PROSITE entry PS50835
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50835
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | IG_LIKE |
Accession [info] | PS50835 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-MAY-2003 CREATED;
26-FEB-2020 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC50835 |
Associated ProRule [info] | PRU00114 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | Ig-like domain profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=91; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=91; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.9519000; R2=0.0181497; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3098.5483398; R2=1.1827956; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.1%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=306; H_SCORE=3460; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=251; H_SCORE=3395; N_SCORE=5.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; M0=-8; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='P'; M= -9,-19,-38,-10, -1,-29,-19,-20,-19,-10,-28,-19,-19, 82, -9,-19, -9, -9,-28,-30,-29,-10; /M: SY='K'; M= -5, -3,-24, -3, 5,-20,-16, -7,-18, 7,-18,-10, -3, -6, 4, 4, 1, 0,-14,-24,-11, 3; /M: SY='V'; M= -4,-22,-19,-26,-20, 5,-24,-22, 13,-18, 6, 4,-19,-19,-20,-17,-10, -3, 15,-18, -3,-20; /M: SY='T'; M= -2,-12,-18,-15, -9, -8,-20,-12, -1, -9, -5, -1, -9,-15, -6, -9, 0, 5, 2,-23, -5, -8; /M: M= -6,-12,-24,-12, -4,-14,-21,-15, -1, -8, -3, -1,-12, -6, -5, -9, -7, -3, 0,-25,-11, -6; /M: SY='T'; M= -4,-13,-19,-16,-10, -4,-21,-12, 0,-12, -1, 0,-10,-15, -9,-11, -5, 1, 1,-22, -5,-10; /I: I=-3; MD=-15; /M: SY='P'; M= -5,-13,-22,-12, -5,-13,-17,-11, -7, -8, -9, -6,-11, 9, -6, -9, -5, -4, -8,-21,-11, -7; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='S'; M= -2, -5,-17, -5, 0,-18, -9, -9,-16, 0,-18,-11, -2, 0, -1, -2, 4, 0,-12,-24,-14, -2; D=-3; /I: I=-3; DM=-15; /M: SY='D'; M= -4, 3,-20, 4, 4,-20,-11, -5,-18, 0,-18,-13, 4, -4, 1, -3, 4, 0,-16,-25,-13, 2; D=-3; /I: I=-3; DM=-15; /M: M= -1, -9,-17,-10, -4,-13,-15, -9, -6, -7, -7, -3, -8,-12, -3, -8, 0, 0, -3,-22, -9, -4; D=-3; /I: I=-3; DM=-15; /M: SY='E'; M= -7, -7,-23, -7, 1,-14,-18, -9,-11, -4,-10, -7, -6, -8, -2, -3, -3, -1, -9,-20, -9, -1; /M: SY='V'; M= 3,-16,-17,-18,-13, -8,-16,-18, 4,-15, 1, 1,-14,-16,-13,-16, -4, -1, 9,-25,-11,-14; /M: M= -4, -5,-23, -6, 0,-16,-15, -9,-13, -2,-12, -8, -3, -6, -1, -2, -1, -2,-11,-24,-11, -1; /M: SY='E'; M= -7, 1,-25, 4, 16,-22,-17, -7,-18, 1,-16,-12, -2, -1, 4, -3, -1, -5,-16,-28,-15, 9; /M: SY='G'; M= -2, -2,-26, -3,-12,-27, 41,-13,-33,-12,-27,-18, 5,-18,-12,-12, 3,-13,-26,-24,-24,-12; /M: SY='E'; M= -3, 6,-23, 7, 13,-26, -9, -3,-23, 3,-21,-13, 5, -9, 10, -1, 6, 0,-20,-29,-16, 11; /I: I=-4; MD=-19; /M: SY='S'; M= -1, -3,-19, -4, -3,-17,-13,-11,-13, -3,-15,-10, -1, -4, -4, -4, 4, 3, -9,-28,-15, -4; D=-4; /I: I=-4; MD=-19; /M: SY='V'; M= 1,-15,-13,-18,-15, -2,-14,-15, 7,-13, 4, 3,-13,-16,-14,-12, -7, -3, 11,-18, -6,-15; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='T'; M= -2, -4,-18, -8, -3,-14,-18,-13, -9, -3,-11, -7, -2,-14, -3, -3, 7, 15, -3,-27,-11, -3; /M: SY='L'; M= -9,-29,-20,-32,-22, 16,-29,-20, 19,-28, 36, 17,-27,-28,-22,-20,-25, -9, 12,-15, 3,-22; /M: SY='T'; M= -3, -5,-19, -8, -4,-14,-15,-11,-10, -6,-11, -7, -2,-12, -4, -4, 6, 11, -5,-28,-11, -5; /M: SY='C'; M=-10,-20,118,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: M= -7, -8,-22, -9, -1,-11,-20, -6, -9, -4, -6, -4, -6,-16, -1, -1, -4, 0, -7,-21, -6, -2; /M: SY='V'; M= 13,-19,-15,-24,-19, -6,-17,-23, 9,-17, 1, 0,-18,-18,-18,-19, -2, 0, 17,-21,-10,-19; /M: SY='S'; M= -2, 0,-19, -1, 1,-17,-13, -7,-17, -2,-18,-12, 3,-12, -1, -1, 8, 5,-12,-26,-11, -1; /M: SY='G'; M= -2, 3,-25, 4, -6,-26, 25,-10,-30,-10,-25,-18, 5,-14, -9,-13, 4, -9,-23,-26,-21, -8; /I: I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14; /M: SY='Y'; M= -4, -3,-14, -5, -5, -1, -7, -2, -7, -7, -8, -6, -1, -6, -6, -7, 0, 0, -7,-10, 1, -6; D=-3; /I: I=-3; DM=-14; /M: SY='P'; M= -7, -7,-25, -6, -3,-13,-15, -9,-13, -7,-16,-11, -5, 14, -6,-10, -3, -3,-15,-23,-10, -6; D=-3; /I: I=-3; DM=-14; /M: SY='P'; M= -6, -6,-29, -1, 4,-26,-10,-12,-22, -4,-23,-16, -6, 26, -2, -8, 0, -4,-22,-28,-20, -1; /M: SY='D'; M= -5, 3,-24, 5, 3,-22,-10, -8,-19, -3,-21,-14, 2, -1, -2, -6, 3, -2,-15,-30,-16, -1; /M: SY='P'; M= -2,-19,-23,-20,-14,-10,-22,-18, 5,-15, -4, -2,-17, 7,-14,-18, -7, -2, 4,-23, -9,-16; /M: SY='T'; M= -4, 1,-21, -1, 3,-16,-14, -5,-16, -2,-17,-11, 3,-12, 3, -2, 7, 8,-13,-24, -9, 2; /M: SY='I'; M= -8,-28,-20,-32,-27, 13,-31,-21, 24,-23, 15, 12,-25,-26,-24,-20,-17, -6, 24,-12, 8,-26; /M: SY='T'; M= -4, -3,-19, -6, -2,-13,-16, -5,-15, 0,-15, -8, 1,-14, 0, 1, 7, 10,-10,-25, -6, -1; /M: SY='W'; M=-20,-39,-49,-40,-30, 12,-20,-29,-19,-20,-18,-19,-39,-30,-20,-20,-39,-29,-29,144, 31,-20; /M: SY='Y'; M=-10,-16,-22,-19,-12, 7,-23,-10, -1,-10, 