PROSITE logo

PROSITE entry PS50921


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry

Entry name [info] ANTAR
Accession [info] PS50921
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-DEC-2003 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE;
29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC50921
Associated ProRule [info] PRU00308

Name and characterization of the entry

Description [info] ANTAR domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=62;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=57;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9703017; R2=0.0155768; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4150.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=452; H_SCORE=4150; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=291; H_SCORE=4150; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-7; D=-30; I=-30; B1=-300; E1=-300; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='L';  M= -3,-15,-21,-20,-15,  4,-22,-16,  3,-13,  6,  4,-12,-20,-14, -7,-10, -3,  2,-18, -2,-15;
/M: SY='Q';  M= -3, -6,-23, -7,  5,-22,-18, -7,-13,  5,-13, -5, -3,-13, 14,  6,  2,  0,-13,-25,-11,  9;
/M: SY='K';  M=  6, -1,-22, -3,  2,-25,-13, -9,-22, 14,-20,-11, -1,-12,  7, 12,  3,  0,-14,-24,-14,  4;
/I:         I=-9; MD=-32;
/M: SY='L';  M= -9,-25,-21,-25,-17,  5,-24,-17,  9,-21, 29, 12,-24,-26,-14,-12,-22, -9,  3, -6,  0,-16; D=-9;
/I:         I=-9; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='E';  M=  1, -1,-24,  0, 10,-26, -8, -8,-21,  7,-19,-12, -2,-12,  8,  5,  1, -7,-15,-25,-16,  8;
/M: SY='R';  M= -2, -4,-26, -5,  7,-26, -4, -7,-26, 12,-21,-12, -1,-13,  9, 17, -1, -6,-20,-22,-16,  7;
/M: SY='E';  M= -8,  7,-26, 12, 28,-29,-18, -2,-22,  7,-20,-13,  1, -8, 20,  0,  3, -3,-20,-29,-16, 24;
/M: SY='L';  M=  6,-20,-16,-23,-17, -5,-21,-13,  7,-16, 13,  5,-19,-23,-15,-12,-10, -2, 12,-24, -7,-17;
/M: SY='A';  M= 19, -5,-19, -7, 11,-23,-11,-11,-15, -1,-13,-10, -7,-10,  4, -5,  3, -4, -8,-24,-18,  7;
/M: SY='Q';  M= -1,  7,-23,  7, 10,-28,-15, -7,-23, 11,-21,-12,  2, -9, 13,  3,  4,  3,-18,-26,-14, 12;
/M: SY='L';  M= -3,-24,-19,-26,-18,  4,-24,-15, 11,-19, 28, 14,-24,-26,-15,-12,-20, -8,  7,-17,  2,-17;
/M: SY='K';  M= -7, -1,-25, -1, 12,-26,-17, -6,-25, 21,-22,-11,  1,-11, 14, 21,  2,  1,-18,-24,-13, 12;
/M: SY='E';  M= -4,  6,-24,  9, 15,-24,-15, -1,-24,  5,-17,-14,  2,-11,  5,  6,  2, -3,-18,-29,-14,  9;
/M: SY='R';  M=  7, -4,-23, -6,  1,-24, -6,-10,-23, 10,-19,-11, -2,-13,  4, 14,  0, -4,-15,-22,-16,  1;
/M: SY='L';  M= -9,-29,-20,-31,-22,  7,-31,-21, 25,-28, 41, 22,-28,-28,-19,-21,-26, -9, 16,-21, -1,-21;
