PROSITE logo

PROSITE entry PS50811


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry

Entry name [info] WRKY
Accession [info] PS50811
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-MAY-2002 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE;
29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC50811
Associated ProRule [info] PRU00223

Name and characterization of the entry

Description [info] WRKY domain profile.
Matrix / Profile [info] 
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=66;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=61;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.2606000; R2=0.0114774; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=5967.6030273; R2=5.0532060; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=718; H_SCORE=9596; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=544; H_SCORE=8717; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...
 
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='S';  M= 26, -4,-10, -8, -4,-20,  0,-14,-16,-10,-22,-16,  2,-10, -4,-14, 28, 12, -6,-32,-20, -4;
/M: SY='D';  M= 11, 14,-22, 20, 19,-29, -9, -8,-25, -1,-19,-19,  2, -7,  2,-11,  4, -6,-18,-29,-20, 11;
/M: SY='I';  M= -7,-14,-24,-13,  6,-12,-29,-18, 12,-11,  1,  1,-15,-15, -7,-15, -9, -7, 12,-27,-11, -2;
/M: SY='D';  M=  8, 26,-22, 34,  8,-32, -6, -8,-28, -4,-22,-22,  8,-10, -4,-14,  4, -6,-18,-32,-20,  2;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-23,-33,-23,  7,-33,-23, 29,-30, 41, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 16,-20,  0,-23;
/M: SY='L';  M=-10, -2,-20,-10,-12, -2,-18, -8,  4,-18, 18,  4,  6,-26,-12,-12,-14, -6, -6,-28, -8,-12;
/M: SY='D';  M= -8, 30,-22, 42, 12,-32, -6, -4,-32, -4,-30,-26, 16,-10,  0,-10, 16,  2,-22,-40,-20,  6;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='G';  M=  0,-18,-22,-18,-24,-18, 30,-24,-12,-20,-14, -8,-12,-24,-24,-20, -4,-12,  2,-24,-22,-24;
/M: SY='W';  M=-20,-28,-38,-28,-24, 22,-26,  0, -8,-14, -8, -8,-28,-30,-14,-14,-28,-18,-18, 78, 60,-20;
/M: SY='R';  M=  8,-10,-22,-14, -4,-20,-12, -8,-22, 14,-16,-10, -4,-16,  2, 34, -2, -6,-12,-20,-14, -4;
/M: SY='W';  M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='P';  M= -4,-26,-22,-22,-18,-12,-26,-26, 10,-16, -6, -2,-26, 18,-22,-20,-10, -4, 18,-30,-18,-22;
/M: SY='V';  M= -4,-30,-18,-34,-30,  0,-34,-30, 38,-24, 14, 14,-26,-26,-26,-24,-14, -4, 42,-26, -6,-30;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='N';  M= -2, 24,-16, 12,  0,-20,  0,  2,-20, -4,-30,-20, 40,-16,  0, -4, 22,  8,-22,-40,-20,  0;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='N';  M=-14, 16,-24,  4, -8,  0,-12, 14,-12, -4,-18,-12, 28,-24, -4, -4, -2, -4,-22,-12, 20, -8;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='G';  