PROSITE entry PS50814
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | WIF |
| Accession [info] | PS50814 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-OCT-2003 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50814 |
| Associated ProRule [info] | PRU00222 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | WIF domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=133; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=128; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.6978766; R2=0.0171979; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=396; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=280; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='L'; M= -8,-28,-20,-32,-23, 5,-30,-20, 27,-25, 34, 25,-27,-27,-18,-20,-24, -8, 20,-22, -2,-22; /M: SY='W'; M=-20,-32,-32,-37,-29, 47,-26,-18, -7,-23, -2, -7,-27,-30,-28,-19,-27,-17,-12, 63, 37,-25; /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27, 3,-37,-27, 41,-30, 29, 20,-23,-23,-20,-27,-23,-10, 24,-20, 0,-27; /M: SY='N'; M= -2, 22,-17, 19, 4,-24, -2, -2,-24, -5,-30,-22, 28,-13, 0, -7, 23, 8,-20,-40,-20, 2; /M: SY='E'; M= -1, -2,-28, 1, 19,-26,-16, 9,-25, 6,-21,-13, -3, 7, 6, -2, -3,-10,-23,-27,-13, 11; /M: SY='H'; M=-13, 4,-27, 9, 12,-25,-20, 33,-20, -3,-17, -6, 2,-15, 13, -3, -5,-12,-17,-30, -2, 10; /M: SY='E'; M=-10, 6,-30, 13, 46,-34,-20, 4,-26, 10,-20,-13, 0, -4, 34, 4, 0,-10,-30,-26,-16, 40; /M: SY='V'; M= 6,-25,-13,-28,-23, -2,-23,-22, 19,-18, 15, 16,-25,-25,-20,-18,-11, -3, 27,-25, -8,-21; /M: SY='R'; M=-13, -3,-25,-10, -5,-15,-17, 0,-12, 15,-10, 11, 3,-18, 5, 25,-10, -8,-12,-23, -8, -2; /M: SY='R'; M=-13,-14,-25,-15, -7,-15,-22, -7,-10, 17, -9, 6, -9,-20, 1, 33,-12, -8, -2,-22, -8, -6; /M: SY='L'; M= -8,-25,-18,-27,-18, 7,-28,-20, 15,-27, 40, 15,-25,-27,-18,-18,-22, 0, 8,-22, -2,-18; /M: SY='I'; M=-10,-23,-22,-31,-23, 13,-30,-20, 21,-23, 18, 18,-18,-21,-18,-20,-15, 1, 13,-17, 3,-21; /M: SY='G'; M= 9,-10,-26,-12,-18,-28, 58,-20,-35,-18,-26,-18, -2,-18,-18,-20, 2,-16,-25,-20,-28,-18; /M: SY='L'; M= -9,-30,-17,-32,-25, 20,-30,-23, 20,-27, 30, 13,-28,-30,-27,-20,-22, -7, 21,-18, 2,-25; /M: SY='E'; M=-10, 7,-27, 14, 22,-19,-17, 0,-25, 8,-21,-16, 1,-10, 7, 0, 1, -5,-22,-21, -1, 14; /M: SY='A'; M= 27,-10,-15,-16, -1, -4, -9,-16,-12,-10, -8,-10,-10,-12,-10,-16, 3, -4, -5,-17,-11, -4; /M: SY='E'; M=-14, 19,-32, 33, 35,-34,-16, -4,-32, 3,-25,-24, 4, 12, 8, -7, -2,-10,-30,-34,-22, 21; /M: SY='L'; M= -8,-25,-22,-27,-16, -2,-30,-18, 