PROSITE entry PS50869
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | BRICHOS |
Accession [info] | PS50869 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-NOV-2003 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC50869 |
Associated ProRule [info] | PRU00255 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | BRICHOS domain profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=97; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=92; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.5309291; R2=0.0163571; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=5794.4599609; R2=3.3899803; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=365; H_SCORE=7032; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=243; H_SCORE=6618; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='F'; M=-15, -8,-24,-14,-17, 27, -7, -6,-16,-20, -9, -9, -1,-20,-23,-15,-10,-11,-15,-10, 6,-18; /M: SY='S'; M= 7, 3,-17, -1, -1,-23, 3, -8,-21, -4,-27,-17, 12,-10, 2, -7, 22, 7,-16,-33,-20, 0; /M: SY='G'; M= -3, -3,-25, -1,-11,-20, 12,-17,-14,-17,-14,-11, -2,-17,-14,-18, 0, -9,-10,-27,-18,-13; /M: SY='G'; M= 3, -1,-22, -5, -6,-21, 15,-12,-25,-11,-26,-18, 7,-16, -5,-12, 11, -1,-20,-14,-17, -5; /M: SY='D'; M= -9, 16,-14, 21, 9,-28, -8, 2,-30, -2,-27,-21, 11,-13, 1, -2, 9, -2,-22,-36,-17, 4; /M: SY='P'; M= -4, -3,-23, -1, 11,-23,-15,-11,-20, -3,-22,-16, -3, 16, 3, -6, 11, 10,-18,-31,-19, 5; /M: SY='A'; M= 13,-17,-24,-21,-18,-14, 8,-22,-15,-16,-16,-13,-14,-17,-15,-19, -2, -8,-10, 12,-10,-16; /M: SY='I'; M= -3, -3,-22, -8,-12,-13,-18,-15, 3,-11, -3, -2, -1,-18,-11, -9, -5, -1, 3,-27,-11,-13; /M: SY='V'; M= -3,-15,-19,-18, -7, -3,-22,-20, 7,-15, -1, -1,-13,-17,-14,-16, -3, 1, 11,-24, -8,-11; /M: SY='V'; M= -5,-27,-17,-30,-24, 0,-31,-24, 27,-22, 20, 15,-25,-26,-19,-20,-16, -4, 30,-25, -5,-23; /M: SY='H'; M=-18,-10,-25,-14,-12, 6,-22, 36,-14,-13,-10, 1, -3,-24, -4, -7,-15,-15,-19, 2, 25, -9; /M: SY='D'; M=-19, 48,-30, 67, 22,-39,-11, 0,-39, 1,-29,-29, 19, -9, 1, -9, 0,-10,-30,-39,-20, 12; /M: SY='F'; M=-18,-25,-25,-30,-25, 50,-23, -5, -2,-22, 5, 0,-19,-29,-26,-16,-19,-11, -5, 14, 44,-25; /M: SY='Q'; M=-10, 4,-29, 4, 17,-32,-16, 4,-26, 20,-24, -8, 4,-10, 28, 14, -3, -9,-26,-23,-11, 22; /M: SY='R'; M=-10, 6,-25, 1, 5,-21,-14, 6,-21, 10,-20,-10, 15,-16, 9, 19, 0, -5,-20,-28,-12, 5; /M: SY='G'; M= -6, -3,-26, -3,-11,-21, 25,-14,-24,-12,-13,-12, 1,-20,-13,-11, -5,-13,-20,-24,-20,-12; /M: SY='L'; M=-12,-27,-18,-30,-22, 14,-31,-15, 17,-24, 26, 14,-24,-28,-17,-19,-23, -9, 9,-11, 13,-20; /M: SY='T'; M= 1,-11,-17,-20,-15, -9,-24,-22, 8,-14, -1, 0, -8,-14,-12,-15, 4, 21, 8,-26, -8,-15; /M: SY='A'; M= 33,-12, -5,-20,-15,-20, 6,-22,-12,-14,-12,-10,-10,-15,-14,-21, 5, -4, -2,-22,-21,-15; /M: SY='Y'; M=-10,-19,-25,-23,-20, 12,-28, -2, 11,-16, 2, 3,-16,-23,-13,-16,-11, -2, 4, 3, 37,-20; /M: SY='R'; M=-14,-14,-27,-14, -5,-12,-24, -6,-12, 15, -4, -1, -9,-20, -1, 25,-15,-10, -8,-18, -1, -5; /M: SY='P'; M=-15, 0,-28, 7, -4, -4,-21,-14,-14,-14, -9,-12, -8, 8,-15,-17,-11, -9,-13,-24, -9,-10; /M: SY='A'; M= 10,-16,-17,-21,-10, 1,-18,-19, 0,-17, 6, -1,-15,-14,-15,-18, -6, 0, 2,-19, -7,-12; /M: SY='P'; M= -3, -3,-25, -3, 0,-23, 4,-11,-21, -8,-22,-15, 2, 5, -3,-10, 5, -2,-19,-30,-22, -3; /M: SY='G'; M= -8,-13,-27,-13,-12,-15, 9, -7,-19, -5, -7, -5, -8,-21,-10, -3,-10,-12,-16,-19, -8,-12; /M: SY='E'; M=-10, 9,-26, 10, 16,-27,-10, -3,-25, 7,-21,-12, 7,-11, 12, 5, 1, -2,-23,-28,-16, 13; /M: SY='K'; M= -1, -6,-11, -9, -3,-21,-16,-12,-22, 18,-21,-11, -3,-16, -1, 14, -3, -4,-12,-22,-11, -3; /M: SY='C'; M=-10,-21,112,-31,-30,-19,-31,-30,-26,-30,-18,-18,-20,-39,-29,-30,-11,-10, -8,-48,-28,-30; /M: SY='Y'; M=-18,-21,-26,-26,-23, 38,-29, 0, 5,-18, 4, 1,-16,-28,-20,-15,-18, -9, -2, 13, 48,-23; /M: SY='I'; M= -6,-30,-20,-34,-28, 2,-34,-28, 37,-26, 22, 16,-26,-26,-24,-24,-18, -6, 34,-24, -4,-28; /M: SY='M'; M= -9,-14,-27,-18, -9,-13,-24, -2, 0, 4, -3, 13,-10,-11, -2, 2,-14,-11, -3,-21, -4, -7; /M: SY='K'; M= -1, -6,-25, -4, 4,-22,-17,-14,-17, 10,-17,-10, -7, 4, -2, 2, -3, -3,-12,-25,-15, 0; /M: SY='M'; M=-10,-19,-23,-22,-10, -7,-24, -7, 9,-12, 17, 28,-19,-15, 5,-10,-17, -9, 0,-21, -4, -3; /M: SY='B'; M= 0, 16,-22, 13, 4,-24,-10, -5,-16, -2,-19,-14, 15,-12, -1, -8, 2, -5,-14,-32,-17, 1; /M: SY='K'; M= -9, -5,-26, -6, -1,-18,-19, -5,-22, 11,-21,-11, -3, 4, -1, 10, -3, 2,-17,-24,-10, -3; /M: SY='S'; M= 6, 3,-19, 3, 7,-24, -7,-10,-19, -3,-19,-14, 1,-10, 4, -8, 12, 6,-12,-29,-17, 6; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='A'; M= 1, -4,-20, -7, -6,-17,-11,-11, -7, -5,-12, -7, -1,-15, -6, -4, 1, -1, -3,-26,-13, -7; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='I'; M= -8,-26,-23,-32,-26, 1,-26,-24, 25,-21, 11, 14,-21,-23,-20,-19,-15, -6, 22,-16, -3,-25; /M: SY='P'; M=-10,-13,-32, -8, 0,-21,-19,-12,-12, -7,-14, -2,-15, 39, -5,-11,-10, -9,-18,-28,-20, -5; /M: SY='P'; M= -1, -2,-24, 1, 11,-25,-13,-12,-21, -6,-25,-19, -2, 24, -1,-11, 11, 5,-20,-33,-22, 3; /M: SY='L'; M= -6,-23,-25,-20,-14, -4,-25,-21, 5,-20, 11, 2,-23, 9,-18,-20,-17, -8, 1,-24,-11,-17; /M: SY='E'; M=-11, 9,-27, 13, 16,-29,-10, -2,-29, 12,-24,-16, 6,-11, 13, 14, 1, -6,-24,-28,-16, 13; /M: SY='N'; M= 6, 7,-18, 1, -2,-18,-10, -9,-11, -6,-12, -8, 9,-14, -4,-10, 5, 2,-10,-30,-15, -3; /M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-30,-22, 14,-24,-21, 15,-27, 28, 13,-25,-22,-23,-21,-23,-10, 9,-17, 1,-22; /M: SY='T'; M= -5, -7,-20, -8, -7,-12,-21, -9, -4,-11, -2, -1, -9,-18, -5,-11, -4, 5, 0,-19, -7, -6; /M: SY='E'; M= -9, 8,-28, 13, 21,-27,-16, -4,-28, 14,-22,-16, 3,-10, 11, 13, -3, -8,-24,-21,-14, 16; /M: SY='L'; M= -4,-15,-21,-18, -6, 1,-22,-12, -2, -7, 9, 6,-15,-19, -5, -8,-13, -4, -4,-16, 0, -5; /M: SY='L'; M= -6,-21,-19,-23,-15, 5,-23,-18, 10,-21, 13, 6,-17,-23,-14,-17, -9, -3, 9,-22, -3,-14; /M: SY='R'; M=-11,-12,-27,-12, -8,-14,-18, -9, -5, 4, -8, 0, -9,-17, -2, 5,-12,-10, -4,-19, -3, -7; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='N'; M= -3, 12,-21, 7, 13,-22,-10, -2,-21, 8,-23,-16, 18,-12, 5, 5, 7, -2,-19,-31,-17, 8; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='M'; M= -8,-12,-20,-15, -5, -2,-21,-10, 2, -3, -1, 4, -9,-15, 0, -5, -7, -6, -1,-15, -2, -3; D=-5; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='K'; M= -2, 3,-22, 5, 13,-24,-13, -4,-20, 14,-17, -9, 0, -8, 13, 6, -1, -6,-17,-20,-11, 13; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11; /M: SY='A'; M= 9, -4,-14, -4, 5,-15, -9,-10,-11, -4, -9, -9, -4, -3, -2, -6, 5, 1, -8,-21,-13, 1; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='G'; M= -5, 0,-26, 0, -3,-24, 24, -6,-29, -4,-24,-14, 4,-14, -3, -6, -2,-13,-25,-14,-16, -3; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='T'; M= -5, -8,-21, -8, -2,-15,-10, -8,-12, -2,-14, -7, -7, -2, -6, -6, 0, 3, -7,-22, -9, -5; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='Y'; M= -2,-14,-25,-16, -9, 0,-21, -5, -3, -5, -7, -4,-13, -8, -7,-10, -8, -5, -6, -4, 18,-11; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='L'; M= -7,-17,-21,-20,-15, -4,-11,-13, 5,-18, 11, 11,-14,-18,-13,-15,-13, -7, 1,-20, -4,-15; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='P'; M= -6,-12,-33, -7, -1,-26,-18,-16,-16, -8,-24,-16,-12, 54, -6,-14, -5, -5,-22,-28,-24, -7; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='Q'; M= -3, 2,-22, 2, 1,-25, -7, -4,-17, -4,-17, -9, 1,-10, 10, -6, 4, 2,-14,-26,-14, 5; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='T'; M= 0, -2,-15, -8, -7,-14, -6,-14,-13, -5,-15, -9, 2,-11, -6, -5, 14, 22, -6,-27,-12, -7; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='Y'; M=-14,-10,-26,-10, -6, 7,-22, 11,-13, -2,-10, -5, -9,-12, -4, -1,-12,-10,-15, -1, 26, -7; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='L'; M= -9,-14,-22,-13, -6, -4,-22, -8, 1,-12, 5, 2,-13, -8, -9, -8,-11, -7, -2,-20, -3, -9; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='V'; M= -3,-13,-23,-12, -3,-15,-12,-18, 0,-12, -8, -5,-12, -1,-10,-16, -4, -5, 1,-25,-15, -8; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='Q'; M=-13, 3,-28, 1, 12,-28,-17, 12,-24, 17,-22, -7, 7,-13, 27, 23, -3, -9,-25,-23, -9, 18; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='E'; M= -4, 4,-24, 9, 25,-23, -8, -4,-25, 1,-21,-18, 1, -8, 7, -3, 8, -3,-21,-27,-13, 15; /M: SY='L'; M= -9, -8,-23, -6, 5,-12,-24, -7, -5,-10, 9, 1,-11,-17, 1, -9,-10, -2, -7,-25, -8, 3; /M: SY='M'; M= -9,-22,-25,-27,-22, -1,-14,-14, 10,-17, 10, 20,-19,-23,-12,-14,-17,-10, 5, -6, 1,-18; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='W'; M= -7,-17,-23,-18,-13, 1,-15, -3, -7, -6, -8, -5,-15,-15, -8, -3,-14,-10, -7, 28, 15,-11; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='V'; M= -2,-12,-15,-13,-17, -9,-22,-20, 10,-11, -3, 1,-11,-22,-17,-12, -1, 2, 21,-31,-12,-17; /M: SY='V'; M= 11,-19,-15,-23,-18, -7,-20,-20, 9,-15, 1, 1,-19,-16,-16,-18, -3, 2, 18,-22, -7,-18; /M: SY='G'; M= 3, -3,-19, -9,-14,-17, 13,-14,-14,-13,-15, -9, 4,-18,-13,-14, 5, 3, -9,-27,-19,-13; /M: SY='P'; M= -9, 7,-30, 17, 19,-31,-10, -9,-28, -1,-27,-22, 0, 21, 1, -9, 2, -6,-27,-33,-23, 9; /M: SY='E'; M= -5, -1,-24, -2, 9,-21,-17, 6,-18, 4,-12, -7, 1,-14, 8, 6, -3, -6,-16,-26, -9, 7; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='P'; M= -7, -8,-20, -5, 3,-13,-13, -9,-13, 1,-13, -9, -7, 16, -2, 2, -3, -3,-13,-18,-12, -1; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='V'; M= -5,-21,-20,-24,-20, -5,-20,-22, 19,-14, 6, 7,-17,-19,-17,-15,-11, -6, 20,-21, -7,-20; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='K'; M= -5, 2,-24, 4, 8,-25, -8,-10,-23, 10,-21,-13, -1,-13, 1, 6, 0, -5,-14,-27,-16, 4; /M: SY='D'; M=-18, 45,-28, 55, 16,-35, -9, 6,-35, 0,-29,-26, 28,-12, 1, -7, 2, -8,-30,-39,-18, 8; /M: SY='L'; M= -7,-17,-22,-19,-14, -7,-23,-18, 5,-12, 6, 2,-13,-13,-13,-10,-11, -4, 4,-20, -8,-15; /M: SY='S'; M= 7, 9,-17, 11, 5,-22, -4, -9,-23, -6,-23,-19, 7,-11, -2,-10, 17, 5,-14,-32,-18, 2; /M: SY='F'; M= -9,-12,-23,-17, -9, 14,-21, -9,-10,-10, -4, -4, -8,-20, -6, -8, -9, -5,-11, -6, 5, -5; /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-32,-23, 25,-29,-19, 15,-28, 34, 13,-26,-29,-24,-20,-25, -9, 9,-12, 9,-23; /M: SY='G'; M= 1, -5,-25, -7,-13,-26, 43,-16,-32,-14,-27,-18, 4,-18,-13,-14, 8, -9,-24,-25,-25,-13; /M: SY='S'; M= 0,-11,-21,-13, -6, -9,-16,-13, -6, -8,-11, -6, -7, -3, -8, -9, 2, 0, -5,-24, -9, -8; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='F'; M= -6,-13,-24,-16, -7, 5,-20,-14,-11, -2,-10, -7, -8, -6,-11, -2, -6, -4,-10,-16, -2, -9; /M: SY='I'; M= -7,-30,-24,-37,-29, 1,-37,-29, 43,-27, 19, 17,-23,-23,-23,-27,-18, -7, 34,-23, -3,-29; /M: SY='Y'; M= -3,-11,-21,-13, -6, -5,-18, -2, -6, -7, -2, -2, -9,-20, -1, -6, -3, -3, -7,-14, 9, -5; /M: SY='R'; M=-10, 5,-26, 4, 11,-24,-13, 9,-26, 7,-21,-12, 8,-13, 10, 14, 0, -2,-22,-27,-11, 