PROSITE entry PS50208
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | CASPASE_P20 |
| Accession [info] | PS50208 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-DEC-2001 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC00864 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Caspase family p20 domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=123; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=118; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.4252000; R2=0.0191057; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=8025.7841797; R2=5.4646840; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=468; H_SCORE=10583; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=363; H_SCORE=10009; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-30; E1=-30; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='R'; M= -4, -9,-29, -6, 8,-25,-17, -9,-24, 13,-22,-14, -6, 12, 3, 20, -5, -8,-21,-24,-18, 3; /M: SY='R'; M=-13, -2,-23, -2, -4,-16,-19, -5,-15, 6, -8, 2, -2,-17, 1, 20, -5, 2,-10,-25, -9, -4; /M: SY='G'; M= -7, -8,-30, -8,-10,-27, 33,-13,-36, 4,-27,-16, 0,-18, -8, 11, -4,-16,-26,-20,-22,-10; /M: SY='L'; M= -8,-26,-20,-27,-20, 2,-29,-21, 19,-18, 28, 17,-25,-26,-18,-15,-22, -8, 17,-22, -3,-19; /M: SY='C'; M= 28,-14, 38,-24,-17,-20,-11,-24,-17,-17,-14,-14,-14,-21,-17,-24, 3, -4, -4,-31,-24,-17; /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23, 7,-33,-23, 28,-30, 42, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 15,-20, 0,-23; /M: SY='I'; M= -9,-30,-27,-39,-30, 0,-39,-30, 47,-29, 19, 19,-21,-21,-21,-29,-19, -9, 33,-21, -1,-30; /M: SY='I'; M=-11,-28,-26,-37,-27, 8,-34,-22, 37,-26, 22, 26,-21,-22,-18,-24,-21,-10, 22,-17, 3,-25; /M: SY='N'; M= -4, 13, 18, 2, -8,-20, -8, -6,-23,-10,-27,-20, 25,-22, -8,-10, 13, 3,-19,-43,-23, -8; /M: SY='N'; M=-11, 36,-21, 18, 0,-20, -2, 18,-21, -1,-29,-18, 55,-20, 1, 0, 8, -2,-30,-39,-16, 0; /M: SY='E'; M= -7, -4, 0, -5, 9,-21,-23,-15,-19, 6,-17,-12, -7,-15, -2, -2, -2, 2, -9,-31,-16, 3; /M: SY='H'; M=-11, 13,-24, 10, 11,-23,-11, 25,-26, 3,-25,-14, 20,-14, 7, 6, 5, -5,-25,-33, -9, 7; /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-37,-28, 72,-30,-14, 0,-27, 8, 0,-20,-30,-35,-18,-20,-10, -2, 13, 38,-28; /M: SY='D'; M=-12, 8,-23, 12, 6,-15,-20, 5,-17, -7,-14,-11, 0,-15, -1, -8, -2, -2,-11,-28, -6, 2; /I: I=-5; MI=0; IM=0; DM=-20; MD=-20; /M: SY='H'; M= -9, 1,-27, 2, 1,-26, 5, 28,-29, -8,-23,-10, 