PROSITE entry PS50228
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | SUEL_LECTIN |
| Accession [info] | PS50228 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-DEC-2001 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50228 |
| Associated ProRule [info] | PRU00260 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | SUEL-type lectin domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=86; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=81; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.7934000; R2=0.0074437; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=7158.5654297; R2=4.9972677; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=901; H_SCORE=11661; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=633; H_SCORE=10322; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='A'; M= 14, -9,-18,-16,-11,-15,-14,-16, -1, -3, -8, -4, -4,-16, -9, -5, -1, -3, 4,-24,-14,-11; /M: SY='C'; M=-14,-16, 33,-18,-15,-17,-25, 0,-25,-14,-20,-14,-13, -7,-13,-10,-11,-11,-18,-32,-10,-17; /M: SY='D'; M=-11, 10,-26, 18, 16,-22,-10, -8,-21, -6, -8,-14, 0,-12, -1,-10, -4, -4,-18,-30,-16, 7; /M: SY='H'; M=-14, 1,-30, 4, -3,-26, 7, 20,-34, 1,-24,-13, 5,-19, 0, 15, -6,-15,-27,-25,-10, -4; /M: SY='P'; M= -7, 0,-30, 5, 17,-27,-14, -8,-23, -3,-27,-20, 2, 33, 2,-10, 3, -4,-27,-33,-24, 7; /M: SY='K'; M= 1, -6,-22, -8, 0,-22,-15,-12,-19, 22,-21, -9, -3,-14, 1, 17, 0, -3, -8,-24,-13, 0; /M: SY='V'; M= 13,-23,-16,-28,-20, -4,-21,-24, 16,-21, 15, 7,-22,-22,-19,-21,-10, -4, 19,-22, -9,-20; /M: SY='H'; M= -8, 3,-22, 3, 14,-20,-18, 23,-23, -4,-18,-11, 4,-10, 6, -4, 7, 8,-19,-31, -5, 9; /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21, 9,-31,-21, 24,-30, 46, 20,-29,-29,-20,-21,-29,-10, 13,-20, 0,-21; /M: SY='S'; M= 4, 0,-16, 0, 4,-24, -6, -8,-22, 5,-29,-16, 7,-10, 9, 1, 25, 10,-14,-34,-17, 6; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='P'; M= -7, 6,-32, 12, 2,-30, -5,-11,-26, -7,-28,-22, 2, 34, -7,-15, -3, -9,-28,-32,-26, -5; /M: SY='P'; M= -4, -4,-29, -5, 5,-23,-17,-11,-16, 6,-20,-12, -1, 13, 0, 3, -5, -8,-18,-26,-18, 0; /M: SY='G'; M= -6, 7,-27, 8, -7,-28, 31,-10,-34, -7,-29,-20, 12,-17, -9, -4, 4,-11,-27,-28,-24, -8; /I: I=-8; MI=-8; IM=-8; DM=-15; MD=-15; /M: SY='K'; M= -6, -9,-24, -8, 2,-20,-23,-16,-11, 12,-16, -7,-10, -2, -4, 2, -5, 0, -2,-26,-14, -2; /M: SY='I'; M= -8,-23,-27,-29,-22, -9,-21,-21, 26,-21, 8, 15,-16,-20,-10,-21,-14,-10, 16,-21, -6,-19; /M: SY='S'; M= -1,-14,-18,-19,-15, -2,-19,-19, 8,-19, -6, -3, -5,-16,-12,-18, 11, 9, 6,-27, -7,-15; /M: SY='S'; M= 8, -5,-15, -7, -3,-19,-10,-15,-14, 3,-21,-12, -1,-12, -3, -3, 16, 11, -3,-31,-15, -3; /M: SY='I'; M= -7,-30,-23,-37,-30, 0,-37,-30, 43,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 37,-23, -3,-30; /M: SY='K'; M= -8, -6,-24, -8, 