 |
|
| Entry: PS50928 |
General information about the entry
| Entry name [info] | ABC_TM1 |
| Accession [info] | PS50928 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-NOV-2003 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 22-FEB-2023 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC00364 |
| Associated ProRule [info] | PRU00441 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | ABC transporter integral membrane type-1 domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=196; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=191; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4184906; R2=0.0217733; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=280; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=188; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='L'; M= -4,-24,-19,-29,-22, 13,-25,-20, 15,-24, 21, 10,-21,-24,-21,-20,-16, -4, 11,-15, 2,-21; /M: M= -7,-19,-27,-21,-14, -5,-13,-16, -7, -9, -4, -3,-16,-12,-11, -6,-14,-10, -7, -2, -4,-13; /M: SY='N'; M= -5, 2,-22, -6, -8,-11,-11, -6, -8, -7,-11, -7, 9,-18, -6, -6, -2, -2, -9,-22, -9, -8; /M: SY='T'; M= 4, 0,-11, -6, -6,-14,-10,-13,-14,-10,-18,-13, 4,-11, -6,-10, 25, 32, -5,-33,-14, -6; /M: SY='L'; M= -6,-27,-19,-31,-23, 11,-28,-22, 20,-26, 28, 14,-25,-26,-22,-21,-20, -6, 16,-18, 0,-22; /M: SY='L'; M= -6,-19,-23,-21,-12, -1,-21,-16, 4,-13, 6, 3,-16,-20,-11,-11,-12, -5, 3,-12, 0,-12; /M: SY='I'; M= -8,-25,-21,-29,-22, 7,-29,-19, 19,-21, 18, 12,-22,-25,-18,-17,-17, -6, 16,-15, 4,-21; /M: SY='A'; M= 16,-10,-12,-16,-13,-13, -3,-19, -7,-14,-10, -7, -7,-15,-12,-16, 10, 9, 2,-26,-15,-13; /M: SY='L'; M= 0,-23,-17,-28,-22, 6,-19,-23, 12,-23, 13, 6,-20,-23,-22,-20,-11, -3, 13,-19, -4,-22; /M: SY='I'; M= 0,-21,-18,-26,-20, -1,-15,-22, 9,-21, 8, 4,-18,-20,-18,-20,-10, -4, 9,-19, -6,-20; /M: SY='A'; M= 15,-10,-13,-14,-12,-15, -1,-18,-10,-13,-13,-10, -6,-14,-11,-15, 11, 7, 0,-27,-16,-12; /M: SY='V'; M= 2,-18,-15,-24,-19, 1,-20,-21, 8,-18, 6, 4,-16,-20,-18,-17, -3, 7, 12,-21, -5,-18; /M: SY='I'; M= 0,-24,-18,-28,-21, 3,-22,-23, 15,-22, 14, 7,-21,-18,-21,-21,-12, -4, 15,-21, -6,-22; /M: SY='L'; M= -6,-26,-20,-31,-24, 8,-25,-23, 20,-26, 21, 11,-22,-23,-22,-22,-17, -7, 14,-18, -2,-23; /M: SY='A'; M= 13, -7,-12,-12, -9,-19, 4,-15,-15,-12,-17,-11, -3,-14, -7,-14, 11, 4, -8,-27,-18, -8; /M: SY='L'; M= -3,-22,-16,-27,-21, 4,-24,-21, 14,-22, 15, 9,-19,-23,-20,-19,-11, 0, 14,-19, -3,-21; /M: SY='I'; M= -1,-25,-19,-28,-21, 3,-24,-23, 15,-22, 13, 7,-22,-14,-21,-21,-13, -4, 15,-21, -6,-22; /M: SY='I'; M= -7,-28,-19,-33,-25, 10,-30,-24, 24,-26, 23, 14,-23,-25,-23,-23,-19, -7, 19,-18, 0,-25; /M: SY='G'; M= 12, -9,-20,-11,-15,-25, 38,-18,-28,-16,-24,-17, -2,-15,-15,-18, 7, -8,-18,-23,-25,-15; /M: SY='I'; M= -4,-23,-18,-28,-22, 6,-26,-21, 16,-22, 15, 9,-19,-23,-19,-20,-11, 0, 15,-19, 0,-21; /M: SY='L'; M= -3,-22,-22,-24,-17, -2,-18,-20, 3,-20, 5, 2,-19, 0,-18,-20,-12, -6, 1,-20, -9,-18; /M: SY='L'; M= 2,-22,-17,-27,-20, 3,-20,-21, 12,-22, 17, 8,-20,-23,-19,-20,-12, -4, 11,-19, -4,-20; /M: SY='G'; M= 24,-10,-18,-15,-14,-23, 27,-20,-21,-15,-18,-14, -5,-15,-14,-19, 6, -7,-12,-21,-23,-14; /M: SY='Y'; M= -8,-24,-22,-28,-22, 13,-27,-14, 14,-21, 13, 8,-21,-25,-19,-18,-17, -6, 10, -4, 16,-22; /M: SY='L'; M= 3,-22,-19,-27,-20, 3,-17,-18, 8,-20, 11, 6,-19,-22,-18,-19,-12, -6, 7,-13, 0,-19; /I: I=-4; MD=-8; /M: SY='L'; M= 1,-19,-17,-23,-16, 1,-19,-17, 6,-16, 11, 7,-16,-21,-14,-12, -9, -3, 6,-19, -5,-15; D=-4; /I: I=-4; MD=-8; /M: SY='A'; M= 11, -5,-17,-10, -9,-15, 1,-12,-13,-10,-13, -9, -1,-15, -8,-11, 5, 0, -7,-22,-14, -9; D=-4; /I: I=-4; MD=-8; /M: SY='R'; M= -9, -9,-22,-10, -3, -7,-17, -3,-12, 4, -9, -5, -5,-17, 0, 13, -5, -4,-10,-14, 0, -3; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8; /M: SY='R'; M= -6,-10,-20,-12, -7, -3,-13, -6, -9, -2, -6, -3, -7,-11, -5, 1, -6, -5, -8,-12, 0, -7; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='N'; M= -7, 1,-24, 0, -2,-18, -2, -5,-21, 0,-20,-13, 6, -9, -3, 2, 0, -5,-18,-24,-12, -3; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: M= -7,-12,-24,-14,-10, -3, -7,-13,-14, -5,-12, -8, -6,-11,-11, -2, -5, -6,-11,-16, -7,-11; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='R'; M= -9,-17,-28,-18,-10, -8,-20,-14,-11, 