PROSITE entry PS50254
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | REL_2 |
| Accession [info] | PS50254 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-DEC-2001 CREATED;
26-FEB-2020 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC00924 |
| Associated ProRule [info] | PRU00265 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | NF-kappa-B/Rel/dorsal domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=178; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=175; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.5397109; R2=0.0186128; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6750.9897461; R2=14.4433270; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=428; H_SCORE=12933; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=321; H_SCORE=11387; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='A'; M= 10, -8,-22,-11, -7,-22, 3,-14,-19, -3,-19,-13, -2, -4, -6, -3, 5, -4,-14,-25,-19, -8; /M: SY='S'; M= 2, 1,-19, 1, -1,-20,-11, 0,-18, -6,-22,-14, 3, -4, -1, -9, 12, 5,-13,-29,-10, -2; /M: SY='L'; M= -7,-10,-23,-11,-11,-13, 0,-14, -7,-13, 1, -2, -6,-22,-11,-10,-10, -8, -7,-24,-13,-11; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='Y'; M=-11,-14,-31,-12, -4, -4,-22, 15,-14, -8,-14, -7,-12, 8, -1,-10,-11,-11,-20, -6, 20, -6; /M: SY='L'; M= -8,-30,-19,-31,-23, 7,-31,-23, 25,-28, 38, 18,-29,-29,-22,-21,-25, -8, 21,-22, -2,-23; /M: SY='E'; M=-12, 11,-27, 18, 23,-27,-18, -3,-23, 8,-19,-15, 3,-11, 8, 8, -3, -8,-18,-30,-16, 15; /M: SY='W'; M=-13,-33,-36,-40,-30, 3,-34,-30, 29,-27, 8, 8,-26,-23,-20,-27,-26,-16, 12, 32, 9,-27; /M: SY='I'; M= -7,-20,-24,-23,-16, -6,-27,-22, 10,-17, -1, 1,-18, 5,-14,-18, -8, 2, 8,-24,-10,-17; /M: SY='E'; M=-10, -2,-27, 5, 36,-18,-23, -6,-15, -2, 1, -8, -9, -9, 8, -6, -9,-10,-18,-27,-14, 22; /M: SY='Q'; M= -8, -4,-30, -1, 17,-35,-18, 1,-21, 4,-23, -8, -4, 13, 37, 1, 1, -7,-28,-25,-16, 26; /M: SY='P'; M= -5,-12,-31, -7, -1,-26,-15,-17,-19,-10,-29,-19, -9, 59, -8,-17, 2, 1,-24,-32,-26, -8; /M: SY='K'; M= -9, -4,-26, -5, 3,-24,-20, 12,-21, 17,-20, -5, -1,-15, 12, 16, -5, -6,-15,-23, -5, 6; /M: SY='Q'; M= -7, -4,-25, -4, 10,-20,-13, 1,-19, -1,-19, -8, -2, -8, 24, -2, 6, -4,-22,-20, -5, 16; /M: SY='R'; M=-12, -3,-29, -4, 2,-25, 2, -6,-32, 18,-25,-14, 4,-17, 3, 32, -6,-12,-24,-22,-16, 0; /I: I=-6; MD=-33; /M: SY='G'; M= 2, -9,-25,-10, -9,-25, 24,-14,-21,-12,-21,-12, -3, -7, -3,-14, 2,-10,-19,-21,-20, -7; D=-6; /I: I=-6; MI=-33; IM=-33; DM=-33; /M: SY='F'; M=-13,-24,-12,-31,-23, 22,-27, -9, 10,-20, 16, 22,-21,-26,-17,-16,-20, -8, 5, -9, 16,-20; /M: SY='R'; M=-17, -5,-30, -1, 17,-23,-20, -1,-30, 23,-20,-13, -1,-10, 12, 46, -7,-10,-23,-23,-14, 11; /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-36,-27, 