PROSITE

Home | Contact

	Home ScanProsite ProRule Documents Downloads Links Funding
	Entry: PS50856

General information about the entry

Entry name [info]

AMOP

Accession [info]

PS50856

Entry type [info]

MATRIX

Date [info]

01-MAY-2004 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 28-MAR-2018 INFO UPDATE.

PROSITE Doc. [info]

PDOC50856

Associated ProRule [info]

PRU00347

Name and characterization of the entry

Description [info]

AMOP domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=151;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=146;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.6896198; R2=0.0100652; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=14014.4609375; R2=15.0076513; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=1; SCORE=1124; H_SCORE=30883; N_SCORE=14.0; MODE=1; TEXT='!!';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=578; H_SCORE=22689; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=379; H_SCORE=19702; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='E'; M= -5, -9,-25, -7,  7,-18, -2,-11,-13, -9, -8, -2, -9, -8, -4,-12, -4, -9,-11,-26,-17,  1;
/M: SY='R'; M=-15,-11,-26,-12, -5,-10,-22,  7,-19, 16,-15, -5, -4,-20,  0, 32,-11,-10,-10,-20, -2, -5;
/M: SY='P'; M= -5,  4,-30,  8,  6,-28, -7, -9,-26,  0,-26,-19,  3, 20, -3, -4, -2, -8,-25,-30,-23,  0;
/M: SY='W'; M=-13, -4,-32,-10, -9,-12,-15, -9,-17, -2,-22,-13,  3,-22,  0, -4,-13,-13,-22, 31,  1, -3;
/M: SY='Y'; M= -1,  1,-25,  5, -4,-10,-14, -2,-16, -8,-16,-14, -5, -3, -7,-13, -1, -5,-15,-12, 10, -7;
/M: SY='R'; M=-14,-14,-25,-16, -8,-13,-23, -9,-12, 12, -8, -3, -7,-21, -1, 38, -9, -3, -3,-22, -9, -8;
/M: SY='D'; M=  1,  4,-21,  9,  3,-17,-16,-12,-12,-11,  2, -8, -6,-15, -7,-14, -6, -4, -9,-28,-13, -2;
/M: SY='E'; M= -5, -5,-22, -5, 11,-18,-17, -5,-10, -1, -6,  3, -6,-12, 10, -3,  1, -3,-12,-27,-12, 11;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='E'; M=-13, -4,-26,  1,  9,-14,-24,  2, -6,-12,  8,  0, -9,-17,  0,-11,-14,-11,-11,-26, -6,  4;
/M: SY='Q'; M= -5,  9,-26,  7, 11,-29,-13,  0,-25, 14,-23,-12, 10,-12, 17, 15,  0, -7,-23,-26,-15, 13;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='L'; M=-12,-23,-23,-24,-11, 10,-29,-12, 12,-21, 28, 15,-23,-24,-13,-16,-23,-10,  4,-14,  8,-13;
/M: SY='K'; M= -8, 13,-26, 13, 16,-27,-13, -2,-27, 17,-25,-17, 14,-11,  7, 14,  0, -6,-23,-29,-16, 11;
/M: SY='C'; M=  1,-10, 16,-12, -6,-13,-16,-14,-15,-15,-11,-12, -8,-20,-10,-16,  7,  4, -8,-32,-13, -8;
/M: SY='D'; M=-13, 17,-30, 25, 23,-36,-17,  1,-30, 16,-26,-15,  6, -9, 24,  7, -2,-10,-28,-28,-15, 23;
/M: SY='P'; M= -6, -3,-28,  3, -1,-28,  2,-12,-28, -5,-29,-20, -1, 18, -5, -3,  5, -5,-24,-30,-23, -5;
/M: SY='R'; M= -9,  0,-26,  2,  8,-14,-18, -4,-23,  8,-17,-10, -1,-14, 10, 14, -5, -9,-19,-19, -8,  9;
/M: SY='W'; M=-15,-27,-29,-29,-18, 18,-26,-17, -3,-18, 10,  1,-24,-27,-12,-10,-25,-15, -9, 27, 12,-13;
/M: SY='P'; M=-13,-19,-34,-16, -8,-14,-21,-16,-12, -9, -9, -9,-16, 26,-10, -6,-17,-11,-19, -7,-13,-11;
/M: SY='N'; M= -4, 13,-20,  3, -3,-19, -8, -4,-12,  0,-23,-13, 26,-16, -1, -3, 12,  3,-15,-34,-16, -3;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='W'; M=-19,-31,-30,-35,-28, 43,-27,-15, -4,-22, -1, -5,-27,-30,-27,-18,-25,-15, -8, 53, 38,-25;
/M: SY='M'; M=  1,-18,-23,-22,-17,-11,  5,-16, -1,-19,  6,  9,-14,-21,-11,-18,-11,-12, -4,-20,-12,-14;
/M: SY='W'; M= -7,-12,-30,-15, -9,-10,-16,  0,-17, -8,-18,-12, -7,-19, -5, -4, -7, -8,-18, 23,  3, -7;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='D'; M=-11, 29,-23, 32, 17,-27,-10, -2,-27, -1,-25,-22, 21,-10,  2, -6,  8,  4,-24,-37,-18,  9;
/M: SY='L'; M= -9, -9,-22,-10, -5, -9,-21, -8,  1,-15, 16,  6, -8,-22,  2,-10,-12, -7, -7,-25, -7, -1;
/M: SY='P'; M= -2,-20,-27,-16, -9,-15,-20,-22, -7,-13,-17,-11,-19, 39,-15,-19, -5, -3, -7,-27,-20,-15;
/M: SY='S'; M=  6,  0,-16,  1, -2,-20, -7,-12,-14,-12,-19,-15,  3, -6, -4,-13, 20,  9, -9,-35,-18, -4;
/M: SY='C'; M=-10,-20,105,-28,-27,-21,-29,-29,-29,-28,-21,-20,-20,-28,-28,-29,-10,-10,-12,-48,-30,-28;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='C'; M=-11,-19,100,-28,-27,-18,-29,-25,-29,-24,-19,-18,-18,-38,-25,-20,-10,-10,-11,-44,-23,-27;
/M: SY='T'; M=  8, -7,-14,-12, -8,-13,-13,-17, -6,-10,-10, -8, -3,-13, -7,-12, 15, 17, -1,-30,-13, -8;
/M: SY='W'; M= -9,-23,-29,-23,-13,  9,-24, -9, -2,-16,  9, -1,-24,-25,-12,-15,-22,-13, -9, 28, 25,-13;
/M: SY='P'; M= -6, -4,-30,  0,  9,-30,-18, -7,-21,  0,-23,-13, -6, 25, 14, -3, -1, -3,-24,-27,-19, 10;
/M: SY='Q'; M= -9, -6,-27, -6,  7,-27,-21,  4,-14, -1,-10, -1, -5, -4, 29,  0, -3, -2,-20,-23, -9, 17;
/M: SY='A'; M= 16, -4,-22, -6,  9,-25,  7,-12,-24, -3,-18,-15, -4,-10, -2, -6,  3, -8,-16,-23,-21,  3;
/M: SY='R'; M= -2,-19,-22,-20,-12,-12,-22,-14,  1, -4, -1,  3,-15,-11, -5,  5,-10, -6,  5,-23,-11,-10;
/M: SY='A'; M=  7,-15,-21,-19,-10,-13,-15, -6, -7, -6,  1,  5,-13, -9, -5,  1, -9, -7, -5,-22,-10, -9;
/M: SY='D'; M=-18, 35,-28, 49, 11,-27,-14,  1,-31, -2,-24,-24, 12,-13, -2,-10, -1, -4,-24,-29, -4,  4;
/M: SY='S'; M= -1,-11,-17,-12, -7, -6,-14,-14, -7, -9, -5, -6, -5,-17, -7, -9,  9,  5, -4,-28, -9, -7;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='G'; M= -2, -8,-23, -8,-11,-20, 33,-14,-25, -6,-17,-11, -3,-15,-11, -8, -4,-14,-19,-16,-18,-11; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29, 74,-30,-20,  2,-30, 14,  2,-21,-30,-38,-20,-21,-10,  1,  7, 27,-29;
/M: SY='R'; M=-14,-13,-25,-16, -6, -5,-20, -3,-13,  6, -7,  5, -7,-20,  6, 25, -8, -7,-11,-18, -4, -1;
/M: SY='P'; M=-11,-21,-36,-19,-11,-14,-20,-23,-18,-13,-23,-18,-21, 34,-13,-18,-12, -3,-24, 21, -9,-13;
/M: SY='D'; M= -9,  5,-26,  8,  0,-23,-19,  1,-15,  4,-15, -9,  0,-15, -2,  4, -7, -9, -9,-27, -9, -3;
/M: SY='D'; M=-14,  8,-30, 15,  2,-21,-15, -3,-22, -3,-22,-14,  2, 12, -3, -5, -4, -7,-22,-25, -8, -3;
/M: SY='A'; M= 13, -3,-23, -4, -1,-24, -1,-14,-18, -6,-16,-13, -5, -5, -6, -8,  1, -7,-12,-24,-19, -5;
/M: SY='C'; M=  3,-11, 45,-17,-17,-22, -3,-21,-27,-20,-24,-19, -7,-25,-17,-21,  9, -2,-12,-39,-26,-17;
/M: SY='D'; M=-11,  6,-31, 13, -4,-25, 13,-12,-34, -8,-27,-23,  1,-17, -9, -9, -3,-13,-27,  1,-14, -6;
/M: SY='P'; M= -6,-17,-34,-16, -5,-19,-19,-15,-14,  0,-18, -7,-16, 15,  0, -4,-13,-12,-18,  3,-10, -4;
/M: SY='D'; M=-10, 11,-29, 19, 13,-30, -8, -7,-29,  9,-24,-16,  2,  0,  2,  2, -4,-10,-24,-29,-18,  6;
/M: SY='E'; M= -7, -5,-23, -4, 10,-11,-11,  0,-20, -5,-14,-11, -1,-14,  3, -2,  4, -4,-17,-25, -9,  6;
/M: SY='R'; M=-11,  4,-28,  3,  0,-27,  4, -4,-31, 14,-26,-14, 11,-17,  5, 22, -3,-11,-25,-24,-17,  1;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='P'; M= -1, -8,-15, -8, -6,-11, -2,-11, -5, -9,-10, -6, -4,  7, -7,-11,  3,  1, -6,-17,-11, -8; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='T'; M=  0,-12,-11,-14,-11, -5,-15,-15,  2,-15,  4, -1, -9,-16,-11,-12,  5, 12,  7,-25, -8,-11; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='C'; M= -9, -7, 48, -8, -5,-17,-22,-16,-21,-16,-10,-13,-11,-23,-13,-17, -8, -8,-11,-34,-19, -9; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='I'; M= -4,-14,-17,-18,-13, -5,-21,-18, 10,-16,  5,  2,-10, -7,-11,-16, -1, 10,  6,-22, -7,-14; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='Y'; M=-13,-14,-21,-16,-12, 13,-22,  3, -3, -7,  2,  0,-12,-21, -5, -2,-11, -1, -7,  4, 31,-10; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='H'; M= -9,  1,-20, -1,  1,-18,-15, 25,-18,  4,-17, -5,  6,-13,  7,  3,  0, -2,-15,-24, -1,  2; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='P'; M= -9,-13,-27,-11, -4,-18,-19,-14,-10,  0,-16, -9,-10, 28, -5,  1, -6, -2,-13,-22,-15, -8; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='G'; M=  0, -5,-21, -7,-10,-23, 26,-14,-25,-12,-21,-14,  1,-14, -6,-12,  8,  4,-18,-23,-20, -8; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='A'; M= 31, -7,-11,-13, -6,-18, -2,-15,-13, -6,-14,-11, -4,-10, -5, -9, 14,  4, -4,-23,-18, -6; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='R'; M=-10,-15,-23,-17, -8,-14,-24,-11,  1,  4, -5,  2,-10,-19,  2, 15, -9, -7,  5,-21, -8, -5; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='H'; M=-14, -6,-24, -9, -9,  2,-20, 35,-12,-14, -5, -1,  2,-23, -5, -8, -8, -9,-15,-17, 19, -9;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='I'; M= -6,-25,-22,-27,-23,  2,-26,-20, 17,-20,  5,  4,-21,-24,-18,-20,-10, -4, 17, -3,  6,-22;
/M: SY='R'; M=-15,-18,-25,-21,-12,  1,-25, -8, -5,  3, -4,  5,-10,-22, -3, 24,-13, -9, -3,-16, -1, -9;
/M: SY='S'; M=  8,  0,-10, -2, -2,-18, -4,-12,-18,-10,-26,-18,  8,-10, -2,-10, 36, 26, -8,-38,-18, -2;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='M'; M= -3,-14,-16,-16,-14, -9, -3,-10,  0, -8, -3, 11,-10,-18, -8, -4, -4, -4,  5,-21,-10,-12; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='Q'; M= -6,-11,-19,-12, -1,-12,-19, -6, -2, -9,  9,  5,-10,-15, 12, -5, -7, -1, -7,-19, -5,  5; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='P'; M=  7, -1,-17, -3, -2,-19, -5,-10,-15, -7,-21,-15,  4, 16, -4,-11, 12,  3,-14,-27,-19, -4; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='V'; M= -1,-14,-10,-16,-15, -6,-10,-18,  3,-16,  4,  0,-11,-18,-14,-14, -1,  6,  8,-23, -9,-15; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='E'; M= -3, -9,-20, -8,  7, -4,-17, -8, -6, -6, -3, -2,-11, -3, -4, -9, -7, -6, -6,-15, -4,  2; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='S'; M= -1, -2,-15, -2,  3,-19, -8, -4,-17,  2,-20,-11,  4,-10, 11,  8, 17,  8,-13,-25,-12,  6; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10;
/M: SY='T'; M= -1, -3,-11, -7, -7, -3,-13, -7, -8, -7,-10, -8, -1,-11, -6, -7, 12, 23, -3,-15,  5, -7; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='G'; M= -7,-17,-29,-17,-18,-14, 22, -6,-20,-22, -5, -6,-11,-24,-16,-17,-13,-18,-19, -6,-10,-17;
/M: SY='A'; M= 16, -8,-16,-12, -6,-14, -8, -8,-16, -3,-17,-12, -3,-14, -3,  1, 12,  3, -8,-20, -5, -6;
/M: SY='G'; M= 13, -6,-23, -7, -2,-26, 29,-16,-28,-11,-23,-17, -2,-13, -9,-16,  6,-10,-20,-23,-25, -5;
/M: SY='Q'; M= -9, -2,-30, -2, 12,-37, -3,  4,-24,  5,-22, -4,  0,-12, 43,  7,  0,-12,-30,-20,-14, 27;
/M: SY='H'; M=-10, -9,-24, -9, -1,-22,-23, 23, -7, -5,-11,  3, -7,-19, 18, -2, -6,-10, -5,-26, -2,  7;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-21,-21, 33,-30, 18,  0,-11,  1,  0,-20,-30,-12,-11,-20,-10, -9, 29, 77,-21;
/M: SY='D'; M=-11, 23,-27, 33,  3,-32, 14, -9,-35, -8,-27,-24, 11,-13, -8,-13,  3, -4,-25,-32,-22, -3;
/M: SY='D'; M=  0,  7,-26, 12, 10,-24,-13, -5,-24,  3,-19,-17, -1, -2,  1,  2, -2, -8,-19,-24,-11,  4;
/M: SY='B'; M= -8, 10,-28, 10, -2,-16,-10, -4,-22, -6,-23,-18,  8,-18, -2, -9, -2, -7,-23,  5,  0, -1;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-25,-12,-17,-23, 41,-15,-25,-16,-21, -5, -2,-18,-13,-16,  3,-11,-19,-23,-23,-15;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='Q'; M=-15, -6,-29, -5, 11, -8,-23, 12,-17,  2,-13, -5, -6,-16, 20,  6, -8,-11,-22, -9, 13, 14;
/M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22, 23,-30,-20, 16,-30, 43, 16,-28,-30,-24,-20,-28,-10,  8,-14,  6,-22;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='M'; M= -8,-21,-18,-26,-18,  2,-23,-11, 22,-17, 24, 31,-19,-19, -9,-14,-19, -8, 12,-16,  0,-14; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='T'; M= -5, -8,-13,-13, -8, -2,-19,-12, -3,-11,  3, -1, -7,-13, -3, -8,  2, 18, -2,-18, -3, -5; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='T'; M=  5, -1, -5, -4, -4, -8, -6, -9, -7, -5, -9, -7,  1, -5, -4, -6, 13, 18, -2,-17, -8, -4; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='D'; M= -8,  7,-15, 12,  1, -7, -9,  2,-12, -3,-11,-10,  1, -3, -2, -6, -1, -3,-11, -9,  6, -2; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='D'; M= -6, 10,-13, 15,  2, -9, -6,  1,-13, -3,-12,-11,  4, -8, -1, -5,  4, -1,-10,-12,  2,  0; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='Q'; M= -4, -3,-14, -4,  3,-14, -9, -2,-10,  0,-11, -4, -2, -7, 16,  0,  1,  0,-12,  0, -3, 10; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='P'; M= -3, -6,-14, -6,  0,-10, -3, -5, -6, -4, -7,  3, -5,  6, -1, -7, -1, -4, -7,-14, -9, -1; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='W'; M= -4,-14,-18,-13,-12, -5,  2,-14, -7,-10, -9, -7,-12, -5,-11,-11, -9, -9, -6, 17, -3,-11; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='G'; M= -1, -2,-13, -1, -6,-11,  6, -9, -7, -9,-10, -6,  1, -8, -6,-10,  4, -2, -5,-15,-10, -7; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-11;
/M: SY='S'; M=  0, -1, -9, -2, -2,-11,  0, -8,-12,  2,-13, -8,  2, -6, -2, -1,  9,  8, -7,-16, -9, -2; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
/M: SY='P'; M= -5,-11,-21, -5,  0,-16,-11,-11,-11, -5,-16,-11,-11, 48, -5,-11, -5, -5,-16,-16,-16, -5; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='R'; M= -4,  2,-13,  4,  0,-11, -8, -3,-10,  2, -5, -2, -1, -9,  0,  7, -4, -5, -7,-14, -6, -1; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='G'; M=  8, -4,-23, -6, -3,-24, 24,-15,-24,-11,-20,-15,  0,-15,-10,-15,  2,-11,-16,-24,-23, -6;
/M: SY='H'; M=-13, -4,-30, -4, -3,-18, -5, 37,-28,  5,-22, -7,  2,-18,  2,  3, -9,-16,-25,-18, 10, -3;
/M: SY='G'; M=-11,  5,-32,  6,  0,-22, 10, -9,-31, -6,-26,-21,  6,-18, -6, -5, -6,-15,-29,  4,-13, -3;
/M: SY='W'; M=  1,-21,-25,-25,-17,  6,-19, -6, -6,-14, -2, -3,-17,-22,-13,-10,-14,-11, -7, 13, 10,-16;
/M: SY='G'; M= -1,-13,-27,-14,-21,-24, 52,-19,-28,-19,-22,-10, -5,-21,-19,-19, -3,-17,-19,-21,-25,-20;
/M: SY='T'; M=  6, -4,-18,-11, -3,-19,-15, -1,-13, -1,-12, -1, -3,-12,  7, -4,  5, 10, -9,-24, -9,  1;
/M: SY='P'; M=  3,-16,-27,-15, -6,-21,-16,-16,-10, -8,-16, -6,-13, 31, -7,-11, -3, -5,-13,-26,-20,-10;
/M: SY='P'; M=-10, -3,-34, -2,  0,-27,-14,-12,-20, -7,-30,-20,  3, 59, -7,-14, -4, -7,-30,-33,-27, -7;
/M: SY='W'; M=-17,-31,-34,-31,-24, 21,-26,-12, -2,-21,  8, -2,-30,-30,-19,-17,-30,-17,-11, 57, 36,-21;
/M: SY='Q'; M=-12, -6,-27,-14, -7,-16,-22, -5,  2, -1, -5,  7,  2,-18,  8,  8, -9, -8, -6,-23, -8, -2;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='E'; M= -3, -2,-12, -2,  5,-10,  0, -7,-10, -5, -5, -6, -2, -6, -2, -6,  1,  3, -8,-14, -9,  1; D=-8;
/I:         I=-8; MI=-17; MD=-17; IM=-17; DM=-17;
/M: SY='P'; M=  8, -6,-18, -6,  1,-21, -7,-10,-15, -6,-20,-12, -4, 15,  4,-10, 11,  2,-14,-24,-17,  1; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='P'; M= -5, -7,-18, -9, -7, -6,-15,-11, -8, -9,-13,-10, -4, 11, -9,-11,  4,  9, -8,-20, -6,-10; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='E'; M=-11,  4,-24,  8, 20,-15,-16, -3,-23, 14,-17,-12,  0, -8,  7, 14, -5, -8,-19,-19, -9, 13; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='V'; M= -6,-24,-13,-28,-24, 23,-25,-22, 18,-20,  9,  6,-21,-24,-26,-17,-12, -4, 25,-12,  4,-24; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='P'; M= -2,-10,-23, -5,  0,-21,-11,-13,-16, -8,-24,-16, -7, 43, -5,-13,  7,  2,-18,-27,-21, -5; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='S'; M= 10, -6,-15, -8, -8,-18, 10,-15,-17,-10,-18,-13, -2, -1, -9,-13, 11,  6,-11,-22,-18, -9; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='M'; M= -8,-13,-19,-14, -1, -4,-20, -8,  4, -7, 16, 18,-15,-16, -3, -7,-16, -8, -1,-18, -4, -2; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='S'; M=  3, -7,-11, -7, -5, -9, -7,-11, -7,-13, -5, -7, -2,-13, -5,-11, 16,  9, -3,-28,-12, -5; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='H'; M= -8, -1,-20, -4, -4,-14,-13, 47,-15, -8,-12,  2,  6,-16,  3, -4, -3,-10,-14,-25,  6, -3; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='W'; M=-19,-32,-34,-34,-27, 34,-26,-15, -6,-21, -1, -6,-29,-30,-23,-18,-29,-18,-14, 69, 39,-23;
/M:         M= -9, -9,-24,-10, -5, -3,-22,  0,-11, -1,  0, -1, -9,-19, -4, -2,-13,-10,-10,-18,  0, -4;
/M: SY='Y'; M=-13, -9,-24,-12, -7,  4,-23, 14, -5,-10, -4, -1, -5,-23, -4, -8,-11, -9, -6,-11, 19, -7;
/M: SY='D'; M=-18, 43,-30, 62, 27,-38,-12,  0,-38,  2,-28,-28, 17, -8,  3, -8,  0,-10,-30,-38,-20, 15;
/M: SY='V'; M= -6,-23,-17,-25,-21,  1,-28,-16, 18,-17, 12, 13,-23,-25,-14,-15,-12, -1, 22,-19,  3,-18;
/M: SY='L'; M=-11,-12,-24,-16, -3, -8,-25,-11,  5, -8,  8,  8, -9,-18, -4, -1,-12, -4, -1,-24, -7, -6;
/M: SY='P'; M=  0,-14,-30, -8, -1,-27,-13,-17,-19,-10,-28,-19,-12, 57, -7,-17,  4, -2,-23,-32,-27, -7;
/M: SY='W'; M=-18,-25,-32,-28,-19, 30,-26, -8, -8,-16, -5, -5,-22,-27,-11,-13,-22,-15,-15, 45, 36,-14;
/M: SY='Y'; M=-14,-16,-26,-22,-19, 17,-27, -2,  7,-14,  0,  1,-10,-24,-13,-10,-12, -7, -1,  0, 32,-19;
/M: SY='Y'; M=-10,-22,-26,-24,-19,  7,-24,-10,  4,-18,  5,  2,-19,-24,-13,-16,-13, -5, -3, 17, 21,-17;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='C'; M=-10,-15, 83,-23,-20,-22,-28,-25,-30,-10,-22,-18,-15,-33,-20,-15,-10,-10,-12,-43,-25,-20;
/M: SY='M'; M= -9,-14,-27,-15,-10,-13, -1, -9,-13, -2, -2,  1,-11,-21, -3,  0,-13,-12,-13,-16, -4, -7;
/M: SY='W'; M=-20,-15,-40,-11,-17,  7,-19,-18,-21,-15,-18,-19,-21,-25,-17,-17,-26,-21,-25, 78, 21,-14;
/M: SY='W'; M= 13, -8,-25,-15, -9,-16, -8,-13,-16, -8,-17,-13, -4,-17,  0,-12, -4, -9,-17, 19, -6, -3;
/M: SY='D'; M= -9, 16,-28, 28, 13,-32,-11, -8,-29, -4,-29,-24,  6, 16, -1,-12,  7, -3,-25,-37,-23,  5;
/M: SY='E'; M=-15,  1,-29,  4, 20,-15,-20,  3,-27, 15,-19,-13,  0,-12,  7, 20, -7,-11,-22,-22, -7, 13;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='G'; M=  6, -7,-16, -7, -7,-15, 14,-11,-15, -8,-14,-10, -5,  8, -8,-11,  0, -7,-12,-13,-15, -8; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='Q'; M= -4, -7,-12, -7, -3, -8,-12, -2, -3, -1, -6, -1, -5,-11,  5,  3, -1, -2, -1,-10,  1,  0; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='R'; M= -2, -8,-17,-10, -6, -6,  0,-10,-14,  3, -8, -5, -5,-13, -6,  5, -6, -8, -9,-11, -7, -6; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='P'; M= -2, -6,-24, -5, 10,-23,-19,-13,-15, -4,-17,-12, -8, 16,  3,-10,  2,  7,-13,-28,-18,  5;
/M: SY='R'; M=-13, -7,-26, -7,  2, -8,-21, -9,-15,  0, -7, -3, -8,-17, -2,  9, -9, -2,-13, -9, -5,  0;
/M: SY='Y'; M=-15,-11,-25,-16,-17, 27,-23,  8, -5,-12, -6, -5, -6,-26,-13,-10, -9, -5,-11,  9, 46,-17;
/M: SY='M'; M=-13,-15,-30,-15, -5,-12,-22,  0, -8, -1, -9,  9,-14,  7,  7,  3,-13,-10,-15,-13,  4, -2;
/M: SY='W'; M=-10,-17,-27,-18, -9,  1,-20,-14,-12, -4, -7, -6,-14,-20, -2, -5,-10, -9,-14, 12,  3, -4;
/M: SY='R'; M=-17,  3,-30,  8, 20,-25,-19,  0,-31, 21,-21,-15,  2,-13, 12, 41, -6,-10,-24,-25,-14, 13;
/M: SY='R'; M=-18, -3,-30,  0, 13,-23,-19,  0,-31, 24,-21,-13,  1,-16, 11, 52, -8,-10,-22,-23,-12,  8;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2018_03 which contains 557'012 sequence entries.

Total number of hits

16 in 16 different sequences

Number of true positive hits

16 in 16 different sequences

Number of 'unknown' hits

Number of false positive hits

Number of false negative sequences

Number of 'partial' sequences

Precision (true positives / (true positives + false positives))

100.00 %

Recall (true positives / (true positives + false negatives))

100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info]

protein_domain

Scaling database [info]

reversed

Author [info]

CJA_Sigrist

Taxonomic range [info]

Eukaryotes

Maximum number of repetitions [info]

Feature key [info]

DOMAIN

Feature description [info]

AMOP

Version [info]

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

16 sequences

ISM1_DANRE  (Q5EGE1    ), ISM1_HUMAN  (B1AKI9    ), ISM1_MOUSE  (A2ATD1    ),

ISM2_DANRE  (Q58T08    ), ISM2_HUMAN  (Q6H9L7    ), ISM_XENLA   (Q8QFV1    ), 
MESH_BOMMO  (H9JIQ1    ), MESH_DROME  (Q0KHY3    ), MLP_ACRMI   (B3EWY9    ), 
MUC4_HUMAN  (Q99102    ), MUC4_MOUSE  (Q8JZM8    ), SUSD2_HUMAN (Q9UGT4    ), 
SUSD2_MOUSE (Q9DBX3    ), YAO6_CAEEL  (Q20762    ), YF1M_CAEEL  (Q21874    ), 
YMS5_CAEEL  (P34501    )

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

SIB Swiss Institute of Bioinformatics | Disclaimer

Back to the Top