1,-10, -6,-13, -7, -7, 6,-12, -8,-10, -3, -3,-10; /M: SY='L'; M= -3,-21,-23,-24,-20, 0, -5,-19, 0,-20, 4, 1,-16,-21,-19,-17,-12, -8, 1,-13, -5,-20; /M: SY='R'; M= -8, 6,-25, 9, 5,-23,-12, -5,-25, 10,-21,-14, 4,-14, 4, 15, -1, -5,-18,-25,-12, 3; /M: SY='R'; M= -4, -3,-24, -6, -3,-16, -9, -7,-18, 3,-17,-10, 1,-14, -1, 5, -1, -3,-14,-18, -9, -3; /M: SY='L'; M= -3,-23,-21,-27,-21, 7,-22,-21, 11,-21, 12, 5,-20,-19,-20,-19,-13, -5, 10,-13, -1,-21; /M: SY='L'; M= -3,-25,-19,-29,-22, 9,-24,-21, 16,-23, 17, 10,-21,-24,-21,-20,-15, -6, 13,-15, 1,-22; /M: SY='R'; M= -9, -7,-23,-10, -5, -9,-16, -7,-11, -1, -6, -1, -4,-18, -2, 6, -5, -3, -9,-21, -6, -4; /M: M= -1,-16,-21,-20,-14, -5,-14,-17, -3,-12, -4, -2,-12,-10,-13, -9, -4, 0, -1,-18, -8,-14; /M: SY='L'; M= -5,-24,-19,-29,-22, 10,-24,-19, 15,-23, 16, 9,-21,-25,-20,-20,-15, -6, 11,-13, 6,-22; /M: SY='V'; M= -2,-21,-17,-26,-21, 5,-23,-20, 13,-21, 10, 7,-17,-22,-19,-19, -8, 0, 14,-20, -2,-21; /M: SY='L'; M= -8, -7,-22, -8, -5, -3,-21,-11, -1,-13, 2, 0, -8,-19, -9,-13, -8, -3, -2,-20, -3, -7; /M: SY='I'; M= -1,-23,-18,-28,-22, 6,-24,-22, 16,-23, 16, 9,-20,-23,-20,-20,-12, -3, 14,-18, -2,-21; /M: SY='P'; M= -6,-21,-25,-22,-15, -3,-16,-20, -1,-19, -1, -1,-17, 9,-17,-19,-11, -5, -4,-20,-10,-17; /M: SY='M'; M= -9,-17,-23,-20,-13, 0,-21, -8, -1, -8, 4, 6,-13,-22, -6, 1,-12, -7, -3,-11, 3,-10; /M: SY='A'; M= 8,-13,-17,-18,-14, -9, -4,-17, -4,-15, -7, -2, -8,-16,-12,-16, 3, 0, 0,-20,-12,-13; /M: SY='I'; M= -6,-24,-19,-30,-24, 8,-30,-23, 22,-23, 16, 13,-20,-23,-21,-21,-13, 1, 20,-20, -1,-23; /M: SY='P'; M= -7,-16,-35, -8, -1,-28,-16,-18,-20,-10,-29,-19,-15, 71, -9,-18, -3, -6,-27,-31,-28, -9; /M: M= 0,-11,-21,-13, -9,-10, -9,-14, -8,-13, -9, -6, -8, -7,-10,-14, 0, 0, -6,-23,-11,-10; /M: SY='I'; M= -7,-25,-20,-29,-22, 12,-28,-20, 17,-23, 16, 10,-21,-24,-20,-19,-15, -5, 15,-16, 2,-21; /M: SY='V'; M= 3,-25,-18,-29,-23, -1,-23,-24, 17,-21, 9, 7,-23,-22,-21,-21,-11, -4, 21,-14, -6,-22; /M: SY='L'; M= -6,-22,-21,-25,-18, 4,-24,-17, 10,-18, 12, 7,-19,-23,-13,-14,-13, -4, 8,-12, 1,-16; /M: SY='A'; M= 10,-17,-19,-22,-18,-10, 3,-20, -3,-19, 0, -1,-13,-18,-16,-20, -4, -6, 1,-21,-13,-18; /M: SY='I'; M= -8,-25,-22,-29,-21, 11,-27,-19, 16,-22, 16, 10,-21,-17,-20,-20,-17, -6, 11,-15, 4,-22; /M: SY='I'; M= -1,-23,-22,-26,-19, 1,-17,-21, 8,-21, 8, 4,-19,-12,-19,-20,-12, -6, 6,-17, -5,-20; /M: SY='L'; M= -8,-27,-24,-31,-23, 12,-23,-21, 10,-24, 15, 7,-24,-26,-20,-20,-21,-10, 6, 8, 6,-21; /M: SY='I'; M= -7,-21,-22,-25,-18, 8,-24,-13, 9,-16, 9, 7,-17,-23,-14,-13,-13, -5, 7,-11, 9,-17; /M: SY='F'; M= -5,-19,-22,-23,-17, 7,-21,-15, 4,-17, 6, 3,-16,-19,-15,-15,-12, -5, 2, -8, 5,-16; /M: SY='L'; M= -4,-25,-22,-28,-22, 5,-20,-21, 13,-22, 14, 9,-21,-23,-19,-20,-16, -7, 11,-11, -1,-21; /I: I=-1; MD=-2; /M: SY='F'; M=-11,-26,-20,-31,-24, 30,-26,-17, 10,-25, 19, 9,-22,-27,-25,-19,-19, -7, 7, -6, 13,-23; D=-1; /I: I=-1; MD=-2; /M: SY='G'; M= 1, -4,-22, -6, -7,-20, 8,-11,-19, -8,-19,-12, 1, -8, -7, -8, 3, -5,-15,-25,-17, -8; D=-1; /I: I=-1; MD=-2; /M: M= -4, -7,-21, -8, -4,-12,-13, -9, -9, -4,-11, -6, -5, 0, -4, -5, -2, -2, -8,-19, -9, -5; D=-1; /I: I=-1; MD=-2; /M: M= -5, -7,-17, -9, -6, -4,-13, -7, -3, -7, -1, -1, -6,-13, -5, -6, -6, -4, -4,-13, -3, -6; D=-1; /I: I=-1; MD=-2; /M: SY='G'; M= -4,-11,-17,-12,-12, -3, 4,-11, -6,-13, -1, -2, -8,-13,-12,-12, -7, -7, -6,-10, -5,-12; D=-1; /I: I=-1; MD=-2; /M: SY='G'; M= -3, -6,-17, -6, -6,-11, 6, -8,-11, -6, -9, -6, -3, -6, -6, -6, -3, -7,-10,-11, -9, -7; D=-1; /I: I=-1; MD=-2; /M: SY='I'; M= -4,-13,-14,-15,-11, 1,-13,-11, 6,-11, 6, 3,-12,-11, -9,-10, -9, -5, 4, -2, 0,-11; D=-1; /I: I=-1; MI=0; MD=-2; IM=0; DM=-2; /M: SY='L'; M= -4, -9,-14,-10, -8, -1, -6, -9, -2,-10, 1, -1, -8, -7, -9, -9, -7, -4, -3, -7, -3, -9; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: M= -2, -7,-13, -9, -7, -3, -6, -9, -3, -8, -2, -2, -6, -8, -7, -8, -3, -2, -3, -9, -4, -7; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='B'; M= -4, 3,-15, 3, -1,-12, -4, -5,-10, -4,-10, -8, 3, -6, -3, -5, 1, -2, -9,-17, -9, -2; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: M= -4, -9,-17,-10, -7, -6,-11, -9, -3, -9, -1, -2, -7, -7, -7, -7, -6, -3, -4,-15, -6, -8; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='L'; M= -5,-12,-18,-14,-11, -1,-12,-11, 