0,-17,-22, -8,-15, 20,-17, -5, -6,-15, 6, 10, -5, 1, -8,-17, 1, 2; /M: SY='F'; M=-16,-15,-22,-19,-19, 38,-26,-11, -4,-21, 6, -2,-14,-25,-24,-16,-14, -3, -4, -1, 23,-20; /M: SY='A'; M= 38,-10,-15,-18,-12,-22, 17,-20,-17,-12,-15,-12, -8,-12,-12,-20, 8, -5, -7,-20,-22,-12; /M: SY='S'; M= -3, 5,-18, 4, -4, -8,-10,-10,-12,-12,-19,-14, 10,-15, -7,-12, 15, 5,-10,-31,-11, -6; /M: SY='Y'; M=-20,-25,-25,-30,-25, 54,-30, 1, 0,-20, 5, 0,-20,-30,-24,-15,-20,-10, -5, 20, 56,-25; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='R'; M=-10, 1,-22, -5, 0,-20,-18, -4,-20, 9,-18,-10, 7,-15, 10, 24, 5, 12,-16,-26,-11, 3; /I: I=-5; MI=0; IM=0; DM=-15; MD=-15; /M: SY='P'; M= -6,-10,-29, -4, 7,-26,-14,-12,-22, -3,-28,-19, -7, 38, -1, -4, 5, -2,-23,-32,-24, 0; /M: SY='S'; M= -4, 2,-21, 0, 5,-22, -5, -9,-18, 0,-19,-12, 5,-13, 2, -4, 7, 5,-12,-29,-17, 4; /M: SY='G'; M= 3, -6,-28, -6, -4,-30, 40,-14,-33,-11,-25,-16, -1,-15, -4,-14, 1,-15,-26,-21,-25, -4; /M: SY='T'; M= -1,-13,-14,-16,-12,-10,-21,-18, 4,-13, -1, 0,-12,-19, -7,-12, 5, 14, 12,-29,-10,-10; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='G'; M= -4,-15,-31,-12,-15,-25, 36,-20,-28,-19,-20,-15, -8, 6,-18,-20, -6,-16,-25,-22,-26,-18; /M: SY='S'; M= -1, -3,-24, -2, -1,-25, 0,-12,-24, -1,-30,-18, 4, 12, -3, -6, 13, 1,-21,-32,-22, -3; /M: SY='F'; M=-18,-16,-23,-19,-16, 38,-26,-10, -5,-20, 5, -1,-14,-25,-18,-14,-16,-10, -7, -1, 20,-15; /M: SY='A'; M= 5, -2,-19, -9, -4,-10,-12,-10,-17, 4,-17,-10, 3,-15, -1, 3, 4, 2,-12,-21,-10, -2; /I: I=-4; MI=0; IM=0; DM=-15; MD=-15; /M: SY='Q'; M= -4, 12,-23, 10, 10,-28,-10, 1,-23, 5,-23,-14, 15,-13, 16, 8, 6, -3,-23,-29,-16, 13; /M: SY='G'; M= -3,-12,-29,-12,-14,-25, 31,-18,-25,-13,-24,-15, -3, -7,-13,-10, 0,-12,-20,-23,-24,-16; /M: SY='N'; M= -3, 7,-17, 1, -2,-17, -9, 2,-16, -3,-18,-12, 16,-16, -1, -3, 13, 8,-14,-34,-12, -2; /M: SY='C'; M= -8,-18,106,-27,-27,-20,-27,-28,-29,-28,-21,-20,-17,-37,-27,-28, -5, -7,-10,-49,-29,-27; /M: SY='H'; M=-13, 6,-28, 6, 6,-25, -4, 22,-25, -1,-19, -5, 8,-16, 9, 4, -5,-13,-25,-27, -8, 6; /M: SY='A'; M= 10, -6,-18,-11, -8,-19, -3,-13, -7,-11,-14, -7, 0,-16, -2,-13, 8, -1, -4,-27,-16, -5; /M: SY='H'; M= -1, -4,-24, -5, -4,-22, 1, 32,-26,-12,-23,-10, 3, -7, -1,-10, 5, -8,-22,-29, -6, -5; /M: SY='R'; M=-13, 8,-28, 3, 5,-25,-15, 20,-26, 18,-25, -9, 17,-16, 13, 21, -4, -9,-26,-27, -7, 7; /I: I=-4; MI=0; IM=0; DM=-15; MD=-15; /M: SY='T'; M= 14, -1,-11, -7, -1,-17, -9,-15,-15, -9,-18,-14, 1, -9, -4,-11, 23, 24, -6,-31,-16, -3; /M: SY='Y'; M=-12,-15, -9,-16,-10, -8,-26, 4, -6, -8, 1, 2,-14,-24, 0, -7,-14,-10, -6,-18, 7, -6; /M: SY='D'; M= -6, 17,-21, 19, 10,-27, -9, -4,-25, 3,-26,-18, 15,-11, 7, -2, 14, 6,-20,-35,-17, 9; /M: SY='V'; M= -1,-22,-23,-27,-20, -8,-21,-21, 14,-13, 5, 6,-16,-21,-15, -6,-12, -7, 15,-22, -9,-20; /M: SY='V'; M= -7,-29,-18,-33,-27, 12,-31,-24, 27,-24, 19, 18,-26,-27,-24,-21,-18, -6, 28,-20, 0,-26; /M: SY='E'; M= 2, 2,-20, 1, 12,-24,-10, -6,-20, 7,-22,-10, 5, -9, 9, 1, 11, 1,-16,-30,-16, 11; /M: SY='K'; M=-10, 6,-29, 6, 21,-31,-18, -2,-27, 30,-26,-11, 6, -9, 20, 18, -4, -9,-25,-24,-13, 20; /M: SY='R'; M= -5, -4,-23, -6, 2,-15,-17, -9,-13, 6, -5, -5, 0,-17, -1, 7, -6, -5,-12,-25,-11, 0; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='B'; M= -9, 4,-21, 4, -4,-14,-20,-12, 0,-11, -3, -5, 2,-20,-11,-13, -6, -5, 3,-32,-13, -8; /M: SY='G'; M= -4, -7,-28, -8,-10,-26, 30,-16,-33, 1,-26,-16, 0,-17, -9, 2, -1, -9,-23,-21,-21,-10; /M: SY='R'; M=-14, -1,-29, 1, 7,-26,-20, -4,-26, 28,-19, -8, 0,-15, 13, 32, -9,-10,-20,-22,-10, 9; /M: SY='R'; M= -8, 0,-22, 0, 12,-18,-16, -5,-20, 5,-15,-12, 3,-13, 5, 14, 5, 3,-16,-29,-14, 7; /M: SY='K'; M= -7, -3,-24, -6, 0,-15,-14, -7,-18, 11,-21, -6, 2,-15, 6, 5, 1, -3,-16,-13, -7, 4; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='T'; M= -2, -2,-15, -8, -8,-10,-17,-12,-10, -3,-15, -9, 1,-15, -7, -5, 12, 21, -2,-26, -4, -8; /M: SY='V'; M= -4,-29,-13,-31,-28, 9,-29,-25, 25,-21, 16, 15,-28,-29,-27,-19,-14, -3, 36,-24, -4,-27; /M: SY='V'; M= -6, -9,-17,-14,-11, 1,-22,-15, 3,-13, 0, -1, -5,-22,-13,-12, -4, 5, 8,-25, -6,-11; /M: SY='V'; M= 11,-26,-10,-28,-26, -4,-24,-28, 21,-18, 6, 6,-26,-26,-26,-20, -6, 0, 39,-28,-12,-26; /M: SY='D'; M= 2, 9,-22, 14, 1,-28, 2,-12,-26, -8,-26,-21, 5, 1, -6,-14, 12, 2,-19,-33,-22, -3; /M: SY='S'; M= -2, 6,-21, 8, 3,-25, -9,-10,-23, -2,-28,-20, 8, 9, -2, -7, 16, 8,-19,-35,-20, -1; /M: SY='E'; M=-11, 15,-26, 15, 16,-27,-13, 8,-28, 13,-26,-16, 16,-12, 8, 10, 2, -6,-25,-31,-13, 11; /M: SY='T'; M= 2,-11,-16,-18,-15, -9,-21,-19, 6, -8, -3, 3, -8,-17,-13,-12, 0, 12, 12,-27,-10,-15; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='G'; M= -3, -6,-29, -4, -1,-28, 33,-16,-33,-12,-26,-19, -2, -2,-10,-15, 1,-10,-27,-24,-26, -6; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; /M: SY='D'; M= -7, 10,-22, 14, 6,-22, 8, -6,-23, -4,-20,-16, 7, 3, -3, -8, 0, -8,-21,-22,-17, 0; D=-6; /I: DM=-29; /M: SY='D'; M=-15, 33,-27, 48, 17,-32,-11, -3,-31, -3,-22,-23, 12,-11, 0,-10, 2, -6,-24,-37,-18, 8; /M: SY='P'; M=-12,-11,-38, -1, 2,-30,-19, -3,-23, -9,-29,-18,-12, 67, -7,-17, -9,-11,-30,-31,-23, -7; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='P'; M=-10,-15,-36, -9, -1,-29,-11,-16,-25, 2,-29,-17,-13, 51, -6, -1, -9,-11,-27,-26,-25, -7; /M: SY='G'; M= -4, 9,-24, 5,-10,-25, 29,-11,-30,-12,-26,-19, 16,-17,-12,-13, 6, -1,-24,-28,-23,-11; /M: SY='T'; M= 7, -8,-10,-15,-13,-10,-18,-21, -3,-12, -8, -7, -7,-14,-13,-13, 14, 30, 10,-30,-12,-13; /M: SY='M'; M= -1,-18,-21,-18,-12, -6,-18,-11, 0,-15, 0, 4,-16, 0,-10,-16, -5, -2, -2,-21, -3,-13; /M: SY='K'; M=-11, -1,-30, -1, 9,-29,-20, -9,-30, 