PROSITE entry PS50213
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | FAS1 |
| Accession [info] | PS50213 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-APR-2003 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50213 |
| Associated ProRule [info] | PRU00082 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | FAS1/BIgH3 domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=130; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=125; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1190171; R2=0.0229535; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=265; N_SCORE=8.2000; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=191; N_SCORE=6.5000; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: M= -5, -8,-22, -8, -5,-13,-13, -7,-13, -7,-13, -8, -5, 0, -6, -8, -2, -3,-13,-22, -6, -7; /M: SY='S'; M= -2, -1,-23, -3, -1,-21, -6,-10,-16, -3,-17,-10, 1, -7, -1, -6, 2, -1,-13,-27,-15, -2; /M: SY='N'; M= -7, 15,-21, 10, 1,-20, -9, -1,-20, -1,-22,-15, 19,-11, -1, -1, 9, 5,-18,-33,-15, -1; /M: SY='I'; M= -3,-22,-18,-27,-22, 0,-27,-22, 21,-22, 16, 10,-18,-23,-19,-20,-13, -4, 19,-24, -6,-22; /M: SY='L'; M= -7,-15,-21,-17,-10, -1,-23,-15, 4,-15, 7, 4,-15,-20,-12,-15,-11, -1, 4,-16, -3,-11; /M: SY='E'; M= -7, 6,-24, 8, 11,-22,-14, -5,-18, 1,-14,-10, 2,-11, 6, -3, 0, -2,-16,-27,-13, 8; /M: SY='V'; M= -1,-15,-20,-18,-11, -4,-23,-19, 6,-11, 4, 2,-13,-18,-12,-11, -7, 0, 7,-22, -6,-12; /M: SY='L'; M= -4,-25,-20,-28,-19, 5,-27,-20, 18,-24, 30, 15,-23,-24,-17,-19,-20, -7, 11,-20, -2,-18; /M: SY='A'; M= 4, -5,-21, -5, 4,-18,-11, -9,-13, -1,-11, -8, -4,-13, 1, -3, 1, -4, -9,-24,-12, 2; /M: SY='E'; M= 0, 3,-22, 4, 9,-22,-10, -8,-19, 0,-17,-13, 3, -9, 3, -3, 5, -1,-15,-29,-16, 5; /M: SY='N'; M= -6, 9,-20, 7, 1,-17,-10, -2,-17, -3,-16,-11, 10,-16, -2, -5, 1, -3,-15,-28,-10, -1; /M: SY='P'; M= -4, -3,-26, -3, -2,-21, -5,-10,-17, -5,-19,-12, 0, 2, -4, -7, 1, -5,-16,-28,-17, -4; /M: SY='D'; M= -7, 7,-25, 9, 8,-26, -3, 0,-26, 1,-23,-15, 7, -8, 3, 1, 1, -7,-23,-28,-15, 4; /M: SY='F'; M= -8,-24, -9,-30,-23, 31,-26,-17, 3,-24, 12, 3,-19,-27,-26,-19,-15, -4, 3, -8, 13,-23; /M: SY='S'; M= 2, 0,-14, -3, -2,-18, -7, -9,-17, -6,-20,-13, 5,-12, -1, -6, 19, 14,-11,-32,-15, -2; /M: SY='T'; M= -3, -7,-20,-13, -9,-11,-16,-15, -3, -8, -7, -1, -5,-14, -5, -9, 1, 8, -2,-24, -9, -7; /M: SY='F'; M=-11,-25,-20,-32,-23, 37,-26,-18, 7,-25, 15, 7,-19,-26,-25,-18,-16, -6, 4, -6, 13,-22; /M: SY='R'; M= -4,-13,-21,-16,-10, -6,-19, -8, -5, -4, -3, -1, -8,-20, -6, 5, -4, -2, -2,-19, -1,-10; /M: SY='E'; M= -7, 6,-24, 8, 9,-23,-11, -2,-23, 4,-19,-12, 4,-13, 6, 5, 2, -2,-19,-27,-12, 7; /M: SY='L'; M= -1,-21,-22,-25,-17, 2,-23,-15, 8,-17, 15, 8,-20,-23,-13,-13,-16, -8, 4, -8, 3,-15; /I: I=-4; MD=-21; /M: SY='L'; M= -5,-25,-19,-27,-21, 6,-26,-20, 19,-23, 24, 14,-23,-25,-18,-18,-18, -7, 16,-19, -1,-20; D=-4; /I: I=-4; MD=-21; /M: SY='E'; M= -6, 3,-22, 1, 9,-21,-16, -5,-15, 7,-15, -8, 4,-11, 8, 6, 1, -1,-14,-25,-12, 8; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='S'; M= 1, -1,-20, -3, 0,-17, -7, -5,-18, 0,-18,-10, 1,-13, 3, -2, 5, 0,-13,-23,-11, 2; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='A'; M= 10, -4,-14, -9, -7,-15, -9,-12,-10, -9,-10, -8, -2,-12, -6,-11, 7, 7, -5,-25,-12, -7; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='G'; M= -8, 7,-26, 8, 2,-23, 10, -5,-27, -4,-21,-14, 8,-15, -2, -6, -1,-10,-23,-26,-17, 0; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='L'; M= -8,-25,-19,-27,-18, 9,-28,-16, 14,-23, 27, 12,-23,-25,-18,-18,-21, -7, 9,-18, 3,-18; /M: SY='A'; M= 3,-11,-19,-15,-11, -7,-16,-16, -2,-11, -2, -4, -9,-16,-11,-10, -3, 0, 1,-21, -8,-11; /M: SY='D'; M= -3, 7,-24, 10, 7,-26,-11, -4,-21, 0,-20,-14, 5, -4, 5, -4, 4, -2,-19,-30,-16, 6; /M: SY='T'; M= -3, -9,-21,-12, -5,-11,-21, -8, -2,-10, -3, 1, -9,-14, -1,-11, -4, 2, -2,-20, -4, -4; /M: SY='L'; M= -9,-25,-22,-29,-21, 10,-30,-20, 20,-25, 28, 13,-22,-24,-19,-20,-21, -8, 12,-17, 2,-21; /M: SY='N'; M= -6, 13,-23, 10, 6,-23, -6, -2,-23, 0,-23,-16, 16,-12, 4, -1, 7, 1,-22,-29,-15, 5; /M: SY='D'; M= -2, 8,-24, 10, 5,-27, 3, -7,-25, -1,-23,-16, 8,-11, 1, -4, 4, -6,-20,-29,-19, 2; /I: I=-4; MD=-19; /M: SY='S'; M= 0, 0,-20, -1, -1,-15, -9, -8,-15, -7,-13,-11, 1, -7, -4, -8, 3, 1,-13,-24,-11, -3; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='G'; M= -5, 0,-25, 0, 1,-24, 9, -8,-26, 2,-22,-13, 3,-14, 2, 1, 1, -6,-21,-23,-16, 1; D=-4; /I: I=-4; DM=-19; /M: SY='P'; M= -4, -2,-25, -2, -1,-22, -5, -8,-19, -5,-22,-14, 2, 7, -3, -6, 3, -3,-18,-28,-18, -4; D=-4; /I: I=-4; DM=-19; /M: SY='Y'; M=-12,-24,-21,-27,-22, 18,-28, -8, 11,-19, 11, 7,-21,-27,-19,-16,-18, -8, 8, -4, 22,-21; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20, -9,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 48, 0,-30,-10,-10; /M: SY='I'; M= -7,-29,-20,-34,-27, 10,-32,-25, 29,-26, 22, 15,-25,-26,-24,-22,-19, -7, 26,-19, 0,-26; /M: SY='F'; M=-16,-29,-15,-36,-26, 