1,-12, 3, 1,-10,-13,-10,-11, -8, -4, -1,-12, -2,-11; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='Y'; M= -8, -6,-22, -7, -7, -4,-12, -6, -9, -8, -7, -6, -3,-13, -7, -7, -5, -4,-10,-10, 1, -8; D=-1; /I: I=-1; DM=-2; /M: SY='S'; M= 3, -3,-21, -6, -7,-19, 7, -5,-21,-10,-21,-14, 3, -9, -7,-10, 9, 2,-16,-26,-15, -8; /M: SY='L'; M= -8,-20,-23,-23,-14, 6,-23,-14, 4,-17, 10, 6,-18,-18,-14,-13,-15, -6, 1, -9, 3,-14; /M: SY='I'; M= -5,-20,-23,-24,-17, 3,-21,-19, 4,-18, 4, 1,-17,-16,-16,-17,-12, -4, 2, -5, 0,-17; /M: SY='A'; M= 8,-10,-17,-15,-13,-13, -3,-17, -8,-15, -6, -6, -7,-12,-12,-16, 0, -1, -5,-22,-14,-13; /M: SY='V'; M= 2,-19,-21,-21,-16,-10,-15,-21, 4,-16, 1, 1,-17, -5,-15,-18, -7, -4, 5,-24,-12,-17; /M: SY='I'; M= 0,-23,-18,-29,-23, -1,-24,-23, 21,-21, 10, 9,-19,-22,-19,-21,-10, -3, 21,-20, -4,-23; /M: SY='I'; M= -6,-27,-20,-32,-24, 9,-28,-23, 22,-25, 22, 13,-23,-25,-21,-22,-19, -7, 16,-15, 0,-23; /M: SY='A'; M= 15,-16,-14,-21,-17,-11, -7,-22, 1,-16, -3, -2,-13,-15,-16,-19, 1, 2, 7,-24,-14,-17; /M: SY='L'; M= -8,-19,-21,-21,-16, 2,-24, -8, 10,-20, 16, 11,-16,-23,-13,-16,-15, -7, 5,-19, 3,-15; /M: SY='V'; M= 7,-15,-15,-20,-17, -7,-10,-21, 2,-17, -3, -2,-11,-18,-16,-18, 2, 5, 8,-24,-11,-17; /M: SY='L'; M= -7,-27,-23,-31,-23, 10,-27,-20, 13,-23, 15, 8,-24,-25,-20,-20,-20, -9, 9, 4, 6,-22; /M: SY='M'; M= -6,-16,-21,-20,-15, 0,-17,-12, -1,-13, -1, 1,-12,-15,-12,-11, -9, -4, -1,-15, -1,-14; /M: SY='S'; M= 0, -9,-18,-13,-11, -8, -5,-11,-11,-12,-11, -7, -4,-16, -9,-13, 2, 1, -8,-17, -6,-10; /M: SY='L'; M= -2,-22,-20,-27,-20, 5,-19,-20, 7,-21, 9, 5,-19,-23,-18,-19,-11, -3, 6, -6, 0,-19; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='P'; M= 6,-16,-26,-15,-10,-18, -2,-20,-16,-14,-18,-13,-13, 24,-13,-19, -3, -7,-15,-21,-20,-13; /M: SY='F'; M=-12,-21,-24,-24,-19, 20,-22,-10, 1,-18, 2, 1,-17,-18,-18,-15,-14, -7, -2, 0, 19,-19; /M: SY='I'; M= -1,-16,-18,-22,-18, -1,-19,-15, 9,-17, 4, 6,-12,-20,-14,-17, -7, -2, 8,-19, -2,-17; /M: SY='V'; M= 6,-18,-16,-24,-19, -2,-18,-18, 8,-17, 4, 6,-15,-19,-15,-17, -4, 1, 11,-20, -4,-18; /M: SY='R'; M=-11,-16,-25,-17, -6, -3,-23,-12, -4, -4, 1, 0,-12,-20, -6, 6,-13, -8, -4,-13, -2, -7; /M: SY='I'; M= -5,-19,-21,-24,-19, 0,-24,-17, 15,-19, 11, 9,-15,-18,-15,-18,-11, -2, 11,-22, -3,-18; /M: SY='I'; M= -5,-22,-17,-27,-21, 8,-26,-18, 13,-19, 12, 10,-19,-23,-18,-16,-11, 0, 13,-17, 2,-20; /M: SY='R'; M=-10,-12,-24,-14, -5, -9,-21, -6,-11, 4, -5, -2, -8,-20, -1, 19, -9, -5, -8,-18, -2, -6; /M: SY='A'; M= 12, -2,-19, -5, -3,-22, 4,-12,-18, -8,-18,-13, 1,-10, -4,-12, 10, 1,-12,-27,-19, -4; /M: SY='A'; M= 9,-11,-20,-15,-11,-11, 8,-14,-15,-13,-13, -9, -6,-16,-11,-14, 3, -5,-10,-19,-11,-11; /M: SY='L'; M= -8,-27,-20,-31,-23, 14,-29,-20, 20,-24, 24, 17,-23,-26,-21,-20,-20, -7, 15,-15, 4,-22; /M: SY='Q'; M= -6, -4,-24, -5, 4,-18,-18, -7,-11, 1, -6, -3, -4,-15, 6, 3, -6, -6,-11,-24,-10, 4; /M: SY='S'; M= 5, 3,-19, 0, 4,-23, -3, -8,-20, -2,-20,-14, 5,-11, 3, -4, 11, 3,-15,-29,-17, 3; /M: SY='I'; M= -5,-26,-19,-30,-23, 1,-31,-24, 27,-22, 16, 13,-22,-24,-20,-21,-14, -4, 26,-23, -4,-23; /M: SY='P'; M=-10, 0,-31, 6, 3,-26,-15,-10,-21, -3,-21,-15, -4, 26, -4, -8, -5, -8,-22,-30,-20, -3; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='K'; M= -7, -3,-27, -2, 6,-23,-16, -6,-21, 10,-19,-10, -2, -2, 6, 10, -2, -5,-17,-24,-13, 5; /M: SY='D'; M= -6, 11,-25, 16, 15,-27, -3, -5,-27, -1,-23,-18, 6, -8, 3, -5, 5, -4,-23,-30,-18, 8; /M: SY='Y'; M=-12,-22,-24,-24,-15, 11,-28, -6, 8,-17, 15, 8,-20,-23, -8,-13,-19, -9, 0, -6, 18,-13; /M: SY='I'; M= -9,-16,-23,-17, -9, -2,-26,-12, 7,-11, 3, 3,-16,-20,-10, -9,-12, -6, 7,-15, 3,-11; /M: SY='E'; M=-10, 7,-28, 13, 33,-25,-19, -2,-24, 8,-17,-14, 1, -7, 12, 4, -2, -8,-23,-27,-15, 22; /M: SY='A'; M= 32,-11,-12,-19,-12,-14, -5,-18, -7,-12, -7, -7, -9,-13,-11,-18, 8, 3, 2,-22,-15,-11; /M: SY='A'; M= 36,-10,-10,-18,-10,-18, 1,-18,-11,-12,-11, -9, -8,-12,-10,-19, 10, 1, -2,-22,-18,-10; /M: SY='R'; M= -9, -8,-26, -9, 0,-16,-19, -4,-16, 12,-11, -5, -5,-17, 5, 22, -8, -7,-13,-18, -5, 0; /M: SY='A'; M= 10,-12,-16,-17,-14,-11,-13,-18, 4,-16, -1, 0, -9,-17,-12,-18, 2, 2, 7,-26,-12,-14; /M: SY='L'; M=-12, -2,-23, 1, -5, -9,-21,-10, -6, -9, 7, 