PROSITE entry PS50815
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | HORMA |
| Accession [info] | PS50815 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-MAY-2003 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50815 |
| Associated ProRule [info] | PRU00109 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | HORMA domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=197; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=192; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.6123738; R2=0.0212867; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=11153.5449219; R2=5.7315173; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=348; H_SCORE=13148; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=183; H_SCORE=12202; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='K'; M=-12, 4,-29, 6, 10,-27,-13, 2,-24, 16,-21, -8, 4,-13, 11, 14, -6,-11,-21,-25,-11, 9; /M: SY='G'; M= -4, -1,-26, 0, 1,-24, 3,-10,-20, -6,-19,-13, 0,-16, 0, -6, -1,-10,-16,-18,-16, 0; /M: SY='S'; M= 4, -6,-13, -7, -7,-14, -9,-13, -8,-10,-15,-10, 2,-16, -7,-10, 20, 11, 0,-35,-16, -7; /M: SY='A'; M= 8, -7,-19, -9, -2,-16, -9,-14, -8,-12, -2, -5, -8,-14, -4,-14, 1, 0, -6,-25,-14, -3; /M: SY='Q'; M=-10, 8,-25, 7, 8,-24,-16, -2,-19, 9,-15, -4, 5,-13, 10, 8, -4, -5,-18,-27,-12, 9; /M: SY='F'; M= -8,-23,-21,-28,-22, 11,-21,-21, 10,-23, 10, 6,-18,-23,-20,-19,-11, -1, 8,-10, 1,-21; /M: SY='L'; M= -5,-27,-19,-30,-23, 6,-27,-22, 18,-22, 21, 16,-25,-26,-20,-19,-18, -5, 18,-12, -1,-21; /M: SY='S'; M= 1, -8,-18,-11, -6,-16,-16,-12, -8, 2,-11, -3, -4,-16, -2, 3, 4, 4, -1,-27,-12, -4; /M: SY='E'; M=-10, 10,-23, 10, 17,-22,-15, -3,-20, 5,-19,-15, 11,-13, 4, 8, 3, -2,-16,-32,-17, 10; /M: SY='F'; M= -8,-23,-13,-30,-22, 29,-26,-13, 2,-19, 10, 5,-19,-26,-22,-16,-17, -9, 1, -4, 18,-21; /M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-34,-25, 19,-30,-19, 23,-25, 28, 22,-25,-27,-21,-20,-22, -9, 16,-15, 5,-23; /M: SY='E'; M= -7, -5,-26, -3, 10,-16,-17, -2,-19, 10,-14, -9, -5,-13, 3, 6, -5, -5,-14,-19, -2, 5; /M: SY='V'; M= -8,-27, -3,-30,-27, 10,-31,-19, 17,-22, 11, 10,-25,-29,-24,-20,-16, -6, 21,-17, 7,-26; /M: SY='A'; M= 24,-11,-15,-15,-12,-16, 7,-16,-13,-13,-13,-11, -7,-15,-11,-17, 10, 0, -4,-22,-15,-12; /M: SY='I'; M= -6,-23,-22,-31,-25, 11,-30,-24, 26,-24, 11, 9,-16,-23,-23,-23,-12, -5, 21,-19, 0,-25; /M: SY='N'; M= -4, 9,-19, 1, -5,-11, -4, 13,-19, -8,-22,-13, 21,-18, -4, -7, 10, 2,-19,-29, -5, -5; /M: SY='C'; M= -2, -5, 7,-13,-12, -8,-15, -7,-11,-16, -8, -5, 1,-22,-11,-14, 3, 2, -8,-32,-12,-12; /M: SY='I'; M= -9,-30,-27,-38,-29, 1,-38,-29, 46,-29, 21, 19,-22,-22,-21,-28,-19, -9, 31,-21, -1,-29; /M: SY='L'; M= -4,-23, -9,-26,-19, 2,-26,-21, 11,-25, 29, 10,-23,-26,-19,-19,-16, -1, 9,-25, -6,-19; /M: SY='Y'; M=-20,-17,-28,-17,-17, 30,-28, 9, -6, -9, -2, -3,-15,-28,-13, -3,-18,-10,-10, 16, 54,-18; /M: SY='L'; M= -6,-12,-22,-14, -6, -8,-23, -7, 2, -9, 4, 3, -9,-21, 1, -6,-10, -7, -1,-19, 0, -3; /M: SY='R'; M=-19, -9,-30, -9, 1,-21,-20, -1,-30, 