5,-15, 6, -6, 1, -8,-26,-28, -7, 2; /M: SY='L'; M=-10,-26,-21,-31,-21, 6,-27,-13, 22,-23, 37, 35,-26,-26,-13,-17,-26,-10, 11,-20, 0,-17; /M: SY='P'; M= -6, -7,-31, -1, 7,-27,-12,-15,-23, -8,-27,-20, -8, 44, -5,-15, 2, -1,-25,-31,-25, -2; /M: SY='E'; M= -4,-10,-23, -9, 6, -8,-20,-13,-13, -4,-13,-11, -9, 1, -6, -4, -1, 1, -9,-23,-12, -1; /M: SY='R'; M=-18,-13,-28,-13, -3,-15,-22, -3,-22, 20, -9, -5, -5,-22, 5, 56,-13,-10,-15,-20, -8, -3; /M: SY='N'; M= -7, 10,-19, 2, -3,-18, -9, -2,-18, 3,-23,-14, 22,-18, -1, 13, 11, 5,-14,-33,-16, -3; /M: SY='G'; M= -2, -8,-27,-10,-17,-26, 47,-18,-34,-14,-26,-17, 0,-18,-16,-10, 2, -8,-24,-22,-25,-17; /M: SY='T'; M= 11, -7,-17,-13,-10,-18, -4,-20,-15,-11,-16,-13, -6, 5,-11,-15, 10, 19, -9,-26,-18,-11; /M: SY='D'; M=-17, 22,-16, 31, 13,-32,-16, 17,-34, 2,-26,-18, 10,-14, 4, -4, -4,-12,-27,-35,-11, 8; /M: SY='V'; M= 6,-20, 7,-24,-21, -5,-23,-23, 2,-11, -4, -2,-20,-25,-21,-15, -7, -4, 16,-25, -9,-21; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='A'; M= 12,-13,-21,-18,-10,-15,-16, -4, -4, -4, -4, -1, -9,-16, -6, -5, -5, -7, -2,-21, -8,-10; /M: SY='D'; M= -1, 8,-21, 10, 10,-26,-15, -7,-20, 0,-18,-13, 2,-11, 8, -1, 6, 5,-14,-29,-15, 8; /M: SY='N'; M= 1, 10,-19, 1, -2,-20, 3, -9,-21, -4,-21,-16, 17,-14, -5, -7, 9, 10,-18,-30,-18, -3; /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20, 7,-27,-15, 20,-25, 42, 30,-27,-27,-15,-17,-27,-10, 10,-20, 0,-17; /M: SY='T'; M= 1,-10,-18,-16,-10, -5,-19,-17,-10, 3,-10, -6, -8,-16, -9, 4, 0, 9, 0,-21, -7,-10; /M: SY='E'; M=-12, 9,-25, 10, 11,-21,-17, -4,-20, 7,-14, -9, 6,-13, 3, 8, -3, -1,-18,-29,-13, 7; /M: SY='L'; M= 0,-20, -3,-24,-17, -4,-24,-20, 3,-19, 16, 4,-18,-24,-15,-12,-12, 0, 3,-25, -9,-17; /M: SY='F'; M=-16,-30,-20,-36,-26, 51,-30,-20, 8,-30, 27, 8,-24,-30,-32,-20,-24,-10, 4, -2, 18,-26; /M: SY='Q'; M=-11, -4,-27, -4, 12,-27,-18, 1,-21, 17,-19, -2, -1,-13, 25, 25, -2, -7,-20,-23,-11, 17; /M: SY='B'; M= -3, 5, -6, 5, -4,-22, -5,-12,-22, -3,-17,-14, 4,-18, -7, -8, 0, -6,-16,-32,-18, -6; /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20, 7,-27,-14, 20,-24, 42, 31,-27,-27,-14,-17,-27,-10, 10,-20, 0,-17; /M: SY='G'; M= -4, 2,-28, 0,-11,-29, 42,-13,-35, -6,-30,-19, 11,-18,-12, -9, 0,-15,-29,-24,-25,-11; /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22, 40,-30, 12, 0,-14, 2, 0,-20,-30,-16,-12,-20,-10, -8, 26, 70,-22; /M: SY='E'; M= -7, 14,-22, 15, 16,-25,-15, -7,-25, 