PROSITE entry PS50195

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	PX
Accession [info]	PS50195
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-MAY-2002 CREATED; 26-FEB-2020 DATA UPDATE; 03-MAY-2023 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC50195
Associated ProRule [info]	PRU00147

Name and characterization of the entry

Description [info]

PX domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=116;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=111;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.7983999; R2=0.0146237; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=5771.9018555; R2=3.3948598; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=390; H_SCORE=7096; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=254; H_SCORE=6634; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M:         M= -3, -8,-22, -8, -8, -9, -9,-10, -9,-12, -8, -5, -7,-12,-10,-12, -2, -3, -5,-23, -7,-10;
/M:         M= -6, -6,-17, -7, -3,-11,-19,-10,-10, -3, -8, -5, -5,-15, -4, -1, -5, -5, -8,-23, -7, -5;
/M:         M= -4,-12,-21,-13,-10, -9,-18,-14, -1,-12, -2, -2,-11,-15, -9,-13, -8, -7,  0,-21, -8,-11;
/M: SY='K';  M= -7, -7,-20, -9, -1,-13,-20, -9,-10,  1, -9, -6, -6,-13, -2,  0, -3,  1, -7,-23, -6, -2;
/M: SY='V';  M= -4,-11,-16,-14,-14, -6,-20,-14,  1,-12, -4, -2, -9,-19,-13,-11, -4,  0,  5,-24, -7,-15;
/M: SY='A';  M=  1,-11,-20,-12, -5,-14,-16,-14, -5, -8, -9, -6, -9, -8, -7,-10,  1,  0,  0,-25,-13, -7;
/M: SY='V';  M= -3,-11,-21,-13, -9,-11,-21,-17,  3,-10, -4, -2, -9,-12,-10,-12, -3,  1,  5,-26,-10,-10;
/M:         M= -4, -7,-24, -6, -1,-18,-17,-11, -9, -6,-11, -6, -8, -4, -3, -8, -2, -1, -7,-24,-12, -3;
/M: SY='S';  M= -1, -7,-16, -6, -1,-16,-15,-10,-11, -7,-11, -8, -7, -9, -6, -8,  1, -2, -6,-28,-14, -4;
/M: SY='R';  M= -5, -7,-22, -7, -2,-16,-13,-11,-14,  0,-14, -9, -5, -5, -4,  2, -3, -3,-11,-24,-12, -4;
/M:         M= -8,-10,-23,-11, -4, -5,-19,-10, -4, -9, -7, -5, -7,-12, -8, -9, -5, -4, -3,-22, -5, -7;
/M: SY='E';  M= -3, -2,-21, -2,  7,-16,-14, -9,-12, -4,-13, -9, -2,-11,  0, -8,  4,  2, -9,-27,-12,  3;
/M: SY='R';  M= -7, -5,-19, -6, -2,-18,-15, -6,-16,  6,-16, -8, -2,-14, -2,  8, -3, -5, -9,-26,-11, -3;
/M: SY='G';  M= -5, -5,-24, -6, -4,-17,  2, -5,-18, -4,-16, -6, -1,-14, -3, -5,  0, -6,-15,-23,-11, -4;
/M: SY='E';  M= -8,  0,-22,  0,  1,-14,-11, -8,-15, -4,-12, -8, -1,-15, -3, -5, -3, -4,-13,-23, -8, -2;
/M:         M= -4, -6,-23, -7, -6,-19,  0, -4,-15, -6,-14, -6, -1,-16, -5, -5,  0, -5,-11,-27,-13, -6;
/M:         M= -5,-11,-24,-12, -5,-11,-14,-13, -9, -4, -9, -2, -9, -7, -5, -5, -5, -4, -7,-21, -9, -6;
/M: SY='D';  M= -6,  6,-24,  7,  6,-24, -7, -6,-23,  6,-22,-13,  7,-10,  3,  1,  4, -3,-19,-29,-15,  4;
/M: SY='K';  M= -2,  0,-22, -1,  3,-23, -8,-10,-21,  7,-21,-12,  2, -9,  2,  5,  7,  5,-15,-28,-16,  2;
/M: SY='Y';  M=-13,-15,-24,-18,-14, 13,-22, 14, -7,-13, -5, -1,-10,-22,-10,-11,-13,-10, -9, -3, 26,-14;
/M: SY='T';  M= -3,-13,-19,-18,-15,  0,-23, -9,  3,-13, -3, -1,-10,-17,-12,-13, -2,  6,  6,-17,  6,-15;
/M: SY='V';  M= -5,-16,-18,-17, -9, -3,-24,-14,  4,-12,  3,  2,-16,-21,-12,-13,-10, -4,  8,-17, -2,-11;
/M: SY='Y';  M=-20,-21,-29,-22,-20, 32,-30, 15,  0,-12,  1,  0,-20,-29,-12,-11,-20,-10, -9, 27, 70,-20;
/M: SY='T';  M= -7,-10,-20,-12, -3,-13,-22,-11, -5, -3, -4, -1, -8,-15,  0,  0, -4,  1, -3,-25, -9, -2;
/M: SY='I';  M= -7,-29,-22,-34,-28,  3,-35,-25, 36,-26, 18, 15,-24,-25,-23,-24,-17, -7, 32,-22,  0,-28;
/M: SY='E';  M= -7, -3,-21, -4,  5,-16,-20, -5,-13,  2,-11, -6, -2,-14,  3,  3, -2, -1,-11,-25, -9,  3;
/M: SY='V';  M= -1,-19,-10,-23,-21, -5,-26,-22, 15,-19,  4,  4,-18,-20,-20,-19, -5,  5, 23,-28, -9,-22;
/M: SY='R';  M= -6, -6,-23, -8,  2,-17,-18, -5,-16,  7,-15, -7, -3,-14,  2,  8,  0,  3,-10,-21, -7,  1;
/M: SY='T';  M=-10, -9,-22,-11,-10, -9,-20, -2, -8, -7, -5, -2, -6,-19, -6,  1, -5,  2, -5,-19, -2, -9;
/M: SY='N';  M= -5,  0,-24, -2,  1,-19, -3, -7,-19, -4,-19,-12,  4, -8,  1, -4,  4, -3,-17,-27,-15,  0;
/M: SY='D';  M= -8,  6,-24,  7,  3,-20, -6, -6,-18, -6,-12,-12,  6,-11, -3, -7, -1, -5,-17,-30,-16, -1;
/I:         I=-2; MD=-9;
/M:         M= -5, -1,-17, -2, -2, -7,-11, -4,-10, -6,-11, -8,  0,  0, -5, -7, -1, -2, -9,-18, -7, -4; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9;
/M:         M=  0, -7,-12, -8, -4, -9, -4, -8, -9, -3, -8, -5, -5, -8, -5, -4,  0,  0, -5,-16, -8, -5; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-9;
/M: SY='E';  M= -3,  3,-20,  5,  8,-20, -6, -4,-19,  3,-19,-12,  3, -7,  3, -1,  5, -2,-15,-24,-13,  5; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-9;
/M: SY='E';  M= -4,  1,-21,  1,  8,-18,-14, -1,-18,  3,-18,-10,  2, -6,  3,  0,  4,  4,-15,-25, -9,  4; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-9;
/M: SY='W';  M= -9,-18,-28,-21,-15,  0,-18,-13,-14, -9,-14,-11,-13,-22, -9, -5,-11, -9,-15, 32,  7,-11;
/M: SY='T';  M= -5, -5,-18, -8, -3, -9,-18, -9,-10, -5, -8, -5, -3,-16, -2, -5,  2,  6, -7,-24, -6, -2;
/M: SY='V';  M= -3,-27,-14,-30,-27,  0,-30,-28, 28,-22, 12, 11,-24,-26,-25,-21,-11,  1, 36,-27, -7,-27;
/M: SY='Y';  M= -9,-11,-22,-12, -4, -3,-21, -4, -9, -2, -9, -5, -8,-17, -4, -1, -7, -6, -9,-10,  7, -5;
/M: SY='R';  M=-19, -9,-30, -9,  1,-21,-20,  4,-30, 30,-21,-10,  0,-19, 10, 64,-10,-10,-20,-20, -9,  1;
/M: SY='R';  M=-17, -7,-28, -8,  1,-19,-19, -1,-27, 25,-20,-10,  1,-18,  9, 54, -6, -6,-19,-20, -8,  1;
/M: SY='Y';  M=-20,-21,-28,-23,-21, 38,-30, 14, -1,-14,  2,  0,-19,-30,-16,-12,-20,-10, -8, 23, 66,-21;
/M: SY='S';  M= -1,  2,-18,  0,  6,-21, -9, -6,-22,  4,-24,-15,  8,-12,  5,  8, 17,  8,-15,-32,-16,  5;
