PROSITE entry PS50866

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	GOLD
Accession [info]	PS50866
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-MAR-2003 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC50866
Associated ProRule [info]	PRU00096

Name and characterization of the entry

Description [info]

GOLD domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=95;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=90;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.4080000; R2=0.0230729; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4182.1708984; R2=2.9635534; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=308; H_SCORE=5095; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=221; H_SCORE=4837; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='R';  M= -9, -2,-27, -2, 12,-22,-19, -2,-23, 15,-19,-11, -1, -6,  8, 17, -3, -3,-19,-25,-12,  9;
/M: SY='E';  M=-10,  1,-29,  5, 24,-27,-20, -5,-24, 19,-20,-11, -2, -6, 13, 13, -5, -9,-20,-25,-14, 17;
/M: SY='C';  M= -6,-13, 71,-21,-21,-15,-25,-24,-24,-21,-17,-16,-13,-31,-21,-22, -4, -2, -9,-41,-22,-21;
/M: SY='F';  M=-11,-25,-20,-30,-24, 26,-29,-17, 14,-23, 13,  7,-20,-26,-23,-19,-14, -4, 11, -9, 15,-24;
/M: SY='Y';  M=-10,-14,-24,-16, -8,  4,-23,  4, -7, -7, -3, -1,-11,-20, -5, -4, -9, -5, -8, -7, 16, -8;
/M: SY='E';  M= -5,  4,-26,  7, 23,-24,-17,  1,-23,  8,-18,-12,  1, -9, 13,  1,  0, -6,-21,-26,-11, 18;
/M: SY='D';  M= -6,  9,-23, 11,  9,-15,-15, -2,-19, -4,-17,-15,  4,-10, -1, -8,  3, -2,-17,-26, -8,  4;
/M: SY='V';  M=  1,-22,-17,-26,-22, -4,-24,-24, 21,-21, 12, 10,-20,-22,-20,-21,-10, -2, 24,-25, -8,-22;
/M: SY='S';  M= -6,  0,-23,  2,  4,-22,-14, -6,-18, -2,-19,-12,  0,  0,  3, -4,  5,  1,-15,-30,-15,  3;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10;
/M: SY='K';  M= -1, -3,-25, -3,  5,-25,-12,-10,-21, 11,-21,-12, -2, -2,  3,  8,  0, -5,-16,-25,-16,  3;
/M: SY='G';  M= -2,  4,-26,  3, -7,-28, 32,-10,-32, -9,-27,-18, 10,-14,-10,-11,  3,-12,-26,-27,-24, -9;
/M: SY='D';  M= -2,  6,-17,  7,  4,-19,-14,-10,-16, -5,-15,-12,  0,-13, -3, -9,  6,  7, -9,-29,-13,  0;
/M: SY='T';  M= -5,-11,-21,-13, -7,-11,-21,-13, -4, -1, -3,  0, -9,-11, -6, -3, -4,  3, -2,-23, -7, -7;
/M: SY='V';  M= -8,-21,-18,-24,-18,  5,-27, -8, 11,-20, 11,  7,-18,-24,-17,-16,-11, -1, 14,-22,  2,-18;
/M: SY='T';  M= -4, -8,-19,-10, -3,-10,-20, -9, -5, -7, -6, -3, -7,-16, -5, -8,  1,  7, -1,-24, -5, -4;
/M: SY='V';  M= -2,-25,-20,-28,-26,  2,-11,-24, 14,-23,  7,  5,-20,-25,-24,-22,-12, -8, 17,-19, -6,-26;
/M: SY='E';  M= -5,  3,-23,  4, 11,-20,-16, -5,-17, -1,-16,-11,  1, -7,  4, -5,  5,  3,-14,-28,-11,  7;
/M: SY='Y';  M=-14,-27,-25,-32,-26, 30,-32,-11, 15,-22, 10,  6,-22,-27,-23,-19,-19, -9,  9,  6, 32,-26;
/M: SY='E';  M= -6, -1,-27,  0, 12,-25,-19, -5,-17,  5,-16, -9, -3,  0, 11,  0, -2, -4,-17,-26,-14, 11;
/M: SY='V';  M=  3,-23,-12,-27,-24, -1,-23,-25, 18,-20,  8,  5,-20,-24,-23,-20, -8,  0, 26,-26, -9,-24;
/M: SY='E';  M= -8, -7,-26, -6,  2,-17,-17, -8, -5, -7, -8, -4, -6, -9,  2, -8, -4, -6, -7,-25, -9,  0;
