PROSITE entry PS51009

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	CYTCII
Accession [info]	PS51009
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-AUG-2004 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC00169

Name and characterization of the entry

Description [info]

Cytochrome c class II profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=126;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=121;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.3845448; R2=0.0141961; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=7732.9521484; R2=4.7280264; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=502; H_SCORE=10106; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=361; H_SCORE=9440; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='D';  M= -6, 20,-28, 30, 20,-32,  0,  1,-33, -2,-24,-22,  7, -9,  2, -9,  1,-11,-27,-31,-19, 11;
/M: SY='V';  M= -6,-28,-19,-32,-27,  0,-33,-21, 32,-24, 17, 14,-24,-26,-23,-22,-16, -6, 33,-25, -3,-27;
/M: SY='L';  M=  3,-16,-18,-18, -8, -5,-22,-13,  3,-13,  7,  2,-17,-20, -7,-13, -7,  0,  5,-18,  0, -8;
/M: SY='E';  M= -8, 11,-29, 18, 32,-30,-17,  2,-30, 17,-24,-17,  3, -6, 12,  5, -3,-10,-25,-28,-15, 22;
/M: SY='Y';  M=  1,-14,-24,-17,-10, -2,-19, -5, -9, -1, -7, -4,-14,-19, -4, -6, -9, -4,-10,  6, 19, -8;
/M: SY='R';  M=-18, -9,-28,-10, -1,-19,-20, -2,-28, 27,-19,-10,  0,-19,  8, 63, -7, -5,-18,-21,-10, -1;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  1, 20,-34,-21,  1,-20, 17,-20, -4, -1, -9, 38, 11, -4,-10,-24,-21,-11, 29;
/M: SY='S';  M= 14, -2,-18, -4, -4,-25, 13,-13,-24, -6,-24,-16,  2,-12, -3,-11, 15,  0,-15,-28,-21, -4;
/M: SY='L';  M=  8,-20,-19,-24,-18, -1,-12,-13,  5,-17, 10,  7,-18,-22,-14,-18,-11, -7,  4,-12,  4,-17;
/M: SY='F';  M=-14,-25,-22,-31,-22, 26,-27, -8, 12,-21, 24, 25,-23,-27,-17,-15,-23,-10,  5, -6, 19,-19;
/M: SY='K';  M= -5,  1,-24,  0, 11,-27,-16, -7,-24, 22,-25,-11,  2, -9, 14, 12,  5,  3,-18,-26,-13, 13;
/M: SY='T';  M=  0, -9,-19,-10, -7, -8,-19,-13, -5, -9, -1, -2, -9,-18, -3,-10, -2,  1, -1,-24, -8, -4;
/M: SY='M';  M= -8,-18,-20,-25,-19, -1,-25,-14, 20,-19, 19, 23,-14,-22,-12,-17,-14, -3, 12,-24, -4,-17;
/M: SY='G';  M=  7, -8,-25,-10,-13,-27, 39,-10,-32,-11,-26,-16,  0,-17,-12,-14,  3,-13,-22,-22,-22,-13;
/M: SY='W';  M= -8, -5,-29, -6, -6,-16,  4,-12,-25, -6,-22,-17,  0,-19, -7, -4, -4,-11,-23,  9, -9, -6;
/M: SY='H';  M=  1,  7,-21,  1,  3,-20,-10, 17,-19, -3,-21,-10, 14,-15,  9, -4,  7, -3,-21,-27, -5,  5;
/M: SY='M';  M=-11,-21,-21,-30,-21, 14,-22, -9,  9,-14, 11, 34,-19,-21,-10,-13,-17, -4,  4, -1,  7,-14;
/M: SY='G';  M= -1, -4,-27, -4, -8,-27, 25,-14,-30,  3,-24,-10, -1,-16, -8, -4, -4,-14,-21,-21,-20, -8;
/M: SY='P';  M= 11,-14,-24,-15, -5,-22,-13,-16,-15,  2,-17,-11,-12, 13, -6,  1, -3, -5, -9,-24,-19, -8;
/M: SY='L';  M= -9,-28,-22,-33,-24,  5,-31,-20, 29,-26, 33, 27,-25,-25,-17,-21,-24, -9, 18,-21, -1,-22;
/M: SY='A';  M= 17, -6,-18,-11, -9,-23, 14,-17,-22, -4,-21,-14, -3,-13, -9,-10,  9,  1,-12,-23,-20, -9;
/M: SY='A';  M= 33,-12,-17,-19,-13,-21, 10,-21,-13,-13,-13,-11, -9, -6,-13,-21,  5, -5, -6,-21,-21,-13;
/M: SY='I';  M= -9,-15,-20,-25,-22,  3,-25,-15, 20,-18,  8, 18, -8,-22,-15,-17,-11, -3, 15,-23, -3,-19;
/M: SY='A';  M= 24,-17,-13,-23,-15,-10,-12,-21,  4,-17,  5,  0,-15,-17,-14,-20,  0, -1,  9,-23,-13,-15;
/M: SY='K';  M= -6,  3,-28,  5, 14,-31,-18, -7,-28, 33,-26,-11,  1, -9, 15, 18, -6, -9,-21,-22,-12, 14;
/M: SY='G';  M=  0, -5,-27, -5,-11,-28, 52,-16,-36,-16,-29,-20,  4,-17,-14,-16,  5,-13,-28,-24,-28,-13;
/I:         I=-5; MD=-27;
/M: SY='E';  M= -9,  8,-25, 14, 26,-27,-15, -1,-23, 11,-20,-13,  1,  2, 17,  3, -2, -8,-23,-23,-14, 21; D=-5;
/I:         I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
/M: SY='A';  M=  7, -8,-20,-12,  1,-17,-15,-11, -7,  5, -5,  0, -9,-12,  2, -3, -5, -6, -6,-19,-10,  1; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-27;
/M: SY='P';  M= -7, -8,-30, -2,  2,-18,-17, -8,-17, -3,-20,-14,-11, 35, -5,-11, -8, -8,-21,-17, -7, -4; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-27;
/M: SY='Y';  M=-16,-15,-24,-20,-20, 29,-25,  1,  2,-16,  5,  0,-10,-28,-18,-13,-16, -8, -4,  4, 37,-20;
/M: SY='D';  M=-12, 31,-29, 43, 13,-35,-11, -5,-33,  1,-28,-25, 12,  5, -2, -9, -1, -9,-27,-35,-21,  5;
/M: SY='A';  M= 32, -1,-15, -8, -3,-24, -4,-12,-14, -6,-14,-11, -2,-11,  2,-14,  8, -2, -8,-23,-19, -1;
/M: SY='E';  M=  6, 10,-24, 14, 21,-31,-12, -5,-24,  4,-20,-16,  1, -7, 12, -5,  3, -7,-20,-27,-18, 16;
/M: SY='A';  M= 22,-13,-15,-18,-10,-17, -8,-19, -2,-11, -7, -5,-12,-15, -9,-17,  3,  0,  6,-23,-16,-10;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='V';  M=  7,-12, -6,-15,-12,  2,-11,-13,  7, -9,  2,  1,-12,-12,-13,-10, -3, -1, 15,-12, -4,-12; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='K';  M=  9, -2,-24, -4,  4,-24,-15,-13,-13, 10,-15, -8, -4,-11,  3, -1, -3, -7, -9,-22,-14,  3;
/M: SY='A';  M= 22, -2,-18, -7, -1,-25, -9,-14,-18,  7,-17,-10, -4,-10,  2, -4,  4, -1, -9,-22,-16,  1;
/M: SY='A';  M= 13, -4,-20, -6,  6,-22,-10,  8,-21, -1,-17,-11, -1,-12,  3,  1,  6, -4,-14,-26,-12,  3;
/M: SY='A';  M= 26,-10,-13,-18,-13,-12, -9,-17, -1,-14,  2, -3, -7,-17,-13,-18,  0, -2,  3,-23,-15,-13;
/M: SY='N';  M=  3,  5,-19, -2,  3,-19,-13,-10,-12,  2,-17,-11,  9,-13, -2, -4,  6,  5, -9,-29,-15,  0;
/M: SY='A';  M= 10,  4,-17, -2,  0,-20,-11,-11,-13, -3,-15,-11,  5,-12, -1, -8,  7,  8, -8,-28,-16, -1;
