PROSITE entry PS50927
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | BULB_LECTIN |
| Accession [info] | PS50927 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-SEP-2003 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50927 |
| Associated ProRule [info] | PRU00038 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Bulb-type lectin domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=115; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=110; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.0290728; R2=0.0127875; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6581.7900391; R2=4.7899160; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=389; H_SCORE=8445; N_SCORE=8.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=272; H_SCORE=7885; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='T'; M= -2, -4,-18, -7, -4,-11,-17,-11,-11, -7,-10, -8, -3,-11, -5, -6, 4, 8, -7,-25, -8, -5; /M: SY='B'; M= -6, 15,-22, 14, 1,-19, -8, -3,-18, -6,-16,-14, 14,-14, -4, -7, 3, -2,-17,-31,-13, -2; /M: SY='T'; M= -1, -9,-17,-13,-10,-11,-18,-13, -1,-13, -6, -3, -6,-11, -9,-12, 5, 10, 2,-28, -9,-11; /M: SY='L'; M= 1,-20,-18,-23,-16, -1,-22,-19, 10,-20, 15, 6,-17,-20,-15,-17, -9, -3, 8,-23, -7,-16; /M: SY='T'; M= -4, -9,-18,-14,-10, -2,-16,-12, -7,-12, -5, -5, -5,-15,-10, -9, 3, 10, -4,-21, -4,-10; /M: SY='S'; M= -1, -4,-22, -4, 4,-20,-10, -7,-17, -5,-20,-13, 0, 1, 3, -7, 7, 1,-17,-25,-13, 2; /M: SY='G'; M= -1, -3,-24, -5, -6,-22, 15,-12,-23, -9,-23,-15, 3,-11, -6, -9, 7, -3,-18,-25,-19, -6; /M: SY='Q'; M= -7, 1,-23, 1, 8,-21,-13, 1,-17, -2,-13, -8, 3,-13, 11, -2, 0, -5,-18,-25,-11, 9; /M: SY='T'; M= -2, -6,-18,-10, -7,-14,-15,-14, -9, -8,-13, -9, -4, -4, -7, -9, 8, 17, -4,-28,-12, -8; /M: SY='L'; M= -9,-28,-22,-30,-21, 7,-29,-21, 22,-27, 34, 16,-26,-26,-20,-21,-24, -9, 13,-17, 0,-21; /M: SY='S'; M= -2, -5,-18, -7, -6,-13, -8, -4,-16, -5,-19,-11, 2,-14, -4, -1, 11, 6,-10,-25, -7, -6; /M: SY='S'; M= 4, -2,-21, -3, -5,-20, 0,-13,-18, -9,-19,-14, 0, -7, -6,-10, 8, 2,-13,-25,-17, -6; /M: SY='G'; M= -3, 6,-24, 3, -5,-23, 21, -8,-27, -8,-25,-18, 13,-16, -8,-10, 6, -4,-22,-28,-20, -6; /M: SY='E'; M= -8, 4,-28, 6, 13,-27,-10, -2,-24, 5,-22,-13, 3, -9, 13, 5, 0, -8,-23,-21,-14, 12; /M: SY='T'; M= -2, -4,-16, -8, -5,-10,-12,-11,-12, -7,-14, -9, 0,-14, -5, -5, 12, 16, -6,-28,-10, -6; /M: SY='L'; M= -8,-26,-21,-28,-19, 8,-28,-17, 15,-23, 31, 13,-23,-27,-18,-16,-22, -8, 9,-18, 2,-19; /M: SY='T'; M= -2,-11,-18,-13, -9, -9,-19,-16, -1, -9, -6, -4, -9,-14,-11,-10, 1, 6, 6,-26, -9,-11; /M: SY='S'; M= 2, -7,-15, -8, -6,-10,-13,-13, -6,-12,-11, -9, -1,-15, -7,-12, 12, 7, -1,-29,-11, -7; /M: SY='G'; M= 1, -6,-25, -4, -1,-25, 7,-13,-23, -7,-23,-16, -2, 6, -5,-10, 5, -5,-20,-28,-22, -4; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='G'; M= -4, 3,-18, 1, -5,-12, 8, -6,-18, -8,-17,-12, 7,-11, -8, -8, 3, -4,-15,-21,-12, -6; D=-9; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='G'; M= -3, 1,-14, 0, -3,-10, 6, -3,-14, -5,-13, -9, 4, -6, -3, -5, 2, -4,-12,-14, -8, -3; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='N'; M= -1, 0,-20, -4, -1,-12, -7,-11,-15, -7,-16,-12, 3,-12, -5, -8, 3, -1,-12,-26,-13, -3; /M: SY='F'; M=-11,-18,-22,-22,-16, 24,-22, -6, -4,-14, 4, 0,-13,-25,-17, -9,-14, -8, -6, -2, 20,-17; /M: SY='T'; M= -4, -3,-20, -6, -2,-17, -5,-11,-18, -2,-17,-12, -1,-12, -5, -2, 3, 4,-12,-26,-14, -4; /M: SY='F'; M=-11,-26,-19,-30,-22, 31,-27,-19, 7,-25, 22, 7,-22,-24,-25,-18,-19, -6, 4,-10, 9,-22; /M: SY='F'; M= -7,-16,-22,-20,-16, 4,-12,-18, 0,-17, -2, -2,-11,-18,-18,-15, -7, -3, 1,-18, -4,-17; /M: SY='F'; M= -8,-13,-19,-19,-14, 8,-17,-11, -1,-13, 0, 7, -8,-19,-11,-10, -6, -3, -1,-19, -1,-12; /M: SY='Q'; M= -6,-10,-24,-11, -2,-10,-12,-10,-15, -8,-13, -8, -6, -1, 3, -7, 1, -1,-15,-21, -9, 0; /M: SY='S'; M= -1, 4,-21, 2, 2,-23, 0, -8,-23, -4,-24,-17, 7, -7, -2, -6, 9, 3,-19,-28,-17, -1; /M: SY='D'; M=-12, 24,-26, 32, 9,-31,-11, -4,-29, -1,-27,-22, 14, 4, -1, -7, 3, -3,-25,-35,-20, 3; /M: SY='C'; M= -2,-10, 10,-13,-14,-20, 3,-17,-23,-14,-21,-15, -4,-19,-14,-14, 2, -5,-13,-28,-21,-14; /M: SY='N'; M= -6, 10,-20, 2, -4,-10, -7, -3,-17, -6,-20,-14, 19,-18, -4, -5, 7, 4,-18,-23, -8, -4; /M: SY='L'; M=-10,-18,-21,-19,-10, 8,-24,-10, 1,-15, 14, 4,-16,-22,-11, -8,-13, -4, -2,-17, 4,-11; /M: SY='V'; M= -2,-18,-19,-19,-15, -6,-16,-18, 2,-14, -2, -2,-15,-20,-14,-11, -3, 1, 9,-16, -7,-15; /I: I=-9; MD=-19; /M: SY='Y'; M= -4, -6, -7, -8, -8, -3, 0, -2, -8, -7, -6, -5, -2,-12, -7, -5, -3, -5, -7, -7, 1, -8; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='L'; M=-11,-28,-23,-33,-24, 15,-32,-22, 23,-26, 26, 14,-23,-26,-21,-19,-23,-10, 14,-13, 4,-24; /M: SY='W'; M=-13,-25,-32,-27,-21, 18,-23, -7, -8,-14, -7, -7,-23,-27,-14,-13,-21,-13,-14, 54, 38,-18; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='Y'; M=-12, 1,-27, 2, 2, -9,-18, 0,-17, 3,-15,-11, 0,-11, -1, 1, -6, -5,-17,-16, 5, -1; /M: SY='N'; M= -1, -5,-21,-10,-11,-14, -2,-10,-11, -7,-12, -7, 1,-17, -9, -8, 1, 1, -8,-23,-11,-10; /I: I=-4; MD=-9; /M: SY='G'; M= 0, 8,-20, 5, -4,-23, 14, -8,-24, -7,-26,-18, 14,-14, -5, -9, 14, 1,-19,-31,-20, -5; D=-4; /I: I=-4; MD=-9; /M: M= -6, -6,-20, -7, -5,-12,-13,-12, -2, -7, -7, -4, -4, -9, -5, -8, -3, -2, -3,-16, -7, -6; D=-4; /I: I=-4; MD=-9; /M: M= -6, -5,-16, -5, -2, -9,-10, -8,-10, -1,-11, -7, -3, -3, -3, 