31,-21,-10, 0,-19, 10, 67,-10,-10,-20,-20,-10, 1; /M: SY='G'; M= 0, 0,-27, -4, -9,-27, 38,-12,-33, -8,-27,-18, 9,-18,-11, -8, 1,-14,-26,-24,-25,-10; /M: SY='I'; M= -8,-30,-22,-34,-27, 9,-34,-26, 32,-28, 27, 16,-26,-26,-24,-24,-21, -8, 26,-20, 0,-27; /M: SY='Y'; M=-18,-25,-26,-28,-23, 40,-31, 1, 5,-19, 10, 3,-21,-29,-20,-15,-21,-10, -3, 16, 52,-23; /M: SY='P'; M= -9,-13,-37, -3, 3,-30,-13,-17,-23, -9,-30,-21,-14, 67, -8,-18, -5, -9,-29,-31,-28, -6; /M: SY='E'; M= 4, 1,-22, 4, 17,-27,-13, -7,-20, 2,-20,-14, -1, -3, 12, -5, 8, -2,-17,-29,-18, 14; /M: SY='E'; M= -8, 11,-29, 17, 26,-30,-12, 2,-29, 9,-23,-17, 5, -4, 11, 3, -1,-10,-26,-29,-17, 17; /M: SY='Y'; M= 0, -9,-13,-12,-13, -2,-19,-12, -3,-15, -4, -5, -9,-19,-13,-17, -1, 1, -2,-17, 5,-14; /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29, 75,-30,-16, 0,-28, 9, 0,-20,-30,-37,-19,-20,-10, -1, 12, 35,-29; /M: SY='E'; M= -6, 1,-23, 0, 4,-21,-13, -9,-14, 4,-16, -9, 2,-14, 4, -1, 1, 0,-11,-28,-14, 4; /M: SY='D'; M=-12, 9,-25, 11, 5,-21,-17, -5,-22, 11,-20,-11, 4,-14, 1, 10, -1, 1,-15,-26, -8, 2; /M: SY='R'; M= -4, -9,-20,-13, -6,-11,-19,-11, -8, 5,-10, -2, -6,-18, -3, 11, -4, -1, -1,-23, -9, -5; /I: I=-6; MD=-12; /M: SY='T'; M= -5, -5, -5, -6, -4, -5,-11, -3, -8, -3, -8, -5, -4, -4, 0, -1, 0, 3, -7, -9, 3, -3; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; /M: SY='R'; M=-11, -2,-25, -4, 0,-18,-20, -4,-17, 11,-15, -7, 1,-16, 8, 19, -3, -1,-14,-22, -5, 2; /M: SY='K'; M= -7, 4,-28, 7, 7,-24, -8, -7,-22, 10,-20,-10, 0,-12, 3, 1, -4, -9,-18,-22, -9, 4; /M: SY='Y'; M=-15,-14,-27,-15,-13, 11,-25, 4, -2, -2, 2, 9,-15,-24, -7, -5,-18,-10, -7, 2, 33,-12; /M: SY='N'; M= -8, 4,-16, -2, -9,-19, 1, -9,-15, -6,-14, -9, 12,-21, -6, -7, -4, -8,-15,-29,-17, -8; /M: SY='L'; M= -6,-22,-19,-23,-17, -2,-26,-21, 13,-16, 18, 9,-19,-23,-15,-14,-13, -2, 13,-24, -6,-17; /M: SY='T'; M= -6,-10,-15,-12, -9,-19,-17,-19,-11, -1,-17, -9, -8, 4,-10, -7, -2, 6, -6,-28,-16,-11; /M: SY='M'; M= -8,-20,-21,-24,-17, -4,-27,-15, 13, -9, 10, 15,-18,-22, -9, -7,-15, -4, 13,-20, 0,-14; /M: SY='L'; M= -8,-21,-24,-24,-15, 3,-25,-11, 4,-19, 15, 6,-20,-23, -8,-15,-17, -5, -2, -1, 6,-12; /M: SY='M'; M= -9,-19,-20,-21,-13, -3,-25,-13, 4, -5, 8, 12,-17,-22, -5, 1,-13, -4, 7,-21, -4, -9; /M: SY='S'; M= 2, -5,-14, -6, -1,-23, -8,-13,-21, -7,-23,-16, -2, 9, -2, -8, 10, 5,-17,-31,-21, -3; /M: SY='R'; M=-12,-10,-18,-13, -8,-12,-23, -2, -6, 0, -8, 3, -6,-19, 1, 5, -8, -6, -6,-23, -5, -5; /M: SY='D'; M=-15, 20,-26, 25, 9,-23,-13, 20,-30, 0,-25,-17, 16,-14, 2, 0, 1, -8,-25,-33, -8, 4; /M: SY='P'; M= -4, -3,-29, -1, 2,-23,-17,-13,-14, -4,-18,-13, -4, 22, -6, -9, -5, -7,-16,-29,-20, -4; /M: SY='E'; M=-10, -4,-24, 0, 19,-28,-18, -4,-22, 4,-22,-13, -6, 13, 9, -4, -6,-11,-24,-28,-18, 13; /M: SY='L'; M= 3,-19,-20,-19,-10, -8,-20,-18, 3,-15, 8, 1,-17, -9,-12,-13, -8, -4, 3,-25,-12,-12; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='N'; M= -6, 1, -9, -2, -2,-24, -6, -3,-24, 4,-22,-12, 5,-17, 3, 