7,-23,-18, 9, -8, 4, -1, 9, 9,-18,-32,-16, 10; /M: SY='V'; M= 0,-25,-10,-27,-27, -2,-28,-28, 24,-18, 7, 7,-25,-27,-27,-18, -5, 8, 42,-30,-10,-27; /M: SY='V'; M=-11, -9,-25, -8, -9,-15,-25, -2, -1, 1, -8, -1, -8,-20, -7, 3,-11, -9, 5,-26, -6,-10; /M: SY='C'; M= -4,-10, 15,-15,-20,-11,-23,-21, 1,-17, -7, -6, -8,-27,-21,-17, -2, 5, 15,-36,-16,-21; /M: SY='K'; M=-12,-13,-26,-13, -1, -2,-25, -9,-10, 9, 1, 0,-13,-19, -4, 3,-17,-10, -9,-13, 6, -3; /M: SY='N'; M= -2, 18,-15, 12, 8,-23,-10, 1,-24, 3,-24,-17, 20,-15, 1, -3, 2, -5,-22,-31,-15, 4; /M: SY='D'; M=-16, 46,-26, 51, 13,-33, -6, 4,-33, 0,-30,-26, 35,-14, 0, -6, 4, -6,-30,-40,-20, 6; /M: SY='L'; M=-10,-25, -6,-27,-17, 0,-29,-18, 11,-25, 31, 13,-24,-28,-11,-18,-23,-10, 4,-23, -5,-14; /M: SY='T'; M= 1, 0,-12, -7, -6,-14,-16,-17,-14, -4,-15,-12, 2,-10, -6, -6, 21, 39, -4,-31,-12, -6; /M: SY='A'; M= 18,-14, -2,-20,-14,-16, -3,-18,-14,-11, -5, -8,-12,-19,-12, -9, -3, -6, -6,-23,-18,-14; /M: SY='E'; M= -6, 4,-26, 9, 17,-25,-16, -3,-23, 6,-15,-12, 0,-12, 11, 10, -1, -7,-20,-27,-15, 13; /M: SY='E'; M=-11, 13,-30, 23, 38,-32, -8, -4,-33, 9,-24,-21, 3, -5, 11, -1, -1,-11,-29,-29,-20, 24; /M: SY='M'; M=-10,-22,-21,-31,-21, 1,-24, -6, 24,-15, 23, 51,-21,-21, -5,-14,-21,-10, 13,-20, 0,-14; /M: SY='Q'; M= -9,-12,-23,-12, 1,-15,-23, -8, -5, -2, 2, 3,-11,-18, 9, 5, -8, -2, -4,-23, -8, 4; /I: I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32; /M: SY='E'; M= -9, 1,-23, 5, 12,-11,-19, -3,-15, -1, -8, -9, -4,-13, 1, -5, -3, -2,-14,-18, 2, 6; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='L'; M= -7,-13,-22,-15, -2, 2,-24,-15, -6, -3, 3, -1,-13,-18, -9, -5,-11, -2, -4,-18, -3, -5; /M: SY='L'; M=-10,-29,-23,-34,-24, 5,-32,-21, 32,-27, 33, 25,-25,-25,-18,-22,-24,-10, 19,-20, 0,-23; /M: SY='R'; M=-16, -2,-30, 0, 9,-26,-20, 9,-29, 25,-22, -9, 2,-15, 17, 40, -8,-11,-23,-22, -8, 10; /M: SY='B'; M= 1, 10,-21, 10, 9,-23,-12, -8,-17, 2,-18,-14, 8,-13, -2, -5, 2, -4,-10,-31,-17, 3; /M: SY='F'; M= -5,-25,-18,-32,-25, 41,-25,-15, 4,-22, 5, 0,-20,-27,-29,-18,-13, -7, 7, 1, 23,-25; /M: SY='A'; M= 27, -5,-13,-10, -2,-23, -3,-12,-15, -7,-18,-12, -2,-10, 5,-12, 19, 5, -8,-27,-18, 1; /M: SY='K'; M= -1, 0,-24, -2, 11,-26,-17, -2,-23, 20,-21, -9, -1,-10, 12, 10, -1, -1,-17,-23,-10, 11; /M: SY='E'; M=-11,-10,-12, -9, 4,-12,-23, -5,-10, -6, 2, -3, -9,-20, -4, 2,-12, -9, -8,-28,-10, -1; /M: SY='P'; M=-11, 1,-32, 10, 7,-27,-19,-13,-15, -8,-21,-16, -5, 