0, -2, -3, -9, -9, -6, -4; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9; /M: SY='T'; M= 0, -3,-13, -8, -5,-12,-16,-13, -9, -4,-10, -8, -1,-11, -5, -1, 9, 22, -2,-24, -9, -6; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='V'; M= -5,-21,-20,-22,-18, 0,-25,-13, 9,-13, 0, 1,-20,-10,-15,-14,-11, -4, 11,-10, 8,-19; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='V'; M= -1,-26,-13,-28,-26, 0,-28,-26, 26,-19, 10, 9,-25,-26,-24,-18,-11, -1, 37,-25, -6,-26; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='W'; M=-20,-40,-49,-40,-30, 12,-20,-30,-20,-20,-19,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-29,147, 30,-20; /M: SY='V'; M= 6,-15,-15,-17,-13,-12,-20,-18, 6,-11, -4, 0,-14,-20,-10,-13, 1, 2, 17,-28,-12,-12; /M: SY='A'; M= 32, -7,-11,-14, -8,-19, -3,-17,-12,-10,-15,-12, -4, -8, -8,-17, 16, 9, -3,-26,-19, -8; /M: SY='N'; M= -8, 30,-22, 16, -2,-22, 6, 4,-22, -3,-29,-19, 46,-19, -2, -3, 8, -3,-28,-35,-20, -2; /M: SY='R'; M=-10, -6,-24, -8, -1,-18,-17, -6,-23, 12,-18,-11, 0,-10, 2, 31, 1, 7,-15,-25,-12, -2; /M: SY='D'; M= -6, 19,-24, 23, 9,-26, -3, -2,-27, -3,-23,-19, 11,-13, 0, -8, 2, -6,-22,-30,-15, 4; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='N'; M= -1, 10,-21, 3, -2,-21, 4, -4,-22, -3,-24,-16, 19,-15, -2, -3, 9, 0,-19,-31,-18, -3; /M: SY='P'; M= -9,-14,-34,-10, -1,-24,-19,-15,-17, -3,-22,-14,-12, 48, -6, -8, -8, -7,-23,-26,-22, -7; /I: I=-10; MD=-21; /M: SY='I'; M= -3,-16,-10,-17,-14, 3,-17,-14, 15,-14, 13, 8,-15,-15,-13,-12,-10, -3, 15,-12, -2,-14; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='G'; M= 0, 0,-23, 0, -9,-22, 21,-10,-25,-14,-20,-15, 5,-16,-10,-14, 5, -6,-19,-27,-20,-10; /I: I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='S'; M= -1, 3,-17, 0, 0,-17, -8, -3,-17, -2,-20,-13, 8, -9, 0, -1, 11, 5,-13,-28,-13, -1; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='S'; M= 1, 2,-19, -1, -4,-18, 5, -8,-20, -8,-22,-15, 8,-12, -6, -9, 11, 2,-15,-28,-16, -5; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='C'; M= 7,-11, 17,-17,-15,-18, -7,-20,-15,-18,-16,-13, -7,-17,-15,-20, 6, 1, -6,-33,-21,-16; /M: M= -6, -9,-22,-13,-11, -9, -9, -7, -9, -7,-10, -4, -4,-19, -8, -3, -2, 0, -5,-21, -4,-11; /M: SY='L'; M= -1,-22,-17,-26,-20, 2,-17,-22, 9,-23, 20, 8,-20,-23,-20,-20,-14, -2, 8,-21, -6,-20; /M: SY='T'; M= -2, -8,-17,-11, -6,-12,-17,-15, -8, -4, -7, -5, -5,-15, -6, -2, 4, 11, -2,-27,-11, -7; /M: SY='L'; M=-10,-24,-23,-28,-19, 8,-28,-18, 16,-17, 23, 17,-21,-24,-16,-14,-21, -9, 10,-17, 1,-18; /M: SY='Q'; M= -4, -3,-23, -5, -1,-21,-10, -8,-12, -3,-15, -7, 1,-14, 6, -5, 5, 2,-11,-27,-12, 2; /M: SY='S'; M= -1, 