 |
|
| Entry: PS50821 |
General information about the entry
| Entry name [info] | PAZ |
| Accession [info] | PS50821 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-MAY-2002 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 22-FEB-2023 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50821 |
| Associated ProRule [info] | PRU00142 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | PAZ domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=115; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=110; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.3211000; R2=0.0212500; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=5351.9135742; R2=7.8062282; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=338; H_SCORE=7990; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=244; H_SCORE=7257; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-60; B1=-60; E0=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='H'; M=-13, 0,-16, 4, 5,-19,-19, 11,-21,-10,-11,-10, -4,-18, 1, -9, -8,-11,-20,-17, -5, 3; /M: SY='E'; M=-10, -4,-28, -2, 20,-14,-23, -7,-17, 3,-14,-10, -6, -1, 10, -2, -4, -5,-19,-22,-10, 15; /M: SY='V'; M= -6,-17,-16,-21,-24, 2,-27,-23, 21,-19, 5, 5,-15,-26,-24,-19,-10, -3, 29,-27, -7,-24; /M: SY='L'; M= -7,-25,-11,-28,-20, 8,-26,-15, 9,-19, 23, 13,-23,-28,-17,-12,-20, -8, 7,-17, 4,-19; /M: SY='D'; M=-10, 13,-27, 19, 17,-28,-15, -2,-27, 10,-20,-12, 4,-11, 10, 11, -3, -9,-21,-28,-15, 12; /M: SY='L'; M= -5,-13,-20,-18,-10, 5,-23,-17, 2,-11, 6, 1,-10,-20,-14,-11,-10, -1, 3,-20, -3,-12; /M: SY='M'; M=-13,-16,-25,-20, -9, 3,-25, 4, 5, -9, 9, 22,-15,-20, -4, -8,-17,-11, -1,-16, 8, -8; /M: SY='E'; M= -6, 4,-22, 4, 18,-23,-11, -6,-23, 2,-19,-15, 5, -9, 9, 2, 9, 9,-19,-29,-16, 13; /M: SY='N'; M= -8, 7,-25, 5, 1,-22,-16, -5,-15, 6,-14, -8, 9,-16, 4, 8, -5, -7,-15,-27,-12, 2; /M: SY='C'; M=-12, -3, 11, -5, -4,-14,-24,-10, -9,-13,-10, -5, -5,-22, -9,-16, -9, -9, -9,-29, -8, -8; /M: SY='S'; M= -2, -6,-21, -7, -1,-16, -9,-13, -8,-12,-11, -9, -2, -7, -7,-13, 5, -1, -5,-31,-17, -5; /I: I=-4; MD=-22; /M: SY='N'; M= -7, 2,-20, -4, 1,-16,-16, -7, -9, 0,-11, -7, 7,-13, 3, 2, 3, 7,-10,-26,-11, 1; D=-4; /I: I=-4; MD=-22; /M: SY='S'; M= -4, -3,-18, -6, 0,-15,-16,-10, -5, -3, -9, -5, 1,-14, 1, -5, 4, 4, -4,-27,-11, 0; D=-4; /I: I=-4; MD=-22; /M: SY='K'; M= -8, -3,-25, -2, 1,-20, -6, -6,-18, 7,-16, -1, -3, -4, 1, 7, -4, -7,-15,-24,-14, 0; D=-4; /I: I=-4; MD=-22; /M: SY='A'; M= 4, -1,-13, -1, -1,-13, -9,-10, -9, -2, -7, -7, -4, 1, -4, -6, 0, 2, -6,-16,-10, -3; D=-4; /I: I=-4; MD=-22; /M: SY='R'; M= 3, -6,-10, -7, -3, -8, -6, -6, -7, -1, -5, -4, -2, -9, -1, 5, 4, 1, -4,-14, -7, -3; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='D'; M=-15, 3,-32, 9, 3,-25,-20, 2,-19, 1,-20,-12, -2, 7, 4, 0, -8,-11,-21,-25, -7, 1; /M: SY='L'; M=-10, -7,-22, -6, 0, -6,-23,-12, 0,-16, 19, 3,-11,-21, -9,-13,-15, -5, -5,-26, -8, -4; /M: SY='S'; M= -2, -5,-18, -6, 0,-17,-14, -1,-13, -5,-17, -7, -2, -5, -2, -7, 11, 10, -8,-32,-12, -2; /M: SY='D'; M= -9, 11,-23, 15, 6,-23,-15, -6,-23, 5,-17,-11, 4,-13, 1, 10, 1, 3,-16,-29,-14, 2; /M: SY='R'; M= -1, 0,-22, 0, 6,-17,-14, -7,-22, 6,-19,-13, 0,-12, 5, 8, 5, 0,-16,-24,-12, 5; /M: SY='D'; M= -9, 15,-27, 22, 7,-26,-15, 7,-25, -3,-21,-15, 4, -6, 8, -7, -1, -4,-22,-25, -5, 6; /M: SY='R'; M=-11,-11,-29,-12, -6,-14, 3, -4,-22, -2,-13, -6, -6,-20, 7, 8, -8,-13,-21,-14, -4, -1; /M: SY='V'; M= -7, -6,-10, -2, -8,-17,-21,-17, -8, -5,-10, -8,-10,-11,-12,-10, -5, -4, 2,-32,-15,-10; /M: SY='F'; M=-14,-14,-24,-18, -8, 19,-24, -9,-11, 1, -6, -1,-11,-20,-11, 2,-12, -4, -8, -6, 13, -9; /M: SY='V'; M=-10,-14, -6,-18,-19, 6,-26,-20, 6,-17, 2, 0,-12,-26,-22,-16,-12, -6, 10,-24, -4,-20; /M: SY='A'; M= 4, -7,-21,-10, -5,-20, -7,-15,-19, 4,-17,-11, -5, -5, -5, 1, 3, 4,-12,-24,-16, -6; /M: SY='E'; M=-11, -3,-13, -1, 19,-26,-22, -7,-24, 16,-20,-12, -4,-13, 10, 15, -6, -9,-18,-27,-15, 14; /M: SY='D'; M= -3, 15,-24, 19, 7,-27, -7, -8,-24, 2,-21,-17, 7,-14, -3, -2, 0, -7,-15,-30,-18, 2; /M: SY='F'; M= -9,-26,-21,-29,-25, 17,-21,-17, 13,-23, 14, 7,-23,-28,-25,-19,-17, -8, 14,-10, 12,-25; /M: SY='Q'; M=-12, -8,-28, -9, 7,-22,-22, -3,-12, 13, -9, 3, -6,-14, 18, 17,-10,-10,-14,-21, -8, 11; /M: SY='G'; M= -9, 11,-26, 15, -7,-20, 19,-11,-28,-12,-23,-19, 8,-19,-14,-15, -2,-12,-19,-27,-19,-10; /M: SY='A'; M= 12,-20,-17,-25,-16, -7,-19,-20, 10,-13, 12, 10,-19,-19,-13,-16,-10, -5, 11,-21, -9,-15; /M: SY='V'; M= -6,-21,-22,-24,-17, -8,-30,-23, 16, -3, 5, 8,-19,-22,-15, -8,-15, -6, 20,-24, -6,-17; /M: SY='V'; M= -4,-28,-15,-30,-27, -2,-31,-27, 27,-17, 9, 10,-25,-27,-24,-13,-12, -3, 40,-27, -8,-27; /M: SY='M'; M= -9,-13,-24,-14, 0, -6,-24, -9, 0,-11, 5, 8,-14, -6, -4,-12,-10, 0, -5,-20, -1, -4; /M: SY='T'; M= 5,-15, -9,-19,-13,-15,-20,-23, -4,-15,-11, -8,-14, 9,-15,-19, 1, 10, 1,-29,-17,-16; /M: SY='P'; M= -7, -4,-30, -1, -3,-20,-17,-14,-21, -6,-21,-17, -8, 6, -3, -7, -5, 0,-20, 2,-10, -3; /M: SY='H'; M=-18, -8,-28, -9, -9, 2,-24, 54,-15,-10,-11, -1, -4,-23, 0, -5,-11, -9,-19, -5, 42, -9; /M: SY='R'; M=-13, 2,-13, -5, -6,-18,-16, -4,-18, 7,-20,-11, 14,-21, 0, 25, -1, -5,-16,-30,-14, -6; /M: SY='N'; M= -4, 15,-24, 4, -7,-23, 21, -3,-27, -4,-28,-18, 29,-19, -6, -1, 5, -8,-27,-30,-22, -7; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='N'; M= -7, 8,-14, 1, 0, -7, -8, 2, -8, -3, -8, -4, 15,-13, 6, -1, -1, -3,-14,-17, -6, 3; D=-5; /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27; /M: SY='D'; M= -6, -1,-16, 3, 1,-12,-13, -6, -4, -5, -5, 2, -6, 0, -4, -8, -5, -5, -2,-19, -9, -2; D=-5; /I: I=-5; DM=-27; /M: SY='Q'; M= -6, -3,-19, -3, 2,-20, 4, -2,-19, 7,-15, -6, 0, -9, 13, 10, -2, -8,-17,-13,-10, 7; D=-5; /I: I=-5; DM=-27; /M: SY='R'; M=-16, -9,-28, -9, -1,-17,-22, 5,-21, 21,-17, -6, -4,-19, 9, 37,-10,-10,-14,-16, 1, 1; /M: SY='R'; M=-10, -7,-21,-12, -9, -4,-22,-10, -9, 6,-12, -6, -3,-20, -8, 9, -4, 4, -2,-19, 0, -9; /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-27,-23, 47,-30, 7, 0,-17, 3, 0,-20,-30,-20,-13,-20,-10, -7, 23, 63,-23; /M: SY='R'; M=-16,-12,-13,-13, -9, -5,-23, 2,-19, 10,-15, -9, -8,-23, -1, 23, -9, -8,-15, -8, 16, -9; /M: SY='V'; M= -5,-27,-17,-32,-28, 7,-32,-28, 29,-23, 11, 10,-23,-25,-26,-22,-11, 1, 33,-23, -3,-28; /M: SY='A'; M= 9, 5, -7, 4, 1,-23,-11,-13,-18, -2,-18,-15, 1,-15, -6,-10, 3, -3, -9,-31,-19, -3; /M: SY='G'; M= -7, 13,-28, 18, 7,-31, 23, -8,-35, -7,-28,-22, 11,-13, -5,-12, 4,-11,-28,-30,-24, 1; /M: SY='V'; M= -6,-30,-18,-33,-28, 9,-33,-27, 30,-26, 22, 14,-27,-27,-26,-23,-18, -6, 32,-22, -2,-28; /M: SY='T'; M= -8, -3, 3, -3,-11,-13,-12,-15,-16,-16, -7,-11, -6,-21,-14,-16, -1, 4,-10,-29,-10,-13; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='F'; M= -6, -8,-20,-12, -9, 4,-16, -9,-12, -8,-13,-10, -2, 1,-11, -5, 0, 3,-12,-15, -1,-11; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='Q'; M= -6, 8,-26, 9, 8,-28, -8, 5,-24, 4,-21,-12, 7,-14, 10, 4, -1, -9,-20,-27,-13, 8; /M: SY='P'; M= -4,-19,-26,-17, -8,-12,-18,-15, -6,-14, -2, -1,-17, 8, -5,-15, -8, -6,-11,-11,-11, -8; /M: SY='T'; M= 12, 1,-13, -8, -6,-16, -9,-13,-14, -5,-16,-13, 5,-12, -6, -5, 17, 21, -7,-29,-15, -6; /M: SY='P'; M= -3, -6,-29, -1, -1,-27, -5,-14,-25, -5,-27,-19, -6, 30, -6, -6, 2, -5,-23,-30,-24, -6; /M: SY='E'; M=-11, 2,-25, 3, 10,-17,-18, 3,-16, 0, -6, -7, 2,-16, 2, 3, -6, -7,-16,-28,-10, 5; /M: SY='S'; M= 0, -8, -2,-10, -7,-12,-13, -9,-13,-13,-13,-10, -3,-18, -2,-12, 15, 10, -8,-29, -7, -5; /M: SY='T'; M= -8,-11, -8,-15,-10, -3,-22,-12,-11, 0, -7, -2, -9,-19, -9, -3, -4, 6, -6,-19, 1, -9; /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29, 73,-30,-20, 2,-30, 14, 2,-21,-30,-38,-20,-21,-10, 1, 7, 27,-29; /M: SY='P'; M= -6,-13,-28,-10, -3,-23,-19,-19,-15, -5,-23,-15,-12, 42, -9,-12, 0, 5,-15,-30,-22, -9; /M: SY='R'; M= -6, -6, -9, -6, -8,-18,-11,-14,-16, -2,-14,-10, -5,-19, -8, 2, 2, 1, -6,-30,-15, -9; /M: SY='D'; M=-14, 17,-28, 21, 9,-29,-15, -3,-29, 13,-26,-17, 11, -6, 7, 13, -1, -4,-24,-30,-16, 7; /M: SY='E'; M=-10, 11,-27, 12, 15,-26, 0, 6,-26, -3,-19,-14, 12,-13, 6, -5, -1,-11,-27,-29,-16, 10; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='N'; M= -4, 0,-17, -2, -1,-16, 5, -6,-16, -1,-16,-11, 7,-13, -3, 3, 3, -4,-11,-22,-14, -3; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='E'; M=-15, 3,-28, 8, 14, -7,-21, 3,-18, 2,-13, -8, -4,-14, 4, -4, -9,-10,-19,-12, 11, 8; /M: SY='Q'; M=-11, -9,-15,-12, 0,-17,-25,-12, -2, -2, -5, -1, -5,-17, 2, -1,-10, -9, -7,-26,-10, -1; /M: SY='T'; M= 4, 0,-10, -6, -6,-14,-12,-16,-14,-10,-18,-14, 4,-10, -6,-10, 28, 38, -4,-34,-14, -6; /M: SY='F'; M=-12,-27,-19,-30,-27, 34,-30,-13, 12,-20, 7, 4,-24,-30,-28,-17,-16, -6, 17, 0, 28,-27; /M: SY='A'; M= 17,-13,-16,-21,-16,-13,-16,-21, 7,-10, -4, -1, -9,-17,-14,-16, -2, -3, 13,-24,-13,-16; /M: SY='E'; M=-14, 19,-30, 31, 40,-33,-17, 9,-32, 5,-23,-19, 6, -5, 17, -2, -1,-11,-30,-32,-16, 28; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-24, 49,-30, 5, 0,-18, 4, 0,-20,-30,-21,-14,-20,-10, -6, 22, 61,-24; /M: SY='K'; M=-11,-12,-27,-12, 1,-13,-25, -6, -5, 5, 5, 3,-12,-17, 1, 1,-16,-11, -7,-22, -5, 0; /M: SY='E'; M= -8, 5,-25, 8, 22,-27,-20, -6,-21, 11,-19,-11, -1, -9, 15, 3, 0, 0,-17,-27,-14, 18; /M: SY='R'; M=-12, -1,-27, -4, 3,-23,-18, -6,-25, 33,-23, -6, 3,-14, 7, 34, -7, -5,-18,-22,-10, 4; /M: SY='Y'; M=-20,-15,-30,-15,-15, 17,-27, 41, -8,-10, -5, 0,-12,-27, -5, -7,-17,-13,-15, 14, 64,-15; /M: SY='N'; M= -6, 13,-26, 5, -6,-26, 24, -5,-30, 1,-30,-18, 26,-18, -6, -3, 3,-10,-28,-29,-22, -6; /M: SY='I'; M=-10,-30,-22,-35,-27, 14,-34,-25, 31,-28, 27, 16,-25,-26,-24,-24,-22, -8, 23,-18, 2,-27; /M: SY='R'; M=-12, 0,-25, 1, 3,-21,-21, -8,-14, 5,-13, -8, -2,-15, 5, 16, -3, 0, -9,-26,-11, 2; /M: SY='L'; M=-10,-30,-25,-35,-25, 5,-35,-25, 34,-30, 36, 20,-25,-25,-20,-25,-25,-10, 20,-20, 0,-25; /M: SY='R'; M=-14, 2,-27, -2, 3,-21,-17, 5,-21, 12,-19, -8, 9,-17, 20, 27, -2, -4,-23,-20, -4, 9; /M: SY='Y'; M=-18, 10,-15, 10, -5, -2,-19, 15,-20, -9,-16,-13, 7,-23, -8,-10, -8,-10,-20,-16, 16, -8; /M: SY='P'; M= -8,-13,-25,-13, -6,-16,-23, -8, -8, -8, -7, -4,-13, 10, -4,-10, -6, 3, -8,-27,-11, -7; /M: SY='N'; M=-11, 22,-24, 16, 6,-26, -9, 19,-25, 4,-27,-14, 30,-16, 11, 2, 5, -5,-27,-34,-12, 8; /M: SY='Q'; M=-10,-11,-26,-10, 8,-19,-24, -3, -5, -6, 8, 6,-12,-17, 24, -3,-12,-10,-14,-21, -7, 16; /M: SY='P'; M= -8,-18,-37, -9, 0,-29,-18,-19,-20,-10,-30,-20,-17, 81, -9,-19, -6, -7,-28,-31,-29, -9; /M: SY='C'; M=-10,-26, 35,-30,-24, -2,-30,-24, 0,-30, 22, 4,-26,-34,-24,-24,-22,-10, 2,-32,-12,-24; /M: SY='L'; M= -8,-30,-20,-32,-24, 6,-32,-24, 27,-28, 37, 18,-28,-28,-22,-22,-24, -8, 21,-22, -2,-24; /M: SY='Q'; M=-12, 6,-26, 7, 2,-21,-19, -4, -9, -3, -4, 1, 2,-16, 8, -5, -9, -9,-13,-27,-10, 5; /M: SY='V'; M= 1,-18,-16,-18,-19,-12, -5,-23, 2,-11, -9, -3,-14,-23,-19,-13, 1, -1, 17,-29,-15,-19; /M: SY='R'; M=-13, 7,-30, 12, 3,-30, 2, -7,-35, 17,-27,-17, 5,-15, 1, 21, -5,-12,-25,-25,-17, 1; /M: SY='H'; M= -7, 5,-25, -2, -4,-15, -6, 22,-21, -8,-21,-10, 15, -8, 1, -7, -1, -9,-24,-27, -6, -3; /M: SY='T'; M= -5, -8,-21,-11, -4,-17,-14,-16, -9, -7,-12, -8, -6, -3, -4, -6, 5, 12, -5,-27,-14, -5; /I: I=-4; MD=-21; /M: SY='D'; M= -6, 9,-19, 12, 9,-15,-10, -4,-22, -1,-22,-16, 8,-11, 4, -4, 11, 1,-17,-28,-12, 7; D=-4; /I: I=-4; MD=-21; /M: SY='K'; M= -2, -3,-21, -6, 1,-18,-16, -7,-18, 15,-18, -8, -2,-11, 6, 10, 2, 5,-12,-18, -4, 3; D=-4; /I: I=-4; MD=-21; /M: SY='R'; M= -4, -8, 4,-13, -9,-16,-16, -2,-18, -4,-11, -9, -3,-15, -6, 5, -6, -8,-13,-27,-13,-10; D=-4; /I: I=-4; MD=-21; /M: SY='L'; M= -7,-14,-18,-15,-11, -4,-10, -2, 2,-12, 11, 6,-11,-17, -9, -9,-14, -9, -2,-15, -2,-11; D=-4; /I: I=-4; MD=-21; /M: SY='N'; M= -3, 17,-10, 9, 0,-11, 0, 3,-11, -1,-16,-11, 27,-10, 0, -1, 8, 2,-14,-21,-11, 0; D=-4; /I: I=-4; MD=-21; /M: SY='L'; M= -7,-12,-13,-13, -8, 9,-15, -5, 