PROSITE entry PS51015
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | YDG |
| Accession [info] | PS51015 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-AUG-2004 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51015 |
| Associated ProRule [info] | PRU00358 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | YDG domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=147; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=142; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1414716; R2=0.0189142; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=10556.7597656; R2=4.7188840; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=337; H_SCORE=12147; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=231; H_SCORE=11647; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='G'; M= -3,-17,-24,-19,-23,-10, 32,-20,-17,-20,-13, -4,-10,-23,-22,-19, -6,-14, -8,-19,-17,-22; /M: SY='N'; M= -7, 1,-25, -1, 2,-14, -6, -7,-23, -1,-21,-15, 6, -4, -4, 4, 1, -4,-21,-25,-15, -2; /M: SY='V'; M= -3,-11,-20,-16,-16,-10,-21, -7, 9,-15, -3, 1, -5,-12,-15,-15, -7, -5, 10,-29,-10,-17; /M: SY='P'; M= -4, -3,-31, 0, 4,-30,-15,-10,-20, -4,-25,-15, -3, 37, 5,-11, -2, -5,-25,-29,-22, 2; /M: SY='G'; M= -5, 0,-31, 4,-11,-32, 47,-16,-38,-15,-30,-22, 2, -7,-15,-18, -1,-17,-30,-25,-28,-14; /M: SY='I'; M= -8,-24,-21,-28,-23, -3,-30,-11, 24,-18, 11, 16,-20,-24,-16,-13,-15, -7, 24,-25, -2,-22; /M: SY='E'; M= -4, -7,-24, -6, 3,-18,-12,-13,-15, 0, -7, -7, -8, -9, -4, -2, -6, -3,-11,-25,-14, -1; /M: SY='V'; M= 1,-25,-16,-24,-21, -8,-25,-26, 15,-12, -1, 2,-25, -8,-22,-16, -8, -2, 28,-28,-14,-22; /M: SY='G'; M= -1, -4,-28, -7,-17,-28, 56,-17,-36,-17,-28,-19, 6,-19,-17,-17, 2,-13,-28,-23,-28,-17; /M: SY='D'; M= -5, 10,-24, 16, 12,-25,-15, 0,-17, -3,-15, -6, 1,-12, 5, -8, -1, -7,-13,-31,-14, 8; /M: M= -4,-10,-25,-14, -8,-13,-17,-14, -4, -8,-12, -4, -4, -8, -6, -9, -1, -1, -7,-10, -9, -8; /M: SY='W'; M=-18,-30,-33,-34,-24, 30,-26,-18, -5,-21, -1, -4,-26,-27,-18,-17,-26,-17,-12, 54, 26,-18; /M: SY='E'; M=-11, -6,-14, -7, 5, -8,-19, 0,-18, -6,-16,-11, -2, -6, 0, -4, -2, -7,-17,-25, -8, 2; /M: SY='Y'; M= -9, 0,-21, -4, -8, 3,-14, -1,-12, -8,-12,-10, 6,-21, -8, -4, 3, 0,-13,-17, 9, -9; /M: SY='R'; M=-16, -7,-28, -8, 2,-22,-20, -1,-27, 25,-20, -9, 0,-17, 13, 54, -6, -4,-19,-21,-10, 4; /M: SY='V'; M= -3,-20,-21,-22,-14, -5,-23,-17, 5, -6, 0, 7,-18,-11,-10, -6,-11, -6, 9,-21, -8,-13; /M: SY='E'; M= 0, -1,-27, 4, 32,-27,-18, -5,-21, 2,-14,-13, -6, 4, 15, -5, -2, -8,-22,-26,-18, 23; /M: SY='L'; M= 1,-23, 9,-29,-21, 3,-24,-20, 4,-24, 17, 9,-23,-27,-20,-21,-16, -8, 6,-24, -8,-20; /M: SY='C'; M=-10,-14, 12,-18,-15,-13,-23, -8,-11, -9, -8, -6, -7,-26,-11, 2, -6, -6, -4,-32,-12,-15; /M: M= -8,-11, -9,-12, -2, -9,-24,-12, -6, -8, -5, -3,-12,-20, -1, -6, -8, -8, -2,-24, -9, -2; /M: SY='W'; M= 1,-23,-23,-25,-18, -6,-21,-10, 3,-16, 0, 0,-21,-23,-12,-16,-14,-10, 6, 8, 0,-15; /M: SY='G'; M= 4, -9,-27,-11,-18,-27, 56,-20,-35,-18,-27,-18, -1,-18,-18,-19, 3,-12,-25,-21,-27,-18; /M: SY='V'; M= 3,-26,-18,-27,-20, 1,-24,-24, 15,-22, 16, 7,-25,-14,-21,-21,-14, -5, 17,-23, -8,-21; /M: SY='H'; M=-17, -5,-27, -5, -5,-17,-22, 78,-20,-12,-15, 2, 3,-22, 3, -3,-10,-17,-16,-30, 15, -5; /M: SY='R'; M=-11,-13,-26,-16,-11, -6, 1,-10,-16, -5, -5, -2, -6,-22, -6, 6,-11,-12,-14,-17, -8, -9; /M: SY='P'; M= 1,-13,-31, -9, 1,-30,-11, -8,-20, -6,-24,-13,-12, 40, 5,-13, -4, -9,-25,-26,-22, 0; /M: SY='H'; M=-11,-13,-24,-15,-11, -3,-23, 18, -9,-16, -7, -2, -8, -9, -9,-12, -7, -2, -9,-17, 4,-12; /M: SY='Q'; M= -6,-12,-21,-13, -3,-19,-21, -7, -3, 1, -7, 7,-10,-18, 13, 3, -4, -5, 0,-24, -9, 5; /M: SY='A'; M= 29, -7,-13,-13, -8,-20, 0,-15,-11, -9,-15,-10, -4,-13, -5,-15, 12, 2, -3,-25,-19, -6; /M: SY='G'; M= -1,-11,-11,-12,-21,-29, 58,-21,-39,-21,-29,-20, -2,-22,-21,-21, -1,-19,-28,-24,-30,-21; /M: SY='I'; M= -9,-28,-26,-36,-28, 6,-35,-28, 38,-28, 14, 14,-19,-21,-21,-27,-15, -7, 26,-19, 1,-28; /M: SY='D'; M= 0, 11,-11, 14, -2,-25, -4, -6,-24,-11,-17,-16, 2,-15, -8,-15, 2, -2,-16,-32,-17, -5; /M: SY='G'; M= -2,-11,-20,-13,-16,-15, 23, -1,-27,-11,-20,-12, -5,-21,-13,-13, -5,-15,-21,-12, 0,-16; /M: SY='M'; M= -7, -7,-24,-13, -9,-17, -5, -8, -5, -8, -7, 5, -1,-17, 4, -6, -3, -5, -9,-24,-12, -3; /M: SY='E'; M= -3, -1,-25, -2, 4,-21, -9, -9,-19, 4,-22,-13, 3, -2, -1, -3, 4, -1,-17,-25,-13, 1; /M: SY='N'; M= -1, 4,-21, 0, -3,-16,-14, -6, -9, -6,-10, -5, 6,-16, 0, -8, 2, 0,-10,-26, -9, -3; /M: SY='E'; M=-11, -1,-28, 4, 9,-14,-12, -4,-19, -4,-12,-12, -6, -5, -3, -8, -7, -6,-19,-17, 0, 2; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='A'; M= 3, 3,-10, 2, -1,-10, -6, -4,-10, 1, -9, -7, 2, -7, -2, 0, 2, 1, -7,-12, -4, -2; D=-14; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='G'; M= 6, -8,-26,-10,-15,-28, 48,-18,-34,-11,-27,-18, -1,-17,-15,-14, 2,-14,-24,-21,-26,-15; /M: SY='A'; M= 20, 0,-15, -3, 2,-21, -8,-14,-17, -4,-17,-14, -1, -9, -4,-11, 14, 10, -8,-28,-18, -1; /M: SY='Y'; M=-13, -6,-13, -5, -3, -4,-24, 5,-13, -8,-10, -6, -8,-21, 1, -8, -8, -6,-11,-14, 11, -2; /M: SY='S'; M= 8, 0,-15, -4, -2,-18, -3,-12,-14,-10,-21,-15, 7,-12, -4,-12, 23, 13, -8,-34,-18, -3; /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='A'; M= 20, -7, -8,-13, -8, -9, -5,-13, 1, -8, -3, -3, -6, -7, -7,-12, 3, 2, 3,-12, -9, -8; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='T'; M= 0, -9, -8,-13,-12, -4,-15,-15, 7,-10, 0, 0, -8,-12,-11,-10, 4, 13, 13,-19, -6,-12; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='S'; M= 4, -5, -7, -5, -5, -9, -5, -9, -3, -8,-12, -7, 0, -9, -4, -8, 16, 9, 2,-23,-10, -5; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='I'; M= -5,-20,-21,-27,-23, -3,-29,-23, 29,-23, 9, 9,-12,-22,-18,-22, -9, -3, 24,-26, -6,-23; /M: SY='V'; M= 9,-23,-12,-25,-24, -7,-13,-26, 14,-18, 0, 2,-21,-25,-24,-19, -3, -1, 30,-28,-14,-24; /M: SY='V'; M= 5,-18,-15,-22,-17, -6,-20,-21, 11,-18, 6, 5,-15,-20,-15,-18, 0, 6, 15,-27,-10,-17; /M: SY='S'; M= 9, -2,-13, -2, 1,-16, -4, -8,-18, -9,-26,-18, 6,-11, 0,-10, 31, 15,-11,-32,-12, 0; /M: SY='G'; M= 2,-13,-26,-14,-20,-20, 44,-17,-26,-18,-21,-14, -6,-21,-19,-19, -2,-15,-17,-16,-16,-20; /M: SY='G'; M= 0, -7,-27, -9,-12,-23, 32, -9,-29,-10,-23,-14, 0,-19, -5, -9, -1,-14,-24,-16,-13, -9; /M: SY='Y'; M=-16,-13,-28,-13,-15, 14,-16, 8,-11, -7, -9, -6,-11,-25, -9, -3,-11, -8,-14, 9, 43,-15; /M: SY='E'; M= -9, 3,-27, 6, 18,-23,-18, 5,-25, 12,-23,-14, 0, -2, 7, 4, 0, -3,-22,-25, -7, 11; /M: SY='D'; M=-14, 30,-27, 44, 9,-32, -2, -5,-32, -6,-22,-23, 12,-13, -4,-12, 1, -8,-24,-36,-19, 2; /M: SY='D'; M=-10, 25,-27, 31, 13,-29,-13, 2,-25, -1,-21,-19, 14,-12, 1, -4, -1, -8,-21,-33,-16, 6; /M: SY='E'; M= -7, 0,-25, 1, 20,-19,-19, -6,-16, 5, -7, -9, -2,-12, 5, 4, -6, -8,-15,-27,-14, 12; /M: SY='D'; M=-14, 32,-27, 43, 10,-29, -2, -2,-33, -4,-27,-24, 17,-13, -1,-10, 3, -8,-27,-34,-18, 5; /M: SY='H'; M= -6, 6,-24, 2, 1,-17,-14, 16,-18, 1,-19,-10, 11,-16, 1, 1, 1, -4,-18,-25, -2, -1; /M: SY='G'; M= 1,-10,-26,-12,-16,-21, 30,-18,-20,-18,-18,-12, -2,-13,-15,-19, 1,-11,-17,-24,-22,-16; /M: SY='D'; M=-14, 30,-28, 43, 24,-34, -8, -4,-34, 0,-25,-25, 11, -8, 2, -8, 2, -4,-27,-35,-20, 13; /M: SY='V'; M= -6,-19,-22,-17, -6, -7,-23,-21, 1,-12, -6, -6,-21,-21,-14,-14, -9, -5, 10, 3, -5, -9; /M: SY='L'; M=-12,-29,-21,-34,-24, 25,-31,-21, 19,-28, 33, 17,-26,-28,-24,-21,-25,-10, 12,-13, 7,-24; /M: SY='I'; M= -7,-26,-22,-31,-24, 2,-30,-26, 21,-24, 16, 9,-24,-24,-21,-21,-16, 0, 19, -6, -1,-23; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='T'; M= 3, -1, -3, -8, -8,-14,-14,-17,-15,-11,-17,-14, 2,-12, -8,-11, 25, 36, -4,-35,-15, -8; /M: SY='G'; M= 5,-10,-28,-11,-19,-29, 63,-20,-37,-19,-28,-19, -1,-19,-19,-20, 1,-18,-27,-20,-29,-19; /M: SY='Q'; M= -5, 4,-24, 5, 11,-29,-13, 12,-24, 3,-22,-10, 5,-12, 21, 7, 6, -4,-22,-28,-10, 15; /M: SY='G'; M= -4,-10,-29,-11,-14,-26, 42,-15,-33, -6,-25,-11, -2,-19,-12, -3, -4,-17,-24,-20,-23,-14; /M: SY='G'; M= 2, -7,-24, -8,-15,-26, 47,-18,-33,-17,-28,-19, 2,-17,-15,-17, 11, -5,-23,-25,-26,-15; /I: I=-7; MD=-15; /M: SY='R'; M= -9, -3,-16, -5, -5, -5,-13, 4, -8, 5, -9, -4, 1,-14, -1, 12, -5, -5, -6,-10, 5, -5; D=-7; /I: I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='B'; M=-12, 23,-24, 23, 13,-26,-11, 3,-24, 5,-21,-15, 21,-12, 10, 3, 0, -6,-25,-30,-15, 11; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='S'; M= -2, 2,-21, 1, 0,-22, -5, -8,-22, 4,-24,-15, 7, 1, -1, 4, 8, 2,-17,-28,-17, -2; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='R'; M= -2, -5,-22, -6, -2,-13,-12, 0,-17, 3,-11, -8, -4,-15, -1, 9, -4, -4,-13,-15, 0, -4; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='N'; M= -4, 6,-16, 3, 1,-16, -3, -5,-13, -2,-16,-10, 10,-10, 1, -4, 7, 4,-12,-23,-12, 1; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='G'; M= 1, -2,-19, -6, -5,-17, 4, 0,-19, 1,-15, -8, 2,-13, -4, -3, -1, -3,-14,-19,-10, -5; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='K'; M= -7, 1,-22, 0, 9,-14,-15, 5,-19, 14,-16, -9, 2,-11, 5, 12, -5, -7,-17,-14, 2, 6; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='Q'; M= 5, 3,-25, 5, 16,-32,-14, -4,-22, 6,-20,-11, -2, -3, 22, -2, 1, -7,-21,-24,-16, 19; /M: SY='P'; M= -2,-18,-17,-18,-12,-17,-20,-20, -2,-12,-13, -7,-13, 11,-12,-12, -1, -2, -1,-30,-17,-14; /M: SY='E'; M= 0, -3,-23, -2, 8,-17,-16, -9,-18, 8,-14, -9, -3,-12, 5, 1, 0, -5,-14,-23,-11, 7; /M: SY='D'; M=-16, 39,-28, 48, 19,-33, -9, 1,-33, 1,-29,-26, 25, -6, 2, -7, 2, -8,-30,-38,-21, 10; /M: SY='Q'; M= -9, -3,-31, -2, 13,-38, -9, 3,-22, 4,-22, -5, -2, -1, 43, 3, -1,-11,-30,-21,-15, 27; /M: SY='K'; M= -7, -6,-24, -6, 2,-23,-20,-12,-18, 26,-19, -6, -4,-14, 4, 17, -5, -3, -9,-23,-10, 3; /M: SY='L'; M=-12,-28,-23,-30,-20, 9,-31,-19, 18,-23, 33, 15,-24,-27,-18,-11,-25,-10, 9,-18, 1,-20; /M: SY='E'; M= -8, -1,-24, 4, 18,-15,-21, -6,-11, -3,-12,-11, -6,-12, 1, -8, 0, -2, -8,-24, -4, 8; /M: SY='R'; M=-13, 11,-27, 12, 0,-26, 2, -4,-31, 9,-26,-18, 14,-17, 0, 19, -1, -7,-25,-28,-17, -2; /M: SY='G'; M= 6, -8,-23,-11,-15,-24, 40,-17,-28,-16,-23,-13, -1,-17,-14,-17, 7, -6,-19,-24,-24,-15; /M: SY='N'; M= -7, 23,-18, 8, -6,-17, 0, 0,-14, -5,-23,-15, 38,-20, -6, -5, 8, 4,-17,-36,-18, -6; /M: SY='L'; M= -9,-19,-22,-21,-15, 3,-24,-10, 4,-14, 22, 8,-16,-26,-12, -3,-20, -9, -1,-15, 5,-15; /M: SY='A'; M= 34, -9,-14,-16, -8,-21, 1,-16,-15, -6,-14,-12, -6,-12, -7, -8, 10, 0, -5,-22,-19, -8; /M: SY='L'; M= -5,-28,-20,-30,-20, 6,-28,-20, 21,-27, 40, 20,-27,-27,-18,-21,-25, -9, 12,-20, -2,-20; /M: SY='E'; M= 3, 0,-25, 2, 25,-25,-16, -9,-22, 13,-15,-12, -4, -7, 8, 2, -3, -8,-18,-24,-16, 17; /M: SY='R'; M=-11, -2,-24, -6, -4,-16,-19, -4,-12, 12,-11, -5, 5,-18, -1, 14, -8, -5,-10,-26, -9, -4; /M: SY='C'; M= 7, -4, 21, -9, -9,-19, -9,-16,-21,-14,-24,-18, 3,-18, -9,-15, 21, 12, -9,-40,-22, -9; /M: SY='M'; M=-11,-22, -3,-27,-20, -5,-25,-13, 1,-17, 3, 7,-18,-25,-13,-11,-16,-11, -1, -6, -3,-17; /M: SY='R'; M=-16, 4,-30, 8, 10,-23,-19, 14,-29, 21,-23,-12, 3,-14, 8, 23, -8,-12,-23,-21, -1, 7; /M: SY='K'; M= -7, -4,-24, -3, 6,-14,-21, -7,-16, 9, -9, -7, -6,-14, 1, 7, -6, 0,-13,-19, -2, 2; /I: I=-7; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14; /M: SY='G'; M= -5, -2,-30, -3, -6,-29, 25,-12,-32, 1,-29,-17, 5, -4, -5, -5, -2,-13,-28,-24,-23, -6; /M: SY='T'; M= -8, 4,-19, -1, -7,-10,-19,-11, -7, -8, -6, -7, 4,-17, -9, -9, 2, 14, -5,-26, -5, -9; /M: SY='P'; M= -7,-12,-34, -4, 8,-29,-12,-16,-23, -8,-28,-20,-12, 57, -5,-16, -2, -7,-28,-31,-27, -2; /M: SY='V'; M= -4,-30,-14,-32,-29, 10,-31,-28, 28,-23, 13, 10,-28,-29,-30,-21,-13, -3, 40,-24, -4,-29; /M: SY='R'; M=-19, -9,-30, -9, 1,-21,-20, -1,-30, 32,-21,-10, 0,-19, 10, 65,-10,-10,-20,-20,-10, 1; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='I'; M= -7,-26, -4,-33,-27, -2,-34,-28, 27,-26, 13, 10,-21,-25,-22,-25,-14, -2, 24,-27, -7,-27; /M: SY='R'; M=-20, -8,-30, -8, 0,-20,-20, 16,-30, 24,-20, -8, 2,-20, 10, 59,-10,-12,-22,-22, -5, 0; /M: SY='G'; M= -3, -9,-28, -9,-15,-20, 40, -1,-32,-16,-25,-15, 0,-20,-13,-15, 1,-14,-25,-17,-10,-15; /I: I=-9; MD=-19; /M: SY='F'; M= -5,-16,-17,-21,-14, 19,-19, -2, -2,-15, 3, 0,-10,-19,-15,-12, -9, -6, -2,-10, 8,-14; D=-9; /I: I=-9; MD=-19; /M: SY='K'; M= -8, -8,-19, -9, -4, -6, -7, -4,-14, 7,-12, -4, -4,-14, -1, 6, -7, -8, -9,-12, -3, -3; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='R'; M= -7, -6,-20, -5, 3,-15,-16, 1,-13, 7,-11, -5, -4,-13, 1, 8, -3, -4, -7,-23, -7, 1; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='R'; M=-12, 2,-27, 1, 1,-19,-10, -3,-22, 11,-20,-12, 7,-17, 2, 22, -2, -5,-18,-24, -9, -1; /M: SY='S'; M= -5, 7, 3, 11, 1,-26, -5, -5,-30, -9,-27,-21, 5,-16, -5, -9, 12, -1,-19,-38,-20, -2; /M: SY='P'; M= -3, 6,-27, 8, 3,-27,-12, -9,-21, -1,-23,-16, 4, 15, -1, -8, 0, -5,-22,-30,-20, 0; /M: SY='F'; M= -9, -8,-11,-15,-15, 13,-21, -8, -6,-13, -8, -7, -3,-23,-16,-13, -6, -5, -7,-11, 13,-16; /M: SY='S'; M= 7, -4, -5, -8, 0,-17,-12, -8,-14, -8,-17,-12, -1,-15, 0,-12, 10, 1,-11,-26, -9, 0; /M: SY='P'; M=-12,-16,-33,-11, -2,-21,-20,-12,-18, 3,-19,-12,-13, 33, -4, 6,-10, -8,-21,-24,-15, -7; /M: SY='S'; M= 9, -2,-17, -6, 2,-21, -4,-14,-19, -3,-18,-13, -1,-10, -1, -7, 13, 13,-11,-27,-17, 1; /M: SY='K'; M= -6, -3,-27, -2, 3,-26, 0,-13,-23, 9,-25,-14, -1, -1, -3, 0, -3, -9,-17,-26,-19, 0; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='G'; M= -1, -2,-23, -8,-15,-19, 14,-16,-11,-15,-15,-10, 5,-19,-15,-17, 0, -5, -8,-26,-19,-16; /M: SY='Y'; M=-13,-16,-25,-19,-19, 20,-26, 4, 4,-14, -2, -1,-12,-26,-13,-13,-10, -5, -2, 7, 44,-19; /M: SY='R'; M=-11, -9,-24,-10,-10,-14,-25,-14, 0, -2, -6, -2, -7,-19, -5, 9, -7, -1, 4,-25, -9,-10; /M: SY='Y'; M=-19,-16,-30,-15,-10, 23,-29, 18, -4, -8, -2, -2,-18,-26, -6, -9,-18,-10,-12, 23, 68,-13; /M: SY='D'; M=-11, 36,-26, 50, 13,-36, -2, -4,-36, -3,-29,-27, 16,-11, -2,-11, 5, -7,-26,-37,-21, 5; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='L'; M=-11,-20,-21,-18,-16, 3,-28,-19, 15,-26, 36, 13,-23,-27,-18,-19,-24, -9, 9,-23, -3,-18; /M: SY='Y'; M=-20,-19,-30,-19,-18, 24,-29, 18, -4, -5, -2, -1,-18,-29, -8, 0,-19,-10,-11, 24, 69,-18; /M: SY='R'; M=-12, -8,-30, -6, 5,-22,-21, -2,-19, 15,-18, -8, -4, -2, 4, 19, -8, -9,-17,-24,-11, 2; /M: SY='V'; M= -5,-28,-18,-30,-26, -2,-32,-26, 28,-17, 9, 10,-24,-26,-22,-12,-13, -4, 36,-26, -7,-26; /M: SY='E'; M= -3, -6,-23, -2, 9,-19,-20, -4,-10, -6,-13, -9, -9, -1, -4,-11, -2, -6, -3,-30,-14, 2; /M: SY='K'; M= -4, 6,-25, 10, 13,-25,-16, -9,-23, 14,-16,-12, 0,-11, 3, 4, -3, -7,-17,-27,-14, 8; /M: SY='Y'; M=-12,-15,-19,-15,-11, 3,-22, 6,-12,-11,-13, -8,-13,-10, -3,-11, -7, -7,-16, 4, 26, -9; /M: SY='W'; M=-16,-23,-41,-26,-21, 1,-18,-22,-20, -9,-22,-18,-20,-25,-14,-12,-26,-18,-27, 95, 17,-14; /M: SY='R'; M= -8,-14,-25,-15, -4,-11,-22,-12, -7, 3, -6, -3, -9,-12, -2, 12, -8, -7, -5,-22, -8, -5; /M: SY='E'; M= -6, 1,-30, 6, 30,-30, -9, -6,-28, 9,-23,-16, -3, 6, 13, 0, -2,-11,-27,-26,-20, 21; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='K'; M= -7,-10,-20,-10, -1,-14,-23,-15, -4, 8, -6, -2,-10,-15, -5, 4, -7, -1, 3,-23, -9, -3; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='G'; M= -3, -4,-25, -6, -9,-21, 30,-15,-26,-15,-17,-14, 3,-18,-12,-15, 2, -7,-21,-25,-22,-11; /M: SY='K'; M= -7,-10,-25, -9, 1,-19,-14,-13,-13, 7,-13, -7, -7,-10, -2, 7, -5, -6, -8,-25,-14, -2; /M: SY='S'; M= -3, 11,-18, 8, 3,-23, -8, 1,-22, 0,-26,-15, 17,-12, 7, -2, 18, 10,-18,-34,-15, 5; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='G'; M= 3, 0,-26, -1,-13,-29, 47,-15,-34,-15,-28,-20, 7,-18,-15,-17, 2,-15,-26,-24,-27,-14; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='F'; M= -9,-15,-13,-22,-18, 17,-12,-15, -8,-17, -7, -4, -6,-23,-19,-11, -3, -5, -6,-16, 0,-18; /M: SY='N'; M=-10, 0,-22, -3,-10, -9,-15, -7, -3, -9, -1, 0, 2,-21,-10,-10, -9, -5, -4,-24, -4,-11; /M: SY='V'; M= -6,-27, -3,-31,-27, 8,-31,-27, 19,-24, 14, 8,-25,-29,-27,-22,-14, -2, 26,-25, -5,-27; /M: SY='F'; M=-18,-27,-19,-33,-25, 42,-27,-16, -9,-17, -3, -6,-22,-29,-27,-14,-22,-14,-10, 32, 28,-23; /M: SY='R'; M=-13, -3,-29, -3, 12,-25,-20, -4,-25, 31,-21, -5, -2,-12, 14, 33, -9,-10,-20,-21,-10, 12; /M: SY='F'; M=-20,-24,-25,-28,-22, 48,-29, -1, -4,-15, 2, -1,-18,-29,-22, -5,-19,-10, -6, 14, 45,-22; /M: SY='R'; M=-14, -8,-29, -8, 3,-22,-21, -6,-23, 30,-16, -6, -4,-16, 9, 38,-12,-10,-17,-20, -9, 4; /M: SY='L'; M=-11,-24,-21,-24,-11, 9,-28,-16, 13,-24, 36, 17,-25,-26,-15,-17,-25,-10, 4,-19, 0,-12; /M: SY='R'; M= -7,-13,-20,-13, -4,-14,-21,-12, -5, 1, -6, -3,-10,-19, -2, 10, -3, 0, 4,-27,-11, -4; /M: SY='R'; M=-13,-11,-30,-11, -1,-21,-18, -4,-27, 22,-20,-11, -3, -6, 6, 52, -8, -9,-20,-21,-13, -2; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 30 in 30 different sequences |
| Number of true positive hits | 30 in 30 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | YDG |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
30 sequences
ORTH1_ARATH (Q9FKA7), ORTH2_ARATH (Q8VYZ0), ORTH3_ARATH (Q9FVS2), ORTH4_ARATH (Q9C8E1), ORTH5_ARATH (Q680I0), ORTHL_ARATH (Q681I0), SUVH1_ARATH (Q9FF80), SUVH1_TOBAC (Q93YF5), SUVH2_ARATH (O22781), SUVH3_ARATH (Q9C5P4), SUVH3_CHLRE (Q5QD03), SUVH4_ARATH (Q8GZB6), SUVH5_ARATH (O82175), SUVH6_ARATH (Q8VZ17), SUVH7_ARATH (Q9C5P1), SUVH8_ARATH (Q9C5P0), SUVH9_ARATH (Q9T0G7), SUVHA_ARATH (Q3EC60), UHRF1_BOVIN (A7E320), UHRF1_CRYNH (J9VHE9), UHRF1_DANRE (E7EZF3), UHRF1_HUMAN (Q96T88), UHRF1_MOUSE (Q8VDF2), UHRF1_RAT (Q7TPK1), UHRF1_XENLA (B6CHA3), UHRF1_XENTR (F6UA42), UHRF2_HUMAN (Q96PU4), UHRF2_MOUSE (Q7TMI3), YDG1_ARATH (Q9FHI0), YDG2_ARATH (Q9LVU3)» more
|
| PDB [Detailed view] |
34 PDB
2PB7; 2ZKD; 2ZKE; 2ZKF; 2ZKG; 2ZO0; 2ZO1; 2ZO2; 3BI7; 3CLZ; 3DWH; 3F8I; 3F8J; 3FDE; 3OLN; 3Q0B; 3Q0C; 3Q0D; 3Q0F; 4NJ5; 4PW5; 4PW6; 4PW7; 4QEN; 4QEO; 4QEP; 4YGI; 6A5K; 6A5M; 6A5N; 6M2V; 6VCS; 6VED; 8JIG » more |