58,-30,-19, 6,-29, 21, 6,-23,-30,-33,-20,-23,-10, 3, 2, 23,-27; /M: SY='R'; M=-19, -9,-30, -9, 1,-21,-20, -1,-30, 31,-21,-10, 0,-19, 10, 67,-10,-10,-20,-20,-10, 1; /M: SY='Y'; M=-17,-23,-30,-26,-23, 21,-33, 5, 15,-16, 6, 6,-20,-27,-13,-16,-20,-10, 2, 15, 57,-23; /M: SY='E'; M= -9, 1,-28, 6, 29,-28,-17, -7,-25, 21,-21,-13, -3, -8, 12, 9, -5,-10,-19,-26,-15, 20; /M: SY='C'; M= -5,-21, 71,-27,-27,-14,-27,-28,-12,-25,-12,-11,-20,-35,-27,-25, -6, -5, 7,-43,-23,-27; /M: SY='E'; M=-10, 7,-30, 14, 48,-33,-20, 3,-27, 10,-20,-14, 0, -3, 32, 3, 0,-10,-30,-27,-17, 40; /M: SY='G'; M= -4,-14,-32,-12,-14,-27, 36,-18,-29,-16,-26,-13, -7, 12,-15,-19, -5,-16,-27,-23,-27,-16; /M: SY='R'; M=-16, -8,-31, -7, 2,-24,-20, 4,-29, 26,-24,-10, -2, -3, 7, 44,-10,-11,-22,-22,-10, 1; /M: SY='S'; M= 9, -3,-10, -5, -4,-20, 0,-14,-20,-11,-26,-18, 4, -4, -5,-13, 27, 16,-11,-35,-21, -5; /M: SY='H'; M= 18, -5,-18,-11, -6,-19,-10, 26,-18,-10,-14, -6, -1,-14, -2,-11, 3, -2,-11,-25, -4, -6; /M: SY='G'; M= -7, -7,-30, -7,-13,-27, 40, 21,-37,-17,-27,-13, 3,-20,-10,-13, -3,-20,-30,-23,-13,-13; /M: SY='S'; M= 0, -5,-19, -5, -4,-22, 8, -9,-27, -1,-27,-17, 5,-15, -1, 9, 19, 4,-17,-31,-19, -4; /M: SY='I'; M= 7,-22,-22,-31,-21, -6,-25,-25, 25,-23, 12, 9,-16,-18,-16,-25, -9, -5, 17,-22, -7,-21; /M: SY='P'; M=-13,-16,-33,-11, -4,-19,-22, 15,-15,-14,-11, -6,-13, 34, -6,-14,-14,-13,-22,-28,-10, -9; /M: SY='G'; M= -6, -9,-29,-10,-18,-13, 38, -7,-28,-16,-22,-15, -1,-23,-16,-16, -5,-16,-25, -8, 0,-18; /M: SY='E'; M= 0, -2,-24, 1, 26,-22,-12, -9,-15, -1,-12, -9, -7, -9, 4, -8, -2, -8,-11,-27,-18, 15; /M: SY='N'; M= -1, 8,-17, 0, -3,-18,-10, 3,-19, -2,-21,-13, 16,-14, -1, 1, 14, 14,-15,-32,-12, -3; /M: SY='S'; M= 2, 6,-16, 5, 14,-21, -8, -7,-21, -4,-25,-19, 10, -8, 4, -7, 25, 14,-15,-36,-19, 9; /M: SY='T'; M= 0, -1,-18, -5, -3,-19, 6,-16,-22,-10,-19,-15, 1,-11, -8,-11, 15, 20,-13,-29,-18, -5; /M: SY='E'; M= 3, 8,-21, 11, 13,-27, -9, -9,-25, 6,-26,-18, 4, -5, 3, -2, 12, 1,-18,-32,-18, 8; /M: SY='R'; M= -7, 3,-25, 1, 11,-22, -8, 1,-26, 9,-21,-14, 9,-14, 5, 20, 1, -4,-22,-27,-15, 6; /M: SY='N'; M= -3, 4,-22, -2, -6,-22, 10, 4,-25, -6,-24,-14, 13,-16, -3, -4, 8, 1,-21,-29,-15, -5; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='K'; M= -8, -4,-30, -4, 1,-29, 4,-12,-33, 29,-29,-13, 0,-14, 2, 21, -7,-13,-23,-20,-15, 1; /M: SY='T'; M= 0, -3,-15,-10,-12,-16, 5,-20,-18,-13,-16,-13, 0,-13,-12,-13, 16, 30, -8,-28,-16,-12; /M: SY='Y'; M=-19,-17,-26,-20,-16, 24,-26, 32, -8,-18, 2, 2,-11,-26,-13,-11,-18,-14,-12, -3, 35,-16; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='T'; M= 4, -8,-14,-10, -4,-14,-17,-17, -3,-10,-10, -7, -6,-14, -6,-12, 12, 16, 5,-30,-14, -5; /M: SY='I'; M= -5,-30,-20,-35,-30, 0,-35,-30, 40,-25, 15, 15,-25,-25,-25,-25,-15, -5, 40,-25, -5,-30; /M: SY='Q'; M=-10, 2,-28, 3, 23,-32,-20, -1,-25, 23,-23, -9, 0, -8, 27, 15, -2, -5,-24,-23,-12, 25; /M: SY='I'; M= -8,-30,-21,-34,-26, 4,-34,-26, 33,-28, 30, 18,-26,-26,-22,-24,-22, -8, 26,-22, -2,-26; /M: SY='C'; M=-13,-12, 13,-17,-16,-11,-24, 13,-10,-18, -1, 2, -6,-28,-11,-12,-13,-11, -8,-33, -5,-15; /M: SY='G'; M= -6, 16,-25, 7, -8,-25, 31, -1,-30,-10,-30,-20, 29,-20, -9,-10, 4,-10,-30,-30,-23, -9; /M: SY='Y'; M=-19,-20,-12,-21,-21, 24,-30, 14, -4,-12, -2, -2,-20,-31,-12,-12,-19,-10,-10, 20, 67,-21; /M: SY='R'; M=-10, 1,-24, 4, 3,-17,-14, -5,-17, 1,-13, -7, -1,-16, 3, 5, -1, -3,-13,-25, -8, 2; /M: SY='G'; M= 0, -5,-29, -3, 1,-30, 43,-15,-36,-12,-26,-20, 0,-14, -9,-15, 0,-16,-29,-23,-27, -4; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='P'; M= -3, -7,-30, -4, 12,-27,-17,-12,-22, 13,-23,-12, -8, 22, 3, 3, -6, -9,-21,-25,-19, 5; /M: SY='A'; M= 10,-19,-21,-20,-15,-17, -6,-23, -3,-15,-11, -7,-18, 9,-18,-20, -4, -6, 4,-26,-20,-18; /M: SY='V'; M= -9,-19,-23,-20,-12, -9,-28,-14, 8, -5, 6, 6,-16,-21, -8, -2,-14, -6, 10,-23, -6,-11; /M: SY='V'; M= -4,-21,-19,-27,-25, -4,-22,-24, 24,-20, 7, 10,-17,-24,-21,-20,-10, -2, 27,-26, -9,-25; /M: SY='L'; M=-10,-19,-21,-20,-11, -6,-27,-16, 5, -7, 9, 4,-16,-23,-10, 6,-13, -3, 9,-24, -7,-12; /M: SY='V'; M= 1,-15, -8,-18,-11,-16,-22,-16, 4,-12, -6, 0,-12,-19, 1,-13, 0, -1, 9,-28,-12, -6; /M: SY='C'; M= -4, -8, 17,-12,-12,-16,-19,-15,-10,-16,-10, -3, -7,-21, -8,-16, 4, 4, -5,-35,-16,-11; /M: SY='L'; M=-11,-29, -5,-33,-25, 24,-30,-22, 11,-29, 27, 9,-26,-31,-28,-21,-23, -9, 11,-16, 4,-25; /M: SY='V'; M= -4,-26,-16,-31,-27, 5,-31,-28, 28,-22, 10, 9,-23,-25,-26,-21, -9, 3, 34,-24, -4,-27; /M: SY='T'; M= -4, -7,-24,-12,-10,-18, 4,-18,-22, -5,-20,-13, -5,-15, -6, -7, 2, 10,-16, -4,-10, -7; /I: I=-6; MD=-33; /M: SY='K'; M= -7, 3,-21, 0, 8,-20,-16, -1,-21, 14,-20,-11, 4,-10, 4, 9, 4, 8,-15,-25, -9, 6; D=-6; /I: I=-6; MI=-33; IM=-33; DM=-33; /M: SY='D'; M= 7, 15,-21, 16, -1,-27, 8,-10,-26, -8,-23,-20, 10,-13, -7,-13, 8, -1,-18,-30,-21, -4; /M: SY='D'; M=-14, 16,-32, 25, 12,-29,-14, -8,-29, -1,-27,-23, 5, 12, -2, -9, -3, -8,-28,-20,-17, 5; /M: SY='P'; M=-12, -4,-34, 6, 16,-25,-20,-10,-21, -5,-20,-17,-10, 39, -1,-13, -8,-10,-26,-28,-19, 5; /M: SY='H'; M=-19, -5,-30, -3, -3,-11,-21, 36,-25, 2,-17, -7, 0,-13, 2, 17,-11,-14,-23,-19, 11, -4; /M: SY='R'; M=-12, -6,-27, -8, -3,-16,-17, -1,-18, 16,-16, -7, 1,-18, 2, 25, -7, -8,-15,-20, -4, -3; /M: SY='P'; M= -6,-23,-27,-19,-10,-13,-24,-20, 1,-17, 2, -1,-23, 24,-12,-18,-15, -8, -4,-26,-16,-13; /M: SY='H'; M=-19, -2,-30, -2, 1,-21,-20, 73,-30, 2,-21, -3, 7,-19, 10, 15,-10,-17,-27,-27, 12, 1; /M: SY='P'; M= -1,-17,-34,-10, -1,-28,-16,-19,-19,-10,-28,-19,-17, 70, -9,-19, -4, -7,-25,-30,-28, -9; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='N'; M= 8, 7,-21, 4, 3,-23, 0, -8,-22, -5,-22,-17, 9,-13, 1,-10, 8, -3,-19,-19,-17, 2; /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23, 28,-30,-20, 15,-30, 39, 15,-27,-30,-25,-20,-27,-10, 7,-12, 8,-23; /M: SY='V'; M= -5,-27,-15,-27,-27, 8,-30,-17, 22,-17, 7, 7,-27,-30,-25,-17,-13, -3, 34,-14, 14,-27; /M: SY='G'; M= -2, -8,-27, -8, -9,-30, 34,-12,-28,-11,-24,-12, -2,-18, 2,-11, 2,-13,-23,-22,-23, -4; /M: SY='K'; M= -8, -9,-25, -9, -2,-21,-23,-14,-14, 29,-18, -5, -8,-16, -1, 21,-10, -7, -2,-23,-10, -2; /M: SY='H'; M=-16, 13,-30, 20, 19,-25,-16, 28,-31, 2,-22,-13, 7,-12, 11, -1, -5,-13,-28,-29, -5, 14; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='C'; M=-13, -9, 59,-14,-16,-22,-24,-18,-30,-10,-22,-18, -8,-31,-15, 0, -7, -8,-15,-41,-23,-17; /M: SY='K'; M=-11, -4,-28, -4, 4,-20,-24, -8, -8, 9,-13, -5, -3,-13, 3, 8, -7, -7, -8,-24, -9, 1; /M: SY='B'; M= -7, 13,-22, 13, 3,-23,-14, -5,-23, 6,-20,-15, 9,-13, -1, 3, 5, 8,-16,-31,-13, 0; /M: SY='G'; M= -2, -6,-30, -4,-16,-31, 61,-18,-39,-18,-30,-21, 1,-16,-18,-19, 0,-19,-30,-22,-29,-17; /M: SY='V'; M= -9,-18,-23,-21,-16, -1,-28,-14, 10, -2, 0, 4,-15,-23,-13, -6,-14, -7, 12,-15, 8,-16; /M: SY='C'; M=-11,-16, 47,-24,-23, -4,-27,-13,-15,-20,-10, -8,-16,-30,-19,-20, -7, 2, -7,-24, 4,-22; /M: SY='E'; M= -4, -4,-19, -2, 6,-18,-21,-13, -7, -4, -9, -7, -8,-14, 0, -6, 1, 6, 2,-29,-13, 3; /M: SY='A'; M= 15,-17,-14,-20,-15,-12,-16,-22, 3,-11, -3, -3,-16,-10,-16,-16, 0, 3, 13,-26,-15,-16; /M: SY='E'; M= -8, 3,-23, 3, 18,-20,-19, 0,-20, 4,-17,-13, 3, -9, 6, 3, 5, 9,-17,-29,-12, 11; /M: SY='L'; M= 1,-16,-19,-21,-17, 3,-24,-21, 10,-21, 13, 4,-16,-21,-18,-20,-10, 1, 9,-21, -4,-18; /M: SY='N'; M= -2, 2,-17, -2, -6,-21, 10, -9,-22,-10,-23,-16, 12,-11, -4, -8, 12, 0,-20,-32,-21, -6; /M: SY='P'; M= -9,-12,-31, -7, -1,-19,-17, 6,-19, -8,-24,-13, -8, 31, 0,-12, -1, -5,-23,-23, -4, -4; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='E'; M= -7, 6,-26, 11, 27,-26,-15, -7,-26, 10,-20,-16, 0, -7, 8, 4, 1, -2,-20,-28,-17, 17; /M: SY='R'; M= -2, 1,-22, 0, -1,-21,-10,-11,-18, 3,-17,-12, 2,-14, -3, 6, 2, 2,-11,-27,-15, -3; /M: SY='M'; M= -8,-20,-15,-25,-17, -6,-25,-11, 9,-11, 2, 17,-16,-12, -8, -8,-12, -6, 5,-20, -2,-15; /M: SY='V'; M= -5,-19,-19,-20,-16, -9,-24,-19, 7, -7, -2, 1,-14,-16,-13, -1, -4, 2, 14,-27,-10,-16; /M: SY='H'; M= 5,-12,-20,-15,-11, -8, -9, 11,-10,-14, -4, -3, -8,-20, -8,-13, -3, -6, -7,-19, 4,-11; /M: SY='S'; M= -1, -1,-13, -6, -6,-16, -3,-10,-15, -9,-20,-12, 6,-16, 0, -9, 14, 8,-10,-30,-15, -3; /M: SY='F'; M=-14,-22,-17,-31,-24, 52,-27,-20, -1,-25, 7, -1,-15,-25,-31,-17,-10, 6, 1, -2, 18,-24; /M: SY='Q'; M= -4, 5,-24, 0, 5,-26,-13, -3,-17, 11,-23, -9, 12,-13, 16, 6, 5, -3,-18,-27,-13, 10; /M: SY='N'; M= -7, 19,-18, 6, -7,-15, -9, -2, -7, -2,-19,-11, 33,-22, -7, -3, 4, -1, -8,-36,-17, -7; /M: SY='L'; M= -9,-29,-19,-30,-21, 9,-29,-19, 21,-28, 45, 22,-29,-29,-19,-19,-28, -9, 12,-21, -1,-20; /M: SY='G'; M= -3, -5,-30, -2, 1,-30, 46,-15,-37,-12,-27,-20, 0,-15, -9,-15, 0,-17,-30,-23,-27, -4; /M: SY='I'; M= -9,-29,-28,-39,-29, 0,-38,-28, 47,-28, 19, 22,-21,-21,-19,-28,-19, -9, 30,-21, -1,-29; /M: SY='Q'; M=-10,-10,-29,-10, 5,-26,-23, -5,-10, -2,-10, -1, -9, 6, 23, -1, -6, -6,-18,-23,-12, 12; /M: SY='C'; M=-12,-19, 54,-24,-21,-12,-28, -2,-17,-26, -2, -6,-17,-33,-20,-21,-15,-12, -9,-38,-12,-21; /M: SY='V'; M= 0,-24,-13,-24,-19, -2,-27,-25, 18,-18, 13, 7,-24,-25,-22,-18,-10, 1, 30,-27, -9,-20; /M: SY='K'; M= -5, -7,-29, -6, 2,-26,-18,-14,-23, 20,-25,-13, -6, 15, 1, 12, -5, -2,-19,-24,-16, 0; /M: SY='K'; M=-10, 2,-30, 3, 19,-30,-20, -8,-30, 42,-28,-12, 0, -8, 12, 26, -8,-10,-22,-22,-12, 15; /M: SY='K'; M=-11, 7,-27, 2, 4,-24,-15, -4,-24, 29,-24,-11, 14,-15, 6, 24, -6, -7,-21,-25,-12, 4; /M: SY='D'; M=-12, 24,-26, 26, 23,-24,-12, 3,-27, 4,-25,-20, 20,-11, 6, -2, 3, -5,-27,-31,-12, 14; /M: SY='M'; M= -7,-26,-20,-32,-25, 1,-28,-17, 30,-19, 20, 33,-24,-24,-15,-18,-18, -7, 26,-23, -3,-21; /M: SY='E'; M= -9, -3,-25, -1, 16,-11,-18, -5,-21, 8,-14, -8, -3,-12, 4, 12, -4, -7,-17,-22, -9, 10; /M: SY='E'; M= 16, 3,-21, 4, 18,-27, -4,-10,-23, -2,-18,-16, -2, -7, 3,-11, 6, -5,-17,-26,-20, 11; /M: SY='A'; M= 23, -4,-13,-11, -4,-17, -8,-16, -9, -9,-13,-11, -2,-11, -7,-14, 13, 10, -2,-27,-17, -6; /M: SY='I'; M= -9,-29,-24,-35,-26, 4,-34,-24, 35,-28, 30, 22,-25,-25,-20,-24,-22, -9, 24,-21, -1,-25; /M: SY='D'; M= -9, 8,-15, 12, 6,-24,-17, -6,-20, 1,-18,-14, 3,-15, -2, 1, -2, -7,-13,-32,-15, 1; /M: SY='C'; M= -6,-10, 14,-12, 0,-18,-23,-12,-18, -5, -7, -8,-11,-21, -4, -7, -8, -6,-12,-31,-15, -2; /M: SY='R'; M= 1, -8,-25,-10, 0,-22,-15, -8,-25, 24,-20,-10, -3,-15, 5, 37, -5, -7,-15,-20,-13, 0; /M: SY='M'; M= -7,-14,-28,-16, -7,-17, -2,-15, -3,-11, -1, 2,-10,-18, -2,-12,-11,-13, -7,-21,-12, -6; /I: I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14; /M: SY='I'; M= -9,-14,-26,-15, 0,-13,-26,-13, 5, -5, 2, 3,-11,-17, 1, -1,-10, -8, 1,-24, -8, -1; /M: SY='L'; M= -7,-20,-20,-25,-17, 4,-27,-20, 10,-17, 18, 7,-17,-22,-15,-10,-13, 3, 7,-20, -2,-17; /M: SY='K'; M=-10, 6,-28, 3, 9,-27, -4, -3,-29, 20,-26,-14, 11,-14, 9, 19, -3, -9,-25,-25,-16, 8; /M: SY='I'; M= -4,-20,-21,-26,-21, -2,-26,-19, 21,-19, 18, 15,-15,-24,-16,-16,-16, -7, 16,-23, -5,-20; /M: SY='D'; M=-16, 27,-27, 30, 14,-28,-11, 3,-31, 9,-26,-21, 23,-14, 5, 15, 0, -7,-27,-34,-17, 8; /M: SY='P'; M=-11, -3,-32, -2, 0,-25,-15, -9,-20, -3,-25,-17, 4, 40, -3, -3, -5, -7,-27,-31,-23, -5; /M: SY='F'; M= -9,-17,-20,-22,-14, 30,-20,-11,-10,-12, -6, -7,-10,-22,-18, -3, -4, -4, -7, -6, 12,-14; /M: SY='D'; M=-14, 21,-28, 23, 14,-28,-11, -1,-27, 10,-25,-18, 18,-13, 6, 8, -1, -8,-25,-31,-17, 9; /M: SY='I'; M= 5,-21,-18,-28,-22, -4,-26,-25, 22,-21, 11, 8,-18,-20,-18,-22, -7, 4, 21,-24, -7,-22; /M: SY='E'; M= -5, -3,-29, 2, 14,-28, 11,-10,-31, 0,-26,-19, -1, 0, 1, -2, 2,-10,-27,-26,-23, 7; /M: SY='F'; M=-11,-17,-23,-19, -6, 10,-24, -5, -2,-15, 9, 4,-14,-18, -8,-11,-13, -8, -6,-17, 3, -7; /M: SY='R'; M= -9, -3,-28, 0, 10,-23, -7, -7,-26, 8,-17,-13, -3,-14, 4, 15, -6,-10,-21,-18,-14, 6; /M: SY='H'; M= -5, -1,-28, -1, 11,-28,-18, 19,-26, 18,-22, -7, 1,-12, 17, 12, -5,-11,-23,-23, -5, 13; /M: SY='G'; M= 0,-10,-23,-13,-11,-16, 5,-14,-14, -5, -5, -5, -5,-20, -9, -4, -8,-10,-11,-22,-15,-10; /M: SY='E'; M=-12, 4,-29, 7, 22,-23,-17, 12,-25, 8,-17,-10, 1,-11, 14, 5, -6,-12,-25,-25, -8, 18; /I: I=-4; MD=-23; /M: SY='E'; M= -5, 3,-17, 3, 12,-17,-16, -6,-13, -2, -8, -7, 0, -8, 8, -3, 4, 10,-12,-22,-10, 10; D=-4; /I: I=-4; MD=-23; /M: SY='D'; M=-10, 3,-24, 7, -1,-17,-17,-11, -7, -6, -9, -8, -4, 6, -6,-11, -7, -5, -9,-23,-11, -5; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='E'; M= -5, -5,-28, -5, 1,-23, -8,-14, -9, 0,-14, -6, -4,-13, 0, -7, -5,-10,-10,-24,-14, -1; /M: SY='D'; M= -5, 8,-25, 14, 11,-28, 8,-10,-29, -3,-25,-19, 4,-12, -2, -9, 5, -7,-20,-31,-21, 4; /M: SY='M'; M=-13,-21,-18,-26,-19, -2,-28, -9, 10, -6, 3, 14,-16,-24, -8, 4,-16, -9, 8,-16, 6,-17; /M: SY='D'; M=-16, 35,-29, 45, 15,-35,-11, -1,-35, 13,-30,-23, 20,-11, 3, 2, -1, -9,-27,-35,-17, 9; /M: SY='L'; M=-11,-10,-21,-16,-14, -1,-21, -9, 6,-17, 22, 11, -4,-26,-11, -8,-17, -7, -2,-25, -6,-13; /M: SY='N'; M= -5, 20,-16, 7, -4,-14, -7, 0,-16, -5,-23,-16, 32,-16, -3, -5, 15, 16,-18,-33,-11, -4; /M: SY='R'; M= 3,-14,-20,-17, -7,-15,-20,-14, -2, -1, -7, -3,-11,-18, -3, 7, -3, -3, 6,-24,-12, -7; /M: SY='V'; M= -1,-30,-11,-30,-29, 1,-30,-29, 29,-21, 12, 11,-30,-30,-29,-20,-11, -1, 48,-29, -9,-29; /M: SY='R'; M=-20,-10,-26,-11, -1,-20,-20, -1,-30, 28,-20,-10, -1,-21, 9, 67,-10,-10,-20,-21,-11, -1; /M: SY='L'; M=-10,-30,-16,-31,-21, 8,-31,-21, 21,-30, 45, 19,-29,-29,-20,-21,-29,-10, 11,-21, -1,-21; /M: SY='C'; M= -8,-22, 64,-29,-27,-13,-29,-26,-10,-22, -9, -7,-21,-35,-26,-19,-10, -7, 8,-40,-21,-27; /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-39,-29, 77,-30,-18, 0,-29, 9, 0,-20,-30,-38,-19,-20,-10, -1, 11, 33,-29; /M: SY='Q'; M=-11, -3,-27, -3, 13,-29,-19, 3,-21, 12,-18, -4, 0,-12, 34, 22, 0, -4,-23,-22,-11, 22; /M: SY='V'; M= 19,-22,-10,-26,-22, -5,-18,-26, 13,-16, 2, 2,-22,-22,-22,-20, -2, 0, 28,-25,-13,-22; /M: SY='F'; M=-16,-18,-23,-23,-18, 35,-23, 14,-11,-21, -5, -3, -9,-24,-19,-13,-10, -8,-10, -2, 22,-17; /M: SY='I'; M= -9,-26,-16,-29,-22, 3,-31,-20, 21,-19, 21, 14,-24,-27,-19,-17,-20, -8, 18,-19, 2,-22; /M: SY='P'; M=-11,-10,-32, -6, 7,-24,-21,-13,-17, 0,-21,-14, -8, 32, -2, 1, -5, -4,-21,-28,-20, -1; /I: I=-5; MD=-28; /M: SY='D'; M= -7, 15,-25, 23, 13,-30, 5, -4,-29, -2,-23,-18, 6, -9, 6, -7, 2, -9,-24,-26,-18, 10; D=-5; /I: I=-5; MD=-28; /M: SY='P'; M= -6, 0,-24, 5, 14,-26,-13, -5,-19, -1,-21,-13, -2, 19, 12, -6, 4, -4,-22,-25,-17, 11; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-28; IM=0; DM=-28; /M: SY='N'; M= -6, 4,-16, 3, 0,-16, -5, 5,-15, 3,-14, -7, 8,-12, 3, 7, 0, -5,-12,-19, -8, 1; D=-5; /I: I=-5; DM=-28; /M: SY='G'; M= 2, -6,-20, -6,-11,-21, 41,-13,-26,-12,-21,-14, 0,-13,-10,-13, 3,-11,-20,-16,-20,-11; D=-5; /I: I=-5; DM=-28; /M: SY='G'; M= 1, 1,-21, -3, -7,-23, 19, -9,-27, -5,-27,-18, 12,-17, -6, 1, 11, -3,-21,-29,-22, -7; /M: SY='F'; M=-12,-19,-27,-23,-20, 17, 4,-15,-18,-16,-11, -9,-11,-24,-19, -9,-10,-13,-15, 5, 6,-18; /M: SY='T'; M= -6, -6,-19,-11, -6,-15,-20,-14,-12, 8,-12, -4, -5,-11, -4, 8, 2, 16, -4,-26,-10, -6; /M: SY='V'; M= -8,-16,-17,-16, -6, -9,-25,-15, 0, -8, 0, -2,-14,-12, -9, -3, -8, 0, 3,-25, -8, -9; /M: SY='P'; M= -2,-17,-26,-15, -8,-16,-20,-17, -6,-10, -4, -5,-17, 15, -9, -8,-10, -7, -6,-25,-16,-11; /M: SY='L'; M= 0,-20,-17,-22,-15, -1,-20,-17, 9,-22, 21, 8,-17,-22,-14,-17, -7, -1, 6,-26, -7,-14; /M: SY='P'; M= -8, -7,-26, -3, -4,-19,-18,-16,-11,-10, -9, -9,-11, 16, -8,-14, -6, 0,-12,-29,-17, -8; /M: SY='P'; M=-10,-15,-37, -8, 4,-30,-20,-12,-19, -5,-26,-14,-15, 60, 8,-12, -8,-10,-29,-26,-23, 3; /M: SY='V'; M= 3,-27,-13,-30,-27, -2,-28,-28, 27,-20, 10, 9,-25,-26,-25,-21, -9, 0, 39,-27, -9,-27; /M: SY='V'; M= 9,-23,-15,-27,-21, -2,-23,-21, 16,-19, 12, 6,-22,-23,-20,-20, -9, -2, 21,-20, -3,-21; /M: SY='S'; M= 9, -1,-11, 0, 0,-20, -1,-10,-20,-10,-30,-20, 9, -7, 0,-10, 39, 19,-11,-40,-20, 0; /M: SY='B'; M=-11, 22,-24, 22, 10,-26,-12, 2,-19, -2,-22,-15, 21,-14, 5, -5, 3, -5,-20,-35,-16, 7; /M: SY='P'; M= -3,-20,-35,-15, -5,-25,-20,-21,-10,-13,-21,-14,-19, 64,-11,-21, -9, -9,-19,-27,-25,-13; /M: SY='I'; M= -9,-30,-28,-39,-30, 0,-39,-30, 48,-29, 19, 19,-21,-21,-21,-29,-19, -9, 32,-21, -1,-30; /M: SY='Y'; M=-17, -7,-28, -7, 3, 12,-24, 16,-12, -6, -8, -7, -6,-21, -3, -7,-12,-10,-17, 2, 36, -2; /M: SY='D'; M=-15, 27, 10, 35, 3,-33,-10, -8,-36, -9,-27,-26, 11,-19, -9,-15, -2,-10,-25,-41,-23, -3; /M: SY='K'; M= -3, 7,-20, 3, 3,-23, -9, -5,-24, 16,-29,-16, 15,-13, 4, 12, 13, 3,-18,-31,-16, 3; /I: I=-5; MD=-28; /M: SY='K'; M=-11, -2,-28, -2, 10,-29,-19, -2,-26, 33,-24, -7, 0,-11, 23, 31, -7, -9,-21,-19, -9, 15; D=-5; /I: I=-5; MD=-28; /M: SY='A'; M= 18, -7,-15,-11, -4,-19, -5,-11,-17, 1,-17,-12, -1,-12, -1, 8, 12, 3, -8,-24,-16, -4; D=-5; /I: I=-5; MD=-28; /M: SY='P'; M= 3, -7,-17, -6, -2,-17, -9,-13,-13, -8,-19,-13, -4, 23, -5,-12, 11, 8,-12,-25,-17, -5; D=-5; /I: I=-5; MD=-28; /M: SY='N'; M= 9, 10,-14, 0, -3,-18, 4, -3,-14, -4,-17,-11, 17,-12, 0, -6, 7, -2,-15,-23,-15, -1; D=-5; /I: E1=0;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 41 in 41 different sequences |
| Number of true positive hits | 40 in 40 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 1 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 97.56 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes, Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | N_Hulo |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | RHD |
| Version [info] | 6 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
40 sequences
DIF_DROME (P98149), DORS_DROME (P15330), NFAC1_BOVIN (P98201), NFAC1_HUMAN (O95644), NFAC1_MOUSE (O88942), NFAC1_PIG (O77638), NFAC2_HUMAN (Q13469), NFAC2_MOUSE (Q60591), NFAC3_HUMAN (Q12968), NFAC3_MOUSE (P97305), NFAC3_RAT (A0A0G2JTY4), NFAC4_HUMAN (Q14934), NFAC4_MOUSE (Q8K120), NFAC4_RAT (D3Z9H7), NFAT5_HUMAN (O94916), NFAT5_MOUSE (Q9WV30), NFAT5_RAT (D3ZGB1), NFKB1_CANLF (Q6F3J0), NFKB1_CHICK (Q04861), NFKB1_DROME (Q94527), NFKB1_HUMAN (P19838), NFKB1_MOUSE (P25799), NFKB1_RAT (Q63369), NFKB2_CHICK (P98150), NFKB2_HUMAN (Q00653), NFKB2_MOUSE (Q9WTK5), NFKB2_XENLA (O73630), RELB_CHICK (P51509), RELB_HUMAN (Q01201), RELB_MOUSE (Q04863), RELB_XENLA (P51510), REL_AVIRE (P01126), REL_CHICK (P16236), REL_HUMAN (Q04864), REL_MELGA (P01125), REL_MOUSE (P15307), TF65_CHICK (P98152), TF65_HUMAN (Q04206), TF65_MOUSE (Q04207), TF65_XENLA (Q04865)» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot False positive sequences |
1 sequence
HELZ_DANRE (Q6NYU2) |
| PDB [Detailed view] |
122 PDB
1A02; 1A3Q; 1A66; 1GJI; 1IKN; 1IMH; 1LE5; 1LE9; 1LEI; 1MDI; 1MDJ; 1MDK; 1NFA; 1NFI; 1NFK; 1OOA; 1OWR; 1P7H; 1PZU; 1RAM; 1S9K; 1SVC; 1VKX; 2AS5; 2I9T; 2O61; 2O93; 2RAM; 2V2T; 3DO7; 3GUT; 3QRF; 5U01; 5ZMC; 6GGR; 6NV2; 6QHL; 6YOW; 6YOX; 6YOY; 6YP2; 6YP3; 6YP8; 6YPL; 6YPY; 6YQ2; 7BI3; 7BIQ; 7BIW; 7BIY; 7BJB; 7BJF; 7BJL; 7BJW; 7BKH; 7CLI; 7NJ9; 7NJB; 7NK3; 7NK5; 7NLA; 7NLE; 7NM1; 7NM3; 7NM9; 7NMH; 7NQP; 7NR7; 7NSV; 7NV4; 7NVI; 7NWS; 7NXS; 7NXT; 7NXW; 7NXY; 7NY4; 7NYE; 7NYF; 7NYG; 7NZ6; 7NZG; 7NZK; 7NZV; 7O34; 7O3A; 7O3F; 7O3P; 7O3Q; 7O3R; 7O3S; 7O57; 7O59; 7O5A; 7O5C; 7O5D; 7O5F; 7O5G; 7O5O; 7O5P; 7O5S; 7O5U; 7O5X; 7O6F; 7O6G; 7O6I; 7O6J; 7O6K; 7O6M; 7O6O; 7VUP; 7VUQ; 7W7L; 8OW4; 8TKL; 8TKM; 8TKN; 8TQD; 9BDU; 9BDV; 9BDW; 9BDX » more |