2, 2,-13,-21,-11, -8,-10, -2, -1, -9, 9,-12; /M: SY='R'; M=-12, -7,-27, -8, 0,-16,-19, -4,-19, 16,-15, -5, -4,-15, 4, 21, -8, -8,-14,-19, -5, 1; /M: SY='B'; M= -9, 19,-25, 19, 8,-26, -6, 0,-24, 0,-23,-17, 18,-11, 4, -2, 3, -5,-24,-32,-17, 6; /I: I=-2; MD=-9; /M: SY='G'; M= 0, 0,-22, -1, -8,-23, 29,-10,-27,-10,-23,-15, 6,-13, -9,-11, 4, -8,-21,-22,-20, -9; D=-2; /I: I=-2; MD=-9; /M: SY='Q'; M= -3, -2,-18, -3, -1,-17, -4, -6,-14, 1,-14, -7, 0, -5, 2, 0, 1, -2,-11,-18,-11, 0; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9; /M: SY='E'; M= -5, -1,-16, 1, 5,-12, -9, -2,-10, 1, -9, -6, -1, -5, 2, 0, -2, -4, -9,-14, -6, 3; D=-2; /I: I=-2; DM=-9; /M: SY='T'; M= -3, -5,-15, -7, -4, -7,-12, -7, -4, -4, -5, -3, -3, -9, -3, -4, -2, 1, -3,-11, -3, -4; D=-2; /I: I=-2; DM=-9; /M: SY='S'; M= -2, -1,-15, -3, -4,-12, -3, -7,-11, -6,-11, -8, 2, -7, -4, -6, 5, 3, -8,-20,-10, -4; D=-2; /I: I=-2; DM=-9; /M: M= -3, -6,-17, -7, -2,-11,-13, -8, -4, -6, -4, -3, -4,-10, 0, -6, -2, 0, -5,-18, -7, -1; D=-2; /I: I=-2; DM=-9; /M: SY='P'; M= -4, -4,-22, -1, 4,-18,-10,-10,-15, -4,-16,-11, -4, 14, -2, -8, 1, -1,-15,-23,-14, 0; D=-2; /I: I=-2; DM=-9; /M: SY='S'; M= -2, -2,-19, -3, 0,-14, -9, -9,-11, -5,-10, -8, -2, -8, -3, -6, 1, 0, -9,-19,-10, -2; D=-2; /I: I=-2; DM=-9; /M: SY='K'; M= -5, -4,-19, -4, 0,-17,-13, -8,-15, 6,-14, -8, -2, -9, 0, 5, 0, -1,-10,-22,-10, -1; D=-2; /I: I=-2; DM=-9; /M: SY='E'; M= -8, 1,-25, 2, 8,-19,-15, 4,-17, -1,-15, -8, 2, -5, 8, -2, -2, -6,-18,-23, -8, 7; D=-2; /I: I=-2; DM=-9; /M: SY='E'; M= -7, 2,-24, 4, 9,-22,-14, -4,-20, 0,-18,-13, 0, -3, 3, -1, 1, -2,-18,-27,-12, 5; /M: SY='N'; M= -6, 2,-24, 0, 1,-21, -7, -7,-19, 0,-19,-12, 5, -8, -1, 1, 0, -4,-17,-25,-15, -1; /M: M= -5, -2,-24, -3, -1,-16, -9, -3,-16, -4,-14, -9, -1,-12, -2, -3, -1, -4,-13,-23, -8, -3; /M: SY='T'; M= -3, -9,-17,-12,-10, -9,-17,-14, -4, -9, -6, -4, -7,-16, -9, -8, 1, 6, 2,-26, -8,-10; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='F'; M= -8,-18,-17,-21,-17, 16,-21,-12, 7,-15, 8, 5,-15,-19,-16,-12,-11, -3, 6, -5, 10,-16; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11; /M: SY='T'; M= -4, -1,-14, -2, -3, -5, -9, -2, -9, -4, -8, -6, -1,-10, -4, -5, 1, 2, -7,-13, 1, -4; D=-2; /I: I=-2; DM=-11; /M: SY='S'; M= -1, -1,-15, -2, -1,-13, -5, -5,-12, -3,-12, -7, 1, -7, 0, -4, 4, 1,-10,-19, -9, -1; D=-2; /I: I=-2; DM=-11; /M: SY='S'; M= 1, -3,-16, -5, -6,-14, 2, -9,-13, -6,-12, -8, 0,-11, -6, -7, 4, 1, -8,-20,-11, -6; D=-2; /I: I=-2; DM=-11; /M: SY='N'; M= -5, 1,-19, 0, 1,-17, -6, -2,-17, 0,-17,-10, 3,-11, 2, -2, 3, -1,-14,-21, -9, 1; D=-2; /I: I=-2; DM=-11; /M: SY='S'; M= 1, -1,-18, -4, -5,-18, 3, -7,-20, -7,-21,-14, 5,-15, -4, -7, 12, 3,-14,-28,-14, -5; /M: SY='T'; M= -3, -6,-19, -9, -4,-12,-16,-11, -9, -6,-10, -6, -4,-15, -4, -5, 5, 8, -4,-24, -8, -5; /M: SY='L'; M= -8,-26,-17,-28,-21, 8,-28,-20, 17,-25, 32, 14,-25,-27,-20,-19,-22, -7, 12,-19, 0,-20; /M: SY='T'; M= -5, -9,-18,-14,-10, -7,-20,-11, -5, -8, -6, -4, -6,-16, -7, -5, 2, 12, -1,-23, -3,-10; /M: SY='I'; M= -9,-29,-22,-34,-26, 11,-33,-24, 29,-26, 23, 16,-24,-25,-23,-23,-20, -7, 22,-17, 2,-26; /M: SY='E'; M= -6, -1,-23, -1, 4,-22,-14, -6,-19, 1,-19,-12, 1, 0, 4, 1, 4, 2,-17,-28,-15, 2; /I: I=-5; MD=-13; /M: SY='N'; M= -2, 3,-20, 1, 1,-19, -7, -5,-16, 0,-17,-10, 7, -8, 0, -2, 4, -2,-14,-25,-14, 0; D=-2; /I: I=-5; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='V'; M= 3,-13,-13,-15,-11, -6,-17,-16, 4,-11, 0, 1,-12,-16,-11,-11, -1, 2, 10,-23, -9,-11; D=-2; /I: I=-5; DM=-13; /M: SY='E'; M= -5, 1,-20, 1, 5,-19,-11, -5,-17, 2,-16,-10, 0, -9, 5, 0, 3, 2,-14,-21,-11, 5; D=-2; /I: I=-5; DM=-13; /M: M= -5,-11,-24,-10, -3,-13,-15,-12,-13, -5,-13,-10,-11, -1, -5, -6, -7, -6,-12, -3, -7, -5; D=-2; /I: I=-5; DM=-13; /M: SY='E'; M= -4, 5,-23, 6, 13,-21,-10, -4,-20, 1,-18,-13, 5,-10, 5, -2, 4, -3,-18,-26,-14, 9; D=-2; /I: I=-5; DM=-13; /M: SY='D'; M=-12, 27,-26, 36, 13,-30,-10, 4,-30, -1,-25,-20, 13,-10, 2, -7, 3, -6,-24,-34,-15, 7; D=-2; /I: I=-5; DM=-13; /M: SY='S'; M= 2, 0,-21, -2, 0,-19, -1, -8,-20, -5,-19,-13, 2,-11, -2, -6, 7, 2,-15,-23,-13, -1; D=-2; /I: I=-5; DM=-13; /M: SY='G'; M= 5, -3,-25, -4, -9,-27, 31,-15,-29,-10,-24,-17, 1,-14,-10,-13, 3, -9,-21,-23,-23,-10; /M: SY='T'; M= -6, -4,-21, -7, -2,-13,-17,-11, -8, -5,-10, -6, -2,-11, -5, -6, 1, 4, -5,-27,-10, -4; /M: SY='Y'; M=-19,-22,-27,-24,-22, 35,-30, 11, 2,-14, 3, 1,-20,-30,-16,-12,-20,-10, -5, 22, 65,-22; /M: SY='T'; M= -5, -5,-17, -9, -5,-10,-18, -9,-11, -3,-12, -7, -3,-15, -3, -2, 6, 12, -6,-22, -3, -5; /M: SY='C'; M=-10,-20,117,-50,-50,-20,-30,-30,-28,-30,-19,-19,-20,-40,-30,-30,-10,-10, -9,-49,-29,-30; /M: SY='Q'; M= -5, -7,-20, -9, 0,-15,-20, -8, -8, 0, -9, -3, -5,-16, 2, 2, -1, 1, -5,-25, -9, 1; /M: SY='V'; M= 16,-20,-12,-25,-20, -8,-17,-23, 10,-15, 2, 2,-19,-21,-19,-17, -3, 0, 23,-25,-13,-20; /M: SY='S'; M= -3, 0,-20, -3, 3,-19,-13, -6,-16, -1,-17,-10, 2,-13, 3, 0, 6, 6,-12,-25,-12, 3; /I: I=-5; MD=-12; /M: SY='H'; M= -9, 11,-19, 5, -2,-13, -9, 25,-16, -5,-17, -9, 19,-16, 1, -3, 1, -5,-19,-23, -1, -2; D=-2; /I: I=-5; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; /M: SY='N'; M= 0, 1,-16, 0, -2,-14, 2, -7,-14, -4,-14,-10, 5, -9, -4, -4, 4, -1,-10,-21,-12, -4; D=-2; /I: I=-5; DM=-12; /M: SY='N'; M= -2, 1,-16, 0, 0,-14, -6, -2,-12, -3,-12, -8, 4,-11, -1, -3, 4, 0,-10,-22, -9, -1; D=-2; /I: I=-5; DM=-12; /M: SY='S'; M= 0, -3,-19, -3, -2,-17, -2, -7,-16, -6,-15,-11, -1, -5, -4, -8, 3, -1,-12,-20,-13, -4; D=-2; /I: I=-5; DM=-12; /M: SY='G'; M= -2, -5,-19, -7, -7,-13, 3,-11,-13, -9,-12, -8, -2,-12, -8, -9, 0, -4, -9,-20,-12, -8; D=-2; /I: I=-5; DM=-12; /M: M= -3, -9,-21, -9, -5,-14,-10,-10, -8, -7, -9, -4, -7, -7, -5, -7, -2, -2, -6,-21,-11, -6; D=-2; /I: I=-5; DM=-12; /M: SY='S'; M= -3, -4,-21, -5, -1,-16,-14,-10,-12, -4,-13, -8, -3, -8, -3, -5, 2, 1, -8,-27,-12, -2; /M: SY='E'; M= -4, -2,-22, -1, 1,-18,-16, -7,-13, -3,-12, -8, -2,-10, 0, -3, 1, 0, -9,-27,-11, 0; /M: SY='E'; M= -4, -1,-22, 0, 8,-20,-14, -5,-18, -1,-18,-11, 0, -5, 6, -3, 7, 3,-15,-27,-11, 6; /M: SY='K'; M= 1, -8,-21,-10, -3,-17,-16,-13,-12, 5,-11, -6, -7,-12, -2, 3, -4, -4, -6,-23,-13, -3; /M: SY='T'; M= -3, 1,-19, -2, 4,-18,-15,-10,-15, 0,-16,-11, 2, -8, -1, -2, 7, 9,-10,-29,-14, 1; /M: SY='V'; M= -4,-26,-17,-30,-23, 6,-29,-24, 20,-23, 17, 10,-23,-24,-22,-20,-15, -3, 21,-20, -3,-23; /M: SY='S'; M= 3, 1,-14, -3, -1,-16,-10, -9,-15, -7,-20,-14, 6,-12, -1, -7, 21, 18, -9,-32,-14, -1; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Post-processing [info]
COMPETES_HIT_WITH | PS50853(15) |
Numerical results [info]
Total number of hits | 5'148 in 2'235 different sequences |
Number of true positive hits | 5'135 in 2'222 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 13 in 13 different sequences |
Number of false negative sequences | 148 |
Number of 'partial' sequences | 4 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 99.75 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 97.20 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Bacteriophages, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria), Eukaryotic viruses |
Maximum number of repetitions [info] | 144 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | N_Hulo |
Feature key [info] | DOMAIN |
Feature description [info] | Ig-like |
Version [info] | 7 |
Cross-references [info]