20,-21, 26, 15,-23,-25, -8,-17,-20, -8, 13,-22, -3,-13; /M: SY='Y'; M=-13,-12,-25,-17,-18, 16, -8, -3, -7,-17, 1, -3, -5,-27,-17,-14,-13,-10,-11, -3, 21,-18; /M: SY='Y'; M=-18,-22,-30,-24,-22, 25,-32, 11, 9,-14, 4, 4,-20,-28,-12,-14,-20,-10, -3, 21, 65,-22; /M: SY='V'; M= 0,-25,-13,-26,-25, -4,-26,-26, 25,-20, 5, 6,-21,-25,-23,-20, -3, 2, 36,-30,-10,-25; /M: SY='E'; M=-11, 0,-26, 4, 20,-23,-16, 15,-28, 9,-22,-13, 4,-11, 12, 20, 3, -6,-23,-29,-10, 14; /M: SY='E'; M=-12, 6,-27, 7, 28,-22,-17, 1,-20, 9,-15, -5, 6,-10, 12, 11, -4, -9,-22,-28,-15, 19; /M: SY='G'; M= -5, -5,-28, -2,-14,-24, 41,-17,-29,-19,-16,-14, -2,-20,-17,-19, -5,-17,-23,-23,-23,-16; /M: SY='H'; M= -3, -3,-23, -8, -6, -9,-17, 13,-12, 0, -8, -4, 2,-20, -3, -3, -8, -8,-14,-16, 9, -6; /M: SY='I'; M= 2,-25,-21,-33,-25, -4,-28,-23, 31,-21, 13, 20,-20,-20,-16,-23,-13, -7, 24,-22, -5,-23; /M: SY='N'; M= 7, 6,-17, -4, -7,-16, -7, -9, -6,-10,-18,-11, 18,-15, -5,-12, 14, 4, -8,-33,-16, -7; /M: SY='H'; M= -8, 3,-24, 0, -2,-20,-14, 25,-22, -8,-23,-12, 11, 4, 0, -7, 6, 4,-22,-33, -7, -4; /M: SY='Y'; M=-18,-11,-26,-17,-18, 30,-25, 11, -4,-12, -3, -4, -6,-28,-14,-10,-15, -8,-12, 14, 53,-18; /M: SY='A'; M= 27, -5,-10,-11, -7,-18, -4,-17,-13,-10,-17,-13, -1,-10, -7,-15, 22, 16, -3,-29,-18, -7; /M: SY='M'; M=-12,-14,-22,-18,-11, -6,-23, 9, -3, -9, 10, 13,-11,-21, -4, 3,-13, -2, -4,-23, 0, -9; /M: SY='D'; M= -9, 10,-22, 11, 0,-22,-14, 11,-18, 1,-21,-11, 11,-17, -2, -2, 2, -4,-11,-33,-10, -2; /M: SY='F'; M=-16,-25,-18,-35,-26, 64,-28,-20, -2,-26, 6, -2,-16,-26,-35,-18,-13, 1, 0, 3, 23,-26; /M: SY='N'; M=-12, 6,-23, -3, -6,-15,-17, 11,-11, -3,-15, -7, 18,-18, -1, 6, 0, 2,-14,-30, -7, -6; /M: SY='V'; M=-10, -9,-22, -5,-11, -6,-25,-11, 0, -4, 0, -1,-14,-23,-13, -7,-13, -7, 7,-19, 4,-13; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='P'; M= 1,-20,-25,-18,-10,-15,-20,-18, -5, -8, -6, -5,-18, 15,-12, -5, -9, -6, -3,-25,-17,-13; /M: SY='V'; M= -4,-30,-17,-34,-30, 0,-34,-30, 37,-24, 14, 14,-26,-26,-26,-24,-14, -4, 43,-26, -6,-30; /M: SY='P'; M=-10,-20,-37,-13, -3,-25,-20,-17,-13,-10,-22, -7,-20, 72, -8,-18,-12,-10,-23,-28,-25,-10; /M: SY='A'; M= 28,-10,-10,-15,-10,-16, -5,-19, -6,-12,-13,-10, -7,-14,-10,-17, 16, 6, 6,-28,-18,-10; /M: SY='N'; M=-12, 32,-25, 29, 23,-27, -8, 5,-27, 3,-27,-22, 34,-12, 6, -2, 5, -5,-30,-37,-20, 15; /M: SY='V'; M= -3,-26,-17,-31,-27, -1,-32,-29, 31,-22, 11, 11,-22,-24,-24,-22, -9, 4, 36,-27, -7,-27; /M: SY='H'; M=-15, 21,-27, 