1, -9,-20, -8, -9,-14, -8, -6,-24, -5, -7; /M: SY='G'; M= 0, -9,-29, -9,-18,-29, 63,-18,-38,-18,-29,-19, 1,-20,-18,-17, 0,-18,-29,-20,-28,-18; /M: SY='A'; M= 18,-16,-10,-22,-15, -8,-12,-17, -1,-15, 4, 2,-15,-18,-13,-18, -4, -4, 3,-20,-10,-14; /M: SY='S'; M= 0, 2,-19, -1, -4,-21, 4,-10,-23, -5,-26,-17, 9, -7, -4, -5, 18, 10,-17,-32,-19, -5; /M: SY='R'; M= -8, -5,-28, -4, 4,-19,-14, -7,-22, 5,-20,-13, -4, 1, 0, 7, -4, -6,-19,-18,-11, 0; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='W'; M=-10,-23,-28,-26,-19, 11,-18,-18, -6,-15, -2, -4,-19,-21,-16,-10,-17,-11, -8, 26, 9,-17; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='Q'; M= -9, -4,-27, -5, 5,-22,-16, 1,-20, 10,-17, -6, -2,-15, 18, 16, -3, -6,-19,-18, -6, 10; /M: SY='V'; M= -2,-18,-19,-23,-16, -7,-25,-19, 11,-12, 3, 5,-14,-19,-11, -9, -6, 3, 12,-23, -6,-15; /M: SY='F'; M=-12,-28,-22,-34,-25, 30,-30,-18, 15,-25, 19, 12,-22,-27,-25,-20,-21, -9, 10, -4, 13,-24; /M: SY='F'; M=-13,-20,-26,-24,-16, 9,-23,-14, -8, -5, -2, -3,-15,-24,-12, 8,-15, -8, -6, 7, 7,-14; /M: SY='R'; M=-12, -5,-26, -6, 0,-15,-18, 4,-22, 15,-17, -8, 0,-17, 4, 21, -6, -6,-17,-18, -1, 0; /M: SY='I'; M= -7,-22,-22,-25,-21, -4,-29, -4, 21,-20, 7, 10,-17,-23,-16,-19,-13, -8, 21,-24, 1,-21; /M: SY='V'; M= -1,-19,-18,-24,-18, -4,-25,-21, 15,-17, 7, 6,-16,-20,-15,-17, -7, 4, 16,-23, -5,-18; /M: SY='L'; M= -9,-29,-21,-31,-23, 14,-29,-21, 19,-27, 33, 16,-26,-28,-21,-20,-25, -9, 12,-13, 3,-22; /M: SY='P'; M=-11,-18,-38,-10, 0,-28,-20,-17,-21, -4,-28,-18,-17, 71, -7, -9,-10,-10,-27,-28,-26, -8; /M: SY='M'; M= -5, -5,-21,-10, -6,-11,-15, -4, -3,-11, 2, 3, 0,-18, 0, -9, -6, -5, -8,-24, -7, -3; /M: SY='A'; M= 15,-17,-13,-23,-16, -9,-15,-20, 6,-18, 5, 3,-14,-18,-14,-19, -1, 0, 9,-24,-12,-15; /M: SY='L'; M= -5,-19,-22,-22,-14, -2,-22,-15, 2, -7, 8, 7,-15,-21,-10, -2,-13, -6, 2,-15, -3,-13; /M: SY='P'; M= -7,-14,-31,-11, -4,-21,-15,-15,-15, -6,-19,-13,-11, 34, -7, -7, -5, -6,-18,-26,-20, -8; /M: SY='A'; M= 2,-12,-23,-14,-11,-16, -2,-15,-11,-12,-14, -9, -8, 0,-11,-14, 0, -3, -8,-23,-14,-12; /M: SY='I'; M= -5,-26,-21,-31,-24, 4,-30,-23, 26,-24, 20, 15,-21,-23,-19,-22,-16, -5, 20,-20, -1,-23; /M: SY='I'; M= -1,-24,-19,-29,-22, 6,-25,-22, 17,-22, 16, 10,-20,-23,-19,-20,-13, -4, 16,-18, -2,-21; /M: SY='T'; M= 6,-12,-17,-16,-12,-10,-14,-18, -4,-13, -9, -7, -9, -4,-13,-15, 5, 9, 1,-25,-12,-13; /M: SY='A'; M= 5,-14,-20,-17,-15,-13, 2,-17, -7,-16, -7, -5, -9,-14,-13,-17, -1, -4, -3,-22,-14,-15; /M: SY='L'; M= 2,-21,-16,-26,-20, 5,-18,-20, 8,-21, 10, 5,-18,-22,-19,-19, -9, -2, 9,-17, -3,-19; /M: SY='V'; M= -2,-19,-20,-23,-19, -5,-14,-20, 7,-17, 5, 4,-14,-20,-16,-14, -8, -1, 8,-22, -9,-18; /M: SY='L'; M= -9,-19,-21,-24,-19, 10,-24,-15, 11,-21, 17, 9,-14,-24,-17,-17,-15, -5, 5,-16, 3,-18; /M: SY='S'; M= 3, -5,-16, -8, -5,-16, -9,-11,-10, -8,-11, -7, -2,-16, -3, -8, 5, 3, -6,-27,-13, -4; /M: SY='F'; M= -8,-26,-19,-32,-24, 28,-26,-21, 11,-24, 13, 7,-20,-25,-25,-20,-15, -5, 9, -6, 9,-24; /M: SY='V'; M= 2,-18,-20,-22,-17,-10,-10,-21, 7,-18, 1, 3,-14,-15,-16,-19, -5, -3, 8,-24,-12,-18; /M: M= -4, -9,-23,-12, -9, -7, -7, -9,-12,-10, -9, -6, -4,-17, -8, -6, -3, -4,-10,-15, -5, -9; /M: SY='A'; M= 10,-12,-14,-18,-13,-10,-12,-16, 0,-15, -1, -1, -8,-17,-11,-16, 3, 3, 3,-25,-12,-12; /M: SY='L'; M=-10,-29,-25,-34,-25, 15,-28,-23, 16,-25, 17, 11,-26,-26,-22,-21,-23,-11, 10, 10, 8,-23; /M: SY='N'; M= -3, 0,-23, -4, -5,-19, 2, -9,-19, -1,-16, -9, 5,-17, -3, -2, 0, -4,-16,-25,-15, -4; /I: I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='E'; M= 0, 3,-20, 3, 4,-17,-11, -9,-14, -8,-12,-11, 0,-13, -4,-11, 3, 1,-10,-26,-13, 0; /M: SY='F'; M= -6,-20,-18,-25,-17, 22,-24,-17, 4,-20, 6, 1,-16,-22,-21,-17, -8, 0, 6,-10, 9,-18; /M: SY='A'; M= 5,-11,-18,-13,-12,-10,-10,-18, -1,-15, -4, -3, -9,-14,-13,-17, 1, 1, 3,-25,-12,-13; /M: SY='I'; M= 0,-20,-20,-24,-17, -2,-21,-20, 10,-18, 7, 4,-17,-19,-15,-18, -9, -1, 10,-16, -5,-17; /M: SY='A'; M= 4,-15,-21,-16, -5,-12,-17,-18, -1,-14, -2, -3,-14, -3,-11,-16, -4, -2, 1,-25,-14, -9; /M: M= -2,-12,-20,-14, -8, -3,-13,-11, -4,-13, -2, -2, -9,-18, -8,-12, -1, -1, -4,-18, -2, -8; /M: SY='I'; M= -6,-25,-19,-31,-24, 14,-28,-21, 18,-23, 16, 12,-22,-25,-21,-19,-15, -4, 17,-15, 4,-23; /M: SY='L'; M= -9,-28,-20,-32,-24, 18,-30,-21, 21,-26, 24, 15,-24,-26,-23,-21,-20, -7, 16,-15, 4,-24; /M: SY='G'; M= 4, -6,-21,-10,-12,-19, 18,-16,-20,-14,-17,-12, 0,-16,-12,-14, 6, 1,-14,-24,-18,-12; /I: I=-4; MD=-7; /M: M= -2,-10,-22,-13,-12, -9, 0,-13,-11,-12, -9, -7, -6,-15,-10,-10, -4, -5, -9,-11, -7,-11; D=-4; /I: I=-4; MD=-7; /M: SY='G'; M= -2, -4,-25, -3, -5,-22, 11,-12,-22, -9,-21,-14, 0, 2, -7,-11, 2, -6,-19,-24,-19, -7; D=-4; /I: I=-4; MD=-7; /M: SY='G'; M= -2, -2,-23, -3, -6,-20, 12,-11,-19, -8,-17,-12, 0,-11, -8,-10, 0, -7,-14,-22,-16, -7; D=-4; /I: I=-4; MD=-7; /M: SY='P'; M= -3, -5,-17, -5, -2,-11, -9, -8, -9, -4,-10, -6, -4, 5, -2, -6, -2, -2, -9,-16, -9, -3; D=-4; /I: I=-4; MD=-7; /M: M= -2, -4,-15, -6, -4,-10, -4, -7, -8, -5, -8, -4, -2, -3, -3, -6, -1, -2, -8,-15, -7, -4; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7; /M: SY='T'; M= 0, -3,-13, -6, -5,-10, -7,-11, -8, -7, -9, -6, -2, -6, -6, -8, 7, 12, -4,-21,-10, -6; D=-4; /I: I=-4; DM=-7; /M: SY='L'; M= -8,-27,-23,-31,-23, 6,-28,-21, 20,-24, 24, 14,-25,-25,-19,-20,-22, -8, 13, -6, 2,-21; D=-4; /I: I=-4; DM=-7; /M: SY='G'; M= 4, -8,-24, -9,-10,-24, 24,-17,-25,-14,-23,-16, -3, -2,-11,-16, 5, -5,-19,-25,-24,-12; /M: SY='T'; M= -5, -9,-21,-11, -7, -9,-19,-11, -3, -8, -2, -1, -8,-17, -5, -7, -4, 1, -1,-22, -5, -7; /M: SY='L'; M= -6,-18,-22,-21,-14, 2,-20,-11, 4,-15, 11, 9,-16,-22,-10,-12,-14, -7, 1,-12, 4,-13; /M: SY='I'; M= -6,-26,-21,-31,-23, 5,-29,-21, 25,-24, 23, 17,-22,-24,-18,-21,-18, -6, 18,-19, 0,-22; /M: SY='Y'; M= -6,-15,-23,-19,-15, 8,-20, -7, -1,-12, -1, -1,-12,-22,-11,-10, -9, -5, -2, -3, 16,-14; /M: SY='Q'; M= -5, 5,-23, 5, 5,-20,-12, -4,-18, 0,-17,-11, 5,-13, 6, 0, 3, -1,-16,-25,-11, 5; /M: SY='A'; M= 8, -9,-19,-13, -8,-10, -6,-11,-10,-10, -8, -5, -6,-16, -5,-11, 1, -2, -7,-18, -6, -7; /M: SY='I'; M= -2,-16,-21,-20,-14, -3,-19,-14, 3,-11, 1, 3,-12,-20, -9, -9, -7, -3, 3,-17, -2,-12; /M: M= -5, -5,-22, -8, -5, -7,-10, -8,-13, -7,-11, -7, -2,-16, -4, -5, -1, -2,-11,-20, -5, -5; /M: M= -3, -5,-22, -7, -3,-12,-12, -7,-12, -5,-10, -6, -2,-15, -1, -4, -1, -2,-10,-21, -6, -2; /M: M= -4, -9,-23,-11, -8, -9, -8, -9,-11, -8, -8, -5, -5,-15, -6, -4, -4, -5,-10,-18, -5, -8; /I: I=-4; MD=-9; /M: SY='D'; M= -6, 5,-22, 6, 0,-15, -8, -6,-17, -6,-15,-11, 4,-13, -3, -6, 0, -3,-14,-24, -9, -2; D=-4; /I: I=-4; MD=-9; /M: SY='S'; M= -3, -2,-17, -3, -4, -9,-10, -7, -9, -6, -8, -6, -1,-11, -4, -6, 1, 1, -7,-19, -6, -5; D=-4; /I: I=-4; MD=-9; /M: SY='S'; M= -1, -1,-15, -2, -2, -9, -6, -5, -9, -5, -9, -7, 0, -4, -3, -6, 1, 0, -8,-15, -6, -3; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9; /M: SY='W'; M=-11,-21,-24,-23,-17, 13,-21,-10, 1,-15, 2, 2,-19,-16,-13,-13,-17,-10, -4, 17, 17,-15; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='G'; M= -2, -6,-26, -5, -4,-19, 8,-11,-22, -9,-21,-15, -3, -1, -7,-11, -1, -8,-21,-11,-15, -6; D=-4; /I: I=-4; DM=-9; /M: SY='I'; M= -2,-17,-20,-20,-13, -3,-20,-14, 4,-13, 4, 3,-15,-17,-11,-13, -8, -2, 4,-17, -1,-13; /M: SY='V'; M= 6,-19,-18,-24,-19, -2,-15,-19, 7,-18, 6, 4,-17,-20,-16,-18, -7, -4, 9,-17, -4,-18; /M: SY='A'; M= 4,-16,-17,-21,-15, -2,-16,-15, 3,-16, 3, 4,-12,-19,-11,-16, -4, -1, 3,-18, -4,-13; /M: SY='A'; M= 20,-15,-15,-22,-15, -7,-10,-20, -1,-15, -3, -3,-13,-14,-15,-19, 0, 0, 4,-18,-10,-15; /M: SY='A'; M= 4,-19,-20,-22,-16, -7,-13,-19, 3,-18, 2, 2,-16, -9,-15,-19, -7, -4, 3,-21, -9,-17; /M: SY='A'; M= 15,-11,-16,-16,-14,-15, 5,-19,-10,-15,-10, -8, -7,-16,-13,-17, 7, 2, -3,-24,-16,-13; /M: SY='L'; M= -4,-25,-18,-29,-23, 6,-27,-22, 19,-23, 20, 12,-22,-25,-21,-20,-15, -2, 18,-19, -2,-22; /M: SY='I'; M= -3,-26,-18,-31,-24, 5,-27,-23, 21,-23, 18, 13,-22,-23,-20,-21,-15, -5, 19,-19, -2,-23; /M: SY='L'; M= -6,-23,-20,-28,-21, 9,-25,-16, 16,-22, 18, 12,-20,-24,-17,-19,-16, -5, 11,-15, 7,-20; /M: SY='L'; M= -1,-23,-17,-28,-22, 7,-21,-21, 12,-22, 13, 8,-19,-23,-20,-20,-11, -2, 13,-17, -2,-21; /M: SY='I'; M= 0,-25,-17,-29,-23, 3,-25,-23, 19,-24, 19, 11,-22,-24,-20,-21,-14, -5, 18,-21, -4,-22; /M: SY='I'; M= -4,-23,-20,-27,-20, 1,-25,-22, 14,-21, 11, 8,-20, -9,-19,-20,-13, -3, 11,-21, -6,-20; /M: SY='V'; M= 2,-14,-13,-19,-17, -7,-15,-19, 4,-17, -2, -1,-10,-18,-16,-17, 0, 4, 9,-26,-10,-17; /M: SY='L'; M= -5,-25,-19,-29,-22, 9,-25,-21, 16,-24, 22, 12,-22,-25,-20,-20,-17, -6, 