1,-22, 0, 1,-20,-10, -4,-15, -4,-19,-12, 4, -8, -1, -5, 7, 1,-12,-30,-14, -1; /M: SY='D'; M=-10, 26,-23, 29, 8,-25, -9, 1,-27, -1,-25,-20, 21,-13, -1, -5, 7, 0,-23,-35,-15, 3; /M: SY='G'; M= 2, -9,-27,-10,-19,-28, 59,-18,-35,-18,-27,-16, 0,-19,-18,-19, 1,-17,-26,-21,-28,-18; /M: SY='N'; M= -9, 27,-21, 16, 4,-21, -5, 5,-21, 0,-25,-18, 37,-16, 1, -1, 8, 0,-24,-36,-17, 2; /M: SY='L'; M=-11,-23,-20,-26,-19, 9,-27,-16, 16,-25, 36, 18,-20,-28,-18,-17,-24, -9, 7,-20, 0,-18; /M: SY='V'; M= -2,-24,-13,-25,-20, -4,-27,-22, 16,-17, 8, 6,-23,-25,-19,-14,-11, -3, 26,-25, -8,-20; /M: SY='L'; M= -7,-29,-20,-32,-25, 5,-32,-24, 28,-26, 29, 17,-26,-27,-22,-22,-21, -7, 24,-22, -2,-24; /M: SY='Y'; M= -7,-19,-22,-22,-16, 8,-24, -7, 5,-15, 11, 5,-16,-24,-13,-12,-14, -5, 2,-10, 14,-16; /I: I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11; /M: SY='D'; M=-11, 28,-24, 35, 9,-29, -2, 0,-30, -2,-25,-22, 18,-12, -1, -7, 4, -5,-24,-33,-17, 4; D=-5; /I: I=-5; DM=-11; /M: SY='H'; M= -3, -1,-24, 0, -2,-22, -1, 3,-21, -6,-19,-11, 2,-10, 1, -6, 2, -6,-18,-26,-11, -2; /M: SY='N'; M= -4, 10,-21, 9, 3,-22, -4, -6,-23, 1,-24,-16, 12,-13, 1, 0, 10, 1,-19,-31,-16, 2; /M: SY='G'; M= -6, 11,-25, 6, -6,-24, 22, -3,-29, -8,-26,-18, 19,-17, -8, -7, 3, -8,-26,-29,-20, -7; /M: SY='R'; M= -5, 1,-23, -2, 0,-21,-11, -4,-21, 10,-21,-11, 6,-13, 2, 11, 4, 3,-15,-27,-12, 0; /M: SY='T'; M= 4,-14,-16,-16,-12, -9,-17,-19, -1,-14, -7, -6,-11, -4,-14,-15, 6, 10, 6,-28,-13,-13; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='V'; M= -3,-27,-17,-30,-26, 1,-28,-25, 26,-21, 16, 11,-24,-27,-24,-20,-14, -4, 31,-25, -6,-26; /M: SY='W'; M=-20,-39,-48,-40,-30, 12,-21,-29,-18,-20,-18,-19,-39,-30,-21,-20,-39,-28,-28,141, 30,-20; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='S'; M= 7, -1,-14, -3, 1,-22, -6, -7,-19, -4,-24,-15, 5,-11, 4, -3, 22, 10,-12,-32,-17, 2; /M: SY='T'; M= 6, -1,-11, -6, -6,-15, -9,-15,-14,-11,-19,-14, 4,-10, -6,-11, 27, 31, -5,-34,-15, -6; /M: SY='N'; M= -8, 16,-21, 6, -4,-16, 1, 2,-20, -3,-23,-14, 28,-16, -4, -3, 3, -4,-23,-30,-14, -4; /M: SY='T'; M= 0, -8,-16,-12,-10,-10,-17,-16, -3,-13, -3, -5, -7,-14,-11,-12, 3, 12, 2,-27, -9,-11; /M: SY='S'; M= 2, 2,-17, -3, -5,-18, -6,-11,-14, -7,-18,-12, 7,-11, -4, -8, 14, 14, -9,-30,-15, -5; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='G'; M= -2, -1,-24, -4, -8,-21, 21,-12,-27, -7,-24,-16, 7,-15, -9, -4, 5, -4,-20,-26,-20, -9; /M: SY='N'; M= -2, 3,-22, 1, 2,-21, -8, -5,-18, 0,-19,-12, 6,-12, 2, -2, 5, 0,-14,-28,-14, 1; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='R'; M= -3, -1,-18, -4, 0,-17,-10, -7,-14, 4,-15, -9, 3, -9, 1, 9, 4, 2,-10,-23,-12, -1; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='G'; M= 0, 1,-21, -2, -7,-21, 19,-10,-24, -9,-23,-16, 10,-15, -7, -9, 9, -3,-19,-28,-20, -7; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='N'; M= -5, 1,-24, 0, -4,-20, -7, -6,-16, -6,-19,-12, 5, 0, -6, -7, 1, -2,-14,-30,-16, -6; /M: SY='Y'; M= -4,-16,-16,-19,-16, 1,-23, -9, 2,-12, -3, -2,-15,-18,-13,-12, -4, 3, 6,-13, 11,-16; /M: SY='V'; M= -1,-19,-17,-22,-19, -4,-18,-17, 7,-13, 0, 2,-17,-23,-17,-11, -5, 0, 16,-22, -5,-19; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='A'; M= 19,-16,-11,-22,-15, -7,-10,-18, -1,-15, 5, 1,-15,-18,-13,-18, -4, -3, 3,-20,-11,-14; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='E'; M= -4, -9,-22, -8, 6,-16,-21,-14, -3, -3, -7, -4,-10,-15, -1, -5, -3, -2, 1,-27,-13, 2; /M: SY='L'; M= -9,-29,-21,-31,-21, 9,-31,-21, 23,-29, 41, 19,-27,-28,-20,-21,-26, -9, 13,-20, 0,-21; /M: SY='L'; M= -9,-14,-23,-14, -6,-10,-21, -8, -2,-11, 12, 6,-13,-19, 3, -5,-12, -5, -6,-23, -6, -2; /M: SY='D'; M= -5, 18,-26, 25, 11,-29,-11, -6,-27, 1,-23,-20, 7, -1, 0, -6, 1, -7,-22,-31,-18, 5; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='B'; M= -8, 23,-21, 21, 4,-23, -5, -3,-24, -3,-25,-20, 23,-14, -2, -6, 11, 6,-21,-34,-17, 1; /M: SY='G'; M= -2,-10,-30,-10,-17,-28, 53,-17,-36,-13,-27,-17, -1,-20,-15, -9, -2,-18,-27,-19,-26,-16; /M: SY='N'; M= -9, 30,-21, 15, 0,-20, -3, 7,-19, 0,-26,-17, 46,-18, 0, 0, 7, -1,-26,-37,-18, 0; /M: SY='L'; M= -9,-28,-19,-31,-23, 23,-28,-21, 14,-26, 27, 12,-25,-28,-25,-19,-21, -7, 13,-14, 5,-23; /M: SY='V'; M= -1,-25,-13,-26,-25, -2,-28,-25, 22,-16, 7, 8,-25,-27,-24,-15, -9, 0, 37,-27, -8,-25; /M: SY='I'; M= -8,-26,-21,-30,-23, 3,-30,-21, 27,-24, 27, 20,-24,-25,-18,-20,-20, -7, 20,-22, -2,-22; /M: SY='R'; M=-13,-12,-26,-13, -8, -2,-22, 1,-11, 4, -9, -4, -8,-20, -2, 16,-10, -7,-10, -9, 14, -8; /M: SY='D'; M= -9, 20,-26, 28, 6,-30, 8, -4,-33, -5,-27,-22, 12,-13, -4, -9, 5, -7,-25,-32,-18, 1; /M: SY='S'; M= 0, -2,-23, -1, 0,-21, -5, -9,-21, -6,-23,-16, 1, 6, -3, -9, 9, 2,-17,-28,-17, -2; /M: SY='N'; M= 1, 5,-19, 2, -3,-21, -3, -9,-18, -4,-21,-14, 8,-11, -5, -7, 7, 0,-13,-30,-17, -5; /M: SY='N'; M= -5, 4,-21, -3, -8,-14, -4, -9,-10, -9,-15,-10, 12,-16, -8, -9, 4, 1,-10,-29,-14, -9; /M: SY='W'; M= -8, -4,-28, -7, -6,-11, -7,-11,-20, -5,-19,-14, 1,-17, -6, -5, -6, -7,-21, 10, -5, -5; /M: SY='S'; M= -1, 4,-21, 4, -2,-18, -8,-10,-17, -5,-17,-13, 4,-12, -4, -6, 6, 1,-12,-26,-14, -3; /M: SY='T'; M= 1, -9,-18,-12,-10,-12,-18,-16, -4, -9, -6, -4, -8,-12, -9, -9, 1, 8, 1,-22,-10,-10; /M: SY='W'; M= -6,-11,-27,-12,-12, -8, -6,-15,-13,-14,-13,-11, -8,-17,-11,-14, -7, -9,-13, 8, -3,-11; /M: M= -4,-10,-26,-11, -6,-15, -8,-12,-15, -8,-15,-10, -7,-12, 0, -7, -2, -2,-15, -4, -8, -3; /M: SY='Y'; M= -8,-10,-24,-13, -7, 2,-14, -8,-14,-11,-14,-10, -5,-15, -7,-10, -1, -3,-13, 0, 3, -6; /M: M= -8,-14,-24,-16, -8, 0,-15,-12, -9,-11, -3, -3,-10,-14, -7, -7, -8, -6,-10,-13, -4, -7; /M: SY='W'; M=-10, -9,-27, -9, -8, -2,-12,-13,-19,-10,-16,-14, -8,-14,-10, -9, -6, -7,-17, 12, 0, -8; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 91 in 82 different sequences |
| Number of true positive hits | 91 in 82 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes, Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 2 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Bulb-type lectin |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
82 sequences
ASAL_ALLSA (P83886), B120_ARATH (O81906), CE101_ARATH (Q9LW83), CEA_COLES (R9RL27), COMI_DICDI (Q03380), CURC1_MOLLA (P19667), CURC2_MOLLA (Q6F495), EP1G_DAUCA (Q39688), EP1L1_ARATH (Q9ZVA1), EP1L2_ARATH (Q9ZVA2), EP1L3_ARATH (Q9ZVA4), EP1L4_ARATH (Q9ZVA5), KPRO_MAIZE (P17801), LEC1_COLES (Q39487), LEC1_CROVR (Q9FVA1), LEC1_REMVI (B5LYJ9), LEC2_COLES (A5HMM7), LEC2_CROVR (Q9FV99), LEC3_CROVR (P86626), LEC_ALLCE (C0HJM8), LEC_ALOAR (P49329), LEC_DENFN (B2KNH9), LEC_GALNI (P30617), LEC_NARPS (C0HM45), LEC_NARTA (C0HLU1), LEC_SCOPL (P0DQV9), LERK1_ORYSI (A0A075F7E9), LERK1_ORYSJ (Q7FAZ3), LERK2_ORYSI (A2XQD3), LERK2_ORYSJ (Q7FAZ2), LERK3_ORYSI (Q25AG3), LERK3_ORYSJ (Q0JEU6), LERK4_ORYSI (Q25AG2), LERK4_ORYSJ (Q7FAZ0), PSRK_ARATH (P0DH87), RKS1_ARATH (Q9ZT07), RLK1_ARATH (Q39202), SD113_ARATH (Q9LPZ9), SD11_ARATH (O81833), SD129_ARATH (O64782), SD16_ARATH (Q9S972), SD17_ARATH (Q39086), SD18_ARATH (O81905), SD22_ARATH (Q39203), SD25_ARATH (Q8RWZ5), SD31_ARATH (P93756), SLSG0_BRAOA (P22551), SLSG1_BRAOA (P22552), SLSG2_BRAOA (P22553), SLSG3_BRAOL (P17840), SLSG4_BRAOL (P17841), SLSG6_BRAOL (P07761), SRK6_BRAOV (Q09092), SRK_ARATH (P0DH86), TAR1_COLES (Q43418), Y1112_ARATH (Q9SXB3), Y1130_ARATH (Q9SXB4), Y1133_ARATH (Q9SXB8), Y1135_ARATH (Q9SXB5), Y1136_ARATH (O64784), Y1137_ARATH (O64783), Y1141_ARATH (Q9LPZ3), Y1142_ARATH (O64778), Y1144_ARATH (O64776), Y1146_ARATH (O64774), Y1148_ARATH (O64771), Y1150_ARATH (Q9SYA0), Y1155_ARATH (Q9SY95), Y1343_ARATH (Q9XID3), Y1614_ARATH (O64780), Y1639_ARATH (O64781), Y1643_ARATH (O64777), Y1649_ARATH (O64770), Y1661_ARATH (Q9SY89), Y1675_ARATH (O64793), Y2913_ARATH (O64477), Y4119_ARATH (Q9T058), Y4230_ARATH (Q9ZR08), Y4729_ARATH (O81832), Y5248_ARATH (Q9FLV4), Y5537_ARATH (O65238), YL633_MIMIV (Q5UR81)» more
|
| PDB [Detailed view] |
14 PDB
1JPC; 1MSA; 1NIV; 1NPL; 2D04; 2DPF; 3DZW; 3MEZ; 3R0E; 5D5G; 5D9Z; 5J76; 5T1X; 5T20 » more |