28, -5,-16, -3, -7,-19,-32,-21, -1; /M: SY='H'; M= -3, 0,-25, 0, 10,-24, -2, 27,-27, -7,-20,-11, 3,-12, 3, -7, 1, -8,-23,-28, -7, 5; /M: SY='H'; M= -5, 5,-22, 1, -2,-19,-11, 46,-23, -8,-22, -9, 16,-17, 3, -4, 6, -3,-22,-33, 0, -2; /M: SY='K'; M= -9, 5,-29, 5, 0,-29, 8, -8,-33, 18,-29,-16, 9,-15, 0, 14, -4,-12,-25,-24,-18, -1; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; /M: SY='S'; M= 8, -3,-10, -6, -3,-13, -5, -9,-13, -2,-15,-10, 2, -9, -1, 2, 15, 11, -6,-22,-12, -3; D=-6; /I: DM=-29; /M: SY='D'; M= -5, 24,-22, 34, 6,-29,-11, -8,-23, -6,-21,-20, 7,-13, -6,-13, 5, -3,-11,-36,-18, 0; /M: SY='S'; M= 1, -7, 14, -9, -9,-12,-11, -9,-19,-14,-23,-17, -1,-19, -8,-14, 20, 9,-10,-31, -6, -9; /M: SY='F'; M= 6,-16, 3,-26,-19, 17,-19,-21, -9,-19, -4, -8,-12,-21,-23,-19, 0, 8, -1,-16, -2,-19; /M: SY='V'; M= -1,-28,-17,-33,-28, 18,-29,-26, 22,-23, 10, 7,-23,-26,-28,-22,-12, -5, 27,-17, 1,-28; /M: SY='C'; M=-10,-27, 29,-32,-26, 10,-30,-25, 1,-29, 15, 2,-25,-33,-28,-23,-19, -9, 7,-27, -7,-26; /M: SY='V'; M= 3,-26,-14,-28,-26, 2,-27,-21, 21,-18, 6, 6,-25,-27,-24,-19,-10, -2, 33,-19, 4,-26; /M: SY='F'; M=-14,-30,-22,-36,-26, 36,-32,-22, 18,-30, 28, 12,-24,-28,-28,-22,-24,-10, 10, -8, 12,-26; /M: SY='L'; M= -8,-27,-18,-30,-22, 6,-27,-17, 22,-23, 36, 29,-27,-27,-17,-17,-24, -8, 16,-22, -2,-19; /M: SY='S'; M= 8, -2,-13, -2, -3,-22, 11,-12,-23,-12,-30,-20, 8,-12, -3,-12, 34, 14,-13,-37,-22, -3; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='E'; M=-11, -8,-25, -6, 8, -2,-27,-14, 0,-11, -1, -4,-11,-15, -8,-14,-10, -9, -1,-22, -6, 0; /M: SY='E'; M=-10, 2,-29, 8, 37,-26,-13, -3,-25, 4,-14,-14, -3, -7, 15, 2, -4,-11,-25,-27,-17, 26; /M: SY='N'; M= -6, 8,-24, 4, 5,-22, 9, -7,-20, -6,-21,-15, 15,-17, -5, -8, 2, -8,-17,-31,-21, 0; /M: SY='G'; M= -2, -8,-21,-13,-18,-15, 9, -7, -8,-16,-11, -5, -1,-23,-16,-15, -4, -9, -2,-27,-15,-18; /M: SY='I'; M= -8,-27,-30,-35,-28, -5,-22,-28, 36,-28, 12, 14,-17,-20,-20,-28,-17,-12, 20,-20, -5,-28; /M: SY='Y'; M=-15,-19, 9,-24,-19, 9,-30, -6, -5,-17, -5, -3,-17,-28, -9,-16,-14,-10, -7, -7, 22,-16; /M: SY='G'; M= 3,-12, -4,-14,-21,-27, 48,-22,-36,-21,-27,-19, -4,-22,-21,-22, -1,-17,-24,-25,-29,-21; /M: SY='Y'; M= -7,-14,-19,-17,-15, -1,-26,-11, 1, -2, -5, -1,-13,-20,-12, -6, -4, 9, 7,-13, 13,-15; /M: SY='D'; M=-11, 22,-24, 28, 5,-24,-14, -7,-20, -4,-12,-15, 8,-15, -5, -9, -3, -3,-15,-33,-15, 0; /M: SY='G'; M= -4, -5,-27, -4,-11,-17, 15, 