9; /M: SY='L'; M=-11,-25,-22,-27,-16, 8,-28, -9, 14,-25, 35, 19,-24,-26,-15,-17,-25,-11, 6,-19, 2,-16; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='G'; M= -2, -1,-25, -5, -7,-16, 6, -5,-24, 2,-20,-11, 5,-18, -6, 4, -3,-10,-19,-21,-12, -7; /M: SY='D'; M= -9, 16,-27, 21, 8,-25, 5, 2,-32, -4,-24,-20, 11,-14, -3, -6, -1,-11,-26,-29,-16, 2; /M: SY='M'; M= -9,-19,-22,-22,-14, -7,-27,-17, 8, -2, 7, 10,-16,-21,-10, 1,-14, -4, 10,-23, -6,-14; /M: SY='P'; M=-11, -4,-35, 5, 10,-31,-19,-13,-24, -1,-28,-19, -9, 50, -1,-11, -6, -7,-28,-30,-24, 2; /M: SY='T'; M= -5,-16,-17,-23,-18, -3,-27,-22, 14,-19, 11, 7,-13,-18,-15,-17, -2, 17, 12,-25, -5,-17; /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22, 37,-30, 13, 1,-14, 2, 1,-20,-30,-15,-12,-20,-10, -7, 25, 69,-22; /M: SY='W'; M=-16,-20,-34,-22,-12, 1,-22,-10,-14, 4,-12, -3,-18,-23, -6, 8,-21,-16,-15, 37, 16, -9; /M: SY='L'; M= 2,-21,-20,-26,-18, -3,-17,-16, 11,-23, 21, 11,-19,-22,-15,-20,-15, -5, 6,-21, -6,-18; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 47 in 47 different sequences |
Number of true positive hits | 47 in 47 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 0 |
Number of false negative sequences | 1 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 97.92 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
Maximum number of repetitions [info] | 1 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | CJA_Sigrist |
Feature key [info] | DOMAIN |
Feature description [info] | BRICHOS |
Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
47 sequences
ANN1_AREMA (Q5SC60), ANN2_AREMA (Q5SC59), BRID5_HUMAN (Q6PL45), CNMD_BOVIN (P17404), CNMD_CHICK (Q9PUU8), CNMD_DANRE (P58239), CNMD_HUMAN (O75829), CNMD_MOUSE (Q9Z1F6), CNMD_RABIT (O77770), CNMD_RAT(O70367), GKN1_HUMAN (Q9NS71), GKN1_MOUSE (Q9CR36), GKN1_PIG(Q8HYA9), GKN2_HUMAN (Q86XP6), GKN2_MOUSE (Q9CQS6), GKN2_RAT(Q29TV8), GKN3_HUMAN (P0CG01), GKN3_MOUSE (Q9D0T7), GKN3_PIG(D2XPP7), ITM2A_HUMAN (O43736), ITM2A_MOUSE (Q61500), ITM2B_BOVIN (Q3T0P7), ITM2B_CHICK (O42204), ITM2B_HUMAN (Q9Y287), ITM2B_MACFA (Q60HC1), ITM2B_MOUSE (O89051), ITM2B_PANTR (A5A6H8), ITM2B_PIG (Q52N47), ITM2B_PONAB (Q5R876), ITM2B_RAT (Q5XIE8), ITM2C_BOVIN (A2VDN0), ITM2C_HUMAN (Q9NQX7), ITM2C_MACFA (Q4R540), ITM2C_MOUSE (Q91VK4), ITM2C_PIG (Q06AV4), ITM2C_PONAB (Q5NVC3), ITM2C_RAT (Q5PQL7), PSPC_BOVIN (P15783), PSPC_HUMAN (P11686), PSPC_MACMU (P55152), PSPC_MOUSE (P21841), PSPC_NEOVI (P35245), PSPC_RABIT (P22398), PSPC_RAT(P11685), TNMD_HUMAN (Q9H2S6), TNMD_MOUSE (Q9EP64), TNMD_RAT(Q9ESC2)» more
|
UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
1 sequence
YQ21_CAEEL (Q09231) |
PDB [Detailed view] |
2 PDB
2YAD; 8RNU |