/M: SY='D';  M=-16, 27,-30, 40, 31,-34,-15, 10,-34,  4,-25,-22, 11, -8, 11, -2, -1,-11,-30,-34,-15, 20;
/M: SY='F';  M=-19,-30,-21,-40,-30, 75,-31,-21,  3,-30, 11,  1,-20,-29,-39,-21,-20,-10,  2,  8, 28,-30;
/M: SY='E';  M= -7, -7,-22, -6,  1, -8,-21, -4, -9, -5, -4, -5, -8,-18, -2, -3, -6, -5, -6,-21, -1, -1;
/M: SY='E';  M= -7, -3,-27, -2,  7,-15,-14, -8,-21,  0,-17,-14, -3,-15, -1, -1, -5, -8,-19, -1, -8,  4;
/M: SY='L';  M=-12,-30,-20,-31,-21, 20,-30,-19, 17,-29, 43, 17,-28,-30,-22,-20,-28,-10,  8,-15,  6,-21;
/M: SY='H';  M=-16,  0,-29,  0,  1,-17,-19, 48,-24,  0,-18, -4,  6,-19, 12,  9, -8,-13,-25,-21, 13,  3;
/M: SY='E';  M= -7,  1,-23,  2,  5,-22,-11,  0,-20,  3,-18, -9,  3,-14,  5,  5,  3, -1,-15,-28,-13,  4;
/M: SY='R';  M= -9, -2,-22, -3,  2,-22,-17, -3,-18, 10,-16, -7,  0,-15, 10, 12, -3, -5,-16,-23, -8,  5;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-21,-31,-21, 10,-30,-20, 21,-29, 45, 20,-28,-29,-20,-19,-29,-10, 11,-19,  0,-21;
/M: SY='K';  M= -6,-10,-18,-11, -1,-13,-21,-12, -9,  3, -4, -1, -9,-17,  1,  2, -5, -2, -6,-24, -9,  0;
/M: SY='E';  M= -6,  0,-25,  1, 11,-21,-16, -5,-20, 10,-17,-10,  0,-11,  5,  9, -2, -6,-15,-26,-13,  7;
/M: SY='R';  M= -8, -3,-20, -6,  1,-13,-18,  0,-15,  3,-11, -4,  0,-17,  3,  5, -5, -5,-14,-23, -6,  1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='F';  M=-15,-18,-22,-21,-17, 30,-25, -1, -5,-15, -1, -3,-13,-20,-19,-10,-15,-10, -7,  0, 25,-18; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='P';  M= -2,-10,-26, -8, -3,-21, -8,-15,-18, -6,-21,-15, -9, 25, -8,-10, -4, -7,-18,-20,-18, -8; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='S';  M=  0, -5,-18, -8, -7, -9, -4, -7,-11, -9, -9, -6, -2,-12, -7, -9,  1,  0, -9,-18, -5, -8; D=-1;
/I:         I=-1; MI=0; MD=-3; IM=0; DM=-3;
/M:         M= -8,-15,-12,-19,-14, -6,-20,-14, -2, -7, -3,  0,-11,-21,-11, -1, -9, -6,  0,-22, -5,-14;
/M: SY='I';  M= -6,-14,-20,-17,-10,-10,-22,-12,  2, -8, -4,  2,-11,-11, -6, -8, -7, -4,  1,-22, -6, -9;
/M: SY='I';  M= -3,-18,-19,-23,-19, -3,-24,-20, 15,-17,  8,  8,-15,-20,-16,-17,-11, -6, 13,-23, -7,-18;
/M: SY='P';  M= -9,-18,-32,-12, -4,-22,-21,-17,-13,-11,-16,-12,-18, 50,-10,-17,-11, -9,-19,-25,-20,-10;
/M: SY='P';  M= -6,-10,-27, -8,  1,-18,-16, -4,-18, -2,-19,-11, -8, 15,  0, -4, -1, -4,-19,-24,-10, -1;
/M: SY='L';  M= -8,-27,-19,-31,-21, 16,-27,-21, 14,-27, 30, 12,-24,-24,-22,-20,-22, -9,  7,-16,  2,-21;
/M: SY='P';  M=-10,-19,-39, -9,  0,-30,-19,-19,-20,-10,-30,-20,-18, 86,-10,-19, -9, -9,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='P';  M= -3, -3,-28,  1,  6,-26, -5, -8,-25, -1,-24,-16, -3, 14, -2, -4,  0, -6,-23,-28,-20,  0;
/M: SY='K';  M= -9, -5,-30, -4,  5,-26,-18,-11,-26, 35,-26,-10, -3, -5,  6, 25, -8, -9,-19,-18,-11,  4;
/M: SY='R';  M= -9,-10,-26, -9, -3,-17,-16, -4,-15,  3,-17, -8, -6,-10,  1,  5, -4, -7,-11,-15, -8, -2;
/M:         M= -8,-14,-25,-16,-11, -4,-23,-12,  0,-12,  0, -1,-11,-14,-11,-10,-11, -6, -2,-12, -3,-12;
/M: SY='F';  M=-10,-20,-21,-24,-17, 13,-25,-14,  6,-18,  8,  5,-16,-22,-18,-14,-13, -6,  6,-14,  3,-18;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='G';  M= -3, -2,-22, -1, -3,-19,  9, -9,-22, -3,-18,-11,  0,-14, -3, -1,  1, -6,-16,-21,-14, -3; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='N';  M= -5,  4,-17,  1,  0,-14, -8, -3,-13,  1,-14, -7,  8,-11,  1,  3,  4,  1,-12,-23, -9,  0; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-3;
/M: SY='S';  M= -3, -4, -9, -6, -4, -4, -7, -4, -6, -3, -8, -5, -1, -8, -2, -1,  2,  2, -6, -6,  0, -4; D=-1;
/I:         I=-1; MI=0; MD=-3; IM=0; DM=-3;
/M: SY='F';  M= -8,-10,-21,-15,-11,  2,-19, -9, -4, -7, -4,  1, -5,-18, -9, -5, -6, -2, -3,-20, -2,-10;
/M: SY='D';  M= -7, 13,-22, 14,  5,-22, -7, -3,-22, -1,-23,-15, 12,-13,  1, -5,  8,  0,-18,-32,-14,  2;
/M: SY='E';  M= -6,  0,-25,  3, 13,-23,-16, -7,-19,  4,-17,-12, -1, -5,  8,  3,  1, -2,-16,-27,-14,  9;
/M: SY='E';  M= -5,  7,-25, 10, 19,-24,-15, -4,-22,  5,-17,-13,  4, -7,  8,  2,  1, -4,-20,-29,-16, 13;
/M: SY='F';  M=-11,-22,-20,-27,-21, 25,-26,-17,  6,-20,  8,  3,-17,-26,-22,-14,-14, -5,  8, -8,  7,-20;
/M: SY='I';  M= -1,-23,-21,-27,-21,  1,-24,-22, 19,-22, 16, 10,-19,-22,-18,-20,-14, -6, 15,-20, -4,-21;
/M: SY='E';  M= -4,  4,-25,  7, 28,-26,-16, -2,-25, 10,-20,-15,  0, -7, 12,  4,  0, -8,-22,-27,-16, 20;
/M: SY='E';  M= -8,  0,-26,  1, 15,-23,-17,  2,-22, 13,-19, -7,  0,-11, 12, 11, -1, -4,-19,-24, -9, 13;
/M: SY='R';  M=-18,-10,-29,-10,  0,-20,-20, -1,-28, 28,-19, -8, -1,-17,  9, 61, -9, -8,-19,-21,-10,  0;
/M: SY='R';  M=-11,-10,-21,-12, -2,-18,-21, -5,-18, 15,-14, -5, -5,-16,  6, 30, -8, -8,-13,-22, -9, -1;
/M: SY='R';  M= -4, -8,-21,-10,  0,-18,-17,-10,-13,  5,-13, -6, -6,-11,  0,  7, -5, -6, -9,-24,-12, -2;
/M: SY='A';  M=  1, -5,-23, -5, -1,-19, -3, -6,-15, -8, -8, -5, -6,-14,  1, -9, -2, -7,-13,-23,-12, -1;
/M: SY='L';  M=-11,-29,-21,-30,-19, 13,-30,-18, 18,-28, 42, 18,-27,-29,-20,-20,-27,-10, 10,-19,  2,-20;
/M: SY='E';  M=-11, 14,-27, 16, 30,-29,-15,  4,-26,  8,-23,-15, 12, -8, 21,  5,  3, -6,-28,-30,-16, 25;
/M: SY='E';  M= -4,  3,-24,  3,  9,-22,-15, -3,-17,  5,-16,-10,  2,-13,  6,  3, -1, -6,-14,-26,-12,  6;
/M: SY='Y';  M=-19,-25,-25,-29,-25, 43,-29,  0, -1,-18,  2,  0,-22,-30,-21,-15,-21,-12, -7, 29, 54,-23;
/M: SY='L';  M= -9,-29,-16,-31,-23,  6,-30,-21, 23,-27, 38, 21,-28,-28,-20,-21,-25, -9, 16,-22, -2,-22;
/M: SY='R';  M= -9,  4,-23, -1,  5,-23,-15, -2,-21, 11,-20,-10,  9,-15, 13, 16, -1, -3,-21,-23,-11,  8;
