PROSITE entry PS50923
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50923
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | SUSHI |
| Accession [info] | PS50923 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-DEC-2003 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50923 |
| Associated ProRule [info] | PRU00302 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Sushi/CCP/SCR domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=61; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=61; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2641132; R2=0.0103577; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=477; N_SCORE=7.2; MODE=1; TEXT='R'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=313; N_SCORE=5.5; MODE=1; TEXT='R?'; /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: M= -5, -8,-53, -9, -7,-15,-14,-15, -4, -4, -8, -4, -7,-15, -8, -4, -5, -4, 0,-26,-12, -9; /I: I=-10,-10,-100,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10; MD=-32; /M: SY='S'; M= -4, -1,-59, 0, 2,-19,-13, -5,-19, 1,-19,-11, 0,-11, 2, -2, 4, 0,-14,-24,-11, 1; D=-15; /I: I=-10,-10,-100,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10; MI=-32; MD=-32; IM=-32; /M: SY='C'; M=-10,-20,116,-30,-30,-18,-30,-30,-29,-30,-19,-19,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-49,-29,-30; /M: SY='P'; M= -6, -5,-58, -2, 1,-24, -6,-12,-21, -5,-22,-15, -5, 19, -4,-10, 0, -4,-21,-28,-19, -3; /M: SY='P'; M= -5, -5,-56, -3, 4,-17,-18, -8,-15, 0,-16,-10, -5, 5, -1, -5, -3, -6,-15,-24,-11, 0; /M: SY='P'; M= -9,-20,-53,-14, -5,-18,-22,-19, -8,-14,-11,-10,-19, 48,-12,-18,-12, -8,-15,-28,-21,-12; /M: SY='P'; M= -8, -3,-59, -1, 2,-22,-11, -8,-19, -5,-22,-14, -3, 19, -4, -9, -3, -5,-20,-27,-16, -3; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='E'; M= -4, -1,-18, 2, 5,-15,-11, -7,-11, -3,-10, -8, -3, 1, 1, -5, -1, -3,-10,-18,-11, 2; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='I'; M= -8,-22,-23,-22,-15, -4,-26,-19, 12,-17, 7, 5,-20, 1,-16,-17,-15, -7, 8,-20, -8,-17; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='E'; M= -7, -1,-26, 1, 12,-20,-17, -6,-16, -1,-15,-11, -3, 6, 2, -5, -3, -6,-17,-24,-14, 6; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='N'; M=-10, 15,-22, 6, 0,-13, -8, 17,-18, -2,-20,-11, 26,-18, 0, -1, 1, -5,-22,-28, -6, -1; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='G'; M= 7,-10,-22,-12,-15,-20, 34,-18,-24,-15,-19,-13, -4,-15,-15,-17, 2,-10,-16,-20,-22,-15; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='R'; M= -8, -5,-23, -6, -3,-10,-16, -4,-12, 0,-11, -6, -4,-15, -1, 2, -4, -2,-10,-16, 0, -3; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='I'; M= -7,-19,-21,-21,-14, 1,-24,-12, 8,-13, 5, 5,-16,-15,-11,-11,-12, -6, 7,-16, 0,-14; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: M= -5, -4,-21, -7, -2,-14,-17, -7, -7, -1,-10, -4, -1,-11, 0, -2, -1, 0, -6,-22, -8, -2; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: M= -4, -6, -4, -8, -7,-11, -9, -9,-10,-11, -8, -7, -3,-10, -7,-11, 0, 0, -8,-22, -9, -8; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='S'; M= -3, -2,-14, -3, 1,-12, -6, -1,-14, 0,-13, -8, 1, -4, 0, 0, 4, 0,-11,-18, -8, 0; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: M= -3, -7,-14,-10, -8, -8,-12,-10, -3, -7, -5, -3, -5, -8, -7, -7, -3, 0, -3,-18, -6, -9; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='K'; M= -5, -4,-25, -3, 2,-20,-11, -5,-18, 4,-17, -9, -2, -8, 2, 1, -1, -5,-15,-23,-10, 1; /M: SY='N'; M= -6, 2,-21, 1, -2,-19, -5, -8,-20, -4,-17,-12, 4, -9, -4, -4, 0, -3,-17,-27,-14, -4; /M: SY='N'; M= -5, -1,-23, -3, -1,-16, -7, -8,-17, -3,-16,-11, 2, -9, -4, -4, 2, 0,-14,-26,-12, -3; /M: SY='Y'; M=-16,-20,-25,-23,-19, 31,-26, 2, -2,-16, 3, 0,-16,-25,-17,-12,-16, -7, -6, 9, 40,-19; /M: M= -5, -7,-23, -7, -2,-14,-18,-10, -9, -5,-10, -6, -6, -5, -3, -6, -2, -1, -7,-25, -9, -3; /M: SY='Y'; M= -9,-13,-25,-13, -6, 2,-23, -3, -3,-12, -3, -3,-12,-14, -9,-12,-10, -8, -4,-13, 7, -9; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='G'; M= -5, -2,-27, -4,-10,-25, 35,-10,-31, -7,-26,-16, 5,-16,-10, -6, -1,-14,-25,-20,-21,-11; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='D'; M= -3, 10,-21, 12, 10,-24,-12, 0,-23, -2,-20,-15, 5,-10, 5, -6, 10, 6,-17,-31,-13, 7; /M: SY='T'; M= -5, -6,-20, -9, -2,-14,-19, -9, -9, 0, -9, -4, -3,-15, 0, 1, 1, 6, -5,-25, -8, -2; /M: SY='V'; M= -3,-27, 0,-32,-27, 0,-31,-28, 22,-25, 13, 9,-25,-28,-25,-24,-14, -5, 27,-27, -8,-27; /M: SY='R'; M= -7, 1,-21, 0, 4,-17,-17, 1,-17, 1,-16,-10, 3,-14, 3, 6, 4, 5,-13,-28, -9, 2; /M: SY='Y'; M=-16,-24,-23,-27,-24, 37,-30, 0, 5,-18, 5, 2,-20,-29,-21,-15,-18, -8, 0, 12, 48,-24; /M: SY='S'; M= -3, -3,-20, -4, 3,-18,-15, -6,-15, 0,-16, -9, 0,-13, 4, 1, 8, 6,-10,-27,-10, 3; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='E'; M= -9, 6,-26, 6, 8,-22,-15, 0,-22, 7,-18,-12, 7,-10, 6, 8, -2, -6,-20,-26,-11, 6; /M: SY='E'; M= -7, 2,-29, 6, 14,-28,-12, -5,-24, 1,-24,-16, 0, 14, 5, -5, 1, -5,-24,-28,-19, 8; /M: SY='G'; M= -3, -7,-29, -6,-14,-24, 45,-15,-34,-14,-27,-18, 1,-15,-15,-15, -1,-16,-27,-20,-22,-14; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='Y'; M=-18,-23,-26,-26,-22, 42,-27, 5, -1,-17, 3, 0,-18,-29,-19,-13,-18,-10, -7, 18, 52,-22; /M: SY='R'; M= -8, -9,-24, -9, 0,-13,-20, -3,-11, 4,-10, -3, -8,-15, 3, 7, -6, -4, -8,-18, -2, 0; /M: SY='L'; M= -7,-23,-21,-26,-17, 0,-25,-17, 13,-19, 25, 15,-21,-21,-13,-14,-18, -6, 8,-21, -4,-16; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='Q'; M= -6, -6,-22, -8, -2,-15,-19, -4, -8, -1, -9, -3, -4,-13, 1, 1, -3, -2, -6,-24, -7, -2; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='G'; M= -2, -5,-27, -4, -9,-26, 40,-13,-32,-13,-25,-17, 0,-11,-12,-13, 0,-13,-25,-21,-24,-11; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='S'; M= -1, 0,-22, 2, 4,-21,-10, -7,-17, -5,-20,-13, 1, 3, 0, -8, 8, 1,-15,-30,-16, 1; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='S'; M= 0, 0,-23, -2, 0,-18, -4, -8,-19, -3,-19,-12, 2, -7, -2, -5, 3, -3,-16,-23,-14, -1; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='T'; M= -3, -6,-19, -9, -4,-11,-19, -9, -6, -6, -9, -6, -4,-15, -3, -6, 3, 7, -3,-23, -5, -4; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='I'; M= -3,-19,-21,-24,-17, -1,-24,-15, 12,-15, 8, 7,-15,-20,-11,-12, -9, -2, 9,-17, 2,-16; /M: SY='T'; M= -6, -8,-20,-11, -4,-12,-22, -9, -7, -3, -7, -3, -7,-16, 0, -1, 0, 10, -3,-22, -5, -3; /M: SY='C'; M=-10,-21,112,-30,-29,-18,-30,-29,-27,-30,-16,-18,-21,-39,-29,-29,-11,-10, -9,-48,-28,-29; /M: SY='Q'; M= -7, -5,-22, -8, -4,-15,-17, -8, -6, -6, -4, -1, -3,-16, 2, -4, -3, 1, -7,-24, -8, -2; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='S'; M= 0, 0,-17, 1, 3,-16, -6, -8,-13, -2,-13, -9, 0, -2, -1, -5, 4, -1,-11,-21,-13, 1; D=-13; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='N'; M= -8, 17,-23, 16, 9,-24, -6, 4,-24, -1,-23,-16, 19,-13, 3, -4, 6, -1,-23,-33,-15, 5; /M: SY='G'; M= -2, -5,-26, -6,-11,-24, 32,-14,-28,-11,-23,-15, 1,-16,-12,-13, 1,-11,-21,-24,-22,-12; /M: SY='Q'; M= -5, -4,-23, -6, -1,-21, -9, -5,-15, 0,-16, -7, -1,-13, 5, 1, 2, 1,-12,-25,-12, 1; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 0,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 0,-20; /I: I=-10,-10,-100,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10; MD=-21; /M: SY='S'; M= -1, 3,-56, 0, -2,-15,-11, -8,-15, -7,-19,-13, 7,-12, -3, -7, 17, 15, -9,-32,-13, -3; D=-10; /I: I=-10,-10,-100,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10; MD=-21; /M: SY='P'; M= -2, 0,-58, -2, -3,-15, 2, -8,-15, -5,-17,-11, 4, 5, -5, -6, 2, -2,-14,-20,-14, -5; D=-10; /I: I=-10,-10,-100,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='P'; M= -2, -5,-55, -5, 2,-21,-13, -9,-18, 1,-19,-11, -4, 6, -1, -3, 1, -1,-15,-25,-15, 0; /M: M= -7,-14,-55,-14, -3,-11,-23,-15, -2, -7, 0, -1,-13, -2, -7, -9,-10, -4, -4,-23,-11, -6; /M: SY='P'; M= -7,-16,-52,-10, -2,-25,-19,-17,-15, -9,-21,-14,-15, 53, -9,-15, -8, -7,-20,-29,-24, -9; /M: SY='T'; M= -5, -8,-52,-10, 0,-13,-20,-10,-10, 1,-10, -5, -6,-14, 0, 1, -1, 2, -5,-23, -9, -1; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='E'; M= -9, -4,-56, -4, 11,-20,-22, -6,-12, 9,-13, -6, -4,-13, 7, 8, -5, -6,-10,-24,-10, 8; /M: SY='K'; M= 3, -5,-53, -5, 2,-20,-13,-12,-15, 4,-15, -9, -6, -6, -1, -1, -1, -5,-10,-25,-14, 0; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 1'057 in 247 different sequences |
| Number of true positive hits | 1'057 in 247 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 9 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 99.16 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes, Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 35 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | N_Hulo |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Sushi |
| Version [info] | 4 |
Cross-references [info]