PROSITE entry PS50856
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | AMOP |
| Accession [info] | PS50856 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-MAY-2004 CREATED;
13-FEB-2019 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50856 |
| Associated ProRule [info] | PRU00347 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | AMOP domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=151; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=146; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.6896198; R2=0.0100652; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=10636.2441406; R2=15.9006548; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=1; SCORE=1124; H_SCORE=28509; N_SCORE=14.0; MODE=1; TEXT='!!'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=578; H_SCORE=19827; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=379; H_SCORE=16663; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='E'; M= -5, -9,-25, -7, 7,-18, -2,-11,-13, -9, -8, -2, -9, -8, -4,-12, -4, -9,-11,-26,-17, 1; /M: SY='R'; M=-15,-11,-26,-12, -5,-10,-22, 7,-19, 16,-15, -5, -4,-20, 0, 32,-11,-10,-10,-20, -2, -5; /M: SY='P'; M= -5, 4,-30, 8, 6,-28, -7, -9,-26, 0,-26,-19, 3, 20, -3, -4, -2, -8,-25,-30,-23, 0; /M: SY='W'; M=-13, -4,-32,-10, -9,-12,-15, -9,-17, -2,-22,-13, 3,-22, 0, -4,-13,-13,-22, 31, 1, -3; /M: SY='Y'; M= -1, 1,-25, 5, -4,-10,-14, -2,-16, -8,-16,-14, -5, -3, -7,-13, -1, -5,-15,-12, 10, -7; /M: SY='R'; M=-14,-14,-25,-16, -8,-13,-23, -9,-12, 12, -8, -3, -7,-21, -1, 38, -9, -3, -3,-22, -9, -8; /M: SY='D'; M= 1, 4,-21, 9, 3,-17,-16,-12,-12,-11, 2, -8, -6,-15, -7,-14, -6, -4, -9,-28,-13, -2; /M: SY='E'; M= -5, -5,-22, -5, 11,-18,-17, -5,-10, -1, -6, 3, -6,-12, 10, -3, 1, -3,-12,-27,-12, 11; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='E'; M=-13, -4,-26, 1, 9,-14,-24, 2, -6,-12, 8, 0, -9,-17, 0,-11,-14,-11,-11,-26, -6, 4; /M: SY='Q'; M= -5, 9,-26, 7, 11,-29,-13, 0,-25, 14,-23,-12, 10,-12, 17, 15, 0, -7,-23,-26,-15, 13; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='L'; M=-12,-23,-23,-24,-11, 10,-29,-12, 12,-21, 28, 15,-23,-24,-13,-16,-23,-10, 4,-14, 8,-13; /M: SY='K'; M= -8, 13,-26, 13, 16,-27,-13, -2,-27, 17,-25,-17, 14,-11, 7, 14, 0, -6,-23,-29,-16, 11; /M: SY='C'; M= 1,-10, 16,-12, -6,-13,-16,-14,-15,-15,-11,-12, -8,-20,-10,-16, 7, 4, -8,-32,-13, -8; /M: SY='D'; M=-13, 17,-30, 25, 23,-36,-17, 1,-30, 16,-26,-15, 6, -9, 24, 7, -2,-10,-28,-28,-15, 23; /M: SY='P'; M= -6, -3,-28, 3, -1,-28, 2,-12,-28, -5,-29,-20, -1, 18, -5, -3, 5, -5,-24,-30,-23, -5; /M: SY='R'; M= -9, 0,-26, 2, 8,-14,-18, -4,-23, 8,-17,-10, -1,-14, 10, 14, -5, -9,-19,-19, -8, 9; /M: SY='W'; M=-15,-27,-29,-29,-18, 18,-26,-17, -3,-18, 10, 1,-24,-27,-12,-10,-25,-15, -9, 27, 12,-13; /M: SY='P'; M=-13,-19,-34,-16, -8,-14,-21,-16,-12, -9, -9, -9,-16, 26,-10, -6,-17,-11,-19, -7,-13,-11; /M: SY='N'; M= -4, 13,-20, 3, -3,-19, -8, -4,-12, 0,-23,-13, 26,-16, -1, -3, 12, 3,-15,-34,-16, -3; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='W'; M=-19,-31,-30,-35,-28, 43,-27,-15, -4,-22, -1, -5,-27,-30,-27,-18,-25,-15, -8, 53, 38,-25; /M: SY='M'; M= 1,-18,-23,-22,-17,-11, 5,-16, -1,-19, 6, 9,-14,-21,-11,-18,-11,-12, -4,-20,-12,-14; /M: SY='W'; M= -7,-12,-30,-15, -9,-10,-16, 0,-17, -8,-18,-12, -7,-19, -5, -4, -7, -8,-18, 23, 3, -7; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='D'; M=-11, 29,-23, 32, 17,-27,-10, -2,-27, -1,-25,-22, 21,-10, 2, -6, 8, 4,-24,-37,-18, 9; /M: SY='L'; M= -9, -9,-22,-10, -5, -9,-21, -8, 1,-15, 16, 6, -8,-22, 2,-10,-12, -7, -7,-25, -7, -1; /M: SY='P'; M= -2,-20,-27,-16, -9,-15,-20,-22, -7,-13,-17,-11,-19, 39,-15,-19, -5, -3, -7,-27,-20,-15; /M: SY='S'; M= 6, 0,-16, 1, -2,-20, -7,-12,-14,-12,-19,-15, 3, -6, -4,-13, 20, 9, -9,-35,-18, -4; /M: SY='C'; M=-10,-20,105,-28,-27,-21,-29,-29,-29,-28,-21,-20,-20,-28,-28,-29,-10,-10,-12,-48,-30,-28; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='C'; M=-11,-19,100,-28,-27,-18,-29,-25,-29,-24,-19,-18,-18,-38,-25,-20,-10,-10,-11,-44,-23,-27; /M: SY='T'; M= 8, -7,-14,-12, -8,-13,-13,-17, -6,-10,-10, -8, -3,-13, -7,-12, 15, 17, -1,-30,-13, -8; /M: SY='W'; M= -9,-23,-29,-23,-13, 9,-24, -9, -2,-16, 9, -1,-24,-25,-12,-15,-22,-13, -9, 28, 25,-13; /M: SY='P'; M= -6, -4,-30, 0, 9,-30,-18, -7,-21, 0,-23,-13, -6, 25, 14, -3, -1, -3,-24,-27,-19, 10; /M: SY='Q'; M= -9, -6,-27, -6, 7,-27,-21, 4,-14, -1,-10, -1, -5, -4, 29, 0, -3, -2,-20,-23, -9, 17; /M: SY='A'; M= 16, -4,-22, -6, 9,-25, 7,-12,-24, -3,-18,-15, -4,-10, -2, -6, 3, -8,-16,-23,-21, 3; /M: SY='R'; M= -2,-19,-22,-20,-12,-12,-22,-14, 1, -4, -1, 3,-15,-11, -5, 5,-10, -6, 5,-23,-11,-10; /M: SY='A'; M= 7,-15,-21,-19,-10,-13,-15, -6, -7, -6, 1, 5,-13, -9, -5, 1, -9, -7, -5,-22,-10, -9; /M: SY='D'; M=-18, 35,-28, 49, 11,-27,-14, 1,-31, -2,-24,-24, 12,-13, -2,-10, -1, -4,-24,-29, -4, 4; /M: SY='S'; M= -1,-11,-17,-12, -7, -6,-14,-14, -7, -9, -5, -6, -5,-17, -7, -9, 9, 5, -4,-28, -9, -7; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='G'; M= -2, -8,-23, -8,-11,-20, 33,-14,-25, -6,-17,-11, -3,-15,-11, -8, -4,-14,-19,-16,-18,-11; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29, 74,-30,-20, 2,-30, 14, 2,-21,-30,-38,-20,-21,-10, 1, 7, 27,-29; /M: SY='R'; M=-14,-13,-25,-16, -6, -5,-20, -3,-13, 6, -7, 5, -7,-20, 6, 25, -8, -7,-11,-18, -4, -1; /M: SY='P'; M=-11,-21,-36,-19,-11,-14,-20,-23,-18,-13,-23,-18,-21, 34,-13,-18,-12, -3,-24, 21, -9,-13; /M: SY='D'; M= -9, 5,-26, 8, 0,-23,-19, 1,-15, 4,-15, -9, 0,-15, -2, 4, -7, -9, -9,-27, -9, -3; /M: SY='D'; M=-14, 8,-30, 15, 2,-21,-15, -3,-22, -3,-22,-14, 2, 12, -3, -5, -4, -7,-22,-25, -8, -3; /M: SY='A'; M= 13, -3,-23, -4, -1,-24, -1,-14,-18, -6,-16,-13, -5, -5, -6, -8, 1, -7,-12,-24,-19, -5; /M: SY='C'; M= 3,-11, 45,-17,-17,-22, -3,-21,-27,-20,-24,-19, -7,-25,-17,-21, 9, -2,-12,-39,-26,-17; /M: SY='D'; M=-11, 6,-31, 13, -4,-25, 13,-12,-34, -8,-27,-23, 1,-17, -9, -9, -3,-13,-27, 1,-14, -6; /M: SY='P'; M= -6,-17,-34,-16, -5,-19,-19,-15,-14, 0,-18, -7,-16, 15, 0, -4,-13,-12,-18, 3,-10, -4; /M: SY='D'; M=-10, 11,-29, 19, 13,-30, -8, -7,-29, 9,-24,-16, 2, 0, 2, 2, -4,-10,-24,-29,-18, 6; /M: SY='E'; M= -7, -5,-23, -4, 10,-11,-11, 0,-20, -5,-14,-11, -1,-14, 3, -2, 4, -4,-17,-25, -9, 6; /M: SY='R'; M=-11, 4,-28, 3, 0,-27, 4, -4,-31, 14,-26,-14, 11,-17, 5, 22, -3,-11,-25,-24,-17, 1; /I: I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16; /M: SY='P'; M= -1, -8,-15, -8, -6,-11, -2,-11, -5, -9,-10, -6, -4, 7, -7,-11, 3, 1, -6,-17,-11, -8; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='T'; M= 0,-12,-11,-14,-11, -5,-15,-15, 2,-15, 4, -1, -9,-16,-11,-12, 5, 12, 7,-25, -8,-11; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='C'; M= -9, -7, 48, -8, -5,-17,-22,-16,-21,-16,-10,-13,-11,-23,-13,-17, -8, -8,-11,-34,-19, -9; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='I'; M= -4,-14,-17,-18,-13, -5,-21,-18, 10,-16, 5, 2,-10, -7,-11,-16, -1, 10, 6,-22, -7,-14; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='Y'; M=-13,-14,-21,-16,-12, 13,-22, 3, -3, -7, 2, 0,-12,-21, -5, -2,-11, -1, -7, 4, 31,-10; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='H'; M= -9, 1,-20, -1, 1,-18,-15, 25,-18, 4,-17, -5, 6,-13, 7, 3, 0, -2,-15,-24, -1, 2; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='P'; M= -9,-13,-27,-11, -4,-18,-19,-14,-10, 0,-16, -9,-10, 28, -5, 1, -6, -2,-13,-22,-15, -8; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='G'; M= 0, -5,-21, -7,-10,-23, 26,-14,-25,-12,-21,-14, 1,-14, -6,-12, 8, 4,-18,-23,-20, -8; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='A'; M= 31, -7,-11,-13, -6,-18, -2,-15,-13, -6,-14,-11, -4,-10, -5, -9, 14, 4, -4,-23,-18, -6; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='R'; M=-10,-15,-23,-17, -8,-14,-24,-11, 1, 4, -5, 2,-10,-19, 2, 15, -9, -7, 5,-21, -8, -5; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='H'; M=-14, -6,-24, -9, -9, 2,-20, 35,-12,-14, -5, -1, 2,-23, -5, -8, -8, -9,-15,-17, 19, -9; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='I'; M= -6,-25,-22,-27,-23, 2,-26,-20, 17,-20, 5, 4,-21,-24,-18,-20,-10, -4, 17, -3, 6,-22; /M: SY='R'; M=-15,-18,-25,-21,-12, 1,-25, -8, -5, 3, -4, 5,-10,-22, -3, 24,-13, -9, -3,-16, -1, -9; /M: SY='S'; M= 8, 0,-10, -2, -2,-18, -4,-12,-18,-10,-26,-18, 8,-10, -2,-10, 36, 26, -8,-38,-18, -2; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='M'; M= -3,-14,-16,-16,-14, -9, -3,-10, 0, -8, -3, 11,-10,-18, -8, -4, -4, -4, 5,-21,-10,-12; D=-5; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='Q'; M= -6,-11,-19,-12, -1,-12,-19, -6, -2, -9, 9, 5,-10,-15, 12, -5, -7, -1, -7,-19, -5, 5; D=-5; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='P'; M= 7, -1,-17, -3, -2,-19, -5,-10,-15, -7,-21,-15, 4, 16, -4,-11, 12, 3,-14,-27,-19, -4; D=-5; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='V'; M= -1,-14,-10,-16,-15, -6,-10,-18, 3,-16, 4, 0,-11,-18,-14,-14, -1, 6, 8,-23, -9,-15; D=-5; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='E'; M= -3, -9,-20, -8, 7, -4,-17, -8, -6, -6, -3, -2,-11, -3, -4, -9, -7, -6, -6,-15, -4, 2; D=-5; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='S'; M= -1, -2,-15, -2, 3,-19, -8, -4,-17, 2,-20,-11, 4,-10, 11, 8, 17, 8,-13,-25,-12, 6; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10; /M: SY='T'; M= -1, -3,-11, -7, -7, -3,-13, -7, -8, -7,-10, -8, -1,-11, -6, -7, 12, 23, -3,-15, 5, -7; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='G'; M= -7,-17,-29,-17,-18,-14, 22, -6,-20,-22, -5, -6,-11,-24,-16,-17,-13,-18,-19, -6,-10,-17; /M: SY='A'; M= 16, -8,-16,-12, -6,-14, -8, -8,-16, -3,-17,-12, -3,-14, -3, 1, 12, 3, -8,-20, -5, -6; /M: SY='G'; M= 13, -6,-23, -7, -2,-26, 29,-16,-28,-11,-23,-17, -2,-13, -9,-16, 6,-10,-20,-23,-25, -5; /M: SY='Q'; M= -9, -2,-30, -2, 12,-37, -3, 4,-24, 5,-22, -4, 0,-12, 43, 7, 0,-12,-30,-20,-14, 27; /M: SY='H'; M=-10, -9,-24, -9, -1,-22,-23, 23, -7, -5,-11, 3, -7,-19, 18, -2, -6,-10, -5,-26, -2, 7; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-21,-21, 33,-30, 18, 0,-11, 1, 0,-20,-30,-12,-11,-20,-10, -9, 29, 77,-21; /M: SY='D'; M=-11, 23,-27, 33, 3,-32, 14, -9,-35, -8,-27,-24, 11,-13, -8,-13, 3, -4,-25,-32,-22, -3; /M: SY='D'; M= 0, 7,-26, 12, 10,-24,-13, -5,-24, 3,-19,-17, -1, -2, 1, 2, -2, -8,-19,-24,-11, 4; /M: SY='B'; M= -8, 10,-28, 10, -2,-16,-10, -4,-22, -6,-23,-18, 8,-18, -2, -9, -2, -7,-23, 5, 0, -1; /M: SY='G'; M= 0,-10,-25,-12,-17,-23, 41,-15,-25,-16,-21, -5, -2,-18,-13,-16, 3,-11,-19,-23,-23,-15; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='Q'; M=-15, -6,-29, -5, 11, -8,-23, 12,-17, 2,-13, -5, -6,-16, 20, 6, -8,-11,-22, -9, 13, 14; /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22, 23,-30,-20, 16,-30, 43, 16,-28,-30,-24,-20,-28,-10, 8,-14, 6,-22; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='M'; M= -8,-21,-18,-26,-18, 2,-23,-11, 22,-17, 24, 31,-19,-19, -9,-14,-19, -8, 12,-16, 0,-14; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='T'; M= -5, -8,-13,-13, -8, -2,-19,-12, -3,-11, 3, -1, -7,-13, -3, -8, 2, 18, -2,-18, -3, -5; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='T'; M= 5, -1, -5, -4, -4, -8, -6, -9, -7, -5, -9, -7, 1, -5, -4, -6, 13, 18, -2,-17, -8, -4; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='D'; M= -8, 7,-15, 12, 1, -7, -9, 2,-12, -3,-11,-10, 1, -3, -2, -6, -1, -3,-11, -9, 6, -2; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='D'; M= -6, 10,-13, 15, 2, -9, -6, 1,-13, -3,-12,-11, 4, -8, -1, -5, 4, -1,-10,-12, 2, 0; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='Q'; M= -4, -3,-14, -4, 3,-14, -9, -2,-10, 0,-11, -4, -2, -7, 16, 0, 1, 0,-12, 0, -3, 10; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='P'; M= -3, -6,-14, -6, 0,-10, -3, -5, -6, -4, -7, 3, -5, 6, -1, -7, -1, -4, -7,-14, -9, -1; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='W'; M= -4,-14,-18,-13,-12, -5, 2,-14, -7,-10, -9, -7,-12, -5,-11,-11, -9, -9, -6, 17, -3,-11; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='G'; M= -1, -2,-13, -1, -6,-11, 6, -9, -7, -9,-10, -6, 1, -8, -6,-10, 4, -2, -5,-15,-10, -7; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='S'; M= 0, -1, -9, -2, -2,-11, 0, -8,-12, 2,-13, -8, 2, -6, -2, -1, 9, 8, -7,-16, -9, -2; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11; /M: SY='P'; M= -5,-11,-21, -5, 0,-16,-11,-11,-11, -5,-16,-11,-11, 48, -5,-11, -5, -5,-16,-16,-16, -5; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='R'; M= -4, 2,-13, 4, 0,-11, -8, -3,-10, 2, -5, -2, -1, -9, 0, 7, -4, -5, -7,-14, -6, -1; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='G'; M= 8, -4,-23, -6, -3,-24, 24,-15,-24,-11,-20,-15, 0,-15,-10,-15, 2,-11,-16,-24,-23, -6; /M: SY='H'; M=-13, -4,-30, -4, -3,-18, -5, 37,-28, 5,-22, -7, 2,-18, 2, 3, -9,-16,-25,-18, 10, -3; /M: SY='G'; M=-11, 5,-32, 6, 0,-22, 10, -9,-31, -6,-26,-21, 6,-18, -6, -5, -6,-15,-29, 4,-13, -3; /M: SY='W'; M= 1,-21,-25,-25,-17, 6,-19, -6, -6,-14, -2, -3,-17,-22,-13,-10,-14,-11, -7, 13, 10,-16; /M: SY='G'; M= -1,-13,-27,-14,-21,-24, 52,-19,-28,-19,-22,-10, -5,-21,-19,-19, -3,-17,-19,-21,-25,-20; /M: SY='T'; M= 6, -4,-18,-11, -3,-19,-15, -1,-13, -1,-12, -1, -3,-12, 7, -4, 5, 10, -9,-24, -9, 1; /M: SY='P'; M= 3,-16,-27,-15, -6,-21,-16,-16,-10, -8,-16, -6,-13, 31, -7,-11, -3, -5,-13,-26,-20,-10; /M: SY='P'; M=-10, -3,-34, -2, 0,-27,-14,-12,-20, -7,-30,-20, 3, 59, -7,-14, -4, -7,-30,-33,-27, -7; /M: SY='W'; M=-17,-31,-34,-31,-24, 21,-26,-12, -2,-21, 8, -2,-30,-30,-19,-17,-30,-17,-11, 57, 36,-21; /M: SY='Q'; M=-12, -6,-27,-14, -7,-16,-22, -5, 2, -1, -5, 7, 2,-18, 8, 8, -9, -8, -6,-23, -8, -2; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='E'; M= -3, -2,-12, -2, 5,-10, 0, -7,-10, -5, -5, -6, -2, -6, -2, -6, 1, 3, -8,-14, -9, 1; D=-8; /I: I=-8; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17; /M: SY='P'; M= 8, -6,-18, -6, 1,-21, -7,-10,-15, -6,-20,-12, -4, 15, 4,-10, 11, 2,-14,-24,-17, 1; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='P'; M= -5, -7,-18, -9, -7, -6,-15,-11, -8, -9,-13,-10, -4, 11, -9,-11, 4, 9, -8,-20, -6,-10; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='E'; M=-11, 4,-24, 8, 20,-15,-16, -3,-23, 14,-17,-12, 0, -8, 7, 14, -5, -8,-19,-19, -9, 13; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='V'; M= -6,-24,-13,-28,-24, 23,-25,-22, 18,-20, 9, 6,-21,-24,-26,-17,-12, -4, 25,-12, 4,-24; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='P'; M= -2,-10,-23, -5, 0,-21,-11,-13,-16, -8,-24,-16, -7, 43, -5,-13, 7, 2,-18,-27,-21, -5; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='S'; M= 10, -6,-15, -8, -8,-18, 10,-15,-17,-10,-18,-13, -2, -1, -9,-13, 11, 6,-11,-22,-18, -9; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='M'; M= -8,-13,-19,-14, -1, -4,-20, -8, 4, -7, 16, 18,-15,-16, -3, -7,-16, -8, -1,-18, -4, -2; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='S'; M= 3, -7,-11, -7, -5, -9, -7,-11, -7,-13, -5, -7, -2,-13, -5,-11, 16, 9, -3,-28,-12, -5; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='H'; M= -8, -1,-20, -4, -4,-14,-13, 47,-15, -8,-12, 2, 6,-16, 3, -4, -3,-10,-14,-25, 6, -3; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='W'; M=-19,-32,-34,-34,-27, 34,-26,-15, -6,-21, -1, -6,-29,-30,-23,-18,-29,-18,-14, 69, 39,-23; /M: M= -9, -9,-24,-10, -5, -3,-22, 0,-11, -1, 0, -1, -9,-19, -4, -2,-13,-10,-10,-18, 0, -4; /M: SY='Y'; M=-13, -9,-24,-12, -7, 4,-23, 14, -5,-10, -4, -1, -5,-23, -4, -8,-11, -9, -6,-11, 19, -7; /M: SY='D'; M=-18, 43,-30, 62, 27,-38,-12, 0,-38, 2,-28,-28, 17, -8, 3, -8, 0,-10,-30,-38,-20, 15; /M: SY='V'; M= -6,-23,-17,-25,-21, 1,-28,-16, 18,-17, 12, 13,-23,-25,-14,-15,-12, -1, 22,-19, 3,-18; /M: SY='L'; M=-11,-12,-24,-16, -3, -8,-25,-11, 5, -8, 8, 8, -9,-18, -4, -1,-12, -4, -1,-24, -7, -6; /M: SY='P'; M= 0,-14,-30, -8, -1,-27,-13,-17,-19,-10,-28,-19,-12, 57, -7,-17, 4, -2,-23,-32,-27, -7; /M: SY='W'; M=-18,-25,-32,-28,-19, 30,-26, -8, -8,-16, -5, -5,-22,-27,-11,-13,-22,-15,-15, 45, 36,-14; /M: SY='Y'; M=-14,-16,-26,-22,-19, 17,-27, -2, 7,-14, 0, 1,-10,-24,-13,-10,-12, -7, -1, 0, 32,-19; /M: SY='Y'; M=-10,-22,-26,-24,-19, 7,-24,-10, 4,-18, 5, 2,-19,-24,-13,-16,-13, -5, -3, 17, 21,-17; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='C'; M=-10,-15, 83,-23,-20,-22,-28,-25,-30,-10,-22,-18,-15,-33,-20,-15,-10,-10,-12,-43,-25,-20; /M: SY='M'; M= -9,-14,-27,-15,-10,-13, -1, -9,-13, -2, -2, 1,-11,-21, -3, 0,-13,-12,-13,-16, -4, -7; /M: SY='W'; M=-20,-15,-40,-11,-17, 7,-19,-18,-21,-15,-18,-19,-21,-25,-17,-17,-26,-21,-25, 78, 21,-14; /M: SY='W'; M= 13, -8,-25,-15, -9,-16, -8,-13,-16, -8,-17,-13, -4,-17, 0,-12, -4, -9,-17, 19, -6, -3; /M: SY='D'; M= -9, 16,-28, 28, 13,-32,-11, -8,-29, -4,-29,-24, 6, 16, -1,-12, 7, -3,-25,-37,-23, 5; /M: SY='E'; M=-15, 1,-29, 4, 20,-15,-20, 3,-27, 15,-19,-13, 0,-12, 7, 20, -7,-11,-22,-22, -7, 13; /I: I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16; /M: SY='G'; M= 6, -7,-16, -7, -7,-15, 14,-11,-15, -8,-14,-10, -5, 8, -8,-11, 0, -7,-12,-13,-15, -8; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='Q'; M= -4, -7,-12, -7, -3, -8,-12, -2, -3, -1, -6, -1, -5,-11, 5, 3, -1, -2, -1,-10, 1, 0; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='R'; M= -2, -8,-17,-10, -6, -6, 0,-10,-14, 3, -8, -5, -5,-13, -6, 5, -6, -8, -9,-11, -7, -6; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='P'; M= -2, -6,-24, -5, 10,-23,-19,-13,-15, -4,-17,-12, -8, 16, 3,-10, 2, 7,-13,-28,-18, 5; /M: SY='R'; M=-13, -7,-26, -7, 2, -8,-21, -9,-15, 0, -7, -3, -8,-17, -2, 9, -9, -2,-13, -9, -5, 0; /M: SY='Y'; M=-15,-11,-25,-16,-17, 27,-23, 8, -5,-12, -6, -5, -6,-26,-13,-10, -9, -5,-11, 9, 46,-17; /M: SY='M'; M=-13,-15,-30,-15, -5,-12,-22, 0, -8, -1, -9, 9,-14, 7, 7, 3,-13,-10,-15,-13, 4, -2; /M: SY='W'; M=-10,-17,-27,-18, -9, 1,-20,-14,-12, -4, -7, -6,-14,-20, -2, -5,-10, -9,-14, 12, 3, -4; /M: SY='R'; M=-17, 3,-30, 8, 20,-25,-19, 0,-31, 21,-21,-15, 2,-13, 12, 41, -6,-10,-24,-25,-14, 13; /M: SY='R'; M=-18, -3,-30, 0, 13,-23,-19, 0,-31, 24,-21,-13, 1,-16, 11, 52, -8,-10,-22,-23,-12, 8; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 16 in 16 different sequences |
| Number of true positive hits | 16 in 16 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | AMOP |
| Version [info] | 6 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
16 sequences
ISM1_DANRE (Q5EGE1), ISM1_HUMAN (B1AKI9), ISM1_MOUSE (A2ATD1), ISM2_DANRE (Q58T08), ISM2_HUMAN (Q6H9L7), ISM_XENLA (Q8QFV1), MESH_BOMMO (H9JIQ1), MESH_DROME (Q0KHY3), MLP_ACRMI (B3EWY9), MUC4_HUMAN (Q99102), MUC4_MOUSE (Q8JZM8), SUSD2_HUMAN (Q9UGT4), SUSD2_MOUSE (Q9DBX3), YAO6_CAEEL (Q20762), YF1M_CAEEL (Q21874), YMS5_CAEEL (P34501)» more
|