PROSITE entry PS50234
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50234
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | VWFA |
Accession [info] | PS50234 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-DEC-2001 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC50234 |
Associated ProRule [info] | PRU00219 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | VWFA domain profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=177; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=172; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.9193000; R2=0.0176105; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=8288.6396484; R2=8.4804182; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=431; H_SCORE=11944; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=317; H_SCORE=10977; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MM=1; M0=-8; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='D'; M=-14, 36,-27, 46, 15,-32,-11, 2,-31, -1,-25,-23, 19,-12, 1, -8, 2, -7,-25,-37,-18, 8; /M: SY='I'; M= -6,-29,-19,-33,-27, 3,-33,-26, 32,-25, 22, 15,-25,-26,-23,-23,-17, -4, 31,-23, -3,-27; /M: SY='V'; M= -1,-22,-13,-27,-23, 2,-26,-19, 17,-19, 9, 9,-20,-24,-20,-18,-10, 0, 21,-20, 0,-22; /M: SY='F'; M=-12,-29,-21,-36,-27, 40,-31,-22, 15,-28, 20, 8,-23,-28,-30,-22,-20, -9, 12, -6, 14,-27; /M: SY='V'; M= -2,-28,-12,-30,-24, 2,-27,-24, 21,-24, 24, 13,-27,-28,-23,-21,-17, -5, 25,-25, -7,-24; /M: SY='I'; M= -8,-29,-20,-32,-25, 7,-32,-24, 29,-26, 27, 17,-26,-25,-22,-22,-21, -7, 23,-21, -2,-24; /M: SY='D'; M=-19, 46,-30, 64, 21,-38,-11, 0,-38, 0,-29,-28, 18,-10, 1, -9, 0,-10,-28,-39,-19, 10; /M: SY='G'; M= 2, -3,-15, -6, -9,-21, 12,-14,-20,-10,-20,-13, 3,-16,-10,-12, 6, -2,-13,-28,-19,-10; /M: SY='S'; M= 9, 0,-10, 0, -1,-19, -2,-10,-20,-10,-28,-19, 9,-11, -1, -9, 37, 20,-10,-39,-19, -1; /M: SY='G'; M= -3, 0,-26, 2, 3,-25, 10, -9,-27, -3,-23,-15, 2,-13, 0, -5, 2, -8,-22,-20,-17, 1; /M: SY='S'; M= 3, 2,-17, 1, 0,-20, -1, -8,-21, -3,-26,-17, 9,-13, 0, -5, 22, 9,-14,-31,-16, 0; /M: SY='M'; M= -6,-23,-21,-30,-23, -1,-25,-18, 25,-19, 16, 26,-20,-22,-14,-19,-15, -6, 20,-22, -4,-20; /M: SY='G'; M= 2, -5,-22, -6, -6,-21, 12,-14,-23, -7,-20,-14, 0,-14, -7, -6, 7, 0,-15,-24,-17, -7; /M: SY='E'; M= -6, 0,-26, 1, 6,-21, -6, -5,-19, -2,-17,-11, 1, -7, 2, -3, 0, -6,-18,-25,-13, 3; /I: I=-4; MD=-23; /M: SY='Q'; M= -1, 0,-22, -1, 2,-17,-10, -6,-16, -1,-15,-10, 0,-11, 3, -2, 1, -3,-13,-23,-10, 2; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='N'; M=-11, 6,-24, 3, 0,-18,-10, -4,-20, 3,-19,-13, 10,-15, 0, 5, -4, -6,-19,-14,-10, -1; D=-4; /I: I=-4; DM=-23; /M: SY='F'; M=-14,-26,-22,-32,-24, 39,-28,-16, 7,-22, 11, 6,-20,-27,-25,-16,-19, -9, 4, 1, 19,-23; /M: SY='E'; M= -9, 8,-26, 7, 11,-24,-15, 1,-21, 5,-20,-12, 7,-10, 11, 5, 0, -3,-21,-25,-11, 10; /M: SY='Q'; M= -4, -8,-21,-10, -2,-16,-18, -7, -9, -1, -7, -3, -6,-16, 2, 0, -3, -2, -6,-23, -8, -1; /M: SY='V'; M= 8,-17,-16,-22,-15, -7,-19,-18, 9,-14, 2, 5,-15,-19,-11,-16, -3, 1, 13,-23, -8,-13; /M: SY='K'; M= -8,-10,-25,-11, -2,-18,-21,-11,-13, 18,-12, -2, -7,-16, 3, 17, -9, -7, -8,-21, -8, -1; /M: SY='E'; M= -4, 10,-25, 12, 15,-28, -9, -5,-25, 4,-23,-16, 6, -5, 6, -1, 3, -4,-21,-30,-18, 10; /M: SY='F'; M= -3,-19,-14,-27,-19, 28,-21,-16, -3,-20, 1, -2,-13,-23,-22,-16, -7, -2, -1, -9, 7,-19; /M: SY='I'; M= 0,-25,-18,-29,-22, 0,-27,-24, 23,-22, 18, 13,-22,-23,-20,-21,-13, -2, 23,-24, -6,-22; /M: SY='E'; M= -2, -5,-19, -7, 2,-15,-18,-10, -7, -3, -8, -5, -4,-14, -2, -6, -1, -1, -5,-27,-11, -1; /M: SY='K'; M= -5, 2,-24, 0, 3,-20,-10, -5,-19, 5,-17,-10, 4,-14, 3, 4, 1, -1,-16,-25,-12, 3; /M: SY='I'; M= -8,-28,-19,-32,-25, 14,-30,-22, 23,-24, 22, 15,-24,-26,-22,-20,-18, -6, 21,-18, 1,-24; /M: SY='I'; M= 0,-25,-16,-30,-24, 2,-25,-23, 22,-22, 16, 15,-22,-24,-20,-21,-13, -6, 21,-22, -5,-23; /M: SY='E'; M= -7, 8,-25, 10, 13,-26, -7, -4,-25, 5,-22,-14, 7,-12, 9, 3, 4, -3,-21,-29,-16, 11; /M: SY='R'; M= -5, 2,-24, 1, 4,-22,-12, -6,-20, 7,-19,-11, 4,-11, 6, 10, 2, -1,-16,-27,-14, 3; /M: SY='L'; M= -8,-23,-19,-27,-20, 10,-24,-16, 11,-22, 23, 14,-20,-25,-18,-17,-19, -8, 6,-17, 1,-18; /M: SY='D'; M= -7, 6,-24, 7, 3,-17,-12, -3,-20, -3,-19,-14, 4, -9, -1, -4, 3, 1,-17,-24, -8, 0; /M: SY='I'; M= -6,-12,-25,-14, -8,-13,-21,-14, 5,-10, -1, 1, -9,-13, -7, -9, -8, -6, 3,-25, -9, -9; /M: SY='G'; M= -1, -3,-21, -3, -6,-18, 5,-11,-17,-10,-16,-12, 0,-16, -7,-11, 5, -3,-13,-25,-13, -7; /I: I=-4; MD=-20; /M: SY='D'; M= -8, 3,-26, 6, 6,-25, -6, -6,-24, 1,-22,-15, 2, 2, 3, -1, 0, -6,-22,-26,-16, 3; D=-4; /I: I=-4; MD=-20; /M: SY='D'; M= -8, 8,-20, 11, 3,-19,-10, -6,-18, 3,-17,-12, 4, -6, -1, 0, -1, -3,-14,-23,-11, 0; D=-4; /I: I=-4; MD=-20; /M: SY='E'; M= -5, 0,-20, 0, 2,-17, -6, -3,-15, 2,-14, -8, 2, -8, 0, 2, -1, -5,-13,-20,-10, 0; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-20; IM=0; DM=-20; /M: SY='V'; M= 1,-10,-13,-15,-14, -7,-17,-17, 6,-13, -3, -1, -7,-11,-12,-14, 1, 8, 9,-20, -8,-14; D=-4; /I: I=-4; DM=-20; /M: SY='R'; M=-14, -1,-25, -4, 3,-21,-16, 15,-24, 10,-19, -7, 6,-18, 15, 25, -4, -8,-23,-23, -4, 6; /M: SY='V'; M= -6,-28,-17,-32,-27, 12,-30,-23, 25,-23, 15, 12,-25,-28,-26,-20,-15, -5, 30,-19, 2,-27; /M: SY='G'; M= 10, -4,-18, -8, -9,-21, 18,-14,-22,-12,-20,-13, 1,-15,-10,-14, 7, -3,-14,-24,-19,-10; /M: SY='I'; M= -5,-28,-19,-32,-25, 5,-29,-24, 26,-25, 25, 16,-25,-26,-22,-22,-19, -6, 25,-22, -3,-25; /M: SY='I'; M= -3,-26,-18,-30,-25, 1,-28,-23, 25,-22, 16, 13,-22,-25,-21,-20,-15, -5, 25,-21, -4,-24; /M: SY='Q'; M= -5, -6,-22, -7, 1,-20,-17, -6,-10, -4, -9, -3, -5,-13, 12, -4, 2, 4,-10,-24,-10, 6; /M: SY='Y'; M=-17,-22,-23,-27,-23, 43,-28, 1, 0,-18, 3, 1,-18,-29,-20,-14,-17, -9, -4, 13, 47,-22; /M: SY='S'; M= 8, 2,-17, -2, -5,-20, 6, -7,-21, -8,-24,-16, 9,-13, -4, -9, 18, 5,-15,-31,-17, -5; /M: SY='D'; M= -4, 6,-23, 7, 1,-22, 2, -2,-25, -5,-23,-17, 7,-12, -3, -7, 7, 0,-20,-25,-11, -1; /M: SY='B'; M= -7, 7,-25, 7, 5,-23, -9, -4,-20, 2,-20,-12, 6,-11, 1, -1, 1, -4,-17,-26,-13, 2; /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='V'; M= 3,-13,-16,-15,-11,-10,-15,-15, 0,-10, -6, -3,-11, -4,-10,-12, -1, 1, 4,-21,-10,-12; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='R'; M= -5, -3,-20, -5, 1,-17,-14, 0,-19, 8,-16, -8, 0,-11, 5, 11, 0, 1,-14,-21, -7, 2; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='T'; M= -3, -6,-21, -7, -1,-15,-18,-14, -3, -9, -7, -5, -6, -8, -6,-11, -1, 3, -1,-24,-12, -4; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='E'; M= -7, -7,-23, -6, 7,-15,-20, -6,-11, -2,-10, -7, -7,-11, 0, -4, -6, -6, -9,-19, -7, 3; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='F'; M= -6,-22,-22,-26,-19, 15,-23,-16, 5,-18, 3, 1,-18,-24,-19,-16,-14, -8, 6, -2, 7,-19; /M: SY='S'; M= -5, 2,-21, 3, 2,-18,-11, -8,-19, -2,-16,-12, 2, -9, -2, -1, 4, 1,-14,-28,-13, 0; /M: SY='L'; M= -9,-26,-21,-28,-20, 18,-27,-17, 11,-24, 26, 10,-23,-24,-21,-17,-22, -9, 6,-12, 6,-20; /M: SY='N'; M= -7, 5,-23, 3, -2,-17, -8, -4,-18, -2,-17,-11, 8,-12, -2, -1, 1, -1,-16,-27,-10, -3; /M: SY='D'; M= -4, 7,-23, 10, 7,-23,-10, -7,-21, -1,-19,-14, 4, -8, 2, -4, 4, 0,-17,-29,-15, 4; /I: I=-5; MI=0; MD=-28; IM=0; DM=-28; /M: SY='Y'; M= -3, -9,-21,-12, -9, -3,-16, -3, -8, -9, -9, -6, -5,-15, -7, -8, 1, 1, -7,-18, 3, -9; /M: SY='Q'; M= -6, -2,-23, -3, 2,-19,-13, -3,-19, 4,-19,-10, 1,-10, 7, 5, 2, -1,-16,-22, -7, 3; /M: SY='N'; M= -4, 12,-19, 10, 3,-21, -8, -3,-22, -1,-24,-17, 15,-13, 2, -1, 14, 7,-17,-33,-15, 2; /M: SY='K'; M= -6, -6,-26, -7, -1,-15,-19,-10,-14, 10,-13, -6, -4, -8, -1, 6, -8, -7,-12,-20, -8, -2; /M: SY='E'; M= -1, 6,-23, 7, 8,-25, -7, -8,-22, 1,-21,-15, 4, -6, 2, -4, 5, -1,-18,-28,-17, 5; /M: SY='E'; M= -3, 8,-24, 12, 14,-25,-13, -4,-22, 2,-19,-14, 3,-10, 5, -3, 3, -4,-17,-27,-15, 10; /M: SY='L'; M= -3,-24,-20,-27,-21, 3,-25,-20, 16,-22, 19, 10,-21,-22,-19,-18,-16, -5, 14,-20, -3,-20; /M: SY='L'; M= -5,-15,-22,-18,-10, -5,-22,-13, 1, -7, 7, 3,-11,-20, -8, -4,-11, -4, -1,-20, -4,-10; /M: SY='E'; M= -5, 6,-24, 6, 11,-24,-13, -2,-23, 8,-22,-13, 7,-12, 11, 7, 5, -2,-20,-27,-13, 10; /M: SY='A'; M= 7,-10,-20,-14, -7,-14,-13, -9, -7, -4, -8, -4, -7,-16, -5, -5, -2, -4, -3,-22, -9, -7; /M: SY='I'; M= -4,-27,-19,-31,-24, 4,-30,-24, 25,-23, 20, 14,-25,-25,-22,-21,-17, -5, 24,-19, -2,-24; /M: SY='R'; M= -7, 4,-25, 3, 5,-21,-12, 1,-23, 8,-20,-11, 6,-13, 7, 11, -1, -5,-20,-24,-11, 5; /M: SY='N'; M= -6, 5,-24, 4, 7,-23, -8, -2,-23, 5,-22,-13, 8,-11, 7, 5, 4, -3,-21,-26,-13, 6; /M: SY='L'; M= -5,-23,-18,-28,-20, 5,-26,-18, 17,-21, 20, 15,-20,-24,-16,-18,-16, -6, 13,-20, -1,-19; /M: SY='R'; M= -8, -4,-27, -3, 6,-22,-16, -7,-18, 6,-16, -9, -4, -1, 6, 7, -3, -4,-17,-26,-14, 5; /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='Y'; M= -7, -7,-15, -7, -7, 2,-13, 2, -1, -7, -1, 0, -6,-12, -4, -6, -7, -4, -3, -4, 12, -6; D=-4; /I: I=-4; DM=-22; /M: SY='Y'; M= -7, -8,-22, -8, -3, -5,-15, -2,-11, -3,-10, -5, -6,-11, 0, -2, -3, -4,-11, -8, 6, -3; D=-4; /I: I=-4; DM=-22; /M: M= -3, -9,-19,-10, -9,-16, -4,-13,-14,-10,-11, -7, -7, -8, -8,-11, -4, -6,-12,-23,-13, -9; /M: SY='G'; M= 0, -4,-23, -5, -7,-21, 13,-11,-22, -7,-20,-12, 1,-15, -6, -9, 4, -4,-16,-23,-16, -7; /M: SY='G'; M= -5, -1,-24, -2, -6,-24, 21,-12,-28, -7,-24,-16, 4,-14, -8, -8, 1, -8,-22,-23,-20, -7; /M: SY='G'; M= -4, -5,-24, -6, -7,-18, 7,-11,-21, -5,-18,-11, 0,-13, -7, -5, -2, -7,-16,-21,-14, -8; /M: SY='T'; M= 3, -3,-13, -9, -8,-12,-17,-17, -9,-10,-10, -9, -2, -9, -9,-11, 14, 29, -1,-29,-12, -9; /M: SY='N'; M= -9, 10,-23, 5, -2,-13,-11, 2,-17, -2,-18,-11, 16,-12, -2, -2, 1, -3,-19,-25, -7, -3; /M: SY='T'; M= -4,-15,-17,-22,-17, -1,-25,-20, 10,-19, 12, 6,-13,-19,-15,-16, -4, 15, 9,-24, -4,-17; /M: SY='G'; M= 3, -3,-21, -6, -8,-19, 12,-11,-21,-10,-19,-13, 2,-15, -8,-11, 3, -5,-16,-23,-17, -8; /M: SY='E'; M= -1, -1,-19, -1, 4,-20,-11, -8,-17, 0,-13, -9, -2,-12, 0, -4, 1, -1,-13,-27,-13, 2; /M: SY='A'; M= 27,-10,-16,-16,-13,-20, 15,-20,-16,-14,-15,-12, -7,-13,-14,-19, 7, -4, -7,-22,-21,-13; /M: SY='L'; M= -9,-30,-21,-32,-23, 7,-31,-22, 26,-28, 40, 21,-28,-28,-20,-21,-26, -9, 16,-20, 0,-22; /M: SY='Q'; M= -6, 0,-24, -1, 6,-22,-15, -4,-17, 6,-14, -6, 0,-13, 10, 4, -2, -5,-15,-25,-12, 8; /M: SY='Y'; M= -8,-11,-23,-14, -8, 5,-21, 4, -9, -5, -6, -2, -9,-20, -5, -4, -9, -6, -9, -8, 17, -8; /M: SY='A'; M= 18,-16,-14,-21,-16,-11, -8,-20, 1,-15, 0, -1,-14,-18,-15,-18, 0, 0, 8,-23,-13,-16; /M: SY='L'; M= -5,-15,-21,-17, -9, -5,-23,-11, 2,-10, 3, 2,-12,-20, -7, -5, -8, -3, 2,-21, -2, -9; /M: SY='E'; M= -8, 3,-25, 3, 11,-20,-13, -3,-20, 5,-17,-10, 4,-13, 9, 5, 0, -5,-19,-25,-12, 10; /I: I=-6; MD=-33; /M: SY='H'; M= -8, -4,-22, -8, -2,-13,-18, 4, -5, -4, -5, 2, 0,-17, 3, -3, -6, -5, -8,-23, -3, -1; D=-6; /I: I=-6; MI=-33; IM=-33; DM=-33; /M: SY='L'; M= -6,-21,-20,-25,-19, 10,-23,-13, 11,-21, 16, 9,-17,-24,-17,-18,-13, -5, 7,-16, 5,-19; /M: SY='F'; M= -9,-11,-21,-16,-11, 17,-20,-12, -7,-10, -3, -4, -7,-19,-14, -8, -8, -5, -7,-12, 4,-11; /M: SY='S'; M= -2, -1,-22, -2, 1,-21,-10, -4,-18, 1,-18,-11, 2,-12, 3, 0, 4, 1,-14,-24,-12, 1; /I: I=-5; MI=0; MD=-26; IM=0; DM=-26; /M: SY='K'; M= -1, -5,-20, -5, 1,-15,-10, -7,-14, 3,-13, -8, -3, -2, -1, 3, -1, -4,-11,-19,-10, -1; D=-5; /I: I=-5; DM=-26; /M: SY='Q'; M= -2, -2,-20, -3, 3,-18, -9, -5,-16, 3,-16, -9, 1, -8, 5, 3, 3, 0,-13,-22,-11, 3; D=-5; /I: I=-5; DM=-26; /M: SY='E'; M= 0, 2,-23, 0, 5,-22, -7, -2,-21, 2,-19,-12, 4,-10, 4, 1, 2, -3,-17,-26,-14, 4; /M: SY='G'; M= -2, -5,-24, -5,-11,-24, 29,-14,-27,-12,-23,-15, 0,-15,-12,-13, 2,-10,-21,-22,-21,-12; /M: SY='N'; M= 0, 3,-19, 0, -3,-15, -8, -5,-14, -5,-15,-10, 6,-15, -4, -6, 4, -1,-11,-26,-11, -4; /I: MD=-13; /M: SY='R'; M=-13, -6,-23, -6, 1,-16,-16, 2,-20, 17,-13, -6, -1,-14, 8, 40, -7, -7,-15,-17, -7, 2; D=-2; /I: I=-3; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='E'; M= -4, -2,-19, 1, 10,-16, -9, -5,-15, 2,-13, -9, -3, 3, 3, 0, -1, -4,-14,-18,-10, 6; D=-2; /I: DM=-13; /M: SY='N'; M= -6, 7,-19, 6, 5,-18, -2, 2,-17, 2,-17,-10, 10, -7, 3, 2, 0, -6,-17,-21,-11, 3; D=-2; /I: DM=-13; /M: SY='A'; M= 8,-10,-12,-14,-10, -8,-10,-11, -1,-10, -6, -3, -8,-12, -9,-13, 2, 1, 3,-18, -6,-10; D=-2; /I: DM=-13; /M: SY='P'; M= -7, -8,-27, -8, 0,-21,-16,-10,-16, 4,-18,-10, -4, 6, 0, 6, -4, -4,-15,-25,-15, -2; /M: SY='K'; M= -8, 0,-26, -2, 6,-24,-16, 2,-21, 17,-21, -7, 4,-12, 12, 14, -3, -6,-18,-25,-10, 8; /M: SY='V'; M= -6,-24,-19,-28,-22, 4,-28,-19, 19,-19, 14, 11,-21,-24,-20,-16,-14, -4, 22,-22, -2,-22; /M: SY='I'; M= -1,-25,-19,-30,-23, 1,-26,-24, 23,-23, 17, 12,-22,-24,-21,-22,-14, -4, 22,-22, -5,-23; /M: SY='I'; M= -7,-28,-21,-34,-27, 4,-33,-23, 33,-24, 19, 17,-24,-25,-21,-23,-18, -7, 28,-19, 2,-27; /M: SY='I'; M= -6,-28,-18,-31,-24, 6,-29,-20, 24,-23, 24, 17,-26,-27,-21,-20,-19, -6, 23,-21, -1,-23; /M: SY='I'; M=-10,-29,-21,-34,-26, 22,-31,-22, 23,-26, 21, 14,-24,-27,-25,-22,-20, -8, 18,-13, 8,-26; /M: SY='T'; M= 5, -3,-10,-10, -9,-12,-15,-19,-10,-11,-12,-10, -1,-11, -9,-11, 20, 37, 0,-31,-13, -9; /M: SY='D'; M= -9, 33,-26, 44, 12,-34, -3, -3,-34, -3,-28,-25, 16,-11, 0,-10, 5, -6,-25,-36,-20, 6; /M: SY='G'; M= 2, -6,-26, -7,-14,-27, 45,-17,-32,-15,-26,-18, 1,-17,-15,-16, 3,-12,-24,-23,-26,-14; /M: SY='E'; M=-10, -2,-27, -1, 4,-17,-17, 0,-17, 4,-16,-10, 0, -8, 3, 4, -4, -6,-17,-21, -4, 2; /M: SY='S'; M= 2, -5,-21, -5, 0,-19, -9,-10,-16, -7,-20,-13, -2, 4, -3,-11, 8, 2,-14,-28,-16, -3; /M: SY='N'; M= -8, 9,-21, 7, 3,-19,-10, -3,-19, -3,-19,-13, 11,-11, 2, -3, 5, 3,-18,-29,-12, 2; /I: MD=-12; /M: SY='D'; M= -9, 10,-20, 15, 4,-18,-10, -6,-17, -4,-15,-11, 3,-10, -4, -8, 0, -5,-13,-25,-10, 0; D=-2; /I: MD=-12; /M: SY='G'; M= -2, -2,-18, -1, -4,-17, 11, -7,-18, -6,-15,-10, 0, -5, -5, -6, 1, -6,-15,-18,-13, -5; D=-2; /I: I=-3; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; /M: M= -4, -2,-17, -2, 0,-12, -2, -6,-13, -1,-10, -7, 0, -9, -2, 0, -1, -2,-11,-16, -8, -2; D=-2; /I: DM=-12; /M: SY='D'; M= -8, 15,-22, 17, 7,-23, -6, -1,-23, 1,-19,-15, 12,-12, 3, 0, 2, -4,-20,-27,-13, 4; D=-2; /I: DM=-12; /M: SY='I'; M= -3,-20,-21,-21,-14, -5,-22,-18, 7,-17, 6, 2,-18, 2,-15,-17,-11, -4, 3,-22, -8,-16; D=-2; /I: DM=-12; /M: SY='R'; M= -6, -7,-22, -7, 2,-13,-19, -6,-11, 2, -8, -4, -5,-15, 1, 5, -4, -3, -8,-22, -7, 1; D=-2; /I: DM=-12; /M: SY='E'; M= -7, 8,-27, 13, 14,-28,-14, -7,-24, 7,-21,-15, 2, -1, 6, 2, 0, -4,-20,-29,-17, 9; /M: SY='V'; M= 6,-16,-19,-18,-10,-10,-19,-19, 5,-14, 0, -1,-15,-10,-12,-17, -5, -3, 7,-23,-10,-13; /M: SY='A'; M= 11,-15,-17,-19,-14,-11,-14,-19, 5,-15, -3, -1,-11,-17,-11,-17, 1, 0, 9,-25,-11,-13; /M: SY='K'; M= -7, 1,-26, 1, 8,-23,-16, -4,-19, 9,-16, -9, 2, -9, 7, 8, -4, -6,-17,-26,-13, 6; /M: SY='R'; M= -6, 3,-24, 1, 5,-20,-14, -4,-18, 6,-16,-10, 5,-14, 3, 9, -1, -3,-15,-26,-12, 3; /M: SY='L'; M= 3,-23,-18,-26,-18, 0,-23,-18, 14,-21, 21, 12,-21,-22,-16,-19,-15, -6, 11,-19, -2,-18; /M: SY='R'; M=-10, -3,-27, -4, 5,-24,-18, -4,-25, 24,-22,-10, 1,-10, 8, 29, -6, -7,-19,-23,-11, 5; /M: SY='E'; M= -2, 5,-22, 5, 8,-25,-10, -5,-23, 7,-21,-13, 5,-11, 4, 4, 3, -2,-17,-28,-15, 6; /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='E'; M= -1, 0,-22, 0, 5,-19, -8, -7,-19, 3,-16,-10, 1,-11, 2, 0, 1, -4,-16,-22,-12, 3; D=-3; /I: I=-3; DM=-17; /M: SY='G'; M= -7, 4,-27, 3, -5,-25, 17, -5,-29, -2,-25,-16, 8,-15, -4, -3, 0,-11,-24,-24,-16, -5; /M: SY='V'; M= -5,-27,-19,-31,-26, 3,-29,-22, 27,-23, 14, 12,-23,-25,-22,-21,-14, -5, 28,-21, 0,-25; /M: SY='E'; M= -4, -2,-23, -3, 2,-19,-15, -9,-13, 1,-15, -8, 0, -7, 1, -1, 0, 0,-11,-27,-13, 0; /M: SY='V'; M= -6,-26,-17,-29,-23, 1,-29,-24, 21,-21, 16, 11,-23,-22,-21,-17,-15, -4, 22,-23, -6,-23; /M: SY='F'; M= -9,-21,-21,-26,-21, 24,-27,-13, 8,-20, 6, 3,-17,-25,-21,-17,-12, -5, 7, -7, 17,-22; /M: SY='V'; M= 7,-16,-14,-21,-17, -5,-17,-21, 3,-16, -4, -3,-13,-10,-17,-17, 0, 5, 9,-24,-10,-17; /M: SY='I'; M= -7,-29,-19,-34,-28, 8,-33,-27, 32,-26, 19, 14,-25,-26,-25,-23,-18, -6, 30,-21, -1,-28; /M: SY='G'; M= 8, -7,-24, -9,-15,-24, 38,-17,-27,-16,-23,-16, 0,-18,-15,-18, 3,-11,-19,-22,-23,-15; /M: SY='V'; M= -7,-27,-18,-32,-26, 11,-31,-23, 24,-23, 14, 12,-23,-24,-24,-21,-14, -3, 25,-19, 2,-26; /M: SY='G'; M= -1, -3,-27, -2, -9,-28, 37,-15,-33, -9,-26,-18, 2,-17,-11,-10, 2,-12,-24,-24,-24,-10; /M: SY='N'; M= -6, 4,-26, 4, 3,-21, -8, -3,-22, -1,-22,-13, 6, -2, 1, -3, 1, -4,-21,-26,-14, 1; /M: SY='D'; M= -2, 4,-23, 5, -1,-20,-10, 0,-16, -6,-15,-10, 3,-11, -4, -8, -1, -6,-13,-28,-12, -4; /M: SY='V'; M= -3, -6,-20, -7, -9, -4,-17,-12, -5,-12, -6, -5, -7,-16,-13,-13, -4, -3, 1,-22, -6,-11; /I: I=-4; MD=-19; /M: SY='B'; M= -8, 13,-21, 13, 3,-18, -8, -1,-18, -2,-18,-14, 12,-13, -1, -5, 3, -2,-16,-27,-10, 0; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='M'; M= -6, -9,-18,-11, -5, -6,-18, -6, -3, -7, 0, 1, -9,-13, -3, -6, -7, -3, -3,-14, -1, -5; D=-4; /I: I=-4; DM=-19; /M: SY='E'; M= -5, 6,-25, 8, 10,-27, -9, -3,-23, 4,-22,-14, 5, -5, 6, 0, 1, -5,-20,-29,-17, 7; /M: SY='E'; M=-11, 0,-26, 1, 14,-14,-19, -4,-17, 3,-13, -8, -2,-11, 8, 2, -5, -6,-17,-22, -8, 11; /M: SY='L'; M= -8,-25,-18,-29,-21, 5,-27,-19, 20,-26, 34, 18,-23,-27,-18,-19,-23, -9, 11,-22, -3,-20; /M: SY='K'; M= -9, 3,-24, 3, 9,-22,-15, -1,-21, 10,-19,-10, 5,-13, 8, 10, -1, -4,-18,-26,-11, 7; /M: SY='E'; M= -4, -4,-23, -4, 4,-17,-17, -8,-12, 2,-11, -6, -4,-13, 2, 1, -2, -3,-10,-23,-10, 2; /M: SY='I'; M= -8,-28,-23,-34,-24, 5,-33,-23, 32,-27, 27, 22,-23,-23,-18,-24,-22, -9, 19,-19, 0,-24; /M: SY='A'; M= 27, -9,-13,-15, -9,-19, 1,-18,-11,-11,-12,-10, -7,-12,-10,-16, 9, 2, -2,-24,-19,-10; /M: SY='S'; M= -1, -4,-13, -7, -8,-16, 1,-12,-19,-10,-18,-13, 2,-16, -7, -9, 7, 2,-14,-24,-15, -8; /M: SY='E'; M= -5, 0,-12, 0, 4,-23,-11,-11,-20, -2,-19,-13, -2, -5, -1, -7, -2, -6,-17,-29,-17, 1; /M: SY='P'; M= -3, -1,-26, -2, -3,-21, -5, -7,-20, -3,-22,-13, 2, 8, -5, -6, 1, -5,-19,-28,-17, -6; /I: I=-3; MD=-16; /M: SY='B'; M= -3, 3,-22, 3, -1,-20, -3, -4,-19, -4,-17,-11, 3, -5, -4, -6, 1, -2,-15,-26,-14, -3; D=-3; /I: I=-3; MD=-16; /M: SY='G'; M= -3, 3,-21, 2, 2,-18, 8, -7,-20, -5,-18,-13, 5, -8, -3, -7, 2, -5,-18,-20,-13, -1; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16; /M: SY='R'; M= -7, -4, -7, -5, -3,-12,-12, -6,-12, -2,-11, -7, -2,-12, -1, 2, -1, -2, -9,-21, -9, -3; D=-3; /I: I=-3; DM=-16; /M: SY='H'; M=-13, -5,-23, -7, -4, -9,-19, 22,-19, -1,-14, -5, 0,-14, -1, 6, -7, -9,-18,-20, 6, -5; /M: SY='V'; M= 0,-16,-19,-21,-18, 3,-21,-15, 8,-16, 2, 1,-11,-21,-16,-16, -5, -1, 9,-17, 3,-18; /M: SY='F'; M=-15,-22,-23,-26,-22, 38,-27, -9, 2,-20, 6, 1,-17,-26,-24,-16,-16, -8, 1, 3, 28,-22; /M: SY='T'; M= -4, -7,-21,-11, -6, -8,-17, -9, -6, -6, -6, -4, -3,-17, -6, -5, -1, 3, -4,-23, -6, -6; /M: SY='V'; M= -3,-10,-19,-11,-11, -8,-20,-16, 3,-12, 2, 1,-11,-18,-12,-12, -7, -3, 7,-26, -9,-12; /M: SY='E'; M= -2, 5,-22, 6, 7,-24,-12, -4,-21, 1,-20,-14, 4, -3, 3, -2, 4, -1,-18,-29,-16, 4; /M: SY='D'; M=-10, 27,-25, 35, 14,-31, -9, -2,-29, 0,-26,-22, 16, -8, 3, -6, 6, -3,-24,-36,-19, 8; /M: SY='F'; M= -7,-20,-24,-23,-16, 13,-17,-15, -4,-16, -1, -2,-17,-20,-17,-14,-12, -8, -4, 5, 7,-15; /M: SY='D'; M= -4, 11,-23, 12, 9,-25, -7, -5,-23, -1,-22,-17, 9, -7, 2, -5, 7, 2,-19,-32,-18, 5; /M: SY='E'; M= 0, 1,-22, 2, 7,-21,-11, -5,-17, -3,-13,-10, 0,-11, 3, -5, 3, -2,-14,-28,-14, 4; /I: I=-5; MI=0; MD=-26; IM=0; DM=-26; /M: SY='L'; M= -9,-29,-22,-32,-23, 7,-31,-22, 26,-27, 35, 19,-26,-26,-20,-21,-24, -9, 17,-20, 0,-22; /M: SY='E'; M= -4, 5,-25, 6, 10,-26, -9, -2,-24, 6,-23,-14, 5, -6, 8, 2, 4, -3,-20,-28,-15, 8; /M: SY='E'; M= -8, 12,-26, 14, 15,-29, -8, -2,-27, 6,-24,-16, 9, -7, 10, 1, 4, -4,-24,-30,-17, 12; /I: I=-5; MI=0; MD=-28; IM=0; DM=-28; /M: SY='L'; M= -8,-24,-21,-29,-21, 14,-27,-18, 14,-21, 17, 11,-19,-24,-18,-16,-16, -5, 9,-15, 4,-19; /M: SY='L'; M= -9,-18,-23,-21,-14, 5,-23,-11, 4,-14, 6, 4,-15,-21, -9, -9,-11, -5, 1,-14, 6,-12; /M: SY='D'; M= -6, 13,-23, 16, 12,-29, -8, -2,-27, 4,-25,-17, 10, -8, 7, -2, 5, -3,-23,-31,-17, 9; /M: SY='E'; M= -4, 0,-24, -2, 6,-19,-15, -4,-18, 6,-16, -9, 1,-10, 5, 5, -1, -2,-16,-24,-11, 5; /M: SY='I'; M= -7,-28,-21,-32,-24, 5,-31,-23, 28,-25, 25, 18,-25,-25,-20,-22,-20, -7, 23,-20, -2,-24; /I: E1=0;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 460 in 331 different sequences |
Number of true positive hits | 445 in 316 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 6 in 6 different sequences |
Number of false positive hits | 9 in 9 different sequences |
Number of false negative sequences | 94 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 98.02 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 82.56 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Archaea, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria), Eukaryotic viruses |
Maximum number of repetitions [info] | 12 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | K_Hofmann |
Feature key [info] | DOMAIN |
Feature description [info] | VWFA |
Version [info] | 5 |
Cross-references [info]