6,-23,-16,-11, -9, -3,-20,-11,-15, -7,-15,-19,-20, -5,-12; /I: MD=-18; /M: SY='K'; M= -3, -3,-18, -2, -3,-18, 1,-11,-15, 6,-17, -9, 0,-11, -3, 0, 2, -4, -8,-20,-12, -4; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='I'; M= -7,-19,-22,-18,-14, -9,-23, -2, 7,-17, 1, 3,-15, 0,-12,-16,-10, -7, 5,-25, -6,-15; D=-4; /I: DM=-18; /M: SY='L'; M= -7,-22,-21,-25,-16, -4,-29,-19, 18,-20, 20, 12,-20,-23, -8,-16,-15, -2, 12,-23, -4,-13; /M: SY='P'; M=-10, 2,-30, 7, 11,-28,-17, -6,-20, 1,-19,-13, -2, 16, 9, -5, -4, -8,-24,-29,-18, 9; /M: SY='I'; M= -9,-23,-23,-25,-17, -1,-30,-15, 18,-19, 18, 12,-20,-24, -7,-16,-16, -5, 11,-17, 5,-13; /M: SY='H'; M=-15, 12,-29, 14, 11,-31,-17, 28,-29, 12,-25, -9, 11,-13, 18, 8, -5,-12,-27,-28, -4, 13; /M: SY='E'; M= -1, 7,-20, 9, 15,-23,-14,-10,-23, 4,-21,-16, 3, -8, 3, -3, 11, 12,-15,-31,-16, 9; /M: SY='I'; M= -9,-28,-23,-34,-25, 3,-33,-22, 34,-26, 28, 25,-24,-24,-18,-23,-22, -9, 23,-21, -1,-24; /M: SY='F'; M= -8,-14,-16,-21,-17, 27,-22,-14, -7,-18, -4, -7, -8,-20,-20,-14, 3, 15, -3, -9, 14,-17; /M: SY='Q'; M= -2, 4,-23, 2, 1,-25, -4, -1,-17, -1,-17, -2, 6,-14, 12, -1, 2, -6,-18,-26,-15, 6; /M: SY='L'; M=-14,-12,-24,-12,-13, 3,-25, 1, 5,-19, 16, 13,-14,-23,-12,-15,-19,-11, -1,-19, 6,-13; /M: SY='F'; M=-17,-31,-25,-37,-27, 49,-28,-20, 2,-27, 13, 6,-25,-29,-30,-19,-25,-13, -2, 24, 22,-25; /M: SY='N'; M=-14, 14,-25, 9, 0,-19,-13, 0,-20, 7,-15,-11, 20,-19, 0, 16, -4, -6,-20,-30,-13, -1; /M: SY='G'; M= 2, 0,-21, -8,-13,-17, 16,-13,-18,-14,-12,-11, 8,-19,-13,-14, 2, -1,-16,-26,-19,-13; /M: SY='D'; M= 3, 11,-21, 16, 3,-25, -9, -9,-23, 0,-17,-16, 3,-13, -2, -2, 5, -3,-14,-30,-17, 0; /M: SY='N'; M=-13, 8,-26, -2, -5,-14,-16, -1,-10, 8,-18, -8, 20,-19, -1, 11, -4, -6,-15,-24, -4, -5; /M: SY='C'; M= -5,-20, 82,-30,-28, -4,-26,-27,-23,-28,-14,-16,-19,-35,-29,-27, -9, -9, -7,-37,-19,-28; /M: SY='P'; M=-14,-14,-33,-10, -1,-22,-21, -2,-21, 7,-18,-10,-10, 24, -1, 14,-12,-11,-22,-25,-14, -5; /M: SY='S'; M= 1, -1,-16, -2, -1,-19, -8, 8,-22, -5,-25,-14, 8,-13, 2, 1, 24, 14,-13,-35,-11, -1; /M: SY='L'; M=-10,-25,-22,-25,-15, 4,-28,-18, 12,-17, 37, 15,-25,-27,-15,-12,-27,-10, 5,-20, -2,-15; /M: SY='T'; M= 0, -9,-20,-13, -5,-16,-21,-15, -6, 4, -6, -2, -8,-15, 0, -2, -2, 7, -2,-23,-10, -3; /M: SY='D'; M=-10, 18,-29, 21, 7,-30, 8, -5,-31, -5,-29,-23, 17, 2, -4,-10, 1,-10,-30,-33,-24, 1; /M: SY='K'; M=-12, 8,-30, 11, 12,-32,-18, -8,-32, 42,-30,-13, 3,-10, 8, 24, -8,-10,-22,-23,-12, 10; /M: SY='P'; M=-10,-22,-37,-13, -3,-24,-22,-20,-14,-13,-17,-14,-22, 71,-12,-20,-13,-10,-24,-28,-25,-12; /M: SY='K'; M=-10, 6,-28, 3, 8,-28,-17, -7,-28, 42,-30,-12, 10,-12, 8, 25, -7, -8,-22,-23,-12, 8; /M: SY='L'; M= -7,-29,-19,-31,-24, 5,-30,-22, 27,-25, 32, 23,-27,-27,-20,-20,-22, -7, 23,-23, -3,-23; /M: SY='F'; M=-14,-30,-21,-37,-28, 39,-33,-24, 19,-29, 19, 9,-23,-27,-31,-23,-20, -9, 15, -7, 13,-28; /M: SY='F'; M=-14,-30,-25,-38,-28, 30,-35,-25, 27,-30, 21, 13,-22,-25,-27,-25,-22,-10, 16, -9, 11,-28; /M: SY='I'; M= -8,-30,-24,-36,-28, 2,-36,-28, 41,-28, 23, 18,-24,-24,-22,-26,-19, -8, 31,-22, -2,-28; /M: SY='Q'; M=-12, 8,-30, 11, 20,-40,-18, 8,-23, 8,-22, -5, 3,-10, 50, 7, 0,-10,-30,-23,-12, 35; /M: SY='A'; M= 42,-13,-10,-22,-13,-17, -5,-22, -4,-12, -7, -7,-13,-13,-13,-20, 7, 0, 8,-22,-18,-13; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='G'; M= -2, -8,-30, -8,-15,-30, 56,-18,-38, -9,-30,-18, 0,-18,-15,-12, -2,-18,-28,-20,-27,-15; /M: SY='E'; M= -7, 9,-21, 8, 10, -8,-14, -9,-20, -6,-15,-15, 5,-12, -5, -9, 3, 6,-16,-25,-10, 3; /M: SY='E'; M= -7, 1,-25, 2, 19,-23,-19, -5,-18, 11,-17,-11, 0,-12, 10, 9, -2, -6,-13,-27,-15, 14; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 73 in 73 different sequences |
| Number of true positive hits | 73 in 73 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes, Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | K_Hofmann |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
73 sequences
CAS1A_XENLA (P55865), CAS1B_XENLA (P55867), CASP1_CANLF (Q9MZV7), CASP1_DROME (O02002), CASP1_FELCA (Q9MZV6), CASP1_HORSE (Q9TV13), CASP1_HUMAN (P29466), CASP1_MOUSE (P29452), CASP1_PIG (Q9N2I1), CASP1_RAT (P43527), CASP1_SPOFR (P89116), CASP2_CHICK (Q98943), CASP2_HUMAN (P42575), CASP2_MOUSE (P29594), CASP2_RAT (P55215), CASP3_BOVIN (Q08DY9), CASP3_CANLF (Q8MKI5), CASP3_FELCA (Q8MJU1), CASP3_HUMAN (P42574), CASP3_MACFA (Q2PFV2), CASP3_MESAU (Q60431), CASP3_MOUSE (P70677), CASP3_PANTR (Q5IS54), CASP3_PIG (Q95ND5), CASP3_RABIT (Q8MJC3), CASP3_RAT (P55213), CASP3_SAIBB (Q5IS99), CASP3_XENLA (P55866), CASP4_BOVIN (Q5E9C1), CASP4_HUMAN (P49662), CASP4_MOUSE (P70343), CASP5_HUMAN (P51878), CASP6_BOVIN (Q3T0P5), CASP6_CHICK (A0A1D5PPP7), CASP6_HUMAN (P55212), CASP6_MOUSE (O08738), CASP6_RAT (O35397), CASP7_CHICK (F1NV61), CASP7_HUMAN (P55210), CASP7_MESAU (P55214), CASP7_MOUSE (P97864), CASP8_DROME (Q8IRY7), CASP8_DROPS (Q29IM7), CASP8_HUMAN (Q14790), CASP8_MOUSE (O89110), CASP8_RAT (Q9JHX4), CASP9_HUMAN (P55211), CASP9_MOUSE (Q8C3Q9), CASPA_DANRE (Q9I9L7), CASPA_HUMAN (Q92851), CASPB_DANRE (Q504J1), CASPC_CANLF (Q075B4), CASPC_HUMAN (Q6UXS9), CASPC_MACMU (Q153Z0), CASPC_MOUSE (O08736), CASPC_RAT (Q920D5), CASPD_BOVIN (O75601), CASPE_HUMAN (P31944), CASPE_MOUSE (O89094), CASP_SFAVA (Q5K5C1), CED3_CAEEL (P42573), CED3_CAERE (P45436), CFLAR_HUMAN (O15519), CFLAR_MOUSE (O35732), CFLAR_PONAB (Q5RD56), CSP1_CAEEL (G5EBM1), CSP2_CAEEL (Q9TZP5), CSPL_HVAVE (A4KXL9), CSPL_TNAVC (Q06VK9), DRICE_DROME (O01382), DRONC_DROME (Q9XYF4), MALT1_HUMAN (Q9UDY8), MALT1_MOUSE (Q2TBA3)» more
|
| PDB [Detailed view] |
290 PDB
1BMQ; 1CP3; 1F1J; 1F9E; 1GFW; 1GQF; 1I3O; 1I4E; 1I4O; 1I51; 1IBC; 1ICE; 1JXQ; 1K86; 1K88; 1KMC; 1M72; 1NME; 1NMQ; 1NMS; 1NW9; 1PAU; 1PYO; 1QDU; 1QTN; 1QX3; 1RE1; 1RHJ; 1RHK; 1RHM; 1RHQ; 1RHR; 1RHU; 1RWK; 1RWM; 1RWN; 1RWO; 1RWP; 1RWV; 1RWW; 1RWX; 1SC1; 1SC3; 1SC4; 1SHJ; 1SHL; 2AR9; 2C1E; 2C2K; 2C2M; 2C2O; 2C2Z; 2CDR; 2CJX; 2CJY; 2CNK; 2CNL; 2CNN; 2CNO; 2DKO; 2FP3; 2FQQ; 2FUN; 2H48; 2H4W; 2H4Y; 2H51; 2H54; 2H5I; 2H5J; 2H65; 2HBQ; 2HBR; 2HBY; 2HBZ; 2J30; 2J31; 2J32; 2J33; 2K7Z; 2NN3; 2P2C; 2QL5; 2QL7; 2QL9; 2QLB; 2QLF; 2QLJ; 2WDP; 2XYG; 2XYH; 2XYP; 2XZD; 2XZT; 2Y0B; 2Y1L; 3D6F; 3D6H; 3D6M; 3DEH; 3DEI; 3DEJ; 3DEK; 3E4C; 3EDQ; 3EDR; 3GJQ; 3GJR; 3GJS; 3GJT; 3H0E; 3H11; 3H13; 3H1P; 3IBC; 3IBF; 3ITN; 3J9K; 3K7E; 3KJF; 3KJN; 3KJQ; 3NKF; 3NR2; 3NS7; 3OD5; 3P45; 3P4U; 3PCX; 3PD0; 3PD1; 3QNW; 3R5J; 3R5K; 3R6G; 3R6L; 3R7B; 3R7N; 3R7S; 3RJM; 3S70; 3S8E; 3SIP; 3SIR; 3UO8; 3UOA; 3V3K; 3V4L; 3V4O; 3V55; 3V6L; 3V6M; 4DCJ; 4DCO; 4DCP; 4EHA; 4EHD; 4EHF; 4EHH; 4EHK; 4EHL; 4EHN; 4EJF; 4FDL; 4FEA; 4FXO; 4HQ0; 4HQR; 4HVA; 4I1P; 4I1R; 4IYR; 4JB8; 4JJ7; 4JJ8; 4JJE; 4JQY; 4JQZ; 4JR0; 4JR1; 4JR2; 4LSZ; 4M9R; 4N5D; 4N6G; 4N7J; 4N7M; 4NBK; 4NBL; 4NBN; 4PRY; 4PRZ; 4PS0; 4PS1; 4QTX; 4QTY; 4QU0; 4QU5; 4QU8; 4QU9; 4QUA; 4QUB; 4QUD; 4QUE; 4QUG; 4QUH; 4QUI; 4QUJ; 4QUL; 4ZVO; 4ZVP; 4ZVQ; 4ZVR; 4ZVS; 4ZVT; 4ZVU; 5I9B; 5I9T; 5IAB; 5IAE; 5IAG; 5IAJ; 5IAK; 5IAN; 5IAR; 5IAS; 5IBC; 5IBP; 5IBR; 5IC4; 5IC6; 5K20; 5MMV; 5MTK; 5V6U; 5V6Z; 6BZ9; 6DEU; 6DEV; 6F6R; 6F7I; 6H4A; 6KMT; 6KMU; 6KMV; 6KMZ; 6KN0; 6KN1; 6NRY; 6NS7; 6PX9; 6PZP; 6VIE; 6YN8; 6YN9; 7A41; 7AK0; 7AK1; 7PAV; 7PAW; 7WR0; 7WR1; 7WR4; 7WR5; 7WR6; 7WZS; 7XN4; 7XN5; 7XN6; 8DGZ; 8DJ3; 8EG5; 8EG6; 8F78; 8F96; 8F97; 8F98; 8F99; 8F9A; 8F9B; 8F9C; 8F9D; 8FBV; 8J6K; 8JOL; 8SPB; 8SV1; 8V4X; 8WRA; 8YBX » more |