PROSITE entry PS51007
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS51007
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | CYTC |
Accession [info] | PS51007 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-JUL-2004 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC00169 |
Associated ProRule [info] | PRU00433 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | Cytochrome c family profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=88; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=83; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.1197873; R2=0.0107271; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=674; N_SCORE=7.1; MODE=1; TEXT='R'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=571; N_SCORE=6.0; MODE=1; TEXT='R?'; /DEFAULT: M0=-6; D=-20; I=-20; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='G'; M= 9, -1,-27, 0, 1,-24, 14,-14,-10, -2,-11, -7, -4, -1, 2,-11, 0, -4,-13,-20,-21, 0; /M: SY='D'; M= 2, 21,-21, 40, 6,-29,-11,-16,-21, -1, -5,-13, 2,-11, -1, -7, -1, -4,-12,-31, -8, 2; /M: SY='A'; M= 15, -8,-21, -9, -8, -8,-12,-16, 11, -6, 2, 5, -7,-12, -5,-13, 0, 8, 13,-36,-12, -9; /M: SY='A'; M= 15, 0,-21, 3, 8,-20, -8,-16, -9, 6,-10, 2, -1, -7, 6, -2, 3, -1, -3,-31,-21, 6; /M: SY='R'; M= 5, 1,-21, 4, 2,-17,-11, -8,-14, 5,-12, 1, 2, -7, 10, 12, 0, -5, -9,-30,-15, 3; /M: SY='G'; M= 1, -1,-39,-10,-18,-30, 73,-28,-10, -9,-20,-19, -1, -8,-17,-19, 1,-18,-29, 7,-30,-18; /M: SY='E'; M= 4, -5,-19, -1, 17,-13,-11,-13,-17, 14, -9, 0, -7, -1, 7, 0, -1,-10,-12,-16,-11, 13; /M: SY='Q'; M= 7, 0,-24, 2, 7,-19,-12, -9,-12, 6,-10, 0, -1, -3, 14, -1, 1, 1,-11,-27,-13, 8; /M: SY='I'; M= 3,-14,-15,-19,-18, 7,-18,-19, 28,-14, 17, 9,-12,-26,-17,-17,-10, 4, 24,-28, 6,-17; /M: SY='F'; M=-17,-27,-35,-36,-31, 69,-26,-23, -1, -9, 17,-14,-15,-32,-21, -7,-10,-14, 10, 13, 36,-31; /I: I=-3; MD=-14; /M: SY='N'; M= 2, 3,-18, 0, 0, -9,-11, -6, -7, 4, -9, 0, 7, -8, 0, -1, 1, 0, -7,-28,-11, -1; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14; /M: SY='A'; M= 10, 0,-24, -5, 1,-19, 3,-14, -8, 4,-13, -1, 4, -2, 7, -4, 1, 1,-12,-28,-22, 1; /M: SY='N'; M= 4, 7,-22, 1, -4,-14, -5,-10, -7, 1,-14, -2, 16,-14, 1, -2, 3, 3,-10,-33,-18, -4; /M: SY='C'; M=-28,-19,165,-29, 10,-30,-39,-49,-19,-29, 0,-19,-10,-29,-19,-20,-19,-19,-19,-21,-59, 0; /M: SY='A'; M= 21, -4,-55, -7, -6,-13, -1,-19, 7, -3, -5, 6, -1,-15, -3,-12, 6, 7, 9,-37,-24, -7; /M: SY='A'; M= 16, -3,-25, -6, -3,-17, 4,-13, -4, -3,-11, -3, 0,-10, 5, -9, 11, 8, -5,-30,-24, -3; /M: SY='C'; M=-30,-20,170,-30, 10,-30,-40,-50,-20,-30, 0,-20,-10,-30,-20,-20,-20,-20,-20,-20,-60, 0; /M: SY='H'; M=-20,-20,-50,-20, 0,-30,-30,140,-20,-20,-10, 20,-10, 10, 0,-10,-10,-20,-30,-50, 0, 0; /M: SY='G'; M= 9, 1,-27, -3, -9,-21, 15,-19, -5, -3,-11, -5, 3,-11, -4,-12, 11, 4, -8,-24,-20, -8; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='I'; M= 4, -8,-29,-11,-11, -5,-11,-11, 11, -8, 2, -1, -4,-11, -7,-11, -3, 5, 9,-25, -5,-11; D=-2; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='D'; M= 0, 8,-25, 9, 4,-20, 2,-11,-12, 1, -9, -7, 7, -6, 0, -7, -1, -5,-15,-17,-14, 2; D=-2; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='K'; M= 0, -4,-13, -5, 1, -9, -1, -3, -7, 3, -7, -2, -3, 3, 2, 1, -2, -4, -9,-11, -7, 0; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11; /M: SY='G'; M= 2, -1,-24, -5, -9,-17, 31,-17, -7, -5,-12,-11, 0, -5, -6,-11, 0, -7,-15, 0,-16, -9; D=-2; /I: I=-2; DM=-11; /M: SY='G'; M= 4, 3,-22, 3, 0,-20, 17,-10,-10, -2,-10, -6, 1, -7, -3, -9, 1, -7,-15,-15,-17, -2; D=-2; /I: I=-2; DM=-11; /M: SY='G'; M= 3, 0,-28, -4, -4,-18, 17,-18, -8, 2,-13, -7, 1, 0, -4, -8, 0, -5,-14,-17,-18, -6; D=-2; /I: I=-2; DM=-11; /M: SY='N'; M= 1, 6,-24, -2, -7,-18, 5, -7, -6, -4,-14, -6, 16, -9, -2,-10, 0, 1,-14,-30,-19, -6; /M: SY='A'; M= 6, -2,-28, -2, -3,-15, 3,-18, -8, 6,-11, 0, -3, -7, -2, 2, 1, -5, -7,-22,-15, -5; /M: SY='V'; M= 7,-10,-22,-15,-19, -4,-10,-21, 16,-11, 2, 1, -5,-22,-13,-13, -2, 9, 18,-27, -6,-17; /M: SY='G'; M= 4, -3,-33,-11,-15,-14, 37,-22, -4, -7, -9, -8, 0,-15,-11,-15, -2,-10,-14, -7,-19,-14; /M: SY='P'; M= -7,-15,-28, -8, 6,-31, -5, 1,-23, 8,-22,-28,-23, 74, -3, -8, -8, -2,-30,-26,-16, -2; /M: SY='N'; M= 3, 10,-17, 5, 3,-18, -5, -5, -8, 1,-10, -3, 17,-10, -2,-13, 1, 0,-14,-37,-20, 1; /M: SY='L'; M= -4, -9,-15,-11, -9, 7,-12,-13, 11,-10, 17, 9,-13,-20,-12,-14,-11, -2, 5,-16, 12,-10; /M: SY='T'; M= 3, -2,-26, -3, -4,-14, -6,-10, -9, -1,-10, -6, 1, -1, 2, -7, 2, 4, -8,-24,-11, -4; /M: SY='G'; M= -4, 0,-24, -1, -3,-20, 20,-17,-12, -2,-11,-12, -3, 4,-11,-14, -3, -8,-21, -9,-13, -7; /M: SY='I'; M= 1, -8,-22,-10, -9, -2,-16, -9, 6, -6, 2, 1, -7,-11, -9,-10, -3, 3, 5,-27, -1,-10; /M: SY='I'; M= -1,-12,-27,-15,-12, 0, -1,-17, 2, -5, 0, -2, -9,-16,-12,-12, -3, -3, 1, -7, 0,-13; /M: SY='G'; M= 2, 0,-25, 1, 1,-19, 13,-17,-13, 1,-12,-10, -3, -5, -3, -8, 2, -7,-16,-12,-14, -1; /M: SY='R'; M= 2, -6,-20, -3, -1,-16,-13,-12,-15, 7,-14, 0, -5, -7, 13, 24, -3, -9, -9,-18,-11, 2; /M: SY='Y'; M= -5, -8,-25, -5, -4, -5,-15, -7, -5, -2, 2, 0,-11,-10, -4, -6, -5, -2, -2,-11, 7, -5; /M: SY='A'; M= 5, -1,-20, 1, -1,-14,-10,-12, -5, -2, -4, -4, -4, -9, -4, -8, 5, 5, -2,-28, -8, -4; /M: SY='G'; M= 3, -4,-28, -5, -6,-17, 14,-18, -8, -2, -9, -8, -6, -5, -4, -7, 0, -6,-11,-14,-14, -6; /I: I=-1; MD=-7; /M: SY='T'; M= 2, 0,-26, 0, -5,-12, -9,-12, -7, -1, -5, -4, 1, -5, 0, -9, 0, 5, -6,-24, -6, -4; D=-1; /I: I=-1; MD=-7; /M: SY='A'; M= 5, -4,-22, -5, -4,-14, 0,-15, -4, -2, -8, -5, -4, -7, -1, -6, 1, 0, -5,-21,-13, -4; D=-1; /I: I=-1; MD=-7; /M: SY='E'; M= -3, -5,-20, -2, 1,-11,-10,-11, -7, 0, -2, -7, -8, 1, -6,-10, -6, -5, -8,-16, -4, -3; D=-1; /I: I=-1; MD=-7; /M: SY='G'; M= -1, 0,-14, -1, -5, -3, 1,-10, -2, -3, -1, -3, 0, -7, -5, -6, -3, -2, -4,-10, -2, -6; D=-1; /I: I=-1; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7; /M: SY='N'; M= 5, 8,-14, 7, -3,-13, -5,-11, -6, -1, -7, -5, 11, -8, -1,-10, 6, 10, -5,-28,-13, -3; D=-1; /I: I=-1; DM=-7; /M: SY='E'; M= 1, -3,-14, 0, 9,-16,-10, -6, -9, 4, -6, -5, -5, 2, 1, -7, 1, -3, -9,-17, -9, 5; D=-1; /I: I=-1; DM=-7; /M: SY='D'; M= 7, 11,-16, 20, 20,-30,-11,-11,-20, 9,-11, -6, 2, -2, 7, -8, 3, -4,-16,-30,-18, 15; /M: SY='D'; M= 6, 4,-23, 7, -2,-18, -4,-14, -7, -2, -5, -3, 0,-12, -3, -9, 1, 0, -4,-26,-12, -3; /M: SY='I'; M= -5,-16,-15,-22,-20, 12,-19,-16, 25,-16, 23, 8,-14,-28,-17,-15,-13, -1, 20,-19, 4,-19; /M: SY='K'; M= 2, -5,-23, -5, 0, -9,-12, -9, -4, 4, -4, 1, -3, -9, -4, -6, 0, -2, -2,-24, -7, -3; /M: SY='D'; M= 5, 4,-24, 9, 4,-16, -7,-15,-13, 5, -7, -3, 0, -7, 2, -4, 0, -3, -8,-25,-11, 2; /M: SY='Y'; M=-10,-18,-31,-19,-14, 10,-11,-18, 0, -8, 5, -6,-17,-19, -3, -6, -9, -5, 2, 12, 19,-12; /M: SY='I'; M= 0,-12,-16,-17,-15, 5,-17,-14, 22,-11, 17, 12,-10,-25,-15,-15,-10, 2, 17,-26, 6,-15; /M: SY='Q'; M= 1, -7,-21, -5, 1,-13,-12,-11,-12, 6, -8, 3, -8, -6, 7, 7, 1, -1, -7,-17, -5, 2; /M: SY='N'; M= -1, 16,-25, 12, -5,-21, 6, -6,-12, -2,-13, -8, 23,-13, -6,-12, -1, -2,-18,-34,-19, -6; /M: SY='P'; M= 0, -7,-31, -8, -3,-30, 25,-10,-16, 0,-21,-19, -8, 29, -6,-13, -3, -8,-27,-14,-24, -6; /M: SY='K'; M= 3, -2,-19, -3, 3,-16, -9,-14,-11, 10,-11, 5, 1, -2, 2, 0, 0, -1,-10,-27,-14, 1; /M: SY='G'; M= 5, 2,-26, -3, -2,-18, 10,-16, -8, 5,-16, -4, 6, -2, -3, -5, 1, -3,-14,-25,-21, -4; /M: SY='K'; M= 1, -5,-31, -4, -6,-12, 0, -9, -6, 2, -4, 0, -5, -6, -7, -8, -4, -4, -7,-18, -5, -8; /I: I=-1; MD=-8; /M: SY='T'; M= -1, -3,-14, -2, -5, -7, -8, -2, -1, -3, -1, -2, -3, -5, -1, -2, -3, 1, 0,-12, 1, -5; D=-1; /I: I=-1; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8; /M: SY='P'; M= 0, -5,-15, -4, 2,-12, -1, -2, -9, 2,-10,-12, -6, 23, 1, -4, -1, 0,-12,-13, -9, -1; D=-1; /I: I=-1; DM=-8; /M: SY='G'; M= 2, -1,-18, -4, -7,-13, 19,-12, -4, -2, -7, -4, 1, -6, -6, -8, -1, -5, -9, -5,-13, -7; D=-1; /I: I=-1; DM=-8; /M: SY='T'; M= 3, -4,-14, -7, -7,-10, -4,-10, 2, -2, -2, 1, -1, -5, -3, -8, 1, 6, 1,-16, -7, -6; D=-1; /I: I=-1; DM=-8; /M: SY='M'; M= 5,-12,-20,-16, -3,-14,-13, 1, 2, 13, 3, 24, -4,-11, -5, -1, -9, -1, -2,-24, -9, -5; D=-1; /I: I=-1; DM=-8; /M: SY='P'; M= 1,-12,-20,-11, -1,-21,-11, 0,-10, 7, -7, 1,-10, 19, -1, -5, -6, 2,-13,-24,-12, -3; D=-1; /I: I=-1; DM=-8; /M: SY='A'; M= 9, -7,-27, -9, -9,-15, 2,-12, -1, -2, -7, -1, -5, -7, -4, -7, -1, -1, -3,-24,-17, -9; /M: SY='F'; M=-11,-18,-28,-26,-18, 