5, -1, -8,-18,-27,-15, -1; D=-14; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='R'; M= -2, 6,-22, 3, 3,-21,-13, -5,-19, 6,-16, -9, 7,-14, 3, 8, 1, -1,-15,-27,-14, 2; /M: SY='Y'; M=-14,-21,-26,-23,-15, 15,-27, -3, 1,-14, 7, 3,-18,-26, -7, -8,-17, -9, -6, 7, 29,-13; /M: SY='I'; M= -8,-30,-24,-35,-27, 2,-35,-26, 38,-27, 25, 20,-24,-24,-21,-25,-21, -8, 28,-22, -2,-27; /M: SY='D'; M= -3, 13,-23, 16, 8,-27,-11, 3,-24, 1,-22,-15, 9,-13, 5, 1, 5, -4,-18,-31,-15, 5; /M: SY='W'; M= -9, -3,-30, -2, -1,-17, -9,-10,-24, -1,-25,-17, -2,-12, 0, -5, -2, -8,-23, 11, -3, 0; /M: SY='L'; M= -1,-23,-19,-27,-20, -1,-25,-22, 14,-18, 16, 10,-22,-23,-17,-17,-14, -2, 14,-14, -4,-19; /M: SY='L'; M= -4,-16,-20,-15, 1, -2,-24,-15, 4,-14, 13, 5,-18,-19,-10,-14,-12, -5, 5,-23, -7, -4; /M: SY='K'; M= -8, -1,-25, 1, 9,-23,-17, -2,-20, 13,-15, -8, -1,-13, 9, 9, -1, -5,-17,-26,-10, 8; /M: SY='G'; M= 2, -5,-18, -8, -7,-27, 20,-11,-25,-11,-21,-12, 1,-17, 2,-11, 4, -9,-22,-25,-21, -2; /M: SY='V'; M= 2,-24, 1,-27,-23, -4,-25,-25, 13,-22, 11, 5,-23,-26,-22,-21, -9, -1, 22,-29,-11,-23; /M: SY='Y'; M=-11,-13,-26,-14, -6, 1,-18, 7,-10, -6, -4, -2, -9,-20, -4, -3,-11,-10,-12,-11, 12, -6; /M: SY='D'; M=-12, 20,-30, 32, 22,-31,-15, -3,-31, 6,-25,-22, 5, 3, 4, -3, -3,-10,-26,-30,-16, 12; /M: SY='W'; M= 12,-19,-23,-23,-12, -4,-13,-20, -9,-14, -6, -8,-18,-18,-11,-17, -8, -8, -7, 19, -2,-10; /M: SY='L'; M= -9,-28,-23,-32,-23, 5,-32,-23, 28,-28, 35, 20,-24,-25,-19,-22,-23, -6, 16,-21, -1,-22; /M: SY='Q'; M= -5, -3,-26, -3, 14,-21,-18, -2,-21, 11,-17, -9, -2,-12, 17, 13, -1, -6,-19,-21, -9, 15; /M: SY='K'; M= -6, 0,-27, 0, 7,-26,-15, -8,-24, 23,-20, -9, -1,-12, 10, 17, -5, -6,-18,-22,-12, 8; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='G'; M= -7, -1,-23, -3, -3,-27, 14,-12,-32, 11,-27,-15, 5,-16, -4, 7, -3,-10,-24,-24,-19, -4; /M: SY='Y'; M=-13,-11,-17,-12, -7, 4,-23, 1,-11, -5, -4, -2,-10,-22, -6, -4,-10, -8,-11,-11, 14, -7; /M: SY='L'; M= -7,-30,-13,-31,-24, 5,-31,-24, 24,-27, 33, 16,-29,-30,-23,-21,-22, -7, 23,-24, -4,-24; /M: SY='R'; M=-12, 1,-28, 1, 13,-26,-18, 7,-25, 20,-23, -9, 4,-13, 20, 21, -3, -8,-24,-21, -6, 15; /M: SY='R'; M= -8, -5,-19, -7, 5,-22,-20, -8,-19, 15,-16, -5, -4,-14, 8, 19, -4, -3,-14,-24,-12, 5; /M: SY='L'; M= -9,-30,-20,-33,-26, 13,-32,-25, 27,-28, 29, 15,-27,-28,-25,-22,-22, -8, 23,-19, 1,-26; /M: SY='A'; M= 13,-15,-16,-20,-13,-11,-16,-20, 9,-15, -3, 1,-12,-16,-12,-18, 4, 1, 13,-27,-13,-13; /M: SY='L'; M= -9,-29,-20,-33,-25, 14,-31,-22, 25,-26, 30, 19,-26,-28,-23,-21,-22, -8, 20,-19, 1,-24; /M: SY='V'; M= 2,-18, -2,-19,-21,-10,-17,-24, 7,-18, -4, -2,-16,-24,-21,-19, 0, 0, 22,-32,-15,-21; /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-38,-30, 10,-37,-29, 41,-28, 17, 16,-22,-23,-24,-27,-18, -8, 29,-18, 2,-30; /M: SY='Y'; M=-11,-13,-14,-18,-14, 9,-24, -4, 0,-15, -1, 0, -9,-22,-13,-14, -6, 1, -2,-12, 15,-15; /M: SY='B'; M= -8, 19,-22, 19, 13,-25,-10, -2,-23, 1,-22,-17, 19,-12, 5, -3, 9, 1,-22,-35,-17, 9; /M: SY='K'; M= -5, 1,-25, -1, 10,-23,-18,-10,-17, 15,-20,-11, 3, -6, 3, 5, -1, -3,-14,-27,-14, 6; /M: SY='E'; M=-10, 1,-22, 7, 13,-22,-20, -4,-20, 2,-14,-12, -6, -2, 0, -5, -8, -9,-17,-26,-11, 6; /M: SY='N'; M= -7, 14,-24, 11, 3,-25, 4, 0,-26, -5,-26,-18, 19, -8, 0, -7, 7, 0,-25,-32,-19, 1; /M: SY='D'; M= -6, 5,-25, 7, 4,-25, -1,-10,-25, 1,-22,-16, 3, -8, -3, 0, 2, -2,-17,-29,-19, -1; /I: I=-6; MD=-12; /M: SY='E'; M=-10, 1,-27, 7, 23,-22,-17, -7,-19, 1,-14,-13, -3, 15, 4, -6, -6, -8,-22,-26,-17, 12; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; /M: SY='V'; M= -2,-16, -7,-18,-16, -5,-20,-18, 11,-15, 6, 6,-16,-12,-15,-16, -9, -2, 13,-21, -8,-16; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='I'; M= -6,-22,-20,-25,-18, 0,-28,-21, 22,-22, 21, 11,-19,-24,-18,-19,-15, -5, 18,-25, -6,-19; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='R'; M=-11, -7, -3, -9, -1,-19,-20,-10,-21, 9,-18,-11, -2,-20, -2, 21, -4, -3,-10,-29,-15, -3; /M: SY='W'; M=-20,-28,-33,-31,-26, 39,-27, -5, -6,-19, -3, -6,-26,-30,-21,-16,-26,-16,-13, 57, 52,-23; /M: SY='V'; M= -2, -9,-12,-12, -8,-17,-20,-13, 0, -6, -9, 0, -7,-18, 0, -9, 0, -2, 3,-28,-12, -5; /M: SY='F'; M=-18,-29,-22,-38,-28, 60,-28,-18, 3,-27, 14, 8,-22,-29,-32,-19,-22,-11, 0, 11, 23,-26; /M: SY='B'; M= -6, 15,-22, 15, 9,-26,-10, -4,-26, 8,-27,-18, 15,-12, 6, 5, 12, 3,-20,-33,-17, 7; /M: SY='F'; M=-13,-28,-21,-36,-28, 40,-31,-23, 16,-27, 13, 9,-20,-26,-30,-21,-17, -5, 14, -7, 13,-28; /M: SY='S'; M= -1, 2,-19, 3, 5,-21,-16, -7,-13, -4,-16,-11, 0,-12, 1, -7, 9, 8, -7,-31,-13, 3; /M: SY='Y'; M=-10,-13,-20,-15,-10, 4,-24, 6, -5, -8, -6, -1,-11,-21, -4, -7, -7, 0, -8, -2, 30,-10; /M: SY='D'; M=-11, 0,-25, 1, -1, -6,-15,-12,-12, -8,-11, -9, -1,-12, -8,-10, -4, -5,-11,-23, -8, -4; /M: SY='E'; M= -7, 6,-27, 10, 11,-27,-13, -7,-24, 2,-24,-17, 4, 11, 4, -2, 2, -4,-23,-31,-19, 6; /M: SY='E'; M= -2, 1,-21, -1, 6,-18, -9, -4,-15, -5,-14,-11, 5,-13, -1, -7, 6, 3,-14,-30,-14, 2; /M: SY='G'; M= -1, -4,-14, -8,-15,-17, 2,-17,-11,-16,-12,-10, 0,-20,-15,-17, -3, -6, -7,-21,-16,-15; /M: SY='S'; M= -1, 0,-23, 2, 2,-23, 0,-13,-21, -7,-21,-16, 1, 3, -6,-12, 6, -1,-17,-30,-21, -3; /M: M= -3, -1,-25, 0, -1,-21,-16,-14, -4, -7,-10, -6, -4,-10, -3,-13, -5, -8, -3,-27,-14, -3; /M: SY='B'; M= -8, 2,-23, 2, -6, -6, -6,-11,-13,-11,-10, -8, 2,-18,-12,-12, -4, -7,-10,-24, -9, -8; /M: SY='A'; M= 3, -8,-20, -8, -4,-16,-15,-15, -1,-12, -3, -4, -9,-16, -6,-15, -1, -3, 3,-27,-13, -6; /M: SY='D'; M= -8, 11,-24, 12, 9,-19,-13, -3,-21, 2,-16,-11, 9,-14, 3, 3, -1, -6,-19,-28,-13, 6; /I: I=-1; MD=-2; /M: SY='I'; M= -6,-19,-17,-21,-15, -1,-22,-16, 19,-17, 14, 12,-16, -6,-12,-16,-14, -6, 11,-15, -3,-15; D=-1; /I: I=-1; MD=-2; /M: SY='N'; M= -1, 5,-11, 0, -3,-12, 3, -4,-12, -3,-14, -7, 11, -9, -3, -4, 9, 5,-10,-20,-11, -3; D=-1; /I: I=-1; MD=-2; /M: M= -6, -2,-12, -5, -3, -3,-11, -3, -2, -2, 0, -1, 0,-10, -3, 0, -4, -1, -4,-10, 0, -3; D=-1; /I: I=-1; MD=-2; /M: SY='N'; M= -1, 6,-12, 5, 2,-14, 5, -3,-15, 1,-14,-10, 8, -7, -1, -2, 3, -3,-12,-15,-11, 1; D=-1; /I: I=-1; MI=0; MD=-2; IM=0; DM=-2; /M: SY='E'; M= 2, 1,-10, -1, 6,-12, -7, -3, -7, -1, -9, -5, 1, -6, 6, -3, 4, 1, -6,-15, -8, 6; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='A'; M= 1, -2,-13, -5, 0,-10,-10, -4, -7, 0, -6, -4, -1, -5, -3, -3, -1, 1, -4,-16, -7, -2; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='K'; M= -3, 1,-15, 1, 3,-14,-10, -1,-13, 8,-13, -7, 3, -9, 1, 7, 1, -1, -8,-18, -8, 2; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='T'; M= -6, -5,-13, -6, -5, 0,-15, -5, -2, -7, -4, -3, -5,-12, -4, -7, 0, 5, -1,-10, 5, -5; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='I'; M= -5,-13,-17,-16, -9, -5,-21,-16, 13, -7, 4, 5,-11,-13, -9, -9, -9, -2, 11,-17, -4,-10; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='S'; M= -3, 11,-16, 11, 5,-20, -3, -1,-21, -5,-22,-16, 12,-10, -1, -7, 15, 10,-16,-31,-15, 2; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='L'; M= -6, -6,-20, -6, 1,-11,-12,-10, -6,-11, 2, 0, -6, -9, -4,-10, -5, 0, -8,-23,-11, -2; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='B'; M= -6, 6,-22, 5, -2,-17, -9, -8,-14, -4, -8, -6, 5,-11, -5, -7, -4, -4,-13,-27,-13, -4; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='E'; M= -7, 13,-24, 18, 20,-27,-13, -3,-26, 4,-21,-17, 8,-10, 8, 2, 6, -2,-21,-32,-17, 14; /M: SY='T'; M= -5,-17,-19,-22,-18, 0,-19,-16, 5,-18, 0, 3,-12,-13,-17,-17, -3, 8, 8,-23, -5,-18; /M: SY='R'; M=-10, -6,-26, -6, 5,-16,-20, -4,-18, 13,-15, -4, -4,-15, 15, 18, -7, -9,-16,-19, -7, 9; /M: SY='Q'; M= -9, 7,-25, 10, 12,-27,-15, -3,-23, 9,-20,-12, 5,-12, 15, 8, 3, -2,-20,-28,-14, 13; /M: SY='Q'; M= -6, 3,-26, 5, 21,-27,-17, 0,-15, 2,-14, -3, 1, -9, 22, -2, 0, -7,-19,-26,-14, 21; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='M'; M= -6,-24,-20,-31,-22, 12,-26,-18, 19,-22, 17, 20,-19,-22,-17,-19,-14, -4, 13,-17, 2,-20; /M: SY='R'; M=-10,-12,-10,-14, -6,-18,-21, -6,-18, 8,-15, -7, -6,-21, 6, 27, -6, -8,-11,-22, -8, -3; /M: SY='S'; M= 9, 0,-19, 0, 3,-23, -6,-11,-20, 2,-19,-13, 0,-11, 1, -5, 10, 3,-13,-28,-16, 2; /M: SY='L'; M= -4,-23,-17,-27,-21, 8,-25,-19, 15,-22, 17, 13,-20,-24,-18,-18,-11, -1, 14,-21, -2,-19; /M: SY='I'; M=-10,-29,-22,-35,-26, 12,-32,-22, 30,-26, 26, 22,-24,-25,-21,-22,-22, -9, 21,-18, 2,-25; /M: SY='R'; M=-15,-10,-28,-12, -5,-14,-21, 1,-15, 13,-12, -5, -1,-20, 3, 35, -9, -8,-12,-20, -3, -5; /M: SY='Q'; M= -7, 0,-24, -1, 11,-28,-17, -4,-23, 18,-23, -9, 2,-10, 21, 16, 5, 2,-20,-25,-12, 15; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='I'; M= -9,-26,-22,-32,-23, 8,-31,-22, 28,-26, 26, 17,-22,-23,-19,-22,-19, -5, 18,-18, 1,-23; D=-10; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='T'; M= 1,-11,-16,-14, -9, -9,-17, -7, -3,-11, -4, -2, -7,-17, -5, -7, 4, 7, 1,-23, -4, -8; D=-10; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='A'; M= 2, -9,-18,-14,-10, -7,-17, -7, 0,-10, -3, -1, -4,-19, -5, -7, -3, -3, 1,-23, -8, -8; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='C'; M= -3,-14, 10,-20,-17, -9,-22,-20, -1,-19, 1, -3,-10,-24,-16,-15, -3, 3, 2,-32,-13,-17; /M: SY='V'; M= -3,-14,-17,-19,-16, -7,-25,-20, 10,-13, 6, 8,-14,-19,-13,-14, -5, 9, 13,-26, -7,-16; /M: SY='S'; M= -2, 3,-19, -2, 4,-22,-13, -6,-18, 4,-20, -8, 7,-12, 10, 3, 11, 10,-14,-29,-14, 6; /M: SY='F'; M=-10,-13,-21,-17,-14, 9,-18, -7, -6,-11, -2, -2, -8,-22,-13, -9, -7, -1, -3,-15, 6,-13; /M: SY='L'; M= -7,-28,-19,-30,-21, 11,-28,-20, 18,-27, 40, 19,-28,-28,-20,-19,-26, -9, 12,-19, 0,-20; /M: SY='P'; M=-10, 2,-32, 11, 19,-30,-12, -9,-28, 3,-27,-20, -3, 25, 2, -4, -2, -9,-28,-30,-23, 9; /M: SY='P'; M= -8,-15,-26,-11, -1,-22,-21,-11,-15, -3,-13, -9,-15, 31, -5,-10,-12,-10,-19,-27,-18, -5; /M: SY='L'; M=-11,-26,-21,-28,-20, 9,-29,-16, 19,-26, 40, 19,-24,-28,-17,-19,-26,-10, 8,-18, 4,-19; /M: SY='P'; M=-10, -9,-27, 0, 10,-30,-20,-15,-24, -7,-27,-20,-13, 55, -5,-16, -6, -8,-28,-32,-27, -1; /M: SY='E'; M= -8, 2,-22, 4, 19,-27,-19, -4,-21, 6,-16,-10, -1, -7, 16, 3, -4, -9,-21,-27,-15, 17; /M: SY='G'; M= -7, -2,-29, 0, 2,-27, 10,-12,-25, -4,-24,-16, 0, 0, -4, -7, -2,-11,-22,-27,-22, -2; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='C'; M= -7,-13, 21,-18,-16, -6,-18,-18, -9,-14, -5, -6, -9,-24,-16,-11, -6, -3, -3,-27,-12,-16; D=-11; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='T'; M= -7, 1,-10, -1, -8, -8,-16,-13,-12, -9,-11,-10, -2,-15,-10, -7, 4, 13, -5,-24, -6,-10; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='F'; M= -7,-22,-13,-25,-21, 15,-24,-18, -2,-21, 3, -3,-21,-20,-22,-20,-18,-11, -3, 8, 9,-21; /M: SY='T'; M= -2, 7,-16, 5, 5,-19,-13,-10,-17, -5,-19,-15, 8,-11, 0, -7, 17, 20,-10,-34,-15, 3; /M: SY='F'; M=-10,-27,-20,-33,-25, 21,-28,-18, 17,-21, 14, 21,-23,-19,-22,-18,-18, -8, 16,-15, 4,-23; /M: SY='R'; M= -9, -5,-25, -5, -1,-19,-20,-10,-18, 14,-12, -6, -5, -9, 0, 17, -7, 0,-12,-24,-11, -2; /M: SY='V'; M= 0,-28,-15,-30,-25, 10,-27,-25, 20,-24, 21, 10,-26,-27,-25,-20,-16, -5, 26,-21, -3,-25; /I: I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='L'; M= -6,-13,-22,-14, -2, -2,-23, -5, -2,-13, 8, 4,-12,-18, -3,-11, -9, -2, -5,-19, 2, -3; /M: SY='Y'; M= -8,-15,-22,-16,-16, 11,-24, 1, 0,-15, 3, 0,-14,-24,-13,-14,-10, -2, -2, -4, 28,-16; /M: SY='Y'; M=-13, -2,-25, -4, -6, -7,-15, 1,-18, 3,-15,-10, -1,-19, -1, 9, -4, 2,-15,-10, 13, -6; /M: SY='D'; M=-10, 25,-24, 29, 11,-28, -3, -5,-29, -1,-26,-22, 17,-11, -1, -7, 7, 2,-24,-35,-19, 5; /M: SY='D'; M= -9, 19,-26, 25, 19,-31, -8, -4,-30, 6,-25,-20, 10,-10, 7, 1, 3, -5,-25,-31,-18, 12; /M: SY='A'; M= 6,-12,-20,-14, -6,-11,-18,-16, -4, -4, -8, -2,-12,-10, -9, -7, -4, -4, 3,-23,-12, -8; /I: I=-10; MD=-21; /M: SY='E'; M= -4, -1,-17, 1, 5,-14,-16,-11,-10, -4, -7, -8, -5, -5, -4, -5, 0, 5, -5,-24,-12, 0; D=-10; /I: I=-10; MD=-21; /M: SY='R'; M= 0, -8,-11,-10, -5, 1,-10, -7, -5, 0, -3, -2, -6,-10, -3, 4, -4, -3, -2, -7, -2, -4; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='P'; M= -8, -7,-36, 4, 5,-31,-17,-16,-23, -7,-28,-21,-12, 63, -7,-17, -7, -9,-28,-31,-27, -4; /M: SY='E'; M= -4, -5,-25, -3, 9,-21, -9, -9,-20, 2,-17,-12, -5, -1, 2, -4, 1, -3,-18,-24,-13, 5; /M: SY='D'; M=-11, 13,-25, 15, 5,-19,-17, 1,-18, -3,-12,-10, 7,-15, 2, -6, -5, -7,-17,-28, -9, 3; /M: SY='W'; M=-17,-24,-36,-24,-16, 12,-24, -7,-12,-12,-11,-10,-24,-25, -7,-12,-23,-15,-20, 65, 37,-11; /M: SY='Q'; M= -6, -4,-24, -4, 9,-22,-22, -8, -7, -1,-10, -4, -6,-12, 13, -2, -1, 1, -7,-26,-12, 10; /M: SY='P'; M=-10, -8,-32, -1, 12,-23,-23,-14,-12, -5,-15,-12,-12, 28, -3,-12, -9, -9,-16,-29,-19, 2; /M: SY='S'; M= -2, -1,-23, 3, 5,-18,-12,-13,-21, -5,-23,-18, -2, 5, -4,-10, 9, 5,-17,-21,-15, 0; /M: SY='D'; M=-12, 8,-28, 13, 1,-15, 8, -9,-27,-11,-18,-17, 2,-12,-11,-14, -5,-13,-23,-22,-12, -5; /M: SY='F'; M= -7,-23,-23,-28,-20, 28,-24,-16, -2,-20, 0, -4,-18,-10,-23,-18,-12, -5, -4, 3, 15,-21; /M: SY='K'; M=-10, -8,-21, -7, 4,-20,-21,-11,-16, 10,-14, -8, -5, -5, 1, 10, -7, -7,-13,-26,-14, 1; /I: I=-6; MD=-13; /M: M=-11, -2,-25, 0, -2,-13,-13, -9,-10, -8, -4, -6, -5,-11, -2, -7,-10, -9,-12,-14, -8, -2; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='I'; M= -1, -9,-10,-11,-10,-12,-12,-14, 1,-13, -5, -3, -6, -8, -6,-14, -1, -1, -1,-22,-10, -9; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='E'; M= -3, 3, -5, 3, 6,-14, -9, -5,-13, -3,-13,-10, 3, -1, 2, -5, 6, 4,-11,-20,-11, 4; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='E'; M= -2, 2,-13, 1, 6,-11,-10, -5, -8, -3, -5, -4, 0, -2, 0, -5, 0, 2, -8,-17, -9, 3; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: M= -4, -5,-15, -6, -4, -1, -6, -7,-10, -4, -7, -5, -5,-11, -1, -5, -4, -6, -9, -1, -1, -2; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='Y'; M= -2, -8,-12, -8, -8, 0,-13, -4, 2, -7, 0, 0, -9,-14, -5, -8, -4, -2, 4, -7, 9, -8; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='T'; M= -1, -7,-12, -9, -6, -8,-13,-11, -2, 0, -6, -3, -6, -3, -6, -1, 0, 6, 2,-15, -7, -7; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='W'; M= -8,-13, -9,-16,-12, 6,-15, -8, -7,-11, -1, -4,-11,-16,-11, -6, -8, -2, -6, 7, 4,-11; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='Q'; M= -7, 3,-19, 1, 2,-19, -8, -1,-11, 0,-13, -3, 5, -4, 11, 0, -1, -3,-14,-19,-10, 6; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='D'; M=-13, 7,-26, 10, 6,-20,-12, 1,-23, 1,-17,-12, 4, -6, 6, 2, -4, -8,-22,-25,-11, 5; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='D'; M=-14, 27,-26, 30, 8,-27,-12, -3,-23, -1,-21,-19, 20, -7, -2, -7, 0, -4,-23,-35,-17, 3; /M: SY='P'; M= -5,-14,-31,-12, -6,-22,-12,-19, -7,-13,-18,-11,-10, 32,-11,-19, -4, -7,-13,-28,-21,-11; /M: SY='E'; M= -9, 1,-25, 1, 9,-19,-15, -4,-14, -1,-13, -9, 2,-14, 7, 1, -1, -4,-14,-25,-10, 7; /M: SY='L'; M= 0,-12,-20,-14, -3,-10,-20,-10, -4, -6, 4, 2,-12,-17, -1, -5, -6, 0, -4,-21, -5, -3; /M: SY='V'; M= -2,-15,-21,-17,-17, -8,-24,-15, 13,-18, 6, 6,-15,-15,-15,-19,-10, -3, 14,-26, -8,-18; /M: SY='D'; M=-10, 6,-28, 10, 7,-26,-16, -4,-21, 0,-23,-15, 4, 9, 6, -3, 0, -3,-22,-28,-14, 5; /M: SY='I'; M= -7,-25,-20,-29,-24, 4,-26,-24, 24,-25, 22, 12,-21,-27,-23,-21,-18, -7, 22,-23, -4,-24; /M: SY='G'; M= -5, -5,-29, -6, -7,-26, 21, -7,-33, 7,-26,-15, 3,-17, -5, 12, -4,-14,-24,-21,-19, -7; /M: SY='S'; M= 1, 0,-18, -4, -2,-18, -7, -5,-15, -5,-20,-12, 8,-14, -3, -5, 14, 9,-10,-32,-14, -3; /M: SY='F'; M= -9,-28,-17,-32,-26, 23,-30,-23, 17,-22, 17, 11,-25,-28,-27,-18,-17, -6, 22,-15, 4,-25; /M: SY='N'; M= -7, 12,-12, 9, 0,-21,-11, -6,-20, -5,-21,-16, 15,-10, -1, -4, 10, 6,-18,-35,-18, -1; /M: SY='T'; M= -1, -4,-17, -7, -8,-12,-11,-17,-13,-12,-17,-13, -1, -1,-10,-13, 15, 21, -8,-30,-14, -9; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='P'; M= -6, -5,-29, -2, 0,-27, 6,-14,-26, -2,-25,-17, -3, 13, -6, -9, -1, -8,-24,-27,-22, -5; /M: SY='H'; M=-13,-14,-20,-16,-13, -6,-21, 13, -6,-15, -7, 1, -9, -8,-11,-13,-13,-13, -8,-24, 0,-14; /M: SY='H'; M=-16,-10,-27,-11, -8,-12,-18, 50,-13,-14, -1, 7, -3,-22, 0, -5,-15,-16,-15,-26, 9, -8; /M: SY='K'; M= -3, -4,-12, -8, -3,-17,-16,-12,-18, 15,-20, -7, -1,-15, -2, 6, 0, -1,-10,-26,-11, -2; /M: SY='V'; M= -3,-21,-17,-26,-22, 2,-20,-20, 15,-20, 14, 12,-18,-25,-20,-18,-12, -3, 17,-23, -6,-21; /M: SY='B'; M= -7, 12,-24, 11, 10,-22,-11, -3,-23, 3,-21,-14, 10,-12, 9, 1, 4, 0,-21,-27,-14, 9; /M: SY='L'; M= -1,-19,-12,-23,-16, -5,-23,-18, 10,-19, 13, 11,-17,-21,-11,-16, -8, 2, 10,-25, -7,-14; /M: SY='Y'; M=-11,-16,-25,-18,-10, 4,-20,-10, -3, -9, 2, 1,-13,-22, -7, -9,-13, -9, -6, -4, 8, -8; /M: SY='V'; M= 9,-25, -4,-28,-25, -5,-24,-27, 18,-20, 7, 5,-25,-26,-24,-21, -7, -2, 32,-28,-12,-25; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 38 in 38 different sequences |
| Number of true positive hits | 38 in 38 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 1 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 97.44 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | HORMA |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
38 sequences
ASY1_ARATH (F4HRV8), ASY2_ARATH (F4JTJ9), HOP1_YEAST (P20050), HORM1_BOVIN (Q2KIY6), HORM1_CANLF (E2RSQ2), HORM1_DANRE (A2BF66), HORM1_HUMAN (Q86X24), HORM1_MACFA (Q4R8B9), HORM1_MOUSE (Q9D5T7), HORM1_PIG (E2IUK4), HORM1_RAT (D3ZWE7), HORM1_XENLA (Q5M7C8), HORM2_BOVIN (A6QQY4), HORM2_CANLF (E2QXH7), HORM2_HUMAN (Q8N7B1), HORM2_MOUSE (Q5SQP1), MAD2_ARATH (Q9LU93), MAD2_CANAL (Q59VQ3), MAD2_MAIZE (Q9XFH3), MAD2_SCHPO (O14417), MAD2_YEAST (P40958), MD2L1_DICDI (Q556Y9), MD2L1_HUMAN (Q13257), MD2L1_MOUSE (Q9Z1B5), MD2L2_BOVIN (Q2KIP7), MD2L2_CHICK (Q4KWZ6), MD2L2_DANRE (Q568H3), MD2L2_DICDI (Q54S00), MD2L2_HUMAN (Q9UI95), MD2L2_MOUSE (Q9D752), MD2L2_RAT (D3Z8D9), MD2L2_XENLA (Q8QFR4), MD2L2_XENTR (Q28H85), PAIR2_ORYSJ (Q76CY8), POLZ2_DROME (Q9VNE1), REV7_ARATH (Q94FL5), REV7_SCHPO (Q0E7J8), REV7_YEAST (P38927)» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
1 sequence
HOP1_SCHPO (Q9P7P2) |
| PDB [Detailed view] |
47 PDB
1DUJ; 1GO4; 1KLQ; 1S2H; 2QYF; 2V64; 2VFX; 3ABD; 3ABE; 3GMH; 3VU7; 4AEZ; 4EXT; 4FJO; 4GK0; 4GK5; 5KHU; 5LCW; 5O8K; 5XPT; 5XPU; 6BC8; 6BCD; 6BI7; 6EKJ; 6EKL; 6EKM; 6F0X; 6K07; 6K08; 6KEA; 6KTO; 6M7A; 6M7B; 6NIF; 6TLJ; 6V8P; 6V93; 6VE5; 6WS0; 6WS5; 6WW9; 6WWA; 7L9P; 7LXD; 7S0T; 8J69 » more |