47,-29,-10, 0,-11, 10, 35,-10,-10,-20,-20,-10, 9; /M: SY='Y'; M=-12,-11,-26,-11, -8, 3,-21, 6,-13, 6,-14, -7, -8,-21, -2, 6, -5, -4,-13, 1, 33, -8; /M: SY='L'; M=-11,-27,-21,-27,-17, 6,-29,-17, 14,-22, 41, 16,-26,-29,-16, -9,-27,-10, 6,-20, -1,-17; /M: SY='E'; M= 7, -6,-22, -8, 8,-10,-15, -4,-15, -4,-12, -9, -7,-12, 8, -8, 1, -5,-14,-14, -1, 8; /M: SY='V'; M= -2,-28,-12,-30,-28, 0,-28,-23, 28,-18, 12, 21,-28,-28,-23,-18,-12, -2, 41,-28, -8,-26; /M: SY='E'; M= 5, 2,-23, 3, 26,-27,-16, -6,-22, 8,-18,-13, -2, -6, 14, -1, 3, -1,-19,-25,-17, 20; /M: SY='Y'; M= 4,-18,-21,-21,-18, 11,-21, 2, 0,-11, -2, -2,-18,-24,-12,-14, -9, -6, 0, 8, 39,-18; /M: SY='N'; M= -7, 0,-26, -1, -5,-19, 0,-14, -6,-14,-13, -9, 2,-16,-10,-16, -1, -8, -6,-28,-16, -9; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='V'; M= 0,-14,-19,-16, -8,-11,-20,-19, 10,-16, -6, -2, -7,-15, -9,-17, 8, 4, 11,-31,-12,-10; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 70 in 62 different sequences |
| Number of true positive hits | 70 in 62 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 2 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | K_Hofmann |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | SUEL-type lectin |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
62 sequences
AGRL1_BOVIN (O97831), AGRL1_HUMAN (O94910), AGRL1_MOUSE (Q80TR1), AGRL1_RAT (O88917), AGRL2_BOVIN (O97817), AGRL2_HUMAN (O95490), AGRL2_MOUSE (Q8JZZ7), AGRL2_RAT (O88923), AGRL3_BOVIN (O97827), AGRL3_HUMAN (Q9HAR2), AGRL3_MOUSE (Q80TS3), AGRL3_RAT (Q9Z173), BGA10_ORYSJ (Q67VU7), BGA11_ARATH (Q9SCV1), BGA11_ORYSJ (Q6ZJJ0), BGA12_ORYSJ (Q0IZZ8), BGA13_ARATH (Q9SCU9), BGA13_ORYSJ (Q7G3T8), BGA14_ARATH (Q9SCU8), BGA14_ORYSJ (Q7XFK2), BGA15_ARATH (Q9C6W4), BGA15_ORYSJ (Q0INM3), BGA16_ARATH (Q8GX69), BGAL1_ARATH (Q9SCW1), BGAL1_ORYSJ (Q8RUV9), BGAL2_ORYSJ (Q8W0A1), BGAL3_ARATH (Q9SCV9), BGAL3_ORYSJ (Q5N8X6), BGAL5_ORYSJ (Q10RB4), BGAL6_ORYSJ (Q10NX8), BGAL7_ARATH (Q9SCV5), BGAL7_ORYSJ (Q75HQ3), BGAL8_ARATH (Q9SCV4), BGAL9_ARATH (Q9SCV3), BGAL_ASPOF (P45582), BGAL_BRAOL (P49676), BGAL_SOLLC (P48980), CSL1_ONCKE (P86177), CSL2_ONCKE (P86178), CSL3_ONCKE (P86179), ELEL_ECHLU (C0HK24), EVA1C_HUMAN (P58658), EVA1C_MOUSE (P58659), EVA1C_PANTR (Q68US5), EVA1_CAEEL (Q9XU98), LEG_HELCR (P22031), LPHN_DROAN (B3MFV7), LPHN_DROER (B3N8M1), LPHN_DROGR (B4J780), LPHN_DROME (A1Z7G7), LPHN_DROMO (B4KMZ1), LPHN_DROPE (B4GD14), LPHN_DROPS (Q292N4), LPHN_DROSE (B4HS00), LPHN_DROVI (B4LNA8), LPHN_DROYA (B4P3A0), LPLT1_CAEEL (G5EDW2), LPLT2_CAEEL (G5ECX0), PK1L2_HUMAN (Q7Z442), PK1L2_MOUSE (Q7TN88), SAL_SILAS (Q9PVW8), SML_SCONI (C0HK23)» more
|
| PDB [Detailed view] |
19 PDB
2JX9; 2JXA; 2ZX0; 2ZX1; 2ZX2; 2ZX3; 2ZX4; 5AFB; 5FTT; 5FTU; 6SKA; 6SKE; 6VHH; 7WY5; 7WY8; 7WYB; 7X10; 8DJG; 8SUF » more |