2, -6, 10, 4,-11,-14, -8, -4,-12, -5, -1, -3, 10, -8; D=-4; /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21; /M: SY='L'; M= -6,-13,-12,-13, -9, 2,-15, 2, 5,-14, 19, 9,-12,-15, -8, -9,-14, -6, 1,-12, 2, -9; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='Q'; M= 0, -5,-19, -8, -1,-21,-16, -8,-11, 2,-16, -6, -1,-15, 9, 4, 6, 3, -5,-27,-13, 3; /M: SY='Y'; M= -5,-17,-25,-21,-13, 4,-17,-10, 5,-15, 0, 4,-13,-19,-12,-17,-10, -5, 0, -9, 12,-14; /M: SY='L'; M= -9,-21,-21,-24,-18, 3,-17,-16, 11,-25, 33, 17,-19,-27,-16,-17,-23,-10, 3,-22, -5,-17; /M: SY='P'; M= -3,-16,-28,-13, -8,-21,-19,-19, -7,-11,-19,-12,-14, 42,-14,-18, -6, -6, -8,-30,-23,-14; /M: SY='P'; M= -9,-14,-29,-10, -7,-16,-21,-15, -4,-14, -5, 0,-16, 27,-10,-18,-11, -8,-11,-28,-16,-11; /M: SY='E'; M=-10, 9,-30, 18, 56,-31,-20, 1,-29, 10,-20,-18, 0, -1, 24, 1, 0,-10,-30,-29,-19, 40; /M: SY='L'; M= 1,-27,-17,-29,-21, 9,-25,-21, 15,-25, 31, 12,-26,-27,-21,-20,-20, -7, 13,-19, -2,-21; /M: SY='C'; M= -8,-23, 69,-31,-29,-13,-30,-27, -7,-26, -7, -4,-22,-34,-26,-26,-12, -8, 7,-41,-21,-28; /M: M= -4, -2,-19, -5, -8, -9,-16, -1, -9, -4,-11, -2, 0,-18, -7, -6, 0, 0, -3,-27, -6, -8; /M: SY='I'; M= -8,-29,-22,-34,-28, 4,-35,-24, 36,-24, 17, 14,-24,-25,-22,-24,-17, -7, 31,-18, 5,-28; /M: SY='I'; M=-10,-20,-24,-24,-20, -6,-31, 12, 18,-21, 4, 11,-13,-23,-13,-17,-14,-10, 16,-26, 4,-20; /M: SY='P'; M= -4,-16,-30,-10, 3,-22,-20,-18,-12, -6,-15,-11,-17, 37, -8,-13, -9, -8,-14,-27,-21, -5; /I: E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 96 in 96 different sequences |
| Number of true positive hits | 96 in 96 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 1 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 98.97 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | PAZ |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
96 sequences
AGO10_ARATH (Q9XGW1 ), AGO11_ORYSJ (Q10F39 ), AGO12_ORYSJ (Q7Y001 ), AGO13_ORYSJ (Q852N2 ), AGO14_ORYSJ (Q6Z4F1 ), AGO15_ORYSJ (Q5NBN9 ), AGO16_ORYSJ (Q6YSJ5 ), AGO17_ORYSJ (Q6H6C3 ), AGO18_ORYSJ (Q69UP6 ), AGO1A_ORYSJ (Q6EU14 ), AGO1B_ORYSJ (Q7XSA2 ), AGO1C_ORYSJ (Q6K972 ), AGO1D_ORYSJ (Q5Z5B2 ), AGO1_ARATH (O04379 ), AGO1_HUMAN (Q9UL18 ), AGO1_MOUSE (Q8CJG1 ), AGO1_SCHPO (O74957 ), AGO2_ARATH (Q9SHF3 ), AGO2_BOVIN (Q6QME8 ), AGO2_DROME (Q9VUQ5 ), AGO2_HUMAN (Q9UKV8 ), AGO2_MOUSE (Q8CJG0 ), AGO2_ORYSJ (Q7XTS4 ), AGO2_RABIT (O77503 ), AGO2_RAT (Q9QZ81 ), AGO2_XENLA (Q6DCX2 ), AGO2_XENTR (Q6DJB9 ), AGO3_ARATH (Q9SHF2 ), AGO3_BOMMO (A9ZSZ2 ), AGO3_BOVIN (Q6T5B7 ), AGO3_CHICK (Q5ZLG4 ), AGO3_DANRE (A3KPK0 ), AGO3_DROME (Q7PLK0 ), AGO3_HUMAN (Q9H9G7 ), AGO3_MOUSE (Q8CJF9 ), AGO3_ORYSJ (Q7XTS3 ), AGO4A_ORYSJ (Q9SDG8 ), AGO4B_ORYSJ (Q0JF58 ), AGO4_ARATH (Q9ZVD5 ), AGO4_CHICK (Q5ZMW0 ), AGO4_HUMAN (Q9HCK5 ), AGO4_MOUSE (Q8CJF8 ), AGO4_XENLA (Q4KLV6 ), AGO5_ARATH (Q9SJK3 ), AGO6_ARATH (O48771 ), AGO7_ARATH (Q9C793 ), AGO7_ORYSJ (Q75HC2 ), AGO8_ARATH (Q3E984 ), AGO9_ARATH (Q84VQ0 ), AUB_DROME (O76922 ), DCL1_ARATH (Q9SP32 ), DCL1_ORYSJ (Q8LMR2 ), DCL2A_ORYSJ (Q10HL3 ), DCL2B_ORYSJ (Q69LX2 ), DCL2_ARATH (Q3EBC8 ), DCL3A_ORYSJ (Q5N870 ), DCL3B_ORYSJ (Q7XD96 ), DCL3_ARATH (Q9LXW7 ), DCL4_ARATH (P84634 ), DCL4_ORYSJ (A7LFZ6 ), DCL_GIAIC (A8BQJ3 ), DCR1_CAEEL (P34529 ), DCR1_DROME (Q9VCU9 ), DICER_BOVIN (Q6TUI4 ), DICER_CHICK (Q25BN1 ), DICER_CRIGR (A0MQH0 ), DICER_DANRE (Q6TV19 ), DICER_HUMAN (Q9UPY3 ), DICER_MOUSE (Q8R418 ), DICER_XENTR (B3DLA6 ), ERGO1_CAEEL (O61931 ), MEL1_ORYSJ (Q851R2 ), NRDE3_CAEEL (Q21691 ), PIWI1_SCHMD (Q2Q5Y9 ), PIWI2_SCHMD (Q2Q5Y8 ), PIWIL_DUGJA (Q2PC95 ), PIWI_DROME (Q9VKM1 ), PIWL1_CHICK (A6N7Y9 ), PIWL1_DANRE (Q8UVX0 ), PIWL1_HUMAN (Q96J94 ), PIWL1_MOUSE (Q9JMB7 ), PIWL2_DANRE (A2CEI6 ), PIWL2_HUMAN (Q8TC59 ), PIWL2_MOUSE (Q8CDG1 ), PIWL2_ONCMY (A6P7L8 ), PIWL2_XENTR (A8KBF3 ), PIWL3_HUMAN (Q7Z3Z3 ), PIWL4_HUMAN (Q7Z3Z4 ), PIWL4_MOUSE (Q8CGT6 ), PIWL4_RAT (Q4G033 ), PNH1_ORYSJ (Q69VD5 ), SIWI_BOMMO (A8D8P8 ), TAG76_CAEEL (P34681 ), WAGO1_CAEEL (Q21770 ), WAGO4_CAEEL (O62275 ), YQ53_CAEEL (Q09249 )» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
1 sequence
AGO1_LEIBR (G8XR08 ) |
| PDB [Detailed view] |
81 PDB
1R6Z; 1SI2; 1SI3; 1T2R; 1T2S; 1VYN; 2FFL; 2L5C; 2L5D; 2QVW; 2XFM; 3MJ0; 3O3I; 3O6E; 3O7V; 3O7X; 3QIR; 4F3T; 4KRE; 4KRF; 4KXT; 4NGB; 4NGC; 4NGD; 4NGF; 4NGG; 4NH3; 4NH5; 4NH6; 4NHA; 4OLA; 4OLB; 4W5N; 4W5O; 4W5Q; 4W5R; 4W5T; 4Z4C; 4Z4D; 4Z4E; 4Z4F; 4Z4G; 4Z4H; 4Z4I; 5GUH; 5JS1; 5JS2; 5KI6; 5T7B; 5VM9; 5W6V; 5WEA; 5ZAK; 5ZAL; 5ZAM; 6CBD; 6KR6; 6MDZ; 6MFN; 6MFR; 6N4O; 6NIT; 6OON; 6RA4; 7ELD; 7ELE; 7KI3; 7SWF; 7VG2; 7VG3; 7YYM; 7YYN; 7YZ4; 7ZPI; 7ZPK; 8DFV; 8DG5; 8DG7; 8DGA; 8DGI; 8DGJ » more |
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission