PROSITE entry PS51075

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	MH1
Accession [info]	PS51075
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-FEB-2005 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51075
Associated ProRule [info]	PRU00438

Name and characterization of the entry

Description [info]

MAD homology domain 1 (MH1) profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=127;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=122;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.6078949; R2=0.0129209; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=9167.3613281; R2=4.6977000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=457; H_SCORE=11314; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=302; H_SCORE=10586; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='Q';  M=  4, -6,-23, -8,  0,-26, -6, -9,-21,  4,-21,-11, -3, -4,  9,  4,  5,  0,-17,-24,-16,  4;
/M: SY='V';  M=  2,-15,-18,-22,-17, -7,-22, -7,  9,-17,  5,  9,-12,-18,-12,-16, -5,  5, 10,-25, -4,-16;
/M: SY='V';  M=  9,-22,-12,-25,-21, -5,-20,-22, 16,-17,  7, 11,-21,-23,-19,-18, -5,  0, 26,-27,-11,-20;
/M: SY='E';  M= -3,  0,-27,  2, 19,-28, -9,  3,-27, 12,-22,-12,  0,-10, 13,  9, -2,-11,-23,-24,-14, 15;
/M: SY='R';  M=-15,-12,-15,-11, -1,-16,-23, -6,-21, 13,-17,-10, -8,-12,  0, 26,-10, -9,-14,-20, -5, -3;
/M: SY='L';  M= -4,-27, -5,-29,-21,  4,-27,-22, 14,-27, 34, 13,-27,-29,-21,-21,-23, -8, 12,-24, -6,-21;
/M: SY='L';  M=-10,-27,-27,-28,-20,  0,-18,-19,  4,-20, 15,  9,-26,-26,-12,-16,-23,-14,  0, 14,  2,-15;
/M: SY='A';  M=  3,-11,-11,-13, -6,-16, -4,-13,-17, -2,-15,-10,-10,-19, -9, -3, -4, -8, -8,-20, -9, -9;
/M: SY='Y';  M=-10,-17,-28,-14, -7, -7,-14, -9,-11, -8, -9, -8,-15, -8, -8, -5, -9, -8,-11, -3,  5, -9;
/M: SY='R';  M=-12, -4,-28, -4,  8,-25,-10, -5,-28, 19,-22,-12,  0,-14, 10, 30, -4, -5,-21,-22,-14,  7;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='T';  M= -3, -9,-15,-14, -9, -6,-18,-15,  5, -7,  2,  1, -7,-12, -7, -8, -1,  9,  4,-19, -5, -9; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='C';  M= -5,-11,  1,-12, -9, -8,-14,-12, -3, -9, -3, -3, -8, -4, -8, -6, -3, -2, -3,-19,-10,-10; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10;
/M: SY='T';  M=  0,  3, -8,  2, -3,-10, -9,-10, -7, -6,-10, -8,  1, -8, -5, -7, 11, 14,  0,-22, -9, -4; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='Q';  M=-11,-12,-27,-10,  5,-18,-24, -7, -9,  0,  3,  1,-13, -7, 11,  2,-13,-10,-14,-22, -9,  7;
/M: SY='G';  M= -5,  6,-23, -2,-13,-19, 22, -9,-19,-13,-19,-13, 18,-22,-13,-12,  0, -9,-17,-29,-21,-13;
/M: SY='D';  M= -4, 14,-25, 18,  6,-25, -6, -9,-23, -7,-18,-17,  7, -3, -5,-12,  1, -2,-20,-31,-19,  0;
/M: SY='E';  M= -6, -1,-26, -3,  4,-22,  0, -8,-16, -3,-15, -9,  4,-14,  3, -6,  0, -7,-17,-27,-16,  3;
/M: SY='D';  M=-11, 20,-23, 27, 14,-24,-17, -8,-23, -4,-15,-17,  6,-10, -2, -9,  4, 10,-17,-33,-15,  6;
/M: SY='E';  M= -9,  7,-26, 13, 29,-25,-17, -5,-21,  3,-19,-16,  2, -7,  9,  1,  4, -5,-19,-31,-17, 18;
/M: SY='E';  M= -8,  2,-28,  5, 16,-22,-18,  8,-25, 13,-20,-11,  0,-12, 12, 11, -5,-10,-22,-20, -2, 12;
/M: SY='W';  M=-17,-20,-33,-20, -2, 16,-23,-15,-18, -9,-11,-13,-19,-21,-12, -4,-20,-16,-20, 40, 12, -4;
/M: SY='A';  M= 15, -4, -3, -9,-11,-15,-12,-16, -7,-14, -3, -7, -4,-19,-13,-17, -2, -4, -2,-28,-16,-12;
/M: SY='R';  M=-11, -5,-29, -3, 12,-25,-10, -6,-25, 17,-17, -9, -3,-14, 10, 19, -8,-11,-21,-22,-13, 10;
/M: SY='K';  M=  0, -4,-25, -7,  2,-24,-16,-10,-25, 29,-22,-10, -2,-12,  5, 27, -4, -3,-15,-21,-12,  2;
/M: SY='A';  M= 17,-16,-13,-20,-14,-11,-14,-19,  1,-10, -2, -3,-14,-19,-13, -8,  2,  0, 12,-25,-14,-14;
/M: SY='V';  M= -6,-20, -4,-28,-24,  4,-30,-26, 15,-22,  4,  3,-16,-22,-23,-21, -5,  9, 18,-24, -4,-24;
/M: SY='Y';  M=-16, -7,-29, -5,  3, -8,-25,  7, -9, -2, -4, -3, -7,-18,  0,  7,-13,-11,-12,-15,  9, -2;
/M: SY='S';  M=  0, -9,-17,-10, -6, -6,-11,  2,-15,-10,-13, -9,  0,-17, -5, -2, 11,  3,-10,-27, -6, -6;
/M: SY='L';  M= -9,-29,-20,-31,-22,  7,-30,-20, 24,-27, 39, 22,-28,-28,-19,-20,-26, -9, 17,-21, -1,-21;
/M: SY='V';  M= -5,-27,-19,-28,-23,  2,-24,-22, 14,-21, 14, 11,-26,-27,-19,-18,-15, -6, 18, -4, -2,-20;
/M: SY='R';  M=-14,  1,-29, -1,  5,-25,-18, -4,-29, 37,-26,-11,  7,-15,  9, 41, -8, -9,-21,-22,-11,  5;
/M: SY='K';  M=-10,-10,-28,-11, -5,-21,-13,-14,-15, 21,-18, -5, -6,-16, -2, 18,-10,-10, -7,-21,-11, -5;
/M: SY='L';  M= -5,-25,-22,-29,-19,  8,-28,-21, 16,-19, 23, 11,-21,-23,-18,-17,-20, -9,  9,-17,  0,-19;
/M: SY='K';  M=-11,  7,-30, 11, 18,-31,-19, -8,-31, 39,-29,-14,  2, -9, 10, 22, -8,-10,-22,-24,-12, 14;
/M: SY='E';  M= -5, 14,-28, 18, 21,-29,-13, -5,-27, 10,-25,-19,  8,  3,  5, -1, -1, -8,-25,-30,-19, 12;
/M: SY='K';  M=-12, -4,-30, -4,  9,-24,-23,  1,-20, 27,-21, -6, -1,-12,  7, 19,-10,-11,-16,-22, -7,  6;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='B';  M= -6, 14, -7, 13,  5,-24,-12, -5,-21, -6,-17,-15, 12,-17,  1, -9,  2, -4,-19,-34,-18,  3;
/M: SY='L';  M= -9,-22,-19,-25,-16,  7,-27,-16, 11,-20, 23, 14,-21,-24,-10,-14,-16, -2,  7,-19,  0,-13;
/M: SY='E';  M=-13, 21,-30, 33, 44,-34,-17,  1,-32,  7,-23,-21,  6, -4, 18, -2,  0,-10,-30,-32,-19, 31;
/M: SY='V';  M=  3, -4,-18, -7, -7,-12,-18,-16,  2,-13,  0, -3, -6,-18,-12,-15, -3,  0,  6,-28,-13,-10;
/M: SY='L';  M=-11,-30,-20,-34,-25, 24,-31,-22, 20,-29, 33, 14,-26,-29,-26,-21,-24, -9, 14,-14,  6,-25;
/M: SY='Y';  M=-14,-18,-27,-18, -4,  2,-29, -6,  6,-11, 11,  4,-17,-21, -7, -5,-18,-10, -2,-10, 14, -8;
/M: SY='K';  M= -5,  9,-26, 12, 12,-29,-16, -6,-27, 19,-23,-14,  3,-10, 10, 12, -1, -4,-20,-26,-14, 11;
/M: SY='A';  M= 41,-11,-10,-19,-11,-18, -3,-20, -7,-11,-10, -9,-10,-12,-11,-19, 11,  2,  4,-23,-19,-11;
/M: SY='V';  M= -2,-30,-13,-31,-29,  1,-31,-29, 32,-22, 14, 12,-29,-29,-28,-21,-13, -2, 44,-28, -8,-29;
/M: SY='E';  M= -6, -5,-22, -5, 14,-14,-22,-10, -6, -6, -3, -1, -7,-10,  1, -9,  0,  5, -7,-28,-11,  7;
/M: SY='S';  M=  3,  0,-17,  0,  6,-26, -7, -5,-21,  1,-28,-14,  7,-10, 15, -1, 25, 10,-16,-33,-17, 11;
/M: SY='R';  M=-11,  3,-30,  5,  2,-30,  4, -6,-31, 11,-27,-15,  6, -7,  5, 12, -4,-12,-26,-25,-18,  2;
/M: SY='G';  M= -3, -4,-29, -1,-12,-29, 40,-18,-34,-15,-28,-20,  0, -4,-15,-18,  1,-10,-27,-25,-27,-14;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='G';  M= -3, -6,-13, -7, -7,-11,  4,-10,-10,  0,-10, -5, -3,-11, -6,  2, -1,  0, -3,-14, -9, -7; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='Q';  M= -2, -3,-25, -1,  5,-24,-18,-11,-10, -1,-16, -8, -5, -1,  6, -7,  0, -5, -9,-27,-15,  4;
/M: SY='P';  M= -2, -8,-28, -6,  4,-21,-16, -9,-21,  9,-23,-14, -7, 13,  0,  4, -2, -5,-19,-21, -9,  0;
/M: SY='T';  M= -2, -2,-17, -7, -6,-17, -9,-15,-19,  1,-19,-13,  2,-12, -4,  4, 14, 24, -9,-28,-13, -6;
/M: SY='K';  M= -1, -9,-30, -8, -3,-28,  7,-15,-28, 11,-27,-15, -5,  5, -4,  6, -5,-12,-22,-22,-20, -5;
/M: SY='C';  M= -9,-17,103,-27,-27,-19,-29,-29,-27,-27,-19,-19,-17,-36,-27,-27, -6, -2, -9,-47,-27,-27;
/M: SY='V';  M=  3,-23, -1,-27,-23, -6,-25,-25, 16,-22,  5,  4,-19,-24,-21,-22, -5, -2, 22,-29,-11,-23;
/M: SY='T';  M= -6,-19, -3,-20,-15, -9,-25,-22, -2,-19,  3, -3,-19,  1,-18,-19, -8,  7,  0,-30,-14,-18;
/M: SY='I';  M=  0,-26,-22,-30,-25, -4,-19,-26, 23,-25, 15, 10,-21,-23,-21,-24,-14, -8, 20,-22, -8,-25;
/M: SY='P';  M=-12,-16,-37, -9, -1,-23,-21,  0,-19, -8,-25,-14,-15, 56, -2,-14,-10,-11,-28,-22,-11, -6;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10;
/M: SY='R';  M=  0,  1,-17,  2, -1,-18,  0, -6,-20,  4,-16,-12,  2,-11, -1, 12,  3, -3,-13,-19,-13, -2; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='R';  M= -5, -2,-16, -2,  5,-10,-12, -2,-14,  6,-14, -9, -1,-10,  2,  8,  4,  4,-11,-14,  0,  2; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='N';  M= -3,  6,-15,  3, -4, -9, -9, -5, -5, -9,  2, -4,  8,-15, -6, -8, -5, -4, -8,-21, -9, -5; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='D';  M= -3, 24,-20, 26,  6,-25, -5, -2,-25,  0,-23,-19, 19,-12,  0, -1,  7, -2,-20,-31,-17,  2; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='G';  M=  8,-10,-21,-11,-13,-22, 29,-18,-23, -7,-19,-12, -5,-16,-13,-11,  0,-11,-13,-19,-21,-13; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='R';  M=-12, -1,-24, -1,  2,-15,-17, -5,-16,  3, -6, -7,  2,-19,  1, 18, -5, -6,-14,-27,-12,  0;
/M: SY='L';  M= -9,-21,-24,-21, -9, -3,-28,-19, 10,-21, 22,  7,-21, -8,-13,-18,-17, -3,  2,-23, -7,-12;
/M: SY='Q';  M=-11,  3,-31,  7, 15,-33,-10, -4,-28, 13,-25,-13,  0,  1, 18,  9, -4,-11,-27,-25,-17, 16;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='I';  M= -5,-19,-16,-22,-16, -4,-25,-17, 16,-15, 13, 13,-18,-20, -8,-14,-10,  1, 16,-22, -5,-13; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='A';  M=  3,-13,-24,-17,-13,-13, -4, -1, -4,-14, -9, -3, -7,-18, -5,-15, -3, -8, -7,-16,  0,-11;
/M: SY='G';  M= -6,  1,-28,  3, -7,-28, 29,  5,-35, -8,-28,-17,  5,-17, -7,-10,  2,-13,-27,-26,-17, -8;
/M: SY='R';  M=-14, -3,-26, -6,  0,-20,-16, 12,-22, 13,-18, -4,  7,-18, 11, 35, -3, -7,-19,-25, -8,  2;
/M: SY='K';  M= -9,-13,-27,-12, -5, -8,-21,-13,-13,  9,-18, -8,-11,  3, -7,  1, -7, -6, -9,-17, -2, -7;
/M: SY='G';  M=  1,-13,-25,-15,-16,-19, 26,-18,-19,-17,-12, -4, -8, -9,-15,-18, -4, -9,-16,-22,-20,-16;
/M: SY='L';  M=-11,-13,-23,-11,-10, -2,-22, -2, -6,-14,  4, -1,-11,-14,-11, -6,-10, -7, -5,-24, -3,-12;
/M: SY='P';  M= -5,-20,-32,-17, -7,-11,-19,-18,-12,-13,-17, -7,-19, 51,-13,-19,-10, -9,-18,-23,-18,-13;
/M: SY='H';  M=-15, -3,-29, -6, -3,-18,-21, 42,-13,-11,-11, -1,  5, -7,  5, -7,-10,-13,-20,-28,  3, -3;
/M: SY='V';  M= -6,-28,-16,-29,-25,  7,-29,-18, 22,-21, 22, 17,-28,-29,-21,-18,-18, -5, 26,-19,  5,-24;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='L';  M= -8,-26, -5,-28,-22,  3,-26,-22, 12,-23, 19,  7,-25,-26,-20,-19,-21, -9, 11, -4, -2,-21; D=-13;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='Y';  M=-12,-20,  9,-24,-22, 16,-26, -6, -1,-18,  2, -1,-19,-28,-19,-16,-15, -8,  0, -3, 25,-22; D=-13;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='C';  M= -1,-14, 39,-19,-19,-14, -2,-20,-18,-20, -9,-10,-12,-24,-19,-20, -6, -9, -8,-28,-19,-19; D=-13;
/I:         I=-13; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
/M: SY='R';  M=-16, -6,-30, -6,  5,-25,-20, -2,-29, 34,-23, -9,  0,-16, 15, 52, -9,-10,-21,-20,-10,  7;
/M: SY='L';  M= -2,-28,-19,-31,-22,  3,-29,-24, 24,-26, 31, 15,-26,-26,-21,-22,-20, -7, 19,-22, -4,-22;
/M: SY='W';  M=-20,-36,-38,-40,-30, 39,-24,-26,-12,-24, -8,-12,-32,-30,-28,-20,-32,-22,-18, 92, 30,-24;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='W';  M=-20,-37,-40,-40,-30, 34,-23,-27,-13,-23,-10,-13,-33,-30,-27,-20,-33,-23,-20,103, 30,-23;
/M: SY='P';  M= -7, -9,-33, -5,  1,-28,-15,-15,-21, -2,-30,-19, -6, 54, -5,-11, -2, -5,-26,-31,-25, -5;
/M: SY='D';  M=-14, 21, -9, 31, 15,-30,-17, -8,-28,  0,-23,-21,  4,-14, -2, -8, -3, -9,-18,-37,-19,  6;
/M: SY='L';  M= -9,-29,-20,-31,-22,  7,-30,-20, 24,-27, 40, 23,-28,-28,-19,-20,-26, -9, 16,-21, -1,-21;
/M: SY='Q';  M= -7, -2,-22, -5,  4,-24,-18, -5,-20, 11,-19, -8,  1,-12, 17, 17,  6, 11,-16,-25,-11,  9;
/M: SY='H';  M= -9, -2,-23,  1, -3,-14,-18, 11,-15, -1,-13, -6, -2,-18, -3, -3, -2, -5, -9,-24,  3, -4;
/M: SY='D';  M= -6, 19,-25, 21, 20,-29,-11,  8,-26,  1,-24,-17, 16,-10, 11, -4,  6, -5,-26,-33,-16, 15;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='S';  M=  4, -8,-12,-10, -8,-11,-12, -4, -6, -5,-10, -5, -4,-14, -6,  0,  7,  6,  3,-24, -9, -8; D=-12;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='E';  M=-10,  4,-28,  9, 37,-29,-20,  0,-26, 10,-19,-13,  0, -6, 25, 10,  1, -4,-26,-26,-16, 31;
/M: SY='L';  M= -8,-27,-19,-29,-21,  6,-30,-22, 22,-27, 36, 16,-26,-27,-20,-20,-22, -3, 16,-22, -2,-21;
/M: SY='R';  M=-11, -4,-26, -5,  7,-22,-21, -9,-22, 26,-20, -9, -3,-14,  5, 29, -5, -1,-13,-23,-11,  4;
/M: SY='R';  M=  3, -2,-24, -6, -1,-22,-11,  2,-21,  4,-23,-13,  4,  2,  0,  7,  2, -4,-18,-27,-15, -3;
/M: SY='L';  M= -9,-30,-22,-33,-24,  6,-33,-24, 31,-29, 36, 19,-27,-27,-21,-23,-25, -9, 21,-21, -1,-24;
/M: SY='P';  M=-10, -6,-16,  0, -4,-22,-19,-15,-17, -8,-16,-14, -9, 14, -9, -7, -6, -6,-14,-32,-20, -9;
/M: SY='C';  M= -5,-12,  3,-15,-13,-16,-11, -7,-18,-16,-19,-12, -7,-21, -6,-15,  3, -1,-13,-13, -9,-10;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='R';  M=-14,  0,-30,  4, 25,-26,-20,  8,-29, 19,-21,-12,  1,-11, 18, 28, -5,-11,-25,-25,-11, 20;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='H';  M=-12,-11, -4,-15,-13, 11,-20, 22,-16,-17,-10, -5, -4,-21,-12,-11, -5, -4,-12,-19,  9,-13; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='A';  M= 10,-10,-22,-11, -6,-18, -1,-12,-17, -3,-18,-12, -8,  7, -7,-10,  1, -5,-14,-17,-10, -8; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='F';  M= -8,-17,-21,-23,-18, 26,-13,-12,-11,-14, -5, -7,-11,-23,-20, -7, -6, -2, -7, -4, 14,-18;
/M: SY='D';  M= -5, 11,-22, 15,  3,-24, -9,-10,-16, -2,-18,-14,  4,-16, -7, -8, -1, -6, -7,-31,-17, -2;
/M: SY='A';  M=  7, -7,-19,-12, -5,-18,-14, -3, -8, -4,-12,  0, -3,-13,  3, -7,  6,  4, -6,-26, -9, -2;
/M: SY='D';  M=-15, 12,-30, 15,  4,-26,-18,  5,-22,  7,-22,-13,  9, -6,  1,  6, -6,-10,-20,-30,-11,  0;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='G';  M= -3, -1,-24, -2, -2,-25,  7, -9,-24, -2,-27,-16,  5,  6,  0, -6,  6, -4,-22,-27,-20, -2; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='D';  M=-14, 16,-29, 23, 18,-27,-16, -3,-26,  6,-19,-17,  8, -3,  4,  3, -4, -9,-24,-31,-17, 10;
/M: SY='M';  M= -3, -3,-22,-11, -5,-10,-18, -5,  0, -9, -2,  3,  1,-17,  1,-10, -5, -2, -7,-21, -2, -3;
/M: SY='V';  M= -2,-27,-14,-30,-28, -1,-31,-29, 29,-21, 10, 10,-25,-26,-26,-21, -8,  4, 40,-28, -8,-28;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='C';  M= -8,-26, 35,-32,-28, -5,-32,-28,  8,-28,  9,  2,-24,-32,-26,-26,-16, -8, 14,-34,-14,-28;
/M: SY='N';  M=-10, 36,-21, 18,  2,-22, -2, 10,-20,  1,-29,-18, 53,-19,  7,  1,  9, -1,-30,-38,-19,  4;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='Y';  M=-20,-18,-30,-18,-18, 25,-29, 28, -3,-10, -2,  0,-17,-29, -8, -9,-19,-11,-12, 24, 74,-18;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='Y';  M=-19,-23,-30,-25,-22, 29,-28, 10,  0,-13,  1,  4,-22,-29,-13,-12,-22,-12, -9, 35, 63,-20;
/M: SY='S';  M=  4,  5,-19,  3, 11,-23, -7, -6,-23,  4,-25,-17, 10,-10,  4,  4, 16,  4,-17,-32,-18,  7;
/M: SY='R';  M=-17,-22,-30,-25,-15,  3,-26,-14, -4, -2,  0,  0,-14,-24, -9, 19,-19,-12, -5,  2,  2,-14;
/M: SY='V';  M= -6,-28,-20,-28,-22,  1,-28,-23, 16,-20, 16,  9,-28,-28,-17,-17,-19, -7, 21, -5, -2,-19;
/M: SY='I';  M= -9,-14, -1,-16,  1,-16,-30,-17,  4,-14, -4, -2,-13,-18, -3,-16,-10, -9,  1,-29,-13, -3;
/M: SY='G';  M=  1, -5,-24, -6, -1,-21,  3,-11,-20, -7,-17,-13,  0, -2, -5, -4,  3, -5,-18,-27,-20, -4;
/M: SY='P';  M= -3,-10,-29, -9, -3,-22,-17,-16,-16, -3,-18,-13, -9, 37, -8,-11, -5, -2,-19,-28,-21, -8;
/M: SY='E';  M= -8, -5,-23, -3, 16,-18,-22, -9,-11,  7,-10, -3, -8,-12,  3,  4, -4, -2, -5,-27,-13,  9;
/M: SY='T';  M= -3,-12, -4,-15, -6,-11,-21,-18, -1,-17, -1, -4, -9,-18, -9,-16,  3,  5,  0,-31,-12, -9;
/M: SY='P';  M= -6, -6,-27, -5,  0,-24,-17,-12,-15,  0,-23,-13, -3, 24,  0, -6,  1,  0,-16,-30,-20, -2;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_02 which contains 571'282 sequence entries.

Total number of hits	43 in 43 different sequences
Number of true positive hits	43 in 43 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	MH1
Version [info]	5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

43 sequences

DAF3_CAEEL  (Q95QI7), DAF8_CAEEL  (Q21733), MAD_DROME   (P42003),

SMA2_CAEEL  (Q02330), SMA3_CAEEL  (P45896), SMA4_CAEEL  (P45897), 
SMAD1_BOVIN (Q1JQA2), SMAD1_COTJA (Q9I962), SMAD1_DANRE (Q9I8V2), 
SMAD1_HUMAN (Q15797), SMAD1_MOUSE (P70340), SMAD1_RAT   (P97588), 
SMAD2_BOVIN (Q1W668), SMAD2_DANRE (Q9I9P9), SMAD2_HUMAN (Q15796), 
SMAD2_MOUSE (Q62432), SMAD2_PONAB (Q5R7C0), SMAD2_RAT   (O70436), 
SMAD3_CHICK (P84023), SMAD3_HUMAN (P84022), SMAD3_MOUSE (Q8BUN5), 
SMAD3_PIG   (P84024), SMAD3_RAT   (P84025), SMAD4_BOVIN (Q1HE26), 
SMAD4_HUMAN (Q13485), SMAD4_MOUSE (P97471), SMAD4_PIG   (Q9GKQ9), 
SMAD4_RAT   (O70437), SMAD5_CHICK (Q56I99), SMAD5_DANRE (Q9W7E7), 
SMAD5_HUMAN (Q99717), SMAD5_MOUSE (P97454), SMAD5_PONAB (Q5R6H7), 
SMAD5_RAT   (Q9R1V3), SMAD6_CHICK (Q9W734), SMAD6_HUMAN (O43541), 
SMAD6_MOUSE (O35182), SMAD7_HUMAN (O15105), SMAD7_MOUSE (O35253), 
SMAD7_RAT   (O88406), SMAD9_HUMAN (O15198), SMAD9_MOUSE (Q9JIW5), 
SMAD9_RAT   (O54835)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

17 PDB

1MHD; 1OZJ; 3KMP; 3QSV; 5MEY; 5MEZ; 5MF0; 5OD6; 5ODG; 5X6G; 5X6H; 5X6M; 6FZS; 6FZT; 6TBZ; 6TCE; 6ZMN
» more