/M: SY='E';  M= -9,  8,-25, 11, 12,-24,-11, -6,-20,  1,-18,-13,  4,-13,  6, -1,  1, -4,-16,-29,-15,  9;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
/M: SY='G';  M= -2,  1,-15,  1, -1,-12,  6, -4,-15, -2,-14, -9,  3, -7, -2, -5,  0, -5,-13, -9, -6, -2; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='S';  M= -2,  2,  1,  3,  2,-14, -6, -7,-15, -1,-13,-10,  1, -9, -2, -3,  5,  0, -9,-20,-11,  0; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='T';  M= -3, -6,-13, -7, -4, -7,-11, -7, -2, -2, -4, -2, -6, -8, -3, -3, -3,  1,  0,-12, -2, -4; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='L';  M= -6,-14,-13,-16,-11,  3,-17,-12, 12,-14, 17,  8,-12,-15,-10,-10,-12, -5,  7,-13, -1,-11; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='T';  M= -1, -4,-11, -6, -3, -8,-10, -5, -8, -1, -9, -5, -2, -7, -1,  0,  5,  8, -4,-16, -5, -2; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='W';  M=-12,-13,-28,-13,-13, -1, -9, -9,-14,-10,-14,-11,-13,-17, -9,-10,-18,-15,-19, 59, 11, -9; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='D';  M= -8,  9,-18, 14,  9,-15, -7,  3,-16, -2,-12,-10,  2, -8,  2, -5, -2, -6,-14,-13, -4,  5; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='F';  M= -8,-17,-15,-22,-16, 26,-18,-11,  4,-15,  6,  2,-13,-17,-17,-11,-13, -7,  1,  7, 14,-16; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='R';  M= -6,  0,-15,  0, -2, -7,-11,  2, -8, -1, -5, -1, -1,-11, -2,  3, -4, -4, -6,-16, -3, -3; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='V';  M= -1,-13,-15,-14, -8, -8,-16,-16,  4,-11, -3, -2,-12, -9,-10,-12, -2,  3,  9,-18, -8,-10; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M:         M= -3, -4,-15, -3, -1,-11, -7, -8,-11, -7, -6, -4, -5,-11, -5, -9, -1, -2, -8,-21, -9, -3; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='G';  M= -1, -2,-26, -2, -5,-26, 25, -9,-31, -7,-27,-18,  3,-12, -7, -7,  5, -9,-24,-25,-20, -7;
/M: SY='G';  M= -7,  0,-29, -2, -8,-22, 10, -8,-23, -8,-23,-14,  4, -7, -6,-11, -4,-12,-23,-13,-13, -7;
/M: SY='D';  M=-12, 21,-26, 30, 14,-25, -5, -1,-29, -4,-24,-21, 11,-12,  1, -9,  3, -6,-24,-32,-16,  7;
/M: SY='I';  M=-10,-21,-21,-26,-19,  4,-26,-13, 13,-20, 10,  8,-16,-20,-15,-16,-15, -9,  8,-18,  2,-19;
/M: SY='D';  M= -8, 11,-25, 15,  4,-27,  2, -3,-26,  0,-23,-15,  8,-14, -1, -5,  2, -6,-20,-30,-17,  2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='F';  M=-11,-26,-20,-32,-26, 29,-28,-17, 16,-23, 12,  9,-21,-26,-25,-19,-17, -8, 15, -6, 16,-26; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='N';  M= -5,  8,-21,  8, -1,-20,  1, -4,-22, -4,-21,-15, 10,-14, -4, -4,  7, -1,-17,-30,-15, -3; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='I';  M= -3,-25,-18,-30,-23,  8,-26,-21, 21,-22, 14, 11,-21,-23,-20,-21,-15, -7, 18,-16,  2,-23; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='Y';  M=-12, -5,-24, -4,  3, -2,-21,  5,-14, -3, -9, -5, -6,-14,  0, -2, -6, -4,-13,-14,  9,  1; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='V';  M=-10,-21,-20,-24,-20,  8,-27,-12, 13,-16,  6,  5,-16,-23,-18,-10,-12, -6, 14,-17,  3,-20; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='T';  M= -4, -3,-19, -3,  0,-14,-15,-12,-12,  0,-12, -9, -4,-11, -3,  0,  2,  6, -5,-24,-10, -2; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='D';  M= -2,  9,-21, 12,  8,-23, -7, -8,-22,  1,-21,-16,  5,  0, -1, -6,  4,  0,-18,-24,-16,  3; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='P';  M= -4, -2,-20, -2,  1,-18,-12,-10,-14, -4,-18,-12, -1, 12, -2, -7,  5,  7,-13,-25,-14, -2; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