/M: SY='R';  M= -8,  0,-20, -1,  2,-20,-16,  1,-21,  9,-17, -9,  3,-17,  5, 14, -2, -6,-17,-24, -9,  2;
/M: SY='L';  M= -8,-28,-13,-31,-24,  6,-31,-23, 23,-27, 30, 16,-26,-28,-21,-21,-22, -8, 18,-22, -2,-23;
/M: SY='L';  M=  0,-21, -2,-25,-18,  1,-23,-19,  4,-20, 12,  5,-19,-25,-16,-17,-11, -5,  6,-23, -6,-17;
/M: SY='N';  M= -1,  0,-20, -4, -1,-18,-12, -2,-15,  0,-15, -8,  5,-16,  2,  2,  3, -1,-13,-26,-11,  0;
/M: SY='H';  M=-10, -4,-24, -4, -7,-14,-20, 20, -7,-12, -5,  1, -2,-17, -4,-10, -8, -8, -7,-27,  0, -8;
/M: SY='P';  M= -6,-12,-28, -7,  1,-23,-17,-14,-16, -6,-22,-14,-12, 35, -6,-10, -3, -6,-18,-29,-21, -5;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M: SY='E';  M= -7,  1,-16,  2, 11, -7,-10, -2,-13,  1,-10, -8,  0, -4,  1,  0, -2, -4,-13,-11, -5,  6; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-12;
/M: SY='I';  M= -7,-25,-22,-27,-18,  0,-30,-22, 20,-20, 19, 11,-23,-21,-17,-16,-18, -8, 17,-20, -5,-19;
/M: SY='A';  M=  2,-13,-14,-17,-10, -4,-17, -9, -4,-13, -3, -2, -9,-18, -9,-12,  0,  1, -2,-20, -3,-10;
/M: SY='R';  M= -8, -3,-18, -5,  3,-20,-13,  0,-19,  4,-15, -7,  3,-17,  7, 11, -1, -5,-16,-27,-12,  4;
/M: SY='S';  M= -3,  4, -5,  1, -1,-19,-11, -8,-18, -8,-18,-14,  8,-13, -4, -9,  9,  3,-14,-35,-18, -3;
/M: SY='D';  M= -9, 10,-26, 18, 14,-26,-15,  1,-24, -2,-22,-17,  3,  2,  2, -7,  2, -5,-21,-31,-14,  7;
/M: SY='E';  M= -7, -4,-19, -2,  4,-16,-21,  3,-11, -6, -5, -4, -6,-17,  2, -7, -7, -9,-10,-26, -6,  2;
/M: SY='V';  M= -4,-22,-16,-23,-19,  1,-27,-20, 17,-20, 13,  7,-21,-25,-20,-18,-13, -4, 21,-23, -5,-20;
/M: SY='Y';  M=-11,-17,-23,-20,-12,  8,-25, -7, -2, -9,  6,  3,-14,-23, -8, -3,-13, -5, -4,-10, 10,-11;
/M: SY='R';  M= -3,  0,-22,  0,  2,-20,-16, -6,-18,  5,-16,-10,  0,-12,  1,  6,  2,  2,-12,-26,-11,  1;
/M: SY='F';  M=-16,-21,-19,-27,-17, 39,-27,-14, -2,-18,  5,  1,-16,-25,-22,-12,-16, -9, -2, -5, 14,-17;
/M: SY='F';  M=-15,-29,-20,-35,-26, 51,-28,-20,  6,-29, 22,  6,-22,-29,-32,-20,-22, -9,  3, -2, 17,-26;
/M: SY='L';  M= -8,-12,-19,-14, -8, -4,-21, -7, -1,-14,  9,  2,-10,-21, -9,-11, -9, -2, -2,-24, -4, -9;
/M: SY='E';  M= -4,  3,-21,  5,  7,-22,-15, -9,-16, -5,-16,-12,  0,  0,  1, -8,  4,  2,-14,-31,-17,  3;
/M:         M= -7, -6,-23, -7, -4,-10,-16,-11,-11, -6, -9, -7, -4,-11, -5, -4, -6, -6,-10,-21, -8, -5;
/M: SY='E';  M= -4,  7,-24, 10, 12,-24,-11, -3,-22, -4,-21,-17,  5,  3,  3, -7,  6, -1,-21,-31,-17,  6;
/M:         M= -9, -1,-27, -1, -1,-17,-11, -7,-17, -1,-16,-11, -1,-10, -1, -2, -5, -7,-16,-17, -9, -2;
/M: SY='D';  M= -9,  2,-25,  3,  2,-14,-15, -5,-14, -5,-13,-10,  0,-10, -3, -5, -2, -5,-13,-24, -6, -2;
/M:         M= -5, -9,-20,-10, -7, -8,-17,-12, -7, -9, -6, -5, -7,-19, -7, -7, -4, -1, -4,-14, -5, -7;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2023_02 which contains 569'516 sequence entries.

Total number of hits	245 in 245 different sequences
Number of true positive hits	245 in 245 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	14
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	94.59 %

Comments [info]

Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	PX
Version [info]	6

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

245 sequences

ATG20_ASHGO (Q75B65    ), ATG20_CANAL (Q59TN9    ), ATG20_CANGA (Q6FR93    ),

ATG20_DEBHA (Q6BZE1    ), ATG20_GIBZE (A0A098DRQ4), ATG20_KLULA (Q6CNX6    ), 
ATG20_SCHPO (Q9USM8    ), ATG20_VANPO (A7TIP6    ), ATG20_YEAS7 (A6ZXL6    ), 
ATG20_YEAST (Q07528    ), BEM1_YEAST  (P29366    ), EREL1_ARATH (F4JTJ2    ), 
EREL2_ARATH (Q8S8D3    ), EREX_ARATH  (Q9LSB9    ), H1BP3_HUMAN (Q53T59    ), 
H1BP3_MOUSE (Q3TC93    ), KI16B_HUMAN (Q96L93    ), KI16B_MOUSE (B1AVY7    ), 
KL98A_DROME (Q9VB25    ), KS6C1_HUMAN (Q96S38    ), KS6C1_MOUSE (Q8BLK9    ), 
LST4_CAEEL  (Q8I4E2    ), MDM1_YEAST  (Q01846    ), MVP1_ASHGO  (Q75CC3    ), 
MVP1_ASPFU  (Q4WZF1    ), MVP1_ASPOR  (Q2UB56    ), MVP1_CANAL  (Q3MPQ4    ), 
MVP1_CANGA  (Q6FNH2    ), MVP1_CRYNB  (P0CR59    ), MVP1_CRYNJ  (P0CR58    ), 
MVP1_KLULA  (Q6CUC4    ), MVP1_NEUCR  (Q7SB97    ), MVP1_SCHPO  (O14120    ), 
MVP1_USTMA  (Q4PHC3    ), MVP1_YARLI  (Q6CHY6    ), MVP1_YEAST  (P40959    ), 
NCF1B_HUMAN (A6NI72    ), NCF1C_HUMAN (A8MVU1    ), NCF1_BOVIN  (O77774    ), 
NCF1_HUMAN  (P14598    ), NCF1_MOUSE  (Q09014    ), NCF1_RAT    (F1M707    ), 
NCF4_HUMAN  (Q15080    ), NCF4_MOUSE  (P97369    ), NISCH_HUMAN (Q9Y2I1    ), 
NISCH_MOUSE (Q80TM9    ), NISCH_RAT   (Q4G017    ), NOXO1_HUMAN (Q8NFA2    ), 
NOXO1_MOUSE (Q8VCM2    ), P3C2A_HUMAN (O00443    ), P3C2A_MOUSE (Q61194    ), 
P3C2A_PONAB (Q5RAY1    ), P3C2B_HUMAN (O00750    ), P3C2G_HUMAN (O75747    ), 
P3C2G_MOUSE (O70167    ), P3C2G_RAT   (O70173    ), PIKI1_CAEEL (G5EDY0    ), 
PLD1_CRIGR  (O08684    ), PLD1_HUMAN  (Q13393    ), PLD1_MOUSE  (Q9Z280    ), 
PLD1_RAT    (P70496    ), PLD2_BOVIN  (Q0V8L6    ), PLD2_HUMAN  (O14939    ), 
PLD2_MOUSE  (P97813    ), PLD2_RAT    (P70498    ), PXDC1_MOUSE (Q8JZU6    ), 
PXDC1_RAT   (Q4KLK8    ), PXK_HUMAN   (Q7Z7A4    ), PXK_MOUSE   (Q8BX57    ), 
PXK_RAT     (Q4FZZ1    ), SCD2_SCHPO  (P40996    ), SGK3_HUMAN  (Q96BR1    ), 
SGK3_MOUSE  (Q9ERE3    ), SGK3_PONAB  (Q5R7A7    ), SGK3_RAT    (Q8R4V0    ), 
SNX10_BOVIN (Q0IIL5    ), SNX10_HUMAN (Q9Y5X0    ), SNX10_MOUSE (Q9CWT3    ), 
SNX11_BOVIN (Q08DD7    ), SNX11_HUMAN (Q9Y5W9    ), SNX11_MOUSE (Q91WL6    ), 
SNX12_HUMAN (Q9UMY4    ), SNX12_MOUSE (O70493    ), SNX12_SCHPO (Q9USN1    ), 
SNX13_HUMAN (Q9Y5W8    ), SNX13_MOUSE (Q6PHS6    ), SNX14_DANRE (Q5PNP1    ), 
SNX14_HUMAN (Q9Y5W7    ), SNX14_MOUSE (Q8BHY8    ), SNX14_PONAB (Q5R903    ), 
SNX15_BOVIN (Q148E7    ), SNX15_HUMAN (Q9NRS6    ), SNX15_MOUSE (Q91WE1    ), 
SNX15_RAT   (Q4V896    ), SNX16_HUMAN (P57768    ), SNX16_MOUSE (Q8C080    ), 
SNX16_PONAB (Q5R6Q7    ), SNX16_RAT   (P57769    ), SNX17_BOVIN (Q5EA77    ), 
SNX17_CAEEL (Q19532    ), SNX17_DANRE (Q5RID7    ), SNX17_HUMAN (Q15036    ), 
SNX17_MOUSE (Q8BVL3    ), SNX17_PONAB (Q5R4A5    ), SNX17_RAT   (Q6AYS6    ), 
SNX18_HUMAN (Q96RF0    ), SNX18_MOUSE (Q91ZR2    ), SNX19_HUMAN (Q92543    ), 
SNX19_MOUSE (Q6P4T1    ), SNX1_ARATH  (Q9FG38    ), SNX1_BOVIN  (Q05B62    ), 
SNX1_HUMAN  (Q13596    ), SNX1_MACFA  (Q4R503    ), SNX1_MOUSE  (Q9WV80    ), 
SNX1_PONAB  (Q5RFP8    ), SNX1_RAT    (Q99N27    ), SNX20_BOVIN (Q2T9W1    ), 
SNX20_HUMAN (Q7Z614    ), SNX20_MOUSE (Q9D2Y5    ), SNX20_RAT   (Q5BK61    ), 
SNX21_HUMAN (Q969T3    ), SNX21_MOUSE (Q3UR97    ), SNX22_HUMAN (Q96L94    ), 
SNX24_BOVIN (Q17QS1    ), SNX24_HUMAN (Q9Y343    ), SNX24_MOUSE (Q9CRB0    ), 
SNX24_RAT   (Q5U2S5    ), SNX25_HUMAN (Q9H3E2    ), SNX25_MOUSE (Q3ZT31    ), 
SNX27_BOVIN (A5PKA5    ), SNX27_HUMAN (Q96L92    ), SNX27_MOUSE (Q3UHD6    ), 
SNX27_RAT   (Q8K4V4    ), SNX29_BOVIN (Q08DX0    ), SNX29_HUMAN (Q8TEQ0    ), 
SNX29_MOUSE (Q9D3S3    ), SNX2A_ARATH (Q8L5Z7    ), SNX2B_ARATH (B9DFS6    ), 
SNX2_BOVIN  (Q2TBW7    ), SNX2_HUMAN  (O60749    ), SNX2_MACFA  (P0C220    ), 
SNX2_MOUSE  (Q9CWK8    ), SNX2_PONAB  (Q5R9A9    ), SNX30_DANRE (Q566W7    ), 
SNX30_HUMAN (Q5VWJ9    ), SNX30_MOUSE (Q8CE50    ), SNX30_XENLA (Q4V7P7    ), 
SNX30_XENTR (Q28E02    ), SNX31_HUMAN (Q8N9S9    ), SNX31_MOUSE (Q6P8Y7    ), 
SNX31_XENLA (Q6DDY6    ), SNX31_XENTR (Q28HD5    ), SNX32_HUMAN (Q86XE0    ), 
SNX32_MOUSE (Q80ZJ7    ), SNX33_HUMAN (Q8WV41    ), SNX33_MOUSE (Q4VAA7    ), 
SNX33_XENLA (Q6NRL2    ), SNX33_XENTR (Q28GP7    ), SNX3_ASHGO  (Q758Y7    ), 
SNX3_ASPFU  (Q4WWS3    ), SNX3_ASPOR  (Q2U4K2    ), SNX3_BOVIN  (Q1RMH8    ), 
SNX3_CANAL  (Q5A748    ), SNX3_CANGA  (Q6FT03    ), SNX3_CRYNB  (P0CR61    ), 
SNX3_CRYNJ  (P0CR60    ), SNX3_GIBZE  (Q4I1H6    ), SNX3_HUMAN  (O60493    ), 
SNX3_KLULA  (Q6CY25    ), SNX3_MOUSE  (O70492    ), SNX3_NEUCR  (Q7SH92    ), 
SNX3_PONAB  (Q5R5V1    ), SNX3_RAT    (Q5U211    ), SNX3_SCHPO  (O94291    ), 
SNX3_USTMA  (Q4P1V3    ), SNX3_YARLI  (Q6C2S9    ), SNX3_YEAST  (Q08826    ), 
SNX41_ASHGO (Q759T1    ), SNX41_CANAL (Q5AD73    ), SNX41_CRYNB (P0CR65    ), 
SNX41_CRYNJ (P0CR64    ), SNX41_DEBHA (Q6BHN9    ), SNX41_EMENI (Q5AZC9    ), 
SNX41_KLULA (Q6CWX3    ), SNX41_NEUCR (Q7SB54    ), SNX41_SCHPO (O60107    ), 
SNX41_YARLI (Q6C9X0    ), SNX41_YEAST (Q04053    ), SNX4_ASHGO  (Q75C43    ), 
SNX4_ASPFU  (Q4WQI6    ), SNX4_BOVIN  (A1A4L0    ), SNX4_CANAL  (Q5AD77    ), 
SNX4_CANGA  (Q6FPT9    ), SNX4_CRYNB  (P0CR63    ), SNX4_CRYNJ  (P0CR62    ), 
SNX4_DEBHA  (Q6BZE9    ), SNX4_EMENI  (Q5B797    ), SNX4_GIBZE  (I1RXT2    ), 
SNX4_HUMAN  (O95219    ), SNX4_KLULA  (Q6CTQ0    ), SNX4_MAGO7  (Q522W5    ), 
SNX4_MOUSE  (Q91YJ2    ), SNX4_NEUCR  (Q7SGV1    ), SNX4_PICPA  (Q5H7C3    ), 
SNX4_PONAB  (Q5R4C2    ), SNX4_SCHPO  (O14243    ), SNX4_YEAST  (P47057    ), 
SNX5_BOVIN  (Q3ZBM5    ), SNX5_HUMAN  (Q9Y5X3    ), SNX5_MOUSE  (Q9D8U8    ), 
SNX5_RAT    (B1H267    ), SNX6_HUMAN  (Q9UNH7    ), SNX6_MOUSE  (Q6P8X1    ), 
SNX6_PONAB  (Q5R613    ), SNX7_HUMAN  (Q9UNH6    ), SNX7_MACFA  (Q4R5U9    ), 
SNX7_MOUSE  (Q9CY18    ), SNX8_BOVIN  (Q2KHV6    ), SNX8_HUMAN  (Q9Y5X2    ), 
SNX8_MOUSE  (Q8CFD4    ), SNX9_HUMAN  (Q9Y5X1    ), SNX9_MOUSE  (Q91VH2    ), 
SNXAA_DANRE (F1Q506    ), SNXAB_DANRE (A8WG21    ), SPD2A_DANRE (Q1LYG0    ), 
SPD2A_HUMAN (Q5TCZ1    ), SPD2A_MOUSE (O89032    ), SPD2B_HUMAN (A1X283    ), 
SPD2B_MOUSE (A2AAY5    ), VAM7_SCHPO  (O74509    ), VAM7_YEAST  (P32912    ), 
VPS5_SCHPO  (Q9C0U7    ), VPS5_YEAST  (Q92331    ), Y0701_DICDI (Q559T8    ), 
YCKC_SCHPO  (Q9Y7N9    ), YNYB_SCHPO  (Q9P779    ), YP097_YEAST (Q06839    ), 
YPT35_ASHGO (Q75CM7    ), YPT35_CANAL (Q5AG56    ), YPT35_CANGA (Q6FR40    ), 
YPT35_DEBHA (Q6BIS2    ), YPT35_PICGU (A5DHC9    ), YPT35_VANPO (A7TKX9    ), 
YPT35_YEAS7 (A6ZT13    ), YPT35_YEAST (P38815    )

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences

14 sequences

MU122_SCHPO (O74444    ), PLD1_SCHPO  (Q09706    ), PLDZ1_ARATH (Q9LRZ5    ),

PLDZ2_ARATH (Q9M9W8    ), PXDC1_BOVIN (Q08D85    ), PXDC1_HUMAN (Q5TGL8    ), 
RHG32_HUMAN (A7KAX9    ), RHG32_MOUSE (Q811P8    ), RHG32_XENLA (Q6GPD0    ), 
RHG33_HUMAN (O14559    ), RHG33_MOUSE (Q80YF9    ), SPO14_YEAST (P36126    ), 
VPS17_SCHPO (Q9URW7    ), VPS17_YEAST (P32913    )

» more

PDB
[Detailed view]

78 PDB

1GD5; 1H6H; 1KMD; 1KQ6; 1O7K; 1OCS; 1OCU; 1XTE; 1XTN; 2AR5; 2CSK; 2CZO; 2DYB; 2ETT; 2I4K; 2IWL; 2L73; 2MXC; 2RAI; 2RAJ; 2RAK; 2REA; 2RED; 2V14; 2V6V; 2WWE; 2YPS; 3DYT; 3DYU; 3FOG; 3HPB; 3HPC; 3IQ2; 3LUI; 3P0C; 4AKV; 4AZ9; 4BGJ; 4HAS; 4IKB; 4IKD; 4ON3; 4P2I; 4P2J; 4PQO; 4PQP; 4PZG; 5F0J; 5F0L; 5F0M; 5F0P; 5GW0; 5GW1; 5TGH; 5TGI; 5TGJ; 5TP1; 5WOE; 5WY2; 5ZN9; 6BUB; 6E8R; 6ECM; 6EDX; 6EE0; 6KOI; 6KOJ; 6KOK; 6MBI; 6N5X; 6N5Y; 6N5Z; 6Q0X; 7BI2; 7BLO; 7D6D; 7D6E; 7X4O
» more