PROSITE entry PS50895
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | SURF1 |
| Accession [info] | PS50895 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-JAN-2003 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC01040 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | SURF1 family profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=226; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=221; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.5675001; R2=0.0132417; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=12189.3808594; R2=13.7036400; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=449; H_SCORE=18342; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=297; H_SCORE=16259; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='F'; M= -8,-19,-25,-22,-18, 11,-19,-19, -1,-17, 1, 0,-17,-12,-19,-17,-14, -8, -2, -3, 1,-18; /M: SY='L'; M= -6,-23,-23,-24,-20, 4, -8,-19, -1,-19, 8, 1,-20,-22,-20,-17,-16,-11, 0, -7, -1,-20; /M: SY='I'; M= 3,-19,-22,-22,-14, -9,-16,-19, 4,-17, 4, 3,-16, -7,-11,-18, -6, -2, 1,-18,-10,-14; /M: M= -8,-12,-24,-16,-15, -6, -4,-15, -7,-16, -1, -1, -7,-17,-12,-14, -9, -4, -9,-11, -8,-13; /M: SY='L'; M= -9,-30,-18,-32,-25, 17,-31,-23, 22,-27, 31, 14,-28,-29,-26,-21,-22, -7, 21,-18, 2,-25; /M: SY='L'; M= 3,-22,-15,-27,-20, 4,-22,-19, 12,-20, 18, 14,-21,-23,-17,-18,-12, -1, 13,-20, -4,-18; /M: SY='V'; M= -6,-24,-19,-27,-23, 6,-18,-23, 14,-24, 15, 7,-20,-25,-23,-20,-12, -3, 16,-21, -5,-23; /M: SY='L'; M= 10,-22,-15,-26,-18, 2,-20,-21, 9,-21, 21, 7,-22,-23,-19,-19,-12, -2, 11,-20, -7,-18; /M: SY='L'; M= -5,-24,-12,-29,-23, 4,-23,-22, 15,-25, 18, 10,-21,-25,-20,-21,-15, -5, 12,-22, -5,-22; /M: SY='P'; M= 4,-14,-22,-16,-11,-16,-11,-21, -7,-15, -9, -8,-12, 12,-13,-18, 1, 6, -6,-27,-18,-14; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='F'; M= -6,-14,-14,-17,-13, 11,-12,-10, 7,-14, 7, 3,-10,-14,-12,-12, -8, -5, 3, -5, 7,-13; D=-13; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='A'; M= 11,-21,-21,-24,-16,-12,-16,-23, 7,-18, 1, -1,-19, 1,-17,-21, -7, -5, 8,-24,-15,-18; /M: SY='V'; M= -4,-21, -3,-29,-24, 4,-28,-24, 14,-22, 4, 6,-17,-23,-21,-22, -7, 2, 16,-24, -5,-23; /M: SY='L'; M= -3,-18, -6,-24,-18, 10,-22,-19, 0,-21, 11, 3,-15,-23,-18,-17, -6, 6, 2,-21, -3,-17; /M: SY='F'; M=-11,-25, -2,-33,-26, 24,-31,-24, 9,-27, 13, 4,-20,-27,-27,-22,-15, -2, 9,-16, 4,-26; /M: SY='G'; M= 4, -9,-21,-13,-14,-10, 12,-16,-19,-12,-18,-13, -3,-18,-14,-13, 3, -4,-12,-12,-10,-14; /M: SY='L'; M= -6,-28,-19,-29,-19, 7,-27,-19, 18,-27, 44, 21,-28,-28,-18,-19,-27, -9, 9,-20, -1,-19; /M: SY='G'; M= 4,-10,-29,-11,-19,-29, 65,-20,-38,-19,-29,-19, -1,-19,-19,-20, 1,-19,-28,-20,-29,-19; /M: SY='T'; M= -4,-13,-12,-18,-14, -2,-21,-19, -3,-14, -9, -7, -8,-10,-14,-11, 7, 16, 3,-27, -9,-15; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='L'; M= -7,-28,-18,-30,-24, 4,-30,-23, 25,-25, 30, 18,-27,-27,-21,-20,-20, -4, 24,-23, -3,-23; /M: SY='Q'; M= -8, -6,-26, -6, 4,-17, -6, -1,-22, 3,-19, -8, -2,-15, 11, 2, -1, -8,-19,-21, -9, 8; /M: SY='R'; M=-19, -9,-30, -9, 1,-21,-20, -1,-30, 31,-21,-10, 0,-19, 10, 67,-10,-10,-20,-20,-10, 1; /M: SY='R'; M= -8,-15,-23,-18,-11, 0,-21, -9, -6, -4, 8, 1,-10,-23, -8, 11,-15, -8, -6,-16, 0,-11; /M: SY='E'; M= -7, -2,-26, -1, 9,-16,-15, 5,-18, 3,-15, -7, -3,-13, 1, -2, -5, -8,-14,-22, -4, 4; /M: SY='W'; M=-12,-13,-38, -9, 5,-12,-18,-15,-24, -3,-21,-18,-18,-17, 0, -8,-19,-19,-28, 56, 5, 5; /M: SY='K'; M=-11, -2,-29, -3, 7,-27,-20, -9,-29, 42,-27,-10, 0,-12, 9, 35, -8, -6,-19,-21,-10, 7; /M: SY='E'; M= -8,-11,-22,-11, 2, -8,-23, -7, -5, -4, 0, 1,-10,-16, -4, -3, -7, -2, -4,-24, -6, -2; /M: SY='Q'; M= 1, 4,-25, 6, 8,-28, -4, -6,-24, 4,-18,-12, 2,-12, 9, 1, -1, -9,-20,-25,-17, 8; /M: SY='L'; M=-11,-17,-22,-17,-10, 2,-27,-16, 6,-16, 22, 7,-18,-24,-13, -7,-18, -6, 3,-22, -4,-12; /M: SY='I'; M=-11,-16,-26,-24,-18, -4,-29, -9, 23,-21, 15, 14, -8,-22,-10,-18,-16, -9, 9,-23, -2,-17; /M: SY='A'; M= 16, 6,-20, 5, 16,-27, -9, -8,-21, 1,-17,-15, 1, -8, 6, -8, 5, -5,-16,-26,-19, 11; /M: SY='R'; M= -4, 1,-22, 0, 1,-18,-14, 0,-19, 2,-16,-11, 4,-15, 4, 10, 4, 3,-15,-25, -8, 1; /M: SY='I'; M= -5,-23,-15,-27,-20, -1,-29,-14, 17,-22, 17, 10,-20,-24,-15,-19,-16, -6, 14,-21, 0,-19; /M: SY='E'; M= -6, 9,-25, 12, 24,-28,-16, -4,-26, 10,-22,-16, 4, -8, 13, 5, 4, -1,-22,-29,-16, 18; /M: SY='Q'; M= 4, -1,-21, -4, 5,-19,-10, 0,-17, -2,-17,-10, 0,-13, 6, -6, 5, 1,-14,-23, -8, 5; /M: SY='R'; M=-10,-10,-26,-12, -2,-18,-19, 1,-16, 11,-11, -1, -4,-18, 9, 30, -7, -8,-13,-22, -8, 1; /M: SY='L'; M= -4,-19,-23,-21, -9, -7,-25,-16, 7,-10, 16, 8,-17,-21, -6, -5,-16, -9, 3,-21, -6, -9; /M: SY='H'; M= -7, 7,-24, 5, 6,-22,-11, 14,-19, -3,-17,-10, 10,-14, 4, -4, 1, -3,-19,-30, -9, 4; /M: SY='A'; M= 23, -6,-14,-12, -3,-18, -7,-12,-12, -7,-13, -7, -5,-11, 0,-12, 13, 7, -6,-23,-13, -2; /M: SY='P'; M= 2, -8,-28, -4, 11,-26,-15,-14,-20, -5,-23,-18,-10, 38, -2,-14, 2, -2,-21,-29,-24, 2; /M: SY='P'; M= 9,-18,-28,-15, -7,-23,-10,-21,-13,-12,-17,-13,-17, 41,-12,-20, -5, -7,-14,-26,-24,-12; /M: SY='V'; M= -1,-22,-20,-26,-18, -7,-27,-21, 18,-15, 8, 8,-18,-21,-11,-12,-10, -2, 19,-24, -7,-16; /M: SY='P'; M= -5, 2,-28, 7, 9,-26,-15,-11,-22, -1,-22,-17, -2, 21, -2, -6, -1, -4,-22,-30,-21, 1; /M: SY='L'; M= 1,-26,-18,-27,-18, 2,-24,-21, 14,-24, 31, 12,-26,-20,-19,-20,-20, -7, 11,-22, -6,-19; /M: SY='P'; M= -1, -9,-28, -6, 3,-25,-12,-16,-18, -4,-23,-15, -8, 31, -6,-12, -1, -3,-18,-29,-23, -4; /M: SY='E'; M= -1, -1,-26, 0, 6,-26,-11,-10,-20, 5,-20,-12, -2, 0, 6, 1, 1, -3,-17,-26,-16, 5; /M: SY='P'; M= -6, -6,-24, -2, -2,-17,-21,-14, -5,-12, -3, -4,-11, 1, -6,-15, -7, -4, -5,-28,-14, -6; /M: SY='L'; M= -1,-13,-21,-13, -1, -8,-20, -9, -5,-14, 4, -2,-13, -8, -5,-13, -6, -2, -6,-25, -9, -4; /I: I=-9; MD=-19; /M: SY='T'; M= 6, -4,-16, -7, -5,-17,-13,-14,-10, -6,-13, -8, -5, 2, -4,-10, 8, 13, -5,-25,-14, -5; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='E'; M= -4, 3,-10, 7, 12,-15,-13, -6,-14, -3,-10,-11, -3, -4, 0, -7, -1, -4,-11,-21,-10, 6; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='K'; M= -1, -4,-16, -4, 1,-14, -8, -8,-10, 3, -6, -4, -4,-11, 0, 1, -3, -4, -6,-17, -9, 0; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='N'; M= -3, 4,-19, 0, -2,-17, -8, -8,-12, -6,-13, -8, 7,-14, -2, -4, 6, 4,-11,-28,-14, -3; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='P'; M= 4,-16,-15,-17, -9,-13,-14,-19, -6,-15, -1, -5,-16, 