13,-17, 0,-21; /M: SY='I'; M= 3,-22,-17,-26,-21, -4,-19,-23, 14,-21, 9, 5,-18,-19,-19,-21, -8, -3, 14,-23, -9,-21; /M: SY='L'; M= -3,-25,-18,-29,-22, 9,-24,-22, 16,-23, 17, 10,-21,-24,-21,-20,-14, -5, 15,-18, -1,-22; /M: SY='N'; M= -5, 0,-20, -4, -7, -4,-13, -9, -9,-11, -9, -8, 3,-18, -9,-11, 1, 1, -8,-22, -5, -8; /M: SY='L'; M= -4,-23,-21,-27,-20, 8,-23,-17, 11,-20, 16, 8,-20,-23,-17,-16,-16, -6, 8,-13, 2,-19; /M: SY='L'; M= -5,-26,-20,-31,-23, 8,-27,-23, 20,-25, 22, 12,-23,-25,-21,-21,-17, -6, 16,-17, 0,-23; /M: M= 0,-15,-20,-19,-14, -2,-10,-13, -2,-15, -1, 0,-11,-20,-10,-13, -5, -4, -1,-16, -1,-13; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 532 in 515 different sequences |
| Number of true positive hits | 532 in 515 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | window20 |
| Author [info] | V_Lesaux |
| Taxonomic range [info] | Archaea, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 2 |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
515 sequences
AAPM_RHIL3 (Q52814 ), AAPQ_RHIL3 (Q52813 ), AFUB_ECOLI (P75681 ), AGLF_RHIME (Q9Z3R6 ), AGLG_RHIME (Q9Z3R7 ), AMIC_STRPN (P0A4M7 ), AMIC_STRR6 (P0A4M8 ), AMID_STRPN (P0A4M9 ), AMID_STRR6 (P0A4N0 ), AMYC_THETU (P37729 ), AMYD_THETU (P37730 ), ANTRP_HALVD (D4GSY8 ), APPB_BACSU (P42062 ), APPC_BACSU (P42063 ), ARAP_BACSU (P94529 ), ARAP_HALH5 (Q9KEF0 ), ARAQ_BACSU (P94530 ), ARAQ_HALH5 (Q9KEE9 ), ARTM_ECO57 (P0AE32 ), ARTM_ECOL6 (P0AE31 ), ARTM_ECOLI (P0AE30 ), ARTM_HAEIN (P45089 ), ARTM_SHIFL (P0AE33 ), ARTQ_BACSU (P54536 ), ARTQ_ECOL6 (P0AE35 ), ARTQ_ECOLI (P0AE34 ), ARTQ_HAEIN (P45090 ), ARTQ_SHIFL (P0AE36 ), BZTB_RHOCB (Q52664 ), BZTC_RHOCB (Q52665 ), CMPB_SYNE7 (Q55106 ), CMPB_SYNP6 (Q5MZ55 ), CMPB_SYNY3 (Q55461 ), CNTB_STAA8 (Q2FVE8 ), CNTB_STAAM (A0A0H3K104), CNTC_STAA8 (Q2FVE9 ), CNTC_STAAM (A0A0H3JU73), CYST_ANTAG (Q85AI0 ), CYST_CHLAT (A2CI71 ), CYST_CHLVU (P56343 ), CYST_ECOLI (P16701 ), CYST_HELSJ (Q2EEX6 ), CYST_MARPO (P26246 ), CYST_MESVI (Q9MUL9 ), CYST_NEPOL (Q9TKU8 ), CYST_PROWI (Q9TJR4 ), CYST_SALTY (P41032 ), CYST_SYNE7 (P27367 ), CYST_SYNY3 (Q01895 ), CYST_ZYGCR (Q32RF7 ), CYSW_ECOL6 (P0AEB1 ), CYSW_ECOLI (P0AEB0 ), CYSW_SYNE7 (P27370 ), CYSW_SYNY3 (P74547 ), DASB_STRCO (Q9K490 ), DASC_STRCO (Q9K489 ), DDPB_ECOLI (P77308 ), DDPC_ECOLI (P77463 ), DPPB_ALKPO (P94311 ), DPPB_BACSU (P26903 ), DPPB_ECO57 (P0AEG0 ), DPPB_ECOL6 (P0AEF9 ), DPPB_ECOLI (P0AEF8 ), DPPB_HAEIN (P45096 ), DPPB_LACLM (A2RI75 ), DPPB_PSEAB (A0A0H2ZGW7), DPPC_ALKPO (P94312 ), DPPC_BACSU (P26904 ), DPPC_ECO57 (P0AEG3 ), DPPC_ECOL6 (P0AEG2 ), DPPC_ECOLI (P0AEG1 ), DPPC_HAEIN (P51000 ), DPPC_LACLM (A2RI76 ), DPPC_PSEAB (A0A0H2ZFV0), EGTU_HELPG (B5Z7I3 ), FBPB1_HAEIN (Q57341 ), FBPB2_HAEIN (P71338 ), FBPB_ACTPL (Q44123 ), FBPB_SERMA (P21409 ), GANP_BACSU (O32261 ), GANQ_BACSU (O07011 ), GBUB_LISM4 (Q9RR45 ), GGTC_SYNY3 (Q55472 ), GGTD_SYNY3 (Q55473 ), GLCT_SACS2 (Q97UZ0 ), GLCU_SACS2 (Q97UY9 ), GLNM_BACSU (O34671 ), GLNP_BACSU (O34606 ), GLNP_ECO57 (P0AEQ8 ), GLNP_ECOL6 (P0AEQ7 ), GLNP_ECOLI (P0AEQ6 ), GLNP_RICBR (Q1RHC0 ), GLNP_RICCN (Q92J96 ), GLNP_RICFE (Q4UKC4 ), GLNP_RICPR (P41083 ), GLNP_RICTY (Q68XN8 ), GLNP_SHIFL (P0AEQ9 ), GLTJ_ECOL6 (P0AER4 ), GLTJ_ECOLI (P0AER3 ), GLTK_ECO57 (P0AER7 ), GLTK_ECOL6 (P0AER6 ), GLTK_ECOLI (P0AER5 ), GLUC_COREF (Q8RQL5 ), GLUC_CORGL (P48244 ), GLUD_COREF (Q8RQL4 ), GLUD_CORGL (P48245 ), GSIC_ECO57 (Q8X6V7 ), GSIC_ECOK1 (A1A970 ), GSIC_ECOL5 (Q0TJL7 ), GSIC_ECOL6 (Q8FJK9 ), GSIC_ECOLI (P75798 ), GSIC_ECOUT (Q1RE94 ), GSIC_PECAS (Q6D3B1 ), GSIC_SALCH (Q57RB0 ), GSIC_SALPA (Q5PGP5 ), GSIC_SALTI (Q8Z862 ), GSIC_SALTY (Q8ZQM2 ), GSIC_SHIBS (Q323W3 ), GSIC_SHIDS (Q32IB7 ), GSIC_SHIF8 (Q0T6D1 ), GSIC_SHIFL (Q83S26 ), GSIC_SHISS (Q3Z3V2 ), GSID_ECO57 (Q8X6V6 ), GSID_ECOK1 (A1A971 ), GSID_ECOL5 (Q0TJL6 ), GSID_ECOL6 (Q8FJK8 ), GSID_ECOLI (P75799 ), GSID_ECOUT (Q1RE93 ), GSID_PECAS (Q6D3B2 ), GSID_SALCH (Q57RA9 ), GSID_SALPA (Q5PGP6 ), GSID_SALTI (Q8XF88 ), GSID_SALTY (Q7CQV4 ), GSID_SHIBS (Q323W2 ), GSID_SHIDS (Q32IB8 ), GSID_SHIF8 (P0C2L2 ), GSID_SHIFL (Q83S25 ), GSID_SHISS (Q3Z3V1 ), HISM_ECO57 (P0AEU5 ), HISM_ECOL6 (P0AEU4 ), HISM_ECOLI (P0AEU3 ), HISM_SALTI (P0A2I8 ), HISM_SALTY (P0A2I7 ), HISM_SHIFL (P0AEU6 ), HISQ_ECOLI (P52094 ), HISQ_SALTI (P0A2J0 ), HISQ_SALTY (P0A2I9 ), HTXC_STUST (O69062 ), HTXE_STUST (O69064 ), LACF_RHIRD (P29823 ), LACG_RHIRD (P29824 ), LPLB_BACSU (P39128 ), LPLC_BACSU (P39129 ), MALC_STRPN (P0A4N1 ), MALC_STRR6 (P0A4N2 ), MALD_STRPN (P0A4N3 ), MALD_STRR6 (P0A4N4 ), MALF_ECO57 (Q7A937 ), MALF_ECOL6 (Q8FB38 ), MALF_ECOLI (P02916 ), MALF_KLEAE (P18812 ), MALF_PHOLL (Q7N984 ), MALF_SALTI (Q8Z1U2 ), MALF_SALTY (P26467 ), MALF_SHIFL (Q83P81 ), MALF_THELN (O51924 ), MALF_VIBCH (Q9KL06 ), MALF_VIBPA (Q87GB7 ), MALF_VIBVU (Q8D3U8 ), MALF_VIBVY (Q7MFC2 ), MALF_YERPE (Q74RF9 ), MALG_ECO57 (P68185 ), MALG_ECOL6 (P68184 ), MALG_ECOLI (P68183 ), MALG_KLEAE (P18814 ), MALG_PHOLL (Q7N983 ), MALG_SALTI (Q8Z1U3 ), MALG_SALTY (P26468 ), MALG_SHIFL (P68186 ), MALG_THELN (Q7LYX6 ), MALG_VIBCH (Q9KL07 ), MALG_VIBPA (Q87GB8 ), MALG_VIBVU (Q8D3U7 ), MALG_VIBVY (Q7MFC1 ), MALG_YERPE (Q74RF8 ), MDXF_BACSU (O06990 ), MDXG_BACSU (O06991 ), MELC_BACSU (O34518 ), MELD_BACSU (O34706 ), METI_ECO57 (Q8X800 ), METI_ECOLI (P31547 ), METI_HAEIN (P46492 ), METI_PASMU (Q9CK96 ), METI_SALTI (Q8Z991 ), METI_SALTY (Q8ZRN0 ), METI_VIBCH (Q9KTJ6 ), METI_YERPE (Q8ZH39 ), METP_BACSU (O32168 ), MOBDP_HALVD (D4GQ17 ), MODB_AZOVI (P37731 ), MODB_ECO57 (P0AF02 ), MODB_ECOLI (P0AF01 ), MODB_HAEIN (P45322 ), MODB_MYCBO (P0A625 ), MODB_MYCTO (P9WG12 ), MODB_MYCTU (P9WG13 ), MODB_RHOCA (Q08382 ), MSMF_STRMU (Q00750 ), MSMG_STRMU (Q00751 ), NGCF_STRCO (O50500 ), NGCG_STRCO (O50501 ), NIFC_CLOPA (P18795 ), NIKB_ECOLI (P33591 ), NIKB_STAA3 (Q2FH55 ), NIKB_STAA8 (Q2FYQ5 ), NIKB_STAAB (Q2YXY7 ), NIKB_STAAC (Q5HG38 ), NIKB_STAAM (Q99UA0 ), NIKB_STAAN (Q7A5Q6 ), NIKB_STAAR (Q6GH25 ), NIKB_STAAS (Q6G9H8 ), NIKB_STAAW (Q8NWT4 ), NIKC_ECO57 (P0AFB0 ), NIKC_ECOLI (P0AFA9 ), NIKC_STAA3 (Q2FH56 ), NIKC_STAA8 (Q2FYQ6 ), NIKC_STAAB (Q2YXY8 ), NIKC_STAAC (Q5HG39 ), NIKC_STAAM (Q99UA1 ), NIKC_STAAN (Q7A5Q7 ), NIKC_STAAR (Q6GH26 ), NIKC_STAAS (Q6G9H9 ), NIKC_STAAW (Q7A0Y0 ), NOCM_AGRFC (P35113 ), NOCQ_AGRFC (P35118 ), NRTB_PHOLA (Q51881 ), NRTB_SYNE7 (P38044 ), NRTB_SYNY3 (P73451 ), OCCM_RHIML (P72296 ), OCCM_RHIRD (P35114 ), OCCQ_AGRT4 (P0A4N6 ), OCCQ_RHIML (P72295 ), OCCQ_RHIRD (P0A4N5 ), OPPB_BACSU (P24138 ), OPPB_ECO57 (P0AFH4 ), OPPB_ECOL6 (P0AFH3 ), OPPB_ECOLI (P0AFH2 ), OPPB_HAEIN (P45054 ), OPPB_LACLA (P0A4N7 ), OPPB_LACLS (P0A4N8 ), OPPB_MYCGE (P47323 ), OPPB_MYCPN (P75554 ), OPPB_SALTY (P08005 ), OPPB_SHIFL (P0AFH5 ), OPPC_BACSU (P24139 ), OPPC_ECO57 (P0AFH7 ), OPPC_ECOLI (P0AFH6 ), OPPC_HAEIN (P45053 ), OPPC_LACLA (P0A4N9 ), OPPC_LACLS (P0A4P0 ), OPPC_MYCGE (P47324 ), OPPC_MYCPN (P75553 ), OPPC_SALTY (P08006 ), OPUAB_BACSU (P46921 ), OPUBB_BACSU (Q45461 ), OPUBD_BACSU (P39775 ), OPUCB_BACSU (O34878 ), OPUCB_LISM4 (G2JZ43 ), OPUCB_LISMN (Q9KHT8 ), OPUCD_BACSU (O34742 ), OPUCD_LISM4 (G2JZ41 ), OPUCD_LISMN (Q9KHT6 ), OSMW_SALTY (Q8ZPK3 ), OSMY_SALTY (Q8ZPK1 ), OUSW_DICD3 (E0SCY2 ), P69_MESHY (P15362 ), P69_MYCGE (P47533 ), P69_MYCPN (P75369 ), PATM_VIBHA (P52625 ), PHNE2_ECOLI (P0DP70 ), PHNE_ECOBD (A0A140NFA3), PHNE_MYCS2 (A0QQ68 ), PHNU_SALCH (Q57SD7 ), PHNU_SALPA (Q5PFQ6 ), PHNU_SALTI (Q8Z8W9 ), PHNU_SALTY (P96064 ), PHNV_SALCH (Q57SD8 ), PHNV_SALPA (Q5PFQ5 ), PHNV_SALTI (Q8Z8X0 ), PHNV_SALTY (P96065 ), POTB_ECOLI (P0AFK4 ), POTB_HAEIN (P45170 ), POTB_MYCGE (P47289 ), POTB_MYCPN (P75058 ), POTB_SALTI (P0A2J8 ), POTB_SALTS (E1WF94 ), POTB_SALTY (P0CL49 ), POTB_SHIFL (P0AFK5 ), POTC_ECO57 (P0AFK8 ), POTC_ECOL6 (P0AFK7 ), POTC_ECOLI (P0AFK6 ), POTC_HAEIN (P45169 ), POTC_MYCGE (P47290 ), POTC_MYCPN (P75057 ), POTC_SHIFL (Q83RR7 ), POTH_ECOLI (P31135 ), POTI_ECOL6 (P0AFL2 ), POTI_ECOLI (P0AFL1 ), PROW_ECOLI (P14176 ), PROW_SALTY (P17327 ), PSTA1_MYCTO (P9WG10 ), PSTA1_MYCTU (P9WG11 ), PSTA2_MYCBO (P0A627 ), PSTA2_MYCTO (P9WG08 ), PSTA2_MYCTU (P9WG09 ), PSTA_ECOLI (P07654 ), PSTA_HAEIN (P45190 ), PSTA_METJA (Q58419 ), PSTA_MYCGE (P47651 ), PSTA_MYCLE (Q50097 ), PSTA_MYCPN (P75185 ), PSTA_PASMU (Q9CNJ6 ), PSTA_RHILO (Q98FL4 ), PSTA_XYLFA (Q9PBK1 ), PSTA_XYLFT (Q87C89 ), PSTA_YERPE (P58655 ), PSTC1_MYCBO (P0A629 ), PSTC1_MYCTO (P9WG06 ), PSTC1_MYCTU (P9WG07 ), PSTC2_MYCBO (P0A631 ), PSTC2_MYCTO (P9WG04 ), PSTC2_MYCTU (P9WG05 ), PSTC_ECO57 (P0AGH9 ), PSTC_ECOLI (P0AGH8 ), PSTC_HAEIN (P45191 ), PSTC_METJA (Q58420 ), PSTC_MYCLE (Q50098 ), PSTC_PASMU (Q9CNJ5 ), PSTC_RHILO (Q98FL3 ), PSTC_SHIFL (P0AGI0 ), PSTC_XYLFA (Q9PBK2 ), PSTC_XYLFT (Q87C90 ), PTXC_STUST (O69053 ), RIBX_CHLAA (A9WGD1 ), SAPB_ECO57 (P0AGH4 ), SAPB_ECOLI (P0AGH3 ), SAPB_HAEIN (P45286 ), SAPB_SALTI (P0A2J4 ), SAPB_SALTY (P0A2J3 ), SAPC_ECOL6 (P0AGH6 ), SAPC_ECOLI (P0AGH5 ), SAPC_HAEIN (P45287 ), SAPC_SALTI (P0A2J6 ), SAPC_SALTY (P0A2J5 ), SAPC_SHIFL (P0AGH7 ), SSUC_BACSU (P40401 ), SSUC_ECOLI (P75851 ), SUGA_MYCTO (P9WG02 ), SUGA_MYCTU (P9WG03 ), SUGB_MYCTO (P9WG00 ), SUGB_MYCTU (P9WG01 ), SULP1_CHLRE (Q8RVC7 ), SULP2_CHLRE (Q6QJE2 ), TAUC_ECOLI (Q47539 ), TCYB_BACSU (P42200 ), TCYL_BACSU (O34315 ), TCYL_ECOL6 (P0AFT3 ), TCYL_ECOLI (P0AFT2 ), TCYL_SHIFL (P0AFT4 ), TCYM_BACSU (O34931 ), THIP_BRUA2 (Q2YLW7 ), THIP_BRUAB (Q57BC3 ), THIP_BRUME (Q8YJ03 ), THIP_BRUSU (Q8FYV0 ), THIP_ECOLI (P31549 ), THIP_HAEIN (P44985 ), THIP_SALTY (Q8ZRV1 ), THIX_HALH5 (Q9K9G6 ), TUPB_CAMJE (Q0P886 ), TUPB_PEPAC (Q93KD5 ), UGPA_AGRFC (Q7CRU3 ), UGPA_BRUA2 (Q2YKR6 ), UGPA_BRUAB (Q578E7 ), UGPA_BRUME (Q8YCA8 ), UGPA_BRUSU (Q8FW09 ), UGPA_ECO57 (Q7AA80 ), UGPA_ECOK1 (A1AGY3 ), UGPA_ECOL5 (Q0TC08 ), UGPA_ECOL6 (Q8FCQ0 ), UGPA_ECOLI (P10905 ), UGPA_ECOUT (Q1R5H6 ), UGPA_PECAS (Q6CZ32 ), UGPA_RHIME (Q92WD8 ), UGPA_SALCH (Q57IS1 ), UGPA_SALPA (Q5PJK9 ), UGPA_SALTI (Q8Z247 ), UGPA_SALTY (Q8ZLF2 ), UGPA_SHIDS (Q32AT4 ), UGPA_SHIF8 (Q0SZM0 ), UGPA_SHIFL (Q83PU6 ), UGPA_YERE8 (A1JID8 ), UGPA_YERPA (Q1CBH4 ), UGPA_YERPE (Q7CKV6 ), UGPA_YERPN (Q1CNC8 ), UGPA_YERPS (Q66FU6 ), UGPE_AGRFC (Q8UB30 ), UGPE_BRUA2 (Q2YKR7 ), UGPE_BRUAB (Q578E8 ), UGPE_BRUME (Q8YCB0 ), UGPE_BRUSU (Q8FW08 ), UGPE_ECO57 (Q8X4P0 ), UGPE_ECOK1 (A1AGY2 ), UGPE_ECOL5 (Q0TC09 ), UGPE_ECOL6 (Q8FCQ1 ), UGPE_ECOLI (P10906 ), UGPE_ECOUT (Q1R5H7 ), UGPE_PECAS (Q6CZ33 ), UGPE_RHIME (Q92WD7 ), UGPE_SALCH (Q57IS2 ), UGPE_SALPA (Q5PJL0 ), UGPE_SALTI (Q8Z246 ), UGPE_SALTY (Q8ZLF3 ), UGPE_SHIDS (Q32AT5 ), UGPE_SHIF8 (Q0SZM1 ), UGPE_SHIFL (Q83PU7 ), UGPE_YERE8 (A1JID9 ), UGPE_YERPA (Q1CBH3 ), UGPE_YERPE (Q7CKV5 ), UGPE_YERPN (Q1CNC7 ), UGPE_YERPS (Q66FU5 ), WTPB_ARCFU (O30143 ), WTPB_METJA (Q58763 ), WTPB_PYRAB (Q9V2C1 ), WTPB_PYRFU (Q8U4K4 ), WTPB_PYRHO (O57893 ), WTPB_THEKO (Q5JEB3 ), XACH_HALVD (D4GP36 ), XACI_HALVD (D4GP37 ), Y1031_BRUAB (Q8VQK4 ), Y1032_BRUAB (Q8VQK5 ), Y1038_PYRHO (O58759 ), Y1050_BRUA2 (Q2YJK1 ), Y1051_BRUA2 (Q2YJK0 ), Y1079_HAEIN (P45023 ), Y1092_BRUSU (Q8FUX0 ), Y1093_BRUSU (Q8FUW9 ), Y1215_PYRHO (O58968 ), Y1216_PYRHO (O58967 ), Y1282_MYCTO (P9WFZ8 ), Y1282_MYCTU (P9WFZ9 ), Y1283_MYCTO (P9WFZ6 ), Y1283_MYCTU (P9WFZ7 ), Y1313_MYCBO (P66965 ), Y1314_MYCBO (P66967 ), Y135_MYCPN (P75263 ), Y136_MYCPN (P75262 ), Y1475_HAEIN (Q57380 ), Y188_MYCGE (P47434 ), Y189_MYCGE (P47435 ), Y207_BRUME (Q8YDG8 ), Y209_BRUME (Q8YDG7 ), Y2550_BRUO2 (A5VU89 ), Y2551_BRUO2 (A5VU90 ), Y2783_BRUAB (Q578M9 ), Y2990_BRUA2 (Q2YL00 ), Y3094_BRUAB (Q577J7 ), Y3107_BRUME (Q8YDR8 ), Y3315_BRUA2 (Q2YK65 ), Y3407_BRUSU (Q8FWN9 ), Y3408_BRUSU (Q8FWN8 ), Y3424_BRUAB (Q576D9 ), Y355_HAEIN (Q57306 ), Y3648_BRUA2 (Q2YJB4 ), Y3749_BRUSU (Q8FVS6 ), Y3860_BRUME (Q8YBN9 ), Y3861_BRUME (Q8YBN8 ), Y413_METJA (Q57856 ), Y4188_BRUSU (Q8FUN2 ), Y4FN_SINFN (P55452 ), Y4OQ_SINFN (P55602 ), Y4OR_SINFN (P55603 ), Y4TF_SINFN (P55660 ), Y4TG_SINFN (P55661 ), Y4TP_SINFN (Q53191 ), Y4TQ_SINFN (Q53192 ), YCJO_ECOLI (P0AFR7 ), YCJO_SHIFL (P0AFR8 ), YCJP_ECOLI (P77716 ), YCKA_BACSU (P42399 ), YDCU_ECOLI (P77156 ), YDCV_ECOLI (P0AFR9 ), YDCV_SHIFL (P0AFS0 ), YEHW_ECOLI (P33359 ), YEHY_ECOLI (P33361 ), YEJB_ECO57 (P0AFU1 ), YEJB_ECOLI (P0AFU0 ), YEJE_ECOLI (P33915 ), YESP_BACSU (O31519 ), YESQ_BACSU (O31520 ), YHDX_ECOLI (P45767 ), YHDY_ECOLI (P45768 ), YJ16_PYRHO (O58760 ), YNJC_ECOLI (P76224 ), YOE1_STRAT (Q53683 ), YOR1_CALSR (P40979 ), YOR2_CALSR (P40980 ), YQGH_BACSU (P46339 ), YQGI_BACSU (P46340 ), YTCP_BACSU (P53561 ), YTEP_BACSU (C0SPB3 ), YTLD_BACSU (O34649 ), YURM_BACSU (O32154 ), YURN_BACSU (O32155 ), YVGM_BACSU (O32209 ), YXEN_BACSU (P54953 )» more
|
| PDB [Detailed view] |
18 PDB
2ONK; 2R6G; 3DHW; 3FH6; 3PUV; 3PUW; 3PUX; 3PUY; 3PUZ; 3PV0; 3RLF; 3TUI; 3TUJ; 3TUZ; 4JBW; 4KHZ; 4KI0; 6CVL » more |
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission