PROSITE entry PS50925
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | BLUF |
| Accession [info] | PS50925 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-SEP-2003 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50925 |
| Associated ProRule [info] | PRU00030 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | BLUF domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=92; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=87; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9650857; R2=0.0161330; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6820.2373047; R2=4.9316545; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=468; H_SCORE=9128; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=282; H_SCORE=8211; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-30,-21, 10,-30,-17, 20,-28, 43, 21,-28,-29,-18,-19,-28,-10, 10,-17, 5,-20; /M: SY='V'; M=-11,-21,-22,-25,-20, 10,-29,-15, 8, -9, 2, 3,-16,-23,-17, -3,-11, -1, 11,-12, 10,-20; /M: SY='R'; M=-11, -6,-12, -9, -2,-15,-19, 4,-23, 4,-18,-10, 0,-18, 3, 20, 1, 3,-16,-26, -8, -2; /M: SY='L'; M=-10,-29, -7,-31,-23, 5,-31,-23, 20,-30, 37, 16,-28,-30,-21,-22,-26,-10, 13,-23, -3,-23; /M: SY='I'; M= -3,-22,-14,-28,-23, -4,-21,-23, 17,-23, 14, 11,-18,-22,-18,-22,-12, -2, 14,-24, -7,-22; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='V'; M= -4,-20,-18,-22,-17, -6,-24,-17, 8, -8, 1, 2,-15,-23,-13, 1, -6, 0, 16,-24, -5,-17; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='R'; M= -7, -2,-26, -2, 3,-24,-18, 1,-19, 11,-16, -7, 0,-14, 13, 15, -3, -4,-16,-24, -9, 7; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='A'; M= 10,-12,-19,-14, -6,-18, -4,-17, -7, -7,-11, -6,-10, -9, -7,-12, 0, -5, 0,-23,-16, -7; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='P'; M= -3, -8,-16,-12, -7,-20,-15, -9,-13, -5,-16, -9, -4, 1, -4, -4, -3, -2,-11,-27,-15, -8; /M: SY='P'; M= -8, -7,-28, -4, 0,-16,-20, 2,-13, -7,-10, -7, -7, 3, -2, -4, -9,-10,-15,-25, -9, -3; /M: SY='D'; M= -5, 12,-26, 14, 6,-25, -9, 0,-22, -2,-20,-15, 9, -4, -2, -7, -2, -8,-20,-31,-16, 1; /M: SY='L'; M=-12,-12,-12,-15,-10, -3,-24,-11, 0,-11, 8, 7,-10,-23,-10, -3,-15, -9, -1,-25, -7,-11; /M: SY='S'; M= -1, -2,-22, -5, -1,-19,-16,-13,-10, -4,-15,-10, 0, -1, -2, -8, 6, 6, -9,-29,-15, -3; /M: SY='A'; M= 3, -9,-24, -9, -2,-14,-16,-13,-15, 3,-14,-10, -9, 0, -6, -2, -4, -6,-10,-20, -9, -5; /M: SY='E'; M= -3, 4,-23, 4, 8,-22,-11, 0,-20, 1,-16,-12, 3,-14, 2, 1, 0, -4,-16,-28,-14, 4; /M: SY='D'; M=-14, 27,-28, 41, 20,-29,-10, -1,-31, -1,-24,-23, 9,-11, 1, -9, 1, -8,-24,-31,-13, 