29,-16,-13, -3, -5, 4,-10, -8,-14,-13,-10, -6, -7, -2, -2, 11,-19; /M: SY='A'; M= 7, -4,-30, -3, -6,-13, 3,-12, -9, -2, -9, -7, -4, -2, -4,-10, 1, -1, -8,-21,-14, -8; /M: SY='G'; M= 2, -2,-32, -5,-10,-17, 23,-20,-12, -1,-15,-13, -2, 2, -7, -8, 0, -8,-17,-14,-19,-11; /M: SY='R'; M= -4, -3,-19, -3, 0,-12,-12, -3, -7, 2, -5, 3, -2,-10, 5, 9, -7,-10, -9,-23, -6, 0; /M: SY='L'; M= -7,-12, -8,-12, -4, 4,-16,-11, 6, -4, 16, 12,-15,-13,-13,-11,-14, -4, 0,-16, 11, -7; /M: SY='S'; M= 8, 7,-21, 3, -1,-16, -6,-14, -9, 5,-14, -4, 11, -8, -4,-11, 17, 15, -8,-37,-19, -4; /M: SY='D'; M= 2, 12,-20, 28, 15,-34, -9,-10,-26, 7,-14,-17, -2, 13, 1, -7, -1, -7,-20,-30,-17, 8; /M: SY='E'; M= 6, 8,-16, 17, 20,-29,-10,-11,-21, 8,-12,-10, 0, 0, 12, -5, 3, -4,-18,-25,-17, 16; /M: SY='D'; M= 2, 18,-15, 37, 26,-40,-12,-10,-30, 7,-11,-16, -1, -2, 14, -4, -1,-11,-24,-23,-15, 22; /M: SY='I'; M= 1,-16,-19,-23,-17, -1,-14,-15, 21, -7, 9, 12, -9,-24, -8, -1,-10, -5, 17,-20, -2,-16; /M: SY='D'; M= 10, 7,-22, 15, 11,-25, -7,-12,-16, 6,-11, -3, 0, -5, 6, -2, 1, -5,-11,-30,-19, 8; /M: SY='D'; M= 7, 24,-25, 36, 4,-28, -5,-16,-19, 2,-11,-10, 14,-13, -4,-10, 2, -1,-13,-36,-18, -1; /M: SY='I'; M= 1,-15,-13,-20,-20, 10,-20,-17, 32,-17, 23, 13,-13,-32,-21,-18,-13, 4, 27,-27, 10,-20; /M: SY='I'; M= 13,-11,-25,-14,-12, -7, -8,-18, 16, -8, 2, 5, -7,-17, -6,-13, 0, 5, 16,-27,-12,-13; /M: SY='A'; M= 22, 3,-22, 3, 7,-21, -3,-16, -7, 4,-11, 3, 4, -8, 7, -8, 7, 4, -3,-39,-29, 5; /M: SY='Y'; M=-35,-30,-50,-18,-21, 34,-27, -3,-10,-10, 23,-10,-35,-23,-11, 1,-19,-15, 5, 46, 70,-20; /M: SY='I'; M= -3,-16,-13,-22,-20, 14,-19,-15, 31,-17, 26, 13,-13,-32,-21,-19,-14, 1, 24,-22, 14,-20; /M: SY='M'; M= 2, -5,-20, -5, 2, -8,-11,-10, -5, 5, -3, 7, -5,-10, 3, 2, -4, -3, -7,-23, -5, 1; /M: SY='S'; M= 5, 0,-25, 0, -2,-19, -1, -9,-12, -1,-12, -8, -1, -6, 1, -9, 10, 6,-11,-24,-14, -2; /M: SY='Q'; M= 1, -6,-16, -7, -3, -4,-16,-11, -1, -6, 5, 2, -7,-15, 9, -2, -6, 3, -3,-21, 3, 1; /M: SY='P'; M= 6, -3,-24, 0, 6,-19, -8,-12,-13, 7,-13, -4, -5, 8, 0, -7, 5, 3,-11,-24,-15, 1; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 500 in 437 different sequences |
Number of true positive hits | 499 in 436 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 1 |
Number of false negative sequences | 16 |
Number of 'partial' sequences | 5 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 99.80 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 96.89 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria) |
Maximum number of repetitions [info] | 3 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | window20 |
Author [info] | N_Hulo |
Feature key [info] | DOMAIN |
Feature description [info] | Cytochrome c |
Version [info] | 3 |
Cross-references [info]