/M: SY='E';  M=  2, -3,-25,  1, 25,-21,-12, -8,-19,  0, -8,-11, -6, -9,  5, -3, -3, -9,-17,-25,-17, 15;
/M: SY='S';  M= -1,  3,-20,  3,  9,-22, -2,-11,-24, -4,-21,-17,  3,-10, -1, -5, 13, 11,-16,-30,-18,  4;
/M: SY='R';  M=-19,  0,-29, -1,  3,-23,-18,  1,-29, 24,-22,-12,  7,-19, 12, 54, -7, -9,-22,-23,-12,  3;
/M: SY='K';  M= -7,  2,-27,  3,  9,-29,-17,  1,-27, 27,-26,-10,  2,-11, 14, 20, -3, -8,-21,-23,-10, 11;
/M: SY='L';  M= -9,-18,-22,-17, -5, -6,-27,-16,  4, -7, 12,  4,-17,-21, -9, -1,-15, -5,  6,-24, -7, -8;
/M: SY='I';  M= -8,-30,-24,-36,-29,  1,-36,-29, 41,-28, 22, 18,-24,-24,-22,-26,-19, -8, 32,-22, -2,-29;
/M: SY='E';  M= -1, 11,-27, 16, 22,-30,  5, -7,-30, -2,-23,-20,  6, -9,  3, -9,  2,-10,-26,-29,-22, 12;
/M: SY='R';  M=-13, -4,-29, -3, 13,-26,-21, -2,-24, 24,-17, -7, -2,-14, 19, 32, -8,-10,-21,-21,-11, 14;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='K';  M= -8, -6,-25, -9, -1,-21,-22,-14,-13, 27,-17, -2, -5,-13,  2, 14, -7, -1, -7,-22, -9,  0;
/M: SY='G';  M= 11, -9,-24,-11,-16,-27, 48,-19,-32,-17,-26,-18, -1,-17,-16,-19,  7,-11,-22,-22,-27,-16;
/M: SY='I';  M= -8,-28,-22,-31,-22,  2,-32,-22, 29,-25, 28, 20,-25,-25,-16,-21,-21, -8, 21,-22, -2,-21;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='M';  M=-10,-18,-22,-26,-15, -5,-21,  0, 16, -8, 15, 51,-17,-19,  7, -8,-17,-10,  6,-20, -1, -4;
/M: SY='A';  M=  7, -7,-20,-10, -1,-20,-11,-15,-12,  2,-12, -7, -6,-12, -1, -4,  2,  3, -7,-24,-14, -1;
/M: SY='R';  M=-13, -5,-25, -7,  4,-14,-19, -2,-15, 10, -9, -1, -1,-17,  4, 21, -7, -5,-14,-22, -5,  2;
/M: SY='H';  M=-14, -3,-28, -3,  5,-19,-19, 24,-23,  9,-16, -6,  3,-17, 11, 18, -7,-10,-21,-23,  2,  5;
/M: SY='G';  M= -8,  7,-28,  7, -7,-28, 32, -5,-35, -7,-28,-19, 12,-18, -9, -3,  0,-14,-29,-26,-22, -9;
/M: SY='M';  M= -9,-25, -3,-31,-24,  0,-29,-21, 15,-23, 16, 17,-23,-26,-17,-20,-18, -6, 11,-15, -4,-21;
/M: SY='S';  M= -2, 11,-18, 14,  2,-25, -2,-10,-25, -7,-25,-19,  9,-11, -1,-10, 19, 14,-16,-34,-18,  0;
/M: SY='E';  M=  4,  5,-24, 10, 41,-27,-14, -5,-25,  4,-19,-18, -1, -3, 12, -5,  5, -5,-22,-29,-20, 27;
/M: SY='E';  M=-11, 12,-29, 16, 21,-28, -8,  3,-29,  1,-25,-19,  9,  3,  5, -2,  1, -8,-28,-32,-19, 12;
/M: SY='E';  M= -5,  8,-28, 14, 30,-31, -6, -3,-29,  5,-21,-17,  2, -7, 14,  0,  0,-10,-26,-27,-19, 22;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='F';  M=-19,-25,-26,-30,-24, 47,-29,  1, -2,-21,  6,  0,-20,-29,-24,-15,-21,-12, -6, 20, 45,-23;
/M: SY='R';  M= -5,  4,-25,  4, 12,-26,-16, -3,-24, 12,-20,-12,  4,-11, 14, 16,  1, -2,-20,-25,-14, 12;
/M: SY='Y';  M= -5,-19,-26,-20,-11, -2,-21, -5, -2,-13,  3,  2,-17,-21, -8,-10,-14,-10, -6,  6,  9,-10;
/M: SY='L';  M=-10,-28,-22,-32,-22,  6,-30,-18, 26,-26, 38, 28,-26,-26,-16,-20,-26,-10, 14,-20,  0,-20;
/M: SY='R';  M=-15, -9,-27, -9,  2,-22,-19, -1,-23, 20,-18, -7, -2,-18, 16, 47, -5, -7,-16,-22,-11,  5;
/M: SY='R';  M=-14, -3,-29, -4,  8,-23,-20, -3,-26, 29,-19, -9,  1,-15, 11, 39, -9, -9,-20,-22,-11,  7;
/M: SY='T';  M=  5, -9,-18,-14, -4,-12,-18,-11, -4, -9, -2,  0, -9,-14,  2,-11,  2, 10, -4,-20, -5, -2;
/M: SY='A';  M= 32, -6,-10,-11, -6,-20,  0,-16,-14,-10,-19,-14, -1,-10, -6,-16, 23,  9, -4,-29,-20, -6;
/M: SY='M';  M=-10,-14,-23,-21, -9,-11,-20,  3,  9, -4,  9, 43,-14,-17, 17, -4,-14,-10, -1,-20, -3,  4;
/M: SY='D';  M= -8, 29,-24, 34,  9,-30, -7, -2,-30,  3,-28,-23, 21,-12,  1, -1,  7, -3,-24,-36,-19,  5;
/M: SY='R';  M=-15, -6,-28, -5,  8,-21,-19,  5,-25, 21,-18, -5,  0,-15, 12, 39, -6, -9,-19,-23, -9,  7;
/M: SY='N';  M=-11, 11,-25,  3,  0,-23, -2,  1,-26, 11,-26,-15, 24,-18,  6, 23,  2, -5,-25,-29,-16,  1;
/M: SY='V';  M= -6,-14, -4,-16, -8,-16,-25,-16, -2, -1, -8,  1,-14,-21, -4, -3, -6, -2,  8,-28,-12, -6;
/M: SY='K';  M= -8, -6,-29, -5,  3,-26,-18,-12,-25, 21,-27,-14, -4, 13,  2, 16, -2, -2,-20,-26,-16,  1;
/M: SY='I';  M=-10,-27,-24,-34,-24,  3,-31,-18, 33,-24, 28, 32,-23,-23,-14,-21,-23,-10, 19,-20,  0,-21;
/M: SY='R';  M= -5, -6,-24, -6,  0,-20,-14, -9,-13,  5,-11, -4, -4,-16,  2,  9, -4, -6, -9,-25,-12, -1;
/M: SY='D';  M=-12, 23,-28, 31, 25,-33,-14,  0,-31,  9,-25,-19, 11, -9, 14,  4,  0, -9,-27,-31,-17, 19;
/M: SY='I';  M= -6,-30,-20,-34,-28,  2,-34,-28, 36,-26, 23, 16,-26,-26,-24,-24,-18, -6, 33,-24, -4,-28;
/M: SY='A';  M= 46,-11, -1,-21,-11,-20, -2,-21,-11,-11,-11,-11,-11,-12,-11,-21,  9, -1, -1,-22,-21,-11;
/M: SY='E';  M=  3,  1,-23,  0, 16,-26,-13, -3,-22,  8,-19,-12,  3,-10, 14, 11,  3, -5,-20,-25,-16, 14;
/M: SY='Q';  M=  5, -3,-18, -5,  2,-21,-14, -9,-13, -3,-13, -8, -3,-13,  8, -3,  8,  6, -8,-27,-14,  5;
/M: SY='I';  M= -6,-30,-19,-34,-28,  2,-34,-28, 35,-26, 22, 16,-26,-26,-24,-24,-18, -6, 35,-24, -4,-28;
/M: SY='V';  M= -6,-29, -9,-32,-27,  2,-32,-27, 27,-26, 22, 13,-27,-29,-25,-23,-18, -6, 30,-26, -6,-27;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_03 which contains 571'609 sequence entries.


Total number of hits 4 in 4 different sequences
Number of true positive hits 4 in 4 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info] Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 1
Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] ANTAR
Version [info] 5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
4 sequences

AMIR_PSEAE  (P10932), NASR_KLEOX  (Q48468), PDTAR_MYCTO (P9WGM2), 
PDTAR_MYCTU (P9WGM3)
» more

PDB
[Detailed view]
4 PDB

1QO0; 1S8N; 1SD5; 4AKK