/M: SY='D';  M= -4, 12,-22, 14,  7,-22,-11, -1,-22,  1,-20,-15,  8,-12,  1, -2,  3, -2,-17,-27,-10,  4; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='G';  M= -4,  5,-23,  4, -8,-25, 27,-10,-29,-11,-26,-17,  9,-13,-10,-13,  1,-12,-25,-22,-21, -9; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='H';  M=-12,  8,-26,  8, 11,-22,-16, 20,-25,  6,-21,-12, 10,-14,  8,  7, -1, -6,-23,-27, -3,  8;
/M: SY='V';  M= -4,-15,-19,-17,-10, -7,-24,-14,  5,-10,  1,  1,-13,-17,-10, -9, -4,  4,  9,-25, -6,-11;
/M: SY='I';  M= -4,-26,-21,-31,-24,  2,-30,-21, 27,-22, 19, 15,-23,-24,-19,-20,-17, -6, 23,-19,  1,-24;
/M: SY='Y';  M= -8,-18,-21,-19,-16,  0,-23, -2,  4,-13,  2,  3,-16,-24,-13,-11,-12, -6,  8,-13, 10,-16;
/M: SY='H';  M= -6, -3,-25, -3,  2,-21,-17,  4,-17,  1,-19, -9,  0, -1,  2, -2,  1, -2,-15,-28,-10,  1;
/I:         I=-1; MD=-7;
/M: SY='T';  M= -2, -6,-11, -6, -3, -7, -9, -7, -3, -2, -6, -3, -5, -3, -2, -3,  0,  1, -1,-11, -3, -3; D=-1;
/I:         I=-1; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7;
/M: SY='E';  M= -8,  2,-25,  2,  7,-21, -8,  3,-22,  3,-20,-12,  5,-11,  5,  3,  1, -5,-20,-26,-11,  5;
/M: SY='E';  M= -6, -1,-25,  0,  9,-18,-12, -8,-19,  6,-16, -9, -1,-13,  5,  2, -2, -6,-15,-23,-12,  7;
/M: SY='D';  M=-10,  1,-26,  3,  3,-17,-11,  0,-17, -2,-13, -7,  0,-15,  0, -4, -7, -9,-15,-21, -7,  1;
/M: SY='E';  M= -2,  3,-23,  4,  7,-24, -9,-10,-20,  0,-22,-15,  3, -1,  0, -4,  7,  1,-15,-31,-18,  3;
/M: SY='S';  M=  0, -9,-22, -9,  0,-17,-12,-11,-10, -7,-12, -8, -6, -5, -4, -8,  4,  1, -7,-27,-13, -3;
/M: SY='Q';  M= -6,  4,-24,  5,  9,-25,-15,  2,-17,  1,-18, -8,  2,-10, 12, -2,  2, -3,-16,-28,-11, 10;
/M: SY='G';  M=  1, -7,-27, -7,-14,-26, 41,-18,-27,-17,-22,-15, -2,-18,-15,-18, -1,-15,-20,-23,-25,-15;
/M: SY='S';  M= -5,  4,-18,  6,  6,-24,-14, -4,-23,  5,-22,-14,  3,-13,  7,  6,  8,  4,-16,-29,-12,  6;
/M: SY='F';  M=-13,-17,-23,-22,-19, 15,-26,  6,  3,-19,  4,  4,-12,-25,-18,-15,-15,-10,  3,-12, 12,-19;
/M: SY='T';  M=  2, -4,-14, -6, -6,-12,-15,-11,-11, -5,-14,-10, -3,-16, -6, -6,  8,  9, -3,-25, -6, -7;
/M: SY='F';  M=-14,-23,-12,-32,-25, 44,-28,-17,  2,-25,  7,  2,-16,-27,-30,-19,-15, -5,  3, -5, 15,-25;
/M: SY='T';  M= -3, -5,-19, -9, -1,-16,-19,-12,-12,  2,-11, -7, -4,-11, -2,  2,  5, 16, -5,-27,-11, -3;
/M: SY='A';  M=  8, -5,-17, -8, -6,-16, -8,-13,-12,-10,-13,-11, -4,-12, -9,-12,  8,  8, -4,-22,-14, -7;
/I:         I=-6; MD=-29;
/M: SY='H';  M= -5, -2,-17, -2,  2,-13, -9,  4,-11, -4,-11, -5,  0, -2,  3, -4,  1, -3,-11,-20, -7,  2; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-29;
/M: SY='E';  M= -4,  4,-18,  6, 14,-16,-10,  2,-16,  3,-14,-10,  2, -5,  6, -1,  1, -4,-15,-18, -8,  9; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='P';  M= -2, -1,-24, -1,  0,-20,-11,-10,-17, -3,-20,-14,  0,  6, -4, -8,  4,  0,-15,-27,-14, -3;
/M: SY='G';  M=  0, -4,-28, -3,-15,-29, 54,-18,-37,-16,-29,-20,  2,-18,-16,-17,  2,-14,-27,-23,-27,-16;
/M: SY='E';  M= -6, -1,-22, -2,  7,-14,-20, -9,-11,  1,-11, -7, -4,-13, -2, -4, -1,  3, -7,-26, -9,  2;
/M: SY='Y';  M=-19,-20,-28,-21,-19, 26,-29, 21,  0,-15,  1,  2,-16,-28,-12,-12,-19,-11, -7, 12, 55,-19;
/M: SY='M';  M= -3,-10,-21,-12, -4,-14,-21,-13, -2, -2, -2,  2,-10,-17, -2, -2, -6, -3,  1,-25,-10, -4;
/M: SY='F';  M= -9,-28,-21,-33,-25, 24,-30,-20, 19,-25, 20, 12,-23,-26,-24,-21,-19, -8, 15,-10, 11,-25;
/M: SY='C';  M= -9,-15, 67,-22,-18,-19,-27,-21,-20,-20,-16,-14,-15,-30,-17,-20, -6, -5, -7,-41,-22,-18;
/M: SY='F';  M=-16,-30,-24,-37,-28, 48,-30,-20,  8,-27, 12,  5,-23,-29,-31,-20,-22,-11,  5, 13, 23,-27;
/I:         I=-1; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5;
/M: SY='D';  M= -8, 24,-23, 31, 13,-28,-11, -2,-27, -3,-23,-20, 13,-11,  2, -8,  8,  1,-21,-35,-16,  7;
/M: SY='N';  M= -8, 31,-22, 17,  2,-22, -3,  5,-21,  3,-29,-19, 45,-13,  1,  0,  9, -1,-27,-37,-20,  1;
/M: SY='S';  M= -5, -1,-21,  0,  1,-16,-13, -7,-17, -4,-18,-12,  1,-10,  1, -4,  8,  6,-12,-24, -9,  0;
/M: SY='Y';  M= -8,-15,-22,-19,-17, 12,-15, -4, -6,-16, -1,  0,-11,-22,-15,-13, -8, -3, -6, -4, 13,-16;
/M: SY='S';  M=  6,  0,-18,  0, -2,-21,  2, -9,-21,-10,-23,-16,  3,-11, -2,-11, 18,  7,-14,-27,-15, -2;
/M: SY='Y';  M= -6, -9,-23,-11, -8, -5,-14,-10,-15, -1,-13, -8, -7,-17, -5, -1, -1,  2,-12, -5,  4, -7;
/M: SY='F';  M=-11,-21,-24,-25,-18, 10,-21,-17,  5,-12,  5,  6,-15,-20,-16,-11,-15, -7,  3,-12,  2,-17;
/M: SY='K';  M= -1,  0,-22, -2,  5,-20,-10, -4,-21,  6,-21,-12,  3,-10,  3,  3,  6,  3,-15,-26,-11,  4;
/I:         I=-2; MD=-13;
/M: SY='S';  M=  0, -5,-20, -6,  0,-17, -9, -8,-18,  3,-17,-11, -3, -8, -2,  2,  4,  1,-11,-25,-13, -2; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-13;
/M: SY='K';  M= -3, -2,-22, -3,  5,-23,-13,-10,-21, 25,-22, -9, -1, -7,  5, 14, -2, -3,-13,-19,-11,  5; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-13;
/M: SY='T';  M= -3, -4,-14, -6, -3,-12,-12,-11, -7, -5, -5, -5, -4,-14, -4, -7, -1,  2, -3,-23,-10, -4; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='V';  M= -5,-29,-16,-31,-27,  3,-31,-26, 29,-23, 20, 14,-27,-27,-24,-21,-16, -3, 34,-24, -4,-26;
/M: SY='E';  M=-11, -5,-24, -5,  4, -5,-21, -2,-13, -1, -8, -5, -5,-16, -2,  2, -5, -3,-11,-20,  0,  0;
/M: SY='Y';  M=-16,-26,-23,-29,-23, 35,-30, -6,  8,-20, 15,  8,-22,-29,-21,-14,-21, -9,  3,  5, 36,-23;
/M: SY='E';  M=-13, 10,-27, 13, 14,-17,-17,  4,-23,  2,-18,-14,  6,-13,  4,  2, -2, -4,-22,-21, -3,  8;
/M: SY='I';  M= -8,-28,-18,-33,-27, 12,-32,-24, 25,-24, 16, 10,-24,-26,-24,-22,-17, -6, 23,-14,  4,-26;
/M: SY='E';  M= -9,  2,-26,  3, 11,-21,-13,  1,-21,  4,-16,-10,  0,-13,  7,  3, -3, -6,-18,-24, -9,  8;
/M: SY='V';  M= -4,-22,-18,-24,-20, -2,-23,-20, 13,-14,  7,  7,-19,-24,-17,-11,-10, -2, 18,-23, -4,-19;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_05 which contains 572'214 sequence entries.

Total number of hits	128 in 128 different sequences
Number of true positive hits	128 in 128 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	9
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	93.43 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	GOLD
Version [info]	5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

128 sequences

CTG1_CAEEL  (O17907), EMP24_SCHPO (Q9P7I9), EMP24_YEAST (P32803),

ERP1_YEAST  (Q05359), ERP2_YEAST  (P39704), ERP3_YEAST  (Q12403), 
ERP4_YEAST  (Q12450), ERP5_YEAST  (P38819), ERP6_YEAST  (P53198), 
FYCO1_HUMAN (Q9BQS8), FYCO1_MOUSE (Q8VDC1), GCP60_HUMAN (Q9H3P7), 
GCP60_MOUSE (Q8BMP6), GCP60_RAT   (Q7TNY6), OSH3_SCHPO  (O13944), 
P24B2_ARATH (Q9S7M9), P24B3_ARATH (Q9LIL4), P24D3_ARATH (Q6IDL4), 
P24D4_ARATH (Q9FVU0), P24D5_ARATH (Q8RWM6), P24D6_ARATH (F4J4Y0), 
P24D7_ARATH (Q8GYG1), P24D8_ARATH (O81045), P24D9_ARATH (Q9LQY3), 
P24DA_ARATH (Q8VY92), P24DB_ARATH (Q9LJV9), PATL1_ARATH (Q56WK6), 
PATL2_ARATH (Q56ZI2), PATL3_ARATH (Q56Z59), PATL4_ARATH (Q94C59), 
PATL5_ARATH (Q9M0R2), PATL6_ARATH (Q9SCU1), RALB_TODPA  (P49193), 
RETM_DROME  (Q9VMD6), S14L1_HUMAN (Q92503), S14L1_MOUSE (A8Y5H7), 
S14L2_BOVIN (P58875), S14L2_HUMAN (O76054), S14L2_MOUSE (Q99J08), 
S14L2_RAT   (Q99MS0), S14L3_HUMAN (Q9UDX4), S14L3_RAT   (Q9Z1J8), 
S14L4_HUMAN (Q9UDX3), S14L4_MOUSE (Q8R0F9), S14L5_HUMAN (O43304), 
S14L5_XENTR (Q0V9N0), S14L6_HUMAN (B5MCN3), TMD11_CANLF (P27869), 
TMD11_MOUSE (Q9D2R4), TMED1_BOVIN (Q2TBK5), TMED1_HUMAN (Q13445), 
TMED1_MOUSE (Q3V009), TMED1_PONAB (Q5R7E6), TMED1_RAT   (Q5BK85), 
TMED1_XENTR (Q28BQ6), TMED2_CAEEL (O17528), TMED2_CRIGR (P49020), 
TMED2_HUMAN (Q15363), TMED2_MOUSE (Q9R0Q3), TMED2_RAT   (Q63524), 
TMED3_HUMAN (Q9Y3Q3), TMED3_MOUSE (Q78IS1), TMED3_RAT   (Q6AY25), 
TMED4_HUMAN (Q7Z7H5), TMED4_MOUSE (Q8R1V4), TMED5_BOVIN (Q2KJ84), 
TMED5_HUMAN (Q9Y3A6), TMED5_MOUSE (Q9CXE7), TMED5_PONAB (Q5R809), 
TMED5_RAT   (Q6AXN3), TMED6_BOVIN (Q0VCA9), TMED6_HUMAN (Q8WW62), 
TMED6_MOUSE (Q9CQG0), TMED7_HUMAN (Q9Y3B3), TMED7_RAT   (D3ZTX0), 
TMED8_HUMAN (Q6PL24), TMED8_MOUSE (Q3UHI4), TMED8_PONAB (Q5R9S0), 
TMED9_BOVIN (Q3T133), TMED9_HUMAN (Q9BVK6), TMED9_MOUSE (Q99KF1), 
TMED9_RAT   (Q5I0E7), TMEDA_BOVIN (Q5E971), TMEDA_CANAL (Q5A302), 
TMEDA_CANGA (Q6FRZ3), TMEDA_CRYNJ (P0CN72), TMEDA_DEBHA (Q6BTC2), 
TMEDA_DICDI (Q769F9), TMEDA_DROAN (B3LVB0), TMEDA_DROER (B3P6T8), 
TMEDA_DROGR (B4JYU5), TMEDA_DROME (Q8SXY6), TMEDA_DROMO (B4K4G5), 
TMEDA_DROPE (B4GE47), TMEDA_DROSI (A0AQ71), TMEDA_DROVI (B4MGF8), 
TMEDA_DROWI (B4NIY1), TMEDA_DROYA (B4PUZ3), TMEDA_EREGS (Q759T8), 
TMEDA_GIBZE (Q4HY20), TMEDA_HUMAN (P49755), TMEDA_KLULA (Q6CWW7), 
TMEDA_MESAU (O35587), TMEDA_MOUSE (Q9D1D4), TMEDA_NEUCR (Q9HEK4), 
TMEDA_PONAB (Q5RE32), TMEDA_RABIT (Q28735), TMEDA_RAT   (Q63584), 
TMEDA_TAKRU (Q90515), TMEDA_YEAST (P54837), TMEDB_DICDI (Q54BN0), 
TMEDE_DROAN (B3MTS8), TMEDE_DROER (B3NZM5), TMEDE_DROGR (B4JG34), 
TMEDE_DROME (Q9I7K5), TMEDE_DROMO (B4KB41), TMEDE_DROPE (B4GMC3), 
TMEDE_DROPS (Q295B2), TMEDE_DROSE (B4HJV5), TMEDE_DROSI (B4QWH9), 
TMEDE_DROVI (B4LYB8), TMEDE_DROWI (B4NKL0), TMEDE_DROYA (B4PVC6), 
TMED_NEMVE  (A7SXK3), YB79_SCHPO  (O14324), YE98_SCHPO  (O13770), 
YN02_CAEEL  (Q03606), YQF6_CAEEL  (Q09270)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences

9 sequences

RETM_AEDAE  (Q16KN5), RETM_ANOGA  (Q7PWB1), RETM_DROPS  (Q29JQ0),

TMEDA_ASPFU (Q4WQL0), TMEDA_CRYNB (P0CN73), TMEDA_EMENI (Q5B5L5), 
TMEDA_SCHPO (O13946), TMEDA_USTMA (Q4P958), TMEDA_YARLI (Q6C503)

» more

PDB
[Detailed view]

19 PDB

1O6U; 1OLM; 4TLG; 4UYB; 5AZW; 5AZX; 5AZY; 5GU5; 5LZ1; 5LZ3; 5LZ6; 5TDQ; 6HLN; 6HLT; 6HLV; 6HLW; 6HM8; 6HMV; 7RRM
» more