10; /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23, 7,-33,-23, 29,-30, 41, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 16,-20, 0,-23; /M: SY='A'; M= 6, -8,-22,-10, -4,-16,-14,-15, -1,-10, -1, 1,-10,-15, -5,-14, -6, -7, 0,-24,-12, -5; /M: SY='D'; M= 6, 12,-21, 13, 8,-28, 2, -7,-25, -5,-24,-19, 9,-11, 2,-10, 12, -2,-19,-31,-20, 5; /M: SY='I'; M=-10,-29,-27,-37,-27, 1,-36,-25, 42,-27, 23, 25,-21,-21,-17,-26,-21,-10, 25,-20, 0,-26; /M: SY='L'; M= -4,-26,-19,-28,-19, 2,-27,-19, 19,-23, 31, 17,-25,-26,-15,-18,-21, -8, 15,-22, -4,-17; /M: SY='E'; M= -3, -3,-23, -3, 8,-16,-18, 4,-19, 1,-11, -8, -3,-13, 3, 3, -2, -2,-15,-24, -7, 5; /M: SY='T'; M= 4, -8,-18,-12, -4,-17,-17,-15, -8, 0,-12, -7, -6,-14, -2, 1, 6, 9, 0,-26,-13, -4; /M: SY='A'; M= 31, -7,-10,-13, -7,-19, -2,-17,-11,-11,-17,-13, -3,-11, -7,-16, 21, 8, -1,-29,-19, -7; /M: SY='R'; M=-12, -7,-24,-10, -2,-12,-20, -6,-16, 7,-12, -7, 0,-17, 4, 25, -2, 1,-12,-22, -8, -1; /M: SY='A'; M= 5,-10,-21,-12, 0,-13,-11,-14,-12, -2, -8, -7, -8,-15, -5, 0, -1, -3, -6,-22,-13, -4; /M: SY='R'; M=-16, -1,-25, -8, -5, 0,-18, 7,-18, 4,-13, -7, 9,-21, -2, 16, -8, -9,-18,-20, -1, -4; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='E'; M= -3, -6,-26, -3, 5,-21,-12,-10,-16, -3, -9, -8, -8, -1, 2, -5, -5, -8,-16,-26,-16, 3; /M: SY='R'; M= -2, -8,-25, -9, -2,-23, -9, -9,-19, 4,-20,-10, -2, -4, 6, 11, 4, -2,-15,-25,-16, 0; /M: SY='A'; M= 3, -8,-20,-13, -9,-11,-16, 0, -5,-10, 0, -1, -3,-19, -6, -7, -4, -5, -6,-26, -7, -9; /M: SY='G'; M= -6, 11,-27, 8, -5,-30, 29, -7,-32, -5,-29,-18, 17,-17, -3, -8, 2,-12,-29,-27,-23, -4; /M: SY='I'; M= -8,-30,-25,-37,-29, 1,-37,-29, 43,-28, 21, 18,-23,-23,-22,-27,-19, -8, 32,-22, -2,-29; /M: SY='T'; M= 1, 0,-11, -8, -7,-13,-17,-18,-13, -6,-14,-11, 1,-10, -7, -7, 21, 42, -3,-31,-11, -7; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='I'; M= 0,-23,-19,-29,-22, 4,-24,-18, 19,-20, 12, 16,-19,-22,-16,-19,-11, -5, 17,-18, 1,-20; /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20, 9,-29,-18, 20,-28, 48, 23,-29,-29,-18,-19,-29,-10, 10,-20, 0,-19; /M: SY='L'; M= -3,-26, -8,-30,-23, 10,-27,-20, 13,-25, 23, 9,-24,-27,-22,-21,-19, -8, 11,-17, 3,-23; /M: SY='Y'; M=-19,-20,-27,-23,-20, 34,-29, 18, -2,-15, 0, 0,-17,-29,-15,-12,-18,-11, -7, 17, 59,-20; /M: SY='N'; M= -2, 6,-20, -1, -7,-15, 0, 1,-16, -6,-19,-12, 16,-19, -5, -7, 7, -1,-15,-28, -9, -7; /M: SY='N'; M= -5, 15,-23, 12, 1,-26, 7, -3,-27, 1,-29,-19, 22,-15, 1, -1, 11, -2,-24,-33,-20, 1; /M: SY='G'; M= -5,-10,-27, -9,-12,-23, 21,-17,-23,-14,-16,-12, -6, -7,-11,-12, -3, -8,-18,-24,-21,-12; /M: SY='F'; M= -6,-13, -9,-18,-12, 5,-21, 1, -6,-16, -2, 0, -9,-23,-10,-13, -8, -7, -4,-19, 4,-11; /M: SY='F'; M=-19,-30,-21,-40,-30, 70,-31,-21, 6,-30, 11, 3,-20,-29,-37,-21,-20,-10, 4, 6, 26,-30; /M: SY='F'; M= -3,-27,-17,-32,-24, 28,-25,-21, 10,-24, 18, 9,-23,-27,-26,-20,-16, -7, 13,-11, 6,-23; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='V'; M= -5,-25, -9,-29,-25, 7,-28,-23, 13,-22, 10, 5,-23,-26,-23,-20,-13, 0, 18,-13, 1,-24; /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23, 7,-33,-23, 30,-30, 40, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 17,-20, 0,-23; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='P'; M= -9, 1,-28, 7, 18,-26,-17, -9,-25, 1,-24,-19, -3, 20, 3, -2, 3, 1,-23,-31,-21, 8; /M: SY='E'; M= -9, 1,-15, 4, 17,-26,-18, -7,-28, 12,-23,-16, -1, -7, 6, 16, -1, -7,-21,-29,-18, 10; /M: SY='E'; M= 0, -1,-25, 1, 19,-26, -9, -7,-23, 6,-19,-14, -2, -4, 9, 1, 4, -5,-20,-27,-18, 13; /M: SY='A'; M= 12, -1,-19, -3, -4,-22,-11,-13,-13, 0,-16,-11, -3, -9, -5, -5, 2, -3, -5,-27,-17, -5; /M: SY='V'; M= -4,-29, -8,-32,-28, 1,-32,-28, 28,-24, 17, 12,-27,-29,-26,-23,-16, -4, 35,-27, -7,-28; /M: SY='D'; M= -6, 8,-25, 13, 13,-24, -8, -3,-23, -1,-21,-15, 4,-12, 7, -3, 4, -5,-19,-27,-12, 10; /M: SY='E'; M= -5, 6,-25, 11, 21,-21,-11, -6,-26, 5,-22,-17, 2, -9, 7, 0, 4, -5,-21,-27,-15, 14; /M: SY='L'; M= -7,-25,-17,-28,-21, 4,-29,-21, 19,-24, 31, 16,-24,-26,-19,-19,-18, 0, 16,-23, -3,-20; /M: SY='F'; M=-20,-25,-24,-31,-25, 54,-30, -1, 1,-20, 6, 3,-20,-30,-25,-15,-20,-10, -4, 17, 51,-25; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='E'; M= -5, 5,-24, 2, 14,-22,-15, 2,-18, 3,-14, -9, 8,-12, 13, 3, 1, -3,-20,-28,-13, 13; /M: SY='R'; M=-11, -1,-25, -4, 2,-19,-18, 5,-19, 14,-17, -8, 5,-16, 4, 19, -3, -3,-16,-26, -8, 1; /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30, 0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-30; /M: SY='Q'; M= -5,-11, -6,-15, -9,-15, -9,-12,-12,-10,-11, -3, -6,-19, 1, -7, 1, -2, -9,-26,-13, -4; /M: SY='Q'; M= -3, 1,-25, -1, 6,-27,-15, -1,-21, 12,-18, -8, 4,-14, 20, 16, 0, -6,-20,-24,-13, 12; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='P'; M= -8, -1,-29, 3, 11,-28,-15, -3,-24, 4,-27,-17, 0, 20, 6, -1, 3, -4,-24,-31,-19, 6; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='R'; M= -9, -4,-25, -4, 7,-20,-14, 4,-20, 5,-18, -9, 0,-14, 10, 11, 2, -1,-17,-23, -5, 7; /M: SY='D'; M= -9, 24,-25, 27, 8,-29, 1, 2,-31, -1,-27,-21, 21,-14, -1, -3, 5, -6,-26,-34,-19, 3; /M: SY='V'; M= -4,-26, 17,-30,-26, -5,-29,-27, 12,-25, 9, 4,-25,-26,-25,-24,-14, -6, 20,-31,-13,-26; /M: SY='E'; M= -7,-12,-23,-11, 6,-16,-26,-14, 3, -2, -3, 0,-13,-16, 2, -7, -8, -7, 5,-26,-11, 3; /M: SY='V'; M= 1,-17,-20,-20,-10,-10,-25,-21, 11, -8, 3, 3,-16,-18,-12,-12, -9, -3, 15,-24, -9,-12; /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-33,-24, 15,-32,-23, 25,-29, 37, 17,-27,-28,-23,-22,-26, -9, 16,-17, 3,-24; /M: SY='F'; M= 1,-11,-20,-13, -7, 7,-17, -4, -8,-14, -2, -2,-10,-19,-11,-14, -4, -5, -7,-13, 7, -9; /M: SY='C'; M= -6, -1, 1, -3, -3,-10,-19, -9,-17, -9,-10, -8, -3,-20, -6, -9, -5, -5,-13,-26, -9, -5; /M: SY='E'; M= 0, 2,-25, 5, 10,-24, 1, -8,-26, 3,-21,-14, 0,-11, 1, -2, 2, -7,-20,-24,-14, 5; /M: SY='P'; M= -5, -2,-30, 3, 8,-22,-17, -8,-20, -5,-22,-17, -6, 28, -3,-13, -4, -5,-23,-24,-12, 0; /M: SY='I'; M= -1,-21,-12,-27,-22, -6,-29,-25, 23,-24, 11, 8,-18,-22,-19,-24,-12, -6, 18,-25, -8,-23; /M: SY='D'; M= -1, 6,-23, 7, 7,-21,-15, -9,-20, -3,-19,-16, 1, 5, -3, -8, 4, 7,-17,-27,-14, 1; /M: SY='E'; M= -1, -4,-23, -3, 9,-20,-10, 3,-21, 2,-18,-11, -2,-13, 5, 3, 3, -3,-16,-24, -8, 5; /M: SY='R'; M=-19,-11,-29,-11, -1,-18,-21, -1,-27, 26,-15, -8, -2,-21, 8, 64,-11,-10,-18,-20, -9, -1; /M: SY='R'; M= -2, -9,-21,-11, -4,-13,-17,-10, -8, -1, 0, 0, -7,-18, -4, 7, -7, -5, -5,-25,-11, -5; /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-37,-29, 73,-30,-15, 0,-27, 9, 0,-20,-30,-36,-19,-20,-10, -1, 13, 37,-29; /M: SY='G'; M= 3, -3,-25, -1, -2,-27, 9, -8,-25,-10,-25,-16, -1, 4, -3,-13, 7, -4,-21,-28,-21, -3; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='N'; M= -8, 7,-28, 7, 4,-28, 8, -9,-25, 0,-24,-16, 9, -8, -2, -6, -2,-11,-23,-28,-20, 1; /M: SY='W'; M=-17,-37,-44,-37,-28, 8,-21,-29,-14,-20,-13,-15,-37,-29,-20,-19,-34,-23,-21,119, 24,-20; /M: SY='S'; M= 1, 2,-20, 3, 4,-25, 1, 4,-26, -3,-27,-16, 7,-12, 4, -5, 17, 2,-19,-32,-15, 3; /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20, 0,-20, 0, 20,-10, 20, 60,-20,-20, 0,-10,-20,-10, 10,-20, 0,-10; /M: SY='G'; M= 6, -5,-24, -8, -1,-26, 8,-12,-26, 6,-22,-12, -2,-13, 1, 4, 0, -7,-18,-21,-18, 0; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 23 in 12 different sequences |
| Number of true positive hits | 23 in 12 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 2 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | BLUF |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
12 sequences
BLUF_ECOLI (P75990), PAL1F_EUGGR (P84738), PALFB_EUGGR (P84737), PALST_EUGGR (P84739), PBL1F_EUGGR (P84742), PBL9F_EUGGR (P84740), PBLFB_EUGGR (P84741), PBLST_EUGGR (P84743), PCYAA_EUGGR (Q8S9F2), PCYAA_EUGLO (Q76L34), PCYAB_EUGGR (Q8S9F1), PCYAB_EUGLO (Q76L33)» more
|