PROSITE entry PS50802
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | OTU |
| Accession [info] | PS50802 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-DEC-2001 CREATED;
13-FEB-2019 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50802 |
| Associated ProRule [info] | PRU00139 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | OTU domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=128; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=123; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.7570000; R2=0.0212912; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6203.8706055; R2=3.2879465; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=317; H_SCORE=7246; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=223; H_SCORE=6937; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='L'; M=-10,-25,-23,-26,-20, 7,-16,-12, 10,-24, 30, 17,-24,-28,-16,-18,-24,-11, 2,-13, 7,-19; /M: SY='T'; M= 1, -9,-18,-11, -5, -3,-19, -7, -6, -9, -9, -7, -9,-17, -8,-11, 5, 11, -1,-15, 9, -8; /M: SY='C'; M= -2,-23, 11,-29,-22, -8,-27,-24, 7,-19, 5, 2,-19,-26,-19,-14,-13, -7, 10,-28,-12,-22; /M: SY='I'; M=-11,-20,-25,-24,-14, 0,-29,-16, 8, -6, 5, 6,-15,-21, -6, -1,-15, -9, 6,-18, -1,-11; /M: SY='H'; M=-14, 6,-29, 4, 6,-18,-16, 25,-22, 3,-23,-11, 12, -3, 4, 0, -5,-10,-26,-24, 2, 3; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='V'; M= -3,-19,-14,-24,-21, -3,-27,-24, 21,-18, 6, 6,-16,-19,-19,-18, -4, 10, 26,-24, -6,-21; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='P'; M= -3, -2,-25, -4, 1,-23,-13, -9,-20, 13,-23,-13, 2, 14, 0, 9, -4, -6,-19,-23,-16, -1; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='G'; M= 8,-10,-23,-11,-10,-23, 23,-15,-24, -8,-20,-14, -5, -1,-10, -7, 0,-10,-18,-19,-22,-12; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='D'; M=-18, 44,-27, 62, 18,-35, -9, 0,-35, 0,-27,-27, 18, -9, 0, -9, 0, -9,-27,-35,-18, 9; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='G'; M= 6, -9,-24,-10,-16,-25, 53,-18,-32,-16,-24,-16, -1,-16,-16,-18, 1,-15,-23,-18,-25,-16; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='N'; M=-10, 28,-20, 25, 5,-23, -5, 15,-24, -2,-25,-18, 31,-14, 1, -4, 8, -3,-24,-34,-13, 2; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='C'; M= -6,-15, 90,-23,-23,-18,-23,-24,-25,-24,-19,-18,-14,-32,-23,-24, -3, -5, -9,-43,-25,-23; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='F'; M=-14,-27,-18,-32,-23, 44,-27,-18, 8,-27, 24, 8,-22,-27,-28,-18,-22, -9, 4, -3, 15,-23; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='W'; M=-16,-24,-29,-26,-21, 24,-23, -2, -2,-14, -1, 3,-23,-25,-14,-12,-23,-14,-10, 46, 42,-18; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='H'; M=-18, -5,-27, -5, 0,-18,-18, 38,-27, 12,-18, -5, 4,-18, 9, 36, -9,-13,-21,-21, 2, 0; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='A'; M= 34,-10, -9,-17,-10,-15, -4,-18, -5,-10, -9, -8, -9,-11,-10,-17, 10, 2, 5,-21,-16,-10; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='V'; M= 2,-23,-16,-26,-23, 1,-25,-18, 22,-17, 7, 7,-20,-21,-19,-19,-10, -4, 24,-15, 4,-23; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='A'; M= 11, -8, 5,-10, -1,-15,-10,-14,-13,-12, -9,-10, -7,-14, -7,-14, 7, 1, -6,-28,-17, -4; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='V'; M= -4, -5,-16, -6, 0,-13,-16, -9, -1, -7, -4, -3, -2,-16, 0, -7, 0, -1, 1,-27,-11, 0; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='Y'; M= -8,-11,-23,-13,-11, -5, 3, -3, -7,-10, -8, -3, -8,-16, -3,-10, -8,-10,-10, -3, 11, -9; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='L'; M=-10,-23,-19,-25,-18, 15,-20,-14, 7,-19, 20, 13,-22,-22,-15,-14,-22,-10, 1, 11, 8,-15; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='G'; M= -5,-16,-25,-17,-13,-12, 3,-15, -8,-15, -7, -5,-11,-18, -5,-14, -7,-10,-11, 3, -7, -9; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='L'; M= -4,-14,-18,-14, -6, -8, -7,-13, -1,-14, 6, 6,-12,-18, -9,-13, -6, -5, 0,-23,-10, -7; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='Y'; M= -2,-12,-21,-12, 0, -2,-21, -6, 2, -8, -2, -2,-13,-15, -6,-12, -7, -6, 1, -9, 11, -4; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='A'; M= 7, -3,-17, -4, -2,-16,-10, -7, -7, -8, -3, 2, -5,-13, 3,-10, 1, -3, -6,-23,-11, 0; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='R'; M=-12, -4,-22, -3, -5, -7,-19, -3, -9, 2, -2, 2, -6,-17, -3, 5, -9, -2, -8,-15, 4, -5; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='E'; M= -5, 3,-17, 4, 18,-18,-13, -3,-15, 9,-13, -8, 0, -4, 12, 4, 1, 2,-14,-17, -9, 15; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='D'; M= -8, 12,-16, 16, 10,-16,-10, -3,-13, -1, -9, -4, 3, -6, 1, -5, 0, 1,-11,-21, -9, 5; D=-1; /I: I=-1; MD=-3; /M: SY='L'; M= -5, -9,-10,-10, -6, -1,-13, -8, 0, -5, 9, 3, -8,-11, -5, 2, -6, 3, 0,-11, -3, -6; D=-1; /I: I=-1; MI=0; MD=-3; IM=0; DM=-3; /M: SY='E'; M= -8, -9,-22, -7, 10, 0,-21, -6, -8, -6, -7, -2,-10,-15, -3, -9, -3, -5, -6,-18, 1, 4; /M: SY='L'; M= -9,-26,-21,-30,-21, 12,-28,-21, 19,-27, 27, 12,-21,-25,-20,-21,-17, -6, 11,-19, 1,-21; /M: SY='R'; M=-18, -8,-30, -8, 2,-22,-20, -2,-30, 35,-22,-10, 0,-18, 10, 60,-10,-10,-20,-20,-10, 2; /M: SY='E'; M= -9, 5,-24, 6, 8,-20,-16, -5,-15, 0, -8, -7, 4,-15, 6, -2, -2, -5,-16,-29,-12, 7; /M: SY='A'; M= 4, 0,-21, -3, -1,-15,-15,-10, -3,-10, -1, 1, -2,-15, -5,-14, -5, -6, -5,-26,-12, -4; /M: SY='T'; M= 0,-17, 0,-23,-18, -8,-24,-22, 2,-14, 2, -1,-14,-21,-15,-10, -4, 8, 8,-27,-11,-18; /M: SY='V'; M= 3,-14, 3,-15,-10,-14,-20, -6, -4,-14, -9, -5,-13,-22,-13,-15, 0, -3, 9,-33,-13,-12; /M: SY='R'; M= -2, -4,-21, -8, 1, -6,-15, -9,-15, 1,-10, -9, 2,-16, -4, 3, -1, -3,-13,-22, -9, -1; /M: SY='F'; M=-16,-14,-24,-18, -7, 23,-25, -7,-13, -5, -5, -6,-10,-21,-12, 7,-10, -2,-10, -5, 15, -9; /M: SY='M'; M= -2, -8,-21,-13, -2,-11,-18, -5, 0, -9, 8, 14, -7,-18, 4, -9,-10, -8, -6,-23, -8, 1; /M: SY='K'; M= -3, -5,-24, -6, 7,-20,-19,-11,-19, 18,-13, -8, -5,-12, 3, 14, -5, -2,-13,-23,-11, 4; /M: SY='E'; M= -1, -1,-21, -3, 11,-10,-15, -6,-14, -6, -9, -9, 1,-13, 4, -7, 2, -4,-15,-24,-11, 8; /M: SY='H'; M=-10, 3,-23, -2, 3,-17,-20, 15,-14, -1,-15, -7, 8,-14, 1, -2, 1, 5,-14,-29, -4, 0; /M: SY='R'; M= -4, 4,-25, 7, 11,-26,-14, -6,-28, 18,-24,-15, 3,-11, 6, 20, 1, -5,-19,-26,-15, 7; /M: M= -1, -4, -3, -9, -4,-17, -7,-13,-18, -8,-10,-11, -1,-19, -8, -4, -1, -1,-13,-29,-17, -6; /M: M= -3, -6,-24, -6, -1,-15,-20,-14, -1, -9, -2, -3, -6,-15, -5, -5, -5, -5, -3,-26,-11, -5; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='F'; M=-16, 5,-22, 4, -8, 20,-17, -3,-13,-12, -8,-11, 3,-20,-16,-11, -8, -8,-13, -8, 13,-11; D=-2; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='E'; M= -3,-11,-20,-11, 5, 0,-19,-12, -7, -4, 5, -2,-12,-14, -6, -7,-11, -8, -7,-16, -4, 0; D=-2; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='P'; M= -9,-10,-30, -7, 6,-23,-20,-14,-13, 6,-19,-10,-10, 30, -2, -4, -9, -9,-16,-23,-16, 0; D=-2; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='F'; M=-13,-17, 1,-22,-12, 36,-22,-14, -7,-18, 0, -5,-13,-21,-22,-14,-12, -8, -5, -5, 9,-15; D=-2; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='I'; M= -2,-13,-19,-17, -5, 1,-19,-13, 3, -7, 0, 0, -9,-13, -8, -3, -7, -6, 1,-13, -3, -8; D=-2; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='W'; M= -8, -5,-23, -2, -3,-13,-13,-12,-14, -3,-12,-10, -8, -1, -5, -6, -6, -6,-14, 1, -6, -4; D=-2; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='S'; M= 0, 0,-14, 1, 8,-18, 3, -4,-17, -2,-17,-10, 3, -6, 8, -4, 10, 0,-14,-19,-13, 8; D=-2; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='D'; M= -4, 2,-15, 6, 5,-14, 1, -7,-14, -7, -7, -9, 0, -9, -3, -8, 1, -4,-11,-19,-11, 1; D=-2; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='P'; M= -6, -9,-18, -9, -1, -2, -3, -8, -9, -7, -7, 0, -8, 3, -6, -9, -6, -8,-11,-12, -7, -3; D=-2; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='S'; M= 4, 5,-11, 5, 1,-15, -6, -8,-14, 2,-14,-10, 2, -6, -1, -3, 8, 6, -8,-19,-10, 0; D=-2; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='V'; M= -1, -6, -9, -9,-10, -4,-12,-10, 5,-10, 2, 0, -2,-16,-10, -9, 0, 1, 9,-21, -8,-10; D=-2; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='A'; M= 10, -1,-10, -3, 6,-13, -5, -7,-10, 5, -9, -6, -3, -4, 1, -1, 1, -3, -6,-12, -9, 4; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11; /M: SY='Y'; M=-16, 1, -8, -1, -6, -7,-21, 6,-18, -3,-15,-10, 1,-24, 1, 0, -8, -9,-19,-11, 18, -5; /M: SY='Y'; M=-14,-25, -5,-29,-23, 19,-29, -8, 6,-22, 19, 12,-24,-30,-19,-17,-22,-10, 1, -7, 21,-21; /M: SY='C'; M=-10, -1, 11, 1, 4,-27,-22,-12,-23, 4,-20,-13, -6,-19, 1, -3, -6, -9,-13,-33,-18, 2; /M: SY='E'; M= -3, 9,-25, 13, 29,-26,-16, -5,-26, 6,-19,-17, 1, -6, 8, 3, 3, -1,-21,-29,-18, 18; /M: SY='Q'; M=-10, -8,-25, -7, 12,-19,-22, -4, -8, 2, -3, 4,-10,-15, 15, 6, -9, -9, -9,-24,-10, 13; /M: SY='E'; M= -8, 2,-22, -1, 15,-16,-15, 0, -9, -1, -8, 10, 2,-11, 7, -5, -1, -5,-13,-29,-12, 11; /M: M= 0, -7,-26,-12, -8,-18, -5,-13,-13, -4,-18,-10, -1,-16, 0, -8, -2, -8,-15, -2, -9, -4; /M: SY='P'; M=-10, 6,-30, 11, 17,-27,-16, -8,-24, -2,-25,-20, 3, 28, 0,-10, 0, -1,-26,-32,-22, 7; /M: SY='K'; M= -4, -1,-27, 2, 5,-26,-17,-10,-20, 13,-16, -9, -5, 0, 5, 3, -8, -9,-17,-24,-14, 4; /M: SY='V'; M= 1,-13,-18,-14, 0,-10,-21,-15, 2,-10, 4, 5,-15,-16, -7,-13, -5, 1, 7,-26,-11, -4; /M: SY='W'; M=-19,-30,-42,-30,-21, 8,-22,-12,-15,-13,-15,-12,-30,-27, -7,-13,-30,-22,-25, 97, 37,-12; /M: SY='A'; M= 7, -6,-22, -5,-10,-20, 6,-17,-15, -7,-10, -9, -7,-17,-12,-12, -4, -9, -7,-24,-17,-11; /I: I=-2; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9; /M: SY='E'; M= -4, 6,-21, 10, 11,-24, 8, -9,-26, -5,-21,-17, 4, -9, -1, -9, 7, 0,-20,-26,-19, 5; D=-2; /I: I=-2; DM=-9; /M: SY='Q'; M=-11, 10,-23, 10, 13,-23,-14, 16,-17, 1,-15, -1, 9,-11, 18, 0, -2, -9,-21,-25, -7, 15; D=-2; /I: I=-2; DM=-9; /M: SY='L'; M= 1,-15,-16,-18, -8, -5,-21,-18, 9,-15, 12, 4,-15,-16,-11,-15, -8, 1, 9,-21, -7,-10; D=-2; /I: I=-2; DM=-9; /M: SY='E'; M= 7, 1,-19, 2, 19,-21,-10, 7,-20, -1,-16,-12, 0, -6, 6, -6, 6, -4,-16,-25,-12, 12; D=-2; /I: I=-2; DM=-9; /M: SY='I'; M= -7,-26,-21,-31,-23, 2,-31,-23, 33,-25, 24, 16,-21,-21,-19,-22,-19, -7, 24,-19, -1,-23; D=-2; /I: I=-2; DM=-9; /M: SY='N'; M= -6, -5,-17,-10,-10, 0, -4,-10,-13, -9, -8, -8, 3,-17,-10, -1, 1, 2,-10,-19, -7,-10; D=-2; /I: I=-2; DM=-9; /M: SY='A'; M= 23, -3,-11, -6, -7,-17, -5,-15, -8, -9,-11,-10, -5,-11, -9,-15, 9, 1, 2,-23,-16, -8; D=-2; /I: I=-2; DM=-9; /M: SY='L'; M= -7,-20, 0,-23,-17, 1,-23,-16, 8,-21, 24, 14,-20,-23,-15,-16,-16, -1, 5,-22, -5,-16; D=-2; /I: I=-2; DM=-9; /M: SY='C'; M= 6,-10, 21,-16,-14,-16,-15,-20,-11,-18,-16,-13, -5,-19,-13,-19, 13, 10, -3,-37,-19,-14; /M: SY='C'; M=-10, -7, 12,-13,-12, -5,-19, -1,-18,-11,-12, -9, 0,-25,-12,-10, -4, -6,-13,-30, -7,-12; /M: SY='L'; M= -2,-21, -1,-29,-21, 5,-25,-20, 8,-22, 13, 9,-19,-24,-19,-20,-12, -1, 6,-22, -4,-20; /M: SY='Y'; M= -7,-21,-24,-24,-19, 15,-25, 2, 6,-15, 14, 12,-21,-26,-11,-14,-19, -9, -1, 4, 36,-17; /M: SY='R'; M=-12, 2, -7, -4, -5,-23, -5, -5,-29, 11,-25,-15, 12,-21, -2, 23, -4, -9,-22,-29,-18, -5; /M: SY='R'; M= -9,-10,-24,-12, -5,-15,-21,-12,-10, 10, -9, -4, -5,-16, -1, 17, -3, 2, -6,-24, -9, -5; /M: SY='H'; M=-15, -1,-29, -2, -4, -9,-20, 4,-15, 0,-16, -9, 3, -4, -5, 3, -9,-10,-17,-23, -5, -6; /M: SY='I'; M= -9,-30,-23,-36,-29, 10,-35,-28, 35,-28, 20, 15,-24,-25,-25,-25,-19, -8, 29,-19, 1,-29; /M: SY='I'; M=-12,-14,-27,-17,-16,-10,-30,-19, 16,-10, 2, 5,-11,-20,-11, -2,-14, -9, 12,-24, -6,-17; /M: SY='I'; M= -7,-30,-22,-35,-27, 3,-35,-27, 37,-27, 25, 17,-25,-25,-23,-25,-20, -7, 30,-23, -3,-27; /M: SY='Y'; M=-14,-16,-28,-16, -9, 7,-29, 1, 3, -4, -2, 0,-16,-22, -7, -8,-15, -9, -1, 3, 35,-11; /I: I=-1; MD=-8; /M: SY='Y'; M= -7,-10,-18,-10, -1, 3,-16, -5,-10, -6, -5, -6, -6,-16, -5, -1, 1, -1, -9,-14, 5, -4; D=-1; /I: I=-1; MD=-8; /M: SY='E'; M= -7, -1,-23, 4, 8,-20, -6, -9,-14, -5,-12, -5, -6, 1, -3,-10, -5, -9,-11,-25,-16, 2; D=-1; /I: I=-1; MD=-8; /M: SY='H'; M= -8, 0,-25, 4, -1,-17, -3, 7,-22, -1,-21,-12, 0, -2, -2, -5, -1, -7,-20,-19, -2, -4; D=-1; /I: I=-1; MD=-8; /M: SY='N'; M= -4, 2,-18, -6, -1, -3,-11, -3,-11, -1, -9, -2, 8,-15, -3, 2, -3, -5,-12,-19, -7, -2; D=-1; /I: I=-1; MD=-8; /M: SY='L'; M= -8,-10,-19, -8,-10, -8,-20,-13, 2,-14, 7, 6,-13, -4,-11,-14,-10, 0, 2,-24, -9,-11; D=-1; /I: I=-1; MD=-8; /M: SY='D'; M= -3, 9,-21, 13, 1,-24, 1, 5,-26, -2,-21,-15, 6,-12, -1, 1, 3, -6,-19,-26,-13, -1; D=-1; /I: I=-1; MD=-8; /M: SY='T'; M= 5, -6,-15, -7, 0,-15,-13,-15, -9, -7,-12,-10, -6, 2, -6,-11, 9, 12, -2,-26,-15, -4; D=-1; /I: I=-1; MD=-8; /M: SY='S'; M= -4, -9,-21, -6, 0,-11, -4, -8,-13,-10,-10,-10, -6, -1, -5,-11, 2, -3,-14,-19, -6, -4; D=-1; /I: I=-1; MD=-8; /M: SY='M'; M= -6, -4,-17, -7, 0, -3,-15, -5, -5, -6, -7, 1, 0,-15, 1, -6, 0, -3, -5,-21, -6, 1; D=-1; /I: I=-1; MD=-8; /M: SY='V'; M= 0,-16,-17,-15,-16,-14, 4,-20, -4,-15,-11, -6,-12, -7,-17,-16, 1, -4, 6,-25,-17,-17; D=-1; /I: I=-1; MD=-8; /M: SY='G'; M= -5, -2,-19, -8,-10, -7, 7,-13,-19, -5,-16,-11, 4,-15,-11, -6, 2, 4,-14,-18,-10,-10; D=-1; /I: I=-1; MD=-8; /M: SY='E'; M= -7, 4,-22, 7, 9,-16,-12, -8,-16, -4,-17,-15, 2,-12, -1, -8, 0, -5,-13, -7,-10, 5; D=-1; /I: I=-1; MD=-8; /M: SY='H'; M=-12, 4,-22, 0, 3, -9,-15, 15,-14, -1, -9, -6, 10,-17, 1, 5, -6, -7,-18,-18, 4, 0; D=-1; /I: I=-1; MD=-8; /M: SY='N'; M=-12, -1,-24, -6, -5, 0,-15, -2,-15, 3,-16,-10, 6, -5, -5, 6, -7, -6,-17,-13, 3, -7; D=-1; /I: I=-1; MD=-8; /M: SY='L'; M= -4, -7,-20, -6, -3, 4,-18, -8, -5,-12, 6, -2,-11,-17,-10,-13,-11, -7, -6,-11, 6, -6; D=-1; /I: I=-1; MD=-8; /M: SY='P'; M= -2, 2,-23, 6, -1,-21,-15,-14,-11, -9,-15,-12, -4, 15, -7,-15, -1, 0,-11,-26,-16, -6; D=-1; /I: I=-1; MD=-8; /M: SY='E'; M= -5, -3,-21, 1, 18,-17,-16, -9,-14, -4, -9,-11, -5, 5, 2, -8, 2, 2,-15,-26,-15, 9; D=-1; /I: I=-1; MD=-8; /M: SY='S'; M= -1, 4,-17, 0, -1,-20, 2, -9,-21, 6,-24,-14, 10,-11, -1, 1, 11, 6,-15,-26,-15, -1; D=-1; /I: I=-1; MD=-8; /M: SY='D'; M= -7, -2,-19, 1, 0, -6, -5,-10,-13, -1,-11, -9, -4,-13, -8, -5, -5, -7, -7,-16, -8, -3; D=-1; /I: I=-1; MD=-8; /M: SY='D'; M= -9, 10,-19, 15, 4,-20, 2, -4,-23, 7,-18,-13, 5, -9, 0, 7, -2, -8,-17,-18,-12, 1; D=-1; /I: I=-1; MD=-8; /M: SY='D'; M= -5, 5,-15, 8, 4,-18, 3, -3,-17, 5,-14, -8, 3, -6, 6, 1, -1, -6,-14,-13, -9, 5; D=-1; /I: I=-1; MD=-8; /M: SY='I'; M= -4, -9,-15,-12, -8, -9, -4, -9, 5, -9, -1, 3, -5, -9, 0, -9, -5, -6, 0,-10, -5, -5; D=-1; /I: I=-1; MD=-8; /M: SY='P'; M= -4, -9,-14, -9, -6, -2,-12, -5, 1, -8, -5, -3, -6, 4, -5, -9, -1, -1, -3, -7, 4, -8; D=-1; /I: I=-1; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8; /M: SY='V'; M= -8,-14,-19,-14,-18, -1,-27,-17, 13,-17, 7, 3,-17,-24,-18,-17,-10, 1, 17,-21, 3,-19; /M: SY='G'; M= -7,-21,-27,-21,-17, -1, 2,-20,-13,-21, -5, -8,-16, -9,-19,-19,-11,-11,-14, -1, -7,-17; /M: SY='L'; M=-12,-27,-23,-30,-24, 21,-31,-13, 18,-24, 23, 11,-25,-29,-21,-19,-22, -9, 12, -5, 23,-24; /M: SY='Y'; M=-11,-12, -8,-17,-15, -6,-25, 1, 0,-11, -2, 1, -7,-25,-12,-11,-13, -9, 0,-22, 4,-15; /M: SY='R'; M=-14, -8,-24,-15,-13, 2,-22, -9, -1, -8, 5, 1, 1,-24,-10, 6,-13, -8, -6,-21, -4,-13; /I: I=-4; MD=-23; /M: SY='H'; M= -2, -9,-15, -9, -8, -9, 0, 3, -9,-14, -2, -3, -3,-15, -6,-10, 1, -3, -8,-21, -6, -8; D=-4; /I: I=-4; MD=-23; /M: SY='N'; M= 1, 6,-10, 0, -4, -3, -4, 3, -6, -3, -9, -6, 11,-10, -3, -4, 1, -1, -9, -8, 3, -4; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='G'; M= -6, -6,-10, -5, 1,-28, 3, 0,-28,-10,-25,-15, -3, -4, 2,-11, 2,-10,-25,-30,-19, 0; /M: SY='N'; M=-10, 7,-26, 3, 7,-24, -4, 12,-22, 4,-20, -4, 13,-15, 11, 2, -3,-10,-24,-27,-11, 8; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='F'; M=-17,-22,-22,-29,-24, 50,-29, -5, -1,-20, 4, -1,-17,-27,-25,-15,-15, -2, -4, 12, 43,-24; /M: SY='D'; M= -5, 22, -6, 27, 1,-27,-12, -9,-23, -7,-21,-20, 10,-17, -9,-14, 0, -6,-13,-37,-20, -4; /M: SY='P'; M= -2,-16,-21,-16,-11,-13,-20,-20, 1,-16, -6, -5,-12, 9,-12,-17, 3, 7, 1,-30,-15,-14; /M: SY='V'; M= 8,-25,-15,-29,-22, -2,-24,-25, 20,-22, 17, 9,-24,-24,-21,-21,-12, -4, 25,-24, -8,-22; /M: SY='Y'; M=-10,-23,-22,-24,-22, 7,-30,-10, 15,-10, 3, 5,-22,-26,-17,-12,-15, -6, 17, -6, 24,-22; /M: SY='P'; M= -3, -6,-27, -4, -2,-15,-17,-16,-19, -4,-20,-15, -9, 25,-10,-11, -3, -1,-17,-24,-15, -7; /M: SY='I'; M= -3,-20,-22,-25,-16, 2,-26,-21, 9, -6, 5, 5,-16,-20,-15,-10,-14, -8, 9,-17, -2,-16; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 91 in 91 different sequences |
| Number of true positive hits | 91 in 91 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 8 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 91.92 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria), Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | OTU |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
91 sequences
ALG13_HUMAN (Q9NP73), ALG13_MOUSE (Q9D8C3), L_CCHFI (Q6TQR6), L_DUGBA (Q66431), L_RSVT (Q85431), OTU10_ARATH (Q9LZF7), OTU11_ARATH (Q0V869), OTU12_ARATH (Q9SGA5), OTU1_ARATH (Q8LG98), OTU1_BOVIN (Q05B57), OTU1_CHICK (Q5F3A6), OTU1_DANRE (Q567B1), OTU1_DICDI (Q55BI3), OTU1_DROME (Q9VRJ9), OTU1_DROPS (Q29FC9), OTU1_HUMAN (Q5VVQ6), OTU1_MOUSE (Q8CB27), OTU1_RAT(Q32Q05), OTU1_SCHPO (O13974), OTU1_XENLA (Q0IH43), OTU1_YEAST (P43558), OTU2_ARATH (Q9LPT6), OTU2_SCHPO (Q9UUK3), OTU2_YEAST (P38747), OTU3_ARATH (Q8GYW0), OTU4_ARATH (Q8LBZ4), OTU5A_DANRE (Q08BW0), OTU5A_XENLA (Q7ZX21), OTU5B_XENLA (Q640H3), OTU5_ARATH (Q9LYC7), OTU6A_HUMAN (Q7L8S5), OTU6A_MOUSE (Q6IE21), OTU6B_CHICK (Q5ZIP6), OTU6B_DANRE (Q7ZV00), OTU6B_HUMAN (Q8N6M0), OTU6B_MOUSE (Q8K2H2), OTU6B_XENLA (Q6GM06), OTU6B_XENTR (Q5M8L0), OTU6_ARATH (Q9XIP2), OTU7A_HUMAN (Q8TE49), OTU7A_MOUSE (Q8R554), OTU7B_HUMAN (Q6GQQ9), OTU7B_MOUSE (B2RUR8), OTU7_ARATH (F4K3M6), OTU8_ARATH (O80949), OTU9_ARATH (Q8LBW2), OTUB1_HUMAN (Q96FW1), OTUB1_MOUSE (Q7TQI3), OTUB1_RAT (B2RYG6), OTUB2_HUMAN (Q96DC9), OTUB2_MOUSE (Q9CQX0), OTUBL_CAEBR (A8XDJ2), OTUBL_CAEEL (Q9XVR6), OTUBL_DROME (Q9VL00), OTUD1_HUMAN (Q5VV17), OTUD1_MOUSE (Q9CUB6), OTUD3_HUMAN (Q5T2D3), OTUD3_MOUSE (B1AZ99), OTUD4_HUMAN (Q01804), OTUD4_MOUSE (B2RRE7), OTUD5_HUMAN (Q96G74), OTUD5_MOUSE (Q3U2S4), OTUD5_RAT (Q2YDU3), OTUD5_XENTR (Q6GL44), OTUD_DROME (Q9VR20), OTU_DROME (P10383), POLG_CILVC (Q1KZ59), RDRP_ASPVP (Q64962), RDRP_BBSCV (Q65652), RDRP_CLBVS (Q91QZ3), RDRP_PVMR (P17965), TNAP3_HUMAN (P21580), TNAP3_MACFA (Q4R8W3), TNAP3_MOUSE (Q60769), TRBID_DROME (Q9VH90), VCIP1_HUMAN (Q96JH7), VCIP1_MOUSE (Q8CDG3), VCIP1_RAT (Q8CF97), VF232_IIV3 (Q196X6), VF232_IIV6 (Q91FU0), VG65_ICHVA (Q00106), VL96_IRV1 (P22856), Y4757_DICDI (Q54P70), Y483_CHLPN (Q9Z868), ZRAN1_BOVIN (A6QP16), ZRAN1_HUMAN (Q9UGI0), ZRAN1_MOUSE (Q7M760), ZRAN1_XENTR (B1H2Q2), ZRN1A_XENLA (Q5U595), ZRN1B_DANRE (A0JMQ9), ZRN1B_XENLA (Q6NUB7)» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
8 sequences
OTULL_HUMAN (Q9NUU6), OTULL_MOUSE (Q3TVP5), OTULL_RAT (Q3B7D8), OTUL_HUMAN (Q96BN8), OTUL_MOUSE (Q3UCV8), POLN_TYMV (P10358), POLN_TYMVA (P20128), POLN_TYMVC (P28477)» more |
| PDB [Detailed view] |
70 PDB
1TFF; 2VFJ; 2ZFY; 3BY4; 3C0R; 3DKB; 3PFY; 3PHU; 3PHW; 3PHX; 3PRM; 3PRP; 3PSE; 3PT2; 3TMO; 3TMP; 3VON; 3ZJD; 3ZJE; 3ZJF; 3ZJG; 3ZNH; 3ZNV; 3ZNX; 3ZRH; 4BOP; 4BOQ; 4BOS; 4BOU; 4BOZ; 4DDG; 4DDI; 4DHI; 4DHJ; 4DHZ; 4FJV; 4HXD; 4I6L; 4KSJ; 4LDT; 5DQ6; 5LRU; 5LRV; 5LRW; 5LRX; 5OE7; 5QIO; 5QIP; 5QIQ; 5QIR; 5QIS; 5QIT; 5QIU; 5QIV; 5QIW; 5QIX; 5QIY; 5QIZ; 5V3B; 5V3P; 5V5G; 5V5H; 5V5I; 6I9C; 7PL7; 8C83; 8CAH; 8CAS; 8CBJ; 8CMS » more |