PROSITE entry PS50951
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | SARAH |
| Accession [info] | PS50951 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-JAN-2004 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 08-NOV-2023 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50951 |
| Associated ProRule [info] | PRU00310 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | SARAH domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3695838; R2=0.0147013; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2551.2155762; R2=1.7990315; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=452; H_SCORE=3364; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=281; H_SCORE=3057; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='V'; M=-10,-20,-21,-21,-14, 12,-29,-18, 12,-19, 10, 4,-20,-24,-20,-18,-15, -7, 14,-16, 5,-17; /M: SY='A'; M= 8,-11,-20,-11, 0,-13,-13,-17, -2,-13, 3, -3,-13,-16, -9,-16, -6, -6, 1,-24,-14, -5; /M: SY='Q'; M=-13, -5,-26, -7, 10, -2,-22, -3,-15, 0,-10, -5, -3,-15, 14, 0, -7, -9,-19,-15, -2, 13; /M: SY='W'; M=-17,-32,-34,-33,-25, 24,-26,-15, -3,-22, 7, -3,-30,-30,-21,-18,-30,-18,-11, 61, 33,-21; /M: SY='D'; M=-13, 7,-29, 10, 7,-22,-21, -9,-11, 4,-11, -8, 2,-14, 0, 0, -8, -9,-12,-28,-12, 2; /M: SY='N'; M= 5, 1,-18, -8, -7,-10,-10, -8, -9, -4, -7, -4, 8,-18, -6, -6, 0, -3,-10,-25,-11, -7; /M: SY='F'; M=-17,-31,-23,-38,-28, 56,-30,-21, 6,-29, 16, 4,-23,-29,-33,-21,-23,-12, 2, 13, 22,-27; /M: SY='S'; M= -3, 8,-19, 7, 12,-23,-12, 3,-22, -3,-22,-15, 9,-10, 8, -5, 17, 12,-18,-34,-14, 9; /M: SY='L'; M=-12,-28,-20,-34,-25, 25,-29,-18, 19,-25, 27, 22,-24,-27,-22,-19,-23, -9, 13,-13, 7,-23; /M: SY='P'; M= -5, -2,-32, 6, 14,-30,-15,-13,-24, -5,-26,-20, -7, 42, -2,-14, -1, -7,-26,-31,-25, 4; /M: SY='E'; M=-11, 9,-27, 19, 30,-26,-20, -5,-19, 1,-13,-14, -2, -9, 9, -6, -4, -9,-16,-31,-16, 19; /M: SY='L'; M=-10,-29, -9,-30,-21, 8,-30,-21, 16,-30, 45, 17,-29,-31,-21,-21,-28,-10, 8,-22, -2,-21; /M: SY='E'; M=-12, 10,-28, 12, 18,-28,-19, 5,-21, 6,-19,-11, 6,-11, 18, 5, -1, -6,-22,-28,-12, 17; /M: SY='N'; M= 0, 7,-20, 1, 2,-21, -4, -4,-20, 2,-22,-11, 14,-13, 4, 2, 11, 4,-17,-30,-17, 3; /M: SY='F'; M=-18,-23,-26,-29,-21, 34,-29,-10, 0,-11, 2, 1,-15,-26,-19, 3,-17,-10, -2, 1, 23,-21; /M: SY='L'; M=-10,-17,-23,-16, -7, -5,-27,-15, 8,-15, 23, 9,-19,-23, -8,-12,-20, -9, 3,-23, -5, -8; /M: SY='E'; M= -9, -4,-17, -3, 10,-22,-13, 1,-23, 1,-15,-10, -2,-14, 9, 7, -1, -3,-20,-27,-13, 8; /M: SY='M'; M= -2,-13,-23,-19,-11,-12,-20,-12, 3, -1, -1, 8, -7,-17, -5, 2, -8, -6, 1,-23, -8,-10; /M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-30,-21, 10,-30,-16, 20,-27, 42, 21,-28,-29,-18,-19,-28,-10, 10,-16, 6,-20; /M: SY='D'; M=-13, 19,-27, 25, 10,-30,-10, -3,-25, 7,-22,-12, 9,-13, 7, -1, -3, -9,-20,-31,-16, 9; /M: SY='E'; M=-10, -5,-28, -3, 13,-23,-19, 0,-20, 10,-16, -6, -5, 1, 10, 10, -6, -8,-20,-25,-12, 10; /M: SY='E'; M=-10, -3,-26, 2, 32,-17,-22, -4,-12, -1, 1, -1, -9, -9, 9, -6, -9,-10,-16,-26,-13, 20; /M: SY='E'; M=-12, -9,-25, -9, 14, 1,-23, -3, -7, -6, 2, 8,-12,-14, 1, -8,-12,-10,-11,-16, 1, 8; /M: SY='E'; M= -7, 7,-28, 12, 28,-28,-17, -4,-25, 17,-20,-10, 0, -7, 13, 5, -4, -9,-22,-26,-15, 20; /M: SY='R'; M=-14, -1,-29, 2, 18,-28,-20, 1,-25, 17,-17, -9, -1,-13, 23, 27, -6,-10,-23,-23,-12, 19; /M: SY='E'; M=-11, 7,-30, 14, 47,-26,-21, 8,-28, 10,-19,-16, -1, -4, 19, 2, -2,-11,-28,-25,-10, 32; /M: SY='I'; M= -7,-29,-21,-34,-27, 3,-33,-25, 35,-26, 25, 20,-25,-25,-21,-23,-20, -7, 28,-23, -3,-26; /M: SY='E'; M= -8, -6,-27, -5, 14,-12,-16, -1,-18, 0,-13, -8, -4,-13, 8, 3, -5,-10,-18,-20, -8, 10; /M: SY='Q'; M=-10, 5,-28, 8, 21,-31,-18, -1,-26, 17,-23,-11, 2, -9, 25, 13, 1, -4,-24,-25,-13, 23; /M: SY='I'; M= -9,-28,-25,-34,-25, 4,-35,-25, 34,-29, 31, 18,-23,-24,-19,-25,-22, -6, 20,-21, -1,-25; /M: SY='R'; M= -7,-11,-21,-14, -7,-15,-23,-11, -2, 3, -5, 3, -9,-20, 2, 6, -7, -2, 4,-25, -9, -3; /M: SY='R'; M=-10, -3,-28, -4, 9,-27,-14, -3,-23, 19,-19, -3, -2,-12, 19, 20, -4, -6,-20,-22,-11, 13; /M: SY='K'; M=-13, -6,-29, -8, 2,-18,-21, -7,-24, 35,-21, -4, -3,-15, 6, 34,-11,-10,-16,-18, -7, 3; /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-23,-22, 38,-30, 14, 0,-13, 2, 0,-20,-30,-15,-12,-20,-10, -8, 27, 72,-22; /M: SY='E'; M= -3, 8,-22, 4, 14,-24,-13, -3,-21, 6,-21,-13, 11,-10, 12, 5, 7, 4,-20,-29,-16, 13; /M: SY='A'; M= 11, -6,-19, -9, 1,-19,-13,-10,-16, 7,-16, -9, -5,-12, 2, 2, 3, 0, -8,-20, -9, 1; /M: SY='Y'; M=-13,-14,-18,-14, -5, 0,-26, -5,-10, 5, -2, -2,-14,-22, -6, 0,-16,-10,-10, -8, 16, -6; /M: SY='R'; M=-19, -9,-30, -9, 1,-21,-20, -1,-30, 32,-21,-10, 0,-19, 10, 67,-10,-10,-20,-20,-10, 1; /M: SY='Q'; M= -7, -4,-26, -7, 6,-23,-19, 3,-14, 4,-10, -1, -2,-16, 28, 10, -5, -8,-20,-19, -5, 16; /M: SY='P'; M= -1,-13,-26,-14, -6,-19,-19,-10, -9, 1,-14, -4,-11, 12, -6, -3, -6, -4, -8,-25,-14, -8; /M: SY='I'; M=-10,-29,-25,-35,-25, 4,-35,-24, 36,-28, 32, 23,-24,-24,-18,-25,-24,-10, 21,-20, 0,-25; /M: SY='L'; M=-10,-13,-22,-13, -6, -6,-25,-13, 6,-15, 16, 6,-13,-22, -8,-10,-16, -8, 3,-25, -7, -7; /M: SY='D'; M= -7, 11,-25, 17, 16,-28,-15, -4,-24, 5,-18,-14, 3,-10, 10, 2, 2, -2,-20,-29,-15, 13; /M: SY='A'; M= 10, -7, -9, -8, 9,-21,-14,-12,-19, 2,-14,-12, -7,-13, -1, 3, 0, -6,-10,-26,-18, 3; /M: SY='L'; M=-10,-26,-23,-30,-20, 3,-30,-18, 23,-21, 33, 26,-24,-25,-14,-17,-25,-10, 12,-20, -1,-18; /M: SY='E'; M=-13, 10,-29, 13, 28,-28,-12, 15,-29, 6,-22,-15, 10,-10, 15, 7, -1,-11,-29,-29,-13, 20; /M: SY='Q'; M= 5, 2,-22, -3, 8,-23,-12, -5,-15, 2,-17,-10, 7,-12, 9, 3, 4, -4,-15,-26,-16, 7; /M: SY='R'; M=-11,-12,-16,-13, -5,-17,-23,-12,-14, 16, -9, -4, -8,-19, -2, 22,-11, -8, -8,-24,-10, -5; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 44 in 44 different sequences |
| Number of true positive hits | 44 in 44 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | window20 |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | SARAH |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
44 sequences
CST1_CAEBR (A8XJW8), CST1_CAEEL (Q9NB31), HIPPO_DROME (Q8T0S6), RASF1_CAEEL (Q22744), RASF1_HUMAN (Q9NS23), RASF1_MOUSE (Q99MK9), RASF2_HUMAN (P50749), RASF2_MOUSE (Q8BMS9), RASF2_RAT (Q3B7D5), RASF3_HUMAN (Q86WH2), RASF3_MOUSE (Q99P51), RASF4_HUMAN (Q9H2L5), RASF4_MOUSE (Q8CB96), RASF4_RAT (Q566C5), RASF5_HUMAN (Q8WWW0), RASF5_MOUSE (Q5EBH1), RASF5_RAT (O35141), RASF6_HUMAN (Q6ZTQ3), RASF6_MOUSE (Q80UQ2), RASF6_RAT (Q4QR82), SAV1_HUMAN (Q9H4B6), SAV1_MOUSE (Q8VEB2), SAV1_RAT(A4V8B4), SAV_DROME (Q9VCR6), STK3_DANRE (Q7ZUQ3), STK3_HUMAN (Q13188), STK3_MOUSE (Q9JI10), STK3_RAT(O54748), STK3_XENLA (Q6IP06), STK4_AOTNA (A4K2W5), STK4_BOVIN (Q5E9L6), STK4_CHICK (Q5ZJK4), STK4_CHLAE (A4K2Y1), STK4_COLGU (A4K2P5), STK4_DICDI (O61125), STK4_HUMAN (Q13043), STK4_LEMCA (A4K2S1), STK4_MACMU (A4K2T0), STK4_MOUSE (Q9JI11), STK4_OTOGA (A4K2Q5), STK4_PAPAN (A4K2M3), STK4_SQUAC (Q802A6), STK4_XENLA (Q6PA14), STK4_XENTR (Q6P3Q4)» more
|
| PDB [Detailed view] |
11 PDB
2JO8; 2YMY; 3WWS; 4HKD; 4L0N; 4LGD; 4NR2; 4OH8; 4OH9; 6AO5; 6BN1 |