50,-30,-20, 6,-29, 21, 6,-23,-30,-32,-20,-22, -9, 4, -3, 17,-26; /M: SY='V'; M= 18,-21,-11,-26,-21, -7,-17,-24, 11,-17, 3, 3,-21,-21,-20,-20, -4, -2, 21,-21,-12,-20; /M: SY='P'; M=-10,-20,-38,-11, -1,-28,-21,-20,-17,-11,-26,-18,-20, 81,-10,-20,-11,-10,-26,-30,-28,-10; /M: SY='T'; M= -1, 1,-14, -5, -5,-15,-14,-12,-13, -6,-16,-12, 5,-11, -5, -6, 14, 21, -6,-30,-13, -6; /M: SY='B'; M=-11, 35,-23, 34, 8,-27, -7, 2,-25, -1,-26,-21, 32,-15, 0, -6, 5, -3,-24,-38,-19, 4; /M: SY='E'; M= -1, 7,-23, 9, 17,-24,-10, -6,-25, 6,-22,-17, 5, -9, 6, 3, 7, -2,-19,-29,-17, 11; /M: SY='A'; M= 34, -7,-13,-15, -9,-20, 1,-17,-12,-10,-12,-11, -6,-11, -9,-16, 10, 1, -4,-23,-19, -9; /M: SY='F'; M=-14,-26,-20,-33,-25, 41,-27,-20, 4,-25, 9, 3,-20,-27,-29,-19,-18, -9, 3, 7, 15,-24; /M: SY='E'; M= 1, 4,-23, 5, 9,-25,-11, -5,-19, 2,-20,-12, 4, -6, 7, -3, 5, -3,-17,-29,-16, 7; /M: SY='K'; M= -2, 3,-23, 2, 3,-21,-12, -8,-20, 8,-19,-12, 5,-11, 2, 4, 3, -2,-16,-27,-14, 2; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='L'; M= -7,-17,-19,-19,-14, -1,-21,-14, 5,-18, 12, 5,-15,-21,-11,-14,-12, -4, 1,-16, -1,-13; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='P'; M= -5, -4,-25, -4, -2,-18, -9,-12,-18, -3,-20,-13, -1, 7, -6, -5, 2, 0,-16,-26,-15, -5; /M: SY='P'; M= -2, -3,-25, -3, 0,-21,-10,-11,-16, -5,-17,-11, -2, 1, 0, -7, 1, -2,-15,-23,-16, -1; /I: I=-2; MD=-10; /M: SY='E'; M= -4, 4,-24, 4, 6,-24, -4, -5,-21, 0,-20,-14, 4, -6, 2, -2, 2, -4,-19,-27,-16, 3; D=-2; /I: I=-2; MD=-10; /M: SY='T'; M= -4, -4,-18, -6, -2, -9,-15, -8,-10, -4, -8, -7, -2,-10, -4, -4, 1, 5, -8,-22, -6, -4; D=-2; /I: I=-2; MD=-10; /M: SY='L'; M= -7,-11,-20,-11, -5, -7,-18,-10, -2, -5, 3, 1, -9,-12, -6, -3,-10, -5, -3,-17, -6, -6; D=-2; /I: I=-2; MD=-10; /M: SY='B'; M= 0, 3,-17, 3, 2,-16, -9, -8,-12, -4,-11, -9, 3,-10, -2, -5, 3, -1,-10,-23,-12, 0; D=-2; /I: I=-2; MD=-10; /M: SY='R'; M= -2, 0,-18, 0, 2,-13,-10, -7,-15, 3,-13, -9, -1,-11, 0, 4, 0, -2,-11,-15, -7, 0; D=-2; /I: I=-2; MD=-10; /M: SY='L'; M= -6,-11,-15,-12, -7, 1,-16, -8, 3,-11, 13, 5,-10,-16, -8, -8,-12, -5, 0,-11, -1, -8; D=-2; /I: I=-2; MD=-10; /M: M= -6, -7,-15, -9, -4, -4,-14, -7, -3, -2, 0, 0, -5, -8, -3, -1, -6, -3, -4,-14, -3, -4; D=-2; /I: I=-2; MD=-10; /M: SY='N'; M= -2, 1,-15, 0, 0,-14, -5, -3,-12, 0,-12, -7, 3, -3, 1, -1, 1, -1,-11,-17, -9, 0; D=-2; /I: I=-2; MD=-10; /M: SY='D'; M= -4, 11,-14, 13, 7,-16, -3, 0,-15, 0,-14,-11, 8, -5, 2, -3, 2, -3,-14,-19,-10, 4; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10; /M: SY='R'; M= -2, -4,-17, -4, 2,-14,-11, -6,-12, 4,-11, -7, -3, 1, 3, 5, -2, -3,-11,-13, -8, 2; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='E'; M= -1, 3,-16, 3, 4,-16, -7, -6,-13, 0,-13, -9, 2, -6, 1, -1, 3, 0,-10,-19,-10, 2; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='E'; M= 0, -1,-16, -2, 1,-16,-11, -6,-13, 0,-10, -7, -1,-11, 1, -2, -1, -4,-10,-21,-10, 1; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='L'; M= -7,-19,-19,-20,-14, 1,-21,-14, 8,-15, 18, 9,-17,-18,-12,-11,-15, -6, 4,-17, -1,-13; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='K'; M= -3, -5,-23, -6, 4,-20,-14, -8,-16, 7,-15, -7, -2,-10, 6, 7, -1, -3,-12,-24,-13, 4; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='E'; M= -3, 7,-23, 6, 9,-23,-12, -5,-22, 7,-20,-13, 8,-10, 7, 4, 3, -2,-19,-27,-14, 7; /M: SY='I'; M= -8,-23,-21,-27,-22, 8,-30,-21, 22,-24, 21, 12,-20,-25,-20,-21,-17, -6, 17,-20, 0,-22; /M: SY='L'; M= -8,-28,-18,-30,-23, 8,-30,-21, 21,-25, 30, 16,-26,-28,-20,-20,-21, -7, 17,-19, 0,-22; /M: SY='R'; M= -8, -4,-25, -5, 3,-17,-18, -5,-17, 9, -9, -5, -2,-14, 3, 13, -6, -4,-14,-24, -9, 2; /M: SY='Y'; M=-10,-10,-24,-14,-12, 7,-16, 6, -9, -9, -5, -4, -5,-23, -7, -5, -9, -6,-12, -4, 23,-11; /M: SY='H'; M=-20, -1,-30, -1, -1,-18,-20, 90,-29,-10,-19, -1, 7,-20, 8, 0,-11,-20,-29,-23, 20, -1; /M: SY='V'; M= -3,-27,-19,-32,-27, 3,-29,-26, 29,-23, 15, 15,-23,-25,-23,-22,-14, -5, 30,-23, -4,-26; /M: SY='I'; M= -4,-26,-19,-30,-25, 2,-30,-23, 26,-23, 17, 12,-22,-24,-21,-21,-14, -1, 26,-22, -2,-25; /M: SY='P'; M= -5, -7,-27, -6, -1,-20,-13,-10,-15, -5,-15,-11, -5, 13, -4, -8, -3, -5,-16,-27,-16, -4; /M: SY='G'; M= -3, 5,-21, 5, 1,-25, 9, -7,-25, -7,-22,-16, 6,-14, -3, -9, 4, -5,-20,-28,-18, -1; /M: SY='Y'; M= -7, -7,-23, -9, -4, -8,-19, -5,-10, -3, -7, -4, -5,-19, 0, 1, -5, -3, -9,-16, 2, -3; /M: SY='Y'; M= -9,-17,-23,-19,-12, 1,-25, -8, 3,-11, 5, 3,-16,-21, -9, -8,-14, -7, 2,-12, 6,-11; /M: M= -5,-10,-11,-11,-10, -8,-19,-12, -4,-15, -1, -4, -9,-17,-11,-14, -4, -1, -3,-23, -5,-11; /M: M= -3,-11,-17,-13, -6, -5,-18,-10, -6,-11, -2, -2, -9,-15, -7,-11, -2, 0, -5,-20, -4, -7; /M: SY='S'; M= 1, 1,-18, -1, 3,-19, -9, -8,-19, 0,-17,-12, 2,-12, 0, -3, 4, -1,-15,-24,-13, 1; /M: SY='D'; M= -6, 12,-23, 15, 8,-25, -9, -3,-22, -1,-20,-14, 8,-10, 4, -5, 5, 0,-18,-31,-14, 5; /M: SY='L'; M= -8,-16,-22,-17,-14, 1,-24,-17, 8,-19, 17, 6,-16,-22,-15,-16,-15, -5, 4,-19, -2,-15; /I: I=-3; MD=-17; /M: M= -6,-10,-22,-11, -6, -9,-18,-10, -5, -4, -4, -1, -8,-15, -4, -2, -5, -4, -3,-22, -6, -6; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='N'; M= -1, 1,-14, -1, -2,-15, 0, -8,-15, -7,-13,-10, 3,-13, -4, -8, 1, -4,-12,-22,-12, -3; D=-3; /I: I=-3; DM=-17; /M: SY='S'; M= -3, -6,-21, -8, -4,-17, -3, -9,-12, -5,-13, -6, -1,-10, -4, -4, 2, -1, -9,-25,-14, -5; D=-3; /I: I=-3; DM=-17; /M: SY='S'; M= -3, -6,-23, -9, -3,-20, -5,-11,-15, -1,-14, -7, -2,-10, 1, 0, 2, 1,-12,-25,-14, -2; D=-3; /I: I=-3; DM=-17; /M: SY='T'; M= -2, -8,-20,-10, -5,-15,-15,-10, -9, -4,-10, -6, -4,-13, -2, -2, 3, 5, -5,-25,-10, -4; D=-3; /I: I=-3; DM=-17; /M: SY='I'; M= -5,-22,-21,-26,-19, 6,-24,-16, 10,-19, 10, 6,-19,-21,-17,-15,-13, -5, 9,-13, 3,-19; /M: SY='E'; M= -2, -1,-22, -2, 6,-20,-15, -9,-18, 1,-16,-12, -1, -5, 2, -1, 4, 6,-14,-25,-13, 3; /M: SY='T'; M= 0, 2,-15, -3, -2,-14,-13,-12,-13, -7,-13, -9, 4,-11, -5, -7, 14, 21, -7,-30,-12, -4; /M: SY='L'; M= -7,-17,-22,-18,-12, -4,-20,-14, 5,-14, 17, 10,-16,-22,-10,-11,-16, -7, 2,-22, -5,-12; /M: SY='Q'; M= -2, -1,-23, -2, 2,-18,-10, -5,-15, -6,-12, -9, 1, -7, 4, -8, 1, -4,-16,-25,-12, 2; /M: SY='G'; M= -3, -3,-28, -3,-10,-28, 37,-12,-32, -9,-27,-17, 4,-15,-11,-11, 0,-14,-26,-24,-23,-11; /M: SY='N'; M= -3, 2,-23, 1, 0,-19, -3, -6,-18, -4,-17,-11, 5,-11, -1, -6, 3, -2,-16,-26,-13, -1; /M: SY='K'; M= -5, 0,-23, 0, 4,-20,-16, -7,-19, 5,-19,-12, 0, -4, 2, 1, 3, 3,-14,-26,-11, 3; /M: SY='L'; M= -9,-26,-23,-29,-22, 6,-29,-19, 21,-23, 22, 12,-22,-23,-19,-18,-20, -8, 15,-18, 2,-22; /M: SY='T'; M= -6, -5,-21, -7, -3,-12,-15, -9,-12, -4,-11, -8, -2,-14, -4, 1, 1, 2, -8,-22, -9, -4; /M: SY='I'; M= -8,-27,-17,-32,-25, 10,-31,-24, 23,-25, 18, 12,-24,-26,-23,-22,-18, -6, 20,-14, 2,-25; /M: SY='N'; M= -5, 1,-20, -5, -5, -9,-12, -8,-14, -2,-15,-10, 7,-16, -5, 0, 5, 7,-11,-25, -8, -6; /M: SY='V'; M= -7,-13,-14,-17,-13, -5,-21,-14, -2, -5, -5, -1, -8,-22,-11, 0, -8, -5, 4,-24, -8,-12; /I: I=-3; MD=-16; /M: SY='B'; M= -7, 4,-23, 4, 3,-16,-10, -3,-18, -1,-17,-12, 4,-13, 1, -3, 2, 0,-15,-22, -4, 1; D=-3; /I: I=-3; MD=-16; /M: SY='N'; M= -4, -1,-23, -2, 1,-22, 0, -4,-22, -2,-20,-13, 4, -8, 0, -1, 4, -2,-18,-27,-15, -1; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16; /M: SY='K'; M= -5, -2,-19, -2, 2,-14,-15, -4,-11, 3,-11, -6, -2, -9, 3, 1, -1, 0, -9,-18, -4, 2; D=-3; /I: I=-3; DM=-16; /M: SY='I'; M= -6,-23,-18,-26,-23, 1,-29,-21, 22,-21, 12, 10,-21,-19,-20,-19,-15, -5, 21,-21, -2,-23; D=-3; /I: I=-3; DM=-16; /M: SY='T'; M= -3,-11,-16,-17,-12, 4,-18,-13, -7, -9, -6, -5, -7,-19,-12, -9, -1, 6, -4,-14, 3,-12; D=-3; /I: I=-3; DM=-16; /M: SY='V'; M= -5,-27,-18,-30,-25, 6,-29,-25, 24,-22, 15, 10,-24,-25,-24,-20,-13, -3, 27,-20, -2,-25; D=-3; /I: I=-3; DM=-16; /M: SY='N'; M= -5, 13,-23, 8, 2,-22, 5, -4,-23, -4,-23,-16, 21,-14, -1, -6, 6, -3,-23,-29,-18, 0; D=-3; /I: I=-3; DM=-16; /M: M= -4, -2,-15, -4, 0,-17,-11, -8,-16, -1,-14, -8, 0,-16, -3, -3, -3, -6,-12,-25,-13, -2; /M: SY='A'; M= 14,-12,-15,-16,-10,-12,-14,-16, -4,-11, -8, -6,-10,-13, -9,-14, 4, 2, 3,-22,-12,-10; /M: SY='R'; M= -7, -8,-22, -9, -3,-17,-18, -8, -9, -1,-10, -4, -5, -7, -3, 1, -4, -3, -7,-27,-12, -5; /M: SY='I'; M= -6,-19,-19,-23,-20, -2,-29,-21, 20,-20, 9, 7,-15,-23,-18,-19,-11, -3, 20,-25, -5,-21; /M: SY='V'; M= -3,-12,-19,-15,-10, -7,-19,-16, 4,-12, -1, 0,-10,-17,-12,-13, -3, 5, 7,-25, -7,-12; /M: SY='K'; M= -6, -3,-22, -2, 1,-20,-11, -7,-18, 2,-16, -9, -2,-10, 2, 1, -2, -5,-14,-25,-12, 1; /M: SY='A'; M= 7, -7,-13,-10, -7,-17,-10,-12,-15, -8,-14,-11, -6, -6, -7,-11, 3, 1,-10,-23,-14, -7; /M: SY='D'; M=-11, 20,-24, 23, 3,-23,-10, -4,-17, -6,-16,-14, 14,-15, -5, -9, -1, -5,-15,-34,-16, -2; /M: SY='I'; M=-10,-18,-20,-23,-17, -3,-27,-12, 12,-15, 4, 6,-14,-19,-13,-13,-12, -6, 8,-20, 0,-17; /M: M= -2, -5,-22, -7, -2,-16,-17,-10, -7, -5, -9, -3, -4, -3, -4, -8, -2, -1, -7,-27,-13, -4; /M: SY='A'; M= 12, -9, -8,-14,-11,-10, -6,-17,-13,-12,-11,-10, -7,-15,-11,-14, 4, 2, -5,-23,-13,-10; /M: SY='T'; M= -4, 3,-18, 0, 0,-18,-11, -8,-18, -3,-20,-14, 6, -7, -3, -6, 8, 9,-14,-30,-14, -2; /M: SY='N'; M= -8, 17,-23, 7, -1,-21, -4, 3,-20, -1,-26,-16, 29,-10, 2, -1, 5, -3,-24,-31,-16, 0; /M: SY='G'; M= 2,-12,-26,-13,-17,-24, 40,-19,-25,-18,-20,-13, -4,-19,-16,-18, 1,-13,-17,-22,-24,-17; /M: SY='V'; M= 1,-21, -8,-25,-21, -5,-25,-23, 15,-17, 3, 4,-19,-24,-20,-17, -5, 2, 24,-27, -9,-21; /M: SY='I'; M= -3,-28,-16,-33,-27, 2,-31,-26, 30,-24, 17, 16,-25,-25,-23,-23,-15, -6, 30,-23, -5,-26; /M: SY='H'; M=-18, -6,-27, -7, -5, -7,-22, 63,-20,-11,-12, 0, 1,-22, 5, -4,-12,-16,-22,-16, 24, -4; /M: SY='V'; M= -3,-20,-20,-23,-18, -4,-14,-19, 9,-17, 3, 5,-16,-20,-14,-17, -8, -3, 11,-21, -6,-17; /M: SY='I'; M= -7,-29,-23,-35,-27, 2,-33,-27, 36,-27, 21, 17,-23,-24,-22,-25,-18, -7, 29,-22, -3,-27; /M: SY='D'; M=-13, 35,-26, 46, 16,-34, -7, 0,-33, -1,-28,-25, 19, -9, 2, -8, 6, -5,-27,-38,-19, 9; /M: SY='K'; M= -5, 0,-23, -1, 5,-21, -8, -5,-23, 8,-21,-12, 3,-14, 5, 8, 2, -3,-18,-25,-13, 4; /M: SY='V'; M= -3,-26,-17,-26,-22, -3,-28,-25, 20,-20, 10, 8,-24,-15,-22,-19,-11, -1, 27,-28,-10,-23; /M: SY='L'; M=-10,-26,-23,-28,-20, 5,-30,-19, 21,-24, 35, 18,-24,-26,-16,-17,-25,-10, 11,-20, 0,-19; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 134 in 64 different sequences |
