PROSITE logo

PROSITE entry PS50951


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry

Entry name [info] SARAH
Accession [info] PS50951
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-JAN-2004 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE;
29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC50951
Associated ProRule [info] PRU00310

Name and characterization of the entry

Description [info] SARAH domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3695838; R2=0.0147013; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2551.2155762; R2=1.7990315; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=452; H_SCORE=3364; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=281; H_SCORE=3057; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='V';  M=-10,-20,-21,-21,-14, 12,-29,-18, 12,-19, 10,  4,-20,-24,-20,-18,-15, -7, 14,-16,  5,-17;
/M: SY='A';  M=  8,-11,-20,-11,  0,-13,-13,-17, -2,-13,  3, -3,-13,-16, -9,-16, -6, -6,  1,-24,-14, -5;
/M: SY='Q';  M=-13, -5,-26, -7, 10, -2,-22, -3,-15,  0,-10, -5, -3,-15, 14,  0, -7, -9,-19,-15, -2, 13;
/M: SY='W';  M=-17,-32,-34,-33,-25, 24,-26,-15, -3,-22,  7, -3,-30,-30,-21,-18,-30,-18,-11, 61, 33,-21;
/M: SY='D';  M=-13,  7,-29, 10,  7,-22,-21, -9,-11,  4,-11, -8,  2,-14,  0,  0, -8, -9,-12,-28,-12,  2;
/M: SY='N';  M=  5,  1,-18, -8, -7,-10,-10, -8, -9, -4, -7, -4,  8,-18, -6, -6,  0, -3,-10,-25,-11, -7;
/M: SY='F';  M=-17,-31,-23,-38,-28, 56,-30,-21,  6,-29, 16,  4,-23,-29,-33,-21,-23,-12,  2, 13, 22,-27;
/M: SY='S';  M= -3,  8,-19,  7, 12,-23,-12,  3,-22, -3,-22,-15,  9,-10,  8, -5, 17, 12,-18,-34,-14,  9;
/M: SY='L';  M=-12,-28,-20,-34,-25, 25,-29,-18, 19,-25, 27, 22,-24,-27,-22,-19,-23, -9, 13,-13,  7,-23;
/M: SY='P';  M= -5, -2,-32,  6, 14,-30,-15,-13,-24, -5,-26,-20, -7, 42, -2,-14, -1, -7,-26,-31,-25,  4;
/M: SY='E';  M=-11,  9,-27, 19, 30,-26,-20, -5,-19,  1,-13,-14, -2, -9,  9, -6, -4, -9,-16,-31,-16, 19;
/M: SY='L';  M=-10,-29, -9,-30,-21,  8,-30,-21, 16,-30, 45, 17,-29,-31,-21,-21,-28,-10,  8,-22, -2,-21;
/M: SY='E';  M=-12, 10,-28, 12, 18,-28,-19,  5,-21,  6,-19,-11,  6,-11, 18,  5, -1, -6,-22,-28,-12, 17;
/M: SY='N';  M=  0,  7,-20,  1,  2,-21, -4, -4,-20,  2,-22,-11, 14,-13,  4,  2, 11,  4,-17,-30,-17,  3;
/M: SY='F';  M=-18,-23,-26,-29,-21, 34,-29,-10,  0,-11,  2,  1,-15,-26,-19,  3,-17,-10, -2,  1, 23,-21;
/M: SY='L';  M=-10,-17,-23,-16, -7, -5,-27,-15,  8,-15, 23,  9,-19,-23, -8,-12,-20, -9,  3,-23, -5, -8;
/M: SY='E';  M= -9, -4,-17, -3, 10,-22,-13,  1,-23,  1,-15,-10, -2,-14,  9,  7, -1, -3,-20,-27,-13,  8;
/M: SY='M';  M= -2,-13,-23,-19,-11,-12,-20,-12,  3, -1, -1,  8, -7,-17, -5,  2, -8, -6,  1,-23, -8,-10;
/M: SY='L';  M=-11,-29,-21,-30,-21, 10,-30,-16, 20,-27, 42, 21,-28,-29,-18,-19,-28,-10, 10,-16,  6,-20;
/M: SY='D';  M=-13, 19,-27, 25, 10,-30,-10, -3,-25,  7,-22,-12,  9,-13,  7, -1, -3, -9,-20,-31,-16,  9;
/M: SY='E';  M=-10, -5,-28, -3, 13,-23,-19,  0,-20, 10,-16, -6, -5,  1, 10, 10, -6, -8,-20,-25,-12, 10;
/M: SY='E';  M=-10, -3,-26,  2, 32,-17,-22, -4,-12, -1,  1, -1, -9, -9,  9, -6, -9,-10,-16,-26,-13, 20;
/M: SY='E';  M=-12, -9,-25, -9, 14,  1,-23, -3, -7, -6,  2,  8,-12,-14,  1, -8,-12,-10,-11,-16,  1,  8;
/M: SY='E';  M= -7,  7,-28, 12, 28,-28,-17, -4,-25, 17,-20,-10,  0, -7, 13,  5, -4, -9,-22,-26,-15, 20;
/M: SY='R';  M=-14, -1,-29,  2, 18,-28,-20,  1,-25, 17,-17, -9, -1,-13, 23, 27, -6,-10,-23,-23,-12, 19;
/M: SY='E';  M=-11,  7,-30, 14, 47,-26,-21,  8,-28, 10,-19,-16, -1, -4, 19,  2, -2,-11,-28,-25,-10, 32;
/M: SY='I';  M= -7,-29,-21,-34,-27,  3,-33,-25, 35,-26, 25, 20,-25,-25,-21,-23,-20, -7, 28,-23, -3,-26;
/M: SY='E';  M= -8, -6,-27, -5, 14,-12,-16, -1,-18,  0,-13, -8, -4,-13,  8,  3, -5,-10,-18,-20, -8, 10;
/M: SY='Q';  M=-10,  5,-28,  8, 21,-31,-18, -1,-26, 17,-23,-11,  2, -9, 25, 13,  1, -4,-24,-25,-13, 23;
/M: SY='I';  M= -9,-28,-25,-34,-25,  4,-35,-25, 34,-29, 31, 18,-23,-24,-19,-25,-22, -6, 20,-21, -1,-25;
/M: SY='R';  M= -7,-11,-21,-14, -7,-15,-23,-11, -2,  3, -5,  3, -9,-20,  2,  6, -7, -2,  4,-25, -9, -3;
/M: SY='R';  M=-10, -3,-28, -4,  9,-27,-14, -3,-23, 19,-19, -3, -2,-12, 19, 20, -4, -6,-20,-22,-11, 13;
/M: SY='K';  M=-13, -6,-29, -8,  2,-18,-21, -7,-24, 35,-21, -4, -3,-15,  6, 34,-11,-10,-16,-18, -7,  3;
/M: SY='Y';  M=-20,-22,-28,-23,-22, 38,-30, 14,  0,-13,  2,  0,-20,-30,-15,-12,-20,-10, -8, 27, 72,-22;
/M: SY='E';  M= -3,  8,-22,  4, 14,-24,-13, -3,-21,  6,-21,-13, 11,-10, 12,  5,  7,  4,-20,-29,-16, 13;
/M: SY='A';  M= 11, -6,-19, -9,  1,-19,-13,-10,-16,  7,-16, -9, -5,-12,  2,  2,  3,  0, -8,-20, -9,  1;
/M: SY='Y';  M=-13,-14,-18,-14, -5,  0,-26, -5,-10,  5, -2, -2,-14,-22, -6,  0,-16,-10,-10, -8, 16, -6;
/M: SY='R';  M=-19, -9,-30, -9,  1,-21,-20, -1,-30, 32,-21,-10,  0,-19, 10, 67,-10,-10,-20,-20,-10,  1;
/M: SY='Q';  M= -7, -4,-26, -7,  6,-23,-19,  3,-14,  4,-10, -1, -2,-16, 28, 10, -5, -8,-20,-19, -5, 16;
/M: SY='P';  M= -1,-13,-26,-14, -6,-19,-19,-10, -9,  1,-14, -4,-11, 12, -6, -3, -6, -4, -8,-25,-14, -8;
/M: SY='I';  M=-10,-29,-25,-35,-25,  4,-35,-24, 36,-28, 32, 23,-24,-24,-18,-25,-24,-10, 21,-20,  0,-25;
/M: SY='L';  M=-10,-13,-22,-13, -6, -6,-25,-13,  6,-15, 16,  6,-13,-22, -8,-10,-16, -8,  3,-25, -7, -7;
/M: SY='D';  M= -7, 11,-25, 17, 16,-28,-15, -4,-24,  5,-18,-14,  3,-10, 10,  2,  2, -2,-20,-29,-15, 13;
/M: SY='A';  M= 10, -7, -9, -8,  9,-21,-14,-12,-19,  2,-14,-12, -7,-13, -1,  3,  0, -6,-10,-26,-18,  3;
/M: SY='L';  M=-10,-26,-23,-30,-20,  3,-30,-18, 23,-21, 33, 26,-24,-25,-14,-17,-25,-10, 12,-20, -1,-18;
/M: SY='E';  M=-13, 10,-29, 13, 28,-28,-12, 15,-29,  6,-22,-15, 10,-10, 15,  7, -1,-11,-29,-29,-13, 20;
/M: SY='Q';  M=  5,  2,-22, -3,  8,-23,-12, -5,-15,  2,-17,-10,  7,-12,  9,  3,  4, -4,-15,-26,-16,  7;
/M: SY='R';  M=-11,-12,-16,-13, -5,-17,-23,-12,-14, 16, -9, -4, -8,-19, -2, 22,-11, -8, -8,-24,-10, -5;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_03 which contains 571'609 sequence entries.


Total number of hits 44 in 44 different sequences
Number of true positive hits 44 in 44 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] window20
Author [info] CJA_Sigrist
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] SARAH
Version [info] 5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
44 sequences

CST1_CAEBR  (A8XJW8), CST1_CAEEL  (Q9NB31), HIPPO_DROME (Q8T0S6), 
RASF1_CAEEL (Q22744), RASF1_HUMAN (Q9NS23), RASF1_MOUSE (Q99MK9), 
RASF2_HUMAN (P50749), RASF2_MOUSE (Q8BMS9), RASF2_RAT   (Q3B7D5), 
RASF3_HUMAN (Q86WH2), RASF3_MOUSE (Q99P51), RASF4_HUMAN (Q9H2L5), 
RASF4_MOUSE (Q8CB96), RASF4_RAT   (Q566C5), RASF5_HUMAN (Q8WWW0), 
RASF5_MOUSE (Q5EBH1), RASF5_RAT   (O35141), RASF6_HUMAN (Q6ZTQ3), 
RASF6_MOUSE (Q80UQ2), RASF6_RAT   (Q4QR82), SAV1_HUMAN  (Q9H4B6), 
SAV1_MOUSE  (Q8VEB2), SAV1_RAT(A4V8B4), SAV_DROME   (Q9VCR6), 
STK3_DANRE  (Q7ZUQ3), STK3_HUMAN  (Q13188), STK3_MOUSE  (Q9JI10), 
STK3_RAT(O54748), STK3_XENLA  (Q6IP06), STK4_AOTNA  (A4K2W5), 
STK4_BOVIN  (Q5E9L6), STK4_CHICK  (Q5ZJK4), STK4_CHLAE  (A4K2Y1), 
STK4_COLGU  (A4K2P5), STK4_DICDI  (O61125), STK4_HUMAN  (Q13043), 
STK4_LEMCA  (A4K2S1), STK4_MACMU  (A4K2T0), STK4_MOUSE  (Q9JI11), 
STK4_OTOGA  (A4K2Q5), STK4_PAPAN  (A4K2M3), STK4_SQUAC  (Q802A6), 
STK4_XENLA  (Q6PA14), STK4_XENTR  (Q6P3Q4)
» more

PDB
[Detailed view]
11 PDB

2JO8; 2YMY; 3WWS; 4HKD; 4L0N; 4LGD; 4NR2; 4OH8; 4OH9; 6AO5; 6BN1