M=  6, -4,-18, -4, -8,-24, 28,-14,-28,-14,-30,-20,  6,-14, -8,-14, 24,  4,-18,-32,-24, -8;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='R';  M=-14, -4,-30, -4,  6,-26,-20, -6,-30, 42,-26,-10,  0,-14, 10, 46,-10,-10,-20,-20,-10,  6;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='T';  M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='K';  M=  7, -3,-24, -6,  7,-30,-14, -7,-21, 20,-21, -7, -3,-10, 20,  9, -1, -7,-17,-20,-13, 14;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='P';  M=-10, -7,-26, -9, -8,-11,-18,-11, -4,-15,  2, -4, -1, 10,-11,-14,-12, -7,-14,-29,-15,-11;
/M: SY='V';  M= 20,-22,-10,-26,-22, -8,-18,-26, 14,-16,  2,  2,-22,-22,-22,-20, -2,  0, 30,-26,-14,-22;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='H';  M=-16,  0,-30,  0,  8,-28,-20, 64,-26, -2,-20,  0,  6,-16, 30,  4, -6,-16,-30,-26,  8, 16;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='N';  M= 14, 13,-14,  2, -3,-20,  0, -5,-17, -6,-24,-17, 24,-14, -3, -9, 19,  6,-15,-34,-20, -3;
/M: SY='R';  M= -2, -4,-18, -4,  0,-20, -8, -6,-24,  6,-26,-16,  6,-14,  4, 22, 20,  8,-14,-32,-16,  0;
/M: SY='H';  M= -2,  0,-16, -3, -3,-17,-12, 21,-20,-10,-21,-11,  7,-13,  0, -7, 19, 16,-13,-34, -5, -3;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='P';  M= -4,-17,-28,-17, -9,-18,-21,-20,  2,-16,-14, -8,-11, 27,-10,-20,  1, -1, -6,-30,-18,-13;
/M: SY='K';  M=-13, -3,-30, -3,  7,-27,-20, -7,-30, 44,-27,-10,  0,-13, 10, 42,-10,-10,-20,-20,-10,  7;
/M: SY='M';  M= 13,-11,-14,-18,-11,-12, -8, -9, -1,-10, -4, 15, -8,-14, -3,-13,  7,  2,  1,-26,-12, -7;
/M: SY='F';  M= -8,-30,-14,-34,-30, 32,-30,-26, 18,-24, 10,  6,-26,-30,-34,-20,-14, -4, 30,-14,  6,-30;
/M: SY='I';  M= -7,-30,-24,-37,-30,  0,-37,-30, 44,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 36,-23, -3,-30;
/M: SY='T';  M=  0,-12,-10,-18,-18, -6,-24,-24,  6,-14, -2, -2,-12,-18,-18,-14,  8, 30, 20,-30,-10,-18;
/M: SY='T';  M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='E';  M= -6,  6,-22,  8, 32,-22,-20, -8,-22,  2,-16,-16,  0, -4,  8, -4,  8, 14,-18,-30,-16, 20;
/M: SY='G';  M= 20,-10,-22,-14,-16,-26, 42,-20,-28,-16,-22,-16, -4,-16,-16,-20,  4,-12,-18,-20,-26,-16;
/M: SY='K';  M=-10,  4,-30,  8, 30,-30,-20, -6,-30, 34,-26,-14,  0, -6, 14, 18, -6,-10,-24,-24,-14, 22;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='N';  M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='D';  M=-16, 22,-34, 38, 12,-36,-14, -8,-32, -4,-30,-26,  4, 30, -4,-14, -4,-10,-30,-36,-24,  2;
/M: SY='V';  M= 20,-22,-10,-26,-22, -8,-18,-26, 14,-16,  2,  2,-22,-22,-22,-20, -2,  0, 30,-26,-14,-22;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_05 which contains 572'214 sequence entries.


Total number of hits 116 in 99 different sequences
Number of true positive hits 114 in 97 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 2 in 2 different sequences
Number of false negative sequences 1
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 98.28 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 99.13 %

Comments [info]

Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 2
Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Feature key [info] DNA_BIND
Feature description [info] WRKY
Version [info] 4

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences		 97 sequences 

RRS1B_ARATH (Q9FL92), WK452_ORYSI (B8AWM1), WK72A_SOLLC (A0A3Q7GFB5), 

WK72B_SOLLC (D8VNC6), WR451_ORYSJ (Q5W6D6), WR52N_ARATH (E1B328), 
WR52R_ARATH (C4B7M6), WR52W_ARATH (C4B7M5), WRK10_ARATH (Q9LG05), 
WRK11_ARATH (Q9SV15), WRK12_ARATH (Q93WY4), WRK13_ARATH (Q9SVB7), 
WRK14_ARATH (Q9SA80), WRK15_ARATH (O22176), WRK17_ARATH (Q9SJA8), 
WRK18_ARATH (Q9C5T4), WRK19_ARATH (Q9SZ67), WRK19_ORYSJ (Q0DFT7), 
WRK20_ARATH (Q93WV0), WRK21_ARATH (O04336), WRK22_ARATH (O04609), 
WRK23_ARATH (O22900), WRK24_ARATH (Q9FFS3), WRK24_ORYSI (Q6B6R4), 
WRK24_ORYSJ (Q6IEQ7), WRK25_ARATH (O22921), WRK26_ARATH (Q9C5T3), 
WRK27_ARATH (Q9FLX8), WRK28_ARATH (Q8VWJ2), WRK28_ORYSI (B8B0R8), 
WRK28_ORYSJ (Q0DAJ3), WRK29_ARATH (Q9SUS1), WRK30_ARATH (Q9FL62), 
WRK31_ARATH (Q93WT0), WRK32_ARATH (P59583), WRK33_ARATH (Q8S8P5), 
WRK34_ARATH (O65590), WRK35_ARATH (O64747), WRK36_ARATH (Q9CAR4), 
WRK38_ARATH (Q8GWF1), WRK39_ARATH (Q9SR07), WRK40_ARATH (Q9SAH7), 
WRK41_ARATH (Q8H0Y8), WRK42_ARATH (Q9XEC3), WRK43_ARATH (Q8GY11), 
WRK44_ARATH (Q9ZUU0), WRK45_ARATH (Q9S763), WRK46_ARATH (Q9SKD9), 
WRK46_HORVU (Q6VWJ6), WRK47_ARATH (Q9ZSI7), WRK48_ARATH (Q9FGZ4), 
WRK49_ARATH (Q9FHR7), WRK50_ARATH (Q8VWQ5), WRK51_ARATH (Q93WU9), 
WRK51_ORYSI (Q6IEN1), WRK51_ORYSJ (Q0JEE2), WRK52_ARATH (P0DKH5), 
WRK53_ARATH (Q9SUP6), WRK54_ARATH (Q93WU8), WRK55_ARATH (Q9SHB5), 
WRK56_ARATH (Q8VWQ4), WRK57_ARATH (Q9C983), WRK58_ARATH (Q93WU7), 
WRK59_ARATH (Q9SJ09), WRK60_ARATH (Q9SK33), WRK61_ARATH (Q8VWV6), 
WRK62_ARATH (Q9LZV6), WRK62_ORYSI (B8BF91), WRK62_ORYSJ (Q6EPZ0), 
WRK63_ARATH (Q9C6H5), WRK64_ARATH (Q9C557), WRK65_ARATH (Q9LP56), 
WRK66_ARATH (Q9M8M6), WRK67_ARATH (Q93WV7), WRK68_ARATH (Q93WV6), 
WRK69_ARATH (Q93WV5), WRK70_ARATH (Q9LY00), WRK70_SOLLC (K4BIZ9), 
WRK71_ARATH (Q93WV4), WRK71_ORYSI (Q6IEL0), WRK71_ORYSJ (Q6QHD1), 
WRK72_ARATH (Q9LXG8), WRK74_ARATH (Q93WU6), WRK75_ARATH (Q9FYA2), 
WRK76_ORYSI (Q6IEK5), WRK76_ORYSJ (Q6EPZ2), WRKY1_ARATH (Q9SI37), 
WRKY1_DICDI (Q554C5), WRKY1_MAIZE (Q32SG4), WRKY2_ARATH (Q9FG77), 
WRKY3_ARATH (Q9ZQ70), WRKY4_ARATH (Q9XI90), WRKY5_ORYSJ (Q75L34), 
WRKY6_ARATH (Q9C519), WRKY7_ARATH (Q9STX0), WRKY8_ARATH (Q9FL26), 
WRKY9_ARATH (Q9C9F0)
» more

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences		 1 sequence 

AVAE_ASPVE  (P9WEK6)


				
	

	

		UniProtKB/Swiss-Prot
False positive sequences		
		
			2 sequences
			


			
ATAT1_TRYCC (Q4CQJ5), ATAT2_TRYCC (Q4DTX9)


				
	

	

		PDB
[Detailed view]		
		
			13 PDB
			


			1WJ2; 2AYD; 2LEX; 5W3X; 6J4E; 6J4F; 6J4G; 7D11; 7P8K; 7Z0R; 7Z0U; 8IEX; 
			
				8K31
			
			

			» more