18, 5,-25,-12, 37,-28, 4,-26,-13, 26,-17, 5, 3, -2,-10,-28,-33, -4, 3; /M: SY='Y'; M=-13, -2,-25, 2, 2, 7,-20, 2,-15, -8,-12,-12, -5,-18, -6,-10, -2, -5,-15, -7, 21, -3; /M: SY='L'; M= -8,-28,-20,-32,-23, 5,-30,-20, 26,-25, 33, 26,-27,-27,-18,-20,-23, -8, 20,-22, -2,-21; /M: SY='N'; M= -5, 16,-20, 11, 10,-22, -6, 15,-23, -3,-27,-17, 26,-13, 5, -3, 15, 2,-24,-37,-14, 7; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='T'; M= 2, 0,-10, -8, -8,-12,-17,-18,-12,-10,-13,-12, 2,-10, -8,-10, 23, 45, -2,-32,-12, -8; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='Q'; M=-11, 7,-28, 3, 12,-32,-17, 20,-23, 12,-23, -5, 11,-13, 34, 10, -2,-10,-28,-25, -7, 22; /M: SY='A'; M= 30, -5,-10,-10, -5,-20, 0,-15,-15,-10,-20,-15, 0,-10, -5,-15, 25, 10, -5,-30,-20, -5; /M: SY='L'; M= 4,-18,-20,-20,-15,-10, -5,-20, -2,-11, 7, 1,-17,-22,-15,-13,-11, -8, 3,-22,-12,-15; /M: SY='G'; M= 4,-12,-24,-15,-14,-20, 14,-17,-15,-10,-16,-10, -4,-17,-10, -4, 2, -7,-10,-23,-18,-14; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='A'; M= 7, -3,-12, -5, -1,-15, 7, -5,-12, -3,-10, -5, -2, -7, 6, -5, 2, -5,-10,-10,-10, 2; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='R'; M= -1, -9,-17,-10, -5, -5,-12, 0,-12, 6, -8, -5, -5,-14, 0, 18, -5, -5, -8, -5, 7, -5; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='K'; M= -8, -8,-32, -6, 6,-25, -9,-15,-17, 8,-20,-10, -7, 6, -1, -2, -8,-12,-17,-24,-17, 1; /M: SY='Y'; M=-10,-26,-20,-26,-23, 14,-30, -9, 16,-20, 20, 10,-26,-30,-20,-16,-20, -7, 15, -5, 26,-23; /M: SY='P'; M=-15,-16,-30,-15, -2, 11,-24, 3,-16,-14,-13,-10,-12, 16,-13,-14,-12,-12,-19,-16, 1, -8; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='E'; M= 2, 10,-23, 16, 24,-28,-12, -7,-27, 8,-23,-19, 3, -7, 7, -2, 7, -4,-20,-30,-19, 15; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='F'; M= -9,-16,-12,-21,-16, 29,-18,-12, 9,-16, 7, 3,-11,-14,-18,-12,-11, -5, 5, 0, 11,-16; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='L'; M= -7,-11,-20, -9,-13, -7,-23,-18, 9,-20, 11, 3,-13,-21,-15,-18, -8, -3, 9,-29, -9,-14; /M: SY='N'; M= -8, -5,-25,-10,-11,-10, -5, -5, -9, -6,-15, -8, 5,-20, -6, 1, 0, -4,-11,-19, 0,-11; /M: SY='L'; M= -8,-23,-19,-23,-11, 10,-28,-20, 12,-20, 19, 7,-23,-25,-19,-17,-17, -7, 14,-20, -2,-14; /M: SY='Q'; M=-12, -8,-27, -7, 8,-16,-23, 2,-12, 5,-12, -4, -8,-17, 18, 11, -7, -8,-12,-15, 4, 11; /M: SY='S'; M= 3, 2,-12, -3, -6,-15, -8,-11,-11,-10,-21,-14, 11,-15, -6,-10, 24, 19, -3,-37,-17, -6; /M: SY='D'; M=-10, 13,-22, 15, -1,-17,-12, -4,-12, -9, -7, -2, 9,-17, -4,-10, -1, -4,-13,-33,-13, -2; /M: SY='D'; M=-19, 49,-29, 63, 17,-37, -9, 1,-37, 0,-30,-29, 26,-11, 0, -9, 1, -9,-30,-40,-20, 9; /M: SY='Q'; M= -5, -3,-24, -1, 15,-27,-18, -5,-16, 10,-19, -7, -3,-11, 21, 4, 3, -4,-13,-26,-13, 18; /M: SY='E'; M= -1, -3,-22, 0, 13,-21, 2,-10,-21, -8,-15,-14, -1,-11, 0,-10, 9, -2,-17,-30,-19, 7; /M: SY='V'; M= 12,-24,-17,-30,-24, -6,-24,-27, 24,-20, 7, 7,-20,-20,-20,-24, -7, -4, 27,-23,-10,-24; /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20, 7,-27,-13, 20,-23, 40, 33,-27,-27,-13,-17,-27,-10, 10,-20, 0,-17; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='P'; M= 3, 1,-23, 3, -1,-25, 4,-12,-23, 2,-21,-15, -2, 6, -5, -6, -1, -8,-18,-21,-18, -4; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='T'; M= 0, 3,-17, 2, -3,-16,-11, -7,-13, 0, -9, -2, -1,-11, -2, 2, 1, 4, -7,-22,-10, -3; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='T'; M= 5, -6,-16,-15, -9,-14,-20,-17, -2,-10, -7, -4, -5,-12, -1,-12, 9, 23, 0,-25,-10, -6; /M: SY='V'; M= -5,-30,-17,-32,-27, 3,-32,-27, 30,-25, 26, 15,-28,-28,-25,-22,-19, -5, 33,-25, -5,-27; /M: SY='N'; M= -5, 18,-18, 8, 0,-20, -3, 1,-22, 1,-28,-18, 33,-17, 2, 8, 17, 5,-21,-37,-18, 0; /M: SY='I'; M= -7,-30,-23,-37,-30, 0,-37,-30, 43,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 37,-23, -3,-30; /M: SY='P'; M= -6,-12,-29, -7, 0,-25,-14,-13,-22, -3,-28,-18, -7, 40, -3, -1, 5, -1,-22,-31,-23, -5; /M: SY='H'; M=-12,-15,-24,-15,-10, -8,-25, 20, -4, -8, 7, 7,-12,-23, -6, -5,-17,-12, -3,-25, 3,-10; /M: SY='K'; M= -3, -5,-22, -5, 3,-21,-15, -9,-16, 9,-14, -6, -2,-14, 9, 5, 4, 0,-13,-27,-11, 6; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='E'; M= -8, -4,-21, -4, 11,-14,-22,-10,-14, 0, -4, -8, -5,-12, 1, 5, 0, 11,-11,-27,-11, 5; /M: SY='V'; M= -3,-30,-17,-33,-30, 0,-33,-30, 37,-23, 13, 13,-27,-27,-27,-23,-13, -3, 43,-27, -7,-30; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='Q'; M=-12, 0,-27, 0, 15,-27,-20, 19,-23, 6,-18, -6, 2,-12, 26, 12, 0, -2,-24,-25, -6, 19; /M: SY='E'; M= -4, 3,-21, 4, 20,-22,-17,-10,-22, 8,-20,-15, 2, -7, 6, 1, 11, 13,-16,-30,-15, 13; /M: SY='I'; M= 1,-21,-23,-26,-14, -8,-26,-18, 17,-19, 17, 11,-18,-20, -4,-18,-14, -8, 8,-20, -5,-11; /M: SY='Q'; M= -3, 2,-23, 3, 19,-30,-13, -2,-23, 10,-25,-12, 3, -8, 24, 5, 12, 0,-22,-28,-15, 21; /M: SY='T'; M= -3, 5,-15, 3, -8,-15,-15,-13, -5,-10,-14,-10, 6,-18,-12,-12, 9, 10, 5,-35,-15,-10; /M: SY='F'; M=-16,-32,-23,-38,-30, 54,-28,-23, 2,-27, 5, -1,-25,-30,-35,-20,-21,-11, 4, 25, 23,-28; /M: SY='S'; M= -3, -7,-18, -8, -1,-17,-15, -8,-13, -4,-10, -6, -2,-15, 7, 4, 10, 10,-10,-28,-12, 2; /M: SY='V'; M= -3,-30,-17,-33,-30, 0,-33,-30, 37,-23, 13, 13,-27,-27,-27,-23,-13, -3, 43,-27, -7,-30; /M: SY='E'; M= -2, -9,-25, -9, 5, 1, -4, -7,-18, -9,-12,-11, -9,-16, -8,-12, -5,-10,-17, -9, 4, -2; /M: SY='L'; M=-13,-28,-22,-30,-22, 26,-30,-13, 13,-27, 35, 13,-27,-30,-22,-18,-27,-10, 5, -6, 19,-22; /M: SY='P'; M= -9,-12,-32, -7, 2,-27,-17,-14,-23, 6,-28,-17, -9, 42, -2, 4, -3, -6,-24,-28,-22, -4; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='T'; M= 8, -7,-12,-14,-10,-10,-15,-18, -6,-14, -2, -6, -6,-14,-10,-13, 12, 26, 0,-28,-11,-10; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='N'; M=-12, 9,-25, 2, 0,-19,-15, 13,-19, 10,-16, -7, 18,-18, 2, 7, -6, -8,-20,-29, -7, 0; /M: SY='R'; M= 4, -8,-20,-10, -1,-22,-15, -9,-14, 8,-17, -7, -4,-15, 8, 10, 4, -2, -6,-25,-13, 3; /M: SY='S'; M= 6, 15,-17, 20, 5,-27, -3, -8,-25, -7,-27,-22, 10,-10, -2,-12, 22, 7,-15,-37,-20, 2; /M: SY='G'; M= 8,-12,-22,-14,-15,-20, 31,-19,-22,-19,-13,-12, -5,-19,-15,-19, 2, -9,-15,-23,-22,-15; /M: SY='Q'; M= -6, -2,-23, -1, 18,-24,-22, -6,-12, 1,-13, -6, -5,-11, 19, -2, 2, 2,-10,-27,-13, 18; /M: SY='V'; M= 13,-21,-13,-28,-21, 6,-18,-20, 9,-16, 5, 10,-19,-21,-19,-18, -6, -3, 17,-18, -5,-19; /M: SY='A'; M= 13, -2,-20, -2, -3,-22, -8,-12,-14, -8,-16, -6, -5, 6, -5,-15, 6, -1,-10,-28,-19, -5; /M: SY='F'; M= -9,-30,-17,-35,-30, 29,-31,-26, 22,-25, 11, 8,-25,-29,-32,-21,-15, -5, 29,-14, 6,-30; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='N'; M= -7, 11,-17, 5, 6,-13,-11, -3,-11, -4, -8, -9, 16,-13, -1, -5, 2, 5,-14,-27,-12, 3; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='V'; M= -1,-24,-10,-25,-24, 0,-24,-21, 24,-15, 10, 16,-24,-24,-21,-15,-10, -1, 36,-24, -7,-22; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='N'; M= -2, 13,-20, 5, -1,-25, 9, -2,-24, -5,-29,-17, 25,-15, 5, -5, 16, 1,-24,-34,-20, 2; /M: SY='L'; M= -8,-28,-18,-30,-22, 6,-28,-18, 22,-25, 37, 25,-28,-28,-18,-18,-25, -8, 17,-22, -2,-20; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='K'; M= -8, 4,-18, 3, 8, -8,-12, 3,-13, 9,-13, -8, 6,-10, 3, 4, -4, -5,-14, -9, 5, 5; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='I'; M= -8,-30,-20,-35,-29, 15,-34,-27, 31,-27, 20, 13,-25,-26,-27,-24,-18, -7, 29,-18, 2,-29; /M: SY='V'; M= -2,-15,-14,-19,-15,-10,-25,-20, 9,-12, -1, 2,-15,-20, -8,-12, 1, 14, 20,-28,-10,-12; /M: SY='M'; M=-10,-19,-18,-25,-18, 9,-25,-14, 4,-11, 9, 12,-16,-23,-14, -1,-11, 2, 7,-18, 0,-16; /M: SY='N'; M= -1, 16,-22, 5, 0,-22, -7, 0,-22, 12,-25,-15, 28,-17, 2, 14, 3, -3,-21,-30,-17, 0; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='P'; M= -6, -8,-18, -7, -3, -7,-11, -2,-12, 0,-14, -9, -5, 6, -2, 4, 1, -1,-12,-11, 3, -5; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='S'; M= -4, -3,-26, 0, 8,-25, 1, 8,-27, -8,-26,-16, 1, 6, 0,-10, 9, -4,-24,-31,-16, 2; /M: SY='N'; M= -7, 5,-22, -1, -7,-17, 5, -5,-19, -5,-16,-12, 17,-20, -5, 4, 3, -4,-19,-30,-17, -7; /M: SY='K'; M=-12, 8,-25, 0, 0, -8,-15, -5,-21, 19,-23,-12, 17,-17, -2, 11, -5, -7,-20,-22, -6, 0; /M: SY='N'; M= -8, 17,-23, 9, 8,-22,-10, -2,-20, -2,-25,-18, 25, 4, 0, -5, 7, 6,-25,-35,-20, 3; /M: SY='I'; M=-12,-15,-25,-13,-15, 2,-27,-20, 7,-20, 5, 0,-16, -5,-19,-20,-15, -8, 5,-22, -5,-18; /M: SY='T'; M= -2,-10,-13,-15,-12, -5,-20,-18, -1,-17, 7, -1, -9,-17,-12,-13, 6, 24, 2,-28, -8,-12; /M: SY='R'; M=-12,-10,-27,-10, -6,-20, -6, 6,-23, 11,-19, -7, -3,-20, -1, 23, -8,-12,-13,-23, -9, -6; /M: SY='L'; M= -5,-19,-15,-23,-18, 1,-26,-22, 11,-21, 22, 8,-19,-23,-18,-16, -9, 13, 13,-25, -5,-18; /M: SY='P'; M=-10, -6,-29, -5, -3,-22,-19, 5,-16, 0,-22,-10, -1, 20, -5, -5, -7, -9,-16,-30,-13, -7; /M: SY='F'; M=-15,-25,-24,-31,-19, 33,-30,-16, 8,-23, 13, 7,-18,-25,-15,-16,-18,-10, 1, -6, 13,-16; /M: SY='R'; M=-15, 2,-28, -1, 3,-23,-16, -1,-28, 31,-25,-12, 11,-17, 8, 44, -6, -8,-22,-24,-12, 3; /M: SY='R'; M= -4,-12,-25,-14, -2,-18,-18, -6,-16, 9, -6, -3, -7,-18, 9, 28, -8, -8,-13,-20,-10, 1; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='K'; M=-13, 2,-26, -2, 8, -7,-18, -5,-23, 17,-20,-12, 7,-15, 1, 17, -7, -8,-20,-20, -6, 4; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='I'; M= -8,-16,-25,-23, -9, -7,-30,-18, 21,-16, 7, 13,-13,-15, -8,-18, -9, 1, 11,-24, -5,-11; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 11 in 11 different sequences |
| Number of true positive hits | 11 in 11 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | WIF |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
11 sequences
RYK1_DROME (Q27324), RYK2_DROME (Q9V422), RYK_CAEEL (G5EGT9), RYK_HUMAN (P34925), RYK_MOUSE (Q01887), WIF1_DANRE (Q9W6F9), WIF1_DROME (Q9W3W5), WIF1_HUMAN (Q9Y5W5), WIF1_MOUSE (Q9WUA1), WIF1_RAT(Q6IN38), WIF1_XENLA (Q9W6F8)» more
|
| PDB [Detailed view] |
5 PDB
2D3J; 2YGN; 2YGO; 2YGP; 2YGQ |