4, 1,-23, -6, -2,-21, 9,-24,-14, 17,-15, 4, 3, 5, -2,-20,-27,-12, 2; /M: SY='V'; M= -3,-19,-12,-23,-20, 0,-22,-21, 11,-18, 8, 4,-17,-24,-19,-16, -7, 4, 18,-25, -7,-20; /M: SY='G'; M= -1, -5,-29, -3, 8,-29, 9,-13,-29, 4,-25,-16, -4, 3, -1, -3, -2,-11,-24,-24,-22, 3; /M: SY='T'; M= 3, -6,-10,-12,-11,-11,-18,-20, -5,-11,-10, -8, -4,-14,-11,-11, 16, 31, 6,-31,-12,-11; /M: SY='D'; M= -7, 18,-26, 25, 11,-31, -3, -1,-30, 1,-25,-20, 10, -9, 4, -2, 3, -8,-25,-31,-18, 7; /M: SY='S'; M= -1, 7,-21, 7, 10,-25, -2, -4,-25, -2,-25,-18, 9, -8, 2, -4, 12, 2,-20,-32,-18, 5; /M: SY='G'; M= -6, 2,-27, 0, -6,-22, 20, -6,-28, -3,-25,-16, 9,-18, -8, -4, 0,-11,-23,-22,-14, -8; /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; /M: SY='D'; M= -8, 18,-21, 23, 3,-23, 9, -3,-25, -5,-21,-17, 13,-11, -2, -8, 3, -7,-21,-24,-14, 0; D=-4; /I: DM=-23; /M: SY='K'; M= -5,-11,-23,-11, -4,-18,-20,-10,-13, 17,-16, -5, -8,-13, -2, 16, -6, -6, -2,-23,-10, -4; /M: SY='P'; M= -9,-18,-34,-11, -2,-26,-20,-20,-18,-10,-26,-18,-18, 73,-11,-19, -6, -2,-24,-30,-26,-11; /M: SY='T'; M= 0, -9,-19,-11, -2,-14,-18,-12, -6, -1, -4, 0, -8,-15, -1, -4, -1, 1, -4,-25,-10, -2; /M: SY='K'; M= 0, -4,-20, -5, 5,-22,-18, -7,-15, 7,-13, -7, -5,-13, 5, 2, -2, -2, -8,-25,-12, 5; /M: SY='P'; M= -7, 5,-29, 12, 14,-29,-14, -9,-25, 4,-25,-18, -1, 15, 3, -4, 0, -6,-23,-30,-20, 7; /M: SY='V'; M= -4,-28, -8,-31,-28, -2,-32,-28, 28,-22, 11, 10,-26,-26,-25,-22,-12, -2, 36,-28, -9,-27; /M: SY='V'; M= -4,-18,-17,-21,-17, -7,-27,-23, 12, -8, 2, 4,-17,-21,-16, -8, -6, 7, 21,-26, -8,-17; /M: SY='I'; M= -9,-30,-28,-39,-30, 0,-39,-30, 48,-29, 20, 19,-21,-21,-21,-29,-19, -9, 31,-21, -1,-30; /M: SY='T'; M= 5, -7,-17, -9, -2,-15,-11,-15, -7, -9, -8, -4, -7,-13, -6,-12, 5, 6, -2,-27,-14, -4; /M: SY='D'; M= -8, 18,-23, 22, 10,-24,-10, 0,-26, 1,-26,-20, 14,-12, 3, 0, 10, 0,-21,-31,-12, 6; /M: SY='C'; M= 1,-20, 53,-27,-25,-14,-24,-27, -8,-24, -8, -9,-18,-30,-24,-25, -5, -5, 5,-38,-21,-25; /M: SY='G'; M= -3, -5,-26, -4, -6,-26, 30,-14,-30, -8,-24,-16, 0,-16, -8, -9, 3, -9,-22,-24,-22, -7; /M: SY='V'; M= -5,-12,-21,-12, 2,-15,-23,-11, 2, -6, -3, 1,-12,-17, 2, -8, -5, -4, 5,-27,-10, 2; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 319 in 319 different sequences |
Number of true positive hits | 319 in 319 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 0 |
Number of false negative sequences | 2 |
Number of 'partial' sequences | 4 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 99.38 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria), Eukaryotic viruses |
Maximum number of repetitions [info] | 1 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | K_Hofmann |
Feature key [info] | DOMAIN |
Feature description [info] | PPIase cyclophilin-type |
Version [info] | 5 |
Cross-references [info]