/M: SY='I';  M=-10,-29,-24,-36,-26, 10,-34,-24, 33,-28, 27, 21,-24,-24,-21,-24,-22, -9, 21,-18,  2,-25;
/M: SY='A';  M= 20, -7,-14, -9, -4,-17,-11,-17, -5,-10, -7, -8,-10,-14,-10,-16,  4, -1,  4,-27,-17, -7;
/M: SY='A';  M= 12, -1,-17, -3,  5,-20,-11,-13,-16, -1,-12,-11, -3,-10, -2, -8,  7,  6, -9,-27,-16,  1;
/M: SY='I';  M= -6,-11,-20,-18,-18, -6,-27,-21, 17,-19,  5,  4, -7,-19,-16,-19, -4,  8, 15,-27, -7,-19;
/M: SY='A';  M= 24,-15,-13,-22,-13,-10,-10,-17,  0,-15,  6,  4,-14,-16,-11,-18,  0,  1,  3,-22,-13,-12;
/M: SY='K';  M= -2,  6,-24,  3, 10,-26,-12,  0,-25, 20,-26,-13, 10,-11,  6, 10,  2, -4,-20,-27,-13,  8;
/M: SY='T';  M=  7, -4,-17, -6, -5,-14,-13,-13,-12, -5, -9, -9, -4,-14, -6, -9,  7,  8, -6,-24, -8, -6;
/M: SY='L';  M= -6,-11,-24,-10,-13,  1, -8,-17, -7,-21,  8, -2,-13,-16,-18,-18,-14,-11, -8,-19, -7,-15;
/M: SY='P';  M=-10,-22,-35,-18, -8,-20,-22,-19, -8,-12,-17, -4,-22, 54,-11,-19,-14,-11,-17,-17,-19,-13;
/M: SY='A';  M=  4, -3,-25, -2, -3,-21, -2,-15,-17, -4,-15,-12, -5,-14, -7,-11, -3, -9,-13,-14,-14, -5;
/M: SY='A';  M=  8, -8,-22, -9, -5,-22, -1,-14,-15,-11,-10, -9, -7, -4, -1,-14,  1, -3,-13,-24,-18, -4;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='F';  M= -4,-22,-15,-26,-18, 29,-20,-16,  5,-22, 18,  5,-18,-22,-22,-16,-15, -7,  3, -5,  8,-18; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='F';  M=-16,-21,-28,-25,-18, 29,-24,-13, -8,-19, -7, -8,-16,  0,-23,-17,-15, -7,-13, 10, 17,-20;
/M: SY='P';  M= 11, -7,-25, -6, -3,-26,  5,-17,-21,-10,-21,-16, -8, 15,-10,-18,  0, -8,-17,-25,-24, -8;
/M: SY='P';  M=  0, -5,-29,  0,  5,-29, -1,-14,-26,  0,-26,-18, -5, 21, -4, -9,  0, -8,-23,-27,-23, -1;
/M: SY='G';  M=  0, -6,-24, -5,-15,-25, 40,-18,-29,-17,-25,-17,  0,-18,-16,-17,  7, -7,-18,-26,-25,-15;
/M: SY='T';  M= -2, -1,-15, -6, -1,-14,-19,-16,-13, -1,-11,-10, -1,-10, -4, -4, 12, 30, -6,-28,-11, -3;
/M: SY='E';  M=  2,  7,-20,  9, 12,-25, -5, -9,-23, -4,-21,-17,  3, -9,  3, -9, 12,  8,-17,-30,-18,  8;
/I:         I=-4; MD=-19;
/M: SY='G';  M=  4, -4,-17, -5, -6,-17, 10,-13,-18, -3,-13, -9, -2,-12, -7, -7,  1, -3,-11,-19,-14, -7; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-19;
/M: SY='G';  M= -3,  1,-20, -1, -7,-16,  2,-11,-10, -7, -9, -7,  2,-13, -8, -9, -3, -5, -9,-20,-12, -8; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-19;
/M: SY='D';  M= -2,  4,-19, 10,  2,-20,-11, -3,-15, -2,-16,-11, -2,  8, -4, -8, -3, -6,-11,-22,-12, -2; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-19;
/M: SY='G';  M= -7, -6,-18, -9,-10, -1,  4, -4,-13, -6, -9, -5,  0,-16,-11, -6, -6, -9,-10,-13, -4,-10; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-19;
/M: SY='D';  M= -6,  2,-18,  6, -1,-15,  2, -7,-17, -2,-15,-12, -2,  3, -4, -6, -4, -8,-15, -3, -9, -3; D=-4;
/I:         I=-4; MI=-19; MD=-19; IM=-19; DM=-19;
/M: SY='G';  M= -1, -7,-11, -7, -9,-10, 10, -3, -8, -9, -9, -5, -3,-11, -8, -8,  1, -4, -2,-14, -9, -9; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-19;
/M: SY='E';  M= -6,  5,-19,  9, 10,-20, -3, -4,-19,  7,-17,-11,  1,  1,  5,  1, -2, -7,-17,-17,-12,  7; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-19;
/M: SY='T';  M=  4, -2,-11, -8, -8, -9,-14,-13,-11, -9,-13,-11,  0,-11, -7,-10, 19, 32, -3,-25, -5, -8; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-19;
/M: SY='E';  M=  4,  8,-23, 12, 26,-27,-11, -6,-26,  3,-21,-18,  2, -7,  7, -1,  7, -3,-20,-30,-19, 16;
/M: SY='A';  M= 32,-12,-10,-20,-13,-15, -8,-21, -2,-12, -7, -7,-12,-14,-13,-18,  9,  6, 10,-25,-17,-13;
/M: SY='K';  M= -3, -3,-25, -5,  2,-22,-17,-10,-20, 25,-17, -8,  0,-14,  3, 17, -5, -6,-14,-23,-11,  2;
/M: SY='P';  M= 16,-16,-27,-14, -4,-26,-11,-20,-16,-10,-21,-16,-16, 47,-10,-20, -1, -6,-17,-26,-26,-10;
/M: SY='A';  M= 15,  0,-20,  0, 12,-25,-11,-12,-19,  7,-18,-13, -4, -9,  1, -4,  4, -4,-11,-25,-17,  7;
/M: SY='I';  M= -5,-28,-25,-37,-28, 10,-34,-28, 35,-27, 15, 13,-20,-22,-23,-27,-16, -8, 25,-17,  2,-28;
/M: SY='W';  M=-19,-36,-42,-38,-29, 24,-17,-27,-17,-22,-14,-15,-33,-29,-25,-20,-33,-25,-23,106, 26,-22;
/M: SY='E';  M= -1,  7,-22,  9, 15,-28, -6, -7,-25,  1,-22,-16,  3, -9,  9, -4, 10,  2,-20,-29,-18, 12;
/M: SY='D';  M= -9, 36,-25, 38, 13,-30, -7,  1,-29,  2,-27,-23, 28,-13,  1, -5,  4, -6,-27,-36,-20,  7;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='M';  M=  3,-17,-21,-22,-15,  2,-10,-14, -7, -9, -3,  4,-13,-19,-11, -7, -7, -7, -5, -6, -3,-12;
/M: SY='E';  M= 12, 11,-22, 15, 18,-28, -9, -9,-24,  2,-19,-18,  1, -7,  2, -9,  3, -6,-17,-28,-19, 10;
/M: SY='D';  M= -6, 15,-27, 22,  9,-33,  2, -7,-32,  7,-27,-19,  7,-11,  4, -2,  1, -9,-25,-29,-19,  7;
/M: SY='F';  M=-17,-30,-18,-38,-30, 68,-30,-22,  5,-28, 10,  2,-22,-30,-38,-20,-18, -8,  8,  4, 24,-30;
/M: SY='K';  M= -9,  4,-29,  6,  5,-29,  5, -8,-29, 15,-24,-10,  1,-13,  3,  5, -6,-13,-23,-24,-16,  4;
/M: SY='A';  M= 14,  0,-19, -2, 10,-23,-12,-12,-16,  1,-15,-12, -4, -9,  2, -8,  6,  1, -9,-26,-17,  6;
/M: SY='K';  M= -2, -6,-25, -6,  1,-22,-12,-14,-15, 13,-14, -7, -6,-14, -2,  6, -7, -9, -9,-23,-13, -1;
/M: SY='A';  M= 16,-14,-22,-19,-12,-14,  2,-17,-12,-13,-13, -9,-10,-15, -6,-16,  0, -7, -9, -5,-11, -8;
/M: SY='K';  M=  8, -5,-21, -7,  2,-23,-15,-10,-14,  9,-14, -4, -6,-13,  5,  4, -2, -6, -6,-23,-14,  3;
/M: SY='K';  M= 13,  1,-21, -1,  6,-26,-11,-13,-22, 16,-20,-12, -2, -9,  1,  2,  1, -2,-13,-23,-15,  4;
/M: SY='F';  M=-13,-25,-19,-31,-23, 38,-25,-15,  6,-24, 16, 14,-19,-26,-23,-17,-15, -7,  3, -8, 12,-21;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='A';  M=  4, -1,-14, -6, -3,-10, -9,  0, -8, -1,-10, -4,  2,-12,  2, -4,  0, -4, -6,-16, -6,  0; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='D';  M=  8,  8,-23, 11,  7,-29,  5,-10,-27, -2,-22,-17,  2,-11,  0,-10,  5, -7,-19,-27,-20,  4;
/M: SY='A';  M= 23, -1,-17, -6,  8,-22, -8,-13,-17,  0,-15,-13, -2, -8, -1, -9,  7,  2,-10,-24,-18,  3;
/M: SY='A';  M= 21, -4,-16, -6, -9,-20,  0,-18,-10,-12,-13,-11, -6,-14,-12,-18,  6, -3, -1,-26,-19,-11;
/M: SY='A';  M= 15, -2,-15, -9,-10,-15,-11,-14, -5, -8, -7, -4, -1,-16,-10,-13,  2,  2,  1,-27,-15,-10;
/M: SY='E';  M= -3, 11,-24, 14, 20,-27,-16, -8,-25, 10,-21,-16,  2, -7,  5,  0,  3,  4,-18,-29,-16, 13;
/M: SY='L';  M= -2,-23,-19,-25,-17,  0,-17,-20,  8,-21, 27, 10,-22,-25,-17,-17,-18, -6,  6,-21, -6,-17;
/M: SY='A';  M= 29, -9,-14,-14, -7,-18, -9,-19, -4,-11, -8, -7, -9,-12,-10,-19,  6, -1,  4,-24,-17, -9;
/M: SY='A';  M= 10, -8,-21,-10,  4,-22,-14,-11,-13,  1, -9, -6, -8, -6,  7, -5, -1, -5,-12,-23,-14,  5;
/M: SY='A';  M= 31,-14,-14,-21,-15,-17,  4,-20, -6,-13, -8, -4,-12,-15,-14,-19,  4, -4,  4,-22,-19,-14;
/M: SY='A';  M= 28, -7,-14,-14, -8,-21, -2,-16,-12, -5,-14,-10, -5,-12, -5,-12,  8,  1, -4,-23,-18, -6;
/M:         M= -1,  0,-23, -2, -3,-17,-13,-13, -8, -4, -6, -6,  0,-15, -6, -9, -5, -5, -8,-26,-13, -5;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='T';  M= 13, -3,-14, -7, -5,-17,-10,-16,-12, -8,-13,-11, -5,  7, -8,-13,  8, 14, -6,-23,-15, -7; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='G';  M=  4, -8,-27,-10,-14,-28, 45,-19,-34, -8,-27,-17, -1,-17,-14,-12,  0,-13,-24,-20,-25,-14;
/M: SY='D';  M=-17, 33,-31, 49, 26,-37,-13, -1,-35,  2,-27,-25, 11,  1,  7, -8, -1,-10,-30,-36,-20, 16;
/I:         I=-6; MD=-29;
/M: SY='A';  M=  8, -8,-17,-10,  3,-12,-14,-10, -8, -2, -6, -4, -8,-11,  3, -6, -1, -2, -5,-18, -9,  3; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='A';  M= 18,  8,-17,  8,  5,-26, -6,-12,-21, -3,-19,-17,  1, -9, -3,-11, 10,  1,-12,-28,-19,  1;
/M: SY='A';  M= 22, -6,-18,-11, -2,-24,  4,-14,-19, -4,-17,-12, -4,-11,  0,-11,  8,  0,-11,-23,-19, -1;
/M: SY='L';  M= -8,-30,-18,-32,-25, 13,-31,-23, 25,-26, 28, 17,-27,-28,-24,-21,-21, -7, 23,-20,  0,-25;
/M: SY='K';  M= -2, -5,-27, -7, -3,-27,  7,-13,-30, 19,-26,-13, -1,-14, -1, 14, -4, -9,-20,-20,-17, -3;
/M: SY='A';  M= 30, -6,-14,-14, -7,-20, -6,-16,-13, -4,-14,-11, -4, -6, -7, -9,  8,  5, -6,-23,-18, -8;
/M: SY='A';  M= 26, -3,-16,-11, -2,-24, -7,-11,-14, -1,-15, -8, -2,-11,  7, -8,  7,  0,-10,-22,-17,  3;
/M: SY='L';  M= -5,-27,-18,-32,-24, 18,-26,-19, 17,-23, 22, 18,-24,-26,-22,-19,-18, -7, 16,-15,  3,-22;
/M: SY='G';  M=  3, -6,-27, -7, -4,-31, 24,-11,-29,  0,-25,-12, -1,-15,  6, -5,  0,-13,-24,-20,-21,  1;
/M: SY='A';  M=  7,  3,-23,  3,  3,-26, -8,-14,-23,  6,-21,-15, -1, -2, -3, -4,  2,  1,-15,-26,-18,  0;
/M: SY='V';  M= -5,-26,-15,-28,-23,  2,-29,-25, 22,-23, 23, 12,-25,-26,-23,-19,-14,  3, 26,-25, -5,-23;
/M: SY='G';  M= -1,-11,-29,-11,-20,-27, 64,-20,-36,-21,-25,-17, -2,-21,-20,-20, -2,-19,-27,-20,-28,-20;
/M: SY='G';  M=  9, -6,-24, -9, -7,-27, 21,-16,-27,  1,-23,-13, -2,-14, -5, -6,  1, -8,-19,-21,-20, -6;
/M: SY='T';  M= 10,  4,-14, -2, -7,-18, -5,-14,-14, -9,-16,-13,  6,-14, -9,-12, 13, 15, -5,-31,-17, -8;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='K';  M= -8, -2,-30, -2,  3,-30,  1,-12,-32, 34,-30,-12,  0,-12,  3, 18, -8,-12,-22,-20,-15,  3;
/M: SY='A';  M= 26, -3,-14,-10, -9,-21, 11,-15,-18,-11,-19,-15,  2,-13, -9,-16, 15,  3,-10,-26,-21, -9;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='D';  M=-15, 27,-30, 40, 31,-36,-15,  1,-33,  8,-25,-21, 10, -7, 16, -1, -1,-10,-29,-33,-18, 24;
/M: SY='D';  M= -5, 22,-24, 26, 15,-29,-12, -6,-28,  6,-23,-20, 11, -9,  2, -3,  3,  0,-21,-32,-17,  8;
/M: SY='F';  M=-20,-26,-24,-32,-26, 60,-30, -4,  0,-22,  6,  0,-20,-30,-28,-16,-20,-10, -4, 18, 50,-26;
/M: SY='R';  M=-18, -8,-30, -8,  2,-22,-20, -2,-30, 34,-22,-10,  0,-18, 10, 62,-10,-10,-20,-20,-10,  2;
/M: SY='A';  M=  9, -4,-21, -5,  5,-21,-15,-12,-11, -1, -8, -7, -7,-13,  2, -5, -3, -6, -7,-24,-14,  3;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_05 which contains 572'214 sequence entries.

Total number of hits	21 in 21 different sequences
Number of true positive hits	21 in 21 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	window20
Author [info]	N_Hulo
Version [info]	5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

21 sequences

C554_CERS4  (Q3J2P2), C554_CERSP  (P0C0X7), C555_BRADU  (Q45234),

C556_AGRFC  (Q8UH04), C556_AGRTA  (P00141), C556_AGRTB  (P00139), 
C556_AGRTC  (P00140), C556_RHOPA  (P00150), CYCP_ALCXX  (P00138), 
CYCP_ALLVD  (P00154), CYCP_CERS4  (P00148), CYCP_HALH2  (P00143), 
CYCP_MAGFU  (P00151), CYCP_MAGML  (P00152), CYCP_PARPM  (P00145), 
CYCP_RHOCA  (P00147), CYCP_RHOPA  (P00149), CYCP_RHORT  (P00144), 
CYCP_RHOSP  (P00146), CYCP_RHOTE  (P00153), CYCP_RUBGE  (P00142)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

66 PDB

1A7V; 1BBH; 1CGN; 1CGO; 1CPQ; 1CPR; 1E83; 1E84; 1E85; 1E86; 1EKY; 1GQA; 1JAF; 1MQV; 1NBB; 1RCP; 1S05; 2CCY; 2J8W; 2J9B; 2XL6; 2XL8; 2XLD; 2XLE; 2XLH; 2XLM; 2XLO; 2XLV; 2XLW; 2XM0; 2XM4; 2YKZ; 2YL0; 2YL1; 2YL3; 2YL7; 2YLD; 2YLG; 2YLI; 3ZQV; 3ZQY; 3ZTM; 3ZTZ; 3ZWI; 4CDA; 4CDV; 4CDY; 4CIP; 4CJG; 4CJO; 4D4N; 4D4X; 4WGY; 4WGZ; 5AGF; 5GYR; 5JLI; 5JP7; 5JRA; 5JS5; 5JSL; 5JT4; 5JUA; 5JVE; 5NC0; 5NGX
» more