8,-13,-18, -6, -1, -5,-25,-16,-12; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='E'; M= 1, 3,-23, 3, 9,-24, -7,-10,-21, 2,-20,-15, 3, -5, -1, -3, 3, -3,-16,-28,-19, 3; /M: SY='D'; M= -7, 19,-27, 24, 12,-30, -8, -4,-29, 4,-25,-20, 11, -6, 3, 1, 1, -6,-24,-31,-19, 7; /M: SY='L'; M= -7,-14,-16,-13,-10, -7,-24,-16, 0,-13, 7, 2,-17,-17,-12,-14,-16, -9, -1,-16, -5,-12; /M: SY='E'; M= 1, 0,-25, 3, 31,-24,-17, -4,-20, 4,-12, -9, -5, -7, 13, -1, -1, -8,-19,-26,-16, 22; /M: SY='Y'; M=-19,-23,-31,-25,-22, 28,-27, 3, -5,-14, -4, -5,-22,-29,-15,-13,-21, -9,-12, 47, 59,-20; /M: SY='R'; M=-13,-11,-16,-12, -7,-16,-21, -3,-19, 12,-16, -8, -4,-21, 0, 36, -4, 0, -8,-26,-10, -7; /M: SY='R'; M=-14,-10,-30, -9, -1,-22,-14, -2,-26, 17,-20,-10, -3, -4, 3, 34, -8, -8,-20,-22,-12, -3; /M: SY='V'; M= -1,-29,-11,-29,-28, -1,-29,-28, 26,-16, 8, 9,-28,-29,-27,-13,-10, -1, 45,-29,-10,-28; /M: SY='R'; M= -5, -6,-21, -9, -2,-18,-18,-12,-14, 9,-15, -7, -2,-14, 3, 11, 4, 9, -7,-26,-11, -1; /M: SY='L'; M= 0,-25,-10,-29,-22, 4,-26,-23, 15,-24, 22, 9,-23,-25,-21,-21,-15, -2, 16,-23, -5,-22; /M: SY='T'; M= -5, 4,-19, 2, -1,-20,-16, -5,-22, 5,-19,-13, 3,-12, -1, 9, 8, 16,-12,-29,-11, -2; /M: SY='G'; M= 2,-12,-17,-13,-21,-27, 52,-21,-33,-20,-25,-17, -4,-22,-21,-21, -1,-17,-21,-23,-28,-21; /M: SY='T'; M= -6, -6,-15, -9, -3,-19,-14, -7,-17, -1,-15, -9, -3,-16, 2, 7, 5, 10, -9,-27,-12, -2; /M: SY='F'; M=-18,-22,-22,-28,-25, 57,-21,-16, -5,-26, 5, -3,-16,-28,-33,-19,-18,-11, -5, 4, 24,-25; /M: SY='D'; M=-11, 2,-16, 8, -5,-14,-20,-12, -9,-13, 6, -5, -8,-21,-11,-10,-13, -9, -5,-29,-11, -8; /M: SY='H'; M= -9, 1,-27, 1, 1,-19,-11, 25,-21, -8,-19,-10, 4, -4, -1, -8, -4, -8,-21,-26, -1, -2; /M: SY='D'; M= -7, 19,-25, 24, 11,-30, -1, -4,-30, -1,-25,-20, 13,-12, 4, -4, 5, -4,-25,-32,-19, 8; /M: SY='R'; M=-12, -1,-29, 2, 8,-26,-11, 4,-26, 14,-22,-11, -1, -9, 6, 16, -7,-11,-20,-25,-12, 5; /M: SY='E'; M= -8, 10,-26, 15, 28,-29,-16, -3,-25, 3,-22,-17, 5, 1, 15, -3, 6, 0,-25,-31,-18, 21; /M: SY='V'; M= -5,-24,-10,-28,-22, 2,-27,-20, 14,-18, 15, 14,-21,-25,-18,-12,-15, -4, 16,-23, -5,-20; /M: SY='L'; M=-12,-23,-24,-23,-16, 5,-28, -2, 8,-18, 18, 11,-21,-18,-11,-12,-21,-10, 1,-14, 11,-15; /M: SY='V'; M= -2,-28,-15,-31,-25, 9,-28,-24, 22,-24, 22, 13,-27,-28,-25,-20,-17, -5, 27,-22, -3,-25; /M: M=-10,-10,-27, -9, -7,-10, 0, -7,-17, -7,-13, -8, -8,-12, -6, -3, -7,-10,-15,-15, -2, -8; /M: SY='P'; M= -1, -7,-27, -7, -1,-18,-11,-11,-16, -7,-17,-13, -4, 18, -6, -9, -2, -4,-19,-24,-14, -6; /M: SY='R'; M=-13,-12,-25,-13, -7,-17,-15, -8,-18, 13,-15, -8, -4,-20, 0, 38, -5, -3, -9,-23,-11, -7; /M: SY='T'; M= -4, -9,-19,-11, -9,-14,-10,-10,-12, -4,-13, -8, -6,-11, -9, -4, 4, 9, -4,-26, -9,-10; /M: SY='R'; M=-12, -6,-26, -4, 0,-17,-21, -3,-11, 5, -5, -1, -6,-18, 1, 12,-10, -8, -8,-25, -8, -1; /M: SY='B'; M= -3, 1,-24, 1, -1,-16, -3,-11,-14,-11,-11, -9, 0,-10, -8,-14, -3, -8,-13,-26,-15, -5; /M: SY='G'; M= -3, 4,-26, 7, -4,-27, 18,-13,-26,-10,-22,-16, 2,-15, -7,-12, 2, -8,-18,-27,-21, -6; /I: I=-5; MD=-11; /M: SY='D'; M=-10, 6,-26, 10, 6,-22,-14, -2,-20, 2,-19,-11, 2, 5, 6, 2, -2, -7,-20,-23,-10, 4; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11; /M: SY='P'; M= -4, -2,-24, -2, 0,-22, -6, -6,-15, -5,-18,-10, 0, 3, -1, -9, -1, -5,-14,-26,-16, -2; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='G'; M= 4,-11,-27,-12,-20,-27, 58,-21,-33,-19,-26,-17, -3,-20,-20,-20, 0,-17,-22,-21,-28,-20; /M: SY='Y'; M=-14,-24,-25,-28,-24, 38,-23, -6, -3,-19, 0, -3,-20,-28,-23,-16,-17, -8, -5, 21, 40,-23; /M: SY='Y'; M=-17,-16,-31,-15, -3, 7,-24, 13,-13, -9, -5, -5,-14,-22, -5, -4,-18,-15,-18, 17, 26, -5; /M: SY='V'; M= 4,-28,-13,-30,-26, -1,-27,-27, 25,-21, 14, 10,-27,-27,-25,-21,-11, -2, 36,-26, -9,-26; /M: SY='L'; M=-10,-26,-21,-29,-21, 11,-29,-15, 18,-22, 24, 17,-24,-27,-15,-17,-20, -8, 14,-15, 7,-18; /M: SY='T'; M= 3, -4,-13,-12, -9,-11,-19,-18, -6,-11, -7, -7, -3,-12, -7,-11, 15, 35, 0,-28,-10, -8; /M: SY='P'; M=-10,-21,-39,-11, -1,-27,-21,-20,-17,-11,-24,-17,-21, 81,-11,-20,-11,-10,-27,-29,-28,-11; /M: SY='F'; M=-12,-28, -9,-35,-25, 42,-28,-20, 5,-28, 20, 7,-23,-29,-29,-20,-21, -9, 3, -7, 12,-25; /M: SY='R'; M= -8,-13,-24,-16, -7,-11,-22, -5, -3, 3, -5, 6,-10,-19, 0, 12, -9, -5, 0,-20, -3, -6; /M: SY='L'; M= -8,-17,-16,-18,-15, -6,-26,-20, 4,-16, 10, 2,-17,-11,-15,-11,-11, 2, 5,-26, -9,-16; /M: SY='D'; M= -4, 10,-26, 14, 10,-25,-16, -9,-16, -3,-14,-12, 3, -6, 1,-10, -2, -6,-15,-29,-16, 5; /I: I=-10; MD=-21; /M: SY='D'; M= -3, 18,-24, 25, 2,-29, 13, -8,-30, -7,-24,-21, 9, -7, -7,-13, 1,-10,-23,-28,-21, -3; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='S'; M= 2, -5,-11, -6, -4, -9, -2, -8, -8, -5, -8, -4, -2, -1, -4, -5, 6, 5, -5,-16, -9, -5; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='G'; M= -4, -5,-30, -3,-14,-27, 51,-14,-36,-16,-27,-19, 0,-19,-14,-17, -1,-18,-29,-18,-20,-14; /M: SY='R'; M=-11, -2,-26, -1, 9,-18,-18, -5,-21, 10,-17,-11, 1, -7, 5, 16, -3, -6,-18,-25,-13, 6; /M: SY='I'; M= -1,-19,-21,-25,-18, 0,-22,-19, 7,-13, 0, 6,-16,-14,-14,-13, -8, -1, 7,-12, -4,-17; /M: SY='I'; M= -6,-30,-19,-34,-28, 2,-34,-28, 35,-26, 23, 16,-26,-26,-24,-24,-18, -6, 34,-24, -4,-28; /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-29,-20, 9,-29,-20, 18,-27, 37, 18,-28,-20,-20,-20,-26, -9, 10,-20, -1,-20; /M: SY='V'; M= -1,-30,-13,-31,-30, 0,-31,-30, 33,-21, 11, 11,-29,-29,-29,-21,-11, -1, 47,-29, -9,-30; /M: SY='N'; M=-11, 32,-21, 23, 3,-22, -7, 3,-18, -2,-24,-18, 38,-18, -3, -4, 5, -2,-20,-38,-19, 0; /M: SY='R'; M=-16,-10,-29,-11, -1,-20,-19, -1,-29, 28,-19,-10, -1,-19, 9, 65, -9, -9,-19,-20,-11, -1; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='W'; M=-19,-35,-38,-38,-29, 30,-24,-24,-10,-22, -8,-11,-32,-30,-25,-19,-31,-21,-15, 90, 31,-23; /M: SY='V'; M= -5,-30,-16,-33,-28, 6,-32,-28, 31,-24, 19, 13,-27,-28,-27,-22,-16, -4, 36,-24, -4,-28; /M: SY='P'; M= -2,-14,-32, -8, 2,-27,-15,-16,-20, -6,-27,-18,-12, 54, -6,-11, -1, -5,-24,-30,-26, -5; /M: SY='R'; M= -7, -7,-27,-10, -5,-14, -4, -8,-19, -2,-19,-12, 0,-11, -2, 6, -3, -8,-18,-13, -9, -5; /M: SY='E'; M=-10, 8,-25, 13, 14,-21,-12, -7,-24, 1,-17,-15, 2,-11, 4, -1, 2, -1,-19,-28,-14, 9; /M: M= -7, -9,-26,-10, -8,-12,-14,-10,-14, 0,-14, -4, -7, -4, -5, 0, -8, -5,-12,-13, -6, -7; /M: SY='R'; M= -6, -8,-26, -7, -7,-19, -2,-14,-19, 4,-18,-10, -6,-12, -6, 5, -6,-10,-10,-22,-14, -7; /M: SY='E'; M= -4, 12,-25, 16, 19,-29,-12, -4,-26, 5,-24,-18, 8, -2, 9, 0, 5, -4,-23,-31,-19, 13; /M: SY='P'; M= -3,-11,-28, -9, 1,-23,-18, 2,-15, -1,-18, -8, -8, 11, 3, -1, -4, -8,-15,-26,-13, -1; /M: SY='S'; M= 3, -6,-19, -7, 0,-14,-15,-13,-12, -5,-14,-11, -4, -8, -5, -3, 7, 5, -6,-27,-14, -3; /M: SY='T'; M= 3, -8,-21,-10, -2,-20,-15,-14,-13, -3,-17, -9, -7, 8, -2, -6, 7, 9, -9,-28,-17, -3; /M: SY='R'; M= -9,-11,-28,-11, 2,-15,-20, -8,-16, 8,-14, -5, -7, 0, 3, 18, -7, -6,-15,-21,-11, 0; /M: SY='P'; M= 2, -5,-25, -4, 0,-22,-16,-13,-11, -9,-11,-10, -7, 13, -2,-14, -2, -4,-13,-27,-18, -3; /M: SY='P'; M= -4, -7,-28, -4, 2,-24,-13,-13,-21, 7,-19,-13, -7, 12, -2, 4, -4, -5,-18,-26,-18, -2; /M: SY='G'; M= 1, -6,-24, -8, -6,-20, 7, -7,-20, -8,-19,-12, -1, -9, -5, -7, 2, -3,-16,-22,-13, -7; /M: M= -5, -5,-23, -8, -2,-10,-14, -4,-12, -9,-11, -8, -2, -5, -1, -9, -1, 0,-13,-22, -6, -2; /I: I=-3; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7; /M: SY='P'; M= -1,-12,-21,-11, -5,-14, -9,-12, -8, -8,-10, -7,-11, 16, -3,-11, -5, -4,-12, -7,-11, -5; D=-3; /I: I=-3; DM=-7; /M: SY='A'; M= 4, -5,-17, -5, 2,-18, 3, -9,-16, 1,-13, -9, -3,-10, 0, 1, 1, -4,-11,-17,-14, 0; D=-3; /I: I=-3; DM=-7; /M: SY='G'; M= 3, -5,-25, -4, -4,-28, 21,-14,-27, -8,-24,-15, -2, -7, -4,-12, 4, -9,-20,-25,-23, -4; /M: SY='P'; M= -6, -7,-25, -5, 6,-20,-19, -9,-12, -6,-17,-12, -6, 13, -3, -8, 1, 1,-11,-31,-17, -1; /M: SY='V'; M= -6,-23,-18,-23,-18, -6,-27,-15, 13,-15, 7, 6,-21,-19,-14,-10,-11, -2, 21,-27, -8,-17; /M: SY='T'; M= -5, 1,-20, 1, 7,-19,-20,-11,-15, 1,-11,-10, -3,-12, 1, 0, 2, 10, -8,-28,-13, 4; /M: SY='V'; M= -5,-25,-18,-28,-25, 0,-25,-24, 25,-24, 19, 12,-21,-27,-23,-21,-16, -6, 26,-25, -7,-25; /M: SY='T'; M= -4,-12,-19,-14, -5,-10,-20,-20, 1,-13, -1, -3,-12,-11,-12,-14, -1, 11, 6,-28,-12, -9; /M: SY='G'; M= 5, -9,-21,-10,-18,-27, 44,-20,-29,-19,-23,-16, -3,-19,-18,-21, 0,-16,-21,-22,-26,-18; /M: SY='V'; M= -1,-22,-20,-25,-18, -3,-25,-18, 11,-15, 10, 7,-20,-16,-15,-10,-12, -2, 12,-21, -4,-18; /M: SY='L'; M= 5,-26,-18,-29,-22, 0,-24,-23, 17,-22, 20, 11,-25,-24,-19,-21,-16, -7, 17,-13, -5,-21; /M: SY='R'; M= -9,-11,-25,-13, -4,-18,-18, -5,-17, 12,-14, -1, -5,-13, 6, 32, -4, -3,-11,-23,-11, -2; /M: SY='P'; M= 0,-14,-27,-14, -7,-12,-14,-14,-10, -8, -7, -4,-15, 12, -8,-13,-10, -9,-13,-19,-10, -9; /M: SY='P'; M= -4, -5,-25, -3, -6,-20,-10, -4,-15,-10,-15,-10, -4, 2, -7, -9, 0, -2,-12,-29,-14, -9; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='E'; M= -3, 4,-24, 9, 29,-23,-17, -7,-20, 2,-12,-13, -4, -1, 7, -5, -2, -5,-19,-26,-16, 18; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='S'; M= 0, 1,-19, 1, 1,-22,-10,-11,-20, 3,-24,-15, 3, 6, -1, -3, 12, 9,-15,-30,-17, -1; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='P'; M=-10,-12,-29, -9, -1,-20,-10,-13,-21, 2,-21,-14, -9, 14, -4, 7, -6, -4,-19,-14,-15, -5; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='G'; M= -4,-12,-26, -9, -6,-21, 10,-16,-19,-11,-16,-11, -8, 6, -9,-13, -3, -9,-16,-24,-20, -8; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='A'; M= 3,-12,-21,-13, -9,-14, -5,-12,-10,-10,-13, -8, -8, -8, -4, -9, 3, -3, -8,-13, -8, -7; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='F'; M= -8,-21,-17,-24,-20, 24,-16,-16, 2,-22, 7, 1,-16,-24,-23,-16, -9, -4, 4,-11, 7,-20; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='L'; M= -3,-17,-18,-20,-15, -1,-10,-10, -2,-15, 5, 3,-13,-21,-12,-10, -9, -4, 1,-19, -5,-14; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='P'; M= -8,-19,-29,-17,-12,-16, -5,-17,-10,-11,-11, -5,-16, 16,-12,-10,-12,-11,-12,-15,-16,-14; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='A'; M= 5, -1,-20, -2, 1,-20,-11,-11,-19, 5,-19,-12, -2,-11, 1, 1, 5, 0,-12,-15,-12, 1; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='N'; M=-11, 26,-24, 22, 6,-25, -1, 5,-26, 3,-27,-19, 30,-11, 1, -1, 3, -6,-27,-32,-17, 3; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='D'; M=-10, 17,-23, 26, 10,-25, -8, -7,-23, -5,-18,-17, 6, -4, -3,-10, 1, -3,-18,-31,-17, 3; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='P'; M= -3,-17,-27,-17,-11, -9, -8,-16, -7,-12,-12, -8,-13, 18,-13,-14, -8, -9,-11,-16,-10,-14; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='E'; M= 1, 1,-25, 3, 9,-21,-10, -8,-20, 1,-18,-14, -2,-13, 3, -6, -1, -7,-16,-15,-10, 6; /M: SY='R'; M= -9, 0,-26, -3, 2,-26, -9, -5,-25, 14,-23,-11, 5, -9, 11, 19, 1, -1,-21,-25,-14, 5; /M: SY='N'; M=-11, 9,-26, 4, -3,-23, 6, -2,-26, 2,-21,-14, 18,-19, 0, 13, -2, -9,-25,-28,-18, -3; /M: SY='L'; M= -4,-18,-23,-21,-15,-11,-11,-13, 1,-13, 3, 2,-13,-22,-10, -5,-10, -8, 3,-23,-10,-14; /M: SY='W'; M=-16,-31,-35,-34,-27, 19,-18,-22, -7,-19, -7, -5,-27,-27,-21,-15,-26,-19,-11, 62, 19,-22; /M: SY='Y'; M=-12,-10,-25,-10, -9, 4,-18, 3, -9,-11, -2, -2,-10,-22, -1, -9, -9, -6,-12, -7, 19, -6; /M: SY='Y'; M= -5,-14,-23,-17,-13, -2,-20, -8, -3, -9, -8, -4,-10,-21, -4, -6, -5, -3, -3, 0, 9, -9; /M: SY='R'; M= -3,-10,-23,-11, -8,-14,-19,-12, -7, 2, -4, -3, -7,-15, -6, 10, -9, -7, -3,-24,-11, -9; /M: SY='D'; M=-15, 31,-26, 40, 10,-28,-12, 6,-31, 1,-26,-22, 17,-13, 0, -6, 2, -3,-24,-32, -9, 4; /M: SY='L'; M= -7,-24,-21,-25,-17, 0,-28,-16, 17,-23, 21, 10,-22,-25,-17,-18,-17, -7, 14,-18, -3,-18; /M: M= 0, -9,-25, -9, -4,-16,-19,-12, -7, -3, -6, -5, -9, -1, -4, -6, -8, -7, -8,-22,-10, -5; /M: SY='E'; M= 12, 6,-21, 2, 14,-26, -9, -5,-20, 1,-18,-13, 6,-10, 10, -4, 5, -5,-18,-26,-18, 12; /M: SY='M'; M= -3,-19,-20,-27,-18, 4,-22,-13, 11,-15, 11, 20,-16,-20,-11,-11,-11, -3, 7,-19, -2,-15; /M: SY='A'; M= 24,-13,-11,-19,-11,-11, -4,-20,-11,-13,-11,-11,-11,-15,-13,-18, 4, -1, -3,-13,-14,-11; /M: SY='R'; M= -1, -5,-26, -4, 10,-27,-15, -5,-23, 12,-21,-11, -2, -4, 16, 17, 1, -5,-20,-24,-15, 11; /M: SY='A'; M= 12, -7,-18, -9, -5,-14,-13, -8, -8, -8, -7, -6, -8,-15, -7,-13, 1, -2, -3,-22, -6, -7; /M: M= -2, -5,-21, -6, -7, -9,-17, -5,-10, -6, -7, -6, -5,-18, -7, -2, -3, -1, -5,-22, -4, -8; /M: SY='G'; M= 5, -9,-26,-10,-12,-26, 38,-19,-29, -8,-24,-15, -4,-17,-14,-13, -1,-14,-19,-21,-24,-13; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='T'; M= 0,-10,-14, -9, -5,-15,-20,-18, -6,-10, -5, -7,-13, -4,-11,-11, -4, 2, 0,-28,-15, -9; /M: SY='A'; M= 12, -2,-18, -8, -4,-17, -6, -7,-12,-10,-10, -9, 1,-10, -7,-13, 3, 1, -9,-27,-15, -6; /M: SY='P'; M=-10,-13,-35, -8, -6,-21, -3,-11,-24,-12,-25,-17,-12, 32, -8,-16, -8,-11,-27,-13,-17, -9; /M: SY='I'; M=-10,-26,-22,-28,-21, 14,-31,-17, 17,-21, 11, 7,-23,-20,-21,-19,-17, -7, 16,-11, 12,-23; /M: SY='Y'; M= -9,-20,-23,-23,-16, 12,-26, -9, 3,-14, 3, 2,-17,-18,-10,-10,-12, -4, 1, -7, 15,-14; /M: SY='I'; M= -8,-30,-21,-32,-25, 6,-31,-26, 24,-25, 22, 12,-28,-22,-23,-22,-21, -8, 21,-13, -2,-25; /M: SY='D'; M= -4, 9,-22, 12, 7,-19,-16, -6,-14, -5,-10, -8, 1,-14, -1,-10, -2, -4,-10,-27,-10, 3; /M: SY='A'; M= 5, -6,-22, -7, 5,-15,-11,-13,-11, -3, -8, -5, -9,-13, -5, -9, -4, -8, -6,-22,-13, 0; /M: M= -4, -6,-21, -5, -2,-16, -8,-13,-10,-10, -4, -6, -6,-18, -5, -8, -3, -3, -6,-27,-14, -4; /M: SY='Y'; M=-11, -3,-28, -1, 3, -9,-20, 5,-16, -3,-12, -7, -6,-11, 8, -5, -7, -9,-19,-12, 10, 5; /M: SY='E'; M= -5, 6,-24, 13, 17,-24,-16, -9,-20, -4,-16,-16, -1, 0, 3, -9, 4, 0,-17,-32,-18, 9; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='P'; M= -5, -4,-15, -4, -3, -7, -4, -1, -7, -7, -8, -2, -3, 1, -1, -7, -3, -5, -9,-12, -5, -3; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5; /M: SY='P'; M= -2, -5,-25, -7, -3,-17,-12, -8,-13, -6,-15, -6, -4, 5, -4,-11, -1, -1,-13,-26,-13, -5; /M: SY='N'; M= -3, -4,-24, -8, -5,-16,-11,-12,-13, -5,-14,-11, 2, -4, -7, -3, -2, -1,-13,-17,-14, -7; /M: SY='D'; M= 5, 3,-23, 7, 2,-27,-12,-12,-19, -2,-21,-15, -3, 7, -2,-10, 3, -4,-13,-30,-20, -1; /M: M= -1, -7,-24, -9, -8,-20, -2,-13,-14, -6,-13, -8, -4, -9, -5, -2, -3, -6,-11,-24,-17, -8; /M: SY='G'; M= -5,-11,-31, -8, -6,-26, 23,-12,-29,-12,-24,-17, -6, 9,-11,-12, -3,-13,-26,-25,-24,-10; /M: SY='L'; M= -7,-22,-26,-22,-17, -1, -4,-18, -4,-18, 3, -2,-18,-24,-17,-14,-16,-13, -4, -1, -2,-17; /M: SY='P'; M= -8,-12,-34, -4, 3,-28,-12,-15,-20, -9,-23,-17,-13, 50, -4,-16, -5, -9,-26,-29,-25, -4; /M: SY='I'; M= -4,-20,-21,-25,-17, -6,-27,-19, 13,-13, 9, 7,-16,-21,-11, -5,-10, 0, 13,-23, -6,-16; /M: SY='G'; M= -5, -2,-31, 4, -7,-31, 31,-16,-34,-14,-30,-22, -1, 9,-13,-18, 0,-14,-29,-27,-28,-11; /M: SY='G'; M= -6,-12,-29,-12,-10,-20, 16,-11,-24,-10,-18,-12, -8,-19, -8, -9, -7,-12,-19, -4,-13, -9; /M: SY='P'; M= -9, -7,-28, -6, -2,-21,-20,-12,-10, -4,-13, -8, -6, 18, -2, -9, -8, -7,-13,-28,-17, -4; /M: SY='T'; M= -5,-11,-19,-15,-13,-10,-11,-13, -7,-14, 0, -3, -8,-13,-12,-10, 0, 15, -4,-25, -9,-13; /M: M= -5, -6,-22, -9,-12,-11,-13,-11, -4, -7, -6, -3, -3,-14,-11, -6, -7, -4, -2,-24, -8,-12; /M: SY='V'; M= 1,-17,-19,-18,-13, -9,-23,-22, 12,-17, 4, 2,-17,-12,-16,-19, -6, -1, 15,-27,-11,-16; /M: SY='H'; M=-11, 12,-23, 12, 6,-19,-16, 13,-19, -7,-13, -8, 9,-14, 0, -7, 1, 1,-17,-32, -8, 3; /M: SY='L'; M= -7,-27,-23,-31,-22, 11,-24,-23, 17,-27, 23, 11,-23,-20,-22,-22,-20, -9, 10,-17, -1,-23; /M: SY='R'; M= -4, -5,-26, -4, 0,-20,-16,-11,-23, 12,-22,-14, -4, 5, -1, 13, -2, -3,-17,-24,-14, -2; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='N'; M= -5, 24,-22, 16, 5,-23, -5, 1,-21, -2,-26,-19, 31, -1, -1, -6, 7, -2,-25,-34,-20, 1; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='D'; M=-11, 11,-25, 13, 8,-24,-14, -3,-21, 2,-20,-14, 10, -8, 4, 7, 1, -5,-19,-32,-16, 5; /M: SY='H'; M=-18, 5,-27, 1, -2,-13,-17, 74,-26,-10,-20, -4, 17,-21, 5, -1, -7,-15,-28,-29, 13, -2; /M: SY='L'; M= -9,-25,-19,-26,-18, 11,-27,-17, 12,-26, 34, 12,-23,-27,-18,-18,-20, -2, 6,-18, 4,-18; /M: SY='Q'; M= -1, 1,-23, -1, 8,-26, 2, -5,-20, -4,-20, -9, 4,-13, 11, -6, 6, -5,-19,-27,-18, 9; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='A'; M= 24,-14,-16,-22,-14,-13, -6,-21, 0,-16, 0, -3,-12,-15,-13,-20, 2, 0, 3,-22,-14,-14; /M: SY='I'; M= -2,-27,-18,-32,-26, 4,-31,-27, 29,-24, 16, 11,-23,-24,-24,-23,-13, -3, 29,-22, -4,-26; /M: SY='T'; M= -4, -1,-17, -7, 1,-13,-21,-11,-13, -5,-12, -8, -1,-10, 7, -5, 11, 28, -9,-25, -8, 5; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='F'; M=-19,-28,-26,-34,-27, 55,-30, -9, 2,-23, 6, 0,-21,-29,-28,-18,-21,-11, -3, 22, 43,-26; /M: SY='G'; M= 11, -8,-17,-11,-11,-19, 15,-17,-17,-15,-17,-13, -1,-15,-11,-16, 14, 5,-10,-28,-20,-11; /M: SY='L'; M=-12,-29,-21,-33,-23, 23,-30,-19, 18,-29, 38, 18,-27,-29,-23,-20,-27,-10, 9,-14, 6,-22; /M: SY='A'; M= 29, -8,-11,-15,-10,-18, 1,-19,-11,-11,-14,-11, -5,-12,-10,-17, 15, 8, -1,-26,-19,-10; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='A'; M= 16,-14,-12,-20,-15, -6, -8,-18, 4,-14, 0, -1,-12,-14,-14,-17, -1, 0, 9,-16, -9,-15; D=-11; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='A'; M= 13,-17,-16,-23,-17, -5, -5,-19, 0,-18, 6, 4,-16,-19,-16,-18, -6, -3, 4,-20,-11,-16; /M: SY='V'; M= 5,-23,-14,-25,-20, 3,-21,-22, 12,-21, 12, 5,-20,-24,-21,-18, -6, -1, 19,-24, -7,-20; /M: SY='V'; M= 4,-18,-18,-21,-16, -8,-19,-22, 5,-18, 6, 0,-17, -6,-17,-18, -5, 6, 7,-25,-12,-17; /M: SY='I'; M= 1,-22,-20,-29,-22, 7,-26,-20, 19,-21, 9, 9,-17,-21,-19,-21, -9, -3, 15,-16, 2,-22; /M: SY='F'; M= -1,-22,-23,-27,-22, 8, -6,-17, 2,-20, 4, 5,-17,-23,-19,-19,-13,-11, 1, -5, 4,-21; /M: SY='L'; M= -5,-25,-22,-28,-21, 9,-20,-13, 9,-20, 20, 16,-24,-26,-16,-17,-21,-10, 4, -3, 9,-18; /M: SY='W'; M= -5,-26,-33,-28,-24, 1, -7,-19, -7,-19, -8, -8,-23,-25,-18,-19,-20,-17,-11, 45, 14,-20; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='V'; M= -2,-15,-12,-17,-14, 7,-16,-11, 6, -9, 4, 2,-12,-16,-13, -4, -8, -4, 10, -9, 2,-14; D=-13; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='Y'; M= -3,-12, -5,-13,-12, -1, -3, -8, -4,-11, 1, -2,-11,-15,-10,-10, -9, -7, -3, 1, 3,-11; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='F'; M=-10,-27,-24,-30,-24, 22,-27,-16, 6,-17, 5, 1,-24,-27,-22,-16,-19,-10, 7, 16, 22,-23; /M: SY='R'; M=-19,-11,-30,-11, -1,-14,-21, 2,-27, 23,-19, -9, -2,-14, 5, 52,-11,-11,-20,-19, -7, -2; /M: SY='R'; M= -9, -6,-26, -9, -3,-18,-13, 0,-19, 13,-12, -3, 1,-18, 4, 24, -9, -9,-16,-22, -9, -2; /M: SY='Y'; M= -4,-15,-23,-18, -9, -1,-13,-10, -4,-11, 1, -1,-12,-20, -8, -9, -8, -7, -6,-13, 3, -9; /M: SY='R'; M= -3, -6,-24, -8, -3,-21, -7, -9,-23, 15,-20,-11, 0,-16, 1, 25, -1, -6,-14,-23,-14, -3; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 22 in 22 different sequences |
| Number of true positive hits | 22 in 22 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
22 sequences
SHY1_SCHPO (Q9Y810), SHY1_YEAST (P53266), SURF1_ARATH (Q9SE51), SURF1_CAEBR (A8Y2C9), SURF1_CAEEL (Q9N5N8), SURF1_CHICK (Q800L1), SURF1_DICDI (Q556J9), SURF1_DROME (Q9U4F3), SURF1_HUMAN (Q15526), SURF1_MONBE (A9UWF0), SURF1_MOUSE (P09925), SURF1_RAT (Q9QXU2), SURF1_RICBR (Q1RJM4), SURF1_RICCN (Q92GL0), SURF1_RICFE (Q4UN32), SURF1_RICPR (Q9ZCJ8), SURF1_TAKRU (O57593), SURF1_XENTR (A4IHH4), SURFL_ARATH (Q9LP74), Y2235_MYCTO (P9WGA6), Y2235_MYCTU (P9WGA7), Y2259_MYCBO (P66884)» more
|