| Number of true positive hits | 134 in 64 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 4 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 97.10 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria), Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 7 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | N_Hulo |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | FAS1 |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
64 sequences
096L_IIV6 (O55719), AURS_GIBZE (I1RF63), BGH3_BOVIN (P55906), BGH3_HUMAN (Q15582), BGH3_MOUSE (P82198), BGH3_PIG(O11780), BGH3_RABIT (Q95215), CTB11_CERBT (A0A2G5I8H1), ELCF_PHANO (Q0UHZ9), FAS1_DROME (P10674), FAS1_SCHAM (P10675), FLA10_ARATH (Q9LZX4), FLA11_ARATH (Q8LEJ6), FLA12_ARATH (Q8LEE9), FLA13_ARATH (Q9FFH6), FLA14_ARATH (Q9LTW9), FLA15_ARATH (Q9FT45), FLA16_ARATH (Q8RWC5), FLA17_ARATH (Q66GR0), FLA18_ARATH (Q93W32), FLA19_ARATH (Q5Q0H2), FLA1_ARATH (Q9FM65), FLA20_ARATH (Q9FGW0), FLA2_ARATH (Q9SU13), FLA3_ARATH (Q9ZQ23), FLA4_ARATH (Q9SNC3), FLA5_ARATH (O49586), FLA6_ARATH (Q9SIL7), FLA7_ARATH (Q9SJ81), FLA8_ARATH (O22126), FLA9_ARATH (Q9ZWA8), FLA_ARTBC (D4B388), FLA_JATCU (C0HJG5), FSC1_SCHPO (O94439), HDP_PLAF7 (Q8IL04), MP70_MYCBO (P0A669), MP70_MYCKA (Q49614), MP70_MYCTO (P9WNF4), MP70_MYCTU (P9WNF5), MP83_MYCBO (P0CAX7), MP83_MYCBT (C1AFY9), MP83_MYCTO (P9WNF2), MP83_MYCTU (P9WNF3), POSTN_HUMAN (Q15063), POSTN_MOUSE (Q62009), STAB1_HUMAN (Q9NY15), STAB1_MOUSE (Q8R4Y4), STAB2_HUMAN (Q8WWQ8), STAB2_MOUSE (Q8R4U0), STAB2_RAT (Q8CFM6), Y1483_SYNY3 (P74615), Y1735_SYNY3 (P73392), Y175_PICP2 (O33752), Y4891_SELML (P0DH64), YFAS1_ASPFU (Q4WC84), YFAS1_CANGA (Q6FJ69), YFAS1_DEBHA (Q6BHU6), YFAS1_EMENI (Q5BD53), YFAS1_EREGS (Q755Y4), YFAS1_KLULA (Q6CMY2), YFAS1_SCHPO (Q9Y801), YFAS1_YARLI (Q6C7M4), YFAS1_YEAST (Q12331), YL001_YEAST (Q07895)» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
4 sequences
081L_IIV3 (Q196X9), FLA21_ARATH (Q9FL53), YFAS1_CANAL (Q5AI48), YFAS1_NEUCR (Q6MV78)» more |
| PDB [Detailed view] |
16 PDB
1NYO; 1O70; 1X3B; 2LTB; 2LTC; 2VXP; 5N86; 5NV6; 5WT7; 5YJG; 5YJH; 